ASSOCIATION AGM2
Association des Étudiants du DEA d'Analyse de Génome et de Modélisation moléculaire
Offres d'emploi post DEA

Les offres Post-DEA de l'association


223 annonces en cours de validité dans toute la baseRetour aux annonces

DateBRStatutP/PTitrePays
27/06/2007MM Stage prive amour france
21/11/2006AG Thèse public PhD studentship in Bioinformatics Angleterre, Grande-Bretagne
31/10/2006AG ??? prive broadcasting Ontario
30/06/2005AG Postdoc prive
30/06/2005AG Postdoc prive Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites France
30/06/2005AG Postdoc prive Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis France
25/01/2005AGMM CDD public CDD Ingénieur d'Etude en biologie moléculaire des algues France
29/11/2004AG Postdoc public
13/12/2003AG ??? prive
13/12/2003AG ??? prive
06/11/2003MM CDI public Computational Chemist Etats-Unis
06/11/2003AG CDD public Research Fellow/Assistant
05/11/2003MM CDI prive Molecular Modeler Etats-Unis
05/11/2003AG CDD public Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics France
05/11/2003AG CDI public Senior Bioinformatics Positon at the FMI Suisse
05/11/2003AG ATER prive Bioinformaticien (poste ATER) France
21/10/2003AG CDI prive Bioinformatics Research Scientist Etats-Unis
21/10/2003AGMM CDI prive BIOINFORMATICS Scientist Singapour
09/10/2003AG Postdoc public 2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats) Canada/Quebec
09/10/2003AG CDI prive BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
09/10/2003AG Postdoc prive motif discovery algorithm/statistics Etats-Unis
05/10/2003AGMM Postdoc public Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics Etats-Unis
19/09/2003AGMM CDI prive BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868) Canada/Quebec
18/09/2003AG Thèse public three PhD positions in Bioinformatics Australie
18/09/2003AG Postdoc public Post-doctoral position in microarray data analysis Suisse
18/09/2003AGMM CDD prive plusieurs postes de Bioinformatique Suisse
09/09/2003MM CDI prive BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist Etats-Unis
03/09/2003AG Postdoc public RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS Grande-Bretagne
03/09/2003AGMM CDD public Developpeur Web pour le site La main a la pate France
02/09/2003AG CDI public Bioinformaticien confirmé France
11/08/2003AG Maître de Conférence public RESEARCH POSITION Canada/Quebec
03/08/2003MM Postdoc public Postdoctoral Fellowship Etats-Unis
03/08/2003AG CDI public Chef de projet bioinformatique au Genoscope France
03/08/2003AG Thèse public Bourse de These en Microbiologie France
03/08/2003AG Postdoc public bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis France
03/08/2003AG CDD prive Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS) France
03/08/2003AG CDI prive Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS Etats-Unis
26/06/2003AG Maître de Conférence public MC de bioinformatique France
23/06/2003AG CDD public Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie France
23/06/2003AG CDI prive Computational Biologist Etats-Unis
13/06/2003MM Thèse public These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole France
11/06/2003MM Postdoc public POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS Etats-Unis
10/06/2003MM Postdoc public Postdoctorals Fellowships in Structural Molecular Biology at the EMBL Outstation France
10/06/2003MM Thèse public Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche France
10/06/2003MM Thèse public Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP France
10/06/2003MM Thèse public Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire France
10/06/2003MM CDI prive Computational Chemists/C++ Etats-Unis
10/06/2003AG CDD public CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster France
10/06/2003AG Postdoc public Research Associate in biostatistics and Grande-Bretagne
10/06/2003AG Postdoc public Postdoctoral Position at MIPS Allemagne
10/06/2003AG Postdoc public Biologist Suisse
10/06/2003AG CDD prive CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services Allemagne
10/06/2003AG Postdoc prive 2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy Etats-Unis
10/06/2003AGMM CDI prive Senior Scientist Bioinformatics, NITD Singapour
28/05/2003AGMM ATER public ATER - Bioinformatique - Lille France
21/05/2003AG Postdoc public Postdoc modele « plante virtuelle » France
21/05/2003AG CDI public charge de cours en bioinformatique Belgique
21/05/2003AG Postdoc public Postdoc Etats-Unis
24/04/2003MM Postdoc public Post-Doctorat au CEA Saclay France
24/04/2003AG CDD public chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD France
24/04/2003AG Postdoc public computational biology/bioinformatics Etats-Unis
18/04/2003AG CDD public Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique France
17/04/2003AG CDI public INFORMATICIEN CHEF DE PROJET France
15/04/2003AGMM CDI public 2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology Irelande
14/04/2003AG CDI public Computer Biologist - Metabolic Disease Group Grande-Bretagne
14/04/2003AG CDI public Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation Grande-Bretagne
08/04/2003MM CDI prive Computational Chemists Etats-Unis
08/04/2003AG Postdoc public Postdoctoral job opening in Computational Biology Etats-Unis
08/04/2003AG CDD prive Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS) France
07/04/2003MM CDI public SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM CDI public SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM Postdoc public POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM Postdoc public Post-doctoral Postion in Structural Genomics Etats-Unis
07/04/2003AG CDD public SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE Grande-Bretagne
06/04/2003MM Postdoc public Post-doctorants CDD 18 moisINRA France
06/04/2003AG Postdoc public bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS France
06/04/2003AG CDI public BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN France
06/04/2003AG Postdoc public Postdoc modélisation des réseaux de gènes France
06/04/2003AG CDI public Poste de professeur en génétique & bio-informatique France
06/04/2003AG Postdoc public Stage post-doctoral en génomique végétale France
06/04/2003AG CDD public POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM France
06/04/2003AG CDI public professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques France
06/04/2003AG CDI public professeur de bioinformatique France
06/04/2003AGMM Postdoc public Postdocs CNRS France
06/04/2003AGMM Maître de Conférence public poste de maître de conférences en Bioinformatique France
06/04/2003AGMM Postdoc public Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)
06/04/2003AGMM CDD prive Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline Etats-Unis
02/04/2003AG Thèse public Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department Irelande
28/03/2003AG CDI public Ingénieur de recherche CNRS France
28/03/2003AG CDI public professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière France
28/03/2003AG Postdoc prive Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics France
23/02/2003AG CDI prive Data Analysis Scientist Etats-Unis
21/02/2003AGMM Postdoc public Postdoctoral Positions, Computational Cell Biology Etats-Unis
20/02/2003AG Postdoc public Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs) Grande-Bretagne
20/02/2003AGMM Postdoc public Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot Suisse
20/02/2003AGMM Postdoc public Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships Etats-Unis
20/02/2003AGMM Postdoc public Postdoc at the Computational and Molecular Population Genetics lab Suisse
20/02/2003AGMM CDI public POSTES DE PROFESSEURS DES UNIVERSITES ET DE MAITRES DE CONFERENCES France
16/02/2003AG ??? public Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute Grande-Bretagne
12/02/2003AGMM Postdoc public Stage postdoctoral Marie Curie : Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation Grande-Bretagne
10/02/2003MM Postdoc public PhD Position, Computational Molecular Biology Canada/Quebec
10/02/2003AGMM Thèse public Research Scholarships Grande-Bretagne
10/02/2003AGMM Postdoc prive Postdoctoral Research Fellowship Grande-Bretagne
07/02/2003AGMM Postdoc public 210 Postdoc CNRS en 2003 France
06/02/2003AG Postdoc public STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE Canada/Quebec
06/02/2003AG Postdoc public Plant Genomics Research Unit PostDoc France
06/02/2003AG CDD public annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana France
06/02/2003AGMM CDI public 2 Senior Principal Investigators and 5-7 Junior Principal Investigators Autriche
06/02/2003AGMM CDI public Poste d'annotateur(trice) SWISS-PROT Suisse
06/02/2003AGMM CDI prive CUSTOMER SUPPORT SPECIALIST Grande-Bretagne
06/02/2003AGMM CDI prive BIOINFORMATICS Etats-Unis
30/01/2003AG CDD public 8 postes Allemagne
29/01/2003MM Postdoc public Postdoc in COMPUTATIONAL MEDICINAL CHEMISTRY Grande-Bretagne
29/01/2003MM CDI prive Mathematicien - Modelisation dynamique en biologie France
29/01/2003AG CDI public Molecular Database Indexer Canada
15/01/2003AG Postdoc public Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques France
15/01/2003AG CDI prive BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST France
15/01/2003AGMM CDI public postes Maitre de Conf et Prof France
02/01/2003AG CDD public BioInfomaticien stockage et analyse de données France)
08/12/2002AG Postdoc public 7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes France
08/12/2002AG CDI public Maitre de conférence à Polytechnique France
08/12/2002AG CDD public BioInformaticien France
03/12/2002AG Postdoc public Postdoctoral position : Genomique bacterienne France
28/10/2002MM Thèse public Database Mining en Olfaction France
18/10/2002AG CDI prive IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER Grande-Bretagne
14/10/2002AGMM ATER public Poste d'ATER en section 27- Annecy France
30/09/2002AG ATER public 2 1/2 postes ATER vacants France
26/09/2002AG Postdoc public 2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV Etats-Unis
26/09/2002AGMM Postdoc public BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN Etats-Unis
23/09/2002AGMM ATER public 2 1/2 postes ATER France
16/09/2002AG Postdoc prive Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc Grande-Bretagne
11/09/2002MM Postdoc public Computational Biology or Bioinformatics Japon
10/09/2002MM Postdoc public Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics Grande-Bretagne
03/09/2002MM CDD prive Chimie-informatique/lead informatics/CRP-VITRY France
30/08/2002MM Thèse public Thèse en Modélisation Moléculaire Grande-Bretagne
30/08/2002AG Postdoc public Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows Japon
30/08/2002AGMM Thèse public Thèses en data/text mining Suisse
30/08/2002AGMM Thèse public Ph.D. or M.Sc. Studentship in BIOINFORMATICS Manitoba, Canada
29/08/2002AGMM CDI public IR2501 Ingénieur de Recherche - Ingénieur en biologie France
29/08/2002AGMM CDI public IR1601 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications France
29/08/2002AGMM CDI public IR2202 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications France
29/08/2002AGMM CDI public IE7301 Ingénieur d' Etudes - Ingénieur en techniques biologiques France
12/08/2002AGMM Postdoc public Post-doct informatique pour la protéomique France
12/08/2002AGMM CDD public Possibilité d'accueil pour un an à l'Université de Cambridge Grande-Bretagne
07/08/2002MM Postdoc public PostDoc position in Bioinformatics Massachussets
07/08/2002MM Postdoc public Postdoctoral Fellow Japon
07/08/2002MM CDI prive Modélisateur moléculaire chez L'Oréal France
07/08/2002AG Thèse public Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments France
07/08/2002AG Thèse public Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique France
07/08/2002AG Thèse public Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus France
07/08/2002AG Thèse public Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique. France
07/08/2002AG Postdoc public Postdoctoral Researcher Californie, USA
07/08/2002AG Postdoc public Full time postdoctoral research position Ontario, Canada
07/08/2002AG CDI prive Biostatistician - Fungal Genomics Project Québec, Canada
07/08/2002AGMM CDI prive Bioinformatics Database Administrator Colombie-Britannique, Canada
07/08/2002AGMM Postdoc prive Industrial Post-Doc in Proteomics Ontario, Canada
06/08/2002MM Thèse public Bourse de thèse fléchée Inter///Bio France
06/08/2002MM Thèse public Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory Massachussets, USA
06/08/2002AG Thèse public Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont France
06/08/2002AGMM Thèse public Écoles Doctorales proposant des allocations au titre de la mobilité France
30/07/2002AG CDD public young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines Grande-Bretagne
26/07/2002AG CDD public CDD, URGV d'Evry France
26/07/2002AG CDI public Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry France
26/07/2002AGMM Postdoc public Post-doctoral position in theorical ecology Californie, USA
26/07/2002AGMM Postdoc public Postdoc Position, Computational and Integrative Bioengineering Washington, USA
25/07/2002AGMM Postdoc public Postdoc, Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle, VT Virginie, USA
24/07/2002MM Thèse public PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry Grande-Bretagne
24/07/2002AG Postdoc public Research Assistant/Fellow Grande-Bretagne
22/07/2002MM Thèse public These en chem-informatique / bio-informatique France
18/07/2002MM Postdoc public Enzyme Function And Reaction Mechanisms: Computational Studies Ohio, USA
17/07/2002MM Postdoc public Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization France
17/07/2002AG Postdoc public Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis Danemark
15/07/2002AGMM Thèse public Thèse avec allocation MENRT - "Sélection et caractérisation de peptides inhibiteurs de biocatalyseurs" France
15/07/2002AGMM Postdoc public Postdoctoral Research Fellowships Suisse
15/07/2002AGMM CDD public Bioinformatics Coordinator Idaho, USA
15/07/2002AGMM ??? prive Two Bioinformatics Support Specialists Suisse
14/06/2002AG CDI public Postdoctoral and Research Assistant Positions Québec, Canada
14/06/2002AG CDI prive IT and Database specialist Italie
11/06/2002AG Postdoc public Postdoctoral Positions Iowa, USA
11/06/2002AGMM CDI prive Expert scientifique et Informatique France
11/06/2002AGMM CDI prive Bio informaticien France
07/06/2002AG CDI prive Bioinformatic Position at The Nestle research center Suisse
06/06/2002AGMM CDD public Ingenieur-expert Bioinformaticien France
05/06/2002AG ATER public ATER bio-informatique & ATER génétique moléculaire du diabète de type 2 France
04/06/2002AGMM CDI public Correspondant informatique et "Data manager" France
11/02/2002AG CDI public Analyst for the analysis of gene expression data Grande-Bretagne
11/02/2002AG Postdoc public Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA Grande-Bretagne
11/02/2002AGMM CDI public Postdoctoral Research Worker - statistical genetics Grande-Bretagne
07/02/2002AG Postdoc public role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease Grande-Bretagne
07/02/2002AG CDI public Maître de conférences (Université Paris XI) France
07/02/2002AG CDI public Head of Bioinformatics Applications Grande-Bretagne
07/02/2002AG Postdoc public Position post doctorale en data mining France
07/02/2002AG CDD public Ingénieur/Post-Doc Bioinformatique (BAC+5 Bioinformatique / 6 mois / PARIS ) France
07/02/2002AG CDD public Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression France
07/02/2002AG Postdoc public Postdoc Positions in Bioinformatics at NCGR, New Mexico Nouveau-Mexique, Etats-Unis
07/02/2002AG CDD prive Bioinformaticien France
07/02/2002AGMM Postdoc public 1 LECTURESHIP Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford Grande-Bretagne
07/02/2002AGMM Postdoc public PhD / Postdoc Positions, European Project: HaeMOdel ?
07/02/2002AGMM CDI public Informatics Scientist (Collaborator Liaison) Grande-Bretagne
07/02/2002AGMM CDI prive BIOINFORMATICIAN Ontario, Canada
03/07/2001MM ATER public ATER Physico-Chimie moléculaire et cellulaire au Muséum National d'Histoire Naturelle France
01/07/2001MM Postdoc prive ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire France
01/07/2001MM CDI prive Researcher – Protein structure modelling NAUTILUS BIOTECH France
01/07/2001AG Postdoc public A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project France
01/07/2001AG ??? prive ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique France
01/07/2000MM CDI prive Software Developers à Gentech (Sophia antipolis) France
01/07/2000AG Thèse public allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive France
01/07/2000AG CDI public two informatics positions at the University of California, Berkeley USA
01/07/2000AG CDD public CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg France
01/07/2000AG CDI public Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand France
01/07/2000AG CDI public Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY France
01/07/2000AG Thèse public Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse France
01/07/2000AG Thèse public PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G) France
01/07/2000AG CDD public Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an) France
01/07/2000AG CDD public 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst Belgique
01/07/2000AG CDD public Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5 France
01/07/2000AG CDD public CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) France
01/07/2000AG CDI prive Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA. Manitoba, Canada
01/07/2000AG CDI prive Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project USA
01/07/2000AG CDI prive Bioinformatics Applications Developer France
01/07/2000AG CDD prive projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir France
01/07/2000AGMM Thèse public Modélisation de l?influence de la démographie sur la cohésion des groupes et les modalités de dispersion des animaux chez les espèces à femelles philopatriques - Le cas du magot France
01/07/2000AGMM Thèse public Appel à candidature : bourse de thèse France


27/06/2007[MM]amour
Source:officiel
Date de parution:27/06/2007Date limite de réponse:15/09/2007
Lieu:rennes (france)Statut:StageSecteur:prive
Description de l'annonce:
chereche personne pouvons m'apprendre à faire l'amour
Contacts:bystere@yahoo.fr

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21/11/2006[AG]PhD studentship in Bioinformatics
Source:
Date de parution:21/11/2006Date limite de réponse:01/12/2006
Lieu:Londres (Angleterre, Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
PhD studentship in Bioinformatics

"Bio-Communication Theory for Genetically influenced Chronic Diseases"
Most diseases are influenced by genetic factors such as Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The aim of this project is firstly to express gene mutation as a digital communication problem (Bio-Communication model) and secondly to apply communication theory to detect SNPs which are likely to predispose people to chronic diseases.

Please note that this position is only open to European Union citizens.

Closing Date: November 30th 2006

For more information:

http://cism.kingston.ac.uk/research/phd-studentship-vacancies/bio-communication-theory-for-genetically-influenced-chronic-diseases_phd-university.htm

Contacts:j.nebel@kingston.ac.uk

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31/10/2006[AG]broadcasting
Source:
Date de parution:31/10/2006Date limite de réponse:?
Lieu: (Ontario)Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
Centre de Recherche expérimental pour la réalisation de Home vidéo et de reality scientifiques en.ligne et de la télévision visé à découvrir des nouvelles stratégies d’amélioration de la vie, sélectionne des deux sexes 18 à 65 ans motivés, ambitieux et dynamiques. Les test de sélections se feront en ligne et sont programmés avec des techniques innovants. Le Centre offre formation, et possibilité de carrière. Envoyer CV de préférence avec photo a : broadcasting@themadivita.com
Contacts:via monte di Dio

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30/06/2005[AG]
Source:Institut Pasteur-Immunophysiology and Intracellular Parasitism unit
Date de parution:30/06/2005Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.
Pièce Jointe : postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)
Contacts:Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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30/06/2005[AG]Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites
Source:Institut Pasteur-Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire
Date de parution:30/06/2005Date limite de réponse:?
Lieu:Institut Pasteur Paris (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.
Pièce Jointe : postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)
Contacts:Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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30/06/2005[AG]Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis
Source:Institut Pasteur-Unité d'Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire
Date de parution:30/06/2005Date limite de réponse:?
Lieu:Institut Pasteur Paris (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.
Pièce Jointe : postdoc_position30juin05.pdf (20 ko)
Contacts:Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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25/01/2005[AGMM]CDD Ingénieur d'Etude en biologie moléculaire des algues
Source:
Date de parution:25/01/2005Date limite de réponse:28/02/2005
Lieu:Roscoff (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Un poste CDD de 18 mois, financé par la Région Bretagne, est ouvert dans l'équipe Génétique d'Algues à la Station Biologique de Roscoff. L'équipe Génétique des Algues (6 scientifiques) a pour but de faire émerger l'algue brune filamenteuse Ectocarpus siliculosus comme modèle pour ce groupe d'organismes. Des outils génétiques, comme la transformation et des approches de RNAi sont en cours de développement et un programme de séquençage complet du génome d'Ectocarpus a été initier en collaboration avec Genoscope. Le(la) candidat(e) sélectionner travaillera sur la transformation d'Ectocarpus en utilisant une gamme d'approches comme le biolistique, le micro-injection, des liposomes et la transformation de protoplastes. Des candidates devraient avoir des compétences en biologie moléculaire; une connaissance des techniques de culture d'algues et des notions en biologie cellulaire seront appréciées. Des candidates devraient envoyer une lettre de candidature, un CV complet et les noms de deux référées a l'adresse suivante.
Pièce Jointe : cdd_roscoff_mcock_vf.dot (56 ko)
Contacts:Pour plus de détails, contact J. Mark Cock, Génétique des Algues, UMR 7139 CNRS-Goëmar-UPMC Végétaux Marins et Biomolécules, Station Biologique, Place Georges Teissier, BP74, 29682 Roscoff Cedex, France
Email: cock@sb-roscoff.fr; website: http://www.sb-roscoff.fr/UMR7139/en/genetics.html


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29/11/2004[AG]
Source:
Date de parution:29/11/2004Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Contacts:adresse

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13/12/2003[AG]
Source:
Date de parution:13/12/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Contacts:adresse

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13/12/2003[AG]
Source:
Date de parution:13/12/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Contacts:adresse

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06/11/2003[MM]Computational Chemist
Source:http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2218
Date de parution:06/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York State (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
A client of ours is seeking a Sr Computational Chemist.

QUALIFICATIONS:
The candidate should be willing to provide molecular modeling support for discovery projects by applying state-of-the-art computational techniques, with the goal of identifying and optimizing novel drug leads.

3 or more years industrial experience in de-novo ligand design,
pharmacophore analyses, ligand docking, library design and analysis, homology modeling and protein-ligand simulations is REQUIRED.

Additional requirements include a Ph.D. in Chemistry, Biochemistry, Biophysics, or a related discipline, and excellent communication skills.
Contacts:HOW TO APPLY:
If you are interested in pursuing this opportunity, please forward your CV, salary requirement, relocation considerations and references to resumes@workwondersstaffing.net. It is important to use the position title as the subject of your email to allow your resume to reach the appropriate recruiter as quickly as possible. If you feel you are not qualified or are not interested in the opportunity, do you know anyone who
might be a good fit?

[Please reference Bioinformatics.Org when responding to this announcement.]

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06/11/2003[AG]Research Fellow/Assistant
Source:http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2233
Date de parution:06/11/2003Date limite de réponse:25/11/2003
Lieu: ()Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
The Robert Gordon University, Aberdeen School of Computing
Research Fellow/Assistant (Ref T229) (2.5 Years)

Efficient Biological Grammar Acquisition

DETAILS:
Applications are invited for the position of Research Fellow/Assistant on an EPSRC funded project entitled "Efficient Biological Grammar Acquisition". The project will be based in the Computing Technologies Centre (a recent 1.5 million pounds, purpose-designed SRIF-funded research centre) in the School of Computing at the Robert Gordon University, Aberdeen. The industrial collaborator on the project will be GlaxoSmithKline, one of the world's leading research-based pharmaceutical and healthcare companies.

Linguistic methods have provided some interesting results in the
recognition of complex biological signals. However the hand
development of grammars is difficult and, because it requires human expertise, expensive. Thus, given the enormous volume of data arising from genome projects, there is a need to automate the acquisition of grammars from sets of biological sequences. As the researcher on this project, you will develop an efficient method of acquiring such grammars using Inductive Logic Programming (ILP). Your method will use efficient techniques for discovering non-terminals which are potentially pertinent to the subsequent induction of a biological grammar and a parser which increases the speed at which biological
grammars may be acquired by an ILP system.

QUALIFICATIONS:
You should have a good honours degree in Computing or a cognate
discipline and some experience of bioinformatics research; or you may have a background in the life sciences and have an advanced MSc in Computing or a cognate discipline. Preferably you will have a PhD in Machine Learning or Bioinformatics or equivalent experience, as demonstrated by a good publication record. Experience of ILP, Prolog or Parsers would be an advantage. A good communicator and programmer, you will bring an enthusiastic and organised approach to this challenging position.

Informal enquiries to: Dr Chris Bryant Tel: +44 (0)1224 262475 E-mail: chb@comp.rgu.ac.uk
Starting Salary: 18,265 - 27,339 GBP
Contacts:HOW TO APPLY:
Further particulars and an application form are available from: Human Resources Department, The Robert Gordon University, Schoolhill, Aberdeen, AB10 1FR. www.rgujobs.ac.uk Tel: +44 (0)1224 262085 E-mail: staffrec@rgu.ac.uk

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05/11/2003[MM]Molecular Modeler
Source:Bioinformatiocs.Org
Date de parution:05/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
I am assisting to recruit Molecular Modeler for a client's Drug Discovery Applications Group in New York City. Here is more information:

This client is a technology leader specializing in computational methods for drug discovery and development. Benefits include medical, dental, 401(k), flexible spending account, 3+ weeks vacation, stock options, and tuition reimbursement. Visa sponsorship and/or relocation are available.

The successful candidate will become part of a multidisciplinary drug discovery team working on both in-house efforts to improve and apply drug discovery methodologies and on collaborative projects with pharmaceutical/biotechnology partners.

JOB DESCRIPTION:
Actively participate in Drug Discovery Applications Group projects
Apply drug discovery software and perform analysis of the results
Effectively communicate results to other members of the Group
Work closely with the Development Team to test and improve Drug Discovery technologies

QUALIFICATIONS:
Ph.D. in computational chemistry, organic chemistry, or biochemistry
Computational experience in at least 1 of the following areas: molecular modeling, structure-based drug design, virtual ligand screening, computationally-driven lead optimization, ligand-based design, or homology modeling
Excellent verbal and written communication skills
Ability to work independently

SKILLS:
Programming skills: Perl script writing, in particular
Experience with chemical databases
Contacts:HOW TO APPLY:
For consideration, please send CV including publications, thesis topic, and advisor to resumes@workwondersstaffing.net

This client is an Equal Opportunity Employer.

[Please reference Bioinformatiocs.Org when replying to this announcement.]

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05/11/2003[AG]Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics
Source:ABGf-3355
Date de parution:22/10/2003Date limite de réponse:22/12/2003
Lieu:Lille (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 22/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 22/12/2003

Position in Biostatistics and Bioinformatics
Field : Microarray data and complex genetic disease analysis

Full time POSITION for 2 years starting November, 2003 in the Department of Human Genetics - Genetics of Multifactorial Diseases – Director of Unit : Professor Philippe Froguel

Project Description :
Analysis of Affymetrix microarray data from transcriptome experiments using animal models and genetic data from human polymorphisms typed in both cohort and family studies. This will be carried out in the context of exploration of the
molecular mechanisms underlying pancreatic beta-cell dysfunction and associated insulin-resistance.

Activities:
* Select and set up appropriate statistical methods for analyzing:
o Microarray data, including normalization, selection of significant expression variation, clustering, GO annotation
o Genetic data, including linkage analysis, association analysis, linkage disequilibrium mapping and haplotype construction
* Manage data (acquisition, validation, quality control, organization)
* Analyze data, interpret and present results
* Adapt or develop new statistical tools when necessary
* Optimize usage of such tools and set up standard analysis procedures
* Data acquisition from public databases and other online resources

Skills :
* Knowledge of statistical methods
* Experience of statistical software such as SPSS, S+ or R
* Strong experience in microarray data analysis
* Knowledge of public databases and other online biological resources

Experience :
Masters Degree (DESS) or PhD, and, ideally, practical experience of microarray experiments.

Training in population genetics can be provided by the lab

Application Deadline :
Applications will be reviewed in October 2003 until a suitable candidate is identified. Interviews may begin in late October
Contacts:Interested applicants should submit a letter of intent, a summary of previous research experience and a curriculum vitae, and reference to :
Sophie Gallina : Sophie.Gallina@mail-good.pasteur-lille.fr

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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05/11/2003[AG]Senior Bioinformatics Positon at the FMI
Source:http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2206
Date de parution:05/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bale (Suisse)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
BACKGROUND:
Tired of the poor funding in academia or the lack of freedom in a company? Want your own office?

We are looking for an enthusiastic person with several years experience in bioinformatics. Extensive experience in sequence analysis, data mining/data integration and genome analysis is required. A good knowledge of UNIX, database programming and shell scripting is a plus. Candidates with a PhD are encouraged to apply but a masters together with several years of practical experience will also be considered. In addition to their support and development commitments the successful candidate will be encouraged to attend international bioinformatics conferences and to have the initiative to develop their own research projects in the field of bioinformatics.

The FMI (www.fmi.ch), which is funded by the Novartis Research Foundation, is an International Institute with over 280 people of which approximately are 150 postdoctoral fellows and graduate students committed to basic research in areas as diverse as cellular growth control, epigenetic gene
regulation and neurobiology. The FMI offers highly competitive academic salaries and it provides state-of-the-art core technologies, transgenic mouse facilities, computing, genomice, and proteomics services.

The FMI is located in Basel, a city offering an outstanding scientific environment in the center of Europe.

JOB DESCRIPTION:
* Help and support: data mining, sequence comparisons, sequence alignment, BLASTs, individual projects with groups, etc.

* Teaching: Teaching of classes in bioinformatics

* Development: Evaluation of new tools and software, development of bioinformatics tools. Making tools accessible to users at (on www, central servers, ...)

* Databases: Maintenance of existing in-house databases (such as genbank,SWISS-PROT, etc.)

* Interface and collaborate with outside institutions: Interact with commercial and academic bioinformaticians in developing and sharing bioinformatic resources.
Contacts:HOW TO APPLY:
Please submit your resume or questions to dean.flanders@fmi.ch.

http://www.fmi.ch

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05/11/2003[AG]Bioinformaticien (poste ATER)
Source:ABGf-3363
Date de parution:27/10/2003Date limite de réponse:27/12/2003
Lieu:Paris (France)Statut:ATERSecteur:prive
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 27/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 27/12/2003

Un poste ATER en Bioinformatique est disponible immediatement a l’Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles, rattache au laboratoire CNRS de Neurobiologie et Diversite Cellulaire (UMR 7637) sous la responsabilite du Pr.J.
Rossier, Professeur de Biologie en 1ere annee.
Les candidats seront titulaires d’une these ou d’une experience equivalente.
L’ATER recrute(e) sera responsable de l'enseignement (TP, 3 fois 15H) en bioinformatique (analyse de genomes, data mining).
Il/elle assistera le professeur dans la preparation des cours et
effectuera le suivi des stages des etudiants.
Son projet de recherche sera dans le domaine de l’analyse du transcriptome (regulation de l’expression des genes dans la Trisomie 21 et le retard mental).
Il/elle aura pour mission de developper et de maintenir une plate forme informatique, en collaboration avec les plate formes publiques existantes.
Remuneration brute mensuelle : environ 1900 euros.
Contacts:Envoyer un cv au Prof . Jean Rossier : jean.rossier@espci.fr
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/10/2003[AG]Bioinformatics Research Scientist
Source:ABG-8094
Date de parution:08/10/2003Date limite de réponse:07/12/2003
Lieu:Johnston (Iowa) (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Position Purpose :
To implement, validate, and customize statistical methods for analyzing functional genomic experiments.

Duties/Responsibilities :
This person will be responsible for identifying, implementing, and validating statistical and data mining methods for designing and analyzing gene expression profiling experiments. This person should also be capable of customizing or extending previously-published methods when needed. This person will lead an effort to integrate gene expression results into biological networks. In addition to these roles, the successful candidate will be able to contribute to other bioinformatics projects requiring statistical analysis.

Educational Qualifications Desired :
Ph.D. in Statistics or closely-related field; post-doctoral experience is desirable.

Competencies and Experience Desired :
The ideal candidate will have a proven track record of application and/or development of innovating data mining algorithms to the analysis of large-scale expression profile data.

Rather than specializing in one particular technique, the candidate will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. He/She will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the analysis of gene expression data.

Excellent computational skills with the ability to work in a UNIX-based environment is expected.

Familiarity with statistical software is expected and a strong preference will be given to those applicants with expertise in either Splus or R.

This position requires a self-motivated scientist who works well in a team environment, communicates clearly and effectively, and creatively and independently solves problems.

Reports To :
Computational Biologist

Department :
Information Management - Bioinformatics and Exploratory Research

Contacts:There are two ways to submit a resume for this position :

You must reference the job code PHI/QA323/WCP in your cover letter or the subject line of your email.

Pioneer employees must apply through PHIweb.

- Send your resume and cover letter in an email message (Attachments should be in Word, WordPerfect, Lotus, or ASCII format.) to : apply@pioneerjobs.com

- Mail your scannable resume and cover letter to the following address :
Resume Processing Center
Pioneer Hi-Bred International, Inc.
400 Locust Street, Suite 700
P.O. Box 14454
Des Moines, IA 50306-3454

Resumes will be accepted until the position is filled.

For general inquiries regarding employment, contact jobs@pioneer.com or call the Pioneer Hi-Bred Employment Job Line number at 515-270-4000 or 1-800-247-6803 ext. 4000.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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21/10/2003[AGMM]BIOINFORMATICS Scientist
Source:
Date de parution:21/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Singapore (Singapour)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Our client is the national flagship initiative in the genomic sciences for Singapore as the country seeks to be an international center for the biomedical sciences and its relevant industrial research and development. In this research institute, the major technical platforms of high throughput
sequencing, genotyping, cDNA library production, bioinformatics, proteomics and expression array technologies have been established and programs in stem cell biology, molecular pharmacology, cancer biology, comparative genomics,
computational biology and population genetics have begun.

BIOINFORMATICS SCIENTIST
Senior level Bioinformatics Scientists are needed who will identify, design, develop and apply advanced computational analyses to biological research throughout the institute. Successful candidates will work closely with investigators in the Biological Investigations, Disease Gene Discovery, Gene
Expression Microarrays, and Population Genetics groups. Outstanding candidates will have a Ph.D. and extensive training in bioinformatics, computational biology, mathematical sciences, or a related field. A research background in molecular or cell biology is advantageous. You must be able to
work in a fast-paced and dynamic environment. Previous experience in managing bioinformatics scientists and projects is required. We are seeking candidates with expertise in one or more of the following areas:

a.. Protein database analysis
b.. Mathematical modelling of protein and gene functions
c.. Statistical analysis and modelling applied to genomic data
d.. Advanced transcript sequence analysis
Contacts:Interested candidates, please forward your detailed resume in MS Word format to: search@scientecsearch.com

ScienTec Search (www.scientecpersonnel.com)
No. 5 Shenton Way
#37-02 UIC Building
Singapore 068808

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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09/10/2003[AG]2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)
Source:ABGe-1249
Date de parution:19/09/2003Date limite de réponse:18/10/2003
Lieu:Laval (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 19/09/2003
Date de fin de diffusion prevue : 18/10/2003

Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique/bio-statistique sont presentement a combler, a l'UNIVERSITE LAVAL (Quebec) au sein d'un projet multi institutionnel, finance par Genome Quebec pour une periode de deux ans. Le travail vise le developpement de methodes d'analyse pertinente a l'expression de genes a grande echelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration etroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des biostatisticiens et des informaticiens.

Position 1.Traitement des donnees de microarray et analyse de designs experimentaux complexes.
Des developpements importants ont ete recemment acquis en analyse statistique des microarrays, toutefois ces progres ont ete principalement appliques a des comparaisons simples. Deux themes principaux seront abordes dans cette partie du projet : la correction de biais dans l'analyse des donnees quantitatives de microarrays et les methodes statistiques pour l'analyse dispositif experimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le developpement de modele pour quantifier le biais experimental ; l'evaluation et l'amelioration des procedures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l'analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l'evaluation de la pertinence et des limites de differentes methodes statistiques ; la modification novatrice des methodes existantes pour les rendre mieux adaptees aux donnees obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d'un projet de genomique fonctionnel situe dans un pavillon de recherche en sciences de la vie.

Qualifications : Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la sante, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise developpee en statistiques. Une comprehension des principes de l'expression des genes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l'experience dans les domaines suivants : connaissance de langages de programmation, manipulation de grands fichiers de donnees, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacites de communications en Anglais ou en Francais sont essentielles.

Position 2. Integration des donnees d'expressions geniques
Le projet consiste a developper des techniques d'analyses concernant deux types d'integration: 1-Integration de donnees provenant de differentes techniques de mesures d'expression genique; 2- Integration des fonctions des genes a leurs profils d'expressions. Ce projet consiste d'abord a integrer les donnees produites par les trois differentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression) et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiees sur les fonctions des genes ainsi que leurs roles dans les differents sentiers, metaboliques ou de signalisations, devront etre integrees aux profils d'expressions geniques.

Qualifications : Un Ph.D en biologie moleculaire ou fonctionnelle ou equivalent avec une tres bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne experience en programmation, en bases de donnees relationnelles et en extraction d'informations des bases de donnees publiques.
Contacts:Pour postuler, soumettre :
- une lettre de presentation
- un curriculum vitae a jour
- IMPORTANT : les noms et coordonnees de trois personnes references

- Transmettre par courriel en un seul document attache (format Word ou PDF) a genome.foret@rsvs.ulaval.ca
- Le nom du candidat doit etre donne au titre du fichier, ou l'inserer dans le texte du courriel.
- Inscrire le numero de position dans la ligne sujet du message.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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09/10/2003[AG]BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
Source:
Date de parution:19/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Bioinformatics Software Engineer opening

At Perlegen Sciences, we conduct genetics research and develop products that impact and improve people's lives. Established in March 2001, we are a well-funded, pre-IPO company aggressively developing our core competencies in research, genome scanning, bioinformatics, and other key areas of our business. We invite you to consider our team as we apply this technology to bring focus to biological research and to accelerate the discovery of drugs and diagnostics.

We currently have an excellent opportunity for a Bioinformatics Software Engineer to aid in the analysis and preparation of sequence and primers, as well as to assist colleagues in issues related to these design elements. We'll rely on you to analyze and design genetic sequence and primers for our association studies, place Perlegen's data in new contexts, make resulting information easily accessible, and quickly respond to questions about Perlegen's SNPs and assays in relation to the human genome. You will also examine past primer performance and make
recommendations for design process improvements. To qualify, you must be a team player who is both meticulous and insightful. You should have a BS in CS/EE or equivalent with a strong genetics/molecular biology background and/or a BS in Biology with a very strong computational background. Excellent Perl, SQL, analytical and communication skills, the ability to work in both Windows and Linux environments, proven ability to find and refine relationships between and within data-sets,
and proficiency manipulating and dissecting large data collections are essential. Two or more years of bioinformatics development experience preferred. Strong PL/SQL, Access and VB skills as well as competency with statistics would be a plus.
Contacts:Email your resume, indicating Job Code GN78, to
perlegen_HR@perlegen.com; mail, again indicating Job Code GN78, to Perlegen Sciences, 2021 Stierlin Court, Mountain View, CA 94043; or fax to 650-625-4580. For more information on this position and other opportunities, visit our website at www.perlegen.com. EOE.

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09/10/2003[AG]motif discovery algorithm/statistics
Source:BioInfo
Date de parution:09/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
We have an immediate open position for a postdoc working on motif discovery algorithm/statistics. If you or someone you know are interested, please contact me asap.
Contacts:Michael Q. Zhang, Ph.D.
Professor
Cold Spring Harbor Lab
1 Bungtown Road
Cold Spring Harbor, NY 11724.
USA
Tel:1-516-367-8393
Fax:1-516-367-8461
http://www.cshl.edu/mzhanglab/
Secretary: Ms. Carol Marcincuk (1-516-367-8387, marcincu@cshl.edu)

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05/10/2003[AGMM]Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics
Source:dmanet
Date de parution:05/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Los Angeles (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
A post-doctoral research associate position in computational
biology/bioinformatics is available immediately within the Computational Biology program at the University of Southern California (USC), Los Angeles.

Topics of research fall under computational functional genomics. In particular:
- Studying the structure, function, and evolution of cellular interaction/regulatory networks
- Developing computational and statistical algorithms to analyze microarray expression data
- Predicting gene/protein function through data integration

Candidate Qualification:
- Recent Ph.D. in biological science, computer science, or statistics
- Research experiences in bioinformatics or related fields
- Good programming skill
- Experience in machine learning or pattern recognition is a plus

More information about the interdisciplinary program in
computational biology at USC can be found at http://www-hto.usc.edu/
Contacts:Please send CV with contact addresses of 2 references to:

Xianghong Jasmine Zhou, Assistant Professor
Program in Molecular and Computational Biology
Department of Biological Sciences, DRB291
University of Southern California
Los Angeles, CA 90089-1340
Email: xjzhou@usc.edu (preferred)
Phone:(213) 740 7055
Fax:(213) 740 2437
http://www-hto.usc.edu/~xjzhou

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19/09/2003[AGMM]BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868)
Source:
Date de parution:19/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Vers-chez-les-Blanc (Canada/Quebec)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
LOCATION: Vers-chez-les-Blanc

OVERALL OBJECTIVE: Drive innovation to achieve business impact by managing projects in his/her Group and delivering high quality end-products.

MAIN RESPONSIBILITIES AND CHALLENGES:

. Provide leadership, focus and motivational support to his/her group.
. Implement NRC and Departmental strategy and Departmental policies within the Group.
. Collaborate with other Group Managers and Project Leaders to define bioinformatic needs and prioritize, launch, terminate projects/activities in his/her portfolio accordingly.
. Lead the Bioinformatics Group to be innovative and proactive to anticipate needs of NRC researchers.
. Manage Group members, including objectives setting and appraisal, to ensure timely delivery of high quality results.
. Ensure quality and documentation of bioinformatics work and training of NRC users.
. Interact and communicate effectively with business and scientific partners (internally and externally) and provide technical assistance as fitted.
. Manage allocated budgets (investments, external contracts) Recruit, integrate, coach and develop people.

REPORTS TO: NRC Department head

EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED: University degree (PhD or equivalent) in bioinformatics. Basic knowledge of human biology or physiology and min of 5 years of industrial experience managing a Bioinformatic Group.

LANGUAGE: Verbal and written communication skills in English.

DATE NEEDED: ASAP
Contacts:CONTACT: Please attach a CV with names of three references (postal and e-mail addresses), on http://www.careers.nestle.com website. (Ref.868)


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18/09/2003[AG]three PhD positions in Bioinformatics
Source:
Date de parution:04/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Callaghan (Australie)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
1431 (Evolutionary Algorithms and Optimization Methods
for large-scale problems in Bioinformatics),

1432 (Algorithmic approaches for problems in Proteomics,
Molecular Modelling and Drug Design)

1433 (Novel Statistical and Optimization Methods for the Life Sciences).

These numbers correspond to the entries in the Jason Postgraduate
Scholarship Database for Australia:

http://www.jason.unimelb.edu.au

where the complete information can be retrieved. Please follow the link and the procedures described in the Jason
database.

In addition, the University offers other Scholarships

http://www.newcastle.edu.au/study/scholarships/index.html

which may relate to other Bioinformatics ongoing projects at Newcastle.
These other scholarships may suit International Students and have a closer deadline in some cases.

More information about the Newcastle
Bioinformatics Initiative is available from the web site at:

http://www.cs.newcastle.edu.au/~nbi

As you can probably see from the scholarships announcements,
we are interested in people who have already some expertise
in algorithmic engineering and in solving large optimization
problems with combinatorial optimization methods, metaheuristics and exact techniques.
Contacts:Dr. Pablo Moscato
Newcastle Bioinformatics Initiative - Director
Postgraduate Director for Computer Science
School of Electrical Engineering and Computer Science
The University of Newcastle, Callaghan, 2308, NSW
AUSTRALIA
moscato@cs.newcastle.edu.au
Phone : +61 2 4921 6056
Fax: +61-2-4921-6929

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18/09/2003[AG]Post-doctoral position in microarray data analysis
Source:
Date de parution:18/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bâle (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
We seek a highly motivated and enthusiastic scientist who is interested in cutting-edge genomics and bioinformatics approaches that include large-scale expression profiling and genome wide identification of protein-DNA interactions in the field of meiosis, gametogenesis and germline development. Our lab operates a high density oligonucleotide microarray platform that enables researchers interested in statistical and clustering aspects of microarray data analysis to work with very
large and very well documented data sets.

We are a member of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), a
prestigious association of laboratories that work in the field of
computational biology. The Biozentrum and the SIB provide an excellent wet lab and IT infrastructure, full support for the recently established Department of Bioinformatics and a highly stimulating, international academic environment.

Candidates should be familiar with statistics of microarray data
analysis, statistical languages and environments (R, S+), programming languages (PHP, Perl), database management systems (Oracle, MySQL), and be comfortable in a Linux development environment.
Contacts:Please send your CV and the names of two references to
Prof. Michael Primig
Department of Bioinformatics
Biozentrum, University of Basel &
the Swiss Institute of Bioinformatics
Klingelbergstrasse 50/70
CH-4056 Basel / Switzerland

Phone Office: +41 61 267 20 98
Phone IT-Office: +41 61 267 15 78
Fax: +41 61 267 33 98
http://www.bioz.unibas.ch/primig
http://www.isb-sib.ch
http://www.bioz.unibas.ch/corelab
http://www.germonline.org

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18/09/2003[AGMM]plusieurs postes de Bioinformatique
Source:
Date de parution:18/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lausanne/Geneve/Bale (Suisse)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Pour info, plusieurs postes sont a pourvoir a l'institut Suisse de Bioinformatique:
* Annotator HAMAP-Swiss-Prot
* Post-doctoral position available
* Code Optimization Scientist
* Genomics Scientist
* Proteomics Scientist
Contacts:Toutes informations utiles a l'url suivante:
http://www.isb-sib.ch/infos/careers.htm

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09/09/2003[MM]BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist
Source:BioJobs
Date de parution:09/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu: (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Responsibilities: Join GE's research in molecular imaging as a
Bioinformatics Scientist, working with world-class experts in imaging physics, molecular biology, and medicinal chemistry, developing the next generation of molecular diagnostics. We need experts in bioinformatics analysis of protein pathways and gene expression to develop tools and techniques for discovering molecular imaging targets and apply these techniques to the study of specific diseases. Projects will involve developing platform technologies for integrating many disparate types of
public and proprietary genomic and proteomic data along with analysis methods to elucidate pathways and identify molecular imaging targets.
Collaborate with GE’s luminary academic and commercial scientific
partners both to develop next generation diagnostic products and to publish research results.
Requirements: Candidates need to have either a PhD in bioinformatics or computational biology, or degrees in both biological and computational sciences, with one being at the PhD level.
·Knowledge of molecular disease mechanisms and pathways.
·Knowledge of genomics and analysis of DNA microarray data.
·Mathematical and computer science background.
·Published work in the bioinformatics field.
·Excellent communication skills (verbal, written, presentation).
·Ability to work effectively in teams.
Demonstrated experience in one or more of the following areas would also be highly desirable:
·Experience in building computational models of biological phenomena.
·Experience in statistical analysis of biological data.
·Experience with microarray tools and algorithms, knowledgeable about their limitations and research areas. ·Experience building
bioinformatics databases and software tools.
Desired: ·Experience in pharmaceutical or biotech industry.
·Experience as Principal Investigator on funded research grants.
·Leadership / coordination ability.

We offer a competitive salary, outstanding benefits package and the professional advantages of an environment that supports your development and recognizes your achievements.
Contacts:To apply to this position, please click on this link.
https://www.research.ge.com/eHire
Please enter GECRD/319910/WB2273 in the job reference code field.

An Equal Opportunity Employer.

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03/09/2003[AG]RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS
Source:ABGe-1229
Date de parution:26/08/2003Date limite de réponse:26/09/2003
Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
DTI-FUNDED “BEACON” PROJECT ON BAYESIAN MODELLING OF METABOLIC AND TOXIC PROCESSES

This is an exciting opportunity for an ambitious and highly computer literate Research Associate with a PhD in chemistry, biochemistry, chemometrics, bioinformatics or cognate subject who is looking to develop their career in the field of metabonomics and whole organism metabolic modelling. The post holder will be part of a post-doctoral team working to develop novel Bayesian methods to model quantitative metabolic data generated by NMR spectroscopy and mass spectrometry of biofluids and be under the supervision of Prof. Jeremy Nicholson, Head of the Biological Chemistry Section (in association with Profs. Steve Muggleton and Mike Sternberg in Computer Science).
In particular the post-holder will be involved in the multivariate statistical analysis of spectroscopic data. A knowledge of NMR spectroscopy and/or mass spectrometry would be
advantageous, but is not essential.

The position is available immediately for a period of 2.5 years. Salary will be on the RA1A scale: £18,265 - £27,390 per annum plus £2,134 London Allowance.
Contacts:Further details and an application form can be obtained from :
- Nahid ASHBY (phone +44 20 7594 3225)
email n.ashby@imperial.ac.uk
- Dr. Marc-Emmanuel DUMAS, m.dumas@imperial.ac.uk

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03/09/2003[AGMM]Developpeur Web pour le site La main a la pate
Source:ABGf-3227
Date de parution:26/08/2003Date limite de réponse:26/09/2003
Lieu:Montrouge (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 26/08/2003
Date de fin de diffusion prevue : 26/09/2003

Description du poste :
La main a la pate cherche un developpeur Web avec une bonne experience professionnelle. Cette personne aura en charge le developpement du nouveau site Internet de La main a la pate, ainsi que des applications d’administration et de gestion de ce site.
Une tres bonne maitrise des langages et technologies du Web dynamique (XML, PHP/MySQL, JAVA, PERL) ainsi que des notions en UML seront indispensables. Les systemes Unix et Windows 2000 serveur seront egalement connus.

Contrat :
Duree : 1 an
Salaire mensuel net : 2000 euros
Lieu : Montrouge (92)
Date de debut : septembre - octobre 2003

La main a la pate :
Creee en 1996 a l’initiative de Georges Charpak, prix Nobel de physique et membre de l’Academie des sciences, La main a la pate est une dynamique de renovation de l’enseignement des sciences a l’ecole primaire. Cette renovation vise a promouvoir une demarche d'investigation scientifique en articulant apprentissages scientifiques, maitrise des langages et
education a la citoyennete.
La main a la pate a mis en place un site Internet
(http://www.inrp.fr/lamap) sous la responsabilite de l'Academie des sciences et de l'Institut National de Recherche Pedagogique. Ce site a ete concu comme un outil d’autoformation pour les enseignants du primaire : ces derniers peuvent y trouver des ressources pedagogiques et scientifiques, en proposer, faire evoluer le corpus existant, faire appel a un scientifique
ou un formateur pour l’aider a mettre en oeuvre des activites dans sa classe, debattre de questions relatives a l’enseignement des sciences, contacter des collegues de sa region, participer a des projets scientifiques avec d’autres classes…
L’utilisation grandissante (140 000 visiteurs par mois) et reconnue (premier prix europeen e-learning en decembre 2001) du site temoigne de l'importance de cet outil pour la communaute enseignante. Il est aujourd'hui necessaire de faire evoluer le site Internet La main a la pate vers une plus grande dynamicite, tant sur l’acces aux ressources que pour la mise en place d’outils de production, d’echanges et d’administration.
Contacts:Lettre + CV a Monsieur David Wilgenbus,
david.wilgenbus@inrp.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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02/09/2003[AG]Bioinformaticien confirmé
Source:
Date de parution:24/07/2003Date limite de réponse:30/09/2003
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:

Référence à rappeler : Drh-588
Date de publication : 24 juillet 2003
Date de clôture : 30 septembre 2003

Au sein d'un laboratoire de recherche en génétique et génomique
végétales travaillant avec des équipes de renommée mondiale, vous
participerez à un enjeu stratégique de premier plan: approfondir la connaissance, la compréhension et la représentation du génome des plantes cultivées tropicales. Bio-informaticien, vous êtes attiré par ce défi et souhaitez travailler dans l'environnement scientifique de la Génopole de Montpellier

Descriptif du poste :
Le poste s'intègre dans l'équipe de bio-informatique d'une unité
d'analyse des polymorphismes chez les plantes cultivées tropicales et méditerranéennes. En partenariat avec différentes équipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amélioration des méthodes pour l'analyse bio-informatique des données issues des travaux de séquençage de grands fragments chez les Monocotylédones et de génotypage chez différentes espèces.
Il contribuera à l'intégration de différentes méthodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation comparative) et réalisera les développements bio-informatiques nécessaires. Il élaborera les approches bio-informatiques adaptées aux études d'association et de
déséquilibre de liaison chez des espèces à biologie variée.

Profil souhaité :
Doctorat en bioinformatique, avec une expérience significative dans le domaine de l'analyse de séquences. Une expérience post-doctorale serait appréciée.
Bonne connaissance des outils d'annotation (détection de motifs,
logiciels de prédiction de gènes...).
Maîtrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc.
Connaissance des modules informatiques spécifiques de la
bio-informatique : Bioperl, BioJava,BioPipeline, etc...
Expérience de la modélisation.
Bonne culture générale en génétique et biologie moléculaire.
Aptitude à la communication interdisciplinaire.
Esprit d'équipe, bon relationnel

Date de prise de fonction :
Dés que possible
Contacts:Renseignements sur le poste :
Brigitte Courtois 04.67.61.56.94
Avenue Agropolis
34398 Montpellier Cedex 5 France
Tel: (33) 04 67 61 56 94
Fax : (33) 4 67 61 56 05
e-mail: brigitte.courtois@cirad.fr

ou Manuel Ruiz 04.67.61.56.31

[ Contacts ]
Cirad: http://www.cirad.fr
Cirad-Drh/Emploi
TA 174/04
34398 Montpellier Cedex 5, France
emploi@cirad.fr


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11/08/2003[AG]RESEARCH POSITION
Source:
Date de parution:02/08/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Montreal (Canada/Quebec)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
Comparative and Evolutionary Genomics/Bioinformatics.
Faculty Position, Canadian Institute for Advanced Research

The Department of Biochemistry at the Faculty of Medicine
invites applicants for a faculty position at the Assistant Research Professor level in the areas of Comparative and Evolutionary Genomics, and Bioinformatics. This position implies a prestigious Scholar appointment in the Evolutionary Biology Program of the Canadian Institute for Advanced Research (CIAR). The successful candidate will have demonstrated excellence in the field of bio- informatics and/or genomics. Preference will be given to candidates with experience in evolutionary biology. He or she is expected to establish an innovative research program, and participate in teaching at both the undergraduate and graduate levels. Salary and startup funds will be commensurable with qualifications and experience, and successful candidates will be eligible for considerable infrastructural support through the Canada Foundation for Innovation.
Contacts:jobs@bch.umontreal.ca

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03/08/2003[MM]Postdoctoral Fellowship
Source:
Date de parution:04/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu: (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Postdoctoral Fellowship under the direction of Dr. Ruth Nussinov, in the Laboratory of Experimental and Computation Biology, to conduct research on protein folding and binding. Will involve computational investigation of structural and functional genomics, and the inter-relationship between protein structure and function and probe the coupling between protein folding and function, and protein binding mechanisms. These
studies are currently at the forefront of structural bioinformatics, with direct implications for protein and for drug design. Will work with novel, state-of-the art computational tools toward these goals.

Ph.D. degree and strong background in molecular calculations; extensive knowledge in protein structures and in molecular simulations; a strong background in biophysics, computational chemistry or structural biology required.

SAIC-Frederick, Inc., a subsidiary of SAIC, is the Operations and
Technical Support (OTS) Contractor for the National Cancer Institute at Frederick (NCI-Frederick) a federally funded research and development center. The mission of SAIC-Frederick, Inc. is to provide scientific, technical, management, administrative, and logistical support to National Institutes of Health (NIH) intramural laboratory research and development related to the causes of and cures for cancer and AIDS.
Intramural research is that conducted by Government scientists operating within various units of NIH, principally the National Cancer Institute (NCI), and the largest institute of NIH. We also conduct basic and applied research in cancer and AIDS; operate and manage the Advanced Biomedical Computing Center (ABCC), the world’s only supercomputer devoted exclusively to biomedical research; and conduct large drug and natural product screening programs.
Excellent salary and benefits accompany our positions, including the opportunity to become an employee-owner in the nation’s largest employee owned research and engineering company.

Job Information
Position Type: Post-Doctoral Research Fellowships
Reference (Job ID number): KMB058452
Start Date: ASAP
Duration: Full Time
Status: open
Contacts:SAIC-Frederick, Inc.
Basic Research Program
D. Higdon
higdon@ncifcrf.gov
http://saic.ncifcrf.gov
How To Apply: email CV or apply online at http://saic.ncifcrf.gov;
or www.saic.com

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03/08/2003[AG]Chef de projet bioinformatique au Genoscope
Source:ABG-7916
Date de parution:02/07/2003Date limite de réponse:02/09/2003
Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 02/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 02/09/2003

Le Genoscope – Centre National de Sequencage recrute un Chef de Projet Bioinformatique, responsable de sa plate-forme d'annotation.

Le Genoscope, composante du GIP CNRG (Consortium National de Recherche en Genomique), mene des projets de genomique a grande echelle en collaboration avec des laboratoires experts de la biologie des organismes concernes, et developpe ses propres thematiques de recherche dans le cadre de l’UMR Genoscope/CNRS/Universite d’Evry « Structure et Evolution des Genomes ».

L’equipe bioinformatique est fortement implique dans l’annotation et l’analyse des genomes sequences au Genoscope, ainsi que dans le developpement de methodes et outils bioinformatiques lies aux differents programmes de recherche. Elle se compose a l’heure actuelle de 9 chercheurs et ingenieurs, qui travaillent en collaboration etroite avec les
biologistes du Centre. L’equipe bioinformatique collabore egalement de pres avec le service Informatique (15 personnes), charge de l’informatique liee a la production de sequences, des processus de traitements automatises, et de la gestion de l’infrastructure materielle et logicielle.
Le Genoscope dispose d'un systeme de calcul a haute performance, constitue principalement d'un cluster Compaq Alpha a 8 membres et 40 processeurs, et d’un espace de stockage.de 10 To.

Le candidat prendra la responsabilite de l’evolution de la plate-forme logicielle d’annotation du Genoscope : expression des besoins, specification fonctionnelle, conception de l’architecture, integration de composants logiciels existants et developpements nouveaux.
Il sera seconde dans sa mission par une petite equipe de 2 bioinformaticiens.

Competences requises :

Au minimum 4 ans d'experience
Bonne connaissance et experience de developpement sous Perl et de C++ ou Java
Experience de la gestion d’un projet de developpement consequent
Excellente maitrise de l’environnement Unix dans un contexte de calcul scientifique a haute performance (calcul distribue, grands ensembles de donnees)

Competences appreciees :

Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (notamment lies a analyse de sequences) Bonne connaissance des SGBD relationnels (modelisation, administration)
Anglais courant

Formation souhaitee : ecole d’ingenieur generaliste, ecole d’informatique, ou 3eme cycle

Date de prise de fonction : Septembre 2003
Contacts:Candidature a adresser par courrier electronique a Vincent Schachter (vs@genoscope.cns.fr)

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003[AG]Bourse de These en Microbiologie
Source:ABGt-3122
Date de parution:16/07/2003Date limite de réponse:15/08/2003
Lieu:Brest (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 16/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 15/08/2003

Proposition de sujet :
Le laboratoire dispose d'une collection originale d'Archaea
hyperthermophiles du groupe des Thermococcales (Pyrococcus, Thermococcus), isolees a partir d'echantillons preleves sur des
sources hydrothermales oceaniques de divers sites des oceans Atlantique, Pacifique et Indien. Un premier crible realise sur 190 isolats a revele la presence de nombreux plasmides de differentes tailles (2,8 a plus de 30kb) chez plus de 40% des isolats examines suggerant que ces elements joueraient un role important dans la b iologie des communautes microbiennes des sources hydrothermales.
A ce jour, seuls deux petits plasmides presents chez des Archaea de ce groupe ont ete decrits, dont l'un, pGT5 dans notre laboratoire a permis la mise au point du premier systeme de
transformation chez ces organismes.
Les objectifs de cette these sont d'etudier la diversite et la
biogeographie de ces elements genetiques, de rechercher les homologies de sequence et d'analyser celles-ci pour mettre
en evidence les structures conservees impliquees dans les fonctions de maintenance, de replication et de propagation et enfin de trouver des indices de transferts horizontaux de genes. Par ailleurs, la comparaison avec les genomes d'Archaea hyperthermophiles apparentees devrait permettre de mieux comprendre le role des plasmides dans la plasticite des genomes de leurs hotes.

Qualifications :
Le candidat ou la candidate detiendra un DEA en microbiologie, genetique ou biologie moleculaire.
Il ou elle possedera des competences en genetique bacterienne, en
biologie moleculaire et en bioinformatique.

Lieu :
A l'IUEM, Technopole Brest-Iroise, place Nicolas Coppernic, 29280
Plouzane, principalement dans le laboratoire de Microbiologie Marine (UMR 6539) de l'IUEM, mais egalement au laboratoire de "
Microbiologie et Biotechnologies des Extremophiles " IFREMER, les deux laboratoires fusionnant en une nouvelle UMR debut 2004.

Debut de la these :
Octobre 2003

Financement :
Bourse regionale pour 3 ans
Contacts:Les candidats et candidates sont pries de transmettre pour le 15 aout au plus tard leur dossier comprenant un CV, un resume du stage de DEA, une lettre d'intention ainsi que le nom d'une
personne de reference a :

daniel.Prieur@univ-brest.fr
et marc.leromancer@univ-brest.fr

les candidats et candidates retenus seront auditionnes la premiere quinzaine de septembre.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003[AG]bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis
Source:
Date de parution:31/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la Génopole d’Evry (banlieue sud de Paris) pour travailler sur l’organisation du génome de la vigne et mener des recherches en génomique comparative avec Arabidopsis thaliana. Cette étude sera réalisée dans un groupe d’environ 50 personnes travaillant en génomique végétale et ira d’études bioinformatiques à la validation des hypothèses à la paillasse. Le salaire brut sera d’environ 2900€.

La Génopole (www.genopole.org) est une « vallée de la génétique » qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d’entreprises de biotechnologie autour de l’Université d’Evry-Val d’Essonne.

Le candidat, titulaire d’une thèse et travaillant actuellement en dehors de la France, sera fortement intéressé par la génomique comparative. Des expériences en bioinformatique (analyse et comparaisons multiples de séquences essentiellement) et en génétique (cartographie génétique et/ou physique) sont demandées.
Contacts:SVP envoyez un CV à adam@evry.inra.fr (http://www.evry.inra.fr).

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03/08/2003[AG]Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)
Source:
Date de parution:18/07/2003Date limite de réponse:25/08/2003
Lieu:Gif sur Yvette (France)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Le Centre de Génétique Moléculaire (CGM) Unité CNRS, situé à Gif sur Yvette (91) recherche un Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS).
Celui-ci sera intégré à la plate-forme de bio-puces dirigée par Lon Aggerbeck, et plus précisémént à l'équipe de Bio-informatique dirigée par Hervé Delacroix.
Il participera à la mise en place et à l'interfaçage des outils
d'analyses statistiques et de clustering (développés en R), ainsi que des outils d'analyse d'images avec la base de données de transcriptome.
Profil : Vous connaissez plusieurs langages de programmation, en
particulier des outils de développement web (HTML, Java, SOAP, expresso, TomCat, ...), des langages de script (perl, php, ...) et avez une expérience de la gestion des bases de données (JDBC, PostgreSQL, MySQL, Oracle, ...).
Des connaissances en statistiques seront particulièrement appréciées.

Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminée d'une durée maximale de 6 mois, disponible à partir du 1er octobre.
Contacts:Les candidats intéressés doivent faire parvenir une lettre de motivation ainsi qu'un curriculum vitae détaillé avant le 25 aout à l'adresse suivante:

Pr Hervé DELACROIX
Centre de Génétique Moléculaire
CNRS UPR 2167
91198 Gif-sur-Yvette Cedex

mail : delacroix@cgm.cnrs-gif.fr

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03/08/2003[AG]Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS
Source:
Date de parution:03/08/2003Date limite de réponse:?
Lieu:St Louis (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
LOCATION: Nestlé Purina Petcare PTC - St Louis, Missouri
JOB DESCRIPTION:
Interact with multi-disciplined scientist teams including nutritionists, animal scientists, molecular biologists, geneticists and other bioinformaticians working against multiple projects. Responsibilities will include input against
experimental design and output, focusing on integrating experimental data, bioinformatical analyses and statistics.
REPORTS TO: Manager of Molecular Biology group
RESPONSIBILITIES:
The position is responsible for leading projects and participating on project teams that conduct basic, non-invasive nutrition research to benefit cats and dogs. The successful candidate will have the capability of using their molecular biology and bioinformatics expertise to aid our product
development scientists to develop products with unique nutritional or wellness claims. The candidate will be expected to collaborate as necessary with other Nestle R&D Centers as well as Universities to stay current in the field. Occasional
travel to other R&D Centers and Universities is required.
EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED:
.. Minimum of BS Degree in Molecular biology or related field (PhD degree highly preferred)
.. Three years experience using bioinformatics and biostatistics with a strength in combining statistics and bioinformatical analyses
.. Research experience working with microarray, rtPCR and comparative genomics data

LANGUAGES NEEDED: English necessary. French an added positive
OTHER SKILLS REQUIRED: Excellent computer skills required as well as good verbal and written communication skills. Must have excellent teamwork skills.
DATE NEEDED: Immediately
Contacts:CONTACT: Bob Foley
3916 Pettis Rd
St. Joseph, MO 64503
Phone-816-387-4103
Fax-816-387-4115
robert.foley@rdmo.nestle.com
Nestle Purina Petcare PTC is an equal opportunity employer (M,F,D,V)

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26/06/2003[AG]MC de bioinformatique
Source:BioInfo
Date de parution:26/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Nice (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
L'Université de Nice Sophia Antipolis demandera un poste de MC de
bioinformatique pour la rentrée 2004.
Le profil retenu est "fouille de données, génomique et protéomique".
Dans le cadre des recherches faites sur le campus actuellement, data mining et/ou ontologies en relation avec les puces à ADN semble être le domaine qui pourrait être privilégié, mais sans pour autant exclure d'autres candidats en fonction de leur dossier.

Comme d'habitude, une expérience post-doctorale ayant permis
l'acquisition d'une double compétence sera un réel avantage, mais un stage post-doctoral ne sera pas exigé du candidat.

Les éventuels futurs candidats, peuvent me contacter par email pour plus de détails et discussions.
Contacts:Richard CHRISTEN
UMR6543 CNRS - Université de Nice Sophia Antipolis
Biologie Virtuelle.
Centre de Biochimie. Parc Valrose.
06108 Nice cedex2
christen@unice.fr
tel 33 - 4 93 76 52 10
fax 33 - 4 93 76 52 19


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23/06/2003[AG]Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie
Source:BioInfo
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:11/07/2003
Lieu:Paris (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (Paris)
recherche un : Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie (CDD INSERM)

Vous serez intégré à l'Institut Fédératif de Recherche du
Département de Biologie dirigé par Patrick Charnay. Plus précisément, vous serez rattaché aux plates-formes du transcriptome et d'Imagerie dirigées par Claude Jacq et Antoine Triller. Vous participerez aux analyses informatiques des
images de ces services, ainsi qu'à la mise en place des outils nécessaires à leur réalisation. Vous serez plus particulièrement conduit à travailler sur des thématiques liées à l'imagerie.

Mission :
Des outils d'analyse des puces à ADN, commerciales ou
fabriquées localement, ont été mis en place (GenePix). Vous assurerez le maintien de ces outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d'analyse.
Vous serez chargé d'assurer le bon fonctionnement des outils de la plate- forme et de vous tenir au courant des évolutions du secteur.
Des robots sont disponibles sur la plate-forme pour la gestion
des matériels biologiques. Vous aurez en charge le fonctionnement
des programmes de ces robots ainsi que le développement d'outils
automatisés permettant par exemple la reconnaissance de colonies sur boîtes.
Vous aurez en charge une partie de la formation des utilisateurs
aux techniques d'analyse d'images des puces à ADN.

Profil :
Vous connaissez plusieurs langages de programmation et vous
avez l'expérience des programmes d'automatisation des tâches
plus particulièrement dans le domaine de l'imagerie. La maîtrise des outils de développement d'interface web (HTML, Javascript, .), des langages de script (PHP, perl, .) et de la gestion des bases de données (SQL) serait un plus.
Des connaissances en biologie seront particulièrement appréciées.

Perspectives :
Ce poste s'inscrit dans la politique de développement de la
bioinformatique et de l'imagerie dans le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure . Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminé disponible immédiatement jusqu'au 30 novembre. Ce poste est accordé avant le recrutement d'un ingénieur d'étude par l'INSERM par concours national.
Vous pourrez ensuite vous présenter à ce poste. Les conditions salariales sont celles des ingénieurs d'études de l'INSERM.

L'arrêté d'ouverture est paru, la date limite de retrait des dossiers est fixée au 11 juillet et la date limite de depôt au 15 juillet

Contacts:Envoyez vos références à Stéphane LE CROM : lecrom@biologie.ens.fr

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23/06/2003[AG]Computational Biologist
Source:bambct-list@molbio.mgh.harvard.edu
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Waltham (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
JOIN A FAST PACED VENTURE BACKED BIOTECHNOGOLGY START-UP

engeneOS was formed in late 2000 to exploit the tremendous opportunity created by the genomics revolution in the biological sciences merged with cutting edge technologies from the physical and information sciences. We are a pioneer in establishing the field of Biomolecular Engineering to enable the design and construction of programmable Biomolecular Machines from natural and artificial building blocks. These Biomolecular Machines will serve a broad range of commercial applications including biosensors, chemical synthesis and processing, bio-electronic devices and materials, nanotechnology, functional genomics and drug discovery.

Founded and lead by an extraordinarily talented group of advisors/partners and management team, engeneOS is a fast paced entrepreneurial organization providing talented people with the opportunity for growth, development and contribution to our dynamic and growing organization.

We are seeking a high energy, dynamic individual to join our team as a Contract to Permanent Computational Biologist.

Contract Computational Biologist

As a key member of our dynamic interdisciplinary team you will actively participate in developing innovative solutions for complex computational biological problems. The ideal candidate should have the following:
-strong biology (especially genomics) and bioinformatics background
-familiarity with genomics database (Genbank, Protein database) and data mining
- Proficiency in search algorithm and database programming with experience in writing multiple applications that interface with databases (MySQL, PostgreSQL, Oracle)
- Statistical Analysis, Proteomics
- Experience with the following technologies:
- C or C++ or Java
- Perl or Python
- GUI development (Swing, GTK+, Tk)

Excellent written and verbal communication skills are required along with the ability to work under aggressive timelines.

engeneOS offers a competitive compensation and benefits package including, medical and dental coverage, Flexible Spending Accounts, Life & Disability Insurance, and stock options.engeneOS is an equal opportunity employer.
Contacts:Please submit your resume/CV to:jobs@engeneos.com
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Jennifer Neves
Staffing Specialist
Compound Therapeutics
1365 Main Street
Waltham, MA02451
PH: (781) 891-3745 x 321
FAX: (781) 891-3796
jneves@compoundtherapeutics.com

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13/06/2003[MM]These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole
Source:ABGt-2938
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:06/07/2003
Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 10/06/2003
Date de fin de diffusion prevue : 06/07/2003

Modelisation microscopique et optimisation des proprietes de molecules d’interet pharmaceutique :
complementarite avec des etudes experimentales

Plusieurs molecules d’interet pharmaceutique, ayant une action
anti-tumorale reconnue, ont fait l’objet d’etudes structurales poussees. Par exemple le busulfan a ete etudie au laboratoire SPMS, sous la responsabilite de N. Ghermani. Cette molecule, et d’autres, ont pu etre cristallisees, et etudiees par diffraction X haute resolution : ceci a permis une analyse detaillee de la densite electronique(1).
La comprehension du comportement alkylant d’une telle molecule au niveau de l’ADN ou des cellules necessite une analyse theorique poussee.
Cette molecule est par ailleurs tres active, et des etudes sont en cours pour en empecher la cristallisation en milieu biologique, cause reconnue de deces. Il s’agit essentiellement d’encapsuler des molecules, tout en maintenant la reconnaissance des sites d’action bio-chimique.
En dehors du travail primordial de pharmaco-technie, il apparait
important de comprendre par voie theorique puis de controler par modelisation les mecanismes microscopiques qui sont en jeu. Cet objectif est commun a de nombreuses molecules vectorisees par des nano-particules pharmacologiques.
Les grandes phases du travail de these seraient les suivantes :
1. Etude theorique de la molecule de busulfan (et aussi d’autres
molecules presentant la meme problematique de forte cristallisation) et comparaison avec les
resultats experimentaux .
Modelisation de l’interaction molecule-ADN.
2. Modelisation des forces de cohesion qui favorisent la
cristallisation. Cette phase fera largement appel a la description d’un solide en termes de « clusters ».
3. Description des interactions dans une molecule en capsulee dans un vecteur ou une nano-particule. Dans cette phase, a la fois l’approche par cluster et la modelisation conformationnelle developpees ces dernieres annees seront importantes.

Ce travail trouvera un prolongement sur des objectifs plus larges :
4. Modelisation des interactions entre nanoparticules.
5 . Modelisation de l’interaction complexe-site actif.

Un tel projet s’inscrit directement dans la ligne des travaux developpes au niveau theorique dans l’UMR ces dernieres annees, ainsi que dans l’operation scientifique « materiaux d’interet pharmaceutique », mixte UFR de Pharmacie / ECP. Il permettrait un pont avec une operation scientifique prioritaire actuelle. Il est certain que l’etude ne peut avancer que par une interaction permanente entre des composantes pharmacotechnique, structurale et theorique.

Le directeur de these serait Jean Michel Gillet, soutenu en co-direction par Nour Eddine Ghermani d’une part (pour les aspects biochimique et structural) et Pierre Becker d’autre part (concernant la reflexion sur les modeles a mettre en œuvre)

A noter enfin qu’une telle collaboration, si elle est un succes, peut deboucher sur des applications a terme mettant en jeu des grands groupes pharmaceutiques.

Jean Michel GILLET, ECP et SPMS
Nour Eddine GHERMANI, Paris XI et SPMS
Pierre BECKER, ECP et SPMS

References :
1. Experimental electron density and electrostatique potential analysis of Zinc (aspirinate)2(H2O)2 complex : a 3d10 metal bonding to a drug ligand A. Spasojevic-de Bire, N. Bouhmaida, A. Kremenovic, G. Morgant, N.E. Ghermani (2002), J. Phys.
Chem. A, 106, 12170-12177

2. A new approach to the electron distribution in flexible molecules. Application to conformational analysis P. Becker, E. Bec, (1996) Chem. Phys. Letters, 260, 319

3. Interpreting Compton anisotropy of ice Ih : a cluster partitioning method S. Ragot, J.M. Gillet, P. Becker, Phys Rev. B, 63, (2002) 235115-1 to 235115-6

4. Electrostatic properties of ibuprofen
N.E. Ghermani, M. Dutheil, P. Becker, J. Chem. Phys. (2002), 117,
205-212

Une bonne formation en physique ou chimie quantique est essentielle.
Une precedente experience dans la modelisation moleculaire serait
appreciable.
Un bon classement de DEA sera un atout favorable, sinon determinant,dans l'obtention d'une bourse de l'Ecole Doctorale de l'Ecole Centrale Paris.
Tous les cours de l'ECP sont accessibles aux doctorants du laboratoire SPMS, avec la possibilite de valider le Diplome d'Etudes Superieures Professionnelles delivre par l'Ecole Centrale Paris.
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.
Contacts:Envoyer un CV ainsi qu'une lettre de motivation (sous la forme d'un courrier electronique avec CV en document attache) a gillet@spms.ecp.fr

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11/06/2003[MM]POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS
Source:BioInfo
Date de parution:11/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:La Jolla (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for a postdoctoral position starting September 2003 or later in the Department of Biochemistry & Molecular Biology within the Center for Biological Modeling at Michigan State University (http://biomodel.msu.edu/). The position is available initially for 1 year with the possibility for extension.

Research interests focus on three main areas: Modeling of large
supramolecular assemblies, in particular interactions between mismatched DNA and the mismatch recognition protein mutS; development of hybrid explicit/implicit solvation methods; and development and application of novel methods for protein structure prediction and refinement.

Ideal candidates would have a strong background in computational or theoretical chemistry, biophysics, biochemistry, structural biology or related discplines. Familiarity with computational chemistry methods, experience in molecular modeling and simulation of biological systems, advanced programming skills, knowledge of the UNIX/Linux operating system, and an interest in developing new methodologies are highly desirable.

MSU, located in East Lansing, Michigan, provides a unique and
challenging interdiscplinary research environment at the interface of biological and physical sciences. East Lansing, located between the Great Lakes, offers a pleasant living environment with many cultural events and excellent opportunities for outdoor activities.
Contacts:Interested applicants should send a curriculum vitae, including relevant experiences, a list of publications, and contact information of three references, to the address listed below. Electronic responses are highly encouraged.

Michael Feig
Department of Molecular Biology, TPC-6
The Scripps Research Institute
10550 N Torrey Pines Road
La Jolla, CA 92037
USA
email: meikel@scripps.edu

http://www.scripps.edu/~meikel/msu/feig.html

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=1856

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10/06/2003[MM]Postdoctorals Fellowships in Structural Molecular Biology at the EMBL Outstation
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Grenoble (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
The European Molecular Biology Laboratory (EMBL) is an international research organization consisting of a headquarters laboratory situated in Heidelberg Germany and four Outstations. The EMBL Outstation in Grenoble has an active research programme in structural molecular biology and shares a common site with the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF) and the Institut Laue Langevin (ILL), world leading centres for X-ray and neutron scattering.
We are seeking to recruit postdoctoral fellows with a strong interest in structural biology who can benefit from the juxtaposition of excellent wet-lab facilities with state-of-the-art beamlines for protein crystallography. Depending on the particular laboratory, candidates should either have a background in molecular biology and biochemistry combined with an interest in structural biology or a background in protein crystallography with some experience in molecular biology and biochemistry.

Fellowships are available in the following laboratories:

Stephen Cusack: Protein/RNA interaction group: the structural basis of protein-RNA recognition in the context of the signal recognition particle and proteins interacting with mRNA or tRNA. e-mail: cusack@embl-grenoble.fr.

Rob Ruigrok: Virus structure group: structure and function of viruses and sub-viral assemblies. e-mail: ruigrok@embl-grenoble.fr.

Christoph Müller: Protein/DNA interaction group: the structural basis of transcriptional regulation, transcription factor/DNA recognition and the mechanism of nuclear transport.
e-mail: mueller@embl-grenoble.fr.

Winfried Weissenhorn: Membrane fusion group: the structural basis for viral and cellular membrane fusion processes. e-mail:
weissen@embl-grenoble.fr.

EMBL is an inclusive, equal opportunity organisation with an exciting and stimulating research environment.

Contacts:Applicants should submit a curriculum vitae, quoting reference no., with concise description of research experience and the names and addresses of at least two referees to:

Head of Outstation,
EMBL
6 rue Jules Horowitz
c/o ILL; B.P. 181;
F - 38042- Grenoble Cedex 9, France;

Fax: 33-4-76-20 77 86.

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10/06/2003[MM]Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche
Source:http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-041.html
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Gif sur Yvette (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-041 DSV
Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire,
Sciences du vivant/Biologie structurale

1. Intitulé du sujet
Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche
bio-informatique et structurale
Topic tittle
SGT1 function in cell cycle regulation probed by biocomputing and
structural biology.

2. Détail du sujet
SGT1 est une protéine très conservée, essentielle à la régulation du cycle cellulaire. Sa fonction exacte demeure inconnue. Prédiction de structure, docking et RMN seront associés pour caractériser comment SGT1 interagit avec ses multiples partenaires biologiques. En étroite collaboration avec des généticiens et des biologistes des plantes, ce travail permettra d'établir le role de la protéine au cours du cycle
cellulaire.

Detailed tittle
SGT1 is an essential component of the cell cycle signalling pathway although its function remains unclear. Structure prediction, docking and NMR will be used to unravel the way SGT1 interacts with its numerous biological partners. In close collaboration with geneticists and plant biologists, this work will shed light on the role of SGT1 in the cell cycle.

3. DEA recommandés
DEA Analyse de génomes et Modélisation Moléculaire. DEA Biophysique Moléculaire.

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Département de Biologie Joliot Curie Service : Service de Biophysique des Fonctions Membranaires

Date souhaitée pour le début de la thèse : 1/09/2003
Contacts:5. Personnes à contacter par le candidat
Raphaël Guerois
LBPM/Laboratoire de Biophysique des Protéines et des Membranes
CEA Saclay. 91191 Gif sur Yvette Cedex
Téléphone : +33 1 69 08 96 79

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10/06/2003[MM]Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP
Source:http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-117.html
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Grenoble (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-117 DSV

Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP

Topic tittle
Structure-function and molecular modelling of MRP-type ABC transporters

2. Détail du sujet
Sur la base des données structurales parcellaires obtenues récemment par microscopie et cristallographie, il s'agira d'élaborer des modèles des transporteurs ABC homologues SUR, YCF1, MRP1 en utilisant les contraintes imposées par nos résultats. Ces modèles permettront d'une part de mieux interpréter les résultats connus et d'autre part de formuler des hypothèses sur les mécanismes et de concevoir des expériences pour les tester. Ce projet demandera des compétences en bioinformatique ainsi qu'en biologie et sera réalisé en parallèle dans l'équipe de simulation et modélisation moléculaire et de l'équipe Transporteurs ABC du laboratoire.

Detailed tittle
On the basis of existing structural data obtained by microscopy and crystallography, models of the homologous ABC transporters, SUR, YCF1 and MRP1 will be constructed using constraints imposed by our experimental results. These models will allow a better interpretation of known data and will constitute a basis for bringing forth hypothesis on the mechanisms and for designing experiments to test these hypothesis.
This project will require knowledge of bioinformatics as well as biology and will be pursued in parallel in the Molecular Simulation and
Modelisation group and the ABC transporters group of the laboratory.

3. DEA recommandés
Modélisation, Mathématiques, Bioinformatique, Biologie Structurale et Fonctionnelle

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Département Réponse et Dynamique
Cellulaires

Date souhaitée pour le début de la thèse : Oct/nov 2003
Contacts:5. Personnes à contacter par le candidat
Serge CROUZY
BMC/Laboratoire de Biophysique Moléculaire et Cellulaire
CEA-DRDC-BMC, 17 rue des Martyrs, 38054 Grenoble
Téléphone : +33 4 38 78 48 48

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10/06/2003[MM]Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire
Source:http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-104.html
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Grenoble (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-104 DSV
Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire
Topic tittle
Numerical Simulation of Intracellular Behavior

2. Détail du sujet
Récemment, il y a une révolution dans la biologie due aux projets
génomiques. Le déluge des données produites par ces projets a changé la façon de penser la recherche en biologie et permet des approches novatrices pour aborder les problèmes biologiques. Le projet proposé pour cette thèse se situe dans le domaine de la biologie post-génomique et a pour but ultime la compréhension des réseaux de protéines - comment ils se comportent et les règles générales qui les gouvernent
Detailed tittle
Recently, there has been a revolution in biology due to the genome projects. The deluge of data produced by these projects has changed the way in which research is done in biology and has led to new approaches to the treatment of biological problems. The project proposed for this thesis falls in the area of post-genomic biology and has as its aim the understanding of protein networks - how they behave and the rules that govern them.

3. DEA recommandés
DEAs de Modélisation, de Physique, de Chimie, de Biologie Structurale ou de Biologie Moléculaire

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Institut de Biologie Structurale

Date souhaitée pour le début de la thèse : octobre 2003
Contacts:5. Personnes à contacter par le candidat
Martin Field
LDM/Laboratoire de Dynamique Moléculaire
IBS 41 rue J. Horowitz 38027 Grenoble
Téléphone : +33 4-38-78-95-94

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10/06/2003[MM]Computational Chemists/C++
Source:Bioinformatics.Org
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Salary plus bonus to 150K+

Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of
experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics,
or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills.
Relevant areas of experience might include the computation of
protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecular systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of
electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with
management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.
Contacts:If you are interested send a Word Attachment copy of your resume to the attention of Norm Davis at normd@cisny.com

[Please Mention Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=1835

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10/06/2003[AG]CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster
Source:BioInfo
Date de parution:28/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Gif-sur-Yvette (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
TRES URGENT: CDD de 12 mois non-renouvelable, niveau IE ou IR selon le diplôme, salaire premier échelon de la catégorie correspondante.

Mots clés: base de données relationnelle, interface web,

Projet:
Dans le cadre de la création d'un centre de ressources biologiques drosophiles organisé en réseau, nous recherchons un ingénieur (ou post-doc) pour développer l'outil de gestion commun sous forme d'une base de données relationnelle. La base recensera l'ensemble des ressources disponibles dans les différents laboratoires partenaires et comportera deux grands types de ressources, - des lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster espèce modèle dont le génome est entièrement connu, - des lignées de populations naturelles et d'espèces variées. (plusieurs milliers de lignées au total)

Mission:
Prendre en charge la conception et la réalisation de la base de données sécurisée (MySql ou PostGreSql) regroupant l'ensemble des lignées et espèces de drosophiles et de l'interface web.

Ce poste est réservé à un candidat qui n'a pas déjà bénéficié d'un CDD avec un établissement public de recherche.

Lieu de travail: CNRS, Gif-sur-Yvette, Populations, Génétique et
Evolution (PGE)
Contacts:Personne à contacter:
Marie-Louise Cariou
Populations, génétique et Evolution - UPR 9034
CNRS - Gif-sur-Yvette
Tél 01 69 82 37 10
Mail: cariou@pge.cnrs-gif.fr

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10/06/2003[AG]Research Associate in biostatistics and
Source:ABGe-1165-Postdoctoral
Date de parution:23/05/2003Date limite de réponse:23/06/2003
Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 23/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 23/06/2003

This is an exciting opportunity for an ambitious post-doc with a PhD in mathematics, statistics, physics or bioinformatics who is looking to develop their career as a biostatistician in the field
of genomics. The post is linked to a Wellcome Trust project, coordinated by Professor James Scott and involving an inter-disciplinary team working to develop the understanding of metabolic diseases and in particular the syndrome of insulin resistance.
You will work directly with Professor Sylvia Richardson, Head of
Biostatistics Group in the Department of Epidemiology for developing and applying multivariate statistical tools to gene
expression data. The post is funded by a Wellcome Trust Thematic grant for Cardiovascular Functional Genomics. The appointment will be for 2 years in the first instance, with a possibility
of a third year.

Further details concerning the Biological Atlas of Insulin Resistance are available on the web pages from the Consortium:
http://www.icggri.ic.ac.uk/bair/index.htm

The appointment will be on the RA1A scale with a minimum of £21,125 per annum plus London Allowance of £2,134 per annum.

Valuing diversity and committed to equality of opportunity.
Contacts:Please contact:
Professor Sylvia Richardson
sylvia.richardson@imperial.ac.uk

Further particular and application form can be obtained from Madeline
Kirk on +44 20 7594 3319, or
email: m.kirk@imperial.ac.uk.

Closing date: 12th June 2003.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003[AG]Postdoctoral Position at MIPS
Source:
Date de parution:23/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Munich (Allemagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for a postdoctoral fellowship to
develop new methods for automatic classification of protein
sequences using machine learning methods.

The input data will include BLAST/FASTA similarity scores,
protein domains and motifs, as well as secondary and tertiary structures predicted by standard bioinformatics methods. The primary classification target will be functional categories (FunCat) developed by the MIPS.

Applicants with a Ph.D. in bioinformatics, computer science/engineering are encouraged to apply. A background in molecular biology as well as demonstrated computer skills (programming in Perl, SQL, C/C++ familiarity with UNIX, Web) are preferred.

The position will be supervised by Prof. H.W. Mewes and Dr. I.V. Tetko.

The salary will be according to BAT IIa. The appointment will be for two years.
The position is available immediately.
Informal inquiries are also welcome.
Contacts:Please send curriculum vitae, names for letters of recommendation to i.tetko@gsf.de, http://mips.gsf.de.

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10/06/2003[AG]Biologist
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:31/05/2003
Lieu:Genève (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist
The BioMinT project is focused on the development of statistical,
machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information:
http://biomint.org/).

The main tasks of the position will consist of:

exploring domain-specific knowledge resources in order to create
lexicons, thesauri and ontologies furnishing sets of document corpora for each stage of tools development and validation
evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators
A university level degree in biology is required, as well as an
experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position.

Eligible candidate for hold a Swiss or European union passport.

Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months

Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva
Contacts:Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to:

Anne-Lise Veuthey

Swiss Institute of Bioinformatics
CMU
1, rue Michel Servet
1211 Genève 4
email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

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10/06/2003[AG]CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services
Source:EMBL Job Vacancy 03/57
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:15/07/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/57

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Heidelberg:


HEAD OF CENTRAL COMPUTING SERVICES

Grade: 9

Duty Station: Heidelberg, Germany

Job Description: The successful candidate will lead a team of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services for the main Laboratory of the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg.

A key task of this team is to provide service and support to the EMBL scientific community at all levels of computing and networking.
Supported equipment includes a broad range of computing devices (from desktop machines, workstations to large servers). The operating system environment is heterogeneous and includes Unix, Linux, MacOS and Windows. The implemented networking technology is state-of-the-art and allows the provision of extensive online services to the worldwide scientific community.

It is essential that the central computing service team collaborate with research groups in computational biology at EMBL. The Head of central computing services is expected to serve as a facilitator for the in-house computational biology community as well as for the EMBL Outstations. The duty of the person also involves support and interaction with the SAP based administrative computing system and consultants.

Qualifications and Experience: Applicants should have a university degree or equivalent as well as having substantial experience in managing and integrating a heterogeneous scientific computing environment, which includes expertise in network security and network administration. The position requires the ability to develop technical concepts and proposals for further improvement of the computing and networking services, including improvement in the areas of the GRID and network security. Previous experience in management of an IT team and skills in negotiating with computer equipment manufactures are highly desirable.


Contract: A contract of 3 yearsí duration will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 15.07.2003
Contacts:EMBL Web site: http://www.embl.de/

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10/06/2003[AG]2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy
Source:ABG-7827
Date de parution:22/05/2003Date limite de réponse:21/07/2003
Lieu:Rochester (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 21/07/2003

There are immediate openings for two postdoctoral positions in
biological NMR at Mayo Clinic and Research Foundation. Several projects involving structural characterization of protein complexes are available.

Applicants should have experience in NMR spectroscopy.
Salary is very competitive and will be determined by the successful candidate's experience. There is an attractive benefit package.

For some general information about research at Mayo Clinic please visit: http://www.mayo.edu/research/

Contacts:Applications, including curriculum vitae and bibliography, and the names of three references, should be sent by email to :

Dr. Georges Mer
Mayo Clinic
Guggenheim 1511B
200 First Street S.W.
Rochester, MN 55905
mer.georges@mayo.edu

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003[AGMM]Senior Scientist Bioinformatics, NITD
Source:http://www.bioplanet.com/planetforums/viewthread.php?tid=1352
Date de parution:13/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Singapour (Singapour)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:

Senior Scientist Bioinformatics, NITD, Singapore

The Novartis Institute for Tropical Diseases in Singapore (NITD) works to advance medical research in the area of progressive infectious and parasitic diseases that affect so many people in the developing world.
Novartis views this as a long term endeavor to enhance the discovery of preventative and effective treatments for diseases like tuberculosis (TB) and dengue, and ultimately reduce the overall affliction of tropical diseases and improve the prosperity of developing countries.

The successful candidate will play an instrumental role in setting up computational biology at the NITD. In close collaboration with the experimental scientist he will computationally support the various research projects and advise biologists and chemists in the use of bioinformatics applications and resources. In addition he will serve as an interface to other bioinformatics research groups in Novartis. He will co-ordinate joint projects and internalize or interface existing in-house resources and applications.

Requirements:

PhD in natural sciences, informatics or related education. Practical working experience, e.g. post doctoral training. Strong background in molecular- and cell-biology and the proven ability to publish in this field. Excellent knowledge of bioinformatics with an emphasis on the analysis of sequences and protein structures. Familiarity with all common bioinformatics algorithms and resources and a profound understanding of how these databases have been compiled. The ability to develop own bioinformatics data-mining strategies and to implement them as software on Unix platforms. Applied knowledge of working with relational databases and the creation of web-based user-interfaces.
Experiences in infectious disease related research would be an asset. As a member of an international, cross-disciplinary team, excellent written and spoken communication skills are essential.

Contacts:Please apply directly via www.novartis.com, Job ID: 18723

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28/05/2003[AGMM]ATER - Bioinformatique - Lille
Source:BioDocs
Date de parution:28/05/2003Date limite de réponse:28/05/2003
Lieu:Lille (France)Statut:ATERSecteur:public
Description de l'annonce:
L'Universite de Lille 1 dispose de postes d'ATER en informatique, avec des besoins d'enseignement en bioinformatique. Les formations concernees sont : DESS Bioinformatique, DESS Proteomique,
DESS Genie Cellulaire, IUP Proteomique et Maitrise de genetique.

La recherche se ferait dans l'equipe Bioinfo du LIFL.

La date limite d'envoi des dossiers est le 28 mai : http://www.univ-lille1.fr/personnels/ater/recrutement_ater.htm
Contacts:N'hesitez pas à me contacter pour avoir plus d'informations :
Helene Touzet, au 03 20 43 68 02 ou touzet@lifl.fr

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21/05/2003[AG]Postdoc modele « plante virtuelle »
Source:ABGt-2813
Date de parution:05/05/2003Date limite de réponse:25/05/2003
Lieu:Grignon (78) (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Integration dans un modele « plante virtuelle » des relations
source-puit et de la senescence au cours du remplissage des grains chez le ble.

Date de debut de diffusion du poste : 05/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 25/05/2003

Contexte des travaux de l’equipe
L’equipe met au point des modeles de fonctionnement de plantes et de population de plantes. Nous developpons en particulier des modeles de « plante virtuelle», fondes sur une representation informatique realiste des plantes. Nous cherchons a integrer dans cette approche les processus essentiels pour la simulation des interactions entre la plante et son environnement, en particulier les stress biotiques (maladies) et abiotiques (ozone,
carence azotee).
Il apparait que l’impact de ces stress est en grande partie lie a une acceleration de la senescence foliaire, probablement due aux modifications des sources et puits de carbone et d’azote. La modelisation de l’effet des contraintes necessite donc la mise au point d’un modele mecaniste de senescence foliaire. Le choix de l’approche « plante virtuelle » permettra de realiser l’integration sur la base d’une representation detaillee des processus, au sein de la plante et dans le temps.

Resume de la proposition : Lors du remplissage des grains chez les cereales, la demande d’azote est superieure aux possibilites de prelevement racinaire et le complement est fourni par remobilisation a partir des organes aeriens. Il en resulte une diminution de la photosynthese qui affecte l’activite racinaire, et accelere le processus. L’objectif de la these sera de mettre au point un modele exprimant ces interactions, et d’evaluer en particulier si la boucle de retroaction decrite plus haut permet de rendre compte de la progression de la senescence foliaire au cours du temps, dans differentes conditions environnementales. Le modele sera developpe selon une approche plante virtuelle developpee dans l’equipe, qui permettra de prendre en compte de facon precise la progression de la senescence au sein de l’architecture et son impact sur l’acquisition du carbone.
La recherche est donc fondee sur l’investigation de processus biologiques, elle inclut une composante importante en modelisation.

Lieu de Travail
INRA : Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France

Profil recherche
Nous recherchons de preference un candidat de formation initiale en biologie, motive par la formalisation mathematique et informatique.

Le candidat doit avoir effectue son DEA en France.
Les candidatures selectionnees par l’equipe seront soumises fin mai a l’Ecole doctorale ABIES pour la decision quant a l’attribution de l’allocation de recherche.
Contacts:Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à :
Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003[AG]charge de cours en bioinformatique
Source:ABGe-1159
Date de parution:?Date limite de réponse:29/05/2003
Lieu:Bruxelles (Belgique)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 13/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 29/05/2003

OUVERTURE DE POSTE

L'Universite Libre de Bruxelles annonce l'ouverture, a partir du 1er octobre 2003, d'un poste de charge de cours a temps plein en bioinformatique en Faculte des Sciences.

Les candidats doivent etre titulaires d'un doctorat en Sciences (ou d'un titre equivalent), et aire etat d'une experience soutenue de recherche de haut niveau portant sur un ou plusieurs
aspects de la bioinformatique: genomique ou proteomique comparative, structurale ou fonctionnelle, modelisation de processus cellulaires, conception rationnelle de molecules biologiquement actives, etc...

Une grande importance sera donnee aux synergies qui pourront s'etablir entre le nouveau charge de cours et les unites de recherche actives en bioinformatique a l'ULB. Le nouveau charge de cours participera a la promotion de la bioinformatique en tant que science interdisciplinaire.

Les candidats doivent egalement faire preuve de dispositions pedagogiques pour l'enseignement superieur. Le candidat retenu se verra attribuer des charges d'enseignement dans le cadre du DEA inter-universitaire en bioinformatique (en langue anglaise). Ces charges seront progressivement completees par des enseignements de 1er ou 2me cycle.

Si le candidat retenu n'appartient pas au personnel enseignant ou scientifique de l'ULB, ou au personnel definitif du Fonds National de la Recherche Scientifique travaillant a l'ULB, il sera engage a titre temporaire pour une periode a trois ans. A l'issue de cette periode, et moyennant une decision du Conseil d'Administration de l'Universite, son engagement fera l'objet d'une nomination a duree indeterminee sur le budget de fonctionnement de l'Universite.

Toutes les informations sont disponibles sur le site :
http://www.ulb.ac.be/docs/greffe/vacances/academique/index_6.html

la reference de l'offre est : 28.04.03/IV.21

Les candidats sont invites a retirer un modele de presentation du curriculum vitae sur le site http://resu1.ulb.ac.be/tools/CV-type.rtf. La candidature accompagnee dudit curriculum vitae, d'un resume des activites precedentes et d'un projet de recherches, doit etre adressee en deux exemplaires a M. Pierre de Maret, Recteur de l'Universite Libre de Bruxelles, 50 avenue Roosevelt, 1050 Bruxelles. Le candidat priera deux personnalites d'envoyer une lettre de recommandation a M. Guy Latouche, Vice-Doyen de la Faculte des Sciences, ULB, CP 212, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles, qui, par ailleurs, se tient a disposition pour toute demande d'information.

La date limite du depot des candidatures est fixee au 29 mai 2003
Contacts:Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
contacts, la source
(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003[AG]Postdoc
Source:
Date de parution:21/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Boston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
If you know of any potentially qualified and interested recent PhD in computer science, math, stats, or physics who is interested in computational biology/bioinformatics, please urge them to contact me directly concerning an open postdoctoral position to work with me in the Department of Biology at Boston College.

Current projects concern algorithm design for the analysis of time series oligonucleotide and cDNA array data, RNA structure prediction, and extensions/refinements of aspects of sequence alignment.

Essential skills required: strong programming ability (especially in C/C++ and python or perl), some probability theory. Some background in computational biology would be helpful, but for someone really interested, this can be learned.

The Boston area has many opportunities in computational biology/bioinformatics, both academic and industrial. The weekly MIT Bioinformatics Seminar, co-organized by Bonnie Berger and myself, facilitates potentially useful future contacts, and the Boston area is home to a number of leading biotech and pharmaceutical companies involved in bioinformatics research (such as Novartis, Millenium, Serono, Lion Bioscience, US Genomics,etc.).
Contacts:Peter Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor, Biology Department
Courtesy appt. Computer Science Department
Boston College
Higgins Hall 416 140 Commonwealth Avenue
617 552 1332 (office) Chestnut Hill, MA 02467
617 552 2011 (fax)
http://cs.bc.edu/~clote/
clote@bc.edu

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24/04/2003[MM]Post-Doctorat au CEA Saclay
Source:BioInfo
Date de parution:24/04/2003Date limite de réponse:15/12/2003
Lieu:Saclay (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Titre: Post-Doctorat au CEA Saclay: Simulation moléculaire du transporteurABC bactérien MsbA inséré dans une membrane en vue de modéliser l'action de la Pgp

Présentation du laboratoire:
Le stage se déroulera au Service de Biophysique des Fonctions Membranaires (DBJC / DSV), dans le cadre d'une collaboration entre le Laboratoire de Biophysique des Protéines et des Membranes et le Laboratoire de Transport Membranaire et Détoxication, au Centre d'Etudes de Saclay (91).

Description de la mission proposée:
La P-glycoprotéine (P-gp) est un transporteur membranaire actif de détoxication cellulaire appartenant à la grande famille ABC ("ATP Binding Cassette"). Remarquablement multispécifique, la P-gp transporte de nombreux xénobiotiques amphiphiles, et nous venons de montrer qu'elle transporte un lipide membranaire, le cholestérol, vers le feuillet externe de la membrane. La protéine MsbA, transporteur ABC bactérien homodimérique, est très proche de la P-gp en terme d'homologie de séquences. C'est aussi un bon homologue fonctionnel de la P-gp puisqu'elle transporte un lipide létal pour la bactérie.
Une structure à haute résolution de MsbA vient d'être publiée. La forme très particulière, "en V" fortement ouvert, du dimère de MsbA est atypique pour une protéine membranaire, et pose le problème de la distribution des lipides autour de la protéine. Déterminer cette distribution permettrait d'avancer vers la compréhension des mécanismes de transport de la MsbA, mais aussi de la P-gp. Seule la simulation moléculaire est actuellement en mesure de fournir une telle information. Nous nous proposons donc d'obtenirpar simulation moléculaire un modèle du système MsbA-membrane, permettant en premier lieu de décrire l'interfacep rotéine-lipide, puis de localiser le site de liaison de son substrat physiologique. L'objectif est de proposer un mécanisme de transport pour ces transporteurs ABC. Ce travail sera effectué en collaboration avec notre équipe de simulation moléculaire.

Formation et profil requis:
Solide bagage en simulation moléculaire des protéines, avec utilisation des programmes CHARMM (de préférence), ou AMBER, ou GROMACS; bonne connaissance des protéines (plus particulièrement celles associées aux systèmes membranaires) permettant ultérieurement d'aborder la problématique de la modélisation par homologie.

Informations générales:
Le poste est à pourvoir dès maintenant et avant le 15/12/03. Le contrat proposé est un CDD de 1 an renouvelable une fois.

Lieu de travail: Centre d'Etudes de Saclay (RER Le Guichet, près d'Orsay).
Contacts:Procédure de dépôt de candidature:
Envoyer par e-mail à Stéphane Orlowski (orlowski@dsvidf.cea.fr) un CV détaillé et une lettre de motivation.

Stéphane Orlowski, SBFM / DBJC, Centre d'Etudes de Saclay, 91191
Gif-sur-Yvette cedex.

Tel: 01 69 08 95 77; FAX: 01 69 08 81 39.


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24/04/2003[AG]chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD
Source:ABGf-2986
Date de parution:18/04/2003Date limite de réponse:07/05/2003
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
ABGf-2986-CDD - Le Cirad recrute un chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique - Montpellier

Date de debut de diffusion du poste : 18/04/2003
Date de fin de diffusion prevue : 07/05/2003

Au sein de l'equipe "Analyse du genome" du programme canne a sucre et de l'UMR " polymorphismes d'interet agronomique " et pour assurer le suivi de plusieurs developpements intervenus recemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
• la poursuite du travail sur les " Single Nucleotide Polymorphism " (SNP) comme outils de genotypage chez la canne a sucre
• l'exploitation des collections d'ESTs de canne a sucre produites a la FAPESP au Bresil et de mais et ble produites par le programme Genoplante pour le marquage de caracteres d'interet agronomique chez la canne a sucre
• l'appui a l'analyse bio-informatique de sequences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gene de resistance a la maladie de la rouille chez le cultivar de canne a sucre R570
• la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du desequilibre de liaison pour le marquage de genes d'interet agronomique chez la canne a sucre

Profil souhaite :
Doctorat en genetique avec maitrise des techniques moleculaires, ou en biologie moleculaire
Experience significative en genetique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de sequences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : Contrat a duree determinee
Date de prise de fonction : Immediate
Contacts:Renseignements sur le poste :
Angelique D'HONT, ca-cas, Tel. 04-67-61-59-27

Pour postuler :

Bernadette VINCENT
CIRAD-CA
TA 70/09
Avenue Agropolis
B.P. 5035
34398 Montpellier Cedex 5
Tel : 04.67.61.55.38

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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24/04/2003[AG]computational biology/bioinformatics
Source:BioJobs
Date de parution:24/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Memphis (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
A postdoctoral position in computational biology/bioinformatics is available in Dr. Yan Cui’s lab at Univeristy of Tennessee Health Science Center (Memphis, TN). We are interested in DNA microarray data analysis, gene network inference and protein structure prediction (http://compbio.utmem.edu).

Ph.D. degree, researh experiences in bioinformatics or related fields, computer programming skills in C/C++ are required.

The successful candidate will be able to take advantage of high
performance computing facility including a new 48-processor Beowulf cluster.

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this
announcement.]
Contacts:
For immediate consideration send your CV to Dr. Yan Cui
(ycui2@utmem.edu)

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18/04/2003[AG]Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique
Source:BioInfo
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:25/04/2003
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Référence à rappeler : DRH ca-705
Date de publication : 07/04/2003
Date de clôture : 25/04/2003

Descriptif du poste :
Au sein de l'équipe «Analyse du génome» du programme canne à sucre et de l'UMR « Polymorphismes d'intérêt agronomique » et pour assurer le suivi de plusieurs développements intervenus récemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
- la poursuite du travail sur les « Single Nucléotide Polymorphism »
(SNP) comme outils de génotypage chez la canne à sucre
- l'exploitation des collections dESTs de canne à sucre produites à la FAPESP au Brésil et de maïs et blé produites par le programme Génoplante pour le marquage de caractères dintérêt agronomique chez la canne à sucre
- l'appui à l'analyse bio-informatique de séquences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gène de résistance à la maladie de la rouille chez le cultivar de canne à sucre R570
- la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du
déséquilibre de liaison pour le marquage de gènes d'intérêt agronomique chez la canne à sucre

Profil souhaité :
Doctorat en génétique avec maîtrise des techniques moléculaires, ou en biologie moléculaire
Expérience significative en génétique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de séquences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : CDD de remplacement (11 mois minimum)
Date de prise de fonction : immédiate
Contacts:Renseignements : Angélique DHONT, ca-cas, Tél. 04-67-61-59-27

Candidatures à adresser à :
Bernadette VINCENT (bernadette.vincent@cirad.fr)
Adresse postale : TA 70 / 09 Ave Agropolis 34398 Montpellier

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17/04/2003[AG]INFORMATICIEN CHEF DE PROJET
Source:BioInfo
Date de parution:15/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le service Bionformatique de l'Institut Curie recrute :
UN INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le
service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7
ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau (6 personnes) pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat sera chargé de la gestion de projets informatiques :
expression de besoins, cahier des charges, définition de l'architecture, développement ou sous-traitance, validation à chaque étape du processus, installation et maintenance. Il aura à participer aux développements et à coordonner trois ingénieurs dans ces missions.
Il aura également à organiser le fonctionnement de l'équipe pour garantir la qualité des développements et des flux d'information.

Compétences :
- Gestion de projets
- Maîtrise d'ouvrage
- Architectures client-serveur et multi-couches
- SGBD relationnels (modélisation et administration)
- conception UML
- Apache (administration)
- Environnement de développement Unix et Windows
- Développement sous C/C++, Java (Swing, AWT, JSP, RMI), Perl, PHP
- Connaissances métier en bioinformatique
- Anglais courant
5 ans d'expérience minimum
Salaire selon profil et expérience
Contacts:Merci d'envoyer vos CV, lettre de motivation et prétentions en précisant la référence BI4 à :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie - Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

Tél. : 01 42 34 65 27
Fax : 01 42 34 65 28

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15/04/2003[AGMM]2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology
Source:BioInfo
Date de parution:15/04/2003Date limite de réponse:09/05/2003
Lieu:Maynooth (Irelande)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for two appointments in the general areas of proteomics/bioinformatics and molecular microbiology. Outstanding candidates in other areas of modern biology are also encouraged to apply. Appointees will be expected to be fully involved in the Department's undergraduate and postgraduate teaching programmes and to develop an internationally competitive research programme in their areas of expertise.

Salary scales (new entrants)

Lecturer - Euro 42,064 - 68,188 p.a. (7 points)
Junior Lecturer - Euro 29,214 - 34,401 (5 points)

Applications in writing, including a full C.V., a list of publications and a brief account of future research objectives, together with the names, addresses, fax, telephone numbers and e-mail address of three referees, should be forwarded to the Personnel Officer, so as not to arrive later than Friday, 9 May 2003.
Contacts:Prior to application, further details of the posts may be obtained from the Personnel Officer, National University of Ireland, Maynooth, Maynooth, Co. Kildare, Ireland.

Confidential Fax No: +353 1 708 3940
E-mail: personnel@may.ie

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14/04/2003[AG]Computer Biologist - Metabolic Disease Group
Source:
Date de parution:14/04/2003Date limite de réponse:18/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Computer Biologist - Metabolic Disease Group (Ref: 560)

Closing Date: 18th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Metabolic Disease Group is a new group at The Wellcome Trust Sanger Institute; our aim is to apply genetic approaches to study type 2 diabetes and obesity. We are following a candidate gene approach and will be investigating the putative role of hundreds of genes via genetic association studies and functional analysis of mutations. We are seeking a Computer Biologist to provide support to the data handling activities of the group, this will involve close collaborative work with other groups at the Institute, in particular the Human Genetics Informatics group.

Informal enquires may be made to Inês Barroso (ib1@sanger.ac.uk)

The ideal candidate for will have at least two years post graduate experience of programming in a UNIX/LINUX environment, using one or more of the following: perl, C, java, javascript, plsql. A familiarity with RDBMS and a working knowledge of perl are essential. The role involves working closely with laboratory scientists and collaboration with other informatics groups, strong communication skills are required.
Contacts:To apply for these positions please write with your CV and current salary details quoting the reference number to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA

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14/04/2003[AG]Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation
Source:
Date de parution:14/04/2003Date limite de réponse:11/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation
(Ref: 559)

Closing Date: 11th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Wellcome Trust Sanger Institute is one of the leading genomics centres in the world, dedicated to analysing and understanding genomes. Through large-scale analysis - and focused research and collaborations - the Sanger Institute's programmes underpin biological and medical research worldwide. The pathogen sequencing unit has established a curated genome database, geneDB, to house gene annotation and functional genomic data. A position is now available for a senior computer biologist within the pathogen sequencing unit responsible for analysis of Plasmodium genome data and maintaining the Plasmodium content of the geneDB database. As a senior computer biologist you will be expected to interact proactively with both malaria and informatics research communities to develop and optimise the content and accessibility of the data. You will also interact with in house computer programmers to maximise the quality and utility of the data to the community. You should have a PhD and preferably laboratory experience of Plasmodium. Knowledge of programming/scripting is desirable, although not essential, as training will be provided.
Contacts:To apply, please write with your CV and current salary details quoting reference 559 to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA. The closing date for applications is 11th April 2003

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08/04/2003[MM]Computational Chemists
Source:
Date de parution:08/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics, or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills. Relevant areas of experience might include the computation of protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecu lar systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.
Contacts:Please send your resume (including list of publications, thesis topic, and advisor, if applicable), along with a history of academic performance (including GPAs as well as SAT, GRE, and other standardized test scores), to . SALARY $ 100,000- 150,000 depending on experience there is flexibility.
SUBMIT RESUMES TO:
Concepts in Staffing
ATT: Norm Davis
normd@cisny.com

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08/04/2003[AG]Postdoctoral job opening in Computational Biology
Source:
Date de parution:08/04/2003Date limite de réponse:01/06/2003
Lieu:Boston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
The Department of Biology at Boston College has available a postdoctoral position for work in the CLOTE LAB in computational biology/bioinformatics with start date June 1, 2003.

Requirements include a recent Ph.D. in computational biology/bioinformatics or strongly computational field such as computer science, mathematics, statistics, physics, chemistry. Strong programming skills are necessary, preferably in C/C++ and Python, as well as ability in mathematical modeling, probability and statistics. Current research projects in the Clote Lab include modeling of RNA and protein, functional genomics, applications of machine learning theory to bioinformatics, and mathematical evolution theory.

Boston College provides a supportive, collegial environment with good Ph.D. program in biology, close proximity for possible research collaborations with other universities in the Boston area, and a very pleasant campus ambience.
Contacts:For more information, please contact:
Peter G. Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor of Biology and Computer Science (courtesy appt)
Boston College
Chestnut Hill, MA 02467
Email: clote@bc.edu
http://www.cs.bc.edu/~clote
http://www.bc.edu/biology
Tel: 617 552 1332
Fax: 617 552 2011

To apply please send either a hardcopy or email application.
Application materials should include a CV,names and addresses of three references. For hardcopy applications please send reprints or preprints of articles. For email applications, please email pointers to on-line articles (please do NOT email the articles).

Applications will be evaluated from now on until the position is filled.

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08/04/2003[AG]Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)
Source:http://www.iarc.fr/pageroot/VACANCY/RC03_1_P2_GCS.html
Date de parution:08/04/2003Date limite de réponse:09/05/2003
Lieu:Lyon (France)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)
Vacancy notice No. IARC/03/FT156

Grade: P.2
Contract Type: Fixed-term appointment
Duration: Time-limited duration of four years

Objectives of the programme:
The overall objective of the Unit of Genetic Cancer Susceptibility is the identification and evaluation of inherited genetic factors in the etiology of cancer and the interaction between environmental factors and susceptibility genes.

The successful candidate will:
- To take a lead role in programming both a genotyping & gene-resequencing database and a laboratory information management system (LIMS) that will manage interaction between laboratory robotics, sequencing and genotyping instrumentation, and the database ;
- To make sure that database and LIMS programming with the GCS Unit is compatible with systems and programs provided by the Biostatistics and Bioinformatics Unit, and collaborate in support with the Computer Services Group ;
- To collaborate with other IARC Research Units and Groups and with outside scientists in the implementation of molecular epidemiological studies and their execution ;
- To keep abreast with methodological developments in the field;
- To be expected to attend several scientific meetings each year.

Qualifications Required:
Education and Skills:
M.S. in Computer Science with documented background in Molecular Biology, or M.S. in Molecular Biology, or Biochemistry, or Biotechnology, or in a related field, with documented background in database programming experience. Ph.D. in any of the fields cited above would be an asset.

Advanced knowledge of database programming and/or laboratory robotics programming. Ability to work in a teamwork environment. Would be an asset: knowledge of Java or Microsoft.NET software platforms, and ability to draft reports and grant proposals.

Experience:
At least two years of relevant professional experience at the national level or one year at the international level. Experience in programming web browser database interfaces would be an asset..

Languages:
Good knowledge of English with a working knowledge of French.

Annual salary
(net of tax):
US$ 40191 at a single rate - US$ 42849 with primary dependents.

Post Adjustment: 27.30 % of the above figures. This percentage is to be considered as indicative since variations may occur each month either upwards or downwards due to currency exchange rate fluctations or inflation.

Applicants should complete a Personal History Form and include a photograph. Internal candidates should use Form WHO.824.
Contacts:APPLICATIONS SHOULD BE SENT TO:

Personnel Office
IARC
150, Cours Albert Thomas
FR-69372 Lyon CEDEX 08
Fax: +33(0)4 72 73 83 35
Email: personnel@iarc.fr

NB: This Email address should ONLY be used for vacancy applications. Due to the large number of messages, any other type of correspondance may not be answered.

Applications from women are encouraged.
Any appointment/extension is subject to WHO Staff regulations, Staff Rules and Manual. Staff are subject to assignment to any office of the WHO in the world and mobility is encouraged.

Qualifications indicated in this vacancy are the minimum requirements. Candidates who are less qualified will not be considered.

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07/04/2003[MM]SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:15/05/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/22
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg: SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany

Commencing Date: As soon as possible after closing date
Job Description: The work will involve development of graphical user interfaces (to be built on the existing modules), support of the Web and Email server, support of remote execution of ARP/wARP jobs on local mulit-processor computer cluster.

Qualifications and Experience: Applicants should have a computational background and experience in the design of GUI. Profound knowledge of C/C++, Java/Javascript, Perl, Tcl/Tk, HTML or Python programming environments is required. Some familiarity with crystallography will be of advantage.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03
EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de

Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/22, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:15/05/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/21
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany Commencing Date: As soon as possible after closing date Job Description: The work will involve research, development and/or coding the software modules in the areas of information theory, estimation theory, statistical pattern recognition, neural networks for information reduction and computer learning, independent component analysis - all applied for 3-dimensional image interpretation. The emphasis is on computational techniques.

Qualifications and Experience: Programming experience and familiarity with some of the above-mentioned areas are essential.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03

EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de
Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/21, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/PD/05
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Applications are invited for a postdoctoral fellow position at the EMBL Outstation in Hamburg, Germany. The work will involve development of tools and protocols for assembling, tuning and running software modules, specifically for structure solution, improvement of crystallographic phases, automatic interpretation of electron density maps and assessment of quality of X-ray data and structural models. A background in protein crystallography and interest in methodology is essential. Emphasis will be on computational techniques. Familiarity with computer programming, statistics and mathematical algorithms is advantageous. Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/PD/05, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]Post-doctoral Postion in Structural Genomics
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Yale (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applicants are invited for a post-doctoral post in the Department of Molecular Biophysics and Biochemistry at Yale University. The position is for two years with possible extensions. Choice of project would to some degree depend on the applicant's interests and abilities, though it is expected that the research will be purely computational and will fall into the emerging field of structural genomics: classifying protein fold families in genomes, developing sequence and structure comparison techniques, and developing databases and analyses for the new genomic information. The ideal applicant would have a PhD (preferably in bioinformatics, biophysics, genetics, or computer science) and have already had some experience in one of the above-mentioned research areas. He or she would be very skilled in programming and using the computer to solve problems (e.g. experience with C/C++, perl5, SQL, HTML/java, fortran, blast/fasta, excel/word, Irix/linux, and so on).
Contacts:Please contact Mark Gerstein for further information (MB&B Department, PO Box 208114, Bass Center, Yale University, New Haven, CT 06520, FAX 203 432 5175, Mark.Gerstein@Yale.edu).

Applicants are requested to send a CV that includes a list of publications and details of 3 references. Normal e-mail is OK for all correspondence. However, copies of official documents should follow by regular post. Further details about the position and structural genomics research at Yale can be obtained over the web at: http://bioinfo.mbb.yale.edu/genome.

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07/04/2003[AG]SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:21/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/34
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Grade: 6 or 7, depending on age, experience and qualifications
Duty Station: Hinxton, near Cambridge, UK
Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: We are looking for a software developer or
bioinformatician to join a new Biochemical Compound Database project at the EBI. The EBI is home to the world class bioinformatics resources, such as the EMBL-Bank, SWISS-PROT + TrEMBL, InterPro, Macromolecular Structure Database (MSD), Gene Ontology (GO), IntEnz database of Enzyme Nomenclature and IUPHAR Receptor Database.

The successful applicant will contribute to our efforts in developing a database of biochemical compounds, focussed on the metabolites and ligands in living cells. The goal is to create a definitive open resource of biochemical terminology and structure for consistent use by other EBI services and groups. The post-holder will take responsibility for the design and development of database and web applications. She/he is also expected to make a scientific contribution to the future expansion of activities in this area.

Qualifications and Experience: Applicants should hold a masters (or higher) degree in Bioinformatics or Computer Science, plus some post-graduate or employment experience in chemoinformatics or bioinformatics. The candidate should be proficient in object-oriented programming languages (preferably Java). Experience with relational database management systems and/or commercial chemical databases would be an advantage.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 21.04.2003

EMBL WWW pages: http://www.embl-heidelberg.de/ and
http://www.ebi.ac.uk/
EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation. Please note that EMBL does not return CVs or attached documents to applicants.
Contacts:Please send a CV and covering letter, including names and addresses of referees, quoting ref. no. 03/34, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, D-69012 Heidelberg, Germany
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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06/04/2003[MM]Post-doctorants CDD 18 moisINRA
Source:BioInfo
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:15/04/2003
Lieu:Jouy-en-Josas (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
L'INRA recrute 40 post-doctorants sur des contrats à durée déterminée (18 mois) (voir le site http://www.inra.fr/drh rubrique "L'INRA recrute 40 post-doctorants").

Il n'y a aucune condition de nationalité. Les dossiers sont à rendre pour le 15 avril.

Notre unité, en collaboration avec l'unité Neurobiologie de l'Olfaction et de la Prise Alimentaire (NOPA) (également située sur le centre de recherche de Jouy-en-Josas) propose un sujet de post-doctorat ayant trait à la modélisation moléculaire de récepteurs olfactifs (qui sont des récepteurs à 7 segments transmembranaires couplés aux protéines G). Brièvement, il s'agit de modéliser certains récepteurs olfactifs d'intérêt pour l'unité NOPA et de tester la fixation de familles d'odorants sur ces récepteurs par des techniques d'amarrage moléculaire (docking). Les ligands potentiels seront ensuite testés expérimentalement.
Contacts:Pour plus d'information, les personnes intéressées sont priées de me contacter, le plus tôt possible, à l'adresse indiquée ci-dessous.

Jean-Francois Gibrat Tel: +33 (1) 34 65 28 97
Mathematique Informatique et Genome, Fax: +33 (1) 34 65 29 01
Institut National de la Recherche Email: gibrat@jouy.inra.fr
Agronomique, Domaine de Vilvert,
Jouy-en-Josas 78352 cedex, France

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06/04/2003[AG]bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS
Source:BioInfo
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:10/04/2003
Lieu:Nancy (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS INRIA-UHP-INPL recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses étant réalisées au MAEM.
Contacts:Réponse nécessaire avant le 10 avril 2003 à adresser à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 : Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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06/04/2003[AG]BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN
Source:BioInfo
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le groupe Bionformatique de l'Institut Curie recrute :

UN BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat travaillera à l'analyse des données génomiques (séquences, puces, réseaux génétiques) issues des différentes plate-formes technologiques de l'Institut et de ses partenaires. Son implication couvrira le développement des aspects méthodologiques, leur implémentation informatique et les analyses proprement dites.

Compétences :
- Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (analyse de séquences, analyses des données de puces)
- Modélisation et analyse de données
- Maîtrise des packages mathématiques et statistiques classiques (R/S+, Mathlab, Spotfire …)
- Maîtrise d'un langage de programmation (C/C++, Java, Perl …)
- Expérience des environnements Unix et Windows
- Anglais courant

Formation souhaitée : Ingénieur Grande Ecole ou 3ème cycle

Salaire selon profil et expérience
Contacts:Personne à contacter, en précisant la référence BI2 :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie Section Recherche
Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

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06/04/2003[AG]Postdoc modélisation des réseaux de gènes
Source:BioInfo
Date de parution:13/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lyon (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Dans le cadre de la campagne de recutement de post-doc par
l'INRA (http://www.inra.fr/drh), notre UMR propose, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes (équipe Helix) un sujet sur la modélisation des réseaux de gènes.

Nous développons une puce à ADN dédiée la bactérie Buchnera,
symbiote du puceron. Le but du travail sera de réaliser une première application consistant à étudier des réseaux de régulation identifiés chez Buchnera. L'accent sera particulère mis sur le métabolisme des acides aminés pour lequel l'UMR BF2I possède une expertise aux plans biochimiques et physiologiques. Plus généralement, ce travail permettra de compléter la panoplie d'outils bioinformatiques proposés dans la plate-forme Génostar en permettant notamment l'analyse des transcriptomes bactériens.

Les personnes intéressés, jeunes docteurs bioinformaticiens -informaticiens ayant acquis une expérience dans la modélisation des réseaux sont priés de me contacter rapidement.
Contacts:Jean Michel FAYARD: jmfayard@insa.insa-lyon.fr

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06/04/2003[AG]Poste de professeur en génétique & bio-informatique
Source:
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:21/03/2003
Lieu:Toulouse (31) (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Poste de professeur en génétique & bio-informatique à l'Université de Toulouse
Section 65, Emploi nº 1312, analyse des génomes.
Date limite de dépôt des candidatures : 21 mars 2003

Profil Recherche :
Le LMGM souhaiterait accueillir un Professeur de Génétique pour créer une équipe s’intéressant à une thématique à l’interface de la Génétique et de la Bio-informatique centrée sur l’Analyse des Génomes et la Génomique Evolutive des Procaryotes. Cette thématique s’intégrerait parfaitement au sein de l’UMR 5100, la nouvelle équipe venant en complément de six (des neuf) équipes du LMGM qui développent leurs projets dans le cadre de deux (des trois) thématiques majeures de l’Unité, ‘‘Organisation et Dynamique du Génome’’ et ‘‘Plasticité Génétique’’.

Profil Enseignement :
La révolution de la Génomique élargit le champ d'investigation en Génétique. Il est impératif que notre université recrute un collègue capable de manier et enseigner les concepts et les méthodes de cette discipline d'avenir qu’est la Génomique. Le remplacement de Jean-Michel Louarn offre l'occasion d'ouvrir ce nouveau champ, par le recrutement d'un collègue travaillant à l'interface de la génétique et de la bio-informatique dans l’Analyse des Génomes et dans la Génomique Evolutive. Ce collègue devrait pour partie renforcer les enseignements déjà assumés par la commission pédagogique de Génétique. Il lui sera bien entendu également demandé de développer l'aspect Génomique Evolutive en s’appuyant sur les données de séquence génomique complète de très nombreux organismes procaryotes (plus de 80 répertoriés à ce jour) appartenant à des branches évolutives différentes.
Contacts:Les candidats intéressés sont priés de contacter le Directeur du LMGM :

Jean-Pierre Claverys
UMR5100 CNRS-Université Paul Sabatier
Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires
118 route de Narbonne
31062 Toulouse Cedex
France
tel. 05 61 33 58 55 (from outside France: 33 561 33 58 55)
05 61 33 59 11 (from outside France: 33 561 33 59 11)
fax 05 61 33 58 86 (from outside France: 33 561 33 58 86)
05 61 33 58 61 (from outside France: 33 561 33 58 61)
claverys@ibcg.biotoul.fr (e-mail)
http://www-ibcg.biotoul.fr/recherche.html

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06/04/2003[AG]Stage post-doctoral en génomique végétale
Source:
Date de parution:06/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de publication de l'offre : février 2003
Entreprise : Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS

Lieu : 2 rue Gaston Crémieux
CP 5708
91057 Evry

Description de l'activité de l'entreprise : L'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) est localisée sur le site du Genopole d'Evry. Cette unité récemment implantée et spécialisée dans la Génomique des Plantes, est une unité mixte INRA/CNRS (UMR 8114). L'URGV occupe une superficie de 1000 m2 scindée en 2 laboratoires. Un premier laboratoire de 500 m2 se trouve dans le même bâtiment que le Genoscope, le second laboratoire étant dans le bâtiment du Centre National de Génotypage (CNG). L'URGV est équipée d'outils performants pour les manipulations "haut débit" (robots, arrayer, etc.). Nous collaborons étroitement avec le Genoscope et le CNG pour des projets impliquant le séquençage et le génotypage respectivement. L'objectif principal de l'Unité est de développer et d'appliquer des approches modernes en génomique pour l'étude des plantes modèles ou d'intérêt agronomique (voir site web:
www.evry.inra.fr/)




Description du poste : Génomique comparée entre Vitis vinifera et Arabidopsis thaliana.

De nombreux caractères sont importants pour la production de raisins de cuve, qu'ils soient liés à la qualité ou à la résistance aux agents pathogènes. Or, leur analyse est ralentie par le long temps de génération de cette espèce pérenne. En revanche, la petite taille du génome de Vitis vinifera (475 Mb) est un avantage pour le développement d'approches génomiques. La construction d'une carte physique du génome de la vigne a donc été initiée à l'UMRGV avec la construction d'une banque BAC d'ADN de Cabernet Sauvignon clone 412 (44 900 clones, taille moyenne des inserts de 145 kb, au moins 13 équivalents génome), un programme d'ancrage de STS sur ces clones BAC (séquence des deux extrémités de 15 000 à 20 000 BACs). En parallèle, des stratégies vont être développées dans l'objectif d'utiliser les données obtenues sur la plante modèle Arabidopsis pour accélérer les recherches sur la vigne. Dans ce cadre, nous souhaitons évaluer dans quelle mesure la connaissance de la séquence du génome d'Arabidopsis pourrait aider à la construction de la carte physique du génome de la vigne en combinant des approches bioinformatiques et de cartographie physique. Le stage implique des interactions entre l'équipe travaillant sur l'organisation des génomes de plantes cultivées (blé, colza, peuplier et vigne), et l'équipe bioinformatique, qui regroupe de façon unique des compétences en analyse des génomes, annotation, construction de bases de données et interfaçage.

Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003

Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable 1 fois
Contacts:Contact : Anne-Françoise Adam-Blondon
Tél.: +33 (01) 60 87 45 34
adam@evry.inra.fr

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06/04/2003[AG]POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM
Source:
Date de parution:05/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Au sein d'une équipe de recherche en génétique statistique (INSERM-Université d'Evry), située sur le campus de génomique d'Evry, le(la) candidat(e) participera à un programme de recherche visant à mettre en évidence des facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans des maladies humaines (asthme, mélanome malin) par des analyses statistiques de données familiales (analyses classiques et analyses propres à la génétique)

Missions:
- contribuer à la gestion de données à l'aide de procédures/programmes informatiques
- effectuer des analyses statistiques de données (univariées et multivariée) à l'aide de logiciels statistiques
- contribuer au développement de procédures et programmes
informatiques pour faciliter la manipulation et l'analyse des données.

- contribuer aux analyses génétiques des données à l'aide de logiciels propres à la génétique

Compétences
- Niveau Maîtrise ou DEA/DESS en biostatistique/informatique/épidémiologie
- Maîtrise des environnements informatiques Windows et UNIX (procédures shell)
- Connaissances des logiciels classiques de statistique (SAS, STATA)
- Connaissances en programmation informatique (Fortran, Pascal, C, shell, perl)
- Connaissances de logiciels utilisés en épidémiologie génétique ou volonté de les acquérir.

Aptitudes: Rigueur dans le travail, fiabilité, communication, capacité d'autonomie, disponibilité

Salaire:
- Niveau Ingénieur d'Etude INSERM/Université (à partir de 1 800 Euros brut par mois) à déterminer en fonction de la qualification et des compétences du candidat
- Contrat à Durée Déterminée (un an et renouvelable)
Contacts:Florence DEMENAIS
INSERM EMI 0006
Tour Evry 2
523 Place des Terrasses de l'Agora
91034 EVRY
Tél : 01 60 87 38 26
Fax : 01 60 87 38 48
Mél : demenais@evry.inserm.fr

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06/04/2003[AG]professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques
Source:
Date de parution:05/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le Departement de Biologie de l ENS-Paris cherche a recruter un professeur animant recherche et enseignement sur le theme: Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques. Celui ci devra mener ses recherches au sein du Departement de Biologie en interaction avec les groupes des Departements de Physique et Informatique.
Contacts:Contacts: A Prochiantz Directeur du Departement de Biologie, prochian@biologie.ens.fr, A Feltz, pour la CS de Biologie 27-28, feltz@biologie.ens.fr

Claude Jacq
Laboratoire de Genetique Moleculaire
CNRS UMR 8541
Ecole Normale Superieure
46 rue d Ulm
75230 PARIS Cedex 05

Tel: 33 1 44 32 35 46 (office)
33 1 44 32 35 70 (secretariat)
mobile: 33 (0)6 61 76 28 98
Fax: 33 (0)1 44 32 37 30 http://www.biologie.ens.fr/microarrays.html

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06/04/2003[AG]professeur de bioinformatique
Source:
Date de parution:06/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lille (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Dans le cadre de la création de l’Institut de Recherches Interdisciplinaires à Lille (http://www.dr18.cnrs.fr/iri/index.htm), l’Université de Lille 1 cherche à recruter un professeur de bioinformatique dont les travaux de recherche concernent l’analyse des séquences régulatrices, le développement de banques de données pour l’étude des réseaux de régulation transcriptionnelle. Des moyens seront alloués pour permettre au candidat retenu de développer une équipe de recherche en collaboration avec les équipes de mathématiciens, de bioinformaticiens et de biologistes de la Génopole de Lille. Chargé de mission pour la création de l’IRI : Bernard Vandenbunder (Bernard.Vandenbunder@ibl.fr)
CNRS UMR 8117 / Institut Pasteur de Lille / Université de Lille 1 Institut de Biologie de Lille 1 rue Calmette BP 447 59021 Lille Cedex (France) Tel : (33) 3 20 87 10 90 Fax : (33) 3 20 87 11 11
Contacts:Nom de la personne à contacter pour l’enseignement : Hélène Touzet
(touzet@lifl.fr)
Nom de la personne à contacter pour la recherche : Jean Marc Geib
(geib@lifl.fr)
Le profil complet du poste se trouve à l’adresse suivante : http://www.univ-lille1.fr/personnels/recrutement/informations.htm


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06/04/2003[AGMM]Postdocs CNRS
Source:AGM2
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:France (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
La liste des laboratoires retenus pour l'accueil des 210 postdocs CNRS est disponible à l'adresse suivante
Contacts:

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06/04/2003[AGMM]poste de maître de conférences en Bioinformatique
Source:
Date de parution:11/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lyon (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
L'INSA de Lyon propose un poste de maître de conférences en Bioinformatique dont les profils recherche et enseignement sont détaillés ci-après (ces profils sont disponibles sur le site de l'insa : http://www.insa-lyon.fr/recrutement/0095.pdf).


Le maitre de conferences recruté integrera l'equipe "systèmes autonomes" du laboratoire PRISMa pour renforcer son axe bioinformatique et modélisation. Ce groupe travaille en étroite collaboration avec des biologistes de l'INSA et de l'université Claude Bernard Lyon I pour proposer des modèles individus-centrés de systèmes biologiques sur la base d'approches bio-inspirées telles que la vie artificielle, les algorithmes génétiques, les réseaux neuromimétiques récurrents ou les animats. Les condidats devront donc disposer de compétences dans ces domaines ainsi qu'en modélisation et simulation, si possible appliquées à la biologie, à la génétique ou à la modélisation cellulaire.

Profil enseignement :
Le candidat sera amené a effectuer son enseignement au département premier cycle et au département informatique de l'INSA de Lyon. Au sein du département informatique, il intégrera les équipes pédagogiques "développement logiciel" et "informatique décisionnelle".
Contacts:Contact recherche :
Joel Favrel : jfavrel@if.insa-lyon.fr (04.72.43.83.63) Jean-Michel Fayard : jmfayard@insa.insa-lyon.fr (04.72.43.60.01)

Contact enseignement :
Jean-Marie Pinon : jmpinon@if.insa-lyon.fr (04.72.43.84.81) Yves Jayet : yves.jayet@insa-lyon.fr (04.72.43.83.84)

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06/04/2003[AGMM]Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)
Source:
Date de parution:02/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Le site Post-docs Sciences de la vie et de la santé vient d'être ouvert par l'INSERM à l'adresse suivante :
http://www.inserm.fr/postdocs/postdocs.nsf

Ce site permet de pouvoir mettre en contact des candidats aux postes de Chargés de Recherche avec des laboratoires qui en recherchent, d'obtenir des informations sur les différents programmes de l'INSERM...
Contacts:

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06/04/2003[AGMM]Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline
Source:
Date de parution:04/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Philadelphie (Etats-Unis)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Subject: Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline

Summer student positions in scientific computing at GlaxoSmithKline

GlaxoSmithKline (GSK) is a world leading research-based pharmaceutical company with a powerful combination of skills and resources to provide a platform for delivering strong growth in today's rapidly changing healthcare environment. GSK's mission is to improve the quality of human life by enabling people to do more, feel better and live longer. GSK has

over 100,000 employees worldwide and over 16,000 are in R&D. GSK R&D is based at 24 sites in seven countries. The company has a leading position in genomics/genetics and new drug discovery technologies.

The Scientific Computing and Mathematical Modeling group has three summer student positions available in our state-of-the-art facilities in Upper Merion (near Philadelphia), PA and in Research Triangle Park (RTP), NC. The Scientific Computing and Mathematical Modeling group applies mathematical and computational techniques to a variety of challenging problems in pharmaceutical research.

Position 1 (REQ# 9056) – parallel programming (Upper Merion, PA). Develop parallel programming tools for a Beowulf cluster. Develop parallel versions for various simulation and optimization algorithms. Minimum requirements: Master/PhD student in Computer science or related field with experience in parallel programming and scientific computing. Experience with large C/C++ programs and knowledge of MPI is required. Experience with Matlab is a plus.

Position 2 (REQ# 9061) – biochemical pathway reconstruction (Upper Merion, PA). Experiment with existing algorithms and develop new ones for pathway reconstruction from expression data. Minimum requirements: Master/PhD student in Numerical Analysis/Scientific Computing with experience in optimization algorithms, knowledge of dynamical systems, inverse problems and regularization techniques. Good programming skills – preferably in Matlab. Knowledge of biology is not required but is a plus.

Position 3 (REQ# 9063) – animation/scientific visualization (RTP, NC). Develop tools for animating dynamical systems such as biochemical pathways or chemistry kinetics. The animated movies created using these tools should help demonstrate some of the complex interactions and nonlinear behaviors of the dynamical system studied. Minimum
requirements: Master/PhD student in Computer Science, Scientific Computing or related field. Experience with animation and/or scientific visualization. Knowledge of VRML or Matlab is a plus.

We are looking for individuals who can successfully integrate sophisticated mathematics and computer software with biological problems. We seek someone who has the motivation to solve real-world problems. Interactions will often be with a larger team composed of other computational scientists and R&D researchers. Excellent communication skills are required. Exceptionally talented undergraduate students also will be considered for all three positions.
Contacts:You can apply by visiting our website: http://www.gsk.com/careers and reference the appropriate REQ#

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02/04/2003[AG]Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department
Source:BioJobs
Date de parution:02/04/2003Date limite de réponse:25/04/2003
Lieu:Dublin (Irelande)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
A postgraduate studentship is available from Oct 2003 in the Computer Science Department for research in Data Mining and Knowledge Discovery in Bioinformatics. Applications are sought from candidates with a good honours degree in a biological subject and from candidates who expect to graduate in the summer of 2003. Previous experience using standard bioinformatics tools and in developing new approaches and methods would be useful.The studentship is funded by Science Foundation Ireland and the research will focus on the development of Machine Learning and Data Mining techniques for application in Bioinformatics.
Contacts:Further details are available from Prof. Pádraig Cunningham or Dr. Nadia Bolshakova (Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie). Applicants should send a full CV to Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie before 25th April.

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28/03/2003[AG]Ingénieur de recherche CNRS
Source:BioInfo
Date de parution:28/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Mission :
L'ingénieur de recherche a en charge de concevoir, développer et déployer les méthodes et outils bioinformatiques d'intégration et d'analyse des données issues des plate-formes de génomique à haut débit, en vue de leur exploitation au sein des programmes de recherche de l'unité et de l'Institut. Il mènera sa mission en concertation étroite avec les biologistes de l'unité, les médecins et les bioinformaticiens de l'Institut.

Activités :
- Analyser les besoins dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges, en relation avec l'ingénieur de la plateforme de génomique fonctionnelle (en cours de recrutement) ;
- Développer des solutions méthodologiques aux problèmes d'analyses à haut débit ;
- Implémenter et mettre en service ces solutions (déploiement, formation) ;
- Intégrer les données génomiques et phénotypiques publiques et privées nécessaires aux analyses ;
- Participer aux analyses de données en relations avec les biologistes et médecins ;
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine ;
- Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en Suvre des techniques bio-informatiques.

Compétences :
- Avoir de bonnes connaissances de la biologie cellulaire et des grands principes qui régissent le fonctionnement des cellules ;
- Avoir une formation approfondie en bio-informatique (diplôme d'ingénieur ou 3ème cycle universitaire) ;
- Avoir une expérience de l'environnement UNIX, des langages Java, C/C++, Perl, PHP, SQL et une pratique des architectures client/serveur ;
- Avoir une expérience dans la gestion et l'analyse de gros volumes de données scientifiques ;
- Avoir une pratique des bases de données, outils d'analyse et concepts de la bioinformatique ;
- Maîtriser l'anglais scientifique à l'orale et à l'écrit ;
- Aptitude à la communication ;
- Travailler en équipe.

Contexte :
Travail au sein de l'UMR 144 CNRS - Institut Curie, en étroite collaboration avec le service Bioinformatique de l'Institut Curie, les plate-formes de transcriptome, CGH, protéome et génotypage, ainsi que d'autres unités du Campus participant au site Mte Ste Geneviève du Génopole Ile de France.
Contacts:Voir http://www.sg.cnrs.fr/drhita/concoursita/2003/02_consulter.htm
et en bas de la page demander à voir le concours n°3

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28/03/2003[AG]professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière
Source:
Date de parution:28/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Un poste de professeur en bio-informatique (0122 s) est ouvert au
recrutement à l'université Paris 6 en 27e section (informatique).

La recherche sera effectuée à l'Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière.

L'enseignement sera dispensé à l'UFR d'informatique.

Le profil complet du poste est disponible à l'adresse www.lip6.fr
Contacts:Recherche : Dominique MAZIER, Unité INSERM 511, Pitié-Salpêtrière, 0140779736

Enseignement : Mme la Directrice de l'UFR informatique :
DirUfr@ufr-info-p6.jussieu.fr

Présidente de la commission de spécialistes 27e section : Anne.Doucet@lip6.fr

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28/03/2003[AG]Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics
Source:ABG-7697-2
Date de parution:21/03/2003Date limite de réponse:01/06/2003
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics : Development of Statistical Strategies and Tools - Evry, France

Date de debut de diffusion du poste : 21/03/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/06/2003

Aventis Pharma, in partnership with the European Commission, offers 2 Marie Curie Industry Host Fellowships, for a 2 year period, on a project focused on the development of statistical strategies for the analysis of case-control pharmacogenetic data. The methods will enable the discovery and consequently the diagnosis of genetic polymorphisms underlying factors such as drug response, drug toxicity, and disease state and severity.

Based at the Evry Genetics and Pharmacogenetics Center,your roles will be to :

- Develop single-and multi-point linkage disequilibrium methods, with special reference to issues such as control sample selection and genomic control, marker selection, haplotype construction and analysis,and multiple testing.

Candidates should have experience in a field such as mathematics, statistics, population genetics, or genetic epidemiology. Fluency in English is required. The positions are open to members of the E.C. or residents of associated countries* for more than 5 years. You must hold a PhD. The age limit at the time of selection is 35 years old.

* Austria, Belgium, Bulgaria, Czech republic, Denmark, Estonia, Finland, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Israel, Italy, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, The Netherlands, Norway, Poland, Portugal, Republic of Cyprus, Romania, Slovakia, Slovenia, Sweden, Spain, and United Kingdom. However French citizens are ineligible as well as those who have been resident in France for more than 12 out of the last 24 months.

Employment Conditions

Field of application
The Marie Curie Post-Doc Fellows are recruited on a fixed-term contract. Aventis has been selected by the European Commission as a hosting institution able to deliver research training for post-doctoral researchers.

Salary and benefits
The annual scales are normally within the range of 30 to 39 k€ depending on the age and experience of the scientist.

Post-doctoral fellows are entitled to elect and participate in the Aventis French benefits as offered to regular full-time associates. This includes: medical and/or dental insurance, healthcare and dependant care reimbursement accounts.

Relocation
In regard to the household goods, Aventis DI&A Paris will reimburse the candidate as follow: up to 600 € for a single person up to 900€ if the Post doc fellow comes with his/her spouse. up to 200€ per child

Mobility allowances
The post doc fellow will receive a monthly mobility allowance of 400 € (as agreed with the EC) all along his/her assignment.

Airfare
Economy airfare will be provided to work site from home and a return economy flight home completion of the post-doc assignment.

Housing accommodations
The company will pay for furnished lodging accommodations for up to 15 days at the post doc fellow arrival in France. In order to help the Post-doc fellow to find a suitable housing, relocation counselor provided by Aventis will be available to discuss the details on housing arrangements. If needed, support will also be provided to open bank account in France and for administrative steps.

French lessons
Aventis will help all post-doctoral fellows who will express the wish to be trained in French. According to their French language knowledge, the most appropriate course will be given. Two 40 hour-package can be offered by Aventis and if necessary additional courses could be given by the “Alliance Francaise”.

Working hours
In application of the agreements on the organization and duration of work in force within the company, working time consists of an average of 35 hours effective work per week over the year.

Vacations
Employees at Aventis are eligible for 31 vacation days for a full period (i.e.12 months), more 14 days off in application to the 35 hours agreement (RTT days) for a full period.
Contacts:Written details and letters of application for both positions, together with CVs and the names of two referees should be sent to :

Dr. JF Deleuze, Director of the Evry Genetics Center, Aventis Pharma, 2, rue Gaston Cremieux, 91057, Evry, France.
Tel: 33 1 58 93 90 01, Fax: 33 1 58 93 90 10, e-mail : jean-francois.deleuze@aventis.com

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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23/02/2003[AG]Data Analysis Scientist
Source:
Date de parution:23/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Ankeny (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Monsanto values diversity and is an equal opportunity affirmative action employer.

Department: Technology Development
Title: Data Analysis Scientist
Req Number: mons-00000893
Location(s): Ankeny IA

Responsibilities:
The successful candidate will be part of a Data Analysis team within our plant breeding organization. The individual in this role will be analyzing molecular marker data sets and crop trial data, this implies: Test procedures through simulations and validations methods to help optimize research strategies. Develop analysis tools and routines to be used by other researchers in the organization. Apply current and new statistical tools to the analysis of experiments. Design and propose experiments, based on analysis results and/or new technological developments.

Required Skills:
A Ph.D. in bioinformatics, statistics, statistical genetics, or in a related discipline with a solid statistical training is required. The candidate should demonstrate ability to work as a team member, have good communication skills, be creative at problem solving, and be detailed-oriented.

Consideration will be given if the candidate could demonstrate any of the following skills: Computer programming as well as building, querying, and managing large databases. Prior exposure to quantitative and population genetics, and the application of molecular markers to large/complex pedigrees. Experience with simulation procedures and Bayesian analysis.
Contacts:http://sh.webhire.com/Public/554/jd1224976.html

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21/02/2003[AGMM]Postdoctoral Positions, Computational Cell Biology
Source:SMB
Date de parution:21/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:La Jolla (Californie) (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
POSTDOCTORAL POSITIONS IN COMPUTATIONAL CELL BIOLOGY
at The Scripps Research Institute, La Jolla, CA

Starting August 2003, we have several openings in our research program on computational cell biology, which is part of the new TSRI Center of Integrative Molecular Biosciences (CIMBio). The mission of CIMBio is to foster multidisciplinary studies of molecular machines, with the aim of determining their structure, their mechanism of action, and their dynamic behavior in the context of living cell. Specifically, our lab is working on biophysical modeling of cell migration and chromosome segregation and on using these systems to test the applicability of advanced quantitative live cell microscopy in conjunction with computational data analysis and interpretation to build high-content screens for genetic and molecular function. A long-term goal of this research is to study the molecular mechanisms of diseases like cancer and the application of live cell imaging and modeling to drug discovery. The lab collaborates with first class cell imaging and molecular biology labs within CIMBio and at the MIT in Cambridge, MA. Joint work with biologist and microscopists in an open lab environment will be an essential component of this research, and upon preference of the candidate, substantial effort can be spent on own experimental work.

Requirements:
Ph.D. degree in Biophysics, Applied Math, Mechanical/Electrical Engineering, or Computer Science, preferably with preliminary experience in applying these disciplines to biological research questions. Applications from cell and molecular biologists who wish to learn computational and modeling techniques are equally welcome.
Contacts:Applicants should email a CV, publication list and a summary of ongoing and future research plans and at least 2 reference letters.
Email to: danuser@biomech.mavt.ethz.ch
More info: http://cimbio.scripps.edu/groups/Danuser/

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20/02/2003[AG]Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)
Source:AGM2
Date de parution:20/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Hertfordshire (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for 2 postdoctoral fellowships in the group of Kim Hammond-Kosack studying Fusarium ear blight and mycotoxin control in Europe’s Cereal Crops. Our studies employ a wide range of techniques from plant pathology, molecular biology, bioinformatics, wheat genetics and functional genomics (http://www.iacr.ac.uk/ppi/wptop.html).

One post-doc fellow will be in charge of the bioinformatics analysis of the plant’s response to Fusarium ear blight infection in both susceptible and resistant wheat cultivars. The second post–doc will be in charge of the bioinformatics analysis of the Fusarium graminearum genes expressed in planta, during the invasion of susceptible and resistant wheat cultivars.

Both posts will take advantage of Monsanto’s proprietary wheat EST collection and transcriptome profiling data sets, specifically generated for these project. In addition, there are growing public wheat ESTs collections and in 2003 the entire F. graminearum genome will be sequenced at the Whitehead Institute, Boston, USA.

Candidates should have a strong background in bioinformatics and molecular biology. An interest in fungal biology/host-pathogen interactions is desirable but not essential. Collaboration and teamwork are essential to this position. Candidates should also show excellent interpersonal skills.

The work will be based in the new Centenary laboratory at Rothamsted Research, with access to first class molecular and analytical facilities, bioimaging, controlled environments and new glasshouses.

Eligible candidate for these 2 posts must be under 35 years of age, have obtained their Ph. D. degree within the last 5 years, hold a European passport and have not worked previously in the UK.
Contacts:Applications, including a detailed CV, a brief summary of research interests, the names and addresses of three referees, should be addressed to Dr Kim Hammond-Kosack, Rothamsted Research, Plant-Pathogen Interaction Division, Harpenden, Hertfordshire, AL5 2QJ, UK. Tel 44(0) 1582 763133 Ext 2240, Fax 44(0) 1582 715009. E. mail kim.hammond-kosack@bbsrc.ac.uk.

Rothamsted Research is situated 30 Km north of London, England and has excellent links to the major motorway, rail and air routes. This government institute with approximately 500 staff undertakes basic and strategic research on sustainable plant-based agriculture and the environment.

Both positions are available April 2003-March 2005 and are funded under EU Framework V.

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20/02/2003[AGMM]Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot
Source:
Date de parution:20/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Genève (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Le groupe Swiss-Prot (http://www.expasy.org/sprot) de l’Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.isb-sib.ch/) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de levures (S. cerevisiae, S. pombe, etc..) dans la base de données Swiss-Prot .

Le projet a pour but une annotation de qualité des protéomes de levures. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l’annotation manuelle des protéines. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

Nous offrons ce poste au sein d’une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s’intégrerait avec plaisir dans ce cadre. D’autre part, ce travail implique une collaboration étroite avec l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI) (http://www.ebi.ac.uk/), Hinxton, UK, et nécessitera des déplacements réguliers à l’étranger.

Conditions indispensables :
Biologiste ou biochimiste, expert en biologie des levures. Bonne connaissance de l’anglais. Travail à temps complet. Nationalité : suisse ou permis C. Bonne motivation pour travail en équipe. Motivation claire pour Swiss-Prot.
Contacts:Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu’au 31 mars 2003, à :
Claudia Sapsezian
Levure
Institut suisse de bioinformatique
CMU
1, rue Michel-Servet
1211 Genève 4
Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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20/02/2003[AGMM]Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships
Source:http://www.cbmi.upmc.edu/training-2003.htm
Date de parution:18/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Pittsburgh (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:

The Center for Biomedical Informatics at the University of Pittsburgh expects to have openings for predoctoral and postdoctoral informatics traineeships beginning in the summer of 2003. The Pittsburgh Biomedical Informatics Training Program has more than 60 core and affiliated faculty members with expertise in:
  • Knowledge-based systems, medical artificial intelligence, biosurveillance
  • Simulation and modeling of complex phenomena in biology and health care
  • Information system development, software, and knowledge engineering
  • Information retrieval, problem solving, and cognition
  • System evaluation, social/organizational factors, and health services research
  • Machine learning, data mining, and knowledge discovery
  • Image processing, integration, and distribution
  • Enterprise computing: integrated architectures and clinical and biomedical applications of the Internet
  • Bioinformatics
Contacts:Candidates may apply for a master’s and/or doctoral degree in Biomedical Informatics, in the biomedical informatics track of the Intelligent Systems Program. Applicants should be either health professionals, or non-health professionals with a background in a technical field such as computer or information science.

Individuals with an interest in any of these areas are invited to visit the program’s web site, send email to training@cbmi.upmc.edu, or call 412-647-7131 for further information.

The University of Pittsburgh is an affirmative action, equal opportunity employer.

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20/02/2003[AGMM]Postdoc at the Computational and Molecular Population Genetics lab
Source:Telejob
Date de parution:19/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bern (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
URL: http://www.telejob.ch/telejob/offer.xml?offer=1661
Company: Zoological Institute, University of Bern

Description:
A position is anticipated to open at the CMPG lab to study the effect of spatial expansions and contractions on molecular diversity. Research will consist in developing theoretical and computer models of genetic diversity in a population experiencing range variation in an heterogeneous and spatially explicit environment.
Education: Applicants must have or be about to finish a Ph.D. in Population Genetics, Statistics, or Bioinformatics. Candidates having expertise in statistics, GIS programs, computer programming (C/C++), and molecular population genetics are particularly encouraged to apply. Lab main language is English, but notions of German or French are welcome. Entrance Upon: April or May 2003 Duration of appointment: two years

Remarks: The CMPG lab and the Zoological Institute of the University of Bern provide exceptional working facilities (library, computer cluster, laboratories), and an intellectually stimulating environment, with many seminars and courses being held in English (see http://cmpg.unibe.ch/ for
details)
Jobsharing possible: no
Only for persons notified workless in Switzerland?: no
Contacts:Contact address (for applications): Zoological Institute University of Bern R. Schneider Baltzerstrasse 6 3012 Bern Email (for applications): laurent.excoffier@zoo.unibe.ch Link to the company: http://www.zoology.unibe.ch

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20/02/2003[AGMM]POSTES DE PROFESSEURS DES UNIVERSITES ET DE MAITRES DE CONFERENCES
Source:AGM2
Date de parution:20/02/2003Date limite de réponse:21/03/2003
Lieu: (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
LES POSTES DE PROFESSEURS DES UNIVERSITES ET DE MAITRES DE CONFERENCES SONT PUBLIES AU JOURNAL OFFICIEL DU 20 FEVRIER 2003, le dépôt des dossiers est fixeé au 21 MARS 2003 minuit.
Contacts:Vous pouvez consulter ces postes sur le site internet du journal officiel http://www.legifrance.gouv.fr/html/frame jo.html ou http://www.journal-officiel.gouv.fr/

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16/02/2003[AG]Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute
Source:
Date de parution:16/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:???Secteur:public
Description de l'annonce:
Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute

The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of computational and experimental genome research. We have strengths in bioinformatics software, algorithm and database development, and exceptional data and computational infrastructure. The Wellcome Trust has recently awarded £300 million to the Sanger Institute to support our new biological/genetics research direction as well as our existing programmes over five years, plus £65 million for IT infrastructure.

Applications are invited for full time faculty positions at the rank of Investigator, Senior Investigator, or Principal Investigator . For faculty members, we are looking for individuals with a proven background in first class research, with a strong, vision and innovative projects that are ideally in areas related to our large scale experimental programmes. We encourage relevant applications from people with backgrounds in bioinformatics, computer science or mathematical or scientific areas.

Head of Production Software: We are also looking for a new head of our production software group, who will be responsible for directing teams involved in internal data processing. This position will have faculty status at one of the levels listed above, with independent research opportunities.

The Sanger Institute is committed to provide a level of support so that there is no impediment to performing high quality and productive science. This includes access to our infrastructure as well as unencumbered support commensurate with the rank of appointment.
Contacts:Applicants are requested to send their curriculum vitae with a full publication list by 31st March 2003. You should also provide a two page description summarising your research accomplishments to date and a three page plan of your future research goals and strategies indicating how these fit with, or make use of Sanger Institute programmes and infrastructure.

All candidates must provide three letters of recommendation. Please arrange to have these letters and application sent to:
Richard Durbin
Faculty Search Committee
The Wellcome Trust Sanger Institute
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SA
ENGLAND

Email: rd@sanger.ac.uk
FAX: +44 (0) 1223 494714

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12/02/2003[AGMM]Stage postdoctoral Marie Curie : Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation
Source:ABG-7601
Date de parution:05/02/2003Date limite de réponse:04/04/2003
Lieu:Billingham (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 05/02/2003
Date de fin de diffusion prevue : 04/04/2003

Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation

High throughput experimentation techniques are leading to a rapid increase in the quantity of data generated by researchers. This requires increased attention to experimental design, data management and data mining activities as well as data modelling. This applies equally to data generated from catalyst characterisation and reactor/process diagnostic techniques. In both of these areas the key information is often hidden in a large amount of data.

The fellow will be involved in data mining and modelling activities in support of a number of business activities and will thus receive broad training in the application of the appropriate mathematical and modelling techniques. Specific activities will include experimental design and data evaluation from high throughput experimentation, kinetic studies, interpretation of catalyst characterisation data, processing of signal data from process diagnostic techniques and data mining of manufacturing plant dat a as well as use of models and modelling techniques to these applications.

Researchers must be nationals of an EU Member or Associated State, or have resided in an EU Member State for at least the last 5 years and normally be under 35 years of age.
Contacts:Applicants interested in any of the above opportunities should apply in writing to Sue Magson, Synetix, PO Box 1, Billingham, Cleveland, TS23 1LB, UK, or by e-mail to sue_magson@ici.com Further details about Synetix can be found on the web-site http://www.synetix.com and further details about Marie-Curie Fellowships on http://www.cordis.lu/improving/home.html

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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10/02/2003[MM]PhD Position, Computational Molecular Biology
Source:http://www.cnd.mcgill.ca/~swain
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:01/09/2003
Lieu:Montreal (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
PhD POSITIONS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY
Centre for Non-Linear Dynamics, McGill University, Montreal. http://www.cnd.mcgill.ca

Applications are invited for one or two PhD positions in the area of computational molecular biology at McGill University. This is an exciting, rapidly growing field driven by the recent explosion in quantitative biological data. See Nature 397, 89 (1999). Students will investigate the `design' behind biochemical information processing networks in simple living organisms. We use techniques from stochastic systems, non-linear dynamics, statistical mechanics and Bayesian probability theory. The positions are ideal for students, who have or expect to obtain a good degree in Mathematics or Physics, and are committed to moving into the areas of molecular biology and bioinformatics.

The Centre for Non-Linear Dynamics is based around a group of mainly theorists in the department of Physiology. It offers a unique graduate training and is an ideal environment for gaining both modelling and biological expertise.

More details are at http://www.cnd.mcgill.ca/~swain
Contacts:Please send/email a CV with the names of two referees to Peter Swain, Department of Physiology, McGill University, 3655 Promenade Sir William Osler, Montreal, Quebec, Canada H3G 1Y6. A probable start date is around September 2003.

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10/02/2003[AGMM]Research Scholarships
Source:AGM2
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Plymouth (Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Centre for Theoretical and Computational Neuroscience University of Plymouth, UK http://www.tech.plym.ac.uk/soc/research/neural/research.html

A number of University Research Scholarships are available for students wishing to study for a PhD in the Centre starting in September/October 2003. The scholarships cover full tuition fees for three years plus an annual living-expenses stipend of £9000. Further support for living expenses is usually available via teaching assistantships.
Contacts:Interested applicants for these Research Scholarships must first make application to the University and to the Centre for admission to its PhD programme. Initially this can be done by sending an email to the Head of the Centre, Professor Mike Denham (mdenham@plym.ac.uk), including a brief statement of research interests and a short curriculum vitae, plus postal address. Applicants will then be sent formal admission application forms.

Note: The closing date for University Scholarship applications is 31st March 2003. Applications for admission to the University's PhD programme should be made well in advance of this date, ideally by the end of February.

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10/02/2003[AGMM]Postdoctoral Research Fellowship
Source:AGM2
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Plymouth (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Centre for Theoretical and Computational Neuroscience University of Plymouth, UK: http://www.tech.plym.ac.uk/soc/research/neural/research.html

A Postdoctoral Research Fellowship is available for candidates who have just completed or are about to complete a PhD in a suitable area of study, to carry out research within the Centre for Theoretical and Computational Neuroscience. The Fellowship will be for two years initially, at a salary level on the University's scales commensurate with experience and age.
Contacts:Interested applicants for this Research Fellowship should in the first instance send an email to the Head of the Centre, Professor Mike Denham (mdenham@plym.ac.uk), including a brief statement of research interests and a short curriculum vitae, plus postal address. Applicants will then be sent a formal application form.

Note: The closing date for applications for the Research Fellowship is 31st March 2003.

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07/02/2003[AGMM]210 Postdoc CNRS en 2003
Source:AGM2
Date de parution:07/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu: (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Le CNRS bénéficie d’un financement pour le recrutement de 210 post-doctorants en 2003. Rendez vous le 1er mars sur le site du CNRS pour obtenir la liste des profils.

Conditions: CDD 1 an renouvelable 2050 Euros brut mensuel
Contacts:En attendant: http://www.cnrs.fr/cw/fr/accu/postdocs.html

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06/02/2003[AG]STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE
Source:ABGe-1068
Date de parution:28/01/2003Date limite de réponse:27/03/2003
Lieu:Laval (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Un grand projet de genomique fonctionnelle appliquee aux arbres forestiers au Centre de recherche en biologie forestiere de l'Universite Laval et finance par Genome Quebec/Genome Canada, offre des opportunites uniques.

Les technologies nouvelles, le travail en equipe, le developpement professionnel et les collaborations internationales vous interessent? Voici un poste de haut-niveau qui pourra combler vos attentes!

Fonctions :

  • Etude du role de facteurs de transcription et autres genes regulateurs des arbres forestiers, impliques dans la differentiation du tissu vasculaire et la formation du bois, ou les mecanismes de defense des arbres.

  • Analyses detaillees de l'expression des genes par RT-PCR en temps reel

  • Analyse de la fonction des genes par surexpression ou inhibition chez l'epinette et le peuplier transgeniques, grace a notre plateforme specialisee de transgenese des arbres forestiers

  • Analyse des profils de transcription des cellules et arbres transgeniques par l'utilisation de puces d'ADN specialisee (microarrays)

  • Participation a la formation et l'encadrement d'etudiants et du personnel de laboratoire

  • Redaction d'articles scientifiques et presentation des resultats dans des congres specialises


  • Qualifications :

  • Diplome de doctorat (Ph. D.) en genomique, biologie vegetale, biologie moleculaire ou cellulaire, ou dans un domaine connexe

  • Une bonne connaissance pratique des methodes de biologie moleculaire est requise

  • Experience souhaitable en manipulation d'ARN, etudes sur micropuces d'ADN, RT-PCR en temps reel ou transgenese des plants

  • Tres bonne communication orale et ecrite

  • Aptitude demontree pour le travail en equipe

  • Capacite au travail autonome et a l'encadrement

  • Tres bonne connaissance de l'anglais ecrit et oral

  • Contacts:Poste disponible des maintenant, contrat jusqu'au 31 mars 2005 avec possibilites de renouvellement.

    Par e-mail : genome.foret@rsvs.ulaval.ca

    SVP, pour postuler, soumettre :
    - une lettre de presentation
    - un curriculum vitae a jour
    - les noms et coordonnees de trois personnes references

    La description du projet est disponible a l'adresse suivante : http://forgenome.rsvs.ulaval.ca

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    06/02/2003[AG]Plant Genomics Research Unit PostDoc
    Source:
    Date de parution:17/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The URGV, Plant Genomics Research Unit (Evry, France), supported by INRA and the CNRS, has a post-doctoral position available immedialetly.

    Description : The applicant must have a PhD in molecular biology, with expertise in bioinformatics. He/she will be involved in a project studying large scale transcription profiling of Arabidopsis. The aims of the project is to develop a Compendium of Arabidopsis Gene Expression (funded by the European Union) using the european Complete Arabidopsis Transcriptome Microarray (CATMA), for Arabidopsis gene function discovery through large scale expression data analysis. Two teams at the URGV are involved in microarray analysis, comprising 2 senior scientists, 5 engineers, 2 post-docs, one PhD student and 2 technicians. The URGV also includes a strong bio-informatics/statistics group.

    Salary : 1800EUR per month, free of charge
    Contacts:Dr Renou jean Pierre
    The Transcriptome Group
    INRA/CNRS -URGV
    2, rue Gaston Crémieux, CP5708, 91057 Evry cedex, France
    Phone + 33 1 60 87 45 17
    e-mail : renou@evry.inra.fr

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    06/02/2003[AG]annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana
    Source:BioInfo
    Date de parution:06/02/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Orsay (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre d'un projet Génoplante nous recherchons un DESS biologiste-bioinformaticien motivé, désirant participer à l'annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana.

    L'annotation semi-automatique du génome d'Arabidopsis thaliana a permis l'identification et la localisation d'environ 29.000 gènes. Cependant, cette première annotation, puisque rapide, est de mauvaise qualité. Or l'ensemble des projets de génomique fonctionnelle qui se développent actuellement dépend de ces annotations.
    Le but du projet est d'obtenir une annotation homogène, fiable, documentée et traçable des gènes d'Arabidopsis et de leurs protéines puis de les saisir dans une base de données à valeur ajoutée. La ré-annotation est effectuée, au sein de laboratoires experts, par l'analyse exhaustive de familles de gènes, à l'aide d'un protocole d'annotation défini lors de la première phase du projet et mettant en oeuvre les logiciels de prédiction les plus efficaces actuellement.

    Ce projet, effectué par un réseau de laboratoires français et SwissProt présente une réelle opportunité pour acquérir rapidement une expérience en analyse de séquences, fouille de données dans les grandes bases de données de séquences, connaissance des génomes et analyse fonctionnelle bioinformatique.

    Lieu: IBP à Orsay.
    Durée : 18 mois, début probable 15 mars - début avril 2003.
    Rémunération: niveau IE CNRS.
    Contacts:Responsable du projet: C. Toffano-Nioche, CR CNRS
    Responsable du laboratoire: A. Lecharny, DR CNRS.
    Equipe "Analyse des génomes des plantes"
    Institut de Biotechnologie des Plantes
    lecharny@ibp.u-psud.fr
    Tel : 33 (0)1 60 87 45 18
    Fax : 33 (0)1 60 87 45 49
    http://www.ibp.u-psud.fr/

    Equipe de bioinformatique de l'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) INRA-CNRS-Univ. Evry-Val d'Essonne
    2, rue G. Crémieux
    CP 5708
    F-91057 Evry CEDEX
    FRANCE
    http://www.evry.inra.fr/

    Claire Toffano-Nioche (toffano@ibp.u-psud.fr)
    Génome, évolution et développement de la plante
    Institut de Biotechnologie des Plantes
    bat.630 - Universite Paris-Sud
    91405 - Orsay cedex
    tel.: 01 69 15 34 04

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    06/02/2003[AGMM]2 Senior Principal Investigators and 5-7 Junior Principal Investigators
    Source:http://www.biomedscientistjobs.com/program/member/job_page.cfm?jobID=2282
    Date de parution:10/03/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Vienne (Autriche)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Job Summary:
    The Institute of Molecular Biotechnology (IMBA) will open its doors in Vienna, Austria, in 2003

    Job Description:
    IMBA is a research initiative funded by the Austrian Academy of Sciences to promote excellence in molecular biology and genetic research. IMBA will be located at the Campus Vienna Biocenter, and, together with the internationally renowned Research Institute of Molecular Pathology (IMP), will form the IMP-IMBA Genome Research Center. Research at IMBA will use the mouse and other model organisms to investigate how animals develop and function, and to explore the molecular basis of human diseases.

    For further information about IMBA, please, refer to: http://www.imba.oeaw.ac.at IMBA is actively recruiting 2 Senior Principal Investigators and 5-7 Junior Principal Investigators to establish independent research groups. The positions will become available in 2003. A generous package will be offered, including internationally competitive salaries for the group leader, postdoctoral fellows, PhD students and technicians, as well as start-up funds and running costs. In-house service facilities include light and electron microscopy, microarrays, DNA and protein sequencing, peptide synthesis, antibody and recombinant protein production, bioinformatics, and a large service for transgenic animals. We aim to establish a creative, stimulating and international environment for research in modern biology with English being the working language.
    Contacts:All applications are encouraged and selections will be solely based on scientific excellence. The applicants will be evaluated by IMBA Scientific Search Committee consisting of internationally renowned scientists. Deadline for applications is March 15th, 2003. Applications should include a CV, research proposal and 3 letters of reference and be sent to: Prof. Josef Penninger, Austrian Academy of Sciences, 1010 Vienna Dr., Ignaz Seipel-Platz 2, Austria e-mail: josef.penninger@oeaw.ac.at

    Contact Info: Job # 2282
    Prof. Josef Penninger
    IMBA - the Institute of Molecular Biotechnology AUSTRIA
    Email: josef.penninger@oeaw.ac.at

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    06/02/2003[AGMM]Poste d'annotateur(trice) SWISS-PROT
    Source:
    Date de parution:06/02/2003Date limite de réponse:24/01/2003
    Lieu:Genève (Suisse)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le groupe SWISS-PROT (http://www.expasy.org/sprot) de l'Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.expasy.org) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de mammifères dans la base de données SWISS-PROT dans le cadre du projet « Human Proteomics Initiative » (HPI) (http://www.expasy.org/sprot/hpi/).

    Le projet HPI a pour but une annotation de qualité du protéome humain. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l'annotation manuelle des protéines humaines et de leurs orthologues chez les mammifères. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes résultant d'épissage alternatif, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

    Nous offrons ce poste au sein d'une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s'intégrerait avec plaisir dans ce cadre.

    Conditions
    Biologiste ou biochimiste.
    Bonne connaissance de l'anglais.
    Poste à temps complet.
    Nationalité : suisse ou permis C.
    Disponibilité du poste : à convenir.
    Salaire : pendant les 2 premières années, classe 10 (selon les barèmes de l'état de Genève), annuités selon le niveau de formation. Passé ce délai, possibilités de progression intéressantes. Durée de l'engagement : contrat à durée indéterminée.
    Contacts:Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu'au 31 janvier 2003, à :

    Claudia Sapsezian
    HPI
    Institut suisse de bioinformatique
    CMU
    1, rue Michel-Servet
    1211 Genève 4
    Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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    06/02/2003[AGMM]CUSTOMER SUPPORT SPECIALIST
    Source:AGM2
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Opportunity: CUSTOMER SUPPORT SPECIALIST: Cambridge, MA PRODUCT SERVICES JOB DESCRIPTION Customer Support Specialist Cambridge, MA office / LION bioscience, Inc.

    Primary Function:
    Position is responsible for the first line quality, timeliness, and commitment in customer support for all LION products.

    Principal Duties and Responsibilities:
  • Installation and maintenance of LION software products at customer sites.
  • Creation, implementation and documentation of installation procedures.

  • Installation of test versions in-house.
  • Trouble-shooting of installation procedures
  • Setup and maintenance of support compute infrastructure.
  • Creation, monitoring and maintenance of customer remote access setups.

  • Updating of contract customer software products.
  • Administrator overviews of software.
  • Influences development of customer training materials.

    MINIMUM JOB REQUIREMENTS:
  • Sound knowledge of UNIX, Linux and Windows NT.
  • At least 2 years in IT preferably to the pharmaceutical or biotechnology industries.
  • Excellent written and verbal communication skills.
  • Dynamic, hard working and action orientated. · Demonstrated ability to operate singly and as part of a team. · Ability to interface credibly within customer organizations.

    DESIRED QUALIFICATIONS:
  • BS in Computer Science.
  • Practical experience with Oracle, MySQL, Perl, Java, C++.
  • Object-oriented development experience.
  • Knowledge of the pharmaceutical and life science arenas.
  • Familiarity with the biotechnology industry.
  • Previous experience in technical support environment.
  • Contacts:cliquez-ici

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    06/02/2003[AGMM]BIOINFORMATICS
    Source:bioinformatics.org
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Chicago (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Summary:Opportunity: BIOINFORMATICS (with GENOMICS) with experience in DATA WAREHOUSING (with ETL) Knightsbridge Solutions, LLC are looking for BIOINFORMATICS (with
    Genomics) with experience in DATA WAREHOUSING (with ETL).

    Recently voted by INC as one of the fastest growing consulting firms in the country, Knightsbridge Solutions, LLC is a privately held systems integration consulting firm which specializes in delivering solutions for Fortune 200 clients who have big data problems. We design and build scalable architectures that address data integration, ETL, data repositories and analytics.
    Contacts:Please email your COMPLETE resume to me at tjones@knightsbridge.com and be sure to include your full name, address, phone number, email, and the words "bioinformatics.org -BIOINFORMATICS (datawarehousing) opportunity " in the subject line.

    We invite your to learn more about our company by visiting our website which is listed below. We look forward to hearing from you soon.

    Todd E. Jones
    Internet Researcher
    Knightsbridge Solutions
    tjones@knightsbridge.com
    732-603-2700 ext.2223

    http://www.knightsbridge.com


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    30/01/2003[AG]8 postes
    Source:AGM2
    Date de parution:30/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Munich (Allemagne)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    8 postes à pourvoir en relation avec les base de données développées au Munich Info center for Protein Seq (MIPS).
    Pièce Jointe : mips.pdf (64 ko)
    Contacts:Voir http://mips.gsf.de/positions

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    29/01/2003[MM]Postdoc in COMPUTATIONAL MEDICINAL CHEMISTRY
    Source:bioinformatics.org
    Date de parution:29/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Salford (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for a BBSRC-funded post-doctoral position
    available immediately to work with Dr Sylvie Ducki on a project
    entitled the Design, Synthesis and Biological Evaluation of Novel
    Tubulin Ligands.

    The aim of the project will be to establish a molecular model for the
    interactions in tubulin-ligand complexes using molecular modelling and
    docking tools.

    Candidates should have a postgraduate degree in a molecular modelling
    related subject or experience in medicinal chemistry together with a
    proven aptitude for computational work. The position will involve
    close co-operation with synthetic chemists as well as biochemists
    therefore applicants should enjoy teamwork and show an active interest
    in related scientific disciplines.

    The salary will be on the RA1A scale (£17,626-£26,491) depending on
    age and experience. The post is available immediately and will be for
    two years.
    Contacts: Interested applicants should submit (for a quick contact use e-mail) a
    cover letter and a CV to Dr. Sylvie Ducki, (s.ducki@salford.ac.uk)
    Centre for Molecular Drug Design, Cockroft Building, University of
    Salford, Salford, M5 4WT, UK.

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    29/01/2003[MM]Mathematicien - Modelisation dynamique en biologie
    Source:ABG-7555
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:25/02/2003
    Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Helios Biosciences, jeune entreprise de biotechnologies, lelaureate du 4eme concours creation-developpement d'entreprises innovantes du Ministere de la Recherche,selectionne des cibles therapeutiques pour soigner les maladies neurologiques grace a des modeles dynamiques des reseaux d'interactions moleculaires du systeme nerveux.

    Le poste concerne le developpement et la mise au point d'un systeme de modelisation de processus biologiques complexes sous la forme de reseaux . Le collaborateur aura pour mission la recherche et la selection l'algorithmes,leur programmation et integration dans le modele, la mise au point et la validation.

    Notre futur collaborateur, docteur ou ingenieur, aura une formation de haut niveau en Mathematiques, et si possible des notions en biologie. Pour mener a bien sa mission au sein de la societe, il est indispensable que celui-ci ait une bonne competence en algebre et en statistiques (notamment analyse matricielle, theorie des graphes). L'algorithmique de propagation / retro propagation de signaux dans des reseaux sera maitrisee.
    Autres exigences : autonomie en matiere de programmation, anglais lu et parle, dynamisme et capacites d'initiative (contexte start-up de biotechnologies).
    Contacts:Priere de nous envoyer votre CV, votre date de disponibilite et votre souhait de remuneration.

    Votre contact est :
    Olivier SOUPAULT olivier@heliobiosciences.com
    06 08 69 24 50

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    29/01/2003[AG] Molecular Database Indexer
    Source:http://www.bind.ca/index.phtml?page=jobs
    Date de parution:29/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Toronto (Canada)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Indexers will gather information from the published literature in order to enter and curate database records.

    The ideal candidate is a recent Ph.D. or M.Sc. graduate with experience in the detection and analysis of molecular interactions.
    You have excellent written communication skills and an interest in bioinformatics (training is provided). You may also have a broad knowledge in one or more of the following areas: signal transduction pathways, regulation of gene expression, metabolic pathways in any organism, biophysical measurement of molecular interactions and/or enzyme kinetics.
    Contacts:We will be conducting several rounds of hiring throughout the year. Qualified individuals are encouraged to apply directly with salary expectations, availability and references to:

    Blueprint Positions c/o
    Christopher W.V. Hogue, Ph.D.
    Samuel Lunenfeld Research Institute
    Rm 1063, Mt. Sinai Hospital
    600 University Ave.
    Toronto, Ontario. Canada. M5G 1X5
    (416) 586-4800 xt2866
    fax (416) 586-8869
    blueprintjobs@mshri.on.ca

    Only suitable applicants will be contacted.

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    15/01/2003[AG]Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques
    Source:ABG-7538
    Date de parution:08/01/2003Date limite de réponse:08/02/2003
    Lieu:Montpellier (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:

    ABG-7538-POSITION POST-DOCTORALE EN STATISTIQUES, BIOSTATISTIQUES/BIOMATHEMATIQUES - Montpellier, France

    Le departement Immunologie-Oncologie recherche, dans le cadre
    d'analyses de donnees generees par les puces a ADN, un post-doc pour developper des methodes statistiques appliquees au transcriptome.
    Le candidat devra posseder un doctorat de Statistiques, biostatistiques et/ou biomathemathiques, une excellente connaissance des methodes statistiques et d'analyse de donnees de masse. Des connaissances en biologie seront tres appreciees.
    La duree de ce programme est de 12 mois renouvelable 6 mois.
    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.
    Contacts:Omar JBILO
    De preference par e-mail : omar.jbilo@sanofi-synthelabo.com
    Sanofi-synthelabo 371 Rue du Professeur Blayac
    34184 MONTPELLIER Cedex 4 - France


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    15/01/2003[AG]BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST
    Source:BioInfo
    Date de parution:15/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Toulouse (31) (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    SANOFI-SYNTHELABO RECHERCHE BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST

    We are currently looking for a bioinformatics scientist to fill a positionin the Bioinformatics unit within the Department of Molecular and Functional Genomics.

    Applicants will be involved in sequence analysis with a strong emphasis on genome and proteome data mining and the developing of application pipelines for gene discovery, to identify potentially new and innovative drug targets in both public and proprietary genomic databases. She/he should also be able to participate in projects concerning other computational biology systems (transcriptome analysis of microarray chips, proteomics analysis by 2D gel electrophoresis, protein characterization by mass-spectroscopy fingerprinting, etc.) as well as in projects integrating data coming from all the bioinformatics systems.

    The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or related area. She/he should have a strong experience in conceiving sequence analysis pipelines and in using state of the art sequence analysis tools and software packages. Solid knowledge of molecular biology, biochemistry and metabolic pathways is required, as well as strong programming skills and background in computing science (Unix, Perl/CGI, HTML, Java, C/C++, SQL, Oracle).

    Excellent communication skills and a collaborative attitude to work in multidisciplinary teams are essential. A working knowledge of french is not indispensable.

    In return for your expertise, we offer a competitive salary/benefits package that includes the opportunity to participate in the success of the company.

    The post will be based at Labège, on the southeastern of Toulouse.
    Contacts:If you are interested in this position, please forward your application immediately to: Dr. Edgardo Ferrán, Bioinformatics, Molecular and Functional Genomics Department, Sanofi-Synthélabo Recherche, Labège Innopole, BP 137, 31676 Labège Cedex, France. Fax: +33 561004228.
    e-mail: edgardo.ferran@sanofi-synthelabo.com.

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    15/01/2003[AGMM]postes Maitre de Conf et Prof
    Source:
    Date de parution:15/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu: (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Comme chaque année, la Guilde des Doctorants recense les postes Maitre de Conf et Prof ouverts au concours. NOTE IMPORTANTE: Pour concourir, il faut avoir était qualifié entre 1999 et 2003 inclus.
    Liste des postes 2003 disponibles:
    http://guilde.jeunes-chercheurs.org/Public/Univ/2003/fiches/

    Un peu de pub au passage: visitez le site de la Guilde:
    http://guilde.jeunes-chercheurs.org/guilde/
    Contacts:

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    02/01/2003[AG]BioInfomaticien stockage et analyse de données
    Source:BioInfo
    Date de parution:17/12/2002Date limite de réponse:17/01/2003
    Lieu:Toulouse (31) (France))Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Un CDD de 11 mois (salaire mensuel brut : 1868 euros) est proposé dans
    l'équipe informatique du projet AGENAE (Analyse du Génome des Animaux
    d'Elevage) sur le site INRA de Toulouse-Auzeville (31), à partir du 1er
    févier 2003.

    Le projet AGENAE a pour but de réunir les connaissances fondamentales
    sur la structure des principaux génomes d'intérêt pour l'élevage - dans
    un contexte de collaboration internationale - et valoriser les
    expertises concentrées à l'INRA en génétique moléculaire et en
    physiologie expérimentale sur les systèmes biologiques bien contrôlés
    dont l'institut dispose (animaux /ad hoc/ et installations
    expérimentales correspondantes).

    L'équipe bio-informatique (SIGENAE) composée de cinq personnes, met à
    disposition des différents laboratoires du projet (plus de 20) des
    outils et des services bio-informatiques. Ses travaux actuels sont
    centrés sur l'analyse de la qualité des séquences d'EST, leur contigage
    et leur annotation.

    Les demandes des utilisateurs pour la période à venir concernent
    l'analyse d'expression et la cartographie.

    Le bio-informaticien recruté aura comme mission de mettre en place des
    outils de stockage et d'analyse de données d'expression et d'apporter le
    support nécessaire à leur utilisation.

    Le niveau d'étude demandé est BAC +4 et plus.

    Cette personne doit être familière avec le traitement des données
    d'analyse d'expression (parties informatique et statistique), connaître
    le langage PERL et la programmation d'interface web.

    Contacts:Veuillez envoyer vos lettre de motivation, CV détaillé et demande de renseignement à Christophe Klopp (christophe.klopp@toulouse.inra.fr)
    = Christophe KLOPP BIA INRA Toulouse 31326 Castanet-Tolosan =
    = Tel: 05 61 28 50 36 Email: christophe.klopp@toulouse.inra.fr =

    La date limite des réponses est fixée au 17 janvier 2003.

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    08/12/2002[AG]7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes
    Source:http://www.inra.fr/gap/actualite/infosgap/concoursCR2003/index.htm
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:?
    Lieu: (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le Département INRA de Génétique et d'Amélioration des Plantes recrute par concours
    7 Chargés de Recherche en 2003

    11 profils recouvrant des compétences en génétique des populations, génétique quantitative et génétique fonctionnelle sont proposés. Ces concours sont ouverts à toute personne titulaire d'un doctorat, PhD ou équivalent, quelque soit sa nationalité.
    Pièce Jointe : inra_dgap.pdf (124 ko)
    Contacts:Pour tout renseignement concernant un profil particulier, contacter les équipes directement concernées (indication en bas de chaque profil).

    Pour tout renseignement concernant l'organisation des concours (ouverture prévue début janvier 2003) contacter la Direction de Ressources Humaines (Chantal David, DRH INRA, 147 rue de l'Université,75338 Paris Cedex 07, david@paris.inra.fr)

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    08/12/2002[AG]Maitre de conférence à Polytechnique
    Source:AGM2
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Palaiseau (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Poste de Maitre de Conférences en Bioinformatique à l'Ecole Polytechnique

    Un poste à plein temps va etre ouvert pour la rentrée 2003.

    Le/la candidat(e) rejoindra le groupe de bioinformatique, nouvellement créé, que je dirige.

    Il/elle participera à l'enseignement de biologie et de bioinformatique (charge annuelle comparable à un poste de MdC à l'université; il s'agit d'enseigner à un public débutant en biologie).

    Le domaine de recherches peut aller de la modélisation et aux différents volets de la bioinformatique "structurale", jusqu'à la simulation de l'évolution ou de réseaux cellulaires, en passant par l'analyse de séquences ou la protéomique "in silico".
    Contacts:J'invite les personnes intéressées à me contacter par email (simonson@igbmc.u-strasbg.fr) en envoyant CV, liste de publications, noms de trois personnes références.

    Les dossiers officiels de candidature seront à envoyer à l'Ecole Polytechnique à Palaiseau avant le 15 février (cf http://www.polytechnique.fr).

    L'inscription sur la liste de qualification des Maitres de Conférences des Universités n'est pas nécessaire (mais un niveau équivalent sera évidemment requis).

    Thomas Simonson
    Professeur, Département de Biologie, Ecole Polytechnique Directeur de Recherches, CNRS

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    08/12/2002[AG]BioInformaticien
    Source:BioInfo
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:31/12/2002
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Un cdd de 6 mois (salaire mensuel net: 1870 euos) est proposé dans l'équipe inra de génotypage à haut débit des plantes installée au centre national de génotypage à evry (91).

    cette équipe permet aux équipes nécessitant du génotypage à haut débit chez les plantes d'accéder aux technologies de pointe, en utilisant en particulier les snp (single nucleotide polymorphism); elle participe aux programmes scientifiques des équipes du secteur végétal de l 'inra et de ses partenaires qui nécessitent des capacités de production massive de données (analyse des ressources génétiques naturelles, connaissance des génomes et des déterminants génétiques de caractà¨res phénotypiques...).

    le cng a développé un logiciel "tout en un", genalys (m.takahashi.2002)
    pour la détection des snps: incorporation directe des résultats des séquenceurs, alignement par rapport à une séquence de référence, visualisation des chromatogrammes, caractérisation automatique des snps (position, type de changement), fichier de sortie compatible avec différents formats de fichiers (dont excel), en relation avec des bases de données.

    cependant des besoins plus particuliers aux programmes réalisés par l'équipe "plantes" sont à résoudre pour permettre une plus grande efficacité dans la manipulation et l'analyse des résultats et surtout leur diffusion aux équipes partenaires.

    la présence d'un (bio)informaticien dans l'équipe pendant 6 mois permettrait
    notamment:
    • la création automatique d'une séquence "virtuelle" permettant de visualiser simultanément tous les polymorphismes connus sur une séquence à
    • partir du fichier de sortie de genalys,
    • la reconstitution automatique d'une séquence nucléotidique à partir d'une séquence de référence et des positions et qualité des snps identifiés.
    • la constitution automatique des haplotypes et leur tri en fonction de leur proximité phylogénétique.
    • le calcul des estimateurs usuellement utilisés pour décrire la variabilité génétique des populations: hétérozygotie, fréquence des snps, des haplotypes.

    la personne recherchée doit être capable de concevoir des programmes en c,c++, perl. la connaissance de java serait appréciée.

    le cdd en question peut commencer au plus tard le 01/01/03.
    Contacts:pour tous renseignements, contacter dominique brunel (brunel@cng.fr)

    centre national de génotypage
    2 rue gaston crémieux cp 5721
    91057 evry cedex


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    03/12/2002[AG]Postdoctoral position : Genomique bacterienne
    Source:ABG
    Date de parution:25/11/2002Date limite de réponse:25/12/2002
    Lieu:Jouy en Josas (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The Unite de Virologie et Immunologie Moleculaires of the Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) has a 18-month postdoctoral position available for someone interested in bacterial genomics. Theproject is supported by a grant from INRA and involves the sequencing of the whole genome of one of the most economically significant fish-pathogenic bacterium worlwide. The position is available immediately and will be based in the INRA research center in Jouy-en-Josas, close to Paris, France. We are seeking a person with proven skills and experience with a wide range of molecular techniques and bioinformatic analyses. The applicants' nationality should be other than French. The laboratory has access to a variety of facilities in the general area of microbial genomics. More details about the project can be provided on request.
    Contacts:Send CV or request for more informations to abdenour@jouy.inra.fr

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    28/10/2002[MM]Database Mining en Olfaction
    Source:ABGt-2323
    Date de parution:23/10/2002Date limite de réponse:01/12/2002
    Lieu:Orléans (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    ABGt-2323-Database Mining en Olfaction - Universite d'Orleans

    Date de debut de diffusion du poste : 23/10/2002
    Date de fin de diffusion prevue : 01/12/2002

    Une bourse de these est disponible au Laboratoire de Chimiometrie et BioInformatique (CBI) de l'Universite d'Orleans. Cette structure, liee a plusieurs partenaires industriels, travaille sur differentes thematiques concernant la Chimie Medicinale, la biodisponibilite (ADME), la toxicite et l'Olfaction par les methodes de la Modelisation Moleculaire et
    Database Mining (DBM).

    Le sujet de these propose consiste a travailler dans le domaine de l'olfaction en exploitant plusieurs techniques DBM innovatrices. Le candidat doit posseder des bonnes connaissances en BioChimie. Une experience en Chimie Informatique, modelisation
    moleculaire et gestion de bases de donnees constituerait un plus.
    Contacts:Les candidats doivent envoyer un CV en format MS Word (avec une photo d'identite jointe), une lettre de motivation et deux references a:

    Prof. Jacques R. CHRETIEN
    Lab. Chimiometrie et BioInformatique
    Universite d'Orleans
    B.P.6759
    45067 Orleans Cedex 2
    Email: jacques.chretien@univ-orleans.fr
    http://iris.univ-orleans.fr

    et, pour connaissance, a:
    Dr. Marco Pintore (Directeur Adjoint)
    Email: marco.pintore@univ-orleans.fr

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    18/10/2002[AG]IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER
    Source:http://www.biotoile.org/annonces.asp
    Date de parution:18/10/2002Date limite de réponse:?
    Lieu: (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    HIGHLY COMPETITIVE AND FLEXIBLE REWARDS PACKAGE UK

    Our client, one of the world's leading pharmaceutical companies, is seeking a talented, experienced scientist to lead a successful, established bioinformatics team and work on the forefront of drug discovery.

    THE POSITION

    The appointed candidate will be responsible for developing new Bioinformatics initiatives to drive the discovery of new therapies for respiratory and inflammatory disease. This pivotal and challenging role offers the incumbent an opportunity to exploit, explore and champion the use of Bioinformatics throughout the drug discovery pipeline – from target
    identification through to late stage discovery, lead optimisation and pharmacogenomics.

    The successful candidate will need excellent interpersonal skills and will be expected to interact with key people in other departments, locally and internationally across the other sites which make up the research area.
    A creative approach to scientific research is important. The successful candidate will be able to use his/her knowledge, experience, and judgment to provide novel solutions to problems and to make a difference to the direction of the science.

    The new incumbent will understand Bioinformatics systems and with this knowledge, exploit and use it. He or She will help other scientists to learn and build their own bioinformatics data and will liase closely and coordinate activities with other Bioinformatics Scientists at sites in North America, UK and Sweden.

    THE CANDIDATE

    The successful candidate will have the following background:

    - A good honours degree in biochemistry, microbiology, biotechnology or biological sciences. A higher degree, such as a PhD, in a relevant discipline would be beneficial.
    - A minimum of three years’ experience in Bioinformatics, of which at least two years would have been gained in the pharmaceutical industry.
    - Practical experience of all main areas of bioinformatics, including microarray, sequence analysis, proteomics, knowledge management, etc.
    - Extensive knowledge of biological techniques used in target
    identification.
    - Proven experience of interacting with external collaborators and vendors.
    - An understanding of drug discovery processes, chemoinformatics and genetics would be desirable.
    - Proven skills in management and direction, where the candidate has managed a small team or supervised a small number of people for a minimum of two years, preferably in a team-leadership role.
    - Experience of training of personnel as well as of programming (key languages include Perl, SQL, VB, VBA, C, Javascript) would be a distinct advantage.
    - Knowledge of Maths and, in particular, of Statistics when applied to microarray data is essential.

    Contacts:CONTACT

    Quoting reference number LTDB-44-1487, please apply with your CV by email to Boris BOUQUENIAUX, Research Associate to borisbouqueniaux@euromedica.com or call on his direct line: +44 (0) 1223 209 509 for more information.

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    14/10/2002[AGMM]Poste d'ATER en section 27- Annecy
    Source:ABG (ref:ABGf-2407)
    Date de parution:02/10/2002Date limite de réponse://
    Lieu:Annecy (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Un poste d'ATER 100% en 27 est proposé à l'IUP-GSI (Génie des Systèmes
    d'Information) / Université de Savoie, sans doute début novembre (la campagne de recrutement vient de commencer).

    Profil du poste enseignement:
    - enseignements en génie logiciel et génie informatique (Bases de données,
    algorithmique objet, méthodes de conception - conception orientée objet et merise, systèmes d'exploitation, etc.)

    Candidatures en sections 27 (possibilites de 100% ou de deux 50%).
    Contacts:Prendre contact avec
    Alain Haurat, directeur de l'IUP-GSI : 04 50 09 65 81 ou par mel alain.haurat@univ-savoie.fr
    ou
    Herve Verjus / Tel: 04 50 09 65 94 / Mel: herve.verjus@univ-savoie.fr.
    Auprès du service du personnel de l'université de Savoie.

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    30/09/2002[AG]2 1/2 postes ATER vacants
    Source:hd-emploi
    Date de parution:30/09/2002Date limite de réponse:07/10/2002
    Lieu:Orsay (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A l'Universite Paris 11 (Orsay), deux 1/2 postes d'ATER sont vacants,les profils souhaités sont :
    1) Biostatistiques (DEUST) et Génétique formelle (DEUG/LICENCE)
    2) Bioinformatique/ bureautique (DEUST de Biotechnologies)

    Les enseignements débuteront dès le 1er semestre.
    Les dossiers administratifs peuvent être retirés au secrétariat du Dépt de Biologie, Bâtiment 360 au 1er étage, ou téléchargés ici

    Penser a y joindre un dossier scientifique.
    Contacts:Les dossiers de candidature sont à déposer pour le 7 Octobre 2002
    au secrétariat du département (bât 360) ou à envoyer par email à
    Antonie Alet (antonie.alet@ibaic.u-psud.fr).

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    26/09/2002[AG]2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV
    Source:Ph. marc
    Date de parution:26/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Los Angeles (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    We are accepting applications for 2 postdoc positions to join our
    group to work on modelling the evolution of drug-resistant HIV.
    These are 3 year positions. This work is funded by an NIH grant (PI Dr. Sally Blower) that will run to 2007.

    We are looking for mathematicians, mathematical/computational
    biologists, physicists or engineers. Our work is focused on using mathematical models as health policy tools to predict the impact of vaccines and treatment, and also to design epidemic control strategies. We use a variety of mathematical and computational techniques, and our research group collaborates with many infectious disease experts. For an overview of our research & recent publications please visit our web site at
    www.biomath.ucla.edu/faculty/sblower.
    Contacts:Please email Professor Sally Blower (sblower@mednet.ucla.edu), Department of Biomathematics, David Geffen School of Medicine at
    UCLA if you are interested in applying.

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    26/09/2002[AGMM]BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN
    Source:Ph. marc
    Date de parution:26/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Charleston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    MEDICAL UNIVERSITY OF SOUTH CAROLINA

    BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN

    The Department of Biometry and Epidemiology (DBE) at the Medical University of South Carolina (MUSC) invites applications for a tenure track position in Bioinformatics and computational Biology, with a focus on functional analysis of genomic data. The Department offers numerous opportunities for collaboration with colleagues in basic science and clinical departments and in various centers on campus. The computational biology activities in MUSC are supported by the Departments of Pharmacology, Biochemistry, and others.

    The successful applicant will be expected to pursue an independent research program and collaborate with investigators in the basic and clinical sciences. Rank and salary will be commensurate with the applicant's qualification and experience.
    Contacts:Applications should include a CV with bibliography, names and addresses of three references, three representative reprints, and a brief description of research plan.

    Application materials should be addressed to:
    Eberhard O. Voit, Professor and Chair of Bioinformatics Search
    Committee, Department of Biometry and Epidemiology, P.O. Box 250835, Medical University of South Carolina, 135 Cannon Street, Charleston, South Carolina, 29425; E-mail: VoitEO@MUSC.edu.

    Evaluation of applications will begin immediately, but the search will remain open until the position is filled.
    MUSC is an Equal Opportunity/Affirmative Action Employer;
    women/minorities are encouraged to apply.

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    23/09/2002[AGMM]2 1/2 postes ATER
    Source:BioDocs
    Date de parution:23/09/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Orsay (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Il reste 2 1/2 postes ATER encore vacants au centre d'Orsay (désistement et retour inesperé d'un support) pour enseigner principalement en biostatistiques, bioinformatique, bureautique (Excel) au DEUST de biotechnologie, plus quelques heures en Genetique formelle (DEUG et licence).
    Contacts:Si vous êtes interessés (ou connaissez quelqu'un susceptible d'être interessé), veuillez SVP me donner rapidement vos (ses) coordonnées.

    Jane LECOMTE
    Vice-présidente de la commission de specialistes 66-69
    jane.lecomte@ese.u-psud.fr
    Université de Paris-Sud XI
    Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution
    UPRESA - 8079 CNRS
    Bat. 362, 91405 ORSAY CEDEX
    FRANCE
    Tel : 33 (0) 1 69 15 76 57
    Fax : 33 (0) 1 69 15 73 53

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    16/09/2002[AG]Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc
    Source:ABG (ref:ABG-7332)
    Date de parution:16/09/2002Date limite de réponse:15/11/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Sygen International plc (formerly PIC International Group), a leading international farm animal genetics company, has recently been awarded two Marie Curie Industrial Host Fellowships, funded by the European Union.

    Sygen has over 1000 employees, distributed in 30 different countries. The company is developing genetic tools to select and breed improved farm animals. The company has two research laboratories, one in Cambridge (UK) and one in Berkeley (CA, USA).

    Two positions are currently available in our Cambridge laboratory where research is focussed on using genomic approaches to discover markers associated with economically important traits in the pig. The first fellowship is for a bioinformatician and the second fellowship is for a molecular biologist.

    Bioinformatician : The work will involve the development of bioinformatics tools and database mining applications. Applicants should have experience in programming and knowledge of database applications. Knowledge in molecular biology and statistics will be an advantage.

    Molecular biologist : The work will involve the discovery of SNPs (single nucleotide polymorphisms) in candidate genes. Applicants should have experience in molecular biology techniques, such as PCR and sequencing. Knowledge in SNP discovery and genotyping will be an advantage.

    The laboratory is well funded, well equipped and integrated into an academic environment. The two positions offer a unique opportunity to work with a cutting-edge genomics company.
    Contacts:For further information or to send your CV, please contact :
    Dr. Dominique Rocha
    Sygen Laboratory, Department of Pathology, University of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge, CB2 1QP, UK
    Email: dr219@mole.bio.cam.ac.uk
    phone: 44 1223 333 709; fax: 44 1223 333 346).

    The EU has strict eligibility criteria for people being accepted onto the Marie Curie Fellowship Programme. Candidates, maximum 35 years of age, national of an EU (except UK) or associated state or resident in the EU for the past 5 years are eligible to apply.
    The two positions are available from November/December 2002.


    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    11/09/2002[MM]Computational Biology or Bioinformatics
    Source:hd-emploi-info
    Date de parution:11/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Kyoto (Japon)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A Post-Doctoral Position in
    Computational Biology or Bioinformatics
    in Institute for Chemical Research
    Kyoto University, Japan

    A post-doctoral position in computational biology or bioinformatics is available at the Proteome Informatics Laboratory, Institute for Chemical Research, Kyoto University, Japan. The laboratory was established in April 2002 with donations from Silicon Graphics Japan,Ltd. The main objective of the laboratory is to build novel computational approaches for analyzing a variety of subjects related to proteomes.

    Current application areas of the laboratory include protein-protein interaction, docking between a protein and its ligand, small-molecule similarity, and pathways.

    The laboratory uses a variety of computational techniques, including algorithmic/thoretical approaches such as approximation algorithms for combinatorial optimization problems as well as machine learning techniques such as active ensemble methods and probabilistic models like finite-mixture models, hidden Markov models, and stochastic grammars.

    The candidate should have a Ph.D. and solid technical experience in one of the above fields or another field in computer science or a similar quantitative area of study. The applicant should be
    enthusiastic and energetic in doing new research in proteome
    informatics and should have sufficient programming skills in C, C++ or Java.

    The laboratory is well funded, and an excellent research environment will be provided. The position is for one year but renewable, by mutual agreement, until as late as March 2005.

    Kyoto University's Institute for Chemical Research is located 10 miles south of downtown Kyoto and 25 miles north of the center of Nara, and thus convenient to Japan's two most famous historical cities. The location is ideal for you to both enjoy Japanese traditional beauty and to devote yourself to a new research field, proteome informatics.

    Contacts:Please send your detailed curriculum vitae to:

    Dr. Hiroshi Mamitsuka
    Associate Professor
    Institute for Chemical Research
    Kyoto University
    Email: mami@kuicr.kyoto-u.ac.jp

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    10/09/2002[MM]Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics
    Source:http://jobs.ac.uk
    Date de parution:10/09/2002Date limite de réponse:03/10/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics
    Department of Biochemistry

    Applications are invited for two posts in connection with a collaboration between Cambridge University and Tripos Associates to develop software for fold recognition and comparative modelling. A computer programmer is required to integrate existing software from Cambridge into the Tripos package and to develop new alogrithms. A post-doctoral research associate with knowledge of and experience in bioinformatics is required to develop new approaches in structural bioinformatics. The posts are available up to three years depending on experience and qualifications on the University scale (£17,626 - £26,491).

    The closing date for applications is 3rd October 2002.

    The Department operates a no-smoking policy.


    The University is committed to equality of opportunity.


    Contacts:Written applications including CV and names and addresses of two referees should be sent to Mrs B Humphry, Department of Biochemistry, 80 Tennis Court Road, Old Addenbrooke's Site, Cambridge, CB2 1GA, email: bjh32@mole.bio.cam.ac.uk.

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    03/09/2002[MM]Chimie-informatique/lead informatics/CRP-VITRY
    Source:ABG (ref:ABG-7317)
    Date de parution:03/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Vitry (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    The Chemo-Informatics group, Aventis Pharma Paris, has a position open for a dynamic individual with a excellent track records in Chemo-Informatics, Chemometrics, Computational Chemistry and/or Molecular Modeling.
    In this position you will be expected to invent, develop, and/or implement algorithms, methods and methodologies in one or more of the following areas: knowledge-base reasoning systems, large data set analysis / chemometrics, data mining, automatic pharmacophore perception, physico-chemical and bio-pharmaceutic property predictions, virtual screening and diversity analysis. You will also participate in the design, integration, deployment of software or in-house developed tools associated with drug discove
    ry. You will closely work with medicinal chemistry, molecular modelling, compound management, screening, drug metabolism and pharmaco-kinetic department, drug-safety department, and information systems. You will closely interact with global and local project teams and with the other informatics groups located on different sites (USA, Germany).
    This position requires a PhD in Computational Chemistry, or in Molecular Modeling or in Chemometrics with a minimum of one or two years of post-doctoral experience preferably in pharmaceutical industry. Knowledge of Bioinformatics is an asset.
    Experience in using large database systems (data, 2D, 3D), good programming and scripting skills (C/C++, Java, Perl, Python, VB, SQL, ..), knowledge of Linux/Unix operating environment as well as of commercial drug discovery software is required. A good understanding of medicinal chemistry is highly desirable. Strong interpersonal skills, capacity and enthusiasm for working in an international, multi-disciplinary team as well as in a project managed environment are required.
    This position is located in Paris (France).
    Contacts:For further information please contact
    Claude Luttmann (claude.luttmann@aventis.com),
    Phone:+33 1 58 93 38 30,
    Cell Phone: +33 (0) 6 82 80 92 27
    Fax: +33 1 58 93 34 78.
    Application with CV should be sent to
    Dr Claude Luttmann,
    Aventis Pharma, CRP,
    13 quai Jules Guesde, BP14,
    F-94403 Vitry-sur-Seine France

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    30/08/2002[MM]Thèse en Modélisation Moléculaire
    Source:ABG (ref:ABGt-2203)
    Date de parution:30/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Southampton (Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Nous recherchons un doctorant en modélisation moléculaire dans le groupe du Dr. Jonathan Essex à l'Université de Southampton (UK), pour étudier "Le Dévelopement de Méthodes de Calculs d'Energie Libre Rapides appliqué au drug discovery".

    Cette position est en partie financée par Celltech. Le projet implique le dévelopement et l'application de nouvelles méthodes pour le calcul d'énergies libres de liaison protéine/ligand.
    Le poste est ouvert a tout candidat citoyen de la CEE, possédant un diplome en Chimie, Physique ou Biochimie.

    Disponibilité recherchée : immediate
    Le salaire annuel est de £8000 (~ 12,500 euros) minimum.

    Le département de Chimie de l'Universite de Southampton est l'un des meilleurs départements de Chimie de Grande Bretagne, il a atteint le grade 5 dans toutes les sections de Recherche.
    Les thèmes de Recherche du Dr. Jonathan Essex concernent l'application des méthodologies de simulations aux problèmes d'intérêt chimiques et biochimiques. Son travail trouve une application directe dans l'industrie pharmaceutique, avec laquelle il collabore de manière intensive. Il a reçu en 2002 la médaille Marlow de la Royal Society of Chemistry.

    Plus d'informations sur le groupe du Dr. Jonathan Essex sont disponibles à l'adresse : http://www.soton.ac.uk/~chemphys/jessex
    Contacts:Pour déposer votre candidature envoyez un CV ainsi que les noms et emails de deux références, à
    Mme Jill Queen the University of Southampton
    (email: jcq@soton.ac.uk, telephone: +44 (0)23 8059 4121).
    Pour plus d'informations contactez le Dr J.W. Essex jwe1@soton.ac.uk ou www.soton.ac.uk/~chemphys/jessex

    Merci de préciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la référence ABG de cette offre.

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    30/08/2002[AG]Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows
    Source:PlanetJobs
    Date de parution:26/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Tokyo (Japon)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Post Doctoral Fellows in Bioinformatics and Biostatistics
    Human Genome Center
    Institute of Medical Science, University of Tokyo

    Program Term: October 2002 - March 2007
    Organization: Education and Research Organization for Genome Information Science
    Joint Project by Bioinformatics Center (Kyoto University) and
    Human Genome Center (University of Tokyo)

    Post Doctoral Fellows of Interest:
    - Biostatistics, gene network, microarray data analysis, systems biology, pathway analysis,
    biosimulation, computational knowledge discovery
    - Academic Background: This program will encourage not only
    bioinformatics specialists but also who would like to become
    bioinformatics specialists through this project. Post doctoral
    fellows with biology/computer science/physics/chemistry/statisitcs are
    encouraged.
    - Condition: Within 5 years after Ph.D.
    - Term: At most 3 years in any period within October 2002 - 2007.
    Contacts:How to Apply: Please send the following items to miyano@ims.u-tokyo.ac.jp
    - CV with a publication list
    - Research proposal (please describe how your background is related to
    the proposal)

    Contact: Satoru Miyano, Ph.D., Professor
    Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo
    Email: miyano@ims.u-tokyo.ac.jp
    Phone: +81-3-5449-5442, Fax: +81-3-5449-5442
    URL: http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/

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    30/08/2002[AGMM]Thèses en data/text mining
    Source:ABG (ref:ABGt-2197)
    Date de parution:30/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Genève (Suisse)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for 2 PhD studentships in data and text mining applied to molecular biology. Successful candidates will join the Artificial Intelligence Research Group, CSD, University of Geneva. They will pursue research in connection with two European projects due to start next fall:
    BioMinT (Biological Text Mining) http://cui.unige.ch/AI-group/biomint/biomint.html
    FunProt (Knowledge Discovery in Functional Proteomics) http://cui.unige.ch/AI-group/funprot/funprot.html

    A third position (pending approval) will involve basic research on developing more powerful representations for automated knowledge discovery.

    Candidates should have the following qualifications or at least a substantial subset thereof:
    - solid training in computer science with good mathematical and outstanding programming skills
    - a strong background in data analysis, machine learning, data/text mining,knowledge representation and management (in particular ontology engineering and information integration)
    - a clear aptitude for independent and creative research
    - bioinformatics literacy or at least a strong interest in the biological sciences, particularly in genomics and proteomics
    - good communication skills in English and French (or at least a clear indication of willingness to learn the latter).

    The salary for a PhD student is around 47500 Swiss Francs per annum.
    Contacts:Please send your curriculum vitae and contact information on three references to Melanie.Hilario@cui.unige.ch.

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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    30/08/2002[AGMM]Ph.D. or M.Sc. Studentship in BIOINFORMATICS
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:26/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Winnipeg (Manitoba, Canada)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Required Skills:
    Qualified applicants must have a B.Sc. or M.Sc. in Bioinformatics, Computational Biology, or related field. Applicants with a degree in biology and extensive programming experience will also be considered.

    Send Resume to: frist@cc.umanitoba.ca

    Job Description:
    Databases are an increasingly valuable resource for biological discovery. However, in-silico experiments are only as good as the underlying datasets that are extracted from these databases. In particular, biases of many different types exist in databases. For example, databases such as GenBank and SwissProt are biased toward model species, while most species are underrepresented. As well, the extraction and refinement of data from these databases is often difficult to automate. We wish to address the following questions:
    1. What kinds of biases exist in biological databases?
    2. How can bias be quantified?
    3. Which analytical methods are affected by bias, and how are they affected?
    4. How can methods for dataset creation and analysis of genomic data be adapted to correct for the biases inherent in biological databases?

    The incumbent would pursue a degree in the interdepartmental Graduate Genetics Program . Stipends are at NSERC Fellowship rates (Ph.D.: $19,100, M. Sc. $17,300 per year) to cover living expenses, tuition and fees. Funding for up to three years has been provided as part of the Genome Canada Bioinformatics Platform ). The position is available immediately.
    Contacts:Applications MUST include: 1) a curriculum vitae, including a brief description of your academic and research experience and representative publications 2) an example of computer code that you have written, illustrating your ability to write clean and understandable code 3) the names, phone numbers and email addresses of three referees.

    Contact for more information:
    Brian Fristensky
    University of Manitoba
    Department of Plant Science
    Winnipeg, MB. CA
    Phone: 204-474-6085
    Fax: 204-474-7528
    frist@cc.umanitoba.ca
    http://home.cc.umanitoba.ca/~frist

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    29/08/2002[AGMM]IR2501 Ingénieur de Recherche - Ingénieur en biologie
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Versailles-Grignon (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur de recherche en biologie conçoit, développe et expérimente de nouvelles méthodes ou technologies dans le cadre de thématiques de recherche en biologie.

    Références du concours :
    Concours: IRA02
    Intitulé: Ingénieur en Biologie
    Lieu: Paris

    Activités:
    Conception et développement d'un projet d'analyse du métabolisme végétal. Responsabilité de la réalisation de ce projet.
    Elaboration des protocoles et mise en place des techniques analytiques adéquates
    Analyse, interprétation et diffusion des résultats
    Recherche et synthèse bibliographiques sur la thématique scientifique et les techniques d'analyse
    Suivre l'évolution scientifique et technique du domaine
    Conseiller et encadrer les utilisateurs internes et externes

    Compétences:
    Connaissances théoriques et pratiques en biologie
    Maîtrise et connaissance pratique des techniques de biochimie et de spectrométrie de masse
    Utilisation des outils informatiques pour le traitement des données et interprétation des résultats
    Connaissances des réglementations en hygiène et sécurité
    Maîtrise des techniques de présentation écrite et orale des résultats
    Maîtrise de l'anglais scientifique et technique

    Environnement:
    L'activité s'exercera au sein du laboratoire de Biologie des Semences, en interaction avec d'autres laboratoires du centre (Phytopharmacie, Nutrition azotée des Plantes). La personne recrutée travaillera sous la responsabilité d'un scientifique du laboratoire.

    Capacités personnelles:
    Diplôme de doctorat, d'ingénieur ou équivalent
    Formation en biologie avec de solides connaissances de biochimie et des techniques physico-chimiques appliquées à la biologie
    Expérience en biochimie analytique et spectrométrie de masse
    Compétence souhaitée en analyse statistique et en bioinformatique
    Autonomie, capacité d'encadrement et de travail en équipe
    Maîtrise de l'anglais scientifique
    Contacts:Personne(s) à contacter:
    Mme POLL 01 30 83 30 68
    Mme GARCÈS 01 30 83 34 79

    Annonce sur le site de l'INRA

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    29/08/2002[AGMM]IR1601 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Valbonne Sophia-Antipolis (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur expert en développement d’applications prend en charge la maîtrise d’œuvre de développement d’applications – architecture et logiciel – en assurant la conception, la conduite de la réalisation et la mise en place.

    Références du concours :
    Concours: IRE01
    Intitulé: Ingénieur en informatique et bioinformatique
    Lieu: Paris

    Références du profil :
    n° BAP: E Informatique Calculs Scientifiques
    Centre: Antibes Département: Santé des Plantes et Environnement
    unité n°: 1112 UMR INRA-UNSA Réponses des Organismes aux Stress Environnementaux
    lieu de travail (si différent): Valbonne Sophia-Antipolis

    Activités:
    Réaliser le développement de logiciels d'analyse et de stockage de données bioinformatiques.
    Intégrer du matériel de technologie avancée et les logiciels correspondants.
    Assurer la mise en oeuvre d'applications bioinformatiques et la formation d'utilisateurs de ces applications.
    Assurer la veille sur les méthodes d'analyse de génomes et de transcriptomes.

    Le poste donne droit à une prime informatique de type 1 à 100% en qualité de Chef de projet (cf. note de service n° 2001-56).

    Compétences:
    Double compétence en informatique et en biologie.
    Maîtriser une ou plusieurs langages de programmation et un ou plusieurs outils de développement.
    Maintenir un site web dynamique.
    Avoir des notions en statistiques, probabilités et bases de données.
    Connaître le domaine d'application et maîtriser ses techniques spécifiques.
    Maîtriser l'anglais scientifique et technique.

    Environnement:
    Une plate-forme de génomique fonctionnelle est mise en place par le Centre d'Antibes. Cette plate-forme commune INRA-CNRS a développé des méthodes d'analyse du transcriptome par biopuces d'ADN (DNA microarrays). L'analyse massivement parallèle de séquences issues de programmes de séquençage (génomique comparative) conjointement aux résultats expérimentaux issus de l'analyse du transcriptome requiert le dessin et l'utilisation de logiciels complexes. L'agent aura une mission-clef à l'interface entre les technologies de génomique fonctionnelle et les sciences biologiques représentées par les utilisateurs de la plate-forme (recherche agronomique, biomédicale, écotoxicologie etc.). L'agent devra anticiper (recherche) et répondre (service) aux besoins nouveaux en matière de bioinformatique.

    Capacités personnelles:
    Des connaissances solides en informatique (bases de données, génie logiciel, technologie des réseaux) ou bioinformatique. Une expérience dans un laboratoire de biologie est souhaitée. Un candidat dont la formation initiale est en biologie devra alors démontrer (publications et activité professionnelle antérieure) une compétence avérée en bioinformatique. Aptitude aux relations humaines, contacts fréquents (recherche, formation, information) avec des biologistes ayant des horizons et intérêts divers.
    Contacts:Personne(s) à contacter:
    M. FEYEREISEN 04 93 12 38 02

    Annonce sur le site de l'INRA

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    29/08/2002[AGMM]IR2202 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Bordeaux (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur expert en développement d’applications prend en charge la maîtrise d’œuvre de développement d’applications – architecture et logiciel – en assurant la conception, la conduite de la réalisation et la mise en place.

    Références du concours :
    Concours: IRE01
    Intitulé: Ingénieur en informatique et bioinformatique
    Lieu: Paris

    Références du profil :
    n° BAP: E Informatique Calculs Scientifiques
    Centre: Bordeaux Département: Génétique et Amélioration des Plantes
    unité n°: 419 UR Espèces fruitières et vigne

    Activités:
    Réaliser le développement de logiciels pour la bioanalyse et en coordonner la réalisation.
    Analyser les besoins exprimés dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges.
    Définir l'architecture matérielle et logicielle en prenant en compte l'environnement existant.
    Intégrer du matériel de technologie avancée et les logiciels correspondants.
    Définir des dispositions qualité (normes de programmation).
    Assurer la mise en oeuvre de l'application (installation, assistance, formation, évaluation).
    Assurer l'évolution de l'application en relation avec les besoins scientifiques des programmes génomiques.
    Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine.
    Rédiger la partie de la documentation développeur, utilisateur et d'exploitation concernant les technologies avancées, coordonner l'ensemble de sa réalisation.
    Assurer la promotion et la valorisation du logiciel développé.
    Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en oeuvre des techniques bio-informatiques.
    Effectuer la recherche et la synthèse bibliographiques pour répondre aux problèmes scientifiques et technologiques liés au développement des activités de recherches.

    Le poste donne droit à une prime informatique de type 1 à 100% en qualité de Chef de projet (cf. note de service n° 2001-56).

    Compétences:
    Posséder des connaissances théoriques solides en biologie et connaître les bio-technologies.
    Maîtriser les différentes méthodes et techniques de la bio-informatique.
    Maîtriser les méthodes et techniques de conception et de programmation.
    Maîtriser un ou plusieurs langages de programmation et un ou plusieurs outils de développement.
    Savoir conduire des négociations avec des partenaires internes et externes.
    Connaître les techniques de communication et les techniques d'animation d'équipe.
    Maîtriser l'anglais technique du domaine.
    Connaître la problématique scientifique du laboratoire et les communautés scientifiques et technologiques du domaine.

    Environnement:
    L’activité s’exerce au sein de l’Unité de Recherches sur les Espèces Fruitières et la Vigne de 50 personnes environ.
    L’ingénieur devra être en relation étroite avec les chercheurs et techniciens de l’Unité concernés par les aspects génomiques, et les bio-informaticiens du centre INRA de Bordeaux et des Universités de Bordeaux 1 et 2 impliqués dans des thématiques communes. De même, au niveau national, il devra être impliqué dans les comités de pilotage des différents projets auxquels il participe. Il aura des contacts fréquents avec les informaticiens et bio-informaticiens concernés par les thématiques similaires ou voisines. Contraintes : déplacements fréquents pour réunions de travail, parfois à l’étranger, permis de conduire B.

    Capacités personnelles:
    Double compétence informatique/biologie, au minimum doctorat ou diplôme d’ingénieur équivalent. Si doctorat en biologie, une formation complémentaire en bio-informatique (DESS ou équivalent) est indispensable.
    Qualités relationnelles : capacité à travailler en équipe sur des projets communs, avec des biologistes et des informaticiens.
    Contacts:Personne à contacter:
    M. LAIGRET 05 57 12 24 53

    Annonce sur le site de l'INRA

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    29/08/2002[AGMM]IE7301 Ingénieur d' Etudes - Ingénieur en techniques biologiques
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Rennes (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Références du concours :
    Concours: IEA03
    Intitulé: Techniques biologiques et bioinformatique
    Lieu: Paris

    Références du profil :
    n° BAP: A Sciences du Vivant
    Centre: Rennes Département: Hydrobiologie et Faune Sauvage
    unité n°: 1037 Station Commune de Recherche en Ichtyophysiologie, Biodiversité et Environnement

    Activités:
    - Choisir, mettre au point et conduire les protocoles d'étude et de préparation des échantillons biologiques (purification d'ARN, productions de sondes complexes,…).
    - Choisir et adapter en relation avec les objectifs de recherche, les techniques d'analyse et de caractérisation du matériel biologique étudié (méthodes d'analyse du transcriptome, qualité des ARNs, gestion des données obtenues à haut débit….).
    - Conduire, en spécialiste, des expériences dans le cadre de la biologie moléculaire à haut débit.
    - Conduire en permanence un ou plusieurs instruments pour l'analyse et l'expérimentation en biologie (plate-forme "transcriptomique" : scanner, robot d'hybridation, séquenceur...) et assurer leur entretien.
    - Encadrer les stagiaires ou les personnels techniques pour l'élaboration et la conduite des protocoles expérimentaux.
    - Transférer ses savoir-faire, conseiller les demandeurs et former les utilisateurs aux techniques et outils pour l'analyse biologique en interne ou en externe.
    - Organiser et contrôler l'utilisation collective de techniques et d'appareillage et gérer les moyens qui leur sont alloués (ici, service commun d'analyse du transcriptome sur puces à ADN, …).
    - Suivre les évolutions technologiques, se former pour les mettre en œuvre, effectuer la recherche documentaire du domaine.

    Compétences:
    - Avoir des connaissances générales en biologie.
    - Avoir des connaissances approfondies, théoriques et pratiques en biologie moléculaire à haut débit et génomique.
    - Maîtriser les logiciels dédiés .
    - Connaître d'un point de vue théorique et pratique le fonctionnement des appareils et savoir exploiter toutes les possibilités pour l'étude du matériel biologique.
    - Connaître les principes éthiques et les réglementations afférentes au protocole expérimental.
    - Connaître et mettre en œuvre les réglementations du domaine en hygiène et sécurité (OGM, expérimentation animale, produits à risques).
    - Savoir communiquer, transmettre ses connaissances, exposer ses résultats.
    - Connaître la problématique scientifique du laboratoire et la communauté technologique du domaine.

    Environnement:
    L'activité s'exerce au sein d'un laboratoire de recherche. Elle implique la connaissance de la réglementation en vigueur en matière d'expérimentation animale de laboratoire (laboratoire niveau L1 et L2, modèle poisson) et l'adaptation aux contraintes de service (astreintes, activités collectives…).

    Capacités personnelles:
    Formation de base : licence ou équivalence. Formation recommandée : biologie/génétique moléculaire.
    Connaissance des outils bioinformatiques appréciées.
    Expérience personnelle : biologie moléculaire à haut débit avec maîtrise de la robotisation appliquée à la génomique (sinon capacité à se former rapidement au travers d’un stage de quelques mois au sein d’un laboratoire compétent).
    - Exploiter les données expérimentales, présenter les résultats, rédiger des rapports d'études, des notes techniques.
    - Communiquer en anglais technique.

    Qualités particulières requises : Bonnes aptitudes relationnelles, goût pour le travail d'équipe, rigueur et organisation.
    Contacts:Personne(s) à contacter:
    Mme LE GAC 02-23-48-50-17
    M. LE BAIL 02-23-48-50-19

    Annonce sur le site de l'INRA

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    12/08/2002[AGMM]Post-doct informatique pour la protéomique
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:12/08/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Grenoble (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Contexte scientifique du projet
    Le premier niveau d'annotation d'un génome consiste (1) à repérer l'ensemble des séquences codantes de ce génome puis (2) à leur associer toutes les informations dont on peut disposer. Ces informations concernent le gène lui-même ou la protéine codée par ce gène. L'annotation du génome d'un organisme vise donc à réunir l'ensemble des informations pertinentes qui permettront d'appréhender, au niveau moléculaire, les grands mécanismes biologiques mis en jeu chez cet organisme.
    L'analyse " massive " des protéines présentes dans une cellule (appelée analyse protéomique) constitue un moyen d'identifier les gènes codant pour ces protéines. Dans cet esprit, le laboratoire de Chimie des Protéines du CEA/Grenoble (équipe mixte CEA/INSERM), fortement soutenu par la Génopole Rhône-Alpes, met en place, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes et la société Génome Express, un projet visant à utiliser la Protéomique comme outil d'annotation des génomes. Une des conditions nécessaires à la réussite de cet objectif réside dans notre capacité à développer rapidement une plate-forme bioinformatique et informatique dédiée à la Protéomique afin d'être en mesure de traiter l'importante masse d'informations (estimée à environ 10 Go/jour au début 2003) produite par ce type d'approche.

    Le projet
    Le projet proposé consiste à concevoir et réaliser une base de données performante qui, interfacée avec notre future plate-forme informatique (LIMS, logiciels de bioinformatique commerciaux ou développés en interne), nous permettra d'exploiter au mieux les informations produites dans le but d'annoter les génomes. La réalisation de ce projet devra s'intégrer harmonieusement avec le reste des travaux conçus pour cette plate-forme.

    Environnement informatique
    Système: Unix, Windows NT
    Programmation: C, Java SGBD Relationnels et/ou Orientés Objet.

    Compétences souhaitées et profil recherché
    Compétences : Bonne connaissance des systèmes de gestion de bases de données (relationnels et/ou orientés objet) et des langages de modélisation (UML).
    Expérience souhaitée dans le développement d'applications sous Unix. Goût pour le travail en équipe et pour la communication interdisciplinaire.

    Profil : les candidats doivent remplir fin Septembre l'une des deux conditions suivantes : 1) être engagés dans la préparation d'un doctorat, hors labos CEA, et l'obtenir avant Décembre 2002, ou 2) être titulaires depuis 2 ans maximum d'un doctorat (préparé hors labos CEA) et avoir eu pour activité depuis leur soutenance de thèse, soit un premier stage post-doctoral hors CEA, soit une période de recherche de stage post-doctoral de 6 mois maximum.

    Contrat : CDD d'un an, renouvelable un an.
    Rénumération : La rénumération est alignée sur la grille des salaires du CEA.
    Date d'embauche souhaitée : Automne 2002
    Lieu de travail : Grenoble
    Contacts:Pour toute information complémentaire et envoi de CV (accompagné d'une lettre de motivation), contacter :
    Jérome Garin : jgarin@cea.fr
    Alain Viari : Alain.Viari@inrialpes.fr

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    12/08/2002[AGMM]Possibilité d'accueil pour un an à l'Université de Cambridge
    Source:BioDocs
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:15/11/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le Service Scientifique de l'Ambassade de France au Royaume Uni a signé une convention avec le "Churchill College" de Cambridge afin de permettre l'accueil d'un chercheur français pendant une période pouvant aller jusqu'à un an. Après examen des candidatures par le Service Scientifique et le Churchill College, le chercheur selectionné est nommé Fellow par l'assemblée du Collège. Il(elle) peut ainsi bénéficier gratuitement pendant un an du logement, de la participation aux déjeuners et diners à la "Haute table" ainsi que de toutes les facilités du Collège. Le titre de Fellow restant acquis, il(elle) peut par la suite continuer de bénéficier des avantages liés à ce statut à l'occasion de séjours sur le campus de Cambridge. Pendant sa résidence au Churchill Collège, le Fellow doit effectuer ses recherches dans un laboratoire de l'Université de Cambridge. Cette convention est ouverte aux chercheurs de toutes les disciplines. Le niveau qui doit être au minimum celui d'un post-docteur confirmé, peut aller jusqu'à celui de Professeur ou Directeur de Recherche. Pour la prochaine année universitaire les candidatures pourront être reçues jusqu'au 15 novembre 2002.
    Contacts:Les candidatures ou les demandes de renseignements complémentaires doivent être envoyées à l'adresse suivante (par courrier ou par E-mail):
    Professeur Gilbert Balavoine
    Conseiller pour la Science et la Technologie
    Ambassade de France
    6 Cromwel Place
    London SW7 2JN UK
    E-mail: gilbert.balavoine@diplomatie.fr

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    07/08/2002[MM]PostDoc position in Bioinformatics
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Boston (Massachussets)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Northeastern University

    Job Title: PostDoc position in Bioinformatics

    Required Skills:
    PhD in biology, structural biology, bioinformatics, physics, computer science, mathematics, statiscits or related disciplines is required. Programming experience for non-computer science applicants (especially C/C++, Java, Perl, SQL) and/or website and database construction are advantage.

    Job Description:
    There are several projects available, from protein folding theory to large-scale methods, which also includes protein network and expression data analysis and development and maintenance of innovative web database resource for molecular biology. Work in close collaboration with experimental laboratories. PhD in biology, structural biology, bioinformatics, physics, computer science, mathematics, statiscits or related disciplines is required. Programming experience for
    non-computer science applicants (especially C/C++, Java, Perl, SQL) and/or website and database construction are advantage. For applicants with computer science degree, knowledge of biology, biochemistry, molecular biology is a plus. The position is for two years with possible extention.
    Interested applicants should send CV, statement of research interests and the names and addresses of three references to Valentin Ilyin, ilyin@mozart.bio.neu.edu, 414 Mugar, Department of Biology, Northeastern University, Boston, MA 02115.
    Contacts:Contact for more information and questions please contact :
    Valentin Ilyin
    Northeastern University
    414 Mugar, Northeastern University
    Boston, MA 02115, MA. US
    Phone: 1-617-373-4031
    ilyin@mozart.bio.neu.edu

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    07/08/2002[MM]Postdoctoral Fellow
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:21/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Ikoma (Japon)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Required Skills:
    Ph.D (candidates who are about to submit their Ph.D. dissertation will also be considered). Knowledge of Structural Biology, and programming skills, especially in the context of managing and analyzing large data bases. The candidate is also expected to be reasonably skilled in oral and written English. For non-Japanese applicants, a knowledge of Japanese is not a requirement but those who have some exposure to the language will be given preference.

    Job Description:
    Two postdoctoral positions are open in the Bioinformatics Unit of the Graduate School on Information Science. The group is fairly new and is supervised by Nobuhiro Go (Professor), Takeshi Kawabata (Associate Professor) and Gautam Basu (Associate Professor). Nara Institute of Science and Technology is situated in the vicinity of Nara city and close to Kyoto and Osaka.

    The postdoctoral positions are fairly independent and the candidate is expected to launch innovative projects in the field of structural bioinformatics under the close supervision of the group leader. In addition, the candidate is expected to take part in group activities which include development of databases and creating programs that would be widely used by the bioinformatics community.

    Salary and benefits will be at the level of assistant professor scale of Japanese National Universities. The exact amount will depend on qualifications and experience of the candidate. The initial appointment will be for one year, renewable up to three years.

    Please send a cover letter describing your interest and qualifications along with (1) Current curriculum Vitae/Resume (2) a full publication list and five reprints (3) Names of two references with full contact information including e-mail address. Screening will begin immediately and proceed until suitable applicants are found.

    Please visit our website for more details.
    Contacts:Send Resume to: gautam@is.aist-nara.ac.jp

    Contact for more information:
    Gautam Basu
    Nara Institute of Science and Technology
    8916-5 Takayama
    Ikoma,JP
    Phone: +81-743-5616
    Fax: +81-743-5617
    gautam@is.aist-nara.ac.jp
    http://nara.aist-nara.ac.jp/index-E.htm

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    07/08/2002[MM]Modélisateur moléculaire chez L'Oréal
    Source:http://www.ibcp.fr/GGMM/emplois.html
    Date de parution:25/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Aulnay (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    MODELISATEUR MOLECULAIRE - Paris -France - (25 juin 2002)

    Vous ne ressemblez à personne.
    Bien entendu, vous voulez intégrer une entreprise qui ne ressemble à aucune autre.
    Imaginez... L'Oréal. Le plus beau portefeuille de marques internationales dans le monde de la beauté, qui s'appuie sur une recherche à la pointe de la technologie. Quelques faits de l'année 2000 : L'Oréal a déposé 420 brevets, lancé environ 450 nouveaux produits, vend 85 produits à la seconde et a plus que triplé son chiffre d'affaires consolidé (12,7 milliards d'Euros) en 10 ans...mais avant tout L'Oréal représente une formidable aventure humaine partagée à travers le monde autour de la beauté, l'innovation et la conquête de nouveaux marchés.

    L'Oréal recherche un Modélisateur Moléculaire pour son Département Modélisation et Evaluations Rapides. Le poste est basé à Aulnay (93) dans notre Centre International de Recherche Avancée consacré aux Sciences de la Matière.

    Rejoignez les 2700 chercheurs du Groupe L'Oréal passionnés par la cosmétique et spécialisés dans une trentaine de disciplines scientifiques (chimie, biologie, physique, physico-chimie, biotechnologies , toxicologie, génétique, pharmacie, formulation cosmétique...) au service de nos différents métiers : le capillaire (coloration, soin et hygiène du cheveu, coiffage) et la peau (soin, maquillage, hygiène corporelle, protection solaire, parfums).

    Rattaché au Responsable Modélisation et Statistique, vous travaillerez en étroite collaboration avec les chimistes de synthèse, à la modélisation et à la conception de molécules originales et innovantes.
    Votre mission consistera à développer plusieurs modèles structure-activités prédictifs et pertinents permettant de faire des propositions aux chimistes de nouvelles molécules à synthétiser possédant les propriétés cosmétiques et biologiques adéquates.

    Titulaire d'un Doctorat, vous maîtrisez les méthodes de modélisation moléculaire, en particulier les techniques modernes de QSAR : descripteurs moléculaires 2D et 3D, techniques de sélection des descripteurs pertinents et d'évaluation de la qualité prédictive des modèles structure-activité.
    Une première expérience (post-doctorale ou industrielle), au cours de laquelle vous avez géré un programme de recherche en collaboration avec des chimistes serait un plus.
    Par ailleurs vous avez une bonne pratique des logiciels usuels de modélisation moléculaire ainsi que des langages et environnements de programmation informatique, et de bonnes connaissances en chimie.
    Ouvert, pragmatique et rigoureux, vous avez le sens du travail en équipe pluridisciplinaire.
    L'Oréal accueille avant tout de fortes personnalités génératrices d'idées.

    Faire partie de ceux qui imagineront L'Oréal demain : voici votre L'Oréalité !
    Contacts:Postulez en ligne en indiquant le numéro de référence suivant : 223

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    07/08/2002[AG]Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon, Villeurbanne (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le projet est de développer des méthodes d'apprentissage pour extraire automatiquement des informations pertinentes des données générées par les puces à ADN. L'approche de "data mining'' proposée est la découverte de règles d'association puis le traitement des règles fréquentes et valides dans un processus interactif entre informaticien et biologiste. Les réseaux de gènes étudiés sont ceux de l'adaptation métabolique à des changements nutritionnels en vue de l'étude de leur implication dans le développement de l'obésité et du diabète de type 2 chez l'homme.
    Pièce Jointe : 13B.pdf (99 ko)
    Contacts:Département NASA et INSA Lyon, Unité INSERM U449 et LISI de Lyon,
    Encadrants S. Rome, J.-F. Boulicaut

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    07/08/2002[AG]Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Versailles (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'objectif de ce projet de recherche est de concevoir et d'adapter des méthodes d'apprentissage automatique capables d'apprendre les connaissances nécessaires à l'extraction automatique de connaissances à partir de textes scientifiques. L'apprentissage se fera à base de corpus à l'aide de méthodes d'analyse linguistique et conceptuelle. Cette approche sera appliquée à l'étude des fonctions géniques, à travers par exemple, l'étude des interactions entre gènes. L'objectif est de mieux interpréter les mécanismes cellulaires et de contribuer à la compréhension du fonctionnement des génomes.
    Pièce Jointe : 5B.pdf (103 ko)
    Contacts:Départements BIA-MIC, Unité MIG Versailles,
    Encadrants C. Nedellec, Ph. Bessières

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    07/08/2002[AG]Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Pour comprendre la grande stabilité de certaines zones du génome des rétrovirus et ce qui les distingue de régions beaucoup plus variables, on construira des modèles probabilistes des séquences qui rendent compte des différences biologiques de ces deux types de régions par des propriétés statistiques. Ces modèles prendront en compte la composition des séquences, les statistiques de motifs caractéristiques ou fonctionnels, et des structures tridimensionnelles connues. Ces modèles feront l'objet d'une validation expérimentale.
    Pièce Jointe : 4B.pdf (99 ko)
    Contacts:Département SA et Université Lyon1, UMR754 INRA-UCB-ENVL et Laboratoire de Probabilités Combinatoire et Statistique
    Encadrants C. Leroux, D. Piau

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    07/08/2002[AG]Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Villeurbanne, Toulouse (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Une modélisation informatique intégrant une représentation complète des différentes notions d'homologie a permis de développer un modèle de cartographie génomique pour plusieurs espèces (homme, souris). Le projet consiste à modéliser la variabilité génétique (intraspécifique ou interspécifique) relative à la structuration des génomes. Cette modélisation ainsi que la synthèse de l'ensemble des connaissances disponibles dans les différentes espèces devraient permettre d'éclairer le lien entre le polymorphisme des gènes, leur évolution et leur positionnement au sein des génomes.
    Pièce Jointe : 12B.pdf (117 ko)
    Contacts:Département GA et Université Lyon, Unité Génétique Cellulaire Toulouse et UMR 5558 Lyon
    Encadrants D. Milan, C. Gautier

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    07/08/2002[AG]Postdoctoral Researcher
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:26/06/2002Date limite de réponse:01/11/2002
    Lieu:Santa Barbara (Californie, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: University of California-Santa Barbara

    Job Title: Postdoctoral Researcher

    Required Skills:
    PhD in Biology, Mathematics, Computer Science or related field. Research experience in Bioinformatics, Genomics, or Phylogenetics. Knowledge of computer programming (prefer C, Java, or PERL) essential.

    Job Description:
    Note that project 3 most heavily involves bioinformatics.

    One postdoctoral position in evolutionary biology is open in the Ecology Evolution and Marine Biology (EEMB) Department http://www.lifesci.ucsb.edu at the University of California-Santa Barbara, with a start date between Jan. 1, 2003 and Oct. 1, 2003. The position is guaranteed for one year with the possibility of additional support, depending on funding. The candidate would work on one of the project below, which are ongoing or planned in the lab. There is also potential for additional collaboration on a project initiated by the postdoc.

    Genomic-scale studies of the evolution of gene expression. This project aims to develop and compare alternative models for the evolution of gene expression using genomic scale data from the literature/databases (microarray, SAGE, ESTs, etc). We have developed maximum likelihood models for the evolution of gene expression using microarray data and would like to extend these analyses to other data sets/data types.
    Contacts:Send Resume to: oakley@lifesci.ucsb.edu

    Please apply for or inquire about this position by sending an email message to Todd Oakley oakley@lifesci.ucsb.edu with the following information (as either attachments or text):

    1. Your CV including publication list (with links to electronic versions of papers when possible)
    2. A 2-3 page description of your research interests/experience, future career goals and how working on one (or more) of the above projects would facilitate achieving those goals.
    3. Names, addresses, and e-mail addresses of 3 references familiar with your work. (Note that it is not necessary to send letters of recommendation with the initial application).

    Applications received by November 1, 2002 will be guaranteed consideration, but the position will remain open until filled.

    The University of California is an Affirmative Action / Equal Opportunity employer. See http://hr.ucsb.edu for additional information.

    Contact for more information:
    Todd Oakley
    University of California-Santa Barbara
    Biological Sciences/EEMB
    Santa Barbara, CA. US
    Phone: (805) 893-3511
    oakley@lifesci.ucsb.edu
    http://www.lifesci.ucsb.edu

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    07/08/2002[AG]Full time postdoctoral research position
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:15/08/2002
    Lieu:Hamilton (Ontario, Canada)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A full time postdoctoral research position is available to study the comparative genomics of sibling species in the Drosophila melanogaster species complex. We're looking for PhD's in biology, genomics or a related field with interests in evolutionary biology and molecular evolution.
    Previous experience in molecular evolution , microarrays and computational methods is essential.
    Position is available August 1, 2002 (this date is flexible- a month or two).

    To obtain more information about this position or to apply: submit a letter of interest, CV, names and email address of three references.
    Also, indicate the date you will be able to start.
    Contacts:Emails and CVs to be sent to :
    Dr. Rama Singh
    Department of biology,
    Mcmaster University,
    1280 main street west,
    Hamilton, Ontario, L8S 4K1
    Canada
    Tel:(905)-525-9140 ext 24378
    Fax: 905-522-6066
    Email - singh@mcmaster.ca

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    07/08/2002[AG]Biostatistician - Fungal Genomics Project
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:19/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Montréal (Québec, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics

    Job Title: Biostatistician - Fungal Genomics Project

    Required Skills:
    Strong background in statistics is required; Strong knowledge of statistical issues in bioinformatics is highly desirable, especially in the areas of sequence similarity scores, normalization of microarray data, clustering and bootstrap estimation of significance, and high-throughput chemical assays;
    Knowledge of machine learning techniques is desirable;
    Programming fluency in MatLab or R or S/S-plus is required;
    Ability to program in C++, Java, and Perl is desirable;

    A PhD in statistics or a related area is essential; postdoctoral experience is preferable. Industry experience is desirable but not required.

    Job Description:
    The Centre for Structural and Functional Genomics, Concordia University, Montreal, Quebec is seeking a biostatistician to provide statistical analysis as part of our bioinformatics team for a project that will identify fungal enzymes with applications to industrial processes. Dr. Adrian Tsang, principal investigator has recently received a large project grant from Genome Canada/ Genome Quebec for 2002- 2005. We are inviting qualified researchers in the fields of molecular biology, genomics, proteomics and bioinformatics to participate in a large-scale project at Concordia University. The project is supported by a multi-disciplinary team of scientists based at the following research centres located in Montreal and Laval: Concordia University's Departments of Biology, Biochemistry, Chemistry and Computer Science, Institute Nationale Recherche Scientifique - Institute Armand Frappier, National Research Centre - Biotechnology Research Institute and the Pulp and Paper Research Institute of Canada.

    The biostatistician will ensure that appropriate statistical methods are used in all aspects of the project. This mainly involves analysis of cDNA microarray data, but also includes data quality reports for each wet lab process, the interpretation of statistical significance of sequence analysis results, and the analysis of data from high-throughput chemical assays. It is expected that the biostatistician will be able to develop new statistical models and methods as required. The position requires that the biostatistician will guide postdoctoral fellows and graduate students in the analysis of transcription profiles.
    Contacts:Send Resume to: genecan@gene.concordia.ca

    Contact for more information:
    Margaret Guest
    Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics
    1455 de Maissonneuve Blvd. West
    Montreal, PQ. CA
    Phone: (514) 848-3392
    genecan@gene.concordia.ca

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    07/08/2002[AGMM]Bioinformatics Database Administrator
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:02/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Vancouver (Colombie-Britannique, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Interomex Biopharmaceuticals Inc.

    Job Title: Bioinformatics Database Administrator

    Required Skills:
    University or technical degree in software engineering or computer science. Minimum two years' related experience. Post-secondary education in LifeSciences or Molecular Biology. Solid experience and knowledge of RDBMS (DB2, Oracle, MySQL and Postresql) administration, SQL, C/C++ programming, Java, PERL or shell scripting and advanced knowledge of AIX/Linux/UNIX operating systems. Knowledge of Bioperl, Biojava, NCBI Toolkit, BLAST and databases such as Genbank perferred. Strong knowledge and experience in object-oriented design, network administration, data mining, modeling languages such as ASN.1 or XML is an asset. Effective oral and written communications, analytical, problem-solving, organizational and interpersonal skills.

    Job Description:
    Work in close collaboraqtion with researchers to create and extend databases containg biological information, maintain and administer biological databases with a relational database management system (RDBMS). Responsibilities include: designing, implementing, administering and deploying databases containing information such as nucleotide and protein sequences, images, laboratory management information and Medline publications; managing and administering RDBMS servers and DB2 on a UNIX platform; creating automated scripts for daily update of database content; performing backups and administrative functions; reporting on database progress; and performing other related duties. System support is also part of the weekly tasks.
    Appropriate candidates will be contacted. No phone calls please.
    Contacts:Send Resume to: info@interomex.com

    Contact for more information:
    Lynn Miller
    Interomex Biopharmaceuticals Inc.
    #201 - 1618 Station Street
    Vancouver, BC. CA
    Phone: 604-267-8000
    Fax: 604-267-2411
    info@interomex.com
    http://www.interomex.com

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    07/08/2002[AGMM]Industrial Post-Doc in Proteomics
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:St Catharines (Ontario, Canada)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Norgen Biotek Corp.

    Job Title: Industrial Post-Doc in Proteomics

    Required Skills:
    Training in protein engineering, expression and purification for use in Proteomics research. Candidate must have above average computer skills. Familiarity with high throughput proteome screening, profiling, 2D gels, mass spectrometry, crystallography and NMR is essential. Candidate must be vibrant and a team worker. Must be able to lead a team and/or able to follow a team leader with lesser academic qualifications. Candidate must have innovative skills.

    Job Description:
    Candidate will be part of a team to develop/validate processes and pipeline products for use in Proteomics research. The candidate will use his/her academic background to explore innovative ideas related to protein purification and analysis, and high-throughput proteome analysis.
    Contacts:Send Resume to: dbautista@norgenbiotek.com

    Contact for more information:
    Dody Bautista, Ph.D.
    Norgen Biotek Corp.
    344 Merritt St.
    St. Catharines, ON. CA
    Phone: 905-227-8848
    Fax: 905-227-1061
    dbautista@norgenbiotek.com
    http://www.norgenbiotek.com

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    06/08/2002[MM]Bourse de thèse fléchée Inter///Bio
    Source:http://germ.cnrs-orleans.fr/annonces.htm
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:17/07/2002
    Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dynamique interne de Biomolécules
    Grâce à l'utilisation de nouvelles méthodes spectroscopiques de RMN récemment développées au Laboratoire, nous pouvons caractériser les mouvements internes de biomolécules telles que les protéines et leurs complexes. Il est possible de localiser ces mouvements, et notamment de distinguer la mobilité du squelette d'une protéine de celle des chaînes latérales des acides aminés. Nous voulons aussi caractériser les échelles de temps de ces mouvements, qui varient des picosecondes jusqu'aux microsecondes.

    Directeur de Thèse : Geoffrey Bodenhauden
    Equipe d'accueil : Laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire, Département de Chimie, ENS Paris
    Bourse du Ministère : Bourse fléchée qui a été attribuée à ce sujet par l'Ecole Doctorale Inter///Bio.
    Contacts:Après consultation avec le Directeur de Thèse, les candidat(e)s devront présenter le sujet devant le jury de l'Ecole Doctorale, probablement entre le 15 et le 17 juillet 2002, en vue de l'attribution définitive de la bourse fléchée à l'un(e) des candidat(e)s.
    Début de la thèse : Octobre 2002
    Contenu Scientifique du programme de Thèse
    Informations administratives :
    Renseignements relatifs à l'Equipe d'Accueil Doctorale (EAD)
    Laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire, Département de chimie, Ecole Normale Supérieure, 24 rue Lhomond, 75231 Paris 05
    Responsable de l'EAD et directeur de thèse: Pr Geoffrey Bodenhausen
    Téléphone : :01 44 32 33 89
    Télécopie : 01 44 32 33 97
    E.mail : Geoffrey.Bodenhausen@ens.fr
    Renseignements relatifs à l'Unité de Recherche
    Nom et appartenance : UMR 8642
    Directeur : Pr Pierre Sinaÿ
    Téléphone : 01 44 32 33 89
    Télécopie : : 01 44 32 33 97
    E.mail : Pierre.Sinay@ens.fr

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    06/08/2002[MM]Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Boston (Massachussets, USA)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Northeastern University

    Job Title: Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory

    Required Skills:
    Particularly appropriate are those who have experience in one or more computer languages, C/C++, Java, Perl/CGI, HTML and others, experience with database development and support, MySQL, PostgressSQL, SQL language is a plus. (Molecular ) Biology or biochemistry background is also a plus.

    Job Description:
    The Department of Biology at Northeastern University has an opening for a PhD Student in the bioinformatics laboratory. Those who are interested in work on protein theory, protein folding, stability, sequence alignments, structure superposition of proteins and DNA/RNA etc. are welcome to apply. Two types of candidates are appropriate for this field. One is from a natural science field such as biology, biochemistry, molecular biology, chemistry or physics who wish to learn computer and math and the second is from math, statistics and computer science who wish to learn biology. Particularly appropriate are those who have experience in one or more computer languages, C/C++, Java, Perl/CGI, HTML and others, experience with database development and support, MySQL, PostgressSQL, SQL language is a plus. Biology or biochemistry background is also a plus.
    Contacts:Send Resume to: ilyin@neu.edu

    Contact for more information and questions please contact :
    Valentin Ilyin
    Northeastern University
    414 Mugar, Northeastern University
    Boston, MA 02115, MA. US
    Phone: 1-617-373-4031
    ilyin@mozart.bio.neu.edu

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    06/08/2002[AG]Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le Ministère de la Recherche vient d'attribuer nominativement une bourse fléchée "génomique" à l'équipe de Christian Biemont, de l'université Lyon1. La bourse est libre pour un candidat extérieur ayant déjà son DEA ou qui va l'avoir très bientôt, puisque cette équipe n'a pas de candidat en cours de DEA cette année.
    Le thème de recherche concernera l'analyse des Eléments Transposables du génome de l'Anophèle et leur distribution dans les populations naturelles.
    L'approche moléculaire sera associée à l'utilisation des outils de la bioinformatique. Le dossier doit être envoyé rapidement au Ministère.
    Contacts:Contacter le plus rapidement possible Christian Biemont :
    Mel : biemont@biomserv.univ-lyon1.fr
    UMR CNRS 5558: "Biometrie et Biologie Evolutive"
    http://biomserv.univ-lyon1.fr/
    Bât Gregor Mendel - Universite Lyon1 69622 Villeurbanne (France)
    Tél.: (33) 4 72 44 81 98 - Fax.: (33) 4 78 89 27 19

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    06/08/2002[AGMM]Écoles Doctorales proposant des allocations au titre de la mobilité
    Source:Ministère
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu: (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Site du Ministère regroupant les sites des ED proposant des allocations de recherche au titre de la mobilité
    Contacts:

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    30/07/2002[AG]young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines
    Source:EMBL
    Date de parution:30/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Hinxton/Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    EMBL-EBI European Bioinformatics Institute

    The European Bioinformatics Institute in Hinxton, near Cambridge, UK, wishes to recruit outstanding young research group leaders in Bioinformatics in one or more of the following areas:

    * Analysis of molecular complexes, pathways and networks
    * The evolution of sequence, structure and function to relate genotype to phenotype
    * Chemo-informatics in relation to biology
    * Deciphering transcriptome/proteome data to understand biological processes
    * The molecular basis of disease
    * Algorithm development for biology

    The EBI provides a world-class research environment and is committed to fostering top quality interdisciplinary research in a highly collaborative international culture. As the European Centre for the international archiving for DNA and protein sequence data, genome data, protein structure data, GO, and expression data, the opportunities for better data integration, analysis and understanding are enormous.

    An initial contract of 5 years' duration will be offered to the successful candidate(s). This can be renewed, depending on circumstances at the time of the review. Informal enquiries are welcomed and can be made to the Director, Professor J. Thornton (thornton@ebi.ac.uk). For more information about the EBI, please refer to: http://www.embl-heidelberg.de/ and http://www.ebi.ac.uk/

    EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
    Contacts:Applicants should submit a curriculum vitae, quoting ref. no. 02/49, with a concise description of research interests and future plans, and should arrange for three letters of recommendation to be sent as soon as possible to:
    The Personnel Section,
    EMBL,
    Postfach 10.2209,
    69012 Heidelberg, Germany.
    Fax: +49 6221 387555;
    email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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    26/07/2002[AG]CDD, URGV d'Evry
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:15/04/2002Date limite de réponse:01/05/2002
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'URGV d'Evry (Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS, Resp. M. Caboche; http://www.evry.inra.fr ) mai 2002), dans le cadre d'un projet Génoplante. Ce CDD concerne un poste de niveau ingénieur au sein de l'équipe bioinformatique de l'URGV qui comprend 5
    permanents, 2 CDD et 3 étudiants stagiaires.

    Le projet concerne le développement d'interfaces (JAVA) pour l'exploitation d'une base de données intégrative sur la génomique structurale et fonctionnelle de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Toutes les données de génomique de cette base (sous ORACLE) sont organisées topologiquement autour des séquences des 5 chromosomes d'Arabidopsis.Cette base de données
    doit entre autres faciliter l'interprétation fonctionnelle des données de type 'transcriptome' et permettre d'étudier les relations entre la structure, la fonction, la localisation et l'évolution des gènes végétaux.

    Ce poste nécessite une bonne connaissance du langage JAVA (en particulier des bibliothèques graphiques) et du langage de requête des bases de données relationnelles (SQL). Une expérience dans les domaines de l'analyse de séquences et de la génomique serait appréciée.

    Contacts:Responsable à contacter: Sébastien Aubourg
    (aubourg@evry.inra.fr)


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    26/07/2002[AG]Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:26/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    PRE-ANNONCE

    L'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique) recrute fin 2002 le Directeur de l'Unité de recherche "Génomique-Info" située à Evry (30kms sud de Paris). Cette Unité est responsable d'une plate-forme Bioinformatique et constitue un pôle national de compétences et d'expertise dans le domaine du végétal.

    Le directeur exercera ses missions en collaboration avec les équipes de l'INRA concernées, dans le cadre de partenariats y compris européens (Génoplante particulièrement, mais aussi GABI, GARNET, ...) :
    -Conception, développement et mise en place de systèmes d'informations génomiques intégrés.
    -Développement des méthodologies, outils et interfaces pour l'analyse et la valorisation des données.
    -Stratégies d'analyse à haut débit des données produites.
    -Veille technologique dans les domaines bioinformatiques.
    -Diffusion de l'information et de l'expertise vers les différentes équipes-relais de l'INRA.
    -Animation et coordination en partenariat avec les responsables d'autres projets transversaux (ex : AGENAE).
    -Valorisation des travaux, publications et transferts.
    -Assistance technique aux équipes biologistes partenaires.
    -En collaboration avec Infobiogen, exploitation, maintenance et sécurité du système.

    Responsable d'une équipe d'une dizaine d'ingénieurs, il(elle) devra à ce titre assurer un certain nombre de fonctions :
    - animation scientifique et collective de l'Unité ;
    - accompagnement et aide à l'insertion des jeunes chercheurs ;
    - suivi du bon déroulement des travaux et démarche qualité ;
    - gestion optimale des ressources humaines ;
    - gestion administrative et financière de l'Unité ;
    - organisation de la communication avec l'extérieur.


    Compétences requises :
    -5 ans minimum d'expérience en conduite de projets informatiques dans le domaine de la recherche en biologie ;
    -expérience en management d'équipe et animation scientifique ;
    -connaissances en bioinformatique et génomique ;
    -expérience solide du monde Unix, SGBD, développement et architectures distribuées ;
    -aptitude à la communication ;
    -français et anglais courant.

    Formation initiale :
    Thèse ou Diplôme Ingénieur ou équivalent BAC + 5
    Double compétence biologie - informatique
    Contacts:Des précisions sur le poste et la procédure de recrutement seront données début septembre 2002

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    26/07/2002[AGMM]Post-doctoral position in theorical ecology
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:26/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Santa Barbara (Californie, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for a post-doctoral researcher to participate in an analysis of theoretical problems in population and community dynamics.
    The research will involve use of stage-structured models of predator and prey populations, including both analytical and simulation approaches. The post-doc will work at Santa Barbara with Bill Murdoch and his collaborators, Roger Nisbet (UCSB) and Cherie Briggs (UC Berkeley).

    Applicants should possess a PhD in mathematical biology, theoretical ecology, or some related discipline, and should have skills in dynamic modeling.

    The position is for 2 years.
    Start date: as soon as possible, but negotiable.
    Contacts:Applicants should submit a CV, a statement of research interests, and the names and e-mail addresses of three referees to murdoch@lifesci.ucsb.edu.

    Initial screening of applications will begin on July 15, but applications received after that date may be considered. Dr. Nisbet will attend the ESTMB meeting in Milan and the SMB meeting in Knoxville in July 2002, and would be happy to meet with applicants at either meeting.

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    26/07/2002[AGMM]Postdoc Position, Computational and Integrative Bioengineering
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:26/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Seattle (Washington, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The Department of Bioengineering at the University of Washington is looking for a postdoctoral research candidate to join the group on Computational and Integrative Bioengineering within the National Simulation Resource Facility.
    The candidate will be involved in the development and analysis of cardiac metabolic systems analysis, and to a lesser extent, biological signal transduction, and gene regulatory networks. Information about the programs and projects can be found at http://nsr.bioeng.washington.edu and http://www.physiome.org.

    The available position is funded by an annual stipend from a NIH/NHLBI Cardiovascular Training Grant. Current levels of funding range from $31,092 to $48,852/year depending on experience.
    We are looking for someone with a computational science or bioengineering background who has experience and interests in integrative biology research.

    An ideal candidate will have an interdisciplinary training with a strong background in computation and in mammalian biology, emphasising metabolism. Experience in network analysis methods, control theory, and the analysis of signaling processes and networks using engineering or applied mathematics approaches is highly preferred. Required skills include expertise in at least one scientific programming language. Eligible candidates for this position must be citizens or noncitizen nationals of the United States.

    This position is available immediately and will be initially limited to a one-year term. The appointment may be continued for two more years, depending upon mutual agreement and availability of the funds.
    Contacts:Applicants should e-mail their resume, list of publications, and contact details of three references to:
    Dr. James Bassingthwaighte
    University of Washington
    Department of Bioengineering
    Box 357962,
    Seattle, WA 98195-7962

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    25/07/2002[AGMM]Postdoc, Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle, VT
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:25/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Blacksburg (Virginie, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Position
    Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle

    Openings are available in an interdisciplinary team building mathematical models of the eukaryotic cell cycle. On the computational side, one or two postdoctoral research scientists are needed to carry out simulations of molecular models of cell cycle regulation in frog eggs and yeast cells.
    A Ph.D. in computational science, applied mathematics, or theoretical chemistry is required. Experience in nonlinear dynamical systems is preferred. The individual must be able to work closely with biochemists and molecular biologists collecting data on these organisms.
    Contacts:Please send curriculum vitae and contact information for two references to:
    Dr. John J. Tyson,
    Biology Department,
    Virginia Polytechnic Institute and State University,
    Blacksburg, VA 24061;
    (540) 231-4662;
    tyson@vt.edu

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    24/07/2002[MM]PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:15/08/2002
    Lieu:Norwich (Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Studentship
    School of Information Systems

    Applications are invited for a PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry at the University of East Anglia. The postholder will undertake research on the EPSRC project "Understanding Protein Domain Motions through Simulation with a Focus on Citrate Synthase". The supervisor will be Dr Steven Hayward.

    Background
    Proteins are molecular machines designed to carry out specific tasks. For a large number of proteins, their structure and function is known, but the key question remains largely unanswered: what is the relationship between structure and function? The study of protein dynamical behavior will provide the answer to this question, but experimental techniques do not gives us a complete picture of the processes occurring at the atomic level. The computational technique of molecular dynamics simulation presents an atomic level description of protein dynamical behavior and has recently provided us with some important insights [1].

    The aim of the project will be to understand the detailed mechanisms of domain closure in enzymes by making comparisons between experimentally determined functional movements in domain proteins and results from molecular dynamics simulations. The project will utilise information stored in the new DynDom database of protein domain movements (see http://www.sys.uea.ac.uk/dyndom ) which is being developed in a bioinformatics approach to understanding and predicting functional movements in proteins[2]. The research project will build upon our recent simulation study of the enzyme citrate synthase[3].

    References
    [1]H.J.C. Berendsen, S.Hayward, "Collective protein dynamics in relation to function", Current Opinions in Structural Biology, 10 (2), 165, 2000.
    [2] S.Hayward,"Structural Principles Governing Domain Motions in Proteins", Proteins, Structure, Function and Genetics, 36, 425, 1999.
    [3]D.Roccatano, A.E.Mark and S.Hayward,"Investigation of the Mechanism of Domain Closure in Citrate Synthase by Molecular Dynamics Simulation",J. Mol. Biol., 310, 1039, 2001.

    To apply you should have or expect to be awarded a First or Upper Second Class Honours degree or MSc in an appropriate discipline.

    The studentship is sponsored by EPSRC and is offered at the rate of £8,000 per year for three years, plus tuition fees. The post is available from October 2002.
    Contacts:Further information may be obtained from Dr Steven Hayward,
    Tel: 01603 593542 or e-mail: sjh@sys.uea.ac.uk

    To apply please send a CV, covering letter and names/addresses of two academic referees to:
    Ms C. Bramwell, Research Administrator, School of Information Systems, University of East Anglia, Norwich NR4 7TJ.
    Applications via email are not permitted.

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    24/07/2002[AG]Research Assistant/Fellow
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:14/08/2002
    Lieu:Southampton (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Genetic Epidemiology and Bioinformatics Research Group - Genome Map Integration
    School of Medicine - Human Genetics Division
    University of Southampton

    We are looking for a research assistant (postgraduate or postdoctoral) to join our expanding research team. We have developed the first metric linkage disequilibrium maps (Maniatis et al, 2002, Proc Natl Acad Sci USA 99:2228-33). The integration of these maps with the sequence based maps we are already developing should provide more precise localisation of disease genes and facilitate studies of recombination and other biological properties of maps. A research assistant is required to continue to develop and apply software for internet data mining and sequence analysis and to construct and integrate linkage disequilibrium maps. A biological background and programming experience (JAVA, C) and experience in sequence analysis and statistics is desirable. The position is for 12 months in the first instance.

    Informal enquiries are welcome in the first instance to Dr Andrew Collins, telephone 023 80 796939.

    Previous applicants need not apply.

    Salary will be in the range £17,626 to £26,491 per annum on Research Grade 1A scale depending on experience.
    Contacts:Application forms and a job description may be obtained from
    the Personnel Department (M),
    University of Southampton, Highfield, Southampton, SO17 1BJ,
    Tel: 023 8059 2750,
    e-mail: recruit@soton.ac.uk or minicom: 023 8059 5595.

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    22/07/2002[MM]These en chem-informatique / bio-informatique
    Source:ABG (ref:ABGt-2123)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:12/09/2002
    Lieu:Illkirch (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Cette thèse s’inscrit dans le cadre du génopole Alsace-Lorraine ("Du gène au Médicament") et des thématiques de l’IFR-85 Gilbet Laustriat (Récepteurs couplés aux Protéines G) afin de faciliter la découverte de nouveaux candidats médicaments à partir de cibles génomiques originales.

    Résumé du sujet de recherche: Cette étude vise a développer une méthode bioinformatique originale dont le but est la conception focalisée de ligands (chimiothèques) de RCPGs, qui représente la famille de cibles thérapeutiques la plus importante du génome humain.

    Profil du candidat recherché :
    - Formation : DEA (nécessaire) en chimie théorique, chimie-informatique, bio informatique, ou informatique
    - Connaissances de bases en chimie-physique théorique
    - notions de modélisation moléculaire
    - aptitude à la programmation (C, C++, perl, java)
    - facilité d’adaptation à un travail dans un environnement pluridisciplinaire.
    Contacts:contacter:
    Dr. Didier ROGNAN : Equipe de Bioinformatique, UMR 7081, Pharmacochimie de la Communication Cellulaire, 67400 Illkirch
    Tél : 03.90.24.42.35,
    e-mail : didier.rognan@pharma.u-strasbg.fr

    Merci de préciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la référence ABG de cette offre.

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    18/07/2002[MM]Enzyme Function And Reaction Mechanisms: Computational Studies
    Source:ABG (ref:ABGe-879)
    Date de parution:16/07/2002Date limite de réponse:16/09/2002
    Lieu:Cleveland (Ohio, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A postdoctoral position is open at Cleveland State University (Ohio -USA) for 2 years (with possible extention for another year). Different projects are proposed in collaboration with Cleveland Clinic:
    1) NOS enzyme
    2) Reaction mechanism of Cl- oxidation to Cl+ by myeloperoxydase
    3) Modeling the AT1 receptor
    4) Activity of Factor V (blood coagulation cofactor).
    In close collaboration with experimentalists our main tools used for these projects are molecular modelling, QM/MM approaches and MD simulations. The salary is very attractive depending on condidate experience.

    You should hold a Ph.D. or equivalent degree in biochemistry, biophysics, chemistry or physics or a related discipline. Very motivated scientist willing to work in a multidisciplinary team and a previous experience with computational methods is appreciable but not a requirement.
    Contacts:For application please send or email your CV + at least 1 recommendation letter to :
    Dr. A. ABABOU
    NMR Center (MSB)
    Leicester University
    University Road
    Leicester LE1 9HN
    UK
    phone: 44 (0) 116 223 3071
    fax: 44 (0) 116 223 1503
    e-mail: aa116@le.ac.uk

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    17/07/2002[MM]Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:17/07/2002Date limite de réponse:30/08/2002
    Lieu:Nancy (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    We have an opening for a post-doctoral fellow for up to 2 years, commencing september/october 2002 or later, to work on:

    Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization Molecular docking is the natural process by which molecules recognize and interact with one another. From a computational standpoint, it also refers to the prediction of the structures of ligand-receptor complexes from the conformations of unbound ligand and unbound receptor. Molecular docking is at the center of such practical applications as protein engineering and drug design. It has already helped to design new ligands for anti-AIDS and anti-cancer agents and for the treatment of diabetes.

    Structure-based molecular docking programs are based on the assumption that ligands which form favorable interactions with the receptor must have high binding affinity. They rely on the number-crunching capabilities of computers to generate and evaluate large numbers of possible bindings. Computers however do not have the experience of human beings and molecular docking methods severely limit the biochemists' ability to analyze the bindings computed and exploit their intuition and expertise to generate sound and reliable solutions. Also, most approaches to molecular docking do not take advantage of the visualization capabilities offered by modern workstations.

    Major challenges in this field are (1) predicting how molecules will dock with one another and (2) identifying the factors that determine the specificity of interaction. To make significant advances, it is necessary to develop novel methods to facilitate the docking techniques by enhancing our ability to understand and analyze docking interactions and to develop hypotheses about which molecules are most likely to interact favorably. These factors can be incorporated into molecular docking by including advanced visualization and haptic (sense of touch) feedback in the process.

    The main goal of this project is to develop an immersive, interactive and easy-to-use modelling environment to enhance molecular docking. The candidate will have at its disposal the state-of-the-art SGI high-performance computing technologies available at LORIA, notably the Reality Center immersive visualization facility and the Onyx 3800
    shared-memory system platform.

    In particular, the postdoctoral candidate is expected:
    - To integrate existing molecular docking programs with the LORIA collaborative computing environment.
    - To implement a haptic interface to facilitate interaction with molecular models, through a high-fidelity, 3D force-feedback device.
    - To combine visualization and haptic feedback to allow interactive docking simulations in the Reality Center.
    - To develop a multimodal user interface to facilitate the work of molecular scientists.

    The successful candidate will have a solid background in SGI graphics software and architecture. He is also expected to have a working knowledge of programming and scripting languages such as Java, Perl and TCL/TK.Candidates having experience in parallel computing and/or grid computing will be given priority.

    Salary will be approximately 21400 euros per annum. There are no restrictions on the nationality of the applicant.
    Contacts:For more information on this position as well as indication of interest, please contact
    Bernard Maigret (Bernard.Maigret@lctn.uhp-nancy.fr) http://www.lctn.uhp-nancy.fr
    or Sylvain Petitjean (Sylvain.Petitjean@loria.fr) http://www.loria.fr

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    17/07/2002[AG]Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis
    Source:comp.theory
    Date de parution:20/06/2020Date limite de réponse:09/08/2002
    Lieu:Aarhus (Danemark)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for a postdoctoral position for a two year period with possibility of extension at the Bioinformatics Research Center (BiRC), University of Aarhus, Denmark.

    The position is in the field of genome analysis, with particular emphasis on developing and applying computational methods to whole genome shotgun and EST sequences from the Pig Genome Project. Emphasis is on using evolutionary approaches, including efficient comparison with the human and mouse genomes.

    Applicants must have a PhD in computer science, statistics, genetics, or molecular biology, with an interest and some prior experience in computational biology and/or evolutionary analysis. The appointee should be able to handle efficiently large amounts of genome data, so prior experience with programming in Python/Perl and/or C/C++ is preferable.

    Pig Genome Project: The position is funded by the Danish National Research Councils as part of a trans-disciplinary national initiative, involving five Danish Research Institutions. The goal of this initiative is to add value to the data generated within the Sino-Danish genome consortium. The overall goal is to use the data to understand the Pig Genome and use those results to increase the understanding of the Human Genome by direct and indirect comparison. BiRCs participation in the project is focused on methods for genome assembly using the human genome as a template, gene finding in Pig and Human, and whole genome evolutionary analysis.

    BiRC: The successful candidate will be situated at BiRC (Bioinformatics Research Center at University of Aarhus, http://www.birc.dk), an interdisciplinary group with approx. 20 scientists from Computer Science, Statistics, Biology, and Molecular Biology. BiRC focuses on various aspects of bioinformatics, ranging form theoretical work in computer science, statistics and biology, to software development, and experimental work in collaboration with biological and medical research laboratories.

    Applicants must submit a curriculum vitae, a description of scientific accomplishments, and a list of publications (all in 4 copies), and 3 copies of publications to be considered in the evaluation.

    The Faculty refers to the Ministerial Order No. 820 of 31.8.2000 on the appointment of teaching and research staff at the universities under the Ministry of Research and Information Technology.

    Salary as agreed between the Danish Ministry of Finance and the Confederation of Professional Unions.
    Contacts:Applications should be addressed to:
    The Faculty of Science
    University of Aarhus
    Ny Munkegade, Building 520
    DK-8000 Aarhus C
    Denmark

    and marked 212/5-9.

    The deadline for receipt of applications is August 9, 2002, at 12,00 noon.

    Supplementary information can be obtained from:
    Mikkel Schierup,
    Tel. +45 8942 3231,
    E-mail: mheide@birc.dk

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    15/07/2002[AGMM]Thèse avec allocation MENRT - "Sélection et caractérisation de peptides inhibiteurs de biocatalyseurs"
    Source:ABG (ref:ABGt-2089)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Compiègne (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Nous avons généré dans l'Unité 6022 CNRS de l'Université de Technologie de Compiègne (UTC) des anticorps anti-idiotypiques catalytiques possédant des activités de type amidase (beta-lactamase et protéase). Nous avons préalablement sélectionné par "phage display" un peptide inhibant un anticorps à activité beta-lactamase (peptide antibiotique). Les objectifs de la thèse proposée sont de caractériser le type d'inhibition induit par cette molécule, de sélectionner d'autres peptides antibiotiques et éventuellement anti-protéasiques et de modéliser les interactions sur des outils de bio-informatique. L'effet du peptide antibiotique en modèle animal sera parallèlement étudié dans le cadre de collaborations.
    Domaines abordés : Biochimie, biologie moléculaire, immunochimie, enzymologie, modélisation moléculaire assistée par ordinateur.
    Compétences requises : Biochimiste titulaire d'un DEA. Le candidat devra avoir une expérience en biochimie des protéines et en enzymologie.
    La thèse débutera à la rentrée universitaire 2002-2003.
    Plus d'informations sur le site Web : http://www.utc.fr/~friboule
    Contacts:Le dossier de candidature comportant un CV devra être envoyé à :
    Alain FRIBOULET - Directeur de Recherches
    ou Bérangère BIHAN-AVALLE - Maître de Conférences

    UMR 6022 CNRS - Génie Enzymatique et Cellulaire
    Université de Technologie de Compiègne
    BP20529
    60205 COMPIEGNE CEDEX
    Tel : 03-44-23-44-13
    E-mail : alain.friboulet@utc.fr, berangere.avalle@utc.fr

    Merci de préciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (Association Bernard Gregory) et la référence ABG de cette offre.

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    15/07/2002[AGMM]Postdoctoral Research Fellowships
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Zurich (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Research Fellowships

    Computational Laboratory (CoLab), Swiss Federal Institute of Technology www.colab.ethz.ch

    The CoLab Postdoctoral Program is envisioned as a core of researchers conducting computational research on topics within the research goals of the CoLab.

    Current research focus areas include : Machine Learning Algorithms and Multiscale Computational Methods as applied to Cell Biology, Bioinformatics and Materials Science.

    Research opportunities
    The postdoctoral fellowships provide successful applicants with the resources and the interdisciplinary environment to support their research goals. The purpose of the fellowship is to stimulate cross-fertilization of ideas and to apply computational science to challenging problems in Science and Engineering. The fellows are responsible for conducting their own research projects and are encouraged to contribute to the CoLab environment of openness, interaction and collaboration.

    Qualifications
    An applicant must have a Ph.D. or Sc.D. degree granted within three years preceding the application date. We strongly encourage applications from women and minorities.
    Criteria used in the selection of postdoctoral fellows are the applicants' scientific competence, their spirit of innovation and the capability of conducting original and independent research in a highly collaborative environment.

    Stipend
    Successful applicants currently receive a stipend of about 90,000 to 100,000 SFR in the first year. These stipends are adjusted annually, based on the governing guidelines of ETH Zurich.

    Numbers and terms of appointments
    We anticipate 5 to 10 initial appointments, followed by another 10 appointments within the next 6 months. The fellowships have a one to three year term. Review of applications will begin July 1, 2002, and will continue until the positions are filled.

    How to apply :
    Each applicant for a postdoctoral fellowship at the CoLab should submit:
    An up-to-date curriculum vitae including summary of scientific work experience, including :
    A detailed list of publications.
    The names and addresses of three people familiar with the applicant's research
    An abstract of her/his doctoral thesis
    A concise statement (1 to 3 pages) describing the applicant's interest in CSE and the research that he/she wishes to pursue during the CoLab appointment

    We encourage applications via e-mail in electronic format (PDF, Word).
    Contacts:Dr. Sabine Attinger
    CoLab Scientific Coordinator
    Swiss Federal Institute of Technology
    ETH Zentrum
    8092 Zurich, Switzerland

    E-mail: sabine.attinger@inf.ethz.ch
    Tel: +41 1 632 2920

    For further information please visit www.colab.ethz.ch

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    15/07/2002[AGMM]Bioinformatics Coordinator
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:15/07/2002
    Lieu:Moscow (Idaho, USA)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The University of Idaho Computer Science Department invites applications for IBEST (Initiative for Bioinformatics & Evolutionary Studies)Bioinformatics Coordinator. This is a temporary position with assured funding for two years and expected funding thereafter. The major function of this position is to maximize the effective use of IBEST bioinformatics facilities by helping users; informing users about available facilities; and enhancing and promoting access to facilities. Requirements include: An advanced degree in biological sciences, statistics, or computer science; experience with bioinformatics or computational biology; excellent communications skills.
    Experience with Beowulf cluster computing is desirable.
    Contacts:Submit resume and at least two letters of reference to: IBEST Bioinformatics
    Coordinator Search, POB 441010, University of Idaho, Moscow, ID 83844-1010.
    or email foster@cs.uidaho.edu.
    Closing date: 15 July 2002 or until filled.

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    15/07/2002[AGMM]Two Bioinformatics Support Specialists
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Epalinges (Suisse)Statut:???Secteur:prive
    Description de l'annonce:
    The Swiss Institute of Bioinformatics seeks two Bioinformatics Support Specialists.

    Detailed job descriptions are available here

    Contacts:Dr. Laurent Falquet, Swiss EMBnet node Manager Swiss Institute of Bioinformatics
    Ch. des Boveresses 155
    CH-1066 Epalinges
    Switzerland

    Tel: +41 (21) 692 5954
    FAX: +41 (21) 692 5945

    Email: Laurent.Falquet@isb-sib.ch

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    14/06/2002[AG]Postdoctoral and Research Assistant Positions
    Source:hd-emploi-bio
    Date de parution:06/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Laval (Québec, Canada)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral and Research Assistant Positions Université Laval, Québec, Canada

    A large-scale project in functional genomics applied to forest trees funded by Genome Canada is now offering several employment opportunities at Université Laval and the Canadian Forestry Service, both located in Québec city, Canada. The project will investigate the regulation of wood formation (secondary xylem differentiation) and defense response in trees by utilizing functional genomics methods including transcriptome analysis and manipulation of gene expression.
    Positions include:
    Project Manager (Position #1);
    Scientific Coordinator - Bioinformatics (Position #2);
    Research Assistant - Molecular Biology and Bioinformatics - Several Positions (Position #3);
    Postdoctoral Fellowships, Molecular Biology and Functional Genomics (Position #4);
    Research Assistants: Platform in Plant Transformation (Forest Trees) - Several positions (Position #5).

    Complete descriptions of positions and application deadlines are available at http://www.forgenome.rsvs.ulava.ca.
    Contacts:Apply by e-mail to genome.foret@rsvs.ulaval.ca. Submit a current résumé, a cover letter, and the name and address of three references. Send requested information in a single attachment (MS Word or pdf files only) with applicant's name in filename, or insert information in body of message. Write the position number in subject line.

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    14/06/2002[AG]IT and Database specialist
    Source:NatureJobs
    Date de parution:14/06/2002Date limite de réponse:30/06/2002
    Lieu:Sienne (Italie)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Site de l'annonce

    Siena Biotech
    IT and Database Specialist
    Siena Biotech is an innovative biomedical research company dedicated to unravelling common and rare human diseases and discovering drugs for their treatment. This start-up company, situated in the heart of Tuscany, has a number of open positions. We are looking for highly motivated individuals interested in working in a multidisciplinary and international environment to identify likely targets for drug intervention in the CNS and oncology areas. Prior experience in drug discovery and strong English language skills are desirable. We are particularly interested in individuals with expertise in the following areas:

    Bioinformatics
    IT and database specialist (Job code B1): Responsible for maintaining computational infrastructure, including computer hardware, network, and software support. Also responsible for creating, maintaining, coordinating, and integrating biological databases, and assisting other scientists from a variety of backgrounds in the use of these resources. Candidates should have an advanced degree or equivalent experience in Computer Science or Information Technology. Background should include significant experience maintaining a heterogeneous computer environment, including experience with Solaris. Experience in the biotechnology or pharmaceutical industry, knowledge of the various public and proprietary biological databases, and familiarity with general database software would be highly advantageous.

    Closing date for applications is June 30, 2002.

    Siena Biotech is an equal opportunity employer.

    Print Ref:(W6516)R1 : IT and Database Specialist
    Don't forget to mention naturejobs when replying to this advert.
    Contacts:Candidates should send resumes, clearly indicating the job code for the position to which they are applying, to:
    Anna D'Arminio
    Siena Biotech S.p.A., Via Fiorentina 1
    53100 - Siena, Italy.,
    Email: adarminio@sienabiotech.it

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    11/06/2002[AG]Postdoctoral Positions
    Source:http://www.agbiotechnet.com/jobs/full.asp?id=771
    Date de parution:11/06/2002Date limite de réponse:01/05/2002
    Lieu:Ames (Iowa, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Research Associate Position in Animal Genetics and Bioinformatics 1 year appointment, renewable Available May 1, 2002 A Postdoctoral Research Associate Position in Animal Genetics and Bioinformatics is available at Iowa State University, Ames, Iowa. The position’s responsibilities include co-management and development of pig genome and pig expressed sequence tag (ESTs) databases, web site support and statistical analysis. The position will work with a productive and internationally recognized group and interact with many disciplines in molecular and quantitative genetics and bioinformatics. There are numerous opportunities for collaborations with cutting edge researchers in the field of animal bioinformatics and for professional rewards including publication and grant writing possibilities. The applicant is expected to have a biology or molecular genetics background and have experience in quantitative genetic analyses. In addition, working knowledge of a UNIX environment and web page design is required. Knowledge in database management and development, programming skills in Perl, Java or other languages, and experience in developing CGI scripts are advantageous. Preference is also given to applicants with experience in database server management and web server management. Salary: Commensurate with experience. Please send C.V. and have 2 letters of reference.
    Contacts:Please contact the following person for further details of this vacancy
    Name: Dr Max F Rothschild
    Position: Distinguished Professor
    Organisation: Iowa State University
    Address:
    Department of Animal Science, Iowa State University
    Ames
    Iowa 50011
    United States
    E-mail: mfrothsc@iastate.edu
    Closing date for applications: 01/05/02

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    11/06/2002[AGMM]Expert scientifique et Informatique
    Source:La Toile des Biologistes
    Date de parution:07/05/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Bourg La Reine (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Notre entreprise est le Leader Mondial dans les Technologies de Gestion de l'Information Scientifique, les Applications Métiers, les Bases de Données spécialisées, le Conseil et l'Assistance pour les Industries de la Pharmacie.
    Nous renforçons notre équipe technico-commerciale par un coordinateur régional. Sa mission sera d'assurer la promotion des offres et le support avant-vente et après-vente de nos solutions.
    La compétence métier est primordiale. Aussi nous recherchons des candidats diplômés en Chimie, Biologie, .... et/ ou Informatique et ayant une première expérience en recherche, gestion de projet, développement, support ou avant-vente pour la recherche dans le secteur pharmaceutique. La personnalité du candidat sera déterminante .
    La connaissance de certains de nos produits serait un plus.
    Le candidat doit avoir au minimum une connaissance pratique avancée sur les technologie de l'information Oracle, Java, VB, C, C++ etc environnement NT,SUN, UNIX..
    Contacts:Les candidatures (CV+lettre de motivation) sont à m'adresser impérativement en anglais

    MDL Information Systems AG
    Direct phone : +33 1 45 36 80 25
    Switchboard: +33 1 45 36 80 00
    Fax: +33 1 45 36 80 01
    Email: jfleclere@mdl.com
    Web site : www.mdl.com
    Succursale française
    5, Bd du Maréchal Joffre
    F-92340 Bourg La Reine

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    11/06/2002[AGMM]Bio informaticien
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:11/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Strasbourg (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Société fondée en 1999 et basée à Strasbourg, leader dans la découverte et le développement de dérivés médicaux, issus de la biologie des insectes, recherche son bio-informaticien.
    Véritable référent en matière de logiciels informatiques dédiés à la Biologie, vous travaillez en étroite collaboration avec notre service de recherche en apportant une aide efficace en matière d'organisation et de rationalisation des axes de recherche; ainsi qu'une expertise dans le développement de nouveaux outils informatiques et dans l'analyse des résultats.De formation supérieure scientifique avec une spécialisation en Bio-Informatique, vous avez une expérience d'au moins 3 ans dans le secteur du médicament, vous possédez des qualités relationnelles, le sens du service et des compétences en gestion de projets. L'anglais courant est indispensable.
    Contacts:Merci d'adresser votre dossier de candidature (lettre, CV, photo) sous la référence 311-MANAGING,
    2, Avenue Roger Salengro, 68100 MULHOUSE.
    E-mail : D.Weill@Managing.fr.

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    07/06/2002[AG]Bioinformatic Position at The Nestle research center
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:28/05/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lausanne (Suisse)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    LOCATION: Nestlé Research Center Lausanne, Switzerland
    http:// www.nutrition.nestle.com/discovery/network/research.asp

    JOB DESCRIPTION :
    We are seeking a BIOINFORMATICIAN to work within a small and dynamic bioinformatics team collaborating closely with "wet-lab" biologicalscientists. Your work will bring you in contact with numerous projectsthroughout Nestlé, including prokaryote genome analysis, sequenceanalysis tools, DNA and protein sequence database management,bioinformatics architecture and integration. Your scientific knowledgeand thorough understanding of bioinformatics applications will be amplyemployed in this vital, multi-disciplinary position. Knowledge of SRS isa plus.

    RESPONSIBILITIES:
    -participate in scientific projects as bioinformatics expert.

    EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED :
    Your background must include a M. Sc. or Ph.D. in Life Science (e.g.,molecular biology or microbiology) and experience in bioinformaticsincluding demonstrated success in project management. Linux, Unixenvironement knowledge required. Familiar with Perl. Bioperl is a plus.

    LANGUAGES NEEDED :
    Fluent in English, knowledge in French is a plus.OTHER SKILLS REQUIRED :The desired individual will be self-motivated, able to communicateequally well with biologists and computer scientists and working well inan interdisciplinary team is of paramount importance.

    DATE NEEDED :
    a.s.a.p.
    Contacts:CONTACT:
    Dr. Frank Desiere, Nestle Research Center, P.O.Box 44,
    CH-100 Lausanne 26
    frank.desiere@rdls.nestle.com

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    06/06/2002[AGMM]Ingenieur-expert Bioinformaticien
    Source:ABG (ref:ABGf-2097)
    Date de parution:27/05/2002Date limite de réponse:24/06/2002
    Lieu:Rennes (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    CDD ingenieur-expert Bioinformaticien 12 a 24 mois, Irisa Rennes, à partir de juillet

    Date de début de diffusion du poste : 27/05/2002
    Date de fin de diffusion prévue : 24/06/2002

    La Genopole Ouest est la dernière née des génopoles, ensemble de plus de 40 laboratoires fédérés pour la recherche en génomique.
    Le but du poste est d'assurer un service de mise à disposition de logiciels de bioinformatique pour tous les membres de la Génopole, à partir d'un serveur web ou de comptes informatiques sur une machine de calcul intensif. Ceci suppose l'installation et la mise à jour de logiciels publics ou privés et le developpement d'interfaces specifiques facilitant l'utilisation de ces logiciels par les biologistes.
    Ce travail comprend l'expertise de l'existant, la veille sur les nouveaux logiciels disponibles, la mise en place et le developpement d'outils génériques pour les laboratoires, et la
    participation active à un comité technique regroupant les personnes impliquées dans les différents laboratoires. Le candidat participera également à des actions de formation sur les outils mis en place. Le poste s'inscrit enfin en support pour la diffusion des recherches en bioinformatique se déroulant au sein de la Génopole.
    Il demande une bonne connaissance des principaux logiciels disponibles et des concepts sous-jacents et une maitrise des langages de script et de la programmation d'interfaces web. De
    bonnes connaissances des environnements de programmation en C ou C++ seront également appreciées.

    Profil du poste :
    En résumé, le profil du poste correspond à un ingénieur en
    bioinformatique chargé des tâches
    suivantes :
    - Rendre accessibles et mettre à jour les principaux logiciels de bioinformatique nécessaires au fonctionnement de la Génopole Ouest;
    - Assurer la veille des nouveaux logiciels disponibles;
    - Développer des interfaces d'accès spécifiques pour ces logiciels et participer à la diffusion des logiciels développés par les équipes de recherche en bioinformatique.
    - Participer aux actions de formation aux outils proposés.

    Duree du contrat :
    12 mois renouvelable 12 mois

    Conditions de recrutement :
    Le niveau de rémunération, dependant de l'experience du candidat, sera de l'ordre de 2000 euros net/mois.
    Le candidat intègrera l'équipe de recherche en bioinformatique Symbiose, à l'Irisa/Inria Rennes, dans le cadre stimulant de l'Irisa, le plus important laboratoire de recherche en informatique de l'Ouest.
    Les axes de recherche developpés dans l'équipe Symbiose offrent au candidat la possibilité de participer à des travaux innovants comme la recherche de signatures complexes dans des familles de séquences ou l'étude de reseaux de régulation de gènes.
    Un second poste de CDD est ouvert pour les aspects d'acces et de suivi des bases de données, et les deux personnes recrutées travailleront en coopération étroite.
    Contacts:Adresser un CV + lettre de motivation à Jacques.Nicolas@irisa.fr

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    05/06/2002[AG]ATER bio-informatique & ATER génétique moléculaire du diabète de type 2
    Source:hd-emploi-bio
    Date de parution:05/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Saint Denis de la Réunion (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    OFFRONS DEMI POSTE ATER BIOCHIMIE/BIOLOGIE MOLECULAIRE (génétique moléculaire du diabète de type 2) au laboratoire de biochimie et biologie moléculaire de l'Université de la Réunion
     
    OFFRONS DEMI POSTE ATER bio-informatique et ayant de solides compétences en biologie moléculaire ou biochimie
    au laboratoire de biochimie et biologie moléculaire de l'Université de la Réunion
    Contacts:Christine ROBERT-DA SILVA
    Laboratoire de biochimie et génétique moléculaire
    Faculté des Sciences
    Université de la Réunion
    15 av. René Cassin
    B.P. 7151
    97715 SAINT DENIS Messag. cédex 09
    Tél : 02 62 93 86 40 (from foreign countries : +(262) 262 93 86 40)
    Fax : 02 62 93 82 37( from foreign countries : +(262) 262 93 82 37)
    @ : robert@univ-reunion.fr

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    04/06/2002[AGMM]Correspondant informatique et "Data manager"
    Source:ABG
    Date de parution:27/05/2002Date limite de réponse:27/06/2002
    Lieu:FOUGERES (35) (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'unite Enregistrement de l'AFSSA - Agence nationale du Medicament veterinaire recherche un ingenieur pour assurer les fonctions de correspondant informatique et de responsable du suivi des bases de donnees.

    Fonctions:
    a. Interlocuteur privilegie de l'Unite Informatique pour l'Unite Enregistrement, il redige le cahier des charges de l'Unite Enregistrement en collaboration avec les utilisateurs de l'unite ;
    b. Il assure le suivi de la mise en oeuvre du cahier des charges ;
    c. Il redige la documentation et forme les utilisateurs aux outils developpes conformement au cahier des charges ;
    d. Il valide le contenu des bases de donnees relatives au medicament
    veterinaire, et apporte les actions correctives necessaires.

    Competences requises :
    a. Capacite a travailler en equipe : ecoute, expression orale aisee ;
    b. Rigueur : analyse, synthese, redaction soignee ;
    c. Outils bureautique ;
    d. Connaissance de methodes informatiques et de SGBD.

    Poste de contractuel avec possibilite titularisation.
    Salaire brut mensuel pour un debutant : de 1593 a 1775 euros en
    fonction du diplome (+ primes annuelles de 3082 a 4397 euros)
    Le poste a pourvoir est base a FOUGERES (35)
    Contacts:CV et LM sont a adresser a
    Mme Sylviane LAURENTIE,
    responsable de l'unite Enregistrement,
    AFSSA - ANMV,
    BP 90203,
    35302 FOUGERES CEDEX
    (02 99 94 78 60)

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    11/02/2002[AG]Analyst for the analysis of gene expression data
    Source:Ph. Marc (Agm2) - jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:05/03/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Research Assistant Grade 1A

    Cancer Research UK Medical Oncology Unit Bioinformatics / Analyst for the analysis of gene expression data
    Barts and The London Queen Mary’s School of Medicine and Dentistry

    We invite applications for the above position to work on the bioinformatic analysis of gene expression data. St Bartholomew's and the Royal London Charitable Foundation have funded the purchase of an Affymetrix system for gene expression analysis. This system, which is available to all groups in the Medical School is located at the Cancer Research UK Department of Medical Oncology, Charterhouse Sq. and will be operated under the direction of Professor Bryan D Young, in close association with the newly established Genome Centre. In order to facilitate the analysis of the expression data generated, a position has been created for a bioinformatics analyst, funded by St Bartholomew's and the Royal London Charitable Foundation and Cancer Research UK.

    The successful applicant is expected to have a MSc in Bioinformatics. Or relevant experience. He/she will liase with research groups in the choice of analysis strategies to be adopted and will be involved in the interpretation of the significance of the results. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

    Salary will be in the range of £19,760 -£28,625 per annum inclusive of London Allowance.

    For an informal discussion of this post, please email Professor Bryan D Young ( bryan.young@cancer.org.uk).

    Working towards equal opportunities
    Contacts:For an application form and further information, please contact our 24 hour recruitment line on 020 7882 3737 or email: smd-recruit@qmw.ac.uk quoting reference number 02512/DP. Completed application forms together with three copies of your Curriculum Vitae should be returned by 05 March 2002 and addressed to SMD Recruitment, Queen Mary, University of London, London E1 4NS.

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    11/02/2002[AG]Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:04/03/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician
    CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA
    Great Ormond Street Hospital for Children NHS Trust
    Institute of Child Health, University College London

    Following the award of a BBSRC Exploiting Genomics grant, we are seeking to employ two post-doctoral research assistants and a bioinformatician to work on this innovative interdisciplinary project. Our goal is to develop new methods of constructing gene and protein regulatory networks, using time series of Affymetrix microarray gene expression data. We will be focussing on the network centred on the biologically important p53 regulated DNA damage response.

    Post-Doctoral Research Fellow: Transcriptional Response to DNA Damage (Ref: PC/02/07a) £17,626 - £19,631 plus LW of £2,134
    This Research Fellow will have a recent PhD in field related to molecular and cellular biology. The successful candidate will be responsible for carrying out biological experiments and gathering data from Affymetrix arrays of 39,000 human transcripts. Experience of RNA handling is an advantage, as is proven attention to detail.

    Post-Doctoral Research Fellow: Mathematical Modelling of the DNA Damage Response (Ref: PC/02/07b) £17,626 - £19,631 plus LW of £2,134
    This appointee is expected to have a mathematical or computational background and will concentrate on developing models based on the biological data. A background in nonlinear dynamics, time series analysis, or the mathematical modelling of biological systems would be an advantage.

    Bioinformatician: Transcriptomics (Ref: PC/02/07c) £17,626 - £24,435 plus LW of £2,134
    The bioinformatician will have a qualification in bioinformatics or experience in manipulating microarray data. Familiarity with current gene array data handling procedures is desirable. The successful candidate will be responsible for array data management in a biological context. In collaboration with the Bioinformatics unit at UCL, they will help ensure compatibility of array data with EBI preferred formats (ArrayExpress), and play an interdisciplinary role in the manipulation of microarray data generated by a variety of groups at UCL.

    The positions are all for a duration of 3 years and are all on the Research 1A payscale. The successful candidates will benefit from the lively interdisciplinary environment provided by the 5*-rated Institute of Child Health and will have the opportunity to interact with a wide variety of projects at the interface of medical science, mathematics and computing.

    Informal enquiries about the post are welcome. Contact Mike Hubank ( m.hubank@ich.ucl.ac.uk) for cell molecular biology and bioinformatics posts and Professor J Stark (j.stark@ucl.ac.uk) for the mathematical post.


    Closing date for applications: 4 March 2002.

    TAKING ACTION FOR EQUALITY

    Contacts:For application details and a job description please contact the Human Resources Office by e-mailing hr1@ich.ucl.ac.uk or telephoning the 24-hour recruitment line on 020 7242 9789 ext. 0766. Please quote the relevant reference.

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    11/02/2002[AGMM]Postdoctoral Research Worker - statistical genetics
    Source:Ph. Marc (Agm2) - jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:21/02/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Research Worker
    statistical genetics
    Social, Genetic and Developmental Psychiatry Research Centre


    Applications are invited for the above post, working in statistical genetics in the Institute's Social, Genetic and Developmental Psychiatry Research Centre. In addition to statistical genetics work, the post will also involve setting up a data management system for an international collaborative study on attention-deficit hyperactivity disorder. Applicants should have a doctoral degree in genetics, preferably on a project involving a linkage or association study of twins. The applicant should also have expertise in the use of genetic analysis software.

    Starting salary in the range £19,585 pa to £22,401 pa (inclusive of London Allowance), depending on qualifications and experience.

    Only candidates shortlisted for interview will be contacted.

    Equality of opportunity is College policy
    Contacts:For further information please see the Personnel area of the Institute's website at http://www.iop.kcl.ac.uk/vacancies. Alternatively you can email vacancies@iop.kcl.ac.uk or send an SAE to the Personnel Office, Institute of Psychiatry, De Crespigny Park, London SE5 8AF. Please quote ref. no. 02/R24 in all correspondence. Closing date for applications 21 February 2002.


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    07/02/2002[AG]role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease
    Source:hd-emploi-bio@garp.univ-bpclermont.fr
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:28/02/2002
    Lieu:Edinbourgh (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Two postdoctoral research fellow positions are available in a
    research group working on the role of translation elongation
    factor 1A (EF1a) isoforms in disease. The two projects will
    involve the use of model organisms including yeast, zebrafish and
    mice, and a wide variety of techniques including molecular
    genetics, bioinformatics and cell biology. Experience in one or
    more of these areas is essential. The positions are available
    immediately and are funded for three years by the Wellcome
    Trust in a 5 rated department based in the Molecular Medicine
    Centre.

    Informal enquiries can be made to Dr. Cathy Abbott (email
    { HYPERLINK mailtoC.Abbott@ed.ac.uk) }C.Abbott@ed.ac.uk). For further
    details and an application form
    please contact the University of Edinburgh Personnel Office
    (details below), or see
    httpwww.jobs.ed.ac.ukjobsindex.cfmaction=jobdet&jobid=
    779
    The appointments will be made on the AR1A salary scale
    (£17,451 - £26,229)
    Application from with full CV and names and addresses of two
    referees should be submitted to the University of Edinburgh
    Personnel Office, 9-16 Chambers Street, Edinburgh EH1 1HT
    no later than 28th February.

    This advert will appear in this week's Nature.
    Contacts: Dr. C.M. Abbott
    Medical Genetics Section, Dept of Medical Sciences
    University of Edinburgh,
    Molecular Medicine Centre,
    Western General Hospital,
    Edinburgh EH4 2XU
    Phone 0131 651 1049, Fax 0131 651 1059

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    07/02/2002[AG]Maître de conférences (Université Paris XI)
    Source:http://garp.univ-bpclermont.fr/guilde/Public/Univ/2002/data/MCF-0911101C-A0001.html
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Gif sur Yvette (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Définition du poste : Maître de conférences
    Établissement : Université Paris XI
    Poste publié en section 65 (Biologie cellulaire)

    Profil du poste :
    Laboratoire d'accueil Station de Génétique Végétale du Moulon (UMR 320 Paris XI/INRA/INA PG)
    Lieu d'enseignement Université Paris XI
    Mots clés génétique multifactorielle, contrôle métabolique, protéomique, modélisation, enzymologie
    Page Web décrivant le laboratoire http://moulon.inra.fr/
    Profil détaillé Recherche

    Le niveau de polymorphisme élevé des gènes codant ou régulant les enzymes impliquées dans des chaînes métaboliques est responsable de la variabilité génétique naturelle des flux qui parcourent ces chaînes. Des calculs analytiques et des simulations ont révélé de remarquables propriétés
    génétiques et évolutives des flux considérés comme caractères quantitatifs modèles (distribution "en L" des effets des gènes, hétérosis métabolique, etc.).
    Le but de la recherche proposée, qui s'effectuera au sein de l'équipe de "Génétique Quantitative Fondamentale" (http://moulon.inra.fr/GQF.html), est de préciser ces résultats, et de les valider expérimentalement. D'une part des reconstitutions in vitro de chaînes métaboliques permettront de faire varier les concentrations d'enzymes et d'en étudier les conséquences en termes d'optimisation, d'épistasie, d'hétérosis, et de coefficients de sélection ; d'autre part, dans des systèmes in vivo, la variabilité génétique des concentrations d'enzymes sera évaluée par une approche de protéomique
    quantitative, et ses conséquences sur le contrôle des flux seront analysées et modélisées. Dans ce projet à l'interface entre biochimie intégrative et génétique, ce sont des compétences en biochimie et en modélisation qui sont
    souhaitées en priorité.

    Références de l'équipe sur le sujet :
    - Bost, Dillmann, de Vienne, 1999. Fluxes and metabolic pools as model traits for quantitative genetics. I. The L-shaped distribution of gene effects.
    Genetics 153, 2001-2012.
    - de Vienne, Bost, Fiévet, Zivy, Dillmann, 2001. Genetic variability of proteome expression and metabolic control. Plant Physiol. Biochem. 39,
    271-283.
    - Bost, de Vienne, Hospital, Moreau, Dillmann, 2001. Genetic and nongenetic
    bases for the L-shaped distribution of Quantitative Trait Loci effects.
    Genetics, 157, 1773-1787.
    - de Vienne, Bost, Fiévet, Dillmann, 2001. Optimization of enzyme concentrations
    for unbranched reaction chains: the concept of combined response coefficient.
    Acta biotheoretica (in press).


    Enseignement

    - Biologie quantitative : DEUG - Unité Fondamentale de Biologie Quantitative
    et de Bioinformatique (Enseignement Intégré).
    >> Modélisation déterministe. Etude de la biodiversité.
    - Génétique quantitative : DEA de Génétique Multifactorielle (TP-TD)
    http://moulon.inra.fr/dea-gm/
    >> Modélisation de la relation gène-caractère
    Contacts:Prénom et Nom Dominique de Vienne
    E-mail devienne@moulon.inra.fr
    Adresse postale, téléphone Station de Génétique Végétale
    UMR 320 Université Paris XI/INRA/INA PG
    La Ferme du Moulon
    91190 Gif-sur-Yvette
    Tél : 01.69.33.23.60
    Fax : 01.69.33.23.40

    Prénom et Nom Christine Dillmann
    E-mail dillmann@moulon.inra.fr
    Adresse postale, téléphone Station de Génétique Végétale
    UMR 320 Université Paris XI/INRA/INA PG
    La Ferme du Moulon
    91190 Gif-sur-Yvette
    Tél : 01.69.33.23.48
    Fax : 01.69.33.23.40

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    07/02/2002[AG]Head of Bioinformatics Applications
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:15/02/2002
    Lieu:Oxford (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    THE WELLCOME TRUST CENTRE FOR HUMAN GENETICS

    ACADEMIC-RELATED RESEARCH STAFF GRADE III: Salary £30,514 - £38,221 p.a: We are recruiting a senior research scientist to head the Bioinformatics Application Team, part of the Bioinformatics and Statistical Genetics group at the Wellcome Trust Centre for Human Genetics. You will have a proven postdoctoral research pedigree in DNA and protein sequence bioinformatics, and in particular the functional and structural annotation of protein sequences. You will be responsible for the overall provision of sequence bioinformatics to aid research programs within Centre, to identify genes associated with complex human disease. In addition the postholder will be expected to perform and publish high-quality independent bioinformatics research. The successful application will have experience at a senior level and an excellent publication record. The appointment would be for three years in the first instance.

    If you apply for this position, please say you saw it FIRST on
    URL of this document: http://jobs.ac.uk/jobfiles/XG193.html
    Date of input: 30/01/02
    Contacts:A letter of application with full curriculum vitae, publication list and a statement of research interests, plus the names and addresses of two referees should be sent to Alicia Vaux, The Wellcome Trust Centre for Human Genetics, Roosevelt Drive, Oxford OX3 7BN. Reference RM-02-011. The closing date for applications is 15 February 2002.

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    07/02/2002[AG]Position post doctorale en data mining
    Source:Association Bernard Gregory (Ph. Marc/Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:05/04/2002
    Lieu:Lyon (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Mining the SAGE data

    A post-doctoral position is available immediately to work on the
    Discovery of association rules
    for generating synexpression groups from large gene expression matrices.
    This project is a joint
    effort between two groups :
    1. one biologist group interested in understanding the molecular basis
    for the cellular switch
    from a self-renewal program to a differentiation program in normal
    cells, and
    2. one computer group interested in developing the forefront data mining
    algorithms.

    The project is based on the use of freely available SAGE data, that have
    been to date only poorly
    exploited. The initial proof of concept has been done and is submitted
    for publication. The
    post-doc is expected to refine from this standpoint, and notably explore
    the following directions:
    a. The expression data have to been transformed into boolean
    data before extraction.
    Various methods for such a transformation will be explored in terms of
    their consequences upon
    the discovered rules.
    b. An extremely interesting scientific challenge is to consider
    other user-defined
    constraints (not only related to frequency and accuracy of the
    association but also various
    constraints) that can be pushed into the association rule mining
    algorithms. It might enable to
    improve the focus and support user guidance in order to generate
    tractable extractions.

    The ideal candidate should be a highly motivated individual with a
    strong background in molecular
    biology and bioinformatics. Experience in programming with Access and
    Delphi will be a plus but is
    not a prerequisite, since the environment will provide learning
    resources in those fields.

    Gender equal opportunities : women are encouraged to participate and to
    apply for the proposed
    open position.

    Contacts:To apply, please submit a full CV, details of relevant experience, and
    the name of two referees to
    :

    Dr O. Gandrillon; Signalisation et identites cellulaires ; CGMC. UMR
    5534 ; Universite Claude
    Bernard Lyon I, Bat 741 ; 43, boulevard du 11 Novembre 1918 ; 69622
    Villeurbanne Cedex ; E-mail:
    Gandrillon@maccgmc.univ-lyon1.fr ; W3 :
    http://cgmc.univ-lyon1.fr/Gandrillon/index.html

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source
    (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    07/02/2002[AG]Ingénieur/Post-Doc Bioinformatique (BAC+5 Bioinformatique / 6 mois / PARIS )
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Paris (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre de la Génopole de la Montagne Sainte Geneviève (Paris), le laboratoire de Biologie Moléculaire du Développement (INSERM U368) de l’Ecole Normale Supérieure recherche un : --Ingénieur d’étude en bioinformatique -- Vous serez intégré à l’équipe dirigée par le Dr Patrick Charnay (http://www.biologie.ens.fr/fr/bmdevelo). Nous travaillons sur le contrôle génétique du développement du système nerveux des vertébrés. Un des aspects de notre travail concerne le développement des cellules de Schwann, qui sont en charge de la myélinisation du système nerveux périphérique. Nous avons entrepris d’étudier le transcriptome de ces cellules afin d’identifier les réseaux de régulation génétique contrôlant leur développement et la myélinisation. Vous participerez donc aux analyses informatiques impliquées par cette étude, ainsi qu’à la mise en place des outils nécessaires à sa réalisation.
    Mission : - Des outils d’analyse et de gestion des résultats des puces à ADN, commerciales ou fabriquées localement, ont été mis en place, basés sur une solution client/serveur PHP/PostgreSQL). Vous poursuivrez la construction des outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d’analyse (clustering, data mining, …). - L’ENS étant également un centre national de ressources “puces à ADN”, vous participerez à l’intégration de tous les outils disponibles pour faciliter l’homogénéisation et le contrôle de toutes les étapes du processus de fabrication et d’analyses des puces à ADN. - Vous serez l’interlocuteur du laboratoire avec les différentes équipes bioinformatique impliquées dans ce projet (ESPCI, Institut Curie, …). --Profil : Vous maîtrisez les outils de développement d’interface web (HTML, Javascript,…), les langages de script (PHP, perl, …) et vous avez l’expérience de la gestion des bases de données (SQL). Vous avez des connaissances en biologie et plus particulièrement des méthodes d’analyse à grande échelle. Diplôme BAC+5 requis. --Perspectives : Ce poste s’inscrit dans la politique de développement de la bio-informatique dans le Département de Biologie de l’Ecole Normale Supérieure qui débouchera l’année prochaine sur la création d’une équipe de recherche dans ce domaine. --Durée du contrat : 6 mois. --Salaire : 16000 F brut. --Date de disponibilité du poste : Février 2002 --
    Contacts:Envoyez vos références à Patrick CHARNAY : Laboratoire de Biologie Moléculaire du Développement – INSERM U368 Ecole Normale Supérieure – 46, rue d’Ulm 75005 PARIS Mail : charnay@biologie.ens.fr

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    07/02/2002[AG]Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Jouy en Josas (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Offre CDD Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et
    outils d'analyse des données d'expression à l'INRA de Jouy en Josas.
    durée : 1 an à compter du 1er février 2002.

    Les programmes de génomique animale (projet transversal AGENA)
    manipulent
    d'énormes volumes de données hétérogènes (de la séquence aux réseaux
    d'interaction entre protéines en passant par les données des
    transcriptomes)
    créées par les technologies à haut débit. L'acquisition, le stockage,
    l'analyse et le traitement de ces données brutes et des données
    annotées,
    leur comparaison avec d'autres données de bases extérieures
    généralistes ou
    spécifiques, leur consultation, ..., doivent être rendues possibles
    auprès
    des biologistes à travers des interfaces conviviaux et performants.
    L'ingénieur participera à la conception et au développement de bases de
    données, au développement d'interfaces pour le biologiste, il mettra à
    disposition des biologistes un ensemble d'outils bio-informatiques et
    il
    participera à leur formation.

    L'ingénieur recruté développera ses activités en étroite collaboration
    avec
    les autres informaticiens du projet AGENA sur Jouy, Toulouse et Rennes.
    Il
    collaborera étroitement avec l'équipe MIG (Mathématique Informatique et
    Génomes), et l'équipe BIA (Biométrie Intelligence Artificielle) de
    Toulouse
    et avec les chercheurs en génomique des 4 espèces animales concernées
    (bovin, porc, truite, poulet).
    Il participera aux groupes de travail et aux séminaires
    bioinformatiques à
    un échelon local, régional et même national.

    Compétences souhaitées :
    Formation en informatique : expérience Unix, Windows nécessaire.
    Compétences en programmation (C, C++ et Perl) et en bases de données
    relationnelles (SQL).
    Connaissances des logiciels de biologie moléculaire souhaitée (BLAST,
    FASTA,
    GCG, ...).
    Connaissances en biologie appréciée.
    Sens de l'organisation et du travail en équipe.

    Le poste (niveau IE) est affecté au centre INRA de Jouy en Josas, il
    est
    à pourvoir immédiatement.

    Contacts: Envoyer CV et lettre de motivation par mail à cch@jouy.inra.fr.

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    07/02/2002[AG]Postdoc Positions in Bioinformatics at NCGR, New Mexico
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Santa Fe (Nouveau-Mexique, Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    My lab has four open postdoc positions in gene expression informatics.
    The details of these positions can be found at
    http://genex.ncgr.org/genex/job-postings.html
    The successful candidates are expected to work on research projects
    involving the analysis of gene regulatory elements by comparative
    approaches, the correlation of gene expression profiles with gene
    regulatory elements, the modeling of regulatory networks, systematic
    molecular diagnosis schemes and drug treatment for leukemias, and gene
    expression analysis for evaluating host-pathogen interactions (using
    the mouse tuberculosis as a model). She/he is expected to closely
    collaborate with researchers at NIH, LANL, and UNM involved in
    microarray-based gene expression and proteomics projects.
    Applicants are expected to have a Ph.D. degree in bioinformatics or
    equivalent training. Good knowledge of biological sequence analysis
    methods and software, as well as programming experience in a UNIX
    environment are essential. A strong interest in gene regulation and
    a basic understanding of experimental molecular biology are also
    important. Experience in exploratory statistical analysis and
    regulatory network simulation would be further advantages.
    We encourage the candidates to send applications as soon as possible,
    including a cover letter, curriculum vitae, a statement of research
    interests, and the names and email addresses of three referees.
    Contacts:Applications and further inquiries should be sent to:
    Dr. Honghui Wan
    Global Bioinformatics Laboratory
    National Center for Genome Resources
    2935 Rodeo Park Drive East
    Santa Fe, NM 87505, USA
    Phone: (505) 995-4410 or 800-450-4854
    Fax: (505) 995-4432
    Email: hw@ncgr.org
    *-*
    Stefan Unger, PhD
    Global Education & Research
    Comp. Biology/Bioinformatics/Comp. Science
    Sun Microsystems
    650-786-0310 (80310)
    *!* JOIN SUN'S COMPUTATIONAL BIOLOGY SIG FOR CUSTOMERS!
    http://www.sun.com/edu/hpc/compbio-sig
    join, post, drop: compbio-sig-info@sun.com
    Computational Challenges in the Post-Genomic Age - II
    http://www.sdsc.edu/Workshops/postgenomic/index.html

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    07/02/2002[AG]Bioinformaticien
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:01/01/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Localisation: Évry (91)
    Durée du contrat : CDD 18 mois
    Date d'embauche : janvier 2002

    Définition de la fonction :
    Biogemma, principale société de biotechnologie végétale française
    (www.biogemma.com) recrute un bioinformaticien. Responsable de la
    partie bioinformatique d'un projet scientifique européen vous devrez
    intégrer les données biologiques issues de ce programme et mettre en
    place un environnement permettant leur analyse et leur valorisation
    par les biologistes.

    Au sein d'une équipe de bioinformaticiens, vous implémenterez des bases
    de données, des chaînes de traitements automatiques ainsi que des
    interfaces homme-machine. Vous serez également impliqué dans différents
    projets bioinformatiques transversaux.

    De réelles capacités d'écoute ainsi qu'un esprit de service à
    l'utilisateur sont requises.

    Environnement de travail:
    - Serveurs Unix Sun/Compaq, WindowsNT
    - SGBDR Oracle
    - GCG, LASSAP, Biomerge

    Profil demandé :
    - Système d'exploitation Unix et Windows
    - Programmation (Perl, Java, PHP, ...)
    - Langages HTML, CGI, XML, SQL
    - BLAST, Package GCG, ...

    Si de bonnes connaissances en biologie sont requises, une expertise
    en biologie végétale n'est pas nécessaire.

    Source annonce:
    Denis SCALA
    BioInformatique
    Biogemma
    2, rue Gaston Crémieux
    91000 Évry
    75001 Paris
    Contacts:Contact:
    Envoyer CV et lettre de motivations à

    Catherine Guichard
    Biogemma - DRH
    1, rue Édouard Colonne


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    07/02/2002[AGMM]1 LECTURESHIP Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford
    Source:Ph. Marc
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:20/03/2001
    Lieu:Oxford (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford, Oxford, UK

    Deadline: 1 March 2002
    Beginning: 1 October 2002
    Duration: permanent
    Salary: 20 470 - 41 570 GB Pounds / year

    University Lecturership in Bioinformatics in association with a
    Supernumerary Fellowship at St John's College.

    Applications are invited for this permanent new post which is funded for the first five years by EPSRC, alongside its similar support for the new Professorship of Bioinformatics held by Professor Jotun Hein.

    These two appointments are part of a major expansion of the resources committed by the Department of Statistics, and more widely in Oxford, to bioinformatics. The anticipated start date for the post is 1 October 2002.

    The successful candidate will be offered a supernumerary fellowship with membership of the Governing Body by St John's College.

    Salary will be on the age-related scale for University Lecturers without tutorial fellowships, which will be £20,470-£41,570 per annum (at 1 March 2002 rates). Additional college allowances may be available as set out in the further particulars.

    Whilst applications are welcome from candidates with research interests in any area of methodological development in bioinformatics, there is a strong preference for candidates whose research is related to 'post-genomic' problems (including for example those pertaining to: structural biology; comparative genomics; analysis of modern experimental techniques such as gene expression arrays, or proteomics; data on genetic variation within species; and proposed 'medical informatics' databases which link medical records with genetic information) and which complements or builds on existing strengths within Oxford.



    Applications (nine copies, one for overseas applicants) including a CV detailing research interests, a publication list, and names, email and postal addresses, fax and telephone numbers for three referees (not more than two being from the same institution) should be sent to the administrator to reach her by 1 March 2002. Referees should be asked to write directly to the above address without waiting for a further request.

    Details of the current research interests in bioinformatics and mathematical genetics within the department may be found at:
    http://www.stats.ox.ac.uk/mathgen
    Other computational biology research in Oxford is described at:
    http://www.compbio.ox.ac.uk



    The closing date for applications is 1 March 2002. The University is an Equal Opportunities Employer.
    Contacts:Further particulars of the post are available from:

    The Administrator
    Department of Statistics
    1 South Parks Road
    Oxford OX1 3TG, UK
    tel 01865 272869
    email: beint@stats.ox.ac.uk
    http://www.stats.ox.ac.uk

    Informal enquiries may be made to Professor Donnelly
    (donnelly@stats.ox.ac.uk) or to Professor Hein (hein@stats.ox.ac.uk).

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    07/02/2002[AGMM]PhD / Postdoc Positions, European Project: HaeMOdel
    Source:P. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:05/03/2002
    Lieu:? (?)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Openings for PhD and Post-Doc positions are available in the frame of the European Union Funded RTN project "Mathematical Modelling for Haemodynamics"(HaeMOdel), aiming at developing research and training young researchers on the mathematical and numerical issues related to the simulation of the human cardiovascular system.

    The Network comprises six European Institutions with a long standing experience on different aspects of this research fields. The young researcher is expected to participate actively to the Network activities, which comprise Workshops, Tutorial courses and a visiting scheme among the Network Teams.

    The project expected starting date is October 1st , 2002. The deadline for the this candidature application is March 5th, 2002.

    The background required to a young pre-doc researcher wishing to
    participate to the project is a degree in Mathematics or Physics or Engineering or Computer Science, with a strong personal interest in numerical methods and scientific computing, as well as the willingness to learn new subjects,
    often not strictly related to his previous studies.

    The post-doc should have a solid experience in mathematical and
    numerical modelling and/or scientific computing. A background in medical research or bioengineering is also welcomed.
    Contacts:The researcher must comply with the eligibility rules for European RTN projects (more details on:
    http://www.cordis.lu/improving/networks/home.htm)

    The full text of the call for application together with the on-line application form, the list of positions available and more details on the HaeMOdel project are found in:
    http://dmawww.epfl.ch/Quarteroni-Chaire/HaeModel/Main/call.html

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    07/02/2002[AGMM]Informatics Scientist (Collaborator Liaison)
    Source:http://hum-molgen.org/positions/postdocs/1897.html
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    SciGenium

    Informatics Software

    Informatics Scientist (Collaborator Liaison)

    The person in this position serves as a liaison between SciGenium and a specific collaborating client, with primary responsibility for European operations. The liaison provides full-time on-site consulting including demonstration and support for data visualization and mining software, understanding the collaborator's needs and conveying those to the home office, defining software requirements to support the collaborator, participating in prototype development, and performing data analysis.

    The European liaison is part of a two-person team to support the collaborator's needs. Along with the other liaison, who has primary responsibility for North American operations, this two-person team must act in a unified fashion to best represent, unify, and integrate the needs of this client under a single client director. Effective and frequent communication is an important aspect of success in this position.

    The Informatics Scientist needs to have an understanding of information visualization, in general. In addition, knowledge of the technical areas being addressed by the client is needed. The candidate should have some familiarity with exploratory data analysis, bioinformatics, and cheminformatics and be willing to learn more in these areas. Familiarity with existing informatics software and Windows and UNIX platforms is desired. Experience with programming languages such as JAVA would be advantageous.

    Training and experience equivalent to a Ph.D. in mathematics/statistics, biochemistry/molecular biology, chemistry, or computer science or an M.D. Experience with informatics and excellent interpersonal skills required.
    Contacts:Interested candidates should forward their resumes to jtrynak@scigenium.com or FAX 208.567.3995 or send to:
    SciGenium
    P.O Box 380916
    Cambridge, MA 02238

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    07/02/2002[AGMM]BIOINFORMATICIAN
    Source:http://hum-molgen.org/
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Toronto (Ontario, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Hess Associates Executive Search

    Hess Associates recruits contract and permanent Information Technology,
    Biotechnology, Genomics, Proteomics, Pharmaceutical, and Bioinformatics
    professionals. Headquartered in Toronto, Canada, we make placements
    across Canada, the United States and internationally through an
    affiliated network of independent search firms. The Company
    has been in business since 1976.

    Position # 871

    Ph.D. level BIOINFORMATICS specialist.
    Please note that a Ph. D. is absolutely essential.

    LOCATION: Canada

    REQUIREMENTS:
    Post doctoral experience preferred.
    Strong interest in bioinformatics as it relates to physiology, biochemistry, cellular processes.
    Desire to publish and interact with Ph.D. level specialists.
    Excellent communication and presentation skills.

    PERMANENT POSITION.
    Salary commensurate with experience.
    Contacts:Application including: CV
    should be sent to:

    Herbert Hess
    Hess Associates
    Biotechnology Executive Search
    712 - 1500 Don Mills Road
    Toronto, ON M3B 3K4, Canada
    Phone: 416-447-3355
    Fax: 416-447-3595
    E-mail: hr@hessjobs.com

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    03/07/2001[MM]ATER Physico-Chimie moléculaire et cellulaire au Muséum National d'Histoire Naturelle
    Source:lettre d'information de l'iEDU
    Date de parution:03/07/2001Date limite de réponse:03/09/2001
    Lieu:Paris (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Avis de vacance d'emplois d' A.T.E.R. au Muséum National d'Histoire Naturelle :

    Une circulaire est envoyée, ce jour, pour affichage, à tous les Directeurs de Laboratoire et Chefs de service.

    10 emplois sont ouverts au Muséum :
    2 postes en Biologie des populations :
    Intitulés des profils :
    - Dynamique des Populations d'oiseaux
    - Dynamique des communautés d'oiseaux

    4 postes en Biologie des organismes :
    Intitulés des profils :
    - Technologies de la reproduction appliquées à la conservation d'espèces en voie de disparition ( Parc de la Haute Touche à
    Azay)
    - Biologie de la conservation des plantes (Conservatoire botanique national du Bassin parisien à Cherré (Sarthe)
    - Phylogénie des Téléostéens (Laboratoire d' Ichtyologie générale et appliquée)
    - Biologie et Biotechnologies Marines (Station de Biologie Marine de Concarneau)

    2 postes en Sciences de la Terre :
    Intitulés des profils :
    - Préhistoire et paléoenvironnements du Quaternaire, Pléistocène supérieur (Abri Pataud)
    - Modélisation hydrosédimentaire et biologique d'écosystèmes côtiers macrotidaux (Laboratoire d'Océanographie Physique)

    2 postes en Biologie expérimentale :
    Intitulés des profils :
    - Endocrinologie évolutive (Laboratoire de Physiologie)
    - Physico-Chimie moléculaire et cellulaire
    Les dossiers sont à retirer à l'Administration - service du Personnel - où ils devront être retournés, au plus tard, le 3
    septembre 2001, délai de rigueur, (le cachet de la poste faisant foi).
    Contacts: le telephone standart ( 01.40.79.30.00), serveur : http://www.mnhn.fr

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    01/07/2001[MM]ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire
    Source:association Bernard Gregory
    Date de parution:01/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Fresnes (France)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire
    (industrie phamaceutique)

    Date de debut de diffusion du poste : 18/06/2001

    Au sein du Departement Sciences Pharmaceutiques de notre Centre de
    Recherche, ce post-doc integrera une equipe de physico-chimistes et
    de formulateurs pour un Contrat post-doctoral d'une duree de 12 mois.

    Il aura pour mission de relier des etudes conformationnelles a
    certaines proprietes physico-chimiques . Pour cela, il devra realiser
    des analyses conformationnelles sur petites molecules (principes
    actifs) en milieu solvant, en utilisant les logiciels MSI, Tripos
    (Sybyl 6.6)...

    Les candidats doivent etre titulaires d'un Doctorat en Chimie /
    physico-Chimie avec une specialisation en modelisation moleculaire.

    Nous vous remercions d'adresser CV + lettre de motivation a :
    PFIZER Global Research & Development
    A l'attention de Joel Vacus
    Departement Sciences Pharmaceutiques
    3/9 rue de la Loge BP 100
    94265 FRESNES Cedex
    Tel: 01 40 96 74 00 / joel.vacus@pfizer.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)
    Contacts:Nous vous remercions d'adresser CV + lettre de motivation a :
    PFIZER Global Research & Development
    A l'attention de Joel Vacus
    Departement Sciences Pharmaceutiques
    3/9 rue de la Loge BP 100
    94265 FRESNES Cedex
    Tel: 01 40 96 74 00 / joel.vacus@pfizer.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)

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    01/07/2001[MM]Researcher – Protein structure modelling NAUTILUS BIOTECH
    Source:http://www.arborescience.com/public/pages_fr/jobs_detail.php?id=1413
    Date de parution:25/05/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Description du poste à pourvoir :

    Job Description: Modelling of protein structure, folding, active sites/domains and ligand/protein-protein interaction.

    Place : Evry, France

    Compensation package:

    -Highly competitive salary
    -Stock options according to personal and Company performance

    Position available immediately
    Requirements: PhD in Biology, Biotechnology or similar Previous experience in modelling of protein structure
    Contacts:Contact :
    Contact information: Manuel Vega
    CEO
    mvega@nautilusbiotech.com
    tel : +33 (0)6 87 69 56 38
    Référence de l'offre, pour votre candidature et dans toute correspondance avec Arborescience :
    ARB1413

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    01/07/2001[AG]A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project
    Source:liste bioinfo IMPG
    Date de parution:27/06/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Bordeaux (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for
    the LIGNOME project.
    This project deals with the functionnal genomics of diverse perennial
    plants (Pines, Poplars, Apricots and Grape)


    posted at : http://www.pierroton.inra.fr/postdoc.html
    Contacts:Jean-Marc Frigerio Genetique et Amelioration des Arbres
    Forestiers
    INRA BP45 Phone : +33 (0)5 57 97 90 79
    F-33611 Gazinet Cedex France Fax : +33 (0)5 57 97 90 88
    Frigerio@pierroton.inra.fr http://www.pierroton.inra.fr


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    01/07/2001[AG]ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique
    Source:association Bernard Gregory
    Date de parution:15/06/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:? (France)Statut:???Secteur:prive
    Description de l'annonce:
    ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique

    Date de debut de diffusion du poste : 15/06/2001

    Societe de Biotechnologies de la metropole lilloise, nous sommes
    specialises dans la decouverte de nouveaux medicaments.
    Dans la cadre de notre expansion nous recherchons un chef de projet
    en bioinformatique.

    Docteur en Biologie, vous avez une formation complementaire en
    informatique et de bonnes connaissances en bioinformatique.
    Maitrisant parfaitement les languages C+, XML ..., vous mettrez en
    place, en particulier, notre outil reseau.
    Votre anglais est courant et vous souhaitez vous investir dans une
    societe jeune et en pleine expansion.
    Contacts:Envoyer votre candidature a notre conseil :
    Valerie Lacoste
    Cabinet F2V
    5 rue Kepler 75116 Paris
    Fax 01 40 70 14 09 / Email : vlacoste@f2v.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)

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    01/07/2000[MM]Software Developers à Gentech (Sophia antipolis)
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Sophia Antipolis (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Software Developers à Gentech (Sophia antipolis)
    Gentech is a biotechnology research laboratory and bioinformatics company. We are developing a cross-platform bioinformatics
    software package for DNA and protein sequence analysis and visualisation.
    Three software developer positions are available with the following requirements:
    - C++ programming
    - Expertise in one or more of the following platforms:Windows98-NT, Linux and MacOS
    - Knowledge of 3D programming, (Quickdraw, OpenGL).
    Gentech is located in the scientific park "Sophia Antipolis" in the South of France near Nice and Cannes, see our web site
    www.gentech.fr.
    Contacts:contact: Gentech 55, Allée Charles Victor Naudin Sophia Antipolis 06410 Biot France
    Tel : 04 93 95 68 28 Fax : 04 93 95 68 27

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    01/07/2000[AG] allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
    Source:liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:13/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Une allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (UMR CNRS 5558).
    Des candidats souhaitant réaliser une thèse en bioinformatique sont espérés sur cette allocation. Le sujet de thèse proposé serait
    la conception d'algorithmes efficaces pour des programmes dédiés à l'analyse comparative, en particulier la reconstitution
    phylo-génétique. La thèse sera codirigée par Manolo Gouy (BBE - UMR CNRS 5558) et Bernard Tourancheau (RESAM, action
    RESO de l'INRIA).
    Plus précisémént l'objectif de cette thèse sera le développement d'une architecture de type client/serveur permettant de réaliser des
    analyses phylogénétiques lourdes (maximum de vraisemblance, bootstrap) grâce à la parallélisation des calculs effectués. Outre des
    développements au niveau des algorithmes de reconstitution phylogénétique proprement dits, ce travail impliquerait également la
    construction d'une interface utilisateur efficace,sur le modèle du logiciel Phylo_win :
    http://pbil.univ-lyon1.fr/software/phylowin.html
    Contacts:Nous encourageons vivement les candidatures et nous invitons les personnes intéressées à prendre contact dès que possible avec :
    Pr. Christian Gautier
    Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR CNRS 5558 Université Claude Bernard - Lyon 1 43, bd. du 11 Novembre
    1918 69622 Villeurbanne Cedex
    cgautier@biomserv.univ-lyon1.fr

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    01/07/2000[AG]two informatics positions at the University of California, Berkeley
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Berkeley (USA)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for two informatics positions at the University of California, Berkeley to work with an LBNL/UCB team in
    developing gene expression analysis methodologies to identify and monitor potentially harmful environmental agents and to
    characterize their putative mechanisms of action. We are developing a variety of machine learning techniques in order to develop
    highly sensitive and informative biosensors and markers for toxicity. We are recruiting for a Senior Specialist o develop novel and
    apply existing analytical methods to gene expression and other data generated from cells, tissues and organisms exposed to
    environmental agents. Requires an advanced degree in either the computational or life sciences with experience in statistical analyses.
    Must be proficient in a UNIX environment and have the ability to program in C/C++, Matlab and basic shell scripts. Knowledge of
    SQL and PERL a plus.
    We are also recruiting for a Junior Specialist (B.S.) who will be responsible for the efficient implementation of analytical
    techniques developed in-house and installation of tools obtained from other sources.
    Contacts:Please send resumes and inquiries by email to Saira Mian at smian@lbl.gov or Chris Vulpe at vulpe@uclink4.berkeley.edu
    Chris Vulpe MD., Ph.D., Assistant Professor
    Nutrition and Toxicology
    119 Morgan Hall
    University of California, Berkeley 94720
    Office: 510-642-1834 Lab:510-642-7564 Fax: 510-642-0535

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    01/07/2000[AG]CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:01/09/2000
    Lieu:Strasbourg (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante: CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg
    Profil : Analyse de séquences d'ADN de plantes
    Connaissances dans le domaine de la cytocinèse et de la paroi
    Connaissances en bioinformatique
    Niveau de formation requis : Doctorat
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : Janvier 2001-9 mois
    Région/lieu ou s'effectuera la recherche : Alsace/Strasbourg
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Dr Elisabeth JAMET elisabeth.jamet@ibmp-ulp.u-strasbg.fr
    Adresse du laboratoire : IBMP-CNRS 12, rue du Général Zimmer 67000 STRASBOURG
    Date limite de candidature : septembre 2000

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    01/07/2000[AG]Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Clermont Ferrand (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand
    Programme : Génoplante-blé gestion de bases de données
    Profil : Le candidat sera chargé de l’organisation, de la maintenance et de l’incrémentation de ressources biologiques moléculaires et
    végétales. Compétences demandées : Expérience en marquage moléculaire et bactériologie, maîtrise des logiciels de gestion de bases
    de données type ORACLE (AURIGE), ACCESS ou PARADOX impérative, grande rigueur et minutie, Il devra avoir des qualités
    d’organisateur et une bonne aptitude pour les relations humaines et le travail en équipe.
    Niveau de formation requis : bac + 5
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : 01/12/99
    Région /lieu où s'effectuera la recherche : Clermont-Ferrand
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Michel Bernard (Michel.Bernard@clermont.inra.fr)
    Adresse du laboratoire : INRA Station d’Amélioration des Plantes Domaine de Crouelle 234, Avenue du Brézet 63039
    Clermont-Ferrand cedex 2
    pas de date limite de candidature annoncée

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    01/07/2000[AG]Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY
    Source: transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY
    Programme : Génoplante Générique, Nouveaux outils d’analyse du génome
    Profil : Ingénieur de recherches.
    Participation à l’organisation de bases de données FST et EST et recherches bioinformatiques sur ces données. ("Data mining")
    Niveau de formation requis : Thèse en biologie moléculaire végétale. Connaissances en analyse de séquences bioinformatique
    souhaitées.
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : Février 2000, CDI sur financement privé
    Région/lieu où s’effectuera la recherche :Evry, région parisienne
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Alain Lecharny lecharny@evry.inra.fr
    Adresse du laboratoire : Unité de Recherche en Génomique végétale INRA 2 Rue Gaston Crémieux 91057 Evry Cedex, France
    Tel: +33 1 60 87 45 06 Fax:+33 1 60 87 45 10
    Date limite de candidature : fin Décembre 2000

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    01/07/2000[AG]Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Toulouse (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse
    Thèse : Développement d’un prototype permettant la localisation de gènes et/ou de motifs structurés. Application à la recherche
    d’éléments d’intérêt chez Arabidopsis thaliana.
    Niveau de formation requis : DEA Informatique (avec goût pour la biologie) ou bioinformatique
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : octobre 2000
    Région/lieu ou s’effectuera la recherche : INRA – Midi-Pyrénées – Toulouse
    Contacts:Scientifique(s) a contacter : Christine Gaspin : Christine.Gaspin@toulouse.inra.fr ou Thomas Schiex :
    Thomas.Schiex@toulouse.inra.fr
    Adresse du laboratoire : INRA/UBIA Chemin de Borde-Rouge Auzeville BP 27 31326 CASTANET-TOLOSAN
    Date limite de candidature : Septembre 2000

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    01/07/2000[AG]PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G)
    Source:transmis par Marie-France Sagot sur la liste bioinfo du Crihan
    Date de parution:01/08/2000Date limite de réponse:15/09/2000
    Lieu:Strasbourg (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G)
    PRESENTATION:
    La bio-informatique constitue un axe de recherche multidisciplinaire récent à la frontière de plusieurs disciplines scientifiques : la
    biologie, l'informatique, la pharmacologie, etc. L'un des objectifs de la bio-informatique est le décryptage du génome humain. Le
    génome d'un être vivant peut-être vu, en effet, comme une chaîne de caractères (une séquence) sur un alphabet à quatre lettres codant
    toutes les informations biologiques correspondant à cet être vivant et notamment les informations correspondant à ses gènes.
    L'objectif de cette thèse est l'annotation et l'analyse d'une famille multigéniques à intérêts thérapeutiques (les récepteurs couplés aux
    protéines G : RCPG) du génome humain. Les RCPG ont un rôle majeur dans la communication entre cellules. Environ 50% des
    médicament actuels sont des ligands des récepteurs RCPGs connues. On en connaît actuellement 200 à 300 chez l'homme et on estime
    le nombre de gènes humain de cette famille entre 1000 et 5000.
    L'analyse fonctionnelle des RCPG est un thème de la génopole Strasbourg-Alsace-Lorraine. Le campus d'Illkirch possède des équipes
    de biologistes et de pharmacologues de renommée internationale qui ont acquis une grande expertise dans le domaine des RCPG.
    Cette thèse s'effectuera dans un contexte scientifique multidisciplinaire. Les objectifs des travaux de recherche envisagés dans le
    cadre de cette thèse sont : la modélisation et la conception d'une plate-forme informatique permettant d'intégrer les connaissances
    biologiques sur les RCPG aux outils combinatoires classiques d'analyse des séquences génomiques, la gestion des annotations et des
    séquences annotées, la modélisation géométrique et topologique des RCPG en 2D (dans le plan) et 3D (dans l'espace). Une des pistes
    envisagées est l'utilisation d'une approche multiagents (y compris le développement de nouveaux agents) pour annoter le génome
    humain : détermination de la structure des gènes, analyses structurales et fonctionnelles éventuellement en relation avec une analyse
    bibliographique automatique.
    Une société émergente en cours d'incubation ayant pour objectif la découverte de nouveaux médicaments ayant pour cibles les RCPG
    orphelins vient d'être primée dans le concours de créations de jeunes entreprises. Cette société est incubée dans le bioincubateur de
    l'école Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg, elle permettra éventuellement d'aider à la promotion de certains des résultats
    futurs de cette thèse. Le candidat doit avoir des compétences fortes en informatique: l'algorithmique et programmation, les bases de
    données, les réseaux, les systèmes d'exploitations. Des compétences fines dans certains des domaines suivants sont souhaitées :
    combinatoire algorithmique des mots et des graphes, apprentissage automatique, probabilités, théorie de l'information, complexité,
    infographie. Des compétences en biologie sont aussi les bienvenues mais pas nécessaires. Enfin le travail se faisant dans un contexte
    multidisciplinaire, le candidat doit posséder des facultés de communication afin d'interagir
    avec les chercheurs des différentes disciplines.
    FINANCEMENT: Bourse MENRT fléchée Bio-Informatique (programme génome).
    LABORATOIRES D'ACCUEILS :
    1- Laboratoire des Sciences de l'Image de l'Informatique et de la Télédétection ( LSIIT UPRES-A 7005 CNRS-ULP )
    2- Institut Fédératif de Recherche Gilbert LAUSTRIAT " Biomolécules et Innovations thérapeutiques " IFR 85 et FR CNRS 2059 (
    UMR CNRS Pharmacologie et physico-chimie des interactions cellulaires et moléculaires ).
    DIRECTEURS DE THESE : TAJINE (Professeur en Informatique) et M. J. HAIECH (Professeur en Biochimie)
    Contacts:Les candidatures pour le sujet de thèse et pour la bourse du ministère sont à adresser avant le 15 septembre 2000 à :
    M. TAJINE
    Laboratoire des Sciences de l'Image, de l'Informatique et de la Télédétection (LSIIT UPRES-A 7005, CRNS) Pôle API (ENSPS),
    Boulevard Sébastien Brant, 67400 Illkirch (Strasbourg) Tel.: 33 (0)3 88 65 55 33 Fax. : 33 (0)3 88 65 55 01
    Mél: tajine@dpt-info.u-strasbg.fr

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    01/07/2000[AG]Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)
    Source:trouvé sur webbio.com
    Date de parution:31/08/2000Date limite de réponse:30/09/2000
    Lieu:Lille (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)
    Société : CNRS UPRESA 8090 Laboratoire Genetique des Maladies Multifactorielles, Lille
    Présentation du poste : Réaliser des analyses statistiques de données génétiques en collaboration avec des chercheurs en biologie
    moléculaire, épidémiologie génétique et des médecins : - Gestion des données (vérification / mise en forme informatique) -
    Organisation des contrôles de qualité - Utilisation de programmes spécifiques de statistique génétique - Mise en forme des résultats
    -Aide à l'interprétation des résultats - Développement de procédures d'automatisation - Participation au développement et à la gestion
    des bases de données - Profil : - Bac + 4 ou 5. Bonnes connaissances statistiques -Formation en statistiques génétiques assurée au sein
    du laboratoire - Disponibilité pour suivre des formations à l'étranger - Connaissances : - Utilisation UNIX, base de programmation C
    ou Pascal et Anglais - Lieu : Institut de Biologie de Lille -
    Contacts:Sophie Gallina Institut de Biologie de Lille
    Laboratoire des maladies multifactorielles 1 rue du professeur Calmette, B.P. 245, 59019 Lille
    Date limite d'envoi : 30 septembre 2000

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    01/07/2000[AG]2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:22/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Ghent (Belgique)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    Place: University of Ghent, Belgium
    Organism: INRA/GenoPlante (French institute/organism)
    Date: as soon as possible
    Objective: in the frame of 2 GenoPlante projects, he/she will be involved in the building of databases and their Web user interfaces
    as well as in the development/enhancement of software for gene prediction, gene annotation, and gene products characterization.
    Skills: Relational Database Management Systems (Sybase, Oracle, postgreSQL) Web development (HTML, JavaScript, Java)
    CGI/software development (C, Perl)
    Qualification: master's degree in computer science or equivalent
    Language: fluent English required
    Contacts:Pierre Rouze (pirou@gengenp.rug.ac.be)
    Patrice Dehais (href=mailto:pahai@gengenp.rug.ac.be>pahai@gengenp.rug.ac.be)
    Address: Laboratoire Associé de l'INRA
    VIB Department of Plant Genetics, University of Ghent,
    K.L. Ledeganckstraat 35, B-9000 GHENT, Belgium
    Tel: +32-9.264.5189
    Fax: +32-9.264.5008

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    01/07/2000[AG]Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5
    Source: posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:28/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Montbonnot Saint Martin (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre de projets en partenariat industriel, l'unite de recherche INRIA Rhone-Alpes a Grenoble (equipe Helix, "Informatique
    et genomique") recrute en CDD (un an, renouvelable deux fois) : Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5. Formation en biologie
    moleculaire et formation complementaire en informatique (par exemple a travers un DESS "double completence"), ou formation en
    informatique assortie de connaissances en biologie. Competences souhaitees en modelisation et programmation par objets.
    Taches a realiser : Conception et programmation d'algorithmes et de stategies d'analyse de donnees genomiques et proteomiques.
    Modelisation des entites biologiques concernees et de leurs relations dans le cadre d'un modele de connaissances a objets. Conception et developpement
    des interfaces personne-machine. Experimentation en vraie grandeur des systemes informatiques resultants.
    Date d'embauche souhaitee : 1er decembre 2000
    Composition du dossier de candidature :
    - une lettre de candidature et de motivation
    - un CV mentionnant les emplois et fonctions remplis anterieurement
    - les éventuelles references ou lettres de recommandation
    Contacts:Francois Rechenmann
    INRIA Rhone-Alpes
    655 avenue de l'Europe
    38330 Montbonnot Saint Martin
    ou par voie electronique a :
    Francois.Rechenmann@inria.fr
    Pour toute information sur les emplois proposes, contacter :
    François Rechenmann Francois.Rechenmann@inria.fr
    Unité de Recherche INRIA Rhône-Alpes Tel. 04 76 61 53 65
    655 avenue de l'Europe Fax 04 76 61 54 08
    38330 Montbonnot Saint Martin ou 04 76 61 52 52
    Secrétariat (Françoise de Coninck) Tel. 04 76 61 53 63
    http://www.inrialpes.fr/

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    01/07/2000[AG]CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante)
    Source:posté sur la liste de l'ABG
    Date de parution:18/10/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    ABGf-648 - CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) - Lyon
    Date de debut de diffusion du poste : 13/10/2000
    A position is open on a short-term contract (5 months from the 1 December 2000) at the Laboratoire de Reproduction etDeveloppement
    des Plantes (UMR 5667 INRA, CNRS, ENSL, Univ. Lyon I), to analyse data produced by the Arabidopsis genomesequencing project.
    This project is part of a nation-wide programme of Arabidopsis genome sequence annotation co-ordinatedby Genoplante. Work in
    Lyon will concentrate on the receptor-like kinase gene superfamily.
    We are looking for a biologist with some experience in sequence analysis and annotation and, if possible, some knowledge of the gene
    family being studied. The position is ideal for a biologist aiming to acquire experience in Bioinformatics. The salary will be
    calculated on the INRA scale depending on the level of experience. The position is open immediately.
    Contacts:Please send a CV and the names of 3 referees to Dr. Mark Cock, R.D.P.,
    UMR 5667 INRA - CNRS ENSL, Ecole Normale Superieure de Lyon, 46, Allee d'Italie, 69364 LYON Cedex 07
    Mark.Cock@ens-lyon.fr, tel: 0472728611

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.
    ABGf-648 - CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) - Lyon

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    01/07/2000[AG]Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA.
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:18/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Winnipeg (Manitoba, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Optimex Group, Inc. is presently has an agreement to locate professionals for the positions below. Negotiations are presently ongoing
    to locate openings in other capacities. Resumes may be forwarded to contact@optimexgroup.com. All positions are located in
    Winnipeg, Manitoba.
    Salary approx. CAD$50,000 per annum. In consultation with the cereal genetics and molecular genomics research scientists and in
    collaboration with a computer programmer, you will conduct research and development in the area of molecular bioinformatics. This
    includes: evaluating current software for the storage, analysis and interpretation of DNA sequence, proteomics and microarray (DNA
    chip) data; developing contacts with recognized experts in the field to facilitate the exchange of the most current theories and
    methodologies; collaborating with local scientists to determine the most important requirements for molecular bioinformatics at the
    Cereal Research Centre; designing, implementing and maintaining a state-of-the-art system to satisfy these requirements, designing
    noval software where necessary; training local staff in the use of molecular bioinformatics systems and sharing developments with
    other AAFC Centres engaged in genomics research. A M.Sc. in biological sciences, biochemistry or molecular biology is required.
    Experience in molecular biology research including the analysis of DNA sequence data. Informatics experience including the use and
    design of large databases and computer programming.
    RESUMES WILL BE SCREENED ACCORDING TO THE ABOVE EXPERIENCE FACTORS. PLEASE INDICATE IN YOUR
    RESUME HOW YOU MEET EACH FACTOR.
    http://www.canadaimmigrationlaw.net/Employment/open-positions.htm#Molecular Bio-Informatics Biologist
    NOTE: M.Sc.= Master of Science = dernier diplome américain avant le Phd = bac +4
    Contacts:contact@optimexgroup.com

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    01/07/2000[AG]Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Philadelphia (USA)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project. University of Pennsylvania
    The individual will be responsible for managing a database, GenMapDB (http://genomics.med.upenn.edu/genmapdb) and running a
    wide range of bioinformatics and image analysis software related to DNAmicroarray studies.
    Experience in Unix and NT systems, database management and programming in C, Java and Perl is necessary. Background in biology
    and genetics would be a major advantage. The successful applicant will hold at least a MS Degree in Computer Science or Biology.
    On-the-job training and course attendance will be available.
    Contacts:Applications including the names and phone numbers of three referees to be sent to:
    Vivian Cheung, MD, University of Pennsylvania, 3516 Civic Center Blvd., ARC 516, Philadelphia, PA 19104; email:
    vcheung@mail.med.upenn.edu.
    plus de détails: http://asso.univ-poitiers.fr/adbep/emploi/BIOINFORMATICSPENNSYLVANIA.htm

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    01/07/2000[AG]Bioinformatics Applications Developer
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:07/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Bioinformatics Applications Developer à Hybrigenics (Paris)
    You will work with our bioinformatics scientists on the design and development of leading-edge biological modeling and analysis
    software. Your initial responsibilities will include design and development of an Oracle-based platform dedicated to the functional
    annotation of protein domain sequences detected using Hybrigenics' PIM building technology.
    Required : An M.Sc. or equivalent experience in either biology or CS/Math, complemented by proven software development
    experience within the life sciences context Familiarity with classical biological sequence analysis algorithms Strong experience with
    object-oriented design and development in C++ or Java (Java preferred) Familiarity with Unix environment Excellent
    problem-solving and communications skills, ability to work both independently and within a team.
    Preferred Competencies : Relational databases (Oracle preferred), SQL
    Contacts:Applications including CV and references should be sent to :
    jobs@hybrigenics.fr - Vincent Schachter & Yvan Chemama - Hybrigenics - 180 avenue Daumesnil - 75012 Paris - France (Ref DV1,
    08/2000)

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    01/07/2000[AG]projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:10/10/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Meylan (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre du projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoire, en partenariat
    avec l'Institut Pasteur (Paris), l'INRIA Rhone-Alpes (Grenoble) et la societe Hybrigenics (Paris), GENOME Express recrute en CDD
    (un an renouvelable ET pouvant par
    la suite evoluer en CDI) :
    - Un ingenieur concepteur/developpeur, formation de niveau Bac+5 en informatique, competence confirmee en programmation par
    objets (Java, et/ou
    C++).
    Il s'agit de participer a la conception et au developpement du noyau d'un systeme a base de connaissances, ainsi que de ses interfaces
    personne-machine generiques (navigation, visualisation, edition, expression de requetes).
    Date d'embauche souhaitee : 1er novembre 2000
    Lieu de travail : Grenoble
    - Un bio-informaticien, niveau Bac+5. Formation en biologie moleculaire et formation complementaire en informatique (par exemple a
    travers un DESS
    "double completence"), ou formation en informatique assortie de connaissances en biologie. Competences souhaitees en modelisation
    (UML) et programmation par objets (Java et/ou C++).
    Taches a realiser :
    1. Modelisation des entites biologiques concernees et de leurs relations dans le cadre d'un modele de connaissances a objets.
    2. Conception et programmation d'algorithmes et de strategies d'annotation des genomes.
    3. Conception et developpement des interfaces personne-machine.
    4. Experimentation en vraie grandeur des systemes informatiques resultants.
    Date d'embauche souhaitee : 1er decembre 2000
    Lieu de travail : Grenoble

    Composition du dossier de candidature :
    - une lettre de candidature et de motivation
    - un CV mentionnant les emplois et fonctions remplis anterieurement
    - les éventuelles references ou lettres de recommandation

    Contacts:A adresser a :
    Yves Vandenbrouck
    GENOME express
    11 Chemin des Pres
    38944 Meylan
    ou par voie electronique a :
    y.vandenbrouck@genomex.com
    Pour toute information supplmentaires, contacter :
    Yves Vandenbrouck
    Bioinformatics Project Coordinator
    y.vandenbrouck@genomex.com
    ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
    GENOME express
    11 Chemin des Pres
    38944 Meylan
    France
    Tel: + 33 (0)4 76 04 16 42 et/and + 33 (0)4 56 38 11 11
    Fax: + 33 (0)4 76 04 16 42 et/and + 33 (0)4 56 38 11 00
    Mobile: +33 613307550
    http://www.genomex.com

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    01/07/2000[AGMM]Modélisation de l?influence de la démographie sur la cohésion des groupes et les modalités de dispersion des animaux chez les espèces à femelles philopatriques - Le cas du magot
    Source:posté sur la liste Virtuallab
    Date de parution:03/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Rennes (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'école Doctorale Vie Agro Santé de L'Univ. Rennes1 est susceptible d'attribuer une bourse de thèse pour un étudiant extérieur à
    Rennes1 et pour un sujet qui sera réalisé au sein de l'UMR 6552 à partir de la rentrée 2000-2001. Nous faisons donc appel à
    candidature pour des étudiants en possession de leur DEA. Il est souhaitable que les candidats aient suivi un cursus qui leur ait permis
    d'acquérir des connaissances en dynamique et en génétique des populations. Des compétences en modélisation sont souhaitées.
    Pouvez-vous diffuser largement ce message auprès de vos collègues?
    Pour tout complément d'information, contacter Jean-Sébastien Pierre
    Jean-Sebastien PIERRE
    Université de Rennes 1 - CNRS
    UMR 6552 "E.V.E."
    Ethologie, eVolution, Ecologie
    Campus de Beaulieu, Batiment 25, 35042 Rennes Cedex
    Tel: (33) 02 99.28.14.20
    Fax: (33) 02 99.28.69.27
    e-mail: Jean-Sebastien.Pierre@univ-rennes1.fr

    Ci après la proposition de sujet de thèse:
    "Encadrants: Jean-Sébastien Pierre et Nelly Ménard (UMR 6552, Rennes1)
    Modélisation de l?influence de la démographie sur la cohésion des groupes et les modalités de dispersion des animaux chez les
    espèces à femelles philopatriques - Le cas du magot (Macaca sylvanus). Chez les espèces où les femelles sont philopatriques (de
    nombreux mammifères sociaux), les femelles tendent à rester ensemble sur le domaine où elles sont nées. Il existe souvent une
    migration asymétrique des deux sexes qui implique que le brassage des individus au sein de la population se fait principalement par
    les migrations des mâles. La formation de nouveaux groupes qui se fait par la division de groupes existants, constitue donc le mode
    essentiel de dispersion des femelles. Ces divisions ont lieu généralement lorsque le groupe a atteint un seuil critique au regard de
    différents facteurs, qu?ils soient d?ordre écologique (relation entre taille des groupes et taille des ressources exploitables, relations
    taille des groupes et stratégies antiprédation) ou d?ordre social (degré de compétition, diminution de la cohésion entre sous-groupes).
    La première conséquence de ces divisions est de ramener les groupes à une taille acceptable pour l?espèce compte tenu des conditions
    de l?environnement. Ensuite, les conséquences portent sur les divergences des nouveaux groupes par rapport au groupe initial en terme
    de degré d?apparentement, apport d?individus étrangers, redistribution éventuelle des ressources, relations entre les nouveaux groupes
    (compétition). Enfin, ces événements particuliers de la dynamique d?une population peuvent avoir des implications majeures sur leur
    structuration génétique (Melnick & al., 1984, Pope, 1992). On peut attendre la plus grande différenciation génétique intergroupes au
    sein de la population lorsque les divisions se font entre les lignées de femelles philopatriques (Chesser, 1991). La proportion de
    variance génétique parmi les lignées dépend de la taille des lignées et du nombre de mâles reproducteurs dans les groupes.On trouve
    la plus grande différenciation génétique quand un seul mâle est reproducteur au sein d?une même lignée. Le modèle utilisé pour notre
    étude sera le magot (Macaca sylvanus), espèce vivant en groupes multimâles-multifemelles dans lesquels les femelles sont
    philopatriques et les mâles migrent à l?âge adulte. Deux populations ont été observées pendant 10-12 ans. Les généalogies au sein des
    groupes sont connues ainsi que les migrations des mâles. Les distances interindividuelles ainsi que les relations sociales ont été
    échantillonnées au cours des observations. Les données démographiques obtenues serviront à cette étude. Nos résultats ont montré
    qu?au delà d?un certain seuil, un groupe de magot était susceptible de se diviser en plusieurs nouveaux groupes. Cette division se fait
    entre les lignées matriarcales et suscite une recrudescence des migrations de mâles.
    Nous nous proposons de modéliser les mécanismes de distanciation des individus qui pourraient conduire à une division de groupe
    afin de cerner dans quelle mesure des proximités aléatoires suffiraient à expliquer la division au delà d?une certaine taille par
    formation de «clusters» et perte de cohésion du groupe. Compte tenu des capacités cognitives des espèces étudiées, les résultats
    devront être modulés par l?analyse d?autres facteurs susceptibles d?influer tels les capacités individuelles à maintenir un réseau de
    relations plus ou moins élargi (Henzi & al., 1997). On peut faire l?hypothèse que plus le taux d?accroissement de la population sera
    grand, plus les divisions seront fréquentes et plus la taille des lignées matriarcales qui compose les nouveaux groupes sera grande (cf.
    résultats de Melnick & Kidd, 1983 sur le macaque rhésus). Nous nous proposons de modéliser l?influence de facteurs d?accroissement
    tels la natalité, la mortalité infantile, l?espérance de vie et la durée de reproduction des femelles adultes sur la structuration des
    groupes (taille des lignées, degré d?apparentement des animaux). La modélisation s?attachera également à préciser l?influence des
    modalités de division sur la structuration génétique d?une population. Elle prévoira la prise en compte des stratégies de reproduction
    comme facteur susceptible d?accentuer ou de moduler l?effet de lignée sur la différenciation génétique intergroupes. Cette partie est
    en cours dans le cadre d?un DEA et trouvera son plein développement au cours de la thèse. La modélisation sera applicable à d?autres
    espèces à femelles philopatriques."
    Contacts: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
    Jean-Sebastien PIERRE, professeur
    Université de Rennes 1 - CNRS, UMR 6552 "E.V.E."
    Ethologie, eVolution, Ecologie
    Campus de Beaulieu, Batiment 25, 35042 Rennes Cedex
    (France)
    Tel : (33) 02 99.28.14.20
    Fax : (33) 02 99.28.69.27
    e-mail : Jean-Sebastien.Pierre@univ-rennes1.fr
    ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

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    01/07/2000[AGMM]Appel à candidature : bourse de thèse
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:10/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lille (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Appel à candidature : bourse de thèse
    École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé de Lille (Directeur Pr Marc Mazzuca)
    Lieu : Université des Sciences et Technologies de Lille
    Équipe : Christian Rolando, UPRESA CNRS 8009 en collaboration avec le Pr. Christian Druon Institut d’Électronique et de
    Microélectronique du Nord, UMR CNRS
    Dans le cadre du Plateau de protéomique de la Génopole de Lille, notre équipe en partenariat avec l’Institut d’Électronique et de
    Microélectronique du Nord, développe des systèmes intégrés basés sur des microsystèmes en silicium (échelle 10 microns) pour la
    purification et la séparation en ligne des échantillons afin de pouvoir accéder à une protéomique à haut débit. Ce programme fait
    l’objet d’une labellisation par le Réseau National de Micro et nanotechnologie.
    Le candidat aura en charge toute la partie biologique du développement de ces nouveaux objets sur des thématiques en partenariat avec
    les équipes de biologie de l’USTL en particulier le Pr Michel Salzet, UPRESA CNRS 87017 (peptide antibactérien) et le Dr
    Jean-Claude Michalski, UMR CNRS 8576 (glycobiologie). Le laboratoire assurera la formation à l’ensemble des techniques de la
    protéomique.
    Équipements spécifiques: électrophorèse bi-dimensionnelle, chromatographie liquide faible débit, spectromètre de masse MALDI,
    spectromètre de masse « Q-TOF », accès local aux banques de données.
    Contacts:Pour tout renseignement complémentaire contacter :
    Dr. Christian Rolando Directeur de Recherche au CNRS
    Courrier électronique / E-mail : Christian.Rolando@univ-lille1.fr
    Université des Sciences et Technologies de Lille (Lille 1)
    UFR de Chimie, Bâtiment C4, 2ème étage, porte 210
    UPRESA CNRS 8009, Chimie Organique et Macromoléculaire
    59655 Villeneuve d'Ascq Cedex, France
    Bureau / Office
    Téléphone: 03 20 43 49 77; Télécopie : 03 20 33 61 36; Téléphone mobile: 06 60 67 37 78
    From outside France
    Phone: 333 20 43 49 77; Fax: 333 20 33 61 36; Cellular Phone: 336 60 67 37 78
    Centre de Spectrométrie de Masse / Mass Spectrometry Center
    Téléphone: 03 20 43 49 76; Télécopie: 03 20 43 43 63;
    From outside France
    Phone: 333 20 43 49 76; Fax: 333 20 43 43 63

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