ASSOCIATION AGM2
Association des Étudiants du DEA d'Analyse de Génome et de Modélisation moléculaire
Offres d'emploi post DEA

Les offres Post-DEA de l'association

222 annonces en cours de validité dans toute la baseRetour aux annonces
DateBRStatutP/PTitrePays
11/07/2017MM Postdoc prive iZI88cd5jkHd fxORIcdvJ
27/06/2007MM Stage prive amour france
21/11/2006AG Thèse public PhD studentship in Bioinformatics Angleterre, Grande-Bretagne
31/10/2006AG ??? prive broadcasting Ontario
30/06/2005AG Postdoc prive Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites France
01/06/2005AGMM Postdoc prive Postdoc Bioinformatics France
29/11/2004AG Postdoc public
29/11/2004AG ??? prive
22/07/2004AG Postdoc prive physic, byophysic, single molecule France
06/11/2003AGMM CDI public Database BIOINFORMATICS PROGRAMMER/ANALYST Etats-Unis
05/11/2003MM CDI prive Molecular Modeler Etats-Unis
05/11/2003AG CDI public Assistant/Associate PROFESSOR Etats-Unis
05/11/2003AG CDI public Senior Bioinformatics Positon at the FMI Suisse
05/11/2003AG Postdoc prive Stage Post-Doctoral en Bioinformatique/Bio-Statistique France
21/10/2003AG Postdoc public Post-doctoral positions BIOINFORMATICS Etats-Unis
21/10/2003AG CDI prive Bioinformatics Research Scientist Etats-Unis
21/10/2003AGMM CDI prive BIOINFORMATICS Scientist Singapour
09/10/2003AG Postdoc public 2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats) Canada/Quebec
09/10/2003AG CDD prive CDD Math-Info France
09/10/2003AG CDI prive BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
09/10/2003AG CDD prive 2 CDD Ingenieur d'etudes France
09/10/2003AG Postdoc prive motif discovery algorithm/statistics Etats-Unis
05/10/2003AGMM Postdoc public Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics Etats-Unis
18/09/2003AG Thèse public three PhD positions in Bioinformatics Australie
18/09/2003AG Postdoc public Post-doctoral position in microarray data analysis Suisse
09/09/2003MM CDI prive BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist Etats-Unis
03/09/2003AG CDI public poste d'ingénieur d'étude génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle
03/09/2003AGMM Postdoc public BIOINFORMATICS TEACHING POSTDOCTORAL FELLOW Etats-Unis
11/08/2003AG Maître de Conférence public RESEARCH POSITION Canada/Quebec
03/08/2003MM Postdoc public Postdoctoral position in Bio-Geometry France
03/08/2003AG CDI public Chef de projet bioinformatique au Genoscope France
03/08/2003AG Postdoc public postdoc paillasse/modélisation post-génomiqueà genopole France
03/08/2003AG Postdoc public bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis France
03/08/2003AG CDI public bioinformaticien confirme France
03/08/2003AG Postdoc prive Stage Post-Doctoral en Bio-Informatique/Bio-Statistique France
02/08/2003MM Postdoc public Post-Doctoral Research Fellowships Etats-Unis
02/08/2003AG Postdoc public Post-Doctoral Research Fellowships Etats-Unis
26/06/2003AG Maître de Conférence public MC de bioinformatique France
23/06/2003AG Postdoc public Computational Neurobiology at EMBL Grande-Bretagne
23/06/2003AG CDD public Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie France
23/06/2003AG Thèse public Open Ph.D. positions in Algorithmic Allemagne
23/06/2003AG CDI prive Computational Biologist Etats-Unis
23/06/2003AG CDI prive BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Etats-Unis
16/06/2003AG CDI public Associate or Full Professor computational biology and bioinformatics Etats-Unis
13/06/2003MM Thèse public These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole France
11/06/2003MM Postdoc public POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS Etats-Unis
10/06/2003MM Thèse public Simulation Numérique des Métalloprotéines Impliquées dans la Toxicologie France
10/06/2003MM Thèse public Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire France
10/06/2003MM CDI prive Computational Chemists/C++ Etats-Unis
10/06/2003MM CDI prive development of advanced algorithms for ligand and structure-based drug design and chemical informatics Etats-Unis
10/06/2003AG CDD public CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster France
10/06/2003AG Postdoc public Biologist Suisse
10/06/2003AG CDI prive GenBank Biologist Etats-Unis
10/06/2003AG CDD prive CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services Allemagne
10/06/2003AG Postdoc prive bourse post-doctorale Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés France
10/06/2003AG ??? prive SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
10/06/2003AGMM CDD public Eight tenure track faculty positions Etats-Unis
10/06/2003AGMM CDI public Associate Professor for Computational Biosciences, tenure track Autriche
10/06/2003AGMM CDI prive Senior Scientist Bioinformatics, NITD Singapour
28/05/2003AGMM ATER public ATER - Bioinformatique - Lille France
21/05/2003AG Postdoc public Postdoc modele « plante virtuelle » France
21/05/2003AG CDI public charge de cours en bioinformatique Belgique
21/05/2003AG Postdoc public Postdoc Etats-Unis
21/05/2003AG CDI public Ingénieur de Recherche en bioinformatique campagne NOEMI France
21/05/2003AG Postdoc public Postdoctoral opportunities in Biological Classification and Etats-Unis
24/04/2003MM Postdoc public Post-Doctorat au CEA Saclay France
24/04/2003AG Postdoc public computational biology/bioinformatics Etats-Unis
18/04/2003AG CDD public Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique France
17/04/2003MM Postdoc prive Cadre de laboratoire - CDD 18 mois - modelisation moléculaire France
17/04/2003AG CDI public INFORMATICIEN CHEF DE PROJET France
15/04/2003AGMM CDI public 2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology Irelande
14/04/2003AG Postdoc public Sanger Institute Postdoctoral Fellowships Grande-Bretagne
14/04/2003AG CDI public Computer Biologist - Metabolic Disease Group Grande-Bretagne
08/04/2003MM CDI prive Computational Chemists Etats-Unis
08/04/2003AG Postdoc public Postdoctoral job opening in Computational Biology Etats-Unis
07/04/2003MM CDI public SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM CDI public SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM Postdoc public POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY Allemagne
07/04/2003MM Postdoc public Post-doctoral Postion in Structural Genomics Etats-Unis
07/04/2003AG Maître de Conférence public Poste d'enseignant-chercheur à l'Ecole des Mines de Paris France
07/04/2003AG CDI public Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot Suisse
07/04/2003AG CDI public RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS Grande-Bretagne
06/04/2003AG Postdoc public bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS France
06/04/2003AG CDI public BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN France
06/04/2003AG CDI public Poste de professeur en génétique & bio-informatique France
06/04/2003AG Postdoc public Stage post-doctoral en génomique végétale France
06/04/2003AG CDD public POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM France
06/04/2003AG CDI public professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques France
06/04/2003AG CDI public 23 postes chargés de recherche INRIA France
06/04/2003AG CDI public professeur de bioinformatique France
06/04/2003AGMM Postdoc public Postdocs CNRS France
06/04/2003AGMM Maître de Conférence public poste de maître de conférences en Bioinformatique France
06/04/2003AGMM Postdoc public Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)
06/04/2003AGMM Postdoc public postdoctoral position, microarray analysis or structural biology France
06/04/2003AG Maître de Conférence public 2 CDD + MDC France
06/04/2003AGMM CDD prive Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline Etats-Unis
28/03/2003AG CDI public Ingénieur de recherche CNRS France
28/03/2003AG CDI public professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière France
28/03/2003AG Postdoc prive Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics France
23/02/2003AG CDI prive Data Analysis Scientist Etats-Unis
21/02/2003AG Stage public stage de bio-informatique France
21/02/2003AG CDI public Scientist--BIOINFORMATICS and MACHINE LEARNING Etats-Unis
21/02/2003AG CDD public Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire France
20/02/2003AGMM Postdoc public Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot Suisse
20/02/2003AGMM Postdoc public Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships Etats-Unis
20/02/2003AGMM Postdoc public Postdoc at the Computational and Molecular Population Genetics lab Suisse
16/02/2003AG ??? public Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute Grande-Bretagne
12/02/2003AGMM Postdoc public Stage postdoctoral Marie Curie : Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation Grande-Bretagne
11/02/2003AG Postdoc prive Bioinformatics scientist Etats-Unis
10/02/2003MM Postdoc public PhD Position, Computational Molecular Biology Canada/Quebec
10/02/2003AGMM Thèse public Research Scholarships Grande-Bretagne
10/02/2003AGMM Postdoc prive Postdoctoral Research Fellowship Grande-Bretagne
06/02/2003AG Postdoc public STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE Canada/Quebec
06/02/2003AG CDI public Chair and lecturers/senior lecturers/readers Grande-Bretagne
06/02/2003AG Postdoc public Plant Genomics Research Unit PostDoc France
06/02/2003AG CDD public annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana France
06/02/2003AGMM CDI public EMBL-BI Group Leaders In BioInformatics Allemagne
06/02/2003AGMM CDD public 10 Bioinformatics/Biostatistics Grande-Bretagne
06/02/2003AGMM CDI prive BIOINFORMATICS Etats-Unis
06/02/2003AGMM CDI prive Sr. Genomics Lab Manager Etats-Unis
05/02/2003AG CDI public GO Curator and Bioinformatics Positions at Rat Genome Database Etats-Unis
05/02/2003AG CDD public Maitre de Conferences en Genomique bacterienne France
05/02/2003AG CDD prive Bio-statisticien/Bio-informaticien chez Pfizer France
29/01/2003MM CDI prive Mathematicien - Modelisation dynamique en biologie France
15/01/2003AG Postdoc public Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques France
02/01/2003AG CDI public Génétique à haut débit chez Arabidopsis thaliana : approche quantitative de la réponse aux contraintes environnementales France
02/01/2003AG CDD public BioInfomaticien stockage et analyse de données France)
02/01/2003AG Postdoc public POSTDOCTORAL POSITION IN BIOINFORMATICS AND GENOME ANALYSIS Belgique
08/12/2002AG Postdoc public Chercheur BioInformaticien France
08/12/2002AG CDI public Maitre de conférence à Polytechnique France
08/12/2002AG CDD public BioInformaticien France
03/12/2002AG Postdoc public Postdoctoral position : Genomique bacterienne France
03/12/2002AGMM Postdoc public post-doc bioinformatique des patrons d'expression France
03/12/2002AGMM CDI prive INGENIEUR COMMERCIAL France
05/11/2002AGMM CDI public Assistant professor positions at the Biozentrum Suisse
26/09/2002AGMM Postdoc public BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN Etats-Unis
23/09/2002AGMM ATER public 2 1/2 postes ATER France
20/09/2002AG Thèse public Genomique et post-genomique d'un lactobacille d'interet industriel France
17/09/2002AG Postdoc public GENOMICS OF RICE SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL DISEASES Etats-Unis
17/09/2002AG CDD prive Ingenieur de Recherche: Genomique fonctionnelle du Développement France
16/09/2002AG Postdoc prive Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc Grande-Bretagne
11/09/2002MM Postdoc public Computational Biology or Bioinformatics Japon
10/09/2002MM Postdoc public Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics Grande-Bretagne
05/09/2002MM Postdoc public Post Doc en bioinformatique aux NIH, Bethesda, USA Maryland, USA
02/09/2002AGMM CDD public Novembre 2002 : Recrutement du Responsable d'une plate-forme R&D en bioinformatique. France
30/08/2002AGMM Thèse public Thèses en data/text mining Suisse
30/08/2002AGMM Thèse public Ph.D. or M.Sc. Studentship in BIOINFORMATICS Manitoba, Canada
29/08/2002AGMM CDI public IR2501 Ingénieur de Recherche - Ingénieur en biologie France
29/08/2002AGMM CDI public IR1601 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications France
29/08/2002AGMM CDI public IE1602 Ingénieur d' Etudes - Ingénieur en développement d'applications France
12/08/2002AGMM Postdoc public Post-doct informatique pour la protéomique France
12/08/2002AGMM CDD public Possibilité d'accueil pour un an à l'Université de Cambridge Grande-Bretagne
07/08/2002MM Postdoc public PostDoc position in Bioinformatics Massachussets
07/08/2002MM Thèse prive Several PhD level openings France
07/08/2002MM CDI prive Modélisateur moléculaire chez L'Oréal France
07/08/2002AG Thèse public Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments France
07/08/2002AG Thèse public Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique France
07/08/2002AG Thèse public Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique. France
07/08/2002AG CDI prive Biostatistician - Fungal Genomics Project Québec, Canada
07/08/2002AGMM CDD public Positions in a Multidisciplinary Team for Bioinformatics Belgique
07/08/2002AGMM CDI prive Bioinformatics Database Administrator Colombie-Britannique, Canada
07/08/2002AGMM Postdoc prive Industrial Post-Doc in Proteomics Ontario, Canada
07/08/2002AG CDI prive Bioinformatician Québec, Canada
06/08/2002MM Thèse public Bourse de thèse fléchée Inter///Bio France
06/08/2002MM Thèse public Contribution à l'annotation structurale du génome de Botrytis cinerea France
06/08/2002MM Thèse public Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory Massachussets, USA
06/08/2002AGMM Thèse public Écoles Doctorales proposant des allocations au titre de la mobilité France
26/07/2002AG CDD public CDD, URGV d'Evry France
26/07/2002AGMM Postdoc public Postdoc Position, Computational and Integrative Bioengineering Washington, USA
25/07/2002AGMM Postdoc public Postdoc, Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle, VT Virginie, USA
24/07/2002MM Thèse public PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry Grande-Bretagne
24/07/2002AG Postdoc public Research Assistant/Fellow Grande-Bretagne
18/07/2002MM Postdoc public Enzyme Function And Reaction Mechanisms: Computational Studies Ohio, USA
17/07/2002MM Postdoc public Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization France
17/07/2002AG Postdoc public Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis Danemark
15/07/2002AG CDI prive Chef de projet Progiciels en Biotechnologies végétales France
15/07/2002AGMM Thèse public Thèse avec allocation MENRT - "Sélection et caractérisation de peptides inhibiteurs de biocatalyseurs" France
15/07/2002AGMM Postdoc public Postdoctoral Research Fellowships Suisse
15/07/2002AGMM ??? prive Two Bioinformatics Support Specialists Suisse
14/06/2002AG CDI public Postdoctoral and Research Assistant Positions Québec, Canada
14/06/2002AGMM Thèse public Thèse sur la génétique du cheval: Modélisation des schémas de sélection dans l'élevage du cheval français France
07/06/2002AG CDI prive Bioinformatic Position at The Nestle research center Suisse
06/06/2002AGMM CDD public Ingenieur-expert Bioinformaticien France
04/06/2002AGMM CDI public Correspondant informatique et "Data manager" France
11/02/2002MM CDI prive Professor/Reader/Senior Lecturer/Lecturer in Structural Biology and Bioinformatics Grande-Bretagne
11/02/2002AG CDI public Analyst for the analysis of gene expression data Grande-Bretagne
11/02/2002AG Postdoc public Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA Grande-Bretagne
07/02/2002AG CDI public FULL-TIME POSITION - Ithaca, NY Database specialist New York, USA
07/02/2002AG Postdoc public role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease Grande-Bretagne
07/02/2002AG CDI public Head of Bioinformatics Applications Grande-Bretagne
07/02/2002AG Postdoc public Position post doctorale en data mining France
07/02/2002AG CDD public Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression France
07/02/2002AG CDI prive Bioinformatics Scientist Singapoure
07/02/2002AG CDD prive Bioinformaticien France
07/02/2002AGMM Postdoc public 1 LECTURESHIP Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford Grande-Bretagne
07/02/2002AGMM Postdoc public PhD / Postdoc Positions, European Project: HaeMOdel ?
07/02/2002AGMM CDI public Informatics Scientist (Collaborator Liaison) Grande-Bretagne
07/02/2002AGMM Postdoc public Associate Professorship/Senior Lecturer/Lecturer Afrique du Sud
03/07/2001MM ATER public ATER Physico-Chimie moléculaire et cellulaire au Muséum National d'Histoire Naturelle France
01/07/2001MM Postdoc prive ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire France
01/07/2001MM CDI prive Researcher – Protein structure modelling NAUTILUS BIOTECH France
01/07/2001AG CDD public 1 or 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst Belgique
01/07/2001AG Postdoc public A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project France
01/07/2001AG ??? prive ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique France
01/07/2001AG ??? prive CELOGOS, Société de Biotechnologie, recherche France
01/07/2000MM CDI prive Software Developers à Gentech (Sophia antipolis) France
01/07/2000AG Thèse public allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive France
01/07/2000AG CDD public CDD ingenieur en bioinformatique Duree : 2 ans Localisation : LIRMM-CNRS a Montpellier. France
01/07/2000AG CDD public CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg France
01/07/2000AG CDI public Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand France
01/07/2000AG CDI public Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY France
01/07/2000AG Thèse public Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse France
01/07/2000AG CDD public Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an) France
01/07/2000AG CDD public 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst Belgique
01/07/2000AG CDD public CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) France
01/07/2000AG CDI prive Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA. Manitoba, Canada
01/07/2000AG CDI prive Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project USA
01/07/2000AG CDI prive PERL/UNIX Developer (chip design) Rosetta Inpharmatics (USA) USA
01/07/2000AG CDI prive Bioinformatics Applications Developer France
01/07/2000AG CDD prive projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir France
01/07/2000AGMM Thèse public Appel à candidature : bourse de thèse France
01/07/2000AGMM Thèse prive ASSISTANT DE RECHERCHE CLINIQUE Paris
11/07/2017[MM]iZI88cd5jkHd
Source:7nXX3drNk
Date de parution:11/07/2017Date limite de réponse:?
Lieu:QAX8nAnCqzDs (fxORIcdvJ)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Gee whiz, and I thhuogt this would be hard to find out.
Contacts:Gee whiz, and I thhuogt this would be hard to find out.

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27/06/2007[MM]amour
Source:officiel
Date de parution:27/06/2007Date limite de réponse:15/09/2007
Lieu:rennes (france)Statut:StageSecteur:prive
Description de l'annonce:
chereche personne pouvons m'apprendre à faire l'amour
Contacts:bystere@yahoo.fr

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21/11/2006[AG]PhD studentship in Bioinformatics
Source:
Date de parution:21/11/2006Date limite de réponse:01/12/2006
Lieu:Londres (Angleterre, Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
PhD studentship in Bioinformatics

"Bio-Communication Theory for Genetically influenced Chronic Diseases"
Most diseases are influenced by genetic factors such as Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The aim of this project is firstly to express gene mutation as a digital communication problem (Bio-Communication model) and secondly to apply communication theory to detect SNPs which are likely to predispose people to chronic diseases.

Please note that this position is only open to European Union citizens.

Closing Date: November 30th 2006

For more information:

http://cism.kingston.ac.uk/research/phd-studentship-vacancies/bio-communication-theory-for-genetically-influenced-chronic-diseases_phd-university.htm

Contacts:j.nebel@kingston.ac.uk

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31/10/2006[AG]broadcasting
Source:
Date de parution:31/10/2006Date limite de réponse:?
Lieu: (Ontario)Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
Centre de Recherche expérimental pour la réalisation de Home vidéo et de reality scientifiques en.ligne et de la télévision visé à découvrir des nouvelles stratégies d’amélioration de la vie, sélectionne des deux sexes 18 à 65 ans motivés, ambitieux et dynamiques. Les test de sélections se feront en ligne et sont programmés avec des techniques innovants. Le Centre offre formation, et possibilité de carrière. Envoyer CV de préférence avec photo a : broadcasting@themadivita.com
Contacts:via monte di Dio

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30/06/2005[AG]Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites
Source:Institut Pasteur-Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire
Date de parution:30/06/2005Date limite de réponse:?
Lieu:Institut Pasteur Paris (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.
Pièce Jointe : postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)
Contacts:Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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01/06/2005[AGMM]Postdoc Bioinformatics
Source:Atragene Bioinformatics
Date de parution:01/06/2005Date limite de réponse:30/06/2005
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Stage Post-Doctoral en Bio-Informatique

ATRAGENE BIOINFORMATICS est une société spécialisée dans la mise en place de plate-formes de découverte in silico pour la recherche bio-pharmaceutique. Basées sur une technologie propriétaire, nos plate-formes permettent d’intégrer intuitivement les principales bases de données et un grand nombre d’applications métier de bio-informatique, de chemo-informatique et de modélisation moléculaire. Notre société est implantée depuis janvier 2003 sur le bioparc Genopole® à Evry (Essonne) à 30 Km au Sud de Paris.

Dans le cadre du développement de notre société, nous proposons un stage post-doctoral d'une durée de 12 mois, reconductible un an. Sous la direction du responsable de notre département BioIT, le candidat participera au développement d’une méthodologie d’analyse des régions régulatrices dans les promoteurs humains.

Le candidat possèdera un doctorat en bio-informatique complété par un stage post-doctoral à l'étranger. Il aura une forte expérience dans le domaine de l'analyse de séquences et en programmation en langage script (perl, python, php5). Une expérience en génomique (puces à ADN, génomique comparative) serait un plus.

Evoluant dans l’environnement dynamique des sociétés de biotechnologies, le candidat devra présenter de bonnes capacités d'adaptation, d'innovation et de communication. Compte tenu des perspectives de développement de notre société, ce poste est évolutif.
Contacts:Pour candidater à ce poste, envoyez votre CV et une lettre de motivation à recrutement@atragene.com en mentionnant la référence : RH/050523/AM/1002

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29/11/2004[AG]
Source:
Date de parution:29/11/2004Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Contacts:adresse

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29/11/2004[AG]
Source:
Date de parution:29/11/2004Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Pièce Jointe : 16.jpg (58 ko)
Contacts:adresse

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22/07/2004[AG]physic, byophysic, single molecule
Source:
Date de parution:22/04/2004Date limite de réponse:?
Lieu: (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
corps de l annonce
Contacts:adresse

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06/11/2003[AGMM]Database BIOINFORMATICS PROGRAMMER/ANALYST
Source:
Date de parution:06/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evanston (Illinois) (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Center for Functional Genomics - Northwestern University - Evanston, Illinois

PROJECT DESCRIPTION:
Join our development team of five people developing two web-based applications. MouseDB, an internal site, provides workflow and data management for a large mouse mutagenesis project here at the Center for Functional Genomics (CFG). The other site, http://neuromice.org, is a virtual storefront to offer the wider research community the mutant lines developed at the CFG and two other mutagenesis centers. General information about the groups involved is available at http://neuromice.org.

Neuromice is a Java webapp, developed using Apache Struts. MouseDB is a hybrid of (mostly) ColdFusion and Java. We use JUnit and an in-house product (ColdUnit on SourceForge) for automated unit testing, CruiseControl and Ant for our continuous integration automated build process, CVS for source code control, ColdFusion MX Professional Edition as our ColdFusion server, Tomcat as our servlet container, Oracle for our database, and FitNesse for automated functional testing. Future plans may include JBoss and/or Hibernate.

Salary is competitive, and Northwestern University offers great benefits beyond the usual health insurance and retirement plan, including tuition reimbursement, access to University libraries and other resources, and the surroundings of a University community.

In addition, the CFG bioinformatics team strives to be a fun and
supportive environment. We are serious about our software practices, and enjoy learning about the biology that our software supports.

ACTIVITIES:
- Writing and unit testing application code in Java and ColdFusion
- Oracle database design
- Working closely with team members and users

QUALIFICATIONS:
- Working knowledge of Java
- Strong web programming experience
- Strong SQL skills (preferably Oracle)
- Good communication skills
- Team-focused, goal-oriented nature

Plusses:
- Automated unit testing experience (JUnit or other)
- Experience writing Ant scripts, administering CruiseControl
- Strong Java web programming experience
- Unix experience
- Matlab experience
- Technical mentoring experience
- Background in biology, genetics

CONDITIONS:
This position is currently tied to NIH funding through the Center for Functional Genomics and is dependent on continued extramural funding.

We are looking to fill this position starting as early as November 10th, and will continue looking until we find the right person.
Contacts:HOW TO APPLY:
Please contact Moses Hohman, IT Project Manager and Associate Director of
Bioinformatics for the CFG, at mmhohman@northwestern.edu

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05/11/2003[MM]Molecular Modeler
Source:Bioinformatiocs.Org
Date de parution:05/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
I am assisting to recruit Molecular Modeler for a client's Drug Discovery Applications Group in New York City. Here is more information:

This client is a technology leader specializing in computational methods for drug discovery and development. Benefits include medical, dental, 401(k), flexible spending account, 3+ weeks vacation, stock options, and tuition reimbursement. Visa sponsorship and/or relocation are available.

The successful candidate will become part of a multidisciplinary drug discovery team working on both in-house efforts to improve and apply drug discovery methodologies and on collaborative projects with pharmaceutical/biotechnology partners.

JOB DESCRIPTION:
Actively participate in Drug Discovery Applications Group projects
Apply drug discovery software and perform analysis of the results
Effectively communicate results to other members of the Group
Work closely with the Development Team to test and improve Drug Discovery technologies

QUALIFICATIONS:
Ph.D. in computational chemistry, organic chemistry, or biochemistry
Computational experience in at least 1 of the following areas: molecular modeling, structure-based drug design, virtual ligand screening, computationally-driven lead optimization, ligand-based design, or homology modeling
Excellent verbal and written communication skills
Ability to work independently

SKILLS:
Programming skills: Perl script writing, in particular
Experience with chemical databases
Contacts:HOW TO APPLY:
For consideration, please send CV including publications, thesis topic, and advisor to resumes@workwondersstaffing.net

This client is an Equal Opportunity Employer.

[Please reference Bioinformatiocs.Org when replying to this announcement.]

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05/11/2003[AG]Assistant/Associate PROFESSOR
Source:bioinformatics.org
Date de parution:05/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
The Department of Biological Sciences, St. John's University, New York, New York is seeking candidates for a tenure track assistant or associate professor position. The successful candidate will have postdoctoral experience in bioinformatics/proteomics/genomics, the potential to develop a funded research program, and the ability to offer graduate and undergraduate courses in his/her speciality.
Contacts:Interested candidates should send their CV, 3 letters of recommendation and a statement of research and teaching interests to:
Jay A. Zimmerman, Ph.D.
Chair
Department of Biological Sciences
St. John's University
Jamaica, NY 11439
or email to
zimmermj@stjohns.edu

St. John's University is an equal opportunity employer, and inquiry from women and underrepresented minority applicants is encouraged.

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2208

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05/11/2003[AG]Senior Bioinformatics Positon at the FMI
Source:http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2206
Date de parution:05/11/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bale (Suisse)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
BACKGROUND:
Tired of the poor funding in academia or the lack of freedom in a company? Want your own office?

We are looking for an enthusiastic person with several years experience in bioinformatics. Extensive experience in sequence analysis, data mining/data integration and genome analysis is required. A good knowledge of UNIX, database programming and shell scripting is a plus. Candidates with a PhD are encouraged to apply but a masters together with several years of practical experience will also be considered. In addition to their support and development commitments the successful candidate will be encouraged to attend international bioinformatics conferences and to have the initiative to develop their own research projects in the field of bioinformatics.

The FMI (www.fmi.ch), which is funded by the Novartis Research Foundation, is an International Institute with over 280 people of which approximately are 150 postdoctoral fellows and graduate students committed to basic research in areas as diverse as cellular growth control, epigenetic gene
regulation and neurobiology. The FMI offers highly competitive academic salaries and it provides state-of-the-art core technologies, transgenic mouse facilities, computing, genomice, and proteomics services.

The FMI is located in Basel, a city offering an outstanding scientific environment in the center of Europe.

JOB DESCRIPTION:
* Help and support: data mining, sequence comparisons, sequence alignment, BLASTs, individual projects with groups, etc.

* Teaching: Teaching of classes in bioinformatics

* Development: Evaluation of new tools and software, development of bioinformatics tools. Making tools accessible to users at (on www, central servers, ...)

* Databases: Maintenance of existing in-house databases (such as genbank,SWISS-PROT, etc.)

* Interface and collaborate with outside institutions: Interact with commercial and academic bioinformaticians in developing and sharing bioinformatic resources.
Contacts:HOW TO APPLY:
Please submit your resume or questions to dean.flanders@fmi.ch.

http://www.fmi.ch

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05/11/2003[AG]Stage Post-Doctoral en Bioinformatique/Bio-Statistique
Source:ABG-8115
Date de parution:20/10/2003Date limite de réponse:20/12/2003
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 20/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 20/12/2003

ATRAGENE BIOINFORMATICS est une jeune societe de biotechnologies en pleine expansion implantee sur le bioparc Genopole a Evry (Essonne).

Accompagnant les evolutions rapides de la genomique et de la post-genomique, nous editons et commercialisons des outils innovants pour aller plus loin dans le processus d'analyse et accelerer les decouvertes des entreprises de biotechnologies, des groupes pharmaceutiques et des laboratoires academiques.

Nous recherchons actuellement un candidat pour un stage post-doctoral d'une duree de 12 mois, reconductible un an. Le candidat participera au developpement et a l'optimisation d'algorithmes dans le domaine de la recherche de motifs communs dans des sequences nucleiques.

Le candidat possedera un doctorat en bio-informatique ou en bio-statistique complete obligatoirement par un stage post-doctoral a l'etranger. Il aura une forte experience dans le domaine de l'analyse de sequences. Le candidat montrera de solides competences dans le domaine de la genomique. Des notions en programmation C et perl seraient appreciees.

Evoluant dans l'environnement dynamique des start-up de biotechnologies, le candidat devra presenter de bonnes capacites d'adaptation, d'innovation et de communication. Compte tenu des perspectives de developpement de notre societe, ce poste est evolutif.
Contacts:Vous etes interesse par ce poste, envoyez votre candidature a recrutement@atragene.com en mentionnant la reference : RH/031016/GB/1002

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et d'indiquer non seulement la reference de l'employeur mais aussi la reference ABG de cette offre.

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21/10/2003[AG]Post-doctoral positions BIOINFORMATICS
Source:BioJobs
Date de parution:14/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Two post-doctoral positions are available to work in bioinformatics and computational biology in Weill Cornell Medical College (New York City). Successful applicants will contribute to the design and development of SigPath, an information management system to support quantitative studies of signaling pathways and networks (http://www.sigpath.org). This project is a multi-disciplinary collaboration between laboratories at Weill Cornell Medical College and Mount Sinai School of Medicine. Candidates should demonstrate strong computational skills (UNIX, detailed knowledge of at least one significant programming language, Java preferred). Preference will be given to candidates who can also demonstrate a good background in biology or chemistry.

Software development and engineering skills, web-based technology, XML and database experience are a plus but can be learned as part of the post-doctoral training offered with this position. Each successful applicant will work in the multidisciplinary and advanced computational environment of the Institute for Computational Biomedicine (http://icb.med.cornell.edu).

Areas of scientific interest include: development of novel data representations for pathway information, information extraction from the literature, visualization and navigation of pathway information, quantitative models and simulation results.
Contacts:Please address resume and two letters of reference to Dr. Fabien Campagne (mailto:icb-jobs@med.cornell.edu).

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21/10/2003[AG]Bioinformatics Research Scientist
Source:ABG-8094
Date de parution:08/10/2003Date limite de réponse:07/12/2003
Lieu:Johnston (Iowa) (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Position Purpose :
To implement, validate, and customize statistical methods for analyzing functional genomic experiments.

Duties/Responsibilities :
This person will be responsible for identifying, implementing, and validating statistical and data mining methods for designing and analyzing gene expression profiling experiments. This person should also be capable of customizing or extending previously-published methods when needed. This person will lead an effort to integrate gene expression results into biological networks. In addition to these roles, the successful candidate will be able to contribute to other bioinformatics projects requiring statistical analysis.

Educational Qualifications Desired :
Ph.D. in Statistics or closely-related field; post-doctoral experience is desirable.

Competencies and Experience Desired :
The ideal candidate will have a proven track record of application and/or development of innovating data mining algorithms to the analysis of large-scale expression profile data.

Rather than specializing in one particular technique, the candidate will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. He/She will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the analysis of gene expression data.

Excellent computational skills with the ability to work in a UNIX-based environment is expected.

Familiarity with statistical software is expected and a strong preference will be given to those applicants with expertise in either Splus or R.

This position requires a self-motivated scientist who works well in a team environment, communicates clearly and effectively, and creatively and independently solves problems.

Reports To :
Computational Biologist

Department :
Information Management - Bioinformatics and Exploratory Research

Contacts:There are two ways to submit a resume for this position :

You must reference the job code PHI/QA323/WCP in your cover letter or the subject line of your email.

Pioneer employees must apply through PHIweb.

- Send your resume and cover letter in an email message (Attachments should be in Word, WordPerfect, Lotus, or ASCII format.) to : apply@pioneerjobs.com

- Mail your scannable resume and cover letter to the following address :
Resume Processing Center
Pioneer Hi-Bred International, Inc.
400 Locust Street, Suite 700
P.O. Box 14454
Des Moines, IA 50306-3454

Resumes will be accepted until the position is filled.

For general inquiries regarding employment, contact jobs@pioneer.com or call the Pioneer Hi-Bred Employment Job Line number at 515-270-4000 or 1-800-247-6803 ext. 4000.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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21/10/2003[AGMM]BIOINFORMATICS Scientist
Source:
Date de parution:21/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Singapore (Singapour)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Our client is the national flagship initiative in the genomic sciences for Singapore as the country seeks to be an international center for the biomedical sciences and its relevant industrial research and development. In this research institute, the major technical platforms of high throughput
sequencing, genotyping, cDNA library production, bioinformatics, proteomics and expression array technologies have been established and programs in stem cell biology, molecular pharmacology, cancer biology, comparative genomics,
computational biology and population genetics have begun.

BIOINFORMATICS SCIENTIST
Senior level Bioinformatics Scientists are needed who will identify, design, develop and apply advanced computational analyses to biological research throughout the institute. Successful candidates will work closely with investigators in the Biological Investigations, Disease Gene Discovery, Gene
Expression Microarrays, and Population Genetics groups. Outstanding candidates will have a Ph.D. and extensive training in bioinformatics, computational biology, mathematical sciences, or a related field. A research background in molecular or cell biology is advantageous. You must be able to
work in a fast-paced and dynamic environment. Previous experience in managing bioinformatics scientists and projects is required. We are seeking candidates with expertise in one or more of the following areas:

a.. Protein database analysis
b.. Mathematical modelling of protein and gene functions
c.. Statistical analysis and modelling applied to genomic data
d.. Advanced transcript sequence analysis
Contacts:Interested candidates, please forward your detailed resume in MS Word format to: search@scientecsearch.com

ScienTec Search (www.scientecpersonnel.com)
No. 5 Shenton Way
#37-02 UIC Building
Singapore 068808

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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09/10/2003[AG]2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)
Source:ABGe-1249
Date de parution:19/09/2003Date limite de réponse:18/10/2003
Lieu:Laval (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 19/09/2003
Date de fin de diffusion prevue : 18/10/2003

Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique/bio-statistique sont presentement a combler, a l'UNIVERSITE LAVAL (Quebec) au sein d'un projet multi institutionnel, finance par Genome Quebec pour une periode de deux ans. Le travail vise le developpement de methodes d'analyse pertinente a l'expression de genes a grande echelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration etroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des biostatisticiens et des informaticiens.

Position 1.Traitement des donnees de microarray et analyse de designs experimentaux complexes.
Des developpements importants ont ete recemment acquis en analyse statistique des microarrays, toutefois ces progres ont ete principalement appliques a des comparaisons simples. Deux themes principaux seront abordes dans cette partie du projet : la correction de biais dans l'analyse des donnees quantitatives de microarrays et les methodes statistiques pour l'analyse dispositif experimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le developpement de modele pour quantifier le biais experimental ; l'evaluation et l'amelioration des procedures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l'analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l'evaluation de la pertinence et des limites de differentes methodes statistiques ; la modification novatrice des methodes existantes pour les rendre mieux adaptees aux donnees obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d'un projet de genomique fonctionnel situe dans un pavillon de recherche en sciences de la vie.

Qualifications : Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la sante, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise developpee en statistiques. Une comprehension des principes de l'expression des genes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l'experience dans les domaines suivants : connaissance de langages de programmation, manipulation de grands fichiers de donnees, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacites de communications en Anglais ou en Francais sont essentielles.

Position 2. Integration des donnees d'expressions geniques
Le projet consiste a developper des techniques d'analyses concernant deux types d'integration: 1-Integration de donnees provenant de differentes techniques de mesures d'expression genique; 2- Integration des fonctions des genes a leurs profils d'expressions. Ce projet consiste d'abord a integrer les donnees produites par les trois differentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression) et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiees sur les fonctions des genes ainsi que leurs roles dans les differents sentiers, metaboliques ou de signalisations, devront etre integrees aux profils d'expressions geniques.

Qualifications : Un Ph.D en biologie moleculaire ou fonctionnelle ou equivalent avec une tres bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne experience en programmation, en bases de donnees relationnelles et en extraction d'informations des bases de donnees publiques.
Contacts:Pour postuler, soumettre :
- une lettre de presentation
- un curriculum vitae a jour
- IMPORTANT : les noms et coordonnees de trois personnes references

- Transmettre par courriel en un seul document attache (format Word ou PDF) a genome.foret@rsvs.ulaval.ca
- Le nom du candidat doit etre donne au titre du fichier, ou l'inserer dans le texte du courriel.
- Inscrire le numero de position dans la ligne sujet du message.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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09/10/2003[AG]CDD Math-Info
Source:
Date de parution:09/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Développement de méthodes mathématiques de traitement automatique de données de PCR quantitative pour le diagnostic (traitement du signal, modélisation).

Ce travail s’insère dans un projet de recherche-développement en relation avec une entreprise du domaine privé.

Le candidat devra faire preuve d’une bonne autonomie dans la mise en place des solutions mathématique proposées et sera en lien étroit avec des experts du domaine et les concepteurs de l’appareillage.

Le poste proposé sera localisé dans un laboratoire académique mais avec un statut salarié du privé.

Lieu :
CNRS UMR 5160
Equipe Bioinformatique
Montpellier
Contacts:Contact :
Franck Molina
Tel: +33/0 467 548 603 ; Fax: +33/0 467 548 610
franck.molina@ibph.pharma.univ-montp1.fr

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09/10/2003[AG]BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
Source:
Date de parution:19/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Bioinformatics Software Engineer opening

At Perlegen Sciences, we conduct genetics research and develop products that impact and improve people's lives. Established in March 2001, we are a well-funded, pre-IPO company aggressively developing our core competencies in research, genome scanning, bioinformatics, and other key areas of our business. We invite you to consider our team as we apply this technology to bring focus to biological research and to accelerate the discovery of drugs and diagnostics.

We currently have an excellent opportunity for a Bioinformatics Software Engineer to aid in the analysis and preparation of sequence and primers, as well as to assist colleagues in issues related to these design elements. We'll rely on you to analyze and design genetic sequence and primers for our association studies, place Perlegen's data in new contexts, make resulting information easily accessible, and quickly respond to questions about Perlegen's SNPs and assays in relation to the human genome. You will also examine past primer performance and make
recommendations for design process improvements. To qualify, you must be a team player who is both meticulous and insightful. You should have a BS in CS/EE or equivalent with a strong genetics/molecular biology background and/or a BS in Biology with a very strong computational background. Excellent Perl, SQL, analytical and communication skills, the ability to work in both Windows and Linux environments, proven ability to find and refine relationships between and within data-sets,
and proficiency manipulating and dissecting large data collections are essential. Two or more years of bioinformatics development experience preferred. Strong PL/SQL, Access and VB skills as well as competency with statistics would be a plus.
Contacts:Email your resume, indicating Job Code GN78, to
perlegen_HR@perlegen.com; mail, again indicating Job Code GN78, to Perlegen Sciences, 2021 Stierlin Court, Mountain View, CA 94043; or fax to 650-625-4580. For more information on this position and other opportunities, visit our website at www.perlegen.com. EOE.

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09/10/2003[AG]2 CDD Ingenieur d'etudes
Source:
Date de parution:09/10/2003Date limite de réponse:21/10/2003
Lieu:Paris (France)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Nous recherchons 2 à pourvoir 2 CDD sur la période Janvier-Juin 2003.

Niveau: Ingenieur d'etudes

Description du poste:

Vous participerez au developpement d'un serveur Web dedie à la
Bioinformatique structurale, localisé à Paris (Jussieu).
Vous participerez à la conception de l'arborescence des services.
Votre tache consistera a mettre a disposition de nouveaux services sur le Web, (interfacer des programmes existants), les documenter, et a organiser le chaînage des programmes existants sur le serveur.

Compétences souhaitées:
Vous avez une connaissance des problématiques de la
bioinformatique structurale, ou ces problématiques vous intéressent et vous etes dynamique et curieux.
Vous avez une bonne compétence en informatique:
Connaissance du système UNIX (Linux)
Aspects Web: HMTL, CGI, (PHP, mySQL), perl
Aspects generaux: C, Fortran (au moins pour pourvoir adapter des programmes existants si nécessaire)
La connaissance du langage Python est un réel plus.

Postes à pourvoir pour 6 mois à partir de Janvier 2004.
Rémunération au niveau ingénieur d'études selon les grilles INSERM.

Attention: cloture des candidatures pour le 21 Octobre, l'audition des candidats sélectionnés aura lieu le Mercredi 22 après midi.
Contacts:Contact: Pierre Tuffery
tuffery@urbb.jussieu.fr
(01 44 27 77 33)


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09/10/2003[AG]motif discovery algorithm/statistics
Source:BioInfo
Date de parution:09/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
We have an immediate open position for a postdoc working on motif discovery algorithm/statistics. If you or someone you know are interested, please contact me asap.
Contacts:Michael Q. Zhang, Ph.D.
Professor
Cold Spring Harbor Lab
1 Bungtown Road
Cold Spring Harbor, NY 11724.
USA
Tel:1-516-367-8393
Fax:1-516-367-8461
http://www.cshl.edu/mzhanglab/
Secretary: Ms. Carol Marcincuk (1-516-367-8387, marcincu@cshl.edu)

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05/10/2003[AGMM]Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics
Source:dmanet
Date de parution:05/10/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Los Angeles (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
A post-doctoral research associate position in computational
biology/bioinformatics is available immediately within the Computational Biology program at the University of Southern California (USC), Los Angeles.

Topics of research fall under computational functional genomics. In particular:
- Studying the structure, function, and evolution of cellular interaction/regulatory networks
- Developing computational and statistical algorithms to analyze microarray expression data
- Predicting gene/protein function through data integration

Candidate Qualification:
- Recent Ph.D. in biological science, computer science, or statistics
- Research experiences in bioinformatics or related fields
- Good programming skill
- Experience in machine learning or pattern recognition is a plus

More information about the interdisciplinary program in
computational biology at USC can be found at http://www-hto.usc.edu/
Contacts:Please send CV with contact addresses of 2 references to:

Xianghong Jasmine Zhou, Assistant Professor
Program in Molecular and Computational Biology
Department of Biological Sciences, DRB291
University of Southern California
Los Angeles, CA 90089-1340
Email: xjzhou@usc.edu (preferred)
Phone:(213) 740 7055
Fax:(213) 740 2437
http://www-hto.usc.edu/~xjzhou

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18/09/2003[AG]three PhD positions in Bioinformatics
Source:
Date de parution:04/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Callaghan (Australie)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
1431 (Evolutionary Algorithms and Optimization Methods
for large-scale problems in Bioinformatics),

1432 (Algorithmic approaches for problems in Proteomics,
Molecular Modelling and Drug Design)

1433 (Novel Statistical and Optimization Methods for the Life Sciences).

These numbers correspond to the entries in the Jason Postgraduate
Scholarship Database for Australia:

http://www.jason.unimelb.edu.au

where the complete information can be retrieved. Please follow the link and the procedures described in the Jason
database.

In addition, the University offers other Scholarships

http://www.newcastle.edu.au/study/scholarships/index.html

which may relate to other Bioinformatics ongoing projects at Newcastle.
These other scholarships may suit International Students and have a closer deadline in some cases.

More information about the Newcastle
Bioinformatics Initiative is available from the web site at:

http://www.cs.newcastle.edu.au/~nbi

As you can probably see from the scholarships announcements,
we are interested in people who have already some expertise
in algorithmic engineering and in solving large optimization
problems with combinatorial optimization methods, metaheuristics and exact techniques.
Contacts:Dr. Pablo Moscato
Newcastle Bioinformatics Initiative - Director
Postgraduate Director for Computer Science
School of Electrical Engineering and Computer Science
The University of Newcastle, Callaghan, 2308, NSW
AUSTRALIA
moscato@cs.newcastle.edu.au
Phone : +61 2 4921 6056
Fax: +61-2-4921-6929

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18/09/2003[AG]Post-doctoral position in microarray data analysis
Source:
Date de parution:18/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bâle (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
We seek a highly motivated and enthusiastic scientist who is interested in cutting-edge genomics and bioinformatics approaches that include large-scale expression profiling and genome wide identification of protein-DNA interactions in the field of meiosis, gametogenesis and germline development. Our lab operates a high density oligonucleotide microarray platform that enables researchers interested in statistical and clustering aspects of microarray data analysis to work with very
large and very well documented data sets.

We are a member of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), a
prestigious association of laboratories that work in the field of
computational biology. The Biozentrum and the SIB provide an excellent wet lab and IT infrastructure, full support for the recently established Department of Bioinformatics and a highly stimulating, international academic environment.

Candidates should be familiar with statistics of microarray data
analysis, statistical languages and environments (R, S+), programming languages (PHP, Perl), database management systems (Oracle, MySQL), and be comfortable in a Linux development environment.
Contacts:Please send your CV and the names of two references to
Prof. Michael Primig
Department of Bioinformatics
Biozentrum, University of Basel &
the Swiss Institute of Bioinformatics
Klingelbergstrasse 50/70
CH-4056 Basel / Switzerland

Phone Office: +41 61 267 20 98
Phone IT-Office: +41 61 267 15 78
Fax: +41 61 267 33 98
http://www.bioz.unibas.ch/primig
http://www.isb-sib.ch
http://www.bioz.unibas.ch/corelab
http://www.germonline.org

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09/09/2003[MM]BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist
Source:BioJobs
Date de parution:09/09/2003Date limite de réponse:?
Lieu: (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Responsibilities: Join GE's research in molecular imaging as a
Bioinformatics Scientist, working with world-class experts in imaging physics, molecular biology, and medicinal chemistry, developing the next generation of molecular diagnostics. We need experts in bioinformatics analysis of protein pathways and gene expression to develop tools and techniques for discovering molecular imaging targets and apply these techniques to the study of specific diseases. Projects will involve developing platform technologies for integrating many disparate types of
public and proprietary genomic and proteomic data along with analysis methods to elucidate pathways and identify molecular imaging targets.
Collaborate with GE’s luminary academic and commercial scientific
partners both to develop next generation diagnostic products and to publish research results.
Requirements: Candidates need to have either a PhD in bioinformatics or computational biology, or degrees in both biological and computational sciences, with one being at the PhD level.
·Knowledge of molecular disease mechanisms and pathways.
·Knowledge of genomics and analysis of DNA microarray data.
·Mathematical and computer science background.
·Published work in the bioinformatics field.
·Excellent communication skills (verbal, written, presentation).
·Ability to work effectively in teams.
Demonstrated experience in one or more of the following areas would also be highly desirable:
·Experience in building computational models of biological phenomena.
·Experience in statistical analysis of biological data.
·Experience with microarray tools and algorithms, knowledgeable about their limitations and research areas. ·Experience building
bioinformatics databases and software tools.
Desired: ·Experience in pharmaceutical or biotech industry.
·Experience as Principal Investigator on funded research grants.
·Leadership / coordination ability.

We offer a competitive salary, outstanding benefits package and the professional advantages of an environment that supports your development and recognizes your achievements.
Contacts:To apply to this position, please click on this link.
https://www.research.ge.com/eHire
Please enter GECRD/319910/WB2273 in the job reference code field.

An Equal Opportunity Employer.

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03/09/2003[AG]poste d'ingénieur d'étude génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle
Source:
Date de parution:29/08/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
L'INRA ouvre un poste d'ingénieur d'étude au sein de l'équipe génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle (Paris, 5°).

Cette équipe, dirigée par J.-J. Daudin et S. Robin, est composée de 6 chercheurs, enseignants-chercheurs et doctorants en statistiques travaillant sur des applications à
- l'analyse des séquences,
- l'analyse des données issues de biopuces (puces à ADN).
Le titulaire de ce poste travaillerait essentiellement sur le 2ème point. Le profil de poste est accessible à l'adresse

http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/profils/ie6002.htm

Contacts:Les informations pratique liées au concours sont accessibles sur le serveur de l'INRA à l'adresse
http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/index.htm.

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03/09/2003[AGMM]BIOINFORMATICS TEACHING POSTDOCTORAL FELLOW
Source:BioJobs
Date de parution:03/09/2003Date limite de réponse:01/11/2003
Lieu:Worcester (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
College of the Holy Cross seeks a Ph.D. to fill a two-year position for a Teaching Postdoctoral Fellow in the Department of Biology (http://www.holycross.edu/departments/biology/website/index.html). The successful candidate will teach three courses each year under the mentorship of Prof. Mary Lee Ledbetter. One course will be in the area of Bioinformatics, aimed at students of both Biology and Computer Science; at least one other will be directed toward non-science majors.
The rest of the appointment involves research with Prof. Ledbetter and undergraduate students on an NSF-supported project on microarray studies of cell communication. The position begins in the summer of 2004; at its conclusion the Fellow will be well qualified to assume an independent faculty position as a Teacher/Scholar in a liberal arts environment.
Contacts:Please send applications, consisting of curriculum vitae,
transcripts, selected publications, research and teaching statements,
and letters from three r
eferees to
Dr. Mary Lee S. Ledbetter
Department of Biology
College of the Holy Cross
Worcester, MA 01610
before November 1, 2003. The College is an Equal Opportunity Employer and complies with all Federal and Massachusetts laws concerning Equal Opportunity and Affirmative Action in the workplace.

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11/08/2003[AG]RESEARCH POSITION
Source:
Date de parution:02/08/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Montreal (Canada/Quebec)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
Comparative and Evolutionary Genomics/Bioinformatics.
Faculty Position, Canadian Institute for Advanced Research

The Department of Biochemistry at the Faculty of Medicine
invites applicants for a faculty position at the Assistant Research Professor level in the areas of Comparative and Evolutionary Genomics, and Bioinformatics. This position implies a prestigious Scholar appointment in the Evolutionary Biology Program of the Canadian Institute for Advanced Research (CIAR). The successful candidate will have demonstrated excellence in the field of bio- informatics and/or genomics. Preference will be given to candidates with experience in evolutionary biology. He or she is expected to establish an innovative research program, and participate in teaching at both the undergraduate and graduate levels. Salary and startup funds will be commensurable with qualifications and experience, and successful candidates will be eligible for considerable infrastructural support through the Canada Foundation for Innovation.
Contacts:jobs@bch.umontreal.ca

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03/08/2003[MM]Postdoctoral position in Bio-Geometry
Source:
Date de parution:15/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Sophia-Antipolis (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Two of the most prominent challenges of the the post-genomic era are to understand the molecular machinery of the cell and to develop new drug design strategies. These key challenges require the determination, understanding and exploitation of the three-dimensional structure of several classes of molecules ---nucleic acids, proteins, drugs---, as well as the elucidation of the interaction mechanisms between these molecules. Most importantly, these challenges involve aspects from biology, chemistry, physics, mathematics and computer science.

Building upon a long and recognized experience in Computational
Geometry and applications, the Geometrica group (formerly Prisme)
(http://www-sop.inria.fr/prisme/index.html.en) is launching a research activity in Bio-Geometry ---the geometric component of the afore-mentioned challenges.

Along this line, a one year Post-Doc position starting Fall 2003
(October / November / December) is now opened. Its primary focus will be docking ---protein-protein as well as protein-ligand, with potential applications to folding. For these reasons, we encourage the application of:

-Bio-(physicists, chemists) with a background in structural biology and an inclination for geometry.

-Computer scientists with a background in algorithms design and
analysis or computational geometry, and interests in molecular
modeling.
Contacts:Applicants with a Ph.D. are encouraged to submit a vitae as well as sample representative publications, and arrange for two letters of recommendation to be sent directly to

Frederic Cazals
INRIA Sophia-Antipolis, Prisme,
2004 route des Lucioles,
BP 93, F-06902 Sophia-Antipolis, France
Email: Frederic.Cazals@sophia.inria.fr


Note. INRIA is the French Institute for Computer Science and
Automation. The Sophia-Antipolis unit is located on the French
Riviera.

-- Project GEOMETRICA, INRIA Sophia-Antipolis, 2004 route des Lucioles,
-- BP 93, F-06902 Sophia-Antipolis,
-- Tel: 33 (0)4 92 38 71 88, Fax: 33 (0)4 92 38 76 43
-- Frederic.Cazals@sophia.inria.fr, http://www.inria.fr/prisme

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03/08/2003[AG]Chef de projet bioinformatique au Genoscope
Source:ABG-7916
Date de parution:02/07/2003Date limite de réponse:02/09/2003
Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 02/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 02/09/2003

Le Genoscope – Centre National de Sequencage recrute un Chef de Projet Bioinformatique, responsable de sa plate-forme d'annotation.

Le Genoscope, composante du GIP CNRG (Consortium National de Recherche en Genomique), mene des projets de genomique a grande echelle en collaboration avec des laboratoires experts de la biologie des organismes concernes, et developpe ses propres thematiques de recherche dans le cadre de l’UMR Genoscope/CNRS/Universite d’Evry « Structure et Evolution des Genomes ».

L’equipe bioinformatique est fortement implique dans l’annotation et l’analyse des genomes sequences au Genoscope, ainsi que dans le developpement de methodes et outils bioinformatiques lies aux differents programmes de recherche. Elle se compose a l’heure actuelle de 9 chercheurs et ingenieurs, qui travaillent en collaboration etroite avec les
biologistes du Centre. L’equipe bioinformatique collabore egalement de pres avec le service Informatique (15 personnes), charge de l’informatique liee a la production de sequences, des processus de traitements automatises, et de la gestion de l’infrastructure materielle et logicielle.
Le Genoscope dispose d'un systeme de calcul a haute performance, constitue principalement d'un cluster Compaq Alpha a 8 membres et 40 processeurs, et d’un espace de stockage.de 10 To.

Le candidat prendra la responsabilite de l’evolution de la plate-forme logicielle d’annotation du Genoscope : expression des besoins, specification fonctionnelle, conception de l’architecture, integration de composants logiciels existants et developpements nouveaux.
Il sera seconde dans sa mission par une petite equipe de 2 bioinformaticiens.

Competences requises :

Au minimum 4 ans d'experience
Bonne connaissance et experience de developpement sous Perl et de C++ ou Java
Experience de la gestion d’un projet de developpement consequent
Excellente maitrise de l’environnement Unix dans un contexte de calcul scientifique a haute performance (calcul distribue, grands ensembles de donnees)

Competences appreciees :

Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (notamment lies a analyse de sequences) Bonne connaissance des SGBD relationnels (modelisation, administration)
Anglais courant

Formation souhaitee : ecole d’ingenieur generaliste, ecole d’informatique, ou 3eme cycle

Date de prise de fonction : Septembre 2003
Contacts:Candidature a adresser par courrier electronique a Vincent Schachter (vs@genoscope.cns.fr)

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003[AG]postdoc paillasse/modélisation post-génomiqueà genopole
Source:
Date de parution:16/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la genopole d'Evry (banlieue Sud de Paris) pour
travailler à la frontière expérimentale entre paillasse et modèle
formel. L'étude, à connotation post-génomique, pourrait porter par exemple sur l'organisation fonctionnelle du noyau eucaryote ou du nucléoïde bactérien, ou sur la différenciation hématopoïétique.

Genopole (www.genopole.org) est une "vallée de la génétique" qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d'entreprises de biotechnologies autour de l'université d'Evry-Val d'Essonne.

Le candidat, titulaire d'une thèse et travaillant actuellement en
dehors de France, sera fortement intéressé par la modélisation
mathématique en biologie. Une bonne formation en biologie et une
expérience de la paillasse sont nécessaires.

Contacts:SVP envoyez un CV à Gilles Bernot (bernot@lami.univ-evry.fr, http://www.lami.univ-evry.fr) ou François Képès (Francois.Kepes@genopole.cnrs.fr, http://stat.genopole.cnrs.fr/~kepes/)

Programme d'Épigénomique, genopole.

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03/08/2003[AG]bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis
Source:
Date de parution:31/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la Génopole d’Evry (banlieue sud de Paris) pour travailler sur l’organisation du génome de la vigne et mener des recherches en génomique comparative avec Arabidopsis thaliana. Cette étude sera réalisée dans un groupe d’environ 50 personnes travaillant en génomique végétale et ira d’études bioinformatiques à la validation des hypothèses à la paillasse. Le salaire brut sera d’environ 2900€.

La Génopole (www.genopole.org) est une « vallée de la génétique » qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d’entreprises de biotechnologie autour de l’Université d’Evry-Val d’Essonne.

Le candidat, titulaire d’une thèse et travaillant actuellement en dehors de la France, sera fortement intéressé par la génomique comparative. Des expériences en bioinformatique (analyse et comparaisons multiples de séquences essentiellement) et en génétique (cartographie génétique et/ou physique) sont demandées.
Contacts:SVP envoyez un CV à adam@evry.inra.fr (http://www.evry.inra.fr).

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03/08/2003[AG]bioinformaticien confirme
Source:ABGf-3198
Date de parution:24/07/2003Date limite de réponse:30/09/2003
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le Cirad recrute un bioinformaticien confirme - Montpellier

Date de debut de diffusion du poste : 24/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 30/09/2003

Au sein d'un laboratoire de recherche en genetique et genomique
vegetales travaillant avec des equipes de renommee mondiale, vous participerez a un enjeu strategique de premier plan:
approfondir la connaissance, la comprehension et la representation du genome des plantes cultivees tropicales.
Bio-informaticien, vous etes attire par ce defi et souhaitez
travailler dans l'environnement scientifique de la Genopole de
Montpellier
Le poste s’integre dans l’equipe de bio-informatique d’une unite
d’analyse des polymorphismes chez les plantes cultivees
tropicales et mediterraneennes.
En partenariat avec differentes equipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amelioration des methodes
pour l'analyse bio-informatique des donnees issues des travaux de
sequencage de grands fragments chez les Monocotyledones
et de genotypage chez differentes especes.
Il contribuera a l'integration de differentes methodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation
comparative) et realisera les developpements bio-informatiques
necessaires. Il elaborera les approches bio-informatiques
adaptees aux etudes d'association et de desequilibre de liaison chez des especes a biologie variee.

Profil souhaite :
Doctorat en bioinformatique, avec une experience significative dans le domaine de l'analyse de sequences. Une experience
post-doctorale serait appreciee.
Bonne connaissance des outils d'annotation (detection de motifs,
logiciels de prediction de genes...)
Maitrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc.
Connaissance des modules informatiques specifiques de la
bio-informatique : Bioperl, BioJava, BioPipeline, etc...
Experience de la modelisation
Bonne culture generale en genetique et biologie moleculaire
Aptitude a la communication interdisciplinaire
Esprit d'equipe, bon relationnel

Lieu d'affectation :
Cirad Montpellier, campus lavalette
Contacts:Informations complementaires et depot des candidatures
http://www.cirad.fr/emploi/chercheurs.html

Complements de dossier de candidature a adresser, avec le numero de reference du poste, par email a : emploi@cirad.fr
ou par courrier postal a :
Cirad Drh - TA 174/04
Avenue Agropolis
34398 Montpellier CEDEX 5

Merci de faire reference a l'ABG lors de tout contact ou lors du depot de votre candidature.

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03/08/2003[AG]Stage Post-Doctoral en Bio-Informatique/Bio-Statistique
Source:Réf : RH/030303/GB/1002
Date de parution:23/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
ATRAGENE BIOINFORMATICS développe des outils appliqués à la génomique et la protéomique à destination des entreprises de biotechnologies, des groupes pharmaceutiques et des laboratoires académiques. Notre société est implantée depuis janvier 2003 sur le bioparc Genopole à Evry (Essonne).

Nous recherchons actuellement un candidat pour un stage post-doctoral d'une durée de 12 mois - reconductible un an - et financé par Genopole. Le candidat participera, sous la direction du directeur du département, au développement et à l'optimisation d'algorithmes dans le domaine de la
recherche de motifs communs dans des séquences nucléiques non alignées.

Le candidat possèdera un doctorat en bio-informatique ou en
bio-statistique complété par un stage post-doctoral à l'étranger. Il aura une forte expérience dans le domaine de l'analyse de séquences. La maîtrise des algorithmes communément utilisés pour la recherche de motifs serait un plus.
Le candidat montrera de solides compétences dans le domaine de la
génomique, ainsi qu'en programmation (C). Des notions en programmation objet seraient appréciées (C++, Java).

Evoluant dans l'environnement dynamique des start-up de biotechnologies, le candidat devra présenter de bonnes capacités d'adaptation, d'innovation et de communication. Une grande aptitude au travail en équipe en milieu multidisciplinaire sera indispensable. Compte tenu des perspectives de développement de notre société, ce poste est évolutif.
Contacts:Vous êtes intéressé par ce poste, envoyez votre candidature à
recrutement@atragene.com.

David Polverari
Directeur bioinformatique
ATRAGENE BIOINFORMATICS
4, rue Pierre Fontaine
91058 Evry - France
david.polverari@atragene.com
www.atragene.com

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02/08/2003[MM]Post-Doctoral Research Fellowships
Source:
Date de parution:04/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Los Angeles (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Keck Graduate Institute of Applied Life Sciences Postdoctoral Fellow The Keck Graduate Institute of Applied Life Sciences is seeking a highly creative and motivated postdoctoral research fellow to participate in the following research area: Development of Bayesian network models and machine learning methods for protein structure prediction. This project is part of a collaborative effort to develop a community resource to enable the emerging science of structural genomics. Candidates should have a Ph.D. in computational biology, computer science, machine learning, theoretical physics, applied mathematics, or a similar quantitative field and a strong interest in molecular biology. KGI is located 35 miles east of Los Angeles, at the foot of the San Gabriel Mountains. Its campus is contiguous with those of the other Claremont Colleges, which together with surrounding educational institutions in Southern California provide a rich intellectual and cultural environment. The position forms part of a collaborative research project between KGI, UCL, UCSD and the Burnham Institute. The successful candidate will be based at KGI and work in close collaboration with the Gatsby Unit for Computational Neuroscience at University College London.
Contacts:Prospective candidates should apply with a cover letter and CV, and ask for at least two letters of recommendation to be sent to Dr. David Wild at: Keck Graduate Institute, 535 Watson Drive, Claremont, CA 91711.
Email: david_wild@kgi.edu.

Contact Information
Keck Graduate Institute
David Wild
david_wild@kgi.edu
Tel. Number: 909-607-8566
FAX Number: 909-607-8086
www.kgi.edu

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02/08/2003[AG]Post-Doctoral Research Fellowships
Source:
Date de parution:04/07/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Washington (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
One or more postdoctoral positions are available in George Lake’s new group at Washington State University. The successful candidate will be part of both the Physics department and the newly formed Center for Integrative Biology. We are looking for a candidate who will use bioinformatics and computational biology with the theory building eye of a physical scientist. The particular projects that will be pursued are:
1) understanding the dynamics of gene regulatory networks, constraints on their properties and evolution that insure robust behavior,
2) developing techniques to examine the evolution of gene regulatory networks as distinct from the evolution of individual genes, and
3) working on a new theory for the explosion of species as occurred in the Cambrian explosion and the mammalian radiation.

Candidate should have a Ph.D. in Biology, Computer Science, Physics or a related field. Programming experience is required as well as an understanding of building quantitative theoretical models.

Job Information
Position Type: Post-Doctoral Research Fellowships
Reference (Job ID number):
Start Date: 2003-09-01
Duration: Full Time
Status: open
Contacts:Washington State University
Department of Physics
George Lake
lake@wsu.edu
Tel. Number: 509-335-1698
FAX Number: 509-335-7816
http://134.121.46.58/Opportunities/current.htm
How To Apply: To apply, please submit a CV, list of publications,
statement of research interests, and have three letters of reference
sent directly to George Lake; Department of Physics; 1245 Webster;
Washington State University; Pullman; WA 99164-2814. Applications
arriving by September 1, 2003 will receive full consideration, but
review of applications and interviews will begin immediately.

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26/06/2003[AG]MC de bioinformatique
Source:BioInfo
Date de parution:26/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Nice (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
L'Université de Nice Sophia Antipolis demandera un poste de MC de
bioinformatique pour la rentrée 2004.
Le profil retenu est "fouille de données, génomique et protéomique".
Dans le cadre des recherches faites sur le campus actuellement, data mining et/ou ontologies en relation avec les puces à ADN semble être le domaine qui pourrait être privilégié, mais sans pour autant exclure d'autres candidats en fonction de leur dossier.

Comme d'habitude, une expérience post-doctorale ayant permis
l'acquisition d'une double compétence sera un réel avantage, mais un stage post-doctoral ne sera pas exigé du candidat.

Les éventuels futurs candidats, peuvent me contacter par email pour plus de détails et discussions.
Contacts:Richard CHRISTEN
UMR6543 CNRS - Université de Nice Sophia Antipolis
Biologie Virtuelle.
Centre de Biochimie. Parc Valrose.
06108 Nice cedex2
christen@unice.fr
tel 33 - 4 93 76 52 10
fax 33 - 4 93 76 52 19


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23/06/2003[AG]Computational Neurobiology at EMBL
Source:BioInfo
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Postdoctoral position available in the team of Computational
Neurobiology at the European Bioinformatics Institute (UK)

The DopaNet consortium (http://www.dopanet.org) is a tentative to
mobilise the european scientific expertise in molecular and cellular neurobiology, in order to investigate precisely and quantitatively all the aspects of neurotransmission --- at the levels of the molecule, the supra-molecular assembly, the neuronal cell and the neuronal network --- in a specific neuronal system.

A crucial step of the DopaNet project will be to build realistic models of networks of signal transduction at the levels of the synapse, the neuron, and the micro-circuit. Those models will provide a deeper understanding of neuronal signalling, but also will aim at reproducing neuronal disorders in silico to understand how specific molecular and cellular abnormalities could generate pathological phenotypes, and to predict the effect of pharmacological treatments

A team of bioinformaticians located at the European Bioinformatics Institute will be in charge of the databases, but also of the modeling of neuronal functions. Within this framework, we look for a person to develop detailled and realistic models of dynamical synapses.

PhD interested in Systems Biology and Signal Transduction are invited to apply.

Requirements:

- Solid culture in Molecular and Cellular Biology. A knowledge of
Neurobiology is a plus.

- Background in Mathematics and/ort Physcics;

- Skills in computing: Knowledge of several programming languages (if possible one of C++, Java or Perl). Experiences of some flavor of Unix would be a plus (the work will be done under Sun solaris, True64 or Linux).

The position will be open at the end of 2003. Interested fellows should send their CV as quick as possible to:

Contacts:Nicolas Le Novère
Receptors and Cognition
Institut Pasteur
25, rue du Dr ROUX
75724 Paris, France

tel: +33 1 45 68 88 44
fax: +33 1 45 68 88 36

email: lenov@pasteur.fr

The European Bioinformatics Institute (EBI, http://www.ebi.ac.uk), part of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL), was established at Hinxton near Cambridge, UK, to foster leading edge research and development in biocomputing. In collaboration with groups in Europe, the
USA and Japan, the EBI maintains many biological databases, including comprehensive public databases of DNA and protein sequences and their 3D structures. The EBI is currently broadening its interests toward transcriptomics, protein networks and metabolic pathways.

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23/06/2003[AG]Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie
Source:BioInfo
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:11/07/2003
Lieu:Paris (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (Paris)
recherche un : Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie (CDD INSERM)

Vous serez intégré à l'Institut Fédératif de Recherche du
Département de Biologie dirigé par Patrick Charnay. Plus précisément, vous serez rattaché aux plates-formes du transcriptome et d'Imagerie dirigées par Claude Jacq et Antoine Triller. Vous participerez aux analyses informatiques des
images de ces services, ainsi qu'à la mise en place des outils nécessaires à leur réalisation. Vous serez plus particulièrement conduit à travailler sur des thématiques liées à l'imagerie.

Mission :
Des outils d'analyse des puces à ADN, commerciales ou
fabriquées localement, ont été mis en place (GenePix). Vous assurerez le maintien de ces outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d'analyse.
Vous serez chargé d'assurer le bon fonctionnement des outils de la plate- forme et de vous tenir au courant des évolutions du secteur.
Des robots sont disponibles sur la plate-forme pour la gestion
des matériels biologiques. Vous aurez en charge le fonctionnement
des programmes de ces robots ainsi que le développement d'outils
automatisés permettant par exemple la reconnaissance de colonies sur boîtes.
Vous aurez en charge une partie de la formation des utilisateurs
aux techniques d'analyse d'images des puces à ADN.

Profil :
Vous connaissez plusieurs langages de programmation et vous
avez l'expérience des programmes d'automatisation des tâches
plus particulièrement dans le domaine de l'imagerie. La maîtrise des outils de développement d'interface web (HTML, Javascript, .), des langages de script (PHP, perl, .) et de la gestion des bases de données (SQL) serait un plus.
Des connaissances en biologie seront particulièrement appréciées.

Perspectives :
Ce poste s'inscrit dans la politique de développement de la
bioinformatique et de l'imagerie dans le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure . Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminé disponible immédiatement jusqu'au 30 novembre. Ce poste est accordé avant le recrutement d'un ingénieur d'étude par l'INSERM par concours national.
Vous pourrez ensuite vous présenter à ce poste. Les conditions salariales sont celles des ingénieurs d'études de l'INSERM.

L'arrêté d'ouverture est paru, la date limite de retrait des dossiers est fixée au 11 juillet et la date limite de depôt au 15 juillet

Contacts:Envoyez vos références à Stéphane LE CROM : lecrom@biologie.ens.fr

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23/06/2003[AG]Open Ph.D. positions in Algorithmic
Source:hd-emploi-info@jeunes-chercheurs.org
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Munich (Allemagne)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
The Department of Computer Science at the Ludwig-Maximilians-
University München offers several full time positions as

RESEARCH ASSOCIATES

within the Research Group on Algorithmic Bioinformatics. These
positions are integrated in the recently established Bioinformatics Initiative Munich (BIM) funded by the DFG. Research and teaching is conducted within a wide cooperation of other Munich Bioinformatics Centers. Our research focuses in design and analysis of efficient algorithms for discrete and combinatorial problems in Bioinformatics.

Applicants for these positions need to have the equivalent of the German University Diploma (e.g., M.Sc.) in Bioinformatics, Computer Science or Mathematics. These are fixed term positions for a period of 2 years with the possibility of extension for another 2 years. Prospective collaborators will have the opportunity to work towards a doctorate from the Ludwig-Maximilians-University Munich. The salary rate is according to the federal salary scale (BAT) on the IIa level.

Candidates are expected to have in-depth knowledge in Computer
Science, in particular in algorithmics, should have basic knowledge in Molecular Biology. Due to teaching obligations, profound knowledge of the German language is mandatory.
Contacts:Applications (including curriculum vitae, copies of certificates, and a
statement of research interests) should be sent to the following
address, where also further information can be obtained:

Prof. Dr. Volker Heun
Institut für Informatik
Ludwig-Maximilians-Universität München
Theresienstr. 39
80333 München
Germany

Email: heun@informatik.uni-muenchen.de
Web: www.bio.informatik.uni-muenchen.de/personen/heun/group/

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23/06/2003[AG]Computational Biologist
Source:bambct-list@molbio.mgh.harvard.edu
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Waltham (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
JOIN A FAST PACED VENTURE BACKED BIOTECHNOGOLGY START-UP

engeneOS was formed in late 2000 to exploit the tremendous opportunity created by the genomics revolution in the biological sciences merged with cutting edge technologies from the physical and information sciences. We are a pioneer in establishing the field of Biomolecular Engineering to enable the design and construction of programmable Biomolecular Machines from natural and artificial building blocks. These Biomolecular Machines will serve a broad range of commercial applications including biosensors, chemical synthesis and processing, bio-electronic devices and materials, nanotechnology, functional genomics and drug discovery.

Founded and lead by an extraordinarily talented group of advisors/partners and management team, engeneOS is a fast paced entrepreneurial organization providing talented people with the opportunity for growth, development and contribution to our dynamic and growing organization.

We are seeking a high energy, dynamic individual to join our team as a Contract to Permanent Computational Biologist.

Contract Computational Biologist

As a key member of our dynamic interdisciplinary team you will actively participate in developing innovative solutions for complex computational biological problems. The ideal candidate should have the following:
-strong biology (especially genomics) and bioinformatics background
-familiarity with genomics database (Genbank, Protein database) and data mining
- Proficiency in search algorithm and database programming with experience in writing multiple applications that interface with databases (MySQL, PostgreSQL, Oracle)
- Statistical Analysis, Proteomics
- Experience with the following technologies:
- C or C++ or Java
- Perl or Python
- GUI development (Swing, GTK+, Tk)

Excellent written and verbal communication skills are required along with the ability to work under aggressive timelines.

engeneOS offers a competitive compensation and benefits package including, medical and dental coverage, Flexible Spending Accounts, Life & Disability Insurance, and stock options.engeneOS is an equal opportunity employer.
Contacts:Please submit your resume/CV to:jobs@engeneos.com
Fax:781-891-3796
Jennifer Neves
Staffing Specialist
Compound Therapeutics
1365 Main Street
Waltham, MA02451
PH: (781) 891-3745 x 321
FAX: (781) 891-3796
jneves@compoundtherapeutics.com

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23/06/2003[AG]BIOMEDICAL INFORMATICS - Research
Source:bioinformatics.org
Date de parution:23/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu: (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Responsibilities: Join GE's research in molecular imaging as a
Bioinformatics Scientist, working with world-class experts in imaging physics, molecular biology, and medicinal chemistry, developing the nextgeneration of molecular diagnostics. We need experts in bioinformatics analysis of protein pathways and gene expression to develop tools and techniques for discovering molecular imaging targets and apply these techniques to the study of specific diseases. Projects will involve developing platform technologies for integrating many disparate types of
public and proprietary genomic and proteomic data along with analysis methods to elucidate pathways and identify molecular imaging targets.
Collaborate with GE’s luminary academic and commercial scientific
partners both to develop next generation diagnostic products and to publish research results.
Requirements: Candidates need to have either a PhD in bioinformatics or computational biology, or degrees in both biological and computational sciences, with one being at the PhD level.
·Knowledge of molecular disease mechanisms and pathways.
·Knowledge of genomics and analysis of DNA microarray data.
·Mathematical and computer science background.
·Published work in the bioinformatics field.
·Excellent communication skills (verbal, written, presentation).
·Ability to work effectively in teams.
Demonstrated experience in one or more of the following areas would also be highly desirable:
·Experience in building computational models of biological phenomena.
·Experience in statistical analysis of biological data.
·Experience with microarray tools and algorithms, knowledgeable about their limitations and research areas.
·Experience building bioinformatics databases and software tools.
Desired:
·Experience in pharmaceutical or biotech industry.
·Experience as Principal Investigator on funded research grants.
·Leadership / coordination ability.
Contacts:To apply to this position, please click on this link.
https://www.research.ge.com/eHire
Please enter GECRD/319910/WB2273 in the job reference code field.

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16/06/2003[AG]Associate or Full Professor computational biology and bioinformatics
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:01/08/2003
Lieu:Washington (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Fred Hutchinson Cancer Research Center
USA-WA-Seattle
Senior Faculty Position (Associate/Full member)

Senior Faculty Position in Bioinformatics or Computational Biology The Fred Hutchinson Cancer Research Center is recruiting an Associate or Full Member (corresponding to Associate or Full Professor) to lead an initiative to develop the broad area of computational biology and bioinformatics. Applicants should have expertise in such areas as computational genomics or proteomics, systems biology, or bioinformatics. Applicants should also have an excellent research history using quantitative methods to investigate biological mechanisms and have demonstrated success in bridging theoretical and empirical approaches. The successful applicant will have the capability of leading multidisciplinary research teams, with a pertinent record of funding. An appointment in a relevant department at the University of Washington is possible depending on mutual interest. A letter summarizing experience and research plans, a complete CV, and the name, title and addresses (including email address) of four references should be sent to: Gail DeVun Fred Hutchinson Cancer Research Center 1100 Fairview Avenue North, MP-702 PO Box 19024 Seattle, WA 98109 gdevun@fhcrc.org Applications or statements of interest should be received by August 1, 2003 to assure consideration. Later applications may also be considered if the position is not yet filled. The Fred Hutchinson Cancer Research Center and the University of Washington are equal Opportunity/affirmative action employers. Both institutions are building culturally diverse faculty and strongly encourage applications from women and minority candidates.

Job Information
Position Type: Faculty
Reference (Job ID number):
Start Date: ASAP
Duration: Full Time
Status: open
Contacts:Fred Hutchinson Cancer Research Center
Quantitative Biology
Gail Devun
gdevun@fhcrc.org

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13/06/2003[MM]These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole
Source:ABGt-2938
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:06/07/2003
Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 10/06/2003
Date de fin de diffusion prevue : 06/07/2003

Modelisation microscopique et optimisation des proprietes de molecules d’interet pharmaceutique :
complementarite avec des etudes experimentales

Plusieurs molecules d’interet pharmaceutique, ayant une action
anti-tumorale reconnue, ont fait l’objet d’etudes structurales poussees. Par exemple le busulfan a ete etudie au laboratoire SPMS, sous la responsabilite de N. Ghermani. Cette molecule, et d’autres, ont pu etre cristallisees, et etudiees par diffraction X haute resolution : ceci a permis une analyse detaillee de la densite electronique(1).
La comprehension du comportement alkylant d’une telle molecule au niveau de l’ADN ou des cellules necessite une analyse theorique poussee.
Cette molecule est par ailleurs tres active, et des etudes sont en cours pour en empecher la cristallisation en milieu biologique, cause reconnue de deces. Il s’agit essentiellement d’encapsuler des molecules, tout en maintenant la reconnaissance des sites d’action bio-chimique.
En dehors du travail primordial de pharmaco-technie, il apparait
important de comprendre par voie theorique puis de controler par modelisation les mecanismes microscopiques qui sont en jeu. Cet objectif est commun a de nombreuses molecules vectorisees par des nano-particules pharmacologiques.
Les grandes phases du travail de these seraient les suivantes :
1. Etude theorique de la molecule de busulfan (et aussi d’autres
molecules presentant la meme problematique de forte cristallisation) et comparaison avec les
resultats experimentaux .
Modelisation de l’interaction molecule-ADN.
2. Modelisation des forces de cohesion qui favorisent la
cristallisation. Cette phase fera largement appel a la description d’un solide en termes de « clusters ».
3. Description des interactions dans une molecule en capsulee dans un vecteur ou une nano-particule. Dans cette phase, a la fois l’approche par cluster et la modelisation conformationnelle developpees ces dernieres annees seront importantes.

Ce travail trouvera un prolongement sur des objectifs plus larges :
4. Modelisation des interactions entre nanoparticules.
5 . Modelisation de l’interaction complexe-site actif.

Un tel projet s’inscrit directement dans la ligne des travaux developpes au niveau theorique dans l’UMR ces dernieres annees, ainsi que dans l’operation scientifique « materiaux d’interet pharmaceutique », mixte UFR de Pharmacie / ECP. Il permettrait un pont avec une operation scientifique prioritaire actuelle. Il est certain que l’etude ne peut avancer que par une interaction permanente entre des composantes pharmacotechnique, structurale et theorique.

Le directeur de these serait Jean Michel Gillet, soutenu en co-direction par Nour Eddine Ghermani d’une part (pour les aspects biochimique et structural) et Pierre Becker d’autre part (concernant la reflexion sur les modeles a mettre en œuvre)

A noter enfin qu’une telle collaboration, si elle est un succes, peut deboucher sur des applications a terme mettant en jeu des grands groupes pharmaceutiques.

Jean Michel GILLET, ECP et SPMS
Nour Eddine GHERMANI, Paris XI et SPMS
Pierre BECKER, ECP et SPMS

References :
1. Experimental electron density and electrostatique potential analysis of Zinc (aspirinate)2(H2O)2 complex : a 3d10 metal bonding to a drug ligand A. Spasojevic-de Bire, N. Bouhmaida, A. Kremenovic, G. Morgant, N.E. Ghermani (2002), J. Phys.
Chem. A, 106, 12170-12177

2. A new approach to the electron distribution in flexible molecules. Application to conformational analysis P. Becker, E. Bec, (1996) Chem. Phys. Letters, 260, 319

3. Interpreting Compton anisotropy of ice Ih : a cluster partitioning method S. Ragot, J.M. Gillet, P. Becker, Phys Rev. B, 63, (2002) 235115-1 to 235115-6

4. Electrostatic properties of ibuprofen
N.E. Ghermani, M. Dutheil, P. Becker, J. Chem. Phys. (2002), 117,
205-212

Une bonne formation en physique ou chimie quantique est essentielle.
Une precedente experience dans la modelisation moleculaire serait
appreciable.
Un bon classement de DEA sera un atout favorable, sinon determinant,dans l'obtention d'une bourse de l'Ecole Doctorale de l'Ecole Centrale Paris.
Tous les cours de l'ECP sont accessibles aux doctorants du laboratoire SPMS, avec la possibilite de valider le Diplome d'Etudes Superieures Professionnelles delivre par l'Ecole Centrale Paris.
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.
Contacts:Envoyer un CV ainsi qu'une lettre de motivation (sous la forme d'un courrier electronique avec CV en document attache) a gillet@spms.ecp.fr

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11/06/2003[MM]POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS
Source:BioInfo
Date de parution:11/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:La Jolla (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for a postdoctoral position starting September 2003 or later in the Department of Biochemistry & Molecular Biology within the Center for Biological Modeling at Michigan State University (http://biomodel.msu.edu/). The position is available initially for 1 year with the possibility for extension.

Research interests focus on three main areas: Modeling of large
supramolecular assemblies, in particular interactions between mismatched DNA and the mismatch recognition protein mutS; development of hybrid explicit/implicit solvation methods; and development and application of novel methods for protein structure prediction and refinement.

Ideal candidates would have a strong background in computational or theoretical chemistry, biophysics, biochemistry, structural biology or related discplines. Familiarity with computational chemistry methods, experience in molecular modeling and simulation of biological systems, advanced programming skills, knowledge of the UNIX/Linux operating system, and an interest in developing new methodologies are highly desirable.

MSU, located in East Lansing, Michigan, provides a unique and
challenging interdiscplinary research environment at the interface of biological and physical sciences. East Lansing, located between the Great Lakes, offers a pleasant living environment with many cultural events and excellent opportunities for outdoor activities.
Contacts:Interested applicants should send a curriculum vitae, including relevant experiences, a list of publications, and contact information of three references, to the address listed below. Electronic responses are highly encouraged.

Michael Feig
Department of Molecular Biology, TPC-6
The Scripps Research Institute
10550 N Torrey Pines Road
La Jolla, CA 92037
USA
email: meikel@scripps.edu

http://www.scripps.edu/~meikel/msu/feig.html

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10/06/2003[MM]Simulation Numérique des Métalloprotéines Impliquées dans la Toxicologie
Source:http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-105.html
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Grenoble (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:


Proposition de sujet de thèse
SL-DSV-03-105 DSV

Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Simulation Numérique des Métalloprotéines Impliquées dans la Toxicologie

Topic tittle
Numerical Simulation of Metalloproteins Implicated in Toxicology

2. Détail du sujet
Les métalloprotéines ont une importance primordiale dans tous les
domaines de la biologie. Pourtant, vu la complexité de leur structure et de leur fonctionnement, ils ont besoin d'outils théoriques spécialement adaptés. Le projet proposé pour cette thèse concerne la modélisation de métalloprotéines et, principalement, celles qui sont importantes pour la toxicologie. Ce travail consistera en l'étude de la fixation des métaux et de la dynamique des protéines.

Detailed tittle
Metalloproteins are of crucial importance in all areas of biology.
However, given the complexity of their structure and function, special simulation techniques are needed to treat them. The project proposed for this thesis concerns the modeling of metalloproteins and, in particular, those that are important in toxicology. The work will study how the metals bind to the proteins and how they influence their dynamics.

3. DEA recommandés
DEAs de Modélisation, de Physique, de Chimie, de Biologie Structurale ou de Biologie Moléculaire.

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Institut de Biologie Structurale
Date souhaitée pour le début de la thèse : 1/10/2003
Contacts:Personnes à contacter par le candidat
Martin Field
LDM/Laboratoire de Dynamique Moléculaire
IBS 41 rue J. Horowitz 38027 Grenoble
Téléphone : +33 4-38-78-95-94

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10/06/2003[MM]Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire
Source:http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-104.html
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Grenoble (France)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-104 DSV
Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire
Topic tittle
Numerical Simulation of Intracellular Behavior

2. Détail du sujet
Récemment, il y a une révolution dans la biologie due aux projets
génomiques. Le déluge des données produites par ces projets a changé la façon de penser la recherche en biologie et permet des approches novatrices pour aborder les problèmes biologiques. Le projet proposé pour cette thèse se situe dans le domaine de la biologie post-génomique et a pour but ultime la compréhension des réseaux de protéines - comment ils se comportent et les règles générales qui les gouvernent
Detailed tittle
Recently, there has been a revolution in biology due to the genome projects. The deluge of data produced by these projects has changed the way in which research is done in biology and has led to new approaches to the treatment of biological problems. The project proposed for this thesis falls in the area of post-genomic biology and has as its aim the understanding of protein networks - how they behave and the rules that govern them.

3. DEA recommandés
DEAs de Modélisation, de Physique, de Chimie, de Biologie Structurale ou de Biologie Moléculaire

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Institut de Biologie Structurale

Date souhaitée pour le début de la thèse : octobre 2003
Contacts:5. Personnes à contacter par le candidat
Martin Field
LDM/Laboratoire de Dynamique Moléculaire
IBS 41 rue J. Horowitz 38027 Grenoble
Téléphone : +33 4-38-78-95-94

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10/06/2003[MM]Computational Chemists/C++
Source:Bioinformatics.Org
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Salary plus bonus to 150K+

Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of
experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics,
or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills.
Relevant areas of experience might include the computation of
protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecular systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of
electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with
management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.
Contacts:If you are interested send a Word Attachment copy of your resume to the attention of Norm Davis at normd@cisny.com

[Please Mention Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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10/06/2003[MM]development of advanced algorithms for ligand and structure-based drug design and chemical informatics
Source:
Date de parution:06/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Exton (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
3-Dimensional Pharmaceuticals, Inc. (now part of Johnson & Johnson Pharmaceutical Research & Development L.L.C.) is seeking qualified candidates to join the Molecular Design and Informatics group at the Exton, PA and Cranbury, NJ sites. The successful candidates will work on the development of advanced algorithms for ligand and structure-based drug design and chemical informatics. Areas of interest include conformational analysis, protein docking, pharmacophore modeling, 3-D database searching, de novo ligand design, statistical analysis of high-throughput screening results, structure-activity correlation, library design and predictive ADME.

Candidates must have a Ph.D. degree in computational chemistry or a related discipline, and must have a strong background in algorithm development and computer programming in one of the areas listed above. Strong C++ programming skills are highly desired, as is the ability to learn new technologies and work effectively in a large development team.
Extensive interactions with other informatics and modeling specialists across multiple sites are expected, and will help define long-term needs and solutions for the company's drug discovery projects. Successful candidates must have excellent communication skills and the ability to work in a dynamic, fast-paced team environment. They are also expected to be active in their scientific community through publications, patent filings and presentations at scientific meetings.
The Molecular Design and Informatics group at 3DP consists of 18 computational chemists, chemoinformaticians and database analysts, and its mission is to provide modeling and informatics support for the company's internal drug discovery programs, develop new methodologies for computer-assisted drug design, and provide enterprise solutions for
Chemical and biological data management. The group has a proven track record of scientific and technical excellence as manifested by its strong publication record, rich patent portfolio, and global impact within R&D, providing a stimulating work environment and great opportunities for scientific growth.
Owing to its heritage, our site combines a unique small company atmosphere with the benefits of one of the largest and most admired pharmaceutical companies in the world.
Contacts:Interested candidates should submit their application by e-mail to Dr. Dimitris K. Agrafiotis at dimitris.agrafiotis@3dp.com (see also www.dimitris-agrafiotis.com). For more information, please visit www.jnj.com, www.jnjpharmarnd.com and www.3dp.com.

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10/06/2003[AG]CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster
Source:BioInfo
Date de parution:28/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Gif-sur-Yvette (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
TRES URGENT: CDD de 12 mois non-renouvelable, niveau IE ou IR selon le diplôme, salaire premier échelon de la catégorie correspondante.

Mots clés: base de données relationnelle, interface web,

Projet:
Dans le cadre de la création d'un centre de ressources biologiques drosophiles organisé en réseau, nous recherchons un ingénieur (ou post-doc) pour développer l'outil de gestion commun sous forme d'une base de données relationnelle. La base recensera l'ensemble des ressources disponibles dans les différents laboratoires partenaires et comportera deux grands types de ressources, - des lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster espèce modèle dont le génome est entièrement connu, - des lignées de populations naturelles et d'espèces variées. (plusieurs milliers de lignées au total)

Mission:
Prendre en charge la conception et la réalisation de la base de données sécurisée (MySql ou PostGreSql) regroupant l'ensemble des lignées et espèces de drosophiles et de l'interface web.

Ce poste est réservé à un candidat qui n'a pas déjà bénéficié d'un CDD avec un établissement public de recherche.

Lieu de travail: CNRS, Gif-sur-Yvette, Populations, Génétique et
Evolution (PGE)
Contacts:Personne à contacter:
Marie-Louise Cariou
Populations, génétique et Evolution - UPR 9034
CNRS - Gif-sur-Yvette
Tél 01 69 82 37 10
Mail: cariou@pge.cnrs-gif.fr

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10/06/2003[AG]Biologist
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:31/05/2003
Lieu:Genève (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist
The BioMinT project is focused on the development of statistical,
machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information:
http://biomint.org/).

The main tasks of the position will consist of:

exploring domain-specific knowledge resources in order to create
lexicons, thesauri and ontologies furnishing sets of document corpora for each stage of tools development and validation
evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators
A university level degree in biology is required, as well as an
experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position.

Eligible candidate for hold a Swiss or European union passport.

Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months

Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva
Contacts:Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to:

Anne-Lise Veuthey

Swiss Institute of Bioinformatics
CMU
1, rue Michel Servet
1211 Genève 4
email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

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10/06/2003[AG]GenBank Biologist
Source:http://www.bioplanet.com/planetforums/viewthread.php?tid=1344
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bethesda (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Enjoy Puzzles? Consider GenBank Biologist - Bethesda, MD

Interested in an exciting and rewarding alternative career in the
biosciences? Tired of bench work? Allergic to latex? Had enough 24/7?
Looking for a real job and not another postdoc? Enjoy puzzles and
problem solving? Incredibly detail-oriented? Comfortable using a
computer? If you have answered yes to most of these questions, then consider joining our team of highly skilled and dedicated scientists working onsite at the National Institutes of Health (NIH) in Bethesda, Maryland. This position is particularly suitable for a molecular biologist just completing a postdoc.

With over 24 million sequence records in its database, GenBank is
recognized by researchers worldwide, and its database is designed to provide and encourage access within the scientific community to the most up to date and comprehensive information available.

Using your molecular biology skills, you will partner with computational biologists, genomic science experts, and computer specialists at the NIH's National Center for Biotechnology Information (NCBI) to help build and maintain GenBank, the nucleotide sequence database for all publicly-available gene sequences. Computercraft has provided scientific expertise to GenBank continuously since 1991.

This is a highly diversified and challenging position requiring a Ph.D. in molecular biology (or related field), excellent written and verbal communication skills, and an aptitude for utilizing DNA sequence analysis software and web-related resources for extensive problem solving. With the training we provide using state-of-the-art custom software, the GenBank Biologist:

· Reviews sequence data directly submitted from individual laboratories, and large-scale sequencing projects.
· Evaluates nucleotide sequence submissions for biological integrity and accuracy.
· Biologically annotates DNA/RNA sequence submissions.
· Communicates extensively with submitters to resolve issues and
concerns related to their sequence submission(s).
· Conducts database and administrative activities related to the
maintenance of GenBank and related NCBI Web resources.
· Travels on occasion to scientific meetings to help disseminate
information about NCBI's resources to the scientific community.

Extensive sequence analysis and/or laboratory experience in molecular biology is essential. Experience with DNA sequence analysis software a plus. In addition, considerable teamwork interaction and excellent organizational and communicational skills are required for this extremely detail-oriented position. Must have strong desire to support publicly available scientific databases.

Qualified scientists who enjoy teamwork interaction, multi-tasking, and problem-solving with a results-oriented focus, are invited to submit all of the following for consideration: cover letter, curriculum vitae, salary history, salary requirements, and U.S. employment eligibility (you must currently reside in the U.S. and be eligible to work). Please note that incomplete applications cannot be considered.

We offer an excellent salary and benefits package, 40-hour work week with flexible start times, and relief from publishing requirements.
Contacts:Email: hr@computercraft-usa.com
Fax: (301) 493-1288
Mail: Computercraft Corporation, Attn: HR, 6701 Democracy Blvd., Suite 401, Bethesda, MD 20817.

Please see our web site for more information: www.computercraft-usa.com

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10/06/2003[AG]CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services
Source:EMBL Job Vacancy 03/57
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:15/07/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/57

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Heidelberg:


HEAD OF CENTRAL COMPUTING SERVICES

Grade: 9

Duty Station: Heidelberg, Germany

Job Description: The successful candidate will lead a team of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services for the main Laboratory of the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg.

A key task of this team is to provide service and support to the EMBL scientific community at all levels of computing and networking.
Supported equipment includes a broad range of computing devices (from desktop machines, workstations to large servers). The operating system environment is heterogeneous and includes Unix, Linux, MacOS and Windows. The implemented networking technology is state-of-the-art and allows the provision of extensive online services to the worldwide scientific community.

It is essential that the central computing service team collaborate with research groups in computational biology at EMBL. The Head of central computing services is expected to serve as a facilitator for the in-house computational biology community as well as for the EMBL Outstations. The duty of the person also involves support and interaction with the SAP based administrative computing system and consultants.

Qualifications and Experience: Applicants should have a university degree or equivalent as well as having substantial experience in managing and integrating a heterogeneous scientific computing environment, which includes expertise in network security and network administration. The position requires the ability to develop technical concepts and proposals for further improvement of the computing and networking services, including improvement in the areas of the GRID and network security. Previous experience in management of an IT team and skills in negotiating with computer equipment manufactures are highly desirable.


Contract: A contract of 3 yearsí duration will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 15.07.2003
Contacts:EMBL Web site: http://www.embl.de/

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10/06/2003[AG]bourse post-doctorale Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés
Source:
Date de parution:27/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Nancy (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS-INRIA-Universités recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et
Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses
étant réalisées au MAEM.
Contacts:Réponse le plus tôt possible à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 :
Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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10/06/2003[AG]SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:???Secteur:prive
Description de l'annonce:
EMBL Job Vacancy 03/22

Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/22

rev. May 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France,
Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal,
Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that
applications are being sought for the following position in Hamburg:


SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY


Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications


Duty Station: Hamburg, Germany


Commencing Date: As soon as possible after closing date


Job Description: The work will involve development of graphical user
interfaces (to be built on the existing modules), support of the Web and
Email server, support of remote execution of ARP/wARP jobs on local
mulit-processor computer cluster.


Qualifications and Experience: Applicants should have a computational
background and experience in the design of GUI. Profound knowledge of
C/C++, Java/Javascript, Perl, Tcl/Tk, HTML or Python programming
environments is required. Some familiarity with crystallography will be
of advantage.


Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful
candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time
of the review.


Closing date: 30.05.03

EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de

Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants.

EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/22, to:
The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg,
Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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10/06/2003[AGMM]Eight tenure track faculty positions
Source:
Date de parution:10/06/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Indianapolis (Etats-Unis)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Eight tenure track faculty positions distributed across all ranks are available in the newly created Center for Computational Biology and Bioinformatics, located within the Indiana University School of Medicine.

The Center is being launched as part of the Indiana Genomics Initiative (INGEN: http://www.ingen.iu.edu/), which was made possible by a grant from the Lilly Endowment.

Please think about this opportunity. If you are not interested for yourself, please encourage students, postdocs and colleagues to take a careful look
Contacts:For more information, go to ttp://www.iscb.org/mem_job_board.php?1. This URL is part of the website for the International Society for Computational Biology.

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10/06/2003[AGMM]Associate Professor for Computational Biosciences, tenure track
Source:
Date de parution:25/05/2003Date limite de réponse:02/06/2003
Lieu:Graz (Autriche)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
University of Graz
Austria-Graz
Associate Professor for Computational Biosciences, tenure track

Call for applicants for a „Tenure Track“ Associate Professorship for Computational Biosciences - Biocomputing Institute of Molecular Biology, Biochemistry and Microbiology, University of Graz The position is to be filled immediately. The successful candidate should demonstrate research and teaching experience in the computational biosciences with particular strength in model development and simulation for application in molecular biology or structural biology. The primary teaching responsibility will be implementation of a new curriculum for computational science, however, contributions to the chemistry and biology programmes are expected. A research focus related to the existing biochemistry, molecular biology and structural biology programmes is preferred (http://www.kfunigraz.ac.at/imbmwww/jobs.html).
Closing date: 2 June

Requirements for an employment:

1.An appropriate Austrian or International University degree
2.Extraordinary scientific qualification in research and teaching
3.Pedagogic and didactic qualification
4.Excellent management skills to provide academic and administrative leadership
5.Experience of work and research in institutions outside Austria
6.Appropriate non-universitary experience, if possible and relevant in this field

The University of Graz has an equal opportunities policy and is taking positive action to increase the number of women in leading positions.
Applications from female candidates are particularly welcome. Where candidates are equally qualified, preference will be given to female candidates.

To apply, please send your CV, with details of your academic and
professional career list of publications not more than 5 reprints of the most important publications description of research activities and future plans in research

Job Information
Position Type: Faculty
Reference (Job ID number):
Start Date: ASAP
Duration: Contract
Status: open
Contacts:Contact Information
University of Graz
Department of Molecular Biology, Biochemistry and Microbiology
O.Univ.Prof. Dr. Georg Hoinkes, Dean of the Science Faculty of the University of Graz
eva.siesz@uni-graz.at
Tel. Number: ++43 316 380 5004
FAX Number: ++43 316 380 9800
http://www.kfunigraz.ac.at/imbmwww/index_e.html
How To Apply: eMail, mail or fax application and resume
Mailing address:
Universitaetsplatz 3, A8010 Graz, Austria

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10/06/2003[AGMM]Senior Scientist Bioinformatics, NITD
Source:http://www.bioplanet.com/planetforums/viewthread.php?tid=1352
Date de parution:13/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Singapour (Singapour)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:

Senior Scientist Bioinformatics, NITD, Singapore

The Novartis Institute for Tropical Diseases in Singapore (NITD) works to advance medical research in the area of progressive infectious and parasitic diseases that affect so many people in the developing world.
Novartis views this as a long term endeavor to enhance the discovery of preventative and effective treatments for diseases like tuberculosis (TB) and dengue, and ultimately reduce the overall affliction of tropical diseases and improve the prosperity of developing countries.

The successful candidate will play an instrumental role in setting up computational biology at the NITD. In close collaboration with the experimental scientist he will computationally support the various research projects and advise biologists and chemists in the use of bioinformatics applications and resources. In addition he will serve as an interface to other bioinformatics research groups in Novartis. He will co-ordinate joint projects and internalize or interface existing in-house resources and applications.

Requirements:

PhD in natural sciences, informatics or related education. Practical working experience, e.g. post doctoral training. Strong background in molecular- and cell-biology and the proven ability to publish in this field. Excellent knowledge of bioinformatics with an emphasis on the analysis of sequences and protein structures. Familiarity with all common bioinformatics algorithms and resources and a profound understanding of how these databases have been compiled. The ability to develop own bioinformatics data-mining strategies and to implement them as software on Unix platforms. Applied knowledge of working with relational databases and the creation of web-based user-interfaces.
Experiences in infectious disease related research would be an asset. As a member of an international, cross-disciplinary team, excellent written and spoken communication skills are essential.

Contacts:Please apply directly via www.novartis.com, Job ID: 18723

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28/05/2003[AGMM]ATER - Bioinformatique - Lille
Source:BioDocs
Date de parution:28/05/2003Date limite de réponse:28/05/2003
Lieu:Lille (France)Statut:ATERSecteur:public
Description de l'annonce:
L'Universite de Lille 1 dispose de postes d'ATER en informatique, avec des besoins d'enseignement en bioinformatique. Les formations concernees sont : DESS Bioinformatique, DESS Proteomique,
DESS Genie Cellulaire, IUP Proteomique et Maitrise de genetique.

La recherche se ferait dans l'equipe Bioinfo du LIFL.

La date limite d'envoi des dossiers est le 28 mai : http://www.univ-lille1.fr/personnels/ater/recrutement_ater.htm
Contacts:N'hesitez pas à me contacter pour avoir plus d'informations :
Helene Touzet, au 03 20 43 68 02 ou touzet@lifl.fr

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21/05/2003[AG]Postdoc modele « plante virtuelle »
Source:ABGt-2813
Date de parution:05/05/2003Date limite de réponse:25/05/2003
Lieu:Grignon (78) (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Integration dans un modele « plante virtuelle » des relations
source-puit et de la senescence au cours du remplissage des grains chez le ble.

Date de debut de diffusion du poste : 05/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 25/05/2003

Contexte des travaux de l’equipe
L’equipe met au point des modeles de fonctionnement de plantes et de population de plantes. Nous developpons en particulier des modeles de « plante virtuelle», fondes sur une representation informatique realiste des plantes. Nous cherchons a integrer dans cette approche les processus essentiels pour la simulation des interactions entre la plante et son environnement, en particulier les stress biotiques (maladies) et abiotiques (ozone,
carence azotee).
Il apparait que l’impact de ces stress est en grande partie lie a une acceleration de la senescence foliaire, probablement due aux modifications des sources et puits de carbone et d’azote. La modelisation de l’effet des contraintes necessite donc la mise au point d’un modele mecaniste de senescence foliaire. Le choix de l’approche « plante virtuelle » permettra de realiser l’integration sur la base d’une representation detaillee des processus, au sein de la plante et dans le temps.

Resume de la proposition : Lors du remplissage des grains chez les cereales, la demande d’azote est superieure aux possibilites de prelevement racinaire et le complement est fourni par remobilisation a partir des organes aeriens. Il en resulte une diminution de la photosynthese qui affecte l’activite racinaire, et accelere le processus. L’objectif de la these sera de mettre au point un modele exprimant ces interactions, et d’evaluer en particulier si la boucle de retroaction decrite plus haut permet de rendre compte de la progression de la senescence foliaire au cours du temps, dans differentes conditions environnementales. Le modele sera developpe selon une approche plante virtuelle developpee dans l’equipe, qui permettra de prendre en compte de facon precise la progression de la senescence au sein de l’architecture et son impact sur l’acquisition du carbone.
La recherche est donc fondee sur l’investigation de processus biologiques, elle inclut une composante importante en modelisation.

Lieu de Travail
INRA : Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France

Profil recherche
Nous recherchons de preference un candidat de formation initiale en biologie, motive par la formalisation mathematique et informatique.

Le candidat doit avoir effectue son DEA en France.
Les candidatures selectionnees par l’equipe seront soumises fin mai a l’Ecole doctorale ABIES pour la decision quant a l’attribution de l’allocation de recherche.
Contacts:Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à :
Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003[AG]charge de cours en bioinformatique
Source:ABGe-1159
Date de parution:?Date limite de réponse:29/05/2003
Lieu:Bruxelles (Belgique)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 13/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 29/05/2003

OUVERTURE DE POSTE

L'Universite Libre de Bruxelles annonce l'ouverture, a partir du 1er octobre 2003, d'un poste de charge de cours a temps plein en bioinformatique en Faculte des Sciences.

Les candidats doivent etre titulaires d'un doctorat en Sciences (ou d'un titre equivalent), et aire etat d'une experience soutenue de recherche de haut niveau portant sur un ou plusieurs
aspects de la bioinformatique: genomique ou proteomique comparative, structurale ou fonctionnelle, modelisation de processus cellulaires, conception rationnelle de molecules biologiquement actives, etc...

Une grande importance sera donnee aux synergies qui pourront s'etablir entre le nouveau charge de cours et les unites de recherche actives en bioinformatique a l'ULB. Le nouveau charge de cours participera a la promotion de la bioinformatique en tant que science interdisciplinaire.

Les candidats doivent egalement faire preuve de dispositions pedagogiques pour l'enseignement superieur. Le candidat retenu se verra attribuer des charges d'enseignement dans le cadre du DEA inter-universitaire en bioinformatique (en langue anglaise). Ces charges seront progressivement completees par des enseignements de 1er ou 2me cycle.

Si le candidat retenu n'appartient pas au personnel enseignant ou scientifique de l'ULB, ou au personnel definitif du Fonds National de la Recherche Scientifique travaillant a l'ULB, il sera engage a titre temporaire pour une periode a trois ans. A l'issue de cette periode, et moyennant une decision du Conseil d'Administration de l'Universite, son engagement fera l'objet d'une nomination a duree indeterminee sur le budget de fonctionnement de l'Universite.

Toutes les informations sont disponibles sur le site :
http://www.ulb.ac.be/docs/greffe/vacances/academique/index_6.html

la reference de l'offre est : 28.04.03/IV.21

Les candidats sont invites a retirer un modele de presentation du curriculum vitae sur le site http://resu1.ulb.ac.be/tools/CV-type.rtf. La candidature accompagnee dudit curriculum vitae, d'un resume des activites precedentes et d'un projet de recherches, doit etre adressee en deux exemplaires a M. Pierre de Maret, Recteur de l'Universite Libre de Bruxelles, 50 avenue Roosevelt, 1050 Bruxelles. Le candidat priera deux personnalites d'envoyer une lettre de recommandation a M. Guy Latouche, Vice-Doyen de la Faculte des Sciences, ULB, CP 212, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles, qui, par ailleurs, se tient a disposition pour toute demande d'information.

La date limite du depot des candidatures est fixee au 29 mai 2003
Contacts:Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
contacts, la source
(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003[AG]Postdoc
Source:
Date de parution:21/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Boston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
If you know of any potentially qualified and interested recent PhD in computer science, math, stats, or physics who is interested in computational biology/bioinformatics, please urge them to contact me directly concerning an open postdoctoral position to work with me in the Department of Biology at Boston College.

Current projects concern algorithm design for the analysis of time series oligonucleotide and cDNA array data, RNA structure prediction, and extensions/refinements of aspects of sequence alignment.

Essential skills required: strong programming ability (especially in C/C++ and python or perl), some probability theory. Some background in computational biology would be helpful, but for someone really interested, this can be learned.

The Boston area has many opportunities in computational biology/bioinformatics, both academic and industrial. The weekly MIT Bioinformatics Seminar, co-organized by Bonnie Berger and myself, facilitates potentially useful future contacts, and the Boston area is home to a number of leading biotech and pharmaceutical companies involved in bioinformatics research (such as Novartis, Millenium, Serono, Lion Bioscience, US Genomics,etc.).
Contacts:Peter Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor, Biology Department
Courtesy appt. Computer Science Department
Boston College
Higgins Hall 416 140 Commonwealth Avenue
617 552 1332 (office) Chestnut Hill, MA 02467
617 552 2011 (fax)
http://cs.bc.edu/~clote/
clote@bc.edu

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21/05/2003[AG]Ingénieur de Recherche en bioinformatique campagne NOEMI
Source:BioInfo
Date de parution:21/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Gif-sur-Yvette (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Un poste d'Ingénieur de Recherche en bioinformatique (Ingénieur expert en développement d'applications) est ouvert dans notre unité au titre de la campagne Noemi
(http://web.dsi.cnrs.fr/afip/owa/consult.affiche_fonc?code_fonc=C60087&code_
corps=IR&code_dr=4&code_bap=E&code_ds=60&nbjours=). Il s'agit d'un concours interne CNRS, mais qui est également ouvert à des personnes issues d'autres organismes publiques sous certaines conditions.

Mission :
Réaliser le développement de logiciels et/ou d’interfaces de bases de données nécessaires au maintien et à l’évolution de l’environnement bioinformatique de la plate-forme de protéomique de l’UMR de Génétique Végétale du Moulon.
Cet environnement concerne l’organisation, la gestion et l’analyse des données produites. Les développements seront donc réalisés autour de la base de données de la plate-forme ainsi que sous forme de logiciels indépendants.
L’ingénieur interagira avec les différents acteurs de la plate-forme (chercheurs, ingénieurs) et définira avec eux les solutions à apporter à leurs besoins.

Activités :
- Réaliser le développement de logiciels (spécification, conception, maquettage, codage et tests)
- Assurer la mise en œuvre des applications (installation, assistance, formation, évaluation)
- Assurer l’évolution des applications en relation avec les besoins scientifiques, techniques et de gestion
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine
d’application et les experts du domaine

Compétences :
- Connaissance approfondie de l’environnement UNIX et du langage C/C++ .
Une bonne pratique des langages Java, Perl, PHP et SQL sera appréciée ;
- Connaissance des architectures client/serveur ;
- Solides compétences en statistiques et analyse de données ;
- Capacité à travailler en équipe ;
- Capacités managériales ;
- Maîtrise de l'anglais technique du domaine.

Contexte :
L’ingénieur travaillera au sein de la plate-forme de protéomique de l’UMR de Génétique Végétale du Moulon, dont plusieurs équipes sont impliquées de longue date dans les analyses de protéomique. Cette structure est par ailleurs « plate-forme technique l’IFR 87 « la Plante et son Environnement ».
Il sera épaulé par les autres bioinformaticiens de l’UMR avec lesquels il sera amené à collaborer.

Pour plus de détails, consulter le site du CNRS :
http://web.dsi.cnrs.fr/afip/owa/consult.accueil ou me contacter.
Contacts:Johann JOETS
UMR de Génétique Végétale du Moulon
Ferme du Moulon
91 190 Gif-sur-Yvette
tel : 330(1)69332378
fax : 330(1)69332340

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21/05/2003[AG]Postdoctoral opportunities in Biological Classification and
Source:BioInfo
Date de parution:21/05/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Caroline du Nord (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
We seek two postdoctoral fellows to participate in a large, NSF and Mellon-funded ITR Project directed at development of a technology framework for data discovery, integration, and visualization for biodiversity research. The persons in these positions will be involved specifically in development of standards, methods, and tools for representing biological nomenclature and classification information.
Even though the rules of taxonomy are quite specific, taxonomic understanding is dynamic, leading to constant changes in the taxonomic entities, the names applied to those entities, and their phylogenetic relationships.
Consequently, taxonomic concepts and the application of names to those concepts vary through time and with the authority employed. Effective integration of data from diverse sources requires that the multiple and overlaping taxonomic concepts be tracked, as well as the multiple names that have been applied to them. We envision that the need for data integration will reshape the way organisms are reported in biodiversity
and ecological data and publications, and the way biological taxonomists and ecologists conduct, report, and disseminate their research.
Developing this link between ecology, systematics, and informatics is crucial to developing effective and useful ecological informatics tools.
The postdocs will work directly with researchers at NCEAS and the
University of North Carolina, and will be expected to locate at one of these institutions. Strong background in both biological systematics and computer and database skills is desirable. Send applications and at least two letters of recommendations by May 26 to Robert K. Peet, Dept. of Biology, CB#3280, University of North Carolina, Chapel Hill, NC
27599-3280, 919-962-6942, peet@unc.edu.
Contacts:Robert K. Peet, Professor Phone: 919-962-6942
Department of Biology, CB#3280 Fax: 919-962-6930
University of North Carolina Cell: 919-368-4971
Chapel Hill, NC 27599-3280 USA Email: peet@unc.edu

http://www.bio.unc.edu/faculty/peet/

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24/04/2003[MM]Post-Doctorat au CEA Saclay
Source:BioInfo
Date de parution:24/04/2003Date limite de réponse:15/12/2003
Lieu:Saclay (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Titre: Post-Doctorat au CEA Saclay: Simulation moléculaire du transporteurABC bactérien MsbA inséré dans une membrane en vue de modéliser l'action de la Pgp

Présentation du laboratoire:
Le stage se déroulera au Service de Biophysique des Fonctions Membranaires (DBJC / DSV), dans le cadre d'une collaboration entre le Laboratoire de Biophysique des Protéines et des Membranes et le Laboratoire de Transport Membranaire et Détoxication, au Centre d'Etudes de Saclay (91).

Description de la mission proposée:
La P-glycoprotéine (P-gp) est un transporteur membranaire actif de détoxication cellulaire appartenant à la grande famille ABC ("ATP Binding Cassette"). Remarquablement multispécifique, la P-gp transporte de nombreux xénobiotiques amphiphiles, et nous venons de montrer qu'elle transporte un lipide membranaire, le cholestérol, vers le feuillet externe de la membrane. La protéine MsbA, transporteur ABC bactérien homodimérique, est très proche de la P-gp en terme d'homologie de séquences. C'est aussi un bon homologue fonctionnel de la P-gp puisqu'elle transporte un lipide létal pour la bactérie.
Une structure à haute résolution de MsbA vient d'être publiée. La forme très particulière, "en V" fortement ouvert, du dimère de MsbA est atypique pour une protéine membranaire, et pose le problème de la distribution des lipides autour de la protéine. Déterminer cette distribution permettrait d'avancer vers la compréhension des mécanismes de transport de la MsbA, mais aussi de la P-gp. Seule la simulation moléculaire est actuellement en mesure de fournir une telle information. Nous nous proposons donc d'obtenirpar simulation moléculaire un modèle du système MsbA-membrane, permettant en premier lieu de décrire l'interfacep rotéine-lipide, puis de localiser le site de liaison de son substrat physiologique. L'objectif est de proposer un mécanisme de transport pour ces transporteurs ABC. Ce travail sera effectué en collaboration avec notre équipe de simulation moléculaire.

Formation et profil requis:
Solide bagage en simulation moléculaire des protéines, avec utilisation des programmes CHARMM (de préférence), ou AMBER, ou GROMACS; bonne connaissance des protéines (plus particulièrement celles associées aux systèmes membranaires) permettant ultérieurement d'aborder la problématique de la modélisation par homologie.

Informations générales:
Le poste est à pourvoir dès maintenant et avant le 15/12/03. Le contrat proposé est un CDD de 1 an renouvelable une fois.

Lieu de travail: Centre d'Etudes de Saclay (RER Le Guichet, près d'Orsay).
Contacts:Procédure de dépôt de candidature:
Envoyer par e-mail à Stéphane Orlowski (orlowski@dsvidf.cea.fr) un CV détaillé et une lettre de motivation.

Stéphane Orlowski, SBFM / DBJC, Centre d'Etudes de Saclay, 91191
Gif-sur-Yvette cedex.

Tel: 01 69 08 95 77; FAX: 01 69 08 81 39.


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24/04/2003[AG]computational biology/bioinformatics
Source:BioJobs
Date de parution:24/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Memphis (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
A postdoctoral position in computational biology/bioinformatics is available in Dr. Yan Cui’s lab at Univeristy of Tennessee Health Science Center (Memphis, TN). We are interested in DNA microarray data analysis, gene network inference and protein structure prediction (http://compbio.utmem.edu).

Ph.D. degree, researh experiences in bioinformatics or related fields, computer programming skills in C/C++ are required.

The successful candidate will be able to take advantage of high
performance computing facility including a new 48-processor Beowulf cluster.

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this
announcement.]
Contacts:
For immediate consideration send your CV to Dr. Yan Cui
(ycui2@utmem.edu)

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18/04/2003[AG]Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique
Source:BioInfo
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:25/04/2003
Lieu:Montpellier (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Référence à rappeler : DRH ca-705
Date de publication : 07/04/2003
Date de clôture : 25/04/2003

Descriptif du poste :
Au sein de l'équipe «Analyse du génome» du programme canne à sucre et de l'UMR « Polymorphismes d'intérêt agronomique » et pour assurer le suivi de plusieurs développements intervenus récemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
- la poursuite du travail sur les « Single Nucléotide Polymorphism »
(SNP) comme outils de génotypage chez la canne à sucre
- l'exploitation des collections dESTs de canne à sucre produites à la FAPESP au Brésil et de maïs et blé produites par le programme Génoplante pour le marquage de caractères dintérêt agronomique chez la canne à sucre
- l'appui à l'analyse bio-informatique de séquences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gène de résistance à la maladie de la rouille chez le cultivar de canne à sucre R570
- la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du
déséquilibre de liaison pour le marquage de gènes d'intérêt agronomique chez la canne à sucre

Profil souhaité :
Doctorat en génétique avec maîtrise des techniques moléculaires, ou en biologie moléculaire
Expérience significative en génétique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de séquences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : CDD de remplacement (11 mois minimum)
Date de prise de fonction : immédiate
Contacts:Renseignements : Angélique DHONT, ca-cas, Tél. 04-67-61-59-27

Candidatures à adresser à :
Bernadette VINCENT (bernadette.vincent@cirad.fr)
Adresse postale : TA 70 / 09 Ave Agropolis 34398 Montpellier

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17/04/2003[MM]Cadre de laboratoire - CDD 18 mois - modelisation moléculaire
Source:ABG-7751
Date de parution:14/04/2003Date limite de réponse:11/05/2003
Lieu:Chilly Mazarin (91) (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
ABG-7751-Cadre de laboratoire - Post Doc CDD 18 mois - modelisation moleculaire - SANOFI-SYNTHELABO - region Paris, France

Date de debut de diffusion du poste : 14/04/2003
Date de fin de diffusion prevue : 11/05/2003

SANOFI-SYNTHELABO RECHERCHE offre un poste en CDD (Cadre Post-Doc) de 18 mois (12 + 6 mois) en modelisation moleculaire, au sein de son departement cardiovasculaire-thrombose. Ce departement se consacre a la decouverte de nouveaux medicaments et regroupe des activites de recherche en chimie et en biologie.

Poste disponible des le 1 juin 2003.

Missions : Le projet innovant concerne l’etude des interactions
proteine-proteine et des interactions proteine-ligand via la construction de modeles par homologie et le developpement de methodologies de criblage virtuel. Ce projet impliquera des collaborations multidisciplinaires notamment avec des biochimistes, des biologistes structuraux et moleculaires et des chimistes medicinaux.

Qualifications demandees : formation de chimiste ou biochimiste ayant un doctorat en modelisation moleculaire.

Experience : La pratique de logiciels de modelisation moleculaire et de chemoinformatique commerciaux (TRIPOS, ACCELRYS, MDL) est recommandee.

Lieu de travail : Centre de recherche de Chilly Mazarin (region
Parisienne)
Contacts:Merci d'envoyer votre candidature par email a :
Dr. Cyril Daveu , Sanofi-Synthelabo Recherche , 1, Ave. Pierre
Brossolette , 91385 Chilly Mazarin cedex
E-mail : cyril.daveu@sanofi-synthelabo.com

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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17/04/2003[AG]INFORMATICIEN CHEF DE PROJET
Source:BioInfo
Date de parution:15/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le service Bionformatique de l'Institut Curie recrute :
UN INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le
service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7
ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau (6 personnes) pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat sera chargé de la gestion de projets informatiques :
expression de besoins, cahier des charges, définition de l'architecture, développement ou sous-traitance, validation à chaque étape du processus, installation et maintenance. Il aura à participer aux développements et à coordonner trois ingénieurs dans ces missions.
Il aura également à organiser le fonctionnement de l'équipe pour garantir la qualité des développements et des flux d'information.

Compétences :
- Gestion de projets
- Maîtrise d'ouvrage
- Architectures client-serveur et multi-couches
- SGBD relationnels (modélisation et administration)
- conception UML
- Apache (administration)
- Environnement de développement Unix et Windows
- Développement sous C/C++, Java (Swing, AWT, JSP, RMI), Perl, PHP
- Connaissances métier en bioinformatique
- Anglais courant
5 ans d'expérience minimum
Salaire selon profil et expérience
Contacts:Merci d'envoyer vos CV, lettre de motivation et prétentions en précisant la référence BI4 à :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie - Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

Tél. : 01 42 34 65 27
Fax : 01 42 34 65 28

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15/04/2003[AGMM]2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology
Source:BioInfo
Date de parution:15/04/2003Date limite de réponse:09/05/2003
Lieu:Maynooth (Irelande)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Applications are invited for two appointments in the general areas of proteomics/bioinformatics and molecular microbiology. Outstanding candidates in other areas of modern biology are also encouraged to apply. Appointees will be expected to be fully involved in the Department's undergraduate and postgraduate teaching programmes and to develop an internationally competitive research programme in their areas of expertise.

Salary scales (new entrants)

Lecturer - Euro 42,064 - 68,188 p.a. (7 points)
Junior Lecturer - Euro 29,214 - 34,401 (5 points)

Applications in writing, including a full C.V., a list of publications and a brief account of future research objectives, together with the names, addresses, fax, telephone numbers and e-mail address of three referees, should be forwarded to the Personnel Officer, so as not to arrive later than Friday, 9 May 2003.
Contacts:Prior to application, further details of the posts may be obtained from the Personnel Officer, National University of Ireland, Maynooth, Maynooth, Co. Kildare, Ireland.

Confidential Fax No: +353 1 708 3940
E-mail: personnel@may.ie

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14/04/2003[AG]Sanger Institute Postdoctoral Fellowships
Source:http://www.sanger.ac.uk/careers/postdoc/
Date de parution:14/04/2003Date limite de réponse:30/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of experimental and computational genome research. We are recognized leaders in genome sequencing, high throughput systems, informatics and analysis of gene function using genetic approaches in a variety of model organisms and humans.

Applications are invited for Postdoctoral Research Fellowships within the Sanger Faculty. This is an exciting opportunity to begin an independent research career in state of the art genomics facilities. Successful candidates will be awarded a fellowship with a starting salary of circa £25,000 p.a. plus excellent benefits. This post is initially offered for two years after which it is expected that the candidate will seek independent support. We are particularly interested in hearing from candidates who have completed their Ph.D within the last year.

Applications
To apply please complete the on-line application form here and attach Degrees, (including grades, GPA or equivalent, dates)
a one page description summarising your research accomplishments to date a list of your publications a two page synopsis of the proposed research programme

NB
You are also expected to arrange for three letters of reference to be sent under separate cover to arrive with the Postdoctoral Committee by the closing date. These can be sent by email to pdc@sanger.ac.uk

If you are interested you must contact current Sanger Institute Faculty members to discuss potential projects in the first instance. A full list of Faculty members is shown here, which includes their contact information and research interests.

The closing date for applications is 30th April 2003. Applications received after this date, or those which do not conform to the above criteria will not be accepted.

Questions regarding this process can be e-mailed to pdc@sanger.ac.uk or by contacting Human Resources on tel:+44 (0)1223 834244.

Postdoctoral Committee
Human Resources
The Wellcome Trust Sanger Institute
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SA
ENGLAND

Email: pdc@sanger.ac.uk
FAX: +44 (0) 1223 494919

Eligibility
Candidates for this programme will be encouraged from all nations. Candidates will have recently (within one year) completed their PhD or are close to completion (e.g. at thesis submission stage). In the latter case, award of a Sanger Postdoctoral Fellowship will be subject to successful completion of the PhD. Alternatively, candidates may chose to apply at a later time. Applications of more experienced candidates (five plus years after completion of PhD), who are considering a career change, may be considered on a case by case basis. Sanger internal applicants are eligible only if not already employed on a postdoctoral contract. Applications for 'tail end funding' will be considered on a case by case basis for all Sanger postdocs.

Ideally, candidates should have several first author publications from their PhD work. Applications will be considered four times per year.

Deadlines
The application deadline for the next committee meeting is: 30th April 2003.

Preliminary application deadlines for 2003 are:
January 31st Concluded
April 30th Now open for applications
July 31st
October 31st
Contacts:
For any further inquiries, please feel free to contact the Sanger Institute's Postdoctoral Committee at the above address.

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14/04/2003[AG]Computer Biologist - Metabolic Disease Group
Source:
Date de parution:14/04/2003Date limite de réponse:18/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Computer Biologist - Metabolic Disease Group (Ref: 560)

Closing Date: 18th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Metabolic Disease Group is a new group at The Wellcome Trust Sanger Institute; our aim is to apply genetic approaches to study type 2 diabetes and obesity. We are following a candidate gene approach and will be investigating the putative role of hundreds of genes via genetic association studies and functional analysis of mutations. We are seeking a Computer Biologist to provide support to the data handling activities of the group, this will involve close collaborative work with other groups at the Institute, in particular the Human Genetics Informatics group.

Informal enquires may be made to Inês Barroso (ib1@sanger.ac.uk)

The ideal candidate for will have at least two years post graduate experience of programming in a UNIX/LINUX environment, using one or more of the following: perl, C, java, javascript, plsql. A familiarity with RDBMS and a working knowledge of perl are essential. The role involves working closely with laboratory scientists and collaboration with other informatics groups, strong communication skills are required.
Contacts:To apply for these positions please write with your CV and current salary details quoting the reference number to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA

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08/04/2003[MM]Computational Chemists
Source:
Date de parution:08/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:New York (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics, or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills. Relevant areas of experience might include the computation of protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecu lar systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.
Contacts:Please send your resume (including list of publications, thesis topic, and advisor, if applicable), along with a history of academic performance (including GPAs as well as SAT, GRE, and other standardized test scores), to . SALARY $ 100,000- 150,000 depending on experience there is flexibility.
SUBMIT RESUMES TO:
Concepts in Staffing
ATT: Norm Davis
normd@cisny.com

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08/04/2003[AG]Postdoctoral job opening in Computational Biology
Source:
Date de parution:08/04/2003Date limite de réponse:01/06/2003
Lieu:Boston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
The Department of Biology at Boston College has available a postdoctoral position for work in the CLOTE LAB in computational biology/bioinformatics with start date June 1, 2003.

Requirements include a recent Ph.D. in computational biology/bioinformatics or strongly computational field such as computer science, mathematics, statistics, physics, chemistry. Strong programming skills are necessary, preferably in C/C++ and Python, as well as ability in mathematical modeling, probability and statistics. Current research projects in the Clote Lab include modeling of RNA and protein, functional genomics, applications of machine learning theory to bioinformatics, and mathematical evolution theory.

Boston College provides a supportive, collegial environment with good Ph.D. program in biology, close proximity for possible research collaborations with other universities in the Boston area, and a very pleasant campus ambience.
Contacts:For more information, please contact:
Peter G. Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor of Biology and Computer Science (courtesy appt)
Boston College
Chestnut Hill, MA 02467
Email: clote@bc.edu
http://www.cs.bc.edu/~clote
http://www.bc.edu/biology
Tel: 617 552 1332
Fax: 617 552 2011

To apply please send either a hardcopy or email application.
Application materials should include a CV,names and addresses of three references. For hardcopy applications please send reprints or preprints of articles. For email applications, please email pointers to on-line articles (please do NOT email the articles).

Applications will be evaluated from now on until the position is filled.

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07/04/2003[MM]SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:15/05/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/22
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg: SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany

Commencing Date: As soon as possible after closing date
Job Description: The work will involve development of graphical user interfaces (to be built on the existing modules), support of the Web and Email server, support of remote execution of ARP/wARP jobs on local mulit-processor computer cluster.

Qualifications and Experience: Applicants should have a computational background and experience in the design of GUI. Profound knowledge of C/C++, Java/Javascript, Perl, Tcl/Tk, HTML or Python programming environments is required. Some familiarity with crystallography will be of advantage.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03
EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de

Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/22, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:15/05/2003
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/21
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany Commencing Date: As soon as possible after closing date Job Description: The work will involve research, development and/or coding the software modules in the areas of information theory, estimation theory, statistical pattern recognition, neural networks for information reduction and computer learning, independent component analysis - all applied for 3-dimensional image interpretation. The emphasis is on computational techniques.

Qualifications and Experience: Programming experience and familiarity with some of the above-mentioned areas are essential.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03

EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de
Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/21, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/PD/05
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Applications are invited for a postdoctoral fellow position at the EMBL Outstation in Hamburg, Germany. The work will involve development of tools and protocols for assembling, tuning and running software modules, specifically for structure solution, improvement of crystallographic phases, automatic interpretation of electron density maps and assessment of quality of X-ray data and structural models. A background in protein crystallography and interest in methodology is essential. Emphasis will be on computational techniques. Familiarity with computer programming, statistics and mathematical algorithms is advantageous. Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.
Contacts:To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/PD/05, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003[MM]Post-doctoral Postion in Structural Genomics
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Yale (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Applicants are invited for a post-doctoral post in the Department of Molecular Biophysics and Biochemistry at Yale University. The position is for two years with possible extensions. Choice of project would to some degree depend on the applicant's interests and abilities, though it is expected that the research will be purely computational and will fall into the emerging field of structural genomics: classifying protein fold families in genomes, developing sequence and structure comparison techniques, and developing databases and analyses for the new genomic information. The ideal applicant would have a PhD (preferably in bioinformatics, biophysics, genetics, or computer science) and have already had some experience in one of the above-mentioned research areas. He or she would be very skilled in programming and using the computer to solve problems (e.g. experience with C/C++, perl5, SQL, HTML/java, fortran, blast/fasta, excel/word, Irix/linux, and so on).
Contacts:Please contact Mark Gerstein for further information (MB&B Department, PO Box 208114, Bass Center, Yale University, New Haven, CT 06520, FAX 203 432 5175, Mark.Gerstein@Yale.edu).

Applicants are requested to send a CV that includes a list of publications and details of 3 references. Normal e-mail is OK for all correspondence. However, copies of official documents should follow by regular post. Further details about the position and structural genomics research at Yale can be obtained over the web at: http://bioinfo.mbb.yale.edu/genome.

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07/04/2003[AG]Poste d'enseignant-chercheur à l'Ecole des Mines de Paris
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:15/05/2003
Lieu:Paris (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
Ce poste, localisé au Centre de Géostatistique à Fontainebleau, comporte une activité principale d'enseignement couplée à une activité de recherche.

Enseignement
L'activité d'enseignement recouvre la responsabilité de l'option "biotechnologie" (organisation des activités pédagogiques liées à
l'option) set de l'enseignement spécialisé "Introduction aux
biotechnologies" dans le cursus des ingénieurs civils de l'Ecole des
Mines, ainsi qu'une charge d'enseignements fondamentaux et appliqués dans ces deux cursus.

Un complément d'information sur l'Option Biotechnologie est disponible à l'adresse suivante : http://www.ensmp.fr/Fr/Formation/2emeCycle/IngCivil/Options/Option-Biotechnologie.html

Recherche
Les activités de recherche se dérouleront au sein du groupe
"Bioinformatique", créé au Centre de Géostatistique à l'automne 2002. Il
participera aux projets de recherche inscrits dans la thématique de
l'équipe concernant l'intégration, la modélisation et l'exploitation de
données hétérogènes en post-génomique (séquences et structures
biologiques, données d'expression, réseaux d'interaction et de
régulation...) avec des applications en génomique fonctionnelle et
structurelle, biologie des systèmes, analyse de voies métabolique et
recherche pharmaceutique. Il sera également invité à proposer de
nouveaux thèmes de recherche sujets à collaboration au sein de l'équipe
et avec des partenaires extérieurs.

De plus amples informations pourront être trouvées sur le serveur du
groupe de bio-informatique : http://cg.ensmp.fr/Bioinfo

Au cours de ses activités de recherche et d'enseignement, le candidat
développera des relations de partenariat étroit avec des industriels et recherchera des financements externes institutionnels et privés.

Profil du candidat
Titulaire d'un doctorat, le candidat devra avoir une bonne connaissance
des domaines de la biophysique, de la biologie moléculaire ou de la
bioinformatique et être fortement sensibilisé aux applications, enjeux
et acteurs des biotechnologies. Un séjour post-doctoral à l’étranger
sera un plus. Une insertion dans les réseaux scientifiques
internationaux et une connaissance du milieu industriel seront
particulièrement appréciées.

Le dossier de candidature comprend :
- Un Curriculum Vitae détaillé ainsi qu’une liste de publications
- Une ou plusieurs lettres de recommandation
- Un projet de recherche

Les dossiers devront parvenir avant le 15 mai 2003 à Mr. Michel Schmitt
Ecole des Mines de Paris
60, Bd Saint Michel
75272 PARIS-Cedex 06

Une description plus précise et une version papier de ce poste est disponible à l'adresse suivante: http://cg.ensmp.fr/Bioinfo/news/poste_biotech.html
Contacts:Pour tout renseignement concernant le profil de l'emploi, vous pouvez contacter :
- Michel Schmitt, Directeur de la Recherche, (michel.schmitt@ensmp.fr
; Tél : +33 1 40 51 92 45 )
- Nicolas Cheimanoff , Directeur des Etudes (nicolas.cheimanoff@ensmp.fr)
; Tél : +33 1 40 51 91 33)
- Jean-Philippe Vert, Responsable de la Bioinformatique au Centre de Géostatistique (jean-philippe.vert@ensmp.fr
; Tél : +33 1 64 69 47 82)

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07/04/2003[AG]Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:30/04/2003
Lieu:Genève (Suisse)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le groupe Swiss-Prot (http://www.expasy.org/sprot) de l'Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.isb-sib.ch/) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de levures (S. cerevisiae, S. pombe, etc..) dans la base de données Swiss-Prot .

Le projet a pour but une annotation de qualité des protéomes de levures. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l’annotation manuelle des protéines. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

Nous offrons ce poste au sein d’une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s’intégrerait avec plaisir dans ce cadre. D’autre part, ce travail implique une collaboration étroite avec l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI) (http://www.ebi.ac.uk/), Hinxton, UK, et nécessitera des déplacements réguliers à l’étranger.

Conditions indispensables :
Biologiste ou biochimiste, expert en biologie des levures. Bonne connaissance de l’anglais. Travail à temps complet. Nationalité : suisse ou permis C. Bonne motivation pour travail en équipe. Motivation claire pour Swiss-Prot.
Contacts:Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu’au 30 avril 2003, à : Claudia Sapsezian Levure Institut suisse de bioinformatique CMU 1, rue Michel-Servet 1211 Genève 4 Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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07/04/2003[AG]RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS
Source:
Date de parution:07/04/2003Date limite de réponse:24/04/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
EMBL/V/03/37
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS

Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications

Duty Station: Hinxton, UK

Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: A research associate position is available in Dr Nick Goldman's research at the EMBL-European Bioinformatics Institute (EBI). The group undertakes research into the evolutionary analysis of DNA and protein sequences. The core research in the group is into computational data analysis methods, and in particular the probabilistic modelling of molecular evolutionary processes and statistical inference based on these models. We also have interests in applications of existing and novel sequence analyses, and benefit from close association with other research and database groups at the EBI (see http://www.ebi.ac.uk/Groups and http://www.ebi.ac.uk/Databases)

The research associate would work with Nick Goldman and other members of the group on issues relating to evolutionary sequence analysis. It is expected that these would include phylogenetic methodology, and may also include specific biological applications. The position permits great freedom for the successful applicant to become involved in research projects already underway in the group (for example, detection of adaptive evolution, analysis of patterns of DNA mutations in both genomic and protein-coding sequences, analysis of patterns of amino acid replacements over evolutionary timescales, relationship of protein structure and evolution, comparative analysis of genome-scale sequences) and to develop her/his own interests and research proposal; the successful candidate will be encouraged to do both of these things.


Qualifications and Experience: It is expected that the successful
applicant will have a Ph.D., and ideally some further research experience, in a related field. Exceptional post-graduate candidates with research experience may also be considered. Necessary qualifications include understanding of and enthusiasm for the questions molecular biologists need to ask of sequence data, experience of mathematical modelling and statistical data analysis, and scientific computer programming. Candidates with backgrounds in biology, mathematics/ statistics or scientific computer programming will be considered.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 24.04.2003

Note: There is also the possibility of one or more post-doctoral fellowships being awarded to permit researchers with established molecular phylogenetics projects to work with Nick Goldman's group for periods of approx. 2-6 months.
Contacts:Anyone interested in this possibility is encouraged to contact Nick Goldman directly.

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06/04/2003[AG]bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS
Source:BioInfo
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:10/04/2003
Lieu:Nancy (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS INRIA-UHP-INPL recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses étant réalisées au MAEM.
Contacts:Réponse nécessaire avant le 10 avril 2003 à adresser à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 : Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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06/04/2003[AG]BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN
Source:BioInfo
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le groupe Bionformatique de l'Institut Curie recrute :

UN BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat travaillera à l'analyse des données génomiques (séquences, puces, réseaux génétiques) issues des différentes plate-formes technologiques de l'Institut et de ses partenaires. Son implication couvrira le développement des aspects méthodologiques, leur implémentation informatique et les analyses proprement dites.

Compétences :
- Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (analyse de séquences, analyses des données de puces)
- Modélisation et analyse de données
- Maîtrise des packages mathématiques et statistiques classiques (R/S+, Mathlab, Spotfire …)
- Maîtrise d'un langage de programmation (C/C++, Java, Perl …)
- Expérience des environnements Unix et Windows
- Anglais courant

Formation souhaitée : Ingénieur Grande Ecole ou 3ème cycle

Salaire selon profil et expérience
Contacts:Personne à contacter, en précisant la référence BI2 :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie Section Recherche
Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

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06/04/2003[AG]Poste de professeur en génétique & bio-informatique
Source:
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:21/03/2003
Lieu:Toulouse (31) (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Poste de professeur en génétique & bio-informatique à l'Université de Toulouse
Section 65, Emploi nº 1312, analyse des génomes.
Date limite de dépôt des candidatures : 21 mars 2003

Profil Recherche :
Le LMGM souhaiterait accueillir un Professeur de Génétique pour créer une équipe s’intéressant à une thématique à l’interface de la Génétique et de la Bio-informatique centrée sur l’Analyse des Génomes et la Génomique Evolutive des Procaryotes. Cette thématique s’intégrerait parfaitement au sein de l’UMR 5100, la nouvelle équipe venant en complément de six (des neuf) équipes du LMGM qui développent leurs projets dans le cadre de deux (des trois) thématiques majeures de l’Unité, ‘‘Organisation et Dynamique du Génome’’ et ‘‘Plasticité Génétique’’.

Profil Enseignement :
La révolution de la Génomique élargit le champ d'investigation en Génétique. Il est impératif que notre université recrute un collègue capable de manier et enseigner les concepts et les méthodes de cette discipline d'avenir qu’est la Génomique. Le remplacement de Jean-Michel Louarn offre l'occasion d'ouvrir ce nouveau champ, par le recrutement d'un collègue travaillant à l'interface de la génétique et de la bio-informatique dans l’Analyse des Génomes et dans la Génomique Evolutive. Ce collègue devrait pour partie renforcer les enseignements déjà assumés par la commission pédagogique de Génétique. Il lui sera bien entendu également demandé de développer l'aspect Génomique Evolutive en s’appuyant sur les données de séquence génomique complète de très nombreux organismes procaryotes (plus de 80 répertoriés à ce jour) appartenant à des branches évolutives différentes.
Contacts:Les candidats intéressés sont priés de contacter le Directeur du LMGM :

Jean-Pierre Claverys
UMR5100 CNRS-Université Paul Sabatier
Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires
118 route de Narbonne
31062 Toulouse Cedex
France
tel. 05 61 33 58 55 (from outside France: 33 561 33 58 55)
05 61 33 59 11 (from outside France: 33 561 33 59 11)
fax 05 61 33 58 86 (from outside France: 33 561 33 58 86)
05 61 33 58 61 (from outside France: 33 561 33 58 61)
claverys@ibcg.biotoul.fr (e-mail)
http://www-ibcg.biotoul.fr/recherche.html

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06/04/2003[AG]Stage post-doctoral en génomique végétale
Source:
Date de parution:06/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de publication de l'offre : février 2003
Entreprise : Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS

Lieu : 2 rue Gaston Crémieux
CP 5708
91057 Evry

Description de l'activité de l'entreprise : L'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) est localisée sur le site du Genopole d'Evry. Cette unité récemment implantée et spécialisée dans la Génomique des Plantes, est une unité mixte INRA/CNRS (UMR 8114). L'URGV occupe une superficie de 1000 m2 scindée en 2 laboratoires. Un premier laboratoire de 500 m2 se trouve dans le même bâtiment que le Genoscope, le second laboratoire étant dans le bâtiment du Centre National de Génotypage (CNG). L'URGV est équipée d'outils performants pour les manipulations "haut débit" (robots, arrayer, etc.). Nous collaborons étroitement avec le Genoscope et le CNG pour des projets impliquant le séquençage et le génotypage respectivement. L'objectif principal de l'Unité est de développer et d'appliquer des approches modernes en génomique pour l'étude des plantes modèles ou d'intérêt agronomique (voir site web:
www.evry.inra.fr/)




Description du poste : Génomique comparée entre Vitis vinifera et Arabidopsis thaliana.

De nombreux caractères sont importants pour la production de raisins de cuve, qu'ils soient liés à la qualité ou à la résistance aux agents pathogènes. Or, leur analyse est ralentie par le long temps de génération de cette espèce pérenne. En revanche, la petite taille du génome de Vitis vinifera (475 Mb) est un avantage pour le développement d'approches génomiques. La construction d'une carte physique du génome de la vigne a donc été initiée à l'UMRGV avec la construction d'une banque BAC d'ADN de Cabernet Sauvignon clone 412 (44 900 clones, taille moyenne des inserts de 145 kb, au moins 13 équivalents génome), un programme d'ancrage de STS sur ces clones BAC (séquence des deux extrémités de 15 000 à 20 000 BACs). En parallèle, des stratégies vont être développées dans l'objectif d'utiliser les données obtenues sur la plante modèle Arabidopsis pour accélérer les recherches sur la vigne. Dans ce cadre, nous souhaitons évaluer dans quelle mesure la connaissance de la séquence du génome d'Arabidopsis pourrait aider à la construction de la carte physique du génome de la vigne en combinant des approches bioinformatiques et de cartographie physique. Le stage implique des interactions entre l'équipe travaillant sur l'organisation des génomes de plantes cultivées (blé, colza, peuplier et vigne), et l'équipe bioinformatique, qui regroupe de façon unique des compétences en analyse des génomes, annotation, construction de bases de données et interfaçage.

Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003

Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable 1 fois
Contacts:Contact : Anne-Françoise Adam-Blondon
Tél.: +33 (01) 60 87 45 34
adam@evry.inra.fr

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06/04/2003[AG]POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM
Source:
Date de parution:05/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
Au sein d'une équipe de recherche en génétique statistique (INSERM-Université d'Evry), située sur le campus de génomique d'Evry, le(la) candidat(e) participera à un programme de recherche visant à mettre en évidence des facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans des maladies humaines (asthme, mélanome malin) par des analyses statistiques de données familiales (analyses classiques et analyses propres à la génétique)

Missions:
- contribuer à la gestion de données à l'aide de procédures/programmes informatiques
- effectuer des analyses statistiques de données (univariées et multivariée) à l'aide de logiciels statistiques
- contribuer au développement de procédures et programmes
informatiques pour faciliter la manipulation et l'analyse des données.

- contribuer aux analyses génétiques des données à l'aide de logiciels propres à la génétique

Compétences
- Niveau Maîtrise ou DEA/DESS en biostatistique/informatique/épidémiologie
- Maîtrise des environnements informatiques Windows et UNIX (procédures shell)
- Connaissances des logiciels classiques de statistique (SAS, STATA)
- Connaissances en programmation informatique (Fortran, Pascal, C, shell, perl)
- Connaissances de logiciels utilisés en épidémiologie génétique ou volonté de les acquérir.

Aptitudes: Rigueur dans le travail, fiabilité, communication, capacité d'autonomie, disponibilité

Salaire:
- Niveau Ingénieur d'Etude INSERM/Université (à partir de 1 800 Euros brut par mois) à déterminer en fonction de la qualification et des compétences du candidat
- Contrat à Durée Déterminée (un an et renouvelable)
Contacts:Florence DEMENAIS
INSERM EMI 0006
Tour Evry 2
523 Place des Terrasses de l'Agora
91034 EVRY
Tél : 01 60 87 38 26
Fax : 01 60 87 38 48
Mél : demenais@evry.inserm.fr

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06/04/2003[AG]professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques
Source:
Date de parution:05/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Le Departement de Biologie de l ENS-Paris cherche a recruter un professeur animant recherche et enseignement sur le theme: Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques. Celui ci devra mener ses recherches au sein du Departement de Biologie en interaction avec les groupes des Departements de Physique et Informatique.
Contacts:Contacts: A Prochiantz Directeur du Departement de Biologie, prochian@biologie.ens.fr, A Feltz, pour la CS de Biologie 27-28, feltz@biologie.ens.fr

Claude Jacq
Laboratoire de Genetique Moleculaire
CNRS UMR 8541
Ecole Normale Superieure
46 rue d Ulm
75230 PARIS Cedex 05

Tel: 33 1 44 32 35 46 (office)
33 1 44 32 35 70 (secretariat)
mobile: 33 (0)6 61 76 28 98
Fax: 33 (0)1 44 32 37 30 http://www.biologie.ens.fr/microarrays.html

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06/04/2003[AG]23 postes chargés de recherche INRIA
Source:
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:18/03/2003
Lieu: (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
L'INRIA ouvre au concours 23 postes de Charges de Recherche 2eme classe, repartis comme suit sur les differentes unites de recherche :

- 5 postes à l'INRIA Futurs,
- 4 postes à l'INRIA Lorraine,
- 3 postes à l'INRIA Rennes,
- 3 postes à l'INRIA Rhône-Alpes,
- 4 postes à l'INRIA Rocquencourt,
- 4 postes à l'INRIA Sophia Antipolis,

Les postes ne sont pas fleches par projets, et etant donne qu'un certain nombre des equipes INRIA sont axes sur la bioinformatique, n'hesitez pas a consulter la page

http://www.inria.fr/travailler/opportunites/chercheurs/concourscr2.fr.html pour plus d'informations.

Attention, date limite de depot des dossiers : 18 mars 2003
Contacts:

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06/04/2003[AG]professeur de bioinformatique
Source:
Date de parution:06/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lille (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Dans le cadre de la création de l’Institut de Recherches Interdisciplinaires à Lille (http://www.dr18.cnrs.fr/iri/index.htm), l’Université de Lille 1 cherche à recruter un professeur de bioinformatique dont les travaux de recherche concernent l’analyse des séquences régulatrices, le développement de banques de données pour l’étude des réseaux de régulation transcriptionnelle. Des moyens seront alloués pour permettre au candidat retenu de développer une équipe de recherche en collaboration avec les équipes de mathématiciens, de bioinformaticiens et de biologistes de la Génopole de Lille. Chargé de mission pour la création de l’IRI : Bernard Vandenbunder (Bernard.Vandenbunder@ibl.fr)
CNRS UMR 8117 / Institut Pasteur de Lille / Université de Lille 1 Institut de Biologie de Lille 1 rue Calmette BP 447 59021 Lille Cedex (France) Tel : (33) 3 20 87 10 90 Fax : (33) 3 20 87 11 11
Contacts:Nom de la personne à contacter pour l’enseignement : Hélène Touzet
(touzet@lifl.fr)
Nom de la personne à contacter pour la recherche : Jean Marc Geib
(geib@lifl.fr)
Le profil complet du poste se trouve à l’adresse suivante : http://www.univ-lille1.fr/personnels/recrutement/informations.htm


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06/04/2003[AGMM]Postdocs CNRS
Source:AGM2
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:France (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
La liste des laboratoires retenus pour l'accueil des 210 postdocs CNRS est disponible à l'adresse suivante
Contacts:

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06/04/2003[AGMM]poste de maître de conférences en Bioinformatique
Source:
Date de parution:11/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Lyon (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
L'INSA de Lyon propose un poste de maître de conférences en Bioinformatique dont les profils recherche et enseignement sont détaillés ci-après (ces profils sont disponibles sur le site de l'insa : http://www.insa-lyon.fr/recrutement/0095.pdf).


Le maitre de conferences recruté integrera l'equipe "systèmes autonomes" du laboratoire PRISMa pour renforcer son axe bioinformatique et modélisation. Ce groupe travaille en étroite collaboration avec des biologistes de l'INSA et de l'université Claude Bernard Lyon I pour proposer des modèles individus-centrés de systèmes biologiques sur la base d'approches bio-inspirées telles que la vie artificielle, les algorithmes génétiques, les réseaux neuromimétiques récurrents ou les animats. Les condidats devront donc disposer de compétences dans ces domaines ainsi qu'en modélisation et simulation, si possible appliquées à la biologie, à la génétique ou à la modélisation cellulaire.

Profil enseignement :
Le candidat sera amené a effectuer son enseignement au département premier cycle et au département informatique de l'INSA de Lyon. Au sein du département informatique, il intégrera les équipes pédagogiques "développement logiciel" et "informatique décisionnelle".
Contacts:Contact recherche :
Joel Favrel : jfavrel@if.insa-lyon.fr (04.72.43.83.63) Jean-Michel Fayard : jmfayard@insa.insa-lyon.fr (04.72.43.60.01)

Contact enseignement :
Jean-Marie Pinon : jmpinon@if.insa-lyon.fr (04.72.43.84.81) Yves Jayet : yves.jayet@insa-lyon.fr (04.72.43.83.84)

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06/04/2003[AGMM]Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)
Source:
Date de parution:02/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu: ()Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Le site Post-docs Sciences de la vie et de la santé vient d'être ouvert par l'INSERM à l'adresse suivante :
http://www.inserm.fr/postdocs/postdocs.nsf

Ce site permet de pouvoir mettre en contact des candidats aux postes de Chargés de Recherche avec des laboratoires qui en recherchent, d'obtenir des informations sur les différents programmes de l'INSERM...
Contacts:

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06/04/2003[AGMM]postdoctoral position, microarray analysis or structural biology
Source:Telejob
Date de parution:25/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Montpellier (France)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Title of the advert: postdoctoral position, microarray analysis or structural biology
URL: http://www.telejob.ch/telejob/offer.xml?offer=1779
Company: Centre de Recherches de Biochimie Macromoléculaire, CNRS
Workplace: Montpellier, FRANCE
Description: Our research efforts focus on discovery and understanding of sequence-structure-function relationships of proteins using methods of theoretical structural biology (molecular modelling, bioinformatics
analysis) and the development of statistical methods for interpretation of microarray data. One of our current projects aims at creation of a database containing information about cell cycle proteins and their functional interactions in different species in order to improve the knowledge of the cell cycle regulation and cancer development. This work can lead to the discovery of new functionally important protein interactions that can be

experimentally tested in the Centre de Recherches de Biochimie Macromoléculaire, where cell cycle regulation is a major topic of research. The person will be involved in the development of this database using statistical methods of microarray data analysis and (or) methods of theoretical structural biology (amino acid sequence database search and molecular modelling). Centre de Recherches de Biochimie Macromoléculaire is located in Montpellier. Montpellier is now a high-tech centre with numerous specialisations such as agriculture, biology, health, the environment and information technology. It is located in the South of France, near the
Mediterranean sea. For general conditions see:
http://www.sg.cnrs.fr/drhchercheurs/post_doc/default.htm click on «laboratoires sélectionnés pour l'accueil d'un post-doc », then on Sciences de la vie :FRE 2593 : Centre de Recherche de Biochimie Macromoléculaire
(CRBM) Potential candidates should send a letter of interest with their

curriculum vitae
Education: Applicants with experience in molecular biology, programming and statistical analysis are welcome to apply. Entrance Upon: as soon as possible Duration of appointment: 1 year with possible 0.5 year extension
Remarks:
Jobsharing possible: no
Only for persons notified workless in Switzerland?: no
Contacts:Contact address (for applications): Dr. Andrey Kajava Centre de Recherches de Biochimie Macromoléculaire (CRBM) FRE-2593 CNRS, 1919 Route de Mende 34293 Montpellier, Cedex 5, FRANCE FAX 33 4 67 521559 Tel. 33 4 67 613405 Email (for applications): bellis@crbm.cnrs-mop.fr, kajava@crbm.cnrs-mop.fr Link to the company: http://www.crbm.cnrs-mop.fr

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06/04/2003[AG]2 CDD + MDC
Source:
Date de parution:06/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Rennes (France)Statut:Maître de ConférenceSecteur:public
Description de l'annonce:
Un poste de maître de conf est ouvert à Rennes avec un profil
préférentiel en bioinformatique http://www.personnel.univ-rennes1.fr/profil_postes_ens_2003/mcf/27MCF0492.htm
Le candidat retenu pourra effectuer sa recherche au sein du projet Inria Symbiose http://www.irisa.fr/symbiose/

Deux postes de CDD sont également ouvert dans le but de développer et mettre à disposition une plate forme logicielle de recherche et découverte de motifs dans les séquences.
On recherche deux types de profils sur ces postes :
* Un candidat interressé pour participer à la création d'une société charger de valoriser les travaux.
* un ingénieur pour assurer le développement des algorithmes disponibles.
Contacts:Des informations plus complètes sont disponibles sur http://www.irisa.fr/symbiose/emplois/

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06/04/2003[AGMM]Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline
Source:
Date de parution:04/04/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Philadelphie (Etats-Unis)Statut:CDDSecteur:prive
Description de l'annonce:
Subject: Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline

Summer student positions in scientific computing at GlaxoSmithKline

GlaxoSmithKline (GSK) is a world leading research-based pharmaceutical company with a powerful combination of skills and resources to provide a platform for delivering strong growth in today's rapidly changing healthcare environment. GSK's mission is to improve the quality of human life by enabling people to do more, feel better and live longer. GSK has

over 100,000 employees worldwide and over 16,000 are in R&D. GSK R&D is based at 24 sites in seven countries. The company has a leading position in genomics/genetics and new drug discovery technologies.

The Scientific Computing and Mathematical Modeling group has three summer student positions available in our state-of-the-art facilities in Upper Merion (near Philadelphia), PA and in Research Triangle Park (RTP), NC. The Scientific Computing and Mathematical Modeling group applies mathematical and computational techniques to a variety of challenging problems in pharmaceutical research.

Position 1 (REQ# 9056) – parallel programming (Upper Merion, PA). Develop parallel programming tools for a Beowulf cluster. Develop parallel versions for various simulation and optimization algorithms. Minimum requirements: Master/PhD student in Computer science or related field with experience in parallel programming and scientific computing. Experience with large C/C++ programs and knowledge of MPI is required. Experience with Matlab is a plus.

Position 2 (REQ# 9061) – biochemical pathway reconstruction (Upper Merion, PA). Experiment with existing algorithms and develop new ones for pathway reconstruction from expression data. Minimum requirements: Master/PhD student in Numerical Analysis/Scientific Computing with experience in optimization algorithms, knowledge of dynamical systems, inverse problems and regularization techniques. Good programming skills – preferably in Matlab. Knowledge of biology is not required but is a plus.

Position 3 (REQ# 9063) – animation/scientific visualization (RTP, NC). Develop tools for animating dynamical systems such as biochemical pathways or chemistry kinetics. The animated movies created using these tools should help demonstrate some of the complex interactions and nonlinear behaviors of the dynamical system studied. Minimum
requirements: Master/PhD student in Computer Science, Scientific Computing or related field. Experience with animation and/or scientific visualization. Knowledge of VRML or Matlab is a plus.

We are looking for individuals who can successfully integrate sophisticated mathematics and computer software with biological problems. We seek someone who has the motivation to solve real-world problems. Interactions will often be with a larger team composed of other computational scientists and R&D researchers. Excellent communication skills are required. Exceptionally talented undergraduate students also will be considered for all three positions.
Contacts:You can apply by visiting our website: http://www.gsk.com/careers and reference the appropriate REQ#

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28/03/2003[AG]Ingénieur de recherche CNRS
Source:BioInfo
Date de parution:28/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Mission :
L'ingénieur de recherche a en charge de concevoir, développer et déployer les méthodes et outils bioinformatiques d'intégration et d'analyse des données issues des plate-formes de génomique à haut débit, en vue de leur exploitation au sein des programmes de recherche de l'unité et de l'Institut. Il mènera sa mission en concertation étroite avec les biologistes de l'unité, les médecins et les bioinformaticiens de l'Institut.

Activités :
- Analyser les besoins dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges, en relation avec l'ingénieur de la plateforme de génomique fonctionnelle (en cours de recrutement) ;
- Développer des solutions méthodologiques aux problèmes d'analyses à haut débit ;
- Implémenter et mettre en service ces solutions (déploiement, formation) ;
- Intégrer les données génomiques et phénotypiques publiques et privées nécessaires aux analyses ;
- Participer aux analyses de données en relations avec les biologistes et médecins ;
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine ;
- Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en Suvre des techniques bio-informatiques.

Compétences :
- Avoir de bonnes connaissances de la biologie cellulaire et des grands principes qui régissent le fonctionnement des cellules ;
- Avoir une formation approfondie en bio-informatique (diplôme d'ingénieur ou 3ème cycle universitaire) ;
- Avoir une expérience de l'environnement UNIX, des langages Java, C/C++, Perl, PHP, SQL et une pratique des architectures client/serveur ;
- Avoir une expérience dans la gestion et l'analyse de gros volumes de données scientifiques ;
- Avoir une pratique des bases de données, outils d'analyse et concepts de la bioinformatique ;
- Maîtriser l'anglais scientifique à l'orale et à l'écrit ;
- Aptitude à la communication ;
- Travailler en équipe.

Contexte :
Travail au sein de l'UMR 144 CNRS - Institut Curie, en étroite collaboration avec le service Bioinformatique de l'Institut Curie, les plate-formes de transcriptome, CGH, protéome et génotypage, ainsi que d'autres unités du Campus participant au site Mte Ste Geneviève du Génopole Ile de France.
Contacts:Voir http://www.sg.cnrs.fr/drhita/concoursita/2003/02_consulter.htm
et en bas de la page demander à voir le concours n°3

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28/03/2003[AG]professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière
Source:
Date de parution:28/03/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Un poste de professeur en bio-informatique (0122 s) est ouvert au
recrutement à l'université Paris 6 en 27e section (informatique).

La recherche sera effectuée à l'Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière.

L'enseignement sera dispensé à l'UFR d'informatique.

Le profil complet du poste est disponible à l'adresse www.lip6.fr
Contacts:Recherche : Dominique MAZIER, Unité INSERM 511, Pitié-Salpêtrière, 0140779736

Enseignement : Mme la Directrice de l'UFR informatique :
DirUfr@ufr-info-p6.jussieu.fr

Présidente de la commission de spécialistes 27e section : Anne.Doucet@lip6.fr

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28/03/2003[AG]Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics
Source:ABG-7697-2
Date de parution:21/03/2003Date limite de réponse:01/06/2003
Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics : Development of Statistical Strategies and Tools - Evry, France

Date de debut de diffusion du poste : 21/03/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/06/2003

Aventis Pharma, in partnership with the European Commission, offers 2 Marie Curie Industry Host Fellowships, for a 2 year period, on a project focused on the development of statistical strategies for the analysis of case-control pharmacogenetic data. The methods will enable the discovery and consequently the diagnosis of genetic polymorphisms underlying factors such as drug response, drug toxicity, and disease state and severity.

Based at the Evry Genetics and Pharmacogenetics Center,your roles will be to :

- Develop single-and multi-point linkage disequilibrium methods, with special reference to issues such as control sample selection and genomic control, marker selection, haplotype construction and analysis,and multiple testing.

Candidates should have experience in a field such as mathematics, statistics, population genetics, or genetic epidemiology. Fluency in English is required. The positions are open to members of the E.C. or residents of associated countries* for more than 5 years. You must hold a PhD. The age limit at the time of selection is 35 years old.

* Austria, Belgium, Bulgaria, Czech republic, Denmark, Estonia, Finland, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Israel, Italy, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, The Netherlands, Norway, Poland, Portugal, Republic of Cyprus, Romania, Slovakia, Slovenia, Sweden, Spain, and United Kingdom. However French citizens are ineligible as well as those who have been resident in France for more than 12 out of the last 24 months.

Employment Conditions

Field of application
The Marie Curie Post-Doc Fellows are recruited on a fixed-term contract. Aventis has been selected by the European Commission as a hosting institution able to deliver research training for post-doctoral researchers.

Salary and benefits
The annual scales are normally within the range of 30 to 39 k€ depending on the age and experience of the scientist.

Post-doctoral fellows are entitled to elect and participate in the Aventis French benefits as offered to regular full-time associates. This includes: medical and/or dental insurance, healthcare and dependant care reimbursement accounts.

Relocation
In regard to the household goods, Aventis DI&A Paris will reimburse the candidate as follow: up to 600 € for a single person up to 900€ if the Post doc fellow comes with his/her spouse. up to 200€ per child

Mobility allowances
The post doc fellow will receive a monthly mobility allowance of 400 € (as agreed with the EC) all along his/her assignment.

Airfare
Economy airfare will be provided to work site from home and a return economy flight home completion of the post-doc assignment.

Housing accommodations
The company will pay for furnished lodging accommodations for up to 15 days at the post doc fellow arrival in France. In order to help the Post-doc fellow to find a suitable housing, relocation counselor provided by Aventis will be available to discuss the details on housing arrangements. If needed, support will also be provided to open bank account in France and for administrative steps.

French lessons
Aventis will help all post-doctoral fellows who will express the wish to be trained in French. According to their French language knowledge, the most appropriate course will be given. Two 40 hour-package can be offered by Aventis and if necessary additional courses could be given by the “Alliance Francaise”.

Working hours
In application of the agreements on the organization and duration of work in force within the company, working time consists of an average of 35 hours effective work per week over the year.

Vacations
Employees at Aventis are eligible for 31 vacation days for a full period (i.e.12 months), more 14 days off in application to the 35 hours agreement (RTT days) for a full period.
Contacts:Written details and letters of application for both positions, together with CVs and the names of two referees should be sent to :

Dr. JF Deleuze, Director of the Evry Genetics Center, Aventis Pharma, 2, rue Gaston Cremieux, 91057, Evry, France.
Tel: 33 1 58 93 90 01, Fax: 33 1 58 93 90 10, e-mail : jean-francois.deleuze@aventis.com

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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23/02/2003[AG]Data Analysis Scientist
Source:
Date de parution:23/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Ankeny (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
Description de l'annonce:
Monsanto values diversity and is an equal opportunity affirmative action employer.

Department: Technology Development
Title: Data Analysis Scientist
Req Number: mons-00000893
Location(s): Ankeny IA

Responsibilities:
The successful candidate will be part of a Data Analysis team within our plant breeding organization. The individual in this role will be analyzing molecular marker data sets and crop trial data, this implies: Test procedures through simulations and validations methods to help optimize research strategies. Develop analysis tools and routines to be used by other researchers in the organization. Apply current and new statistical tools to the analysis of experiments. Design and propose experiments, based on analysis results and/or new technological developments.

Required Skills:
A Ph.D. in bioinformatics, statistics, statistical genetics, or in a related discipline with a solid statistical training is required. The candidate should demonstrate ability to work as a team member, have good communication skills, be creative at problem solving, and be detailed-oriented.

Consideration will be given if the candidate could demonstrate any of the following skills: Computer programming as well as building, querying, and managing large databases. Prior exposure to quantitative and population genetics, and the application of molecular markers to large/complex pedigrees. Experience with simulation procedures and Bayesian analysis.
Contacts:http://sh.webhire.com/Public/554/jd1224976.html

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21/02/2003[AG]stage de bio-informatique
Source:bioinfo
Date de parution:21/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Paris (France)Statut:StageSecteur:public
Description de l'annonce:
Proposition de stage de bio-informatique

Sujet:
Constitution d'une base de connaissance pour l'étude des réseaux de régulation génétique

Descriptif:
Dans le cadre d'une collaboration entre le Laboratoire de Génétique de la Neurotransmission (LGN, unité CNRS UMR 7091) et le Laboratoire d'Informatique de Paris 6 (LIP6), nous développons une plate-forme logicielle destinée à l'étude des réseaux génétiques. Ce système permettra l'exploitation conjointe de deux types d'informations:
  • les connaissances sur les réseaux de régulation génétique, issues d'expériences de biologie humide démontrant un lien de régulation entre deux gènes, et actuellement dispersées dans la littérature scientifique ou des bases de données hétérogènes.
  • les profils d'expression des gènes constituant ces réseaux, obtenus par des technologies comme les puces à ADN, le SAGE ou la RT-PCR.


Ce système logiciel, appelé GeNetDB (pour Genetic Network Database), est destiné à servir de source de données pour les équipes pluridisciplinaires travaillant sur la problématique de l'inférence et/ou de la modélisation des réseaux génétiques.
En plus de constituer une base de connaissance, GeNetDB pourra être utilisé comme outil de traitement via l'écriture de scripts de commande ou de modules additionnels pour manipuler les données qu'il propose.

Le modèle de donnée étant finalisé, et l'implémentation du logiciel suffisamment avancée pour une première exploitation, nous recherchons une personne capable de nous aider dans le processus de recherche, d'importation et d'annotation des données qui vont constituer la base de GeNetDB.
Cette personne devra évaluer la pertinence et la qualité des données accessibles sur Internet ou auprès d'auteurs, et en gérer la récupération. Une fois obtenues, elles devront être nettoyées et adaptées au modèle de donnée sous-jacent à GeNetDB, pour enfin être annotées.

Ce stage est d'une durée minimum de 2 mois.

Profil recherché:
Biologiste (ayant de bonnes connaissances en biologie moléculaire, et éventuellement en microbiologie), de niveau maîtrise ou DEA/DESS, possédant en informatique de solides compétences dans les domaines de la recherche d'informations sur Internet (utilisation des moteurs et méta-moteurs de recherche, exploitation de bases de données en ligne) et de la manipulation de ces informations (stockage, organisation des données, requêtes sur celles-ci). Cette personne devra être à l'aise
dans les environnements Windows et Unix.
Des compétences en programmation (Perl, Python ou Java), en gestion du format XML (DTD, XPath, XSLT), et en bases de données (MySQL), seraient un plus.
Contacts:Adresser candidature (CV et lettre de motivation):
- par e-mail (de préférence) aurelien.mazurie@free.fr
- par courrier
Aurélien Mazurie
Laboratoire LGN
CNRS UMR 7091
Bat. CERVI, 5ème étage
Hopital Pitié-Salpétrière
83, bd de l'Hopital
75013 Paris
- par fax
01.42.17.75.33

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21/02/2003[AG]Scientist--BIOINFORMATICS and MACHINE LEARNING
Source:bioinformatics.org
Date de parution:21/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Moffett Field - Californie (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
Description de l'annonce:
Research Institute for Advanced Computer Science (RIACS) and NASA Ames Research Center seek a scientist in the areas of Bioinformatics and Machine Learning to collaborate with RIACS and NASA scientists in pursuit of grand challenge problems in space biology.

RIACS performs basic and applied computer science research in collaboration with NASA and university scientists to solve challenging scientific problems in support of NASA's goals and missions. RIACS is located at NASA Ames Research Center in the heart of Silicon Valley. RIACS is an institute of the Universities Space Research Association (USRA), a non-profit organization.

Early studies indicate that space impacts life in profoundly different ways than on Earth, as demonstrated by gene expression data obtained in experiments in space and under simulated microgravity and high radiation environments. With its mission to improve life on Earth, to search for life outside our home planet, and to extend life to space, NASA has undertaken a broad range of activities in space biology and biotechnology. These activities are broadly focused on the the impact of the space environment on living matter, including risks, remedies, and potential benefits.

RIACS and NASA Ames seek a scientist with a proven record in bioinformatics and a strong computer science background to contribute to this research program. The scientist will work closely with molecular biologists, bioinformaticians, and the the Machine Learning Group of the Computational Sciences Division at NASA Ames Research Center. Initial duties may include but are not limited to:

  • Collaboration with NASA scientists on the analysis and interpretation of microarray data related to space experiments;
  • Contributions to the development of machine learning and data mining methods for bioinformatics.


The candidate will also play an active role and responsibility in identifying and applying for follow-on funding from NASA and other government agencies.

The successful candidate will have many of the following qualifications:
  • A Ph.D. with 2 years experience, or a Master's degree and five years experience in Molecular Biology, Computer Science, or a related field.
  • Familiarity with bioinformatics tools and methods.
  • Publication history in bioinformatics.
  • Wet lab experience.
  • Strong computer science and machine learning background.
  • Experience in statistics, Bayesian models, and Markov models.
  • Ability to work effectively with scientific personnel in multiple disciplines (e.g., life science and computer science).
  • Strong interpersonal skills.


Compensation for this position is competitive, and based on the candidates' experience and expertise.
Contacts:Working at RIACS provides the opportunity to collaborate on a variety of challenging space-related information technology research problems with top quality researchers from around the world. If this position excites you, please visit our web site at http://www.riacs.edu and follow the instructions under the Employment page to apply.

RIACS is an equal opportunity employer.

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21/02/2003[AG]Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire
Source:
Date de parution:21/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Nantes (France)Statut:CDDSecteur:public
Description de l'annonce:
L'Université de Nantes dispose, pour la rentrée 2003, d'un poste de Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire. Ce poste est ouvert dans la section 27 Informatique) et à ce titre le profil du candidat recherché est le suivant :

Recherche :
Le candidat devra effectuer ses travaux de recherche au sein du thème ComBi (Combinatoire et Bio-informatique) de l'IRIN (l'Institut de Recherche en Informatique de Nantes). Ses compétences en informatique devront être complémentaires à celles (fortement combinatoires) des membres du thème, et ses compétences en biologie seront, de préférence, appuyées par une première expérience en bio-informatique. Le candidat pourra soit s'intégrer dans l'une des directions de recherche actuelles
du thème (découverte de motifs sur les structures primaires, comparaison de structures secondaires, comparaison de génomes), soit proposer une nouvelle direction de recherche. Il sera, par ailleurs, demandé au candidat recruté de participer activement au renforcement des collaborations entre le thème ComBi et les équipes de recherche en Biologie de Nantes ou d'ailleurs.

Enseignement :
Le candidat devra enseigner l'informatique à tous les niveaux de
formation proposés par le Département Informatique de l'Université de Nantes, et devra participer aux tâches administratives inhérentes au bon fonctionnement du département.
Contacts:Toute personne intéressée est priée de prendre contact avec :

Recherche : Irena Rusu, rusu@irin.univ-nantes.fr
Responsable du thème ComBi
Enseignement : Marie-Madeleine Tallineau, tallinea@info.univ-nantes.fr
Responsable du Département d'Informatique

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20/02/2003[AGMM]Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot
Source:
Date de parution:20/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Genève (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Le groupe Swiss-Prot (http://www.expasy.org/sprot) de l’Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.isb-sib.ch/) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de levures (S. cerevisiae, S. pombe, etc..) dans la base de données Swiss-Prot .

Le projet a pour but une annotation de qualité des protéomes de levures. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l’annotation manuelle des protéines. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

Nous offrons ce poste au sein d’une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s’intégrerait avec plaisir dans ce cadre. D’autre part, ce travail implique une collaboration étroite avec l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI) (http://www.ebi.ac.uk/), Hinxton, UK, et nécessitera des déplacements réguliers à l’étranger.

Conditions indispensables :
Biologiste ou biochimiste, expert en biologie des levures. Bonne connaissance de l’anglais. Travail à temps complet. Nationalité : suisse ou permis C. Bonne motivation pour travail en équipe. Motivation claire pour Swiss-Prot.
Contacts:Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu’au 31 mars 2003, à :
Claudia Sapsezian
Levure
Institut suisse de bioinformatique
CMU
1, rue Michel-Servet
1211 Genève 4
Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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20/02/2003[AGMM]Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships
Source:http://www.cbmi.upmc.edu/training-2003.htm
Date de parution:18/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Pittsburgh (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:

The Center for Biomedical Informatics at the University of Pittsburgh expects to have openings for predoctoral and postdoctoral informatics traineeships beginning in the summer of 2003. The Pittsburgh Biomedical Informatics Training Program has more than 60 core and affiliated faculty members with expertise in:
  • Knowledge-based systems, medical artificial intelligence, biosurveillance
  • Simulation and modeling of complex phenomena in biology and health care
  • Information system development, software, and knowledge engineering
  • Information retrieval, problem solving, and cognition
  • System evaluation, social/organizational factors, and health services research
  • Machine learning, data mining, and knowledge discovery
  • Image processing, integration, and distribution
  • Enterprise computing: integrated architectures and clinical and biomedical applications of the Internet
  • Bioinformatics
Contacts:Candidates may apply for a master’s and/or doctoral degree in Biomedical Informatics, in the biomedical informatics track of the Intelligent Systems Program. Applicants should be either health professionals, or non-health professionals with a background in a technical field such as computer or information science.

Individuals with an interest in any of these areas are invited to visit the program’s web site, send email to training@cbmi.upmc.edu, or call 412-647-7131 for further information.

The University of Pittsburgh is an affirmative action, equal opportunity employer.

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20/02/2003[AGMM]Postdoc at the Computational and Molecular Population Genetics lab
Source:Telejob
Date de parution:19/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Bern (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
URL: http://www.telejob.ch/telejob/offer.xml?offer=1661
Company: Zoological Institute, University of Bern

Description:
A position is anticipated to open at the CMPG lab to study the effect of spatial expansions and contractions on molecular diversity. Research will consist in developing theoretical and computer models of genetic diversity in a population experiencing range variation in an heterogeneous and spatially explicit environment.
Education: Applicants must have or be about to finish a Ph.D. in Population Genetics, Statistics, or Bioinformatics. Candidates having expertise in statistics, GIS programs, computer programming (C/C++), and molecular population genetics are particularly encouraged to apply. Lab main language is English, but notions of German or French are welcome. Entrance Upon: April or May 2003 Duration of appointment: two years

Remarks: The CMPG lab and the Zoological Institute of the University of Bern provide exceptional working facilities (library, computer cluster, laboratories), and an intellectually stimulating environment, with many seminars and courses being held in English (see http://cmpg.unibe.ch/ for
details)
Jobsharing possible: no
Only for persons notified workless in Switzerland?: no
Contacts:Contact address (for applications): Zoological Institute University of Bern R. Schneider Baltzerstrasse 6 3012 Bern Email (for applications): laurent.excoffier@zoo.unibe.ch Link to the company: http://www.zoology.unibe.ch

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16/02/2003[AG]Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute
Source:
Date de parution:16/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:???Secteur:public
Description de l'annonce:
Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute

The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of computational and experimental genome research. We have strengths in bioinformatics software, algorithm and database development, and exceptional data and computational infrastructure. The Wellcome Trust has recently awarded £300 million to the Sanger Institute to support our new biological/genetics research direction as well as our existing programmes over five years, plus £65 million for IT infrastructure.

Applications are invited for full time faculty positions at the rank of Investigator, Senior Investigator, or Principal Investigator . For faculty members, we are looking for individuals with a proven background in first class research, with a strong, vision and innovative projects that are ideally in areas related to our large scale experimental programmes. We encourage relevant applications from people with backgrounds in bioinformatics, computer science or mathematical or scientific areas.

Head of Production Software: We are also looking for a new head of our production software group, who will be responsible for directing teams involved in internal data processing. This position will have faculty status at one of the levels listed above, with independent research opportunities.

The Sanger Institute is committed to provide a level of support so that there is no impediment to performing high quality and productive science. This includes access to our infrastructure as well as unencumbered support commensurate with the rank of appointment.
Contacts:Applicants are requested to send their curriculum vitae with a full publication list by 31st March 2003. You should also provide a two page description summarising your research accomplishments to date and a three page plan of your future research goals and strategies indicating how these fit with, or make use of Sanger Institute programmes and infrastructure.

All candidates must provide three letters of recommendation. Please arrange to have these letters and application sent to:
Richard Durbin
Faculty Search Committee
The Wellcome Trust Sanger Institute
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SA
ENGLAND

Email: rd@sanger.ac.uk
FAX: +44 (0) 1223 494714

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12/02/2003[AGMM]Stage postdoctoral Marie Curie : Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation
Source:ABG-7601
Date de parution:05/02/2003Date limite de réponse:04/04/2003
Lieu:Billingham (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Date de debut de diffusion du poste : 05/02/2003
Date de fin de diffusion prevue : 04/04/2003

Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation

High throughput experimentation techniques are leading to a rapid increase in the quantity of data generated by researchers. This requires increased attention to experimental design, data management and data mining activities as well as data modelling. This applies equally to data generated from catalyst characterisation and reactor/process diagnostic techniques. In both of these areas the key information is often hidden in a large amount of data.

The fellow will be involved in data mining and modelling activities in support of a number of business activities and will thus receive broad training in the application of the appropriate mathematical and modelling techniques. Specific activities will include experimental design and data evaluation from high throughput experimentation, kinetic studies, interpretation of catalyst characterisation data, processing of signal data from process diagnostic techniques and data mining of manufacturing plant dat a as well as use of models and modelling techniques to these applications.

Researchers must be nationals of an EU Member or Associated State, or have resided in an EU Member State for at least the last 5 years and normally be under 35 years of age.
Contacts:Applicants interested in any of the above opportunities should apply in writing to Sue Magson, Synetix, PO Box 1, Billingham, Cleveland, TS23 1LB, UK, or by e-mail to sue_magson@ici.com Further details about Synetix can be found on the web-site http://www.synetix.com and further details about Marie-Curie Fellowships on http://www.cordis.lu/improving/home.html

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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11/02/2003[AG]Bioinformatics scientist
Source:http://bioinformatics.org/
Date de parution:11/02/2003Date limite de réponse:?
Lieu:Richmond (Virginie) (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Philip Morris USA, a global leader in the manufacturing and marketing of consumer products made for adults, seeks a Post Doctoral Research Fellow to join us at our Research, Development and Engineering headquarters in Richmond, VA.

We are seeking a uniquely qualified bioinformatics scientist to support cutting edge research in the field of plant genomics. Specifically, the successful candidate will work interactively with Philip Morris USA scientists and company-funded researchers at various academic institutions to develop computational tools that will facilitate gene discovery and annotation from data generated as part of a major project sponsored by Philip Morris USA.

Qualified candidates must have completed a Ph.D. in either the biological or computer sciences and have experience and a publication record in bioinformatics and/or genomics research. Candidates who have experience applying computer science expertise toward biological research projects are especially desired. The successful candidate will possess these qualifications and will be well versed in standard databases and software applicable to DNA and protein research. Expertise with object-oriented programming and scripting tools (JAVA, C++, PERL, XML, BPEL4WS etc.) and experience working interactively with biological scientists in problem solving is also desired.

In addition to the opportunity to apply your scientific skills toward critical business objectives, we offer an excellent compensation package including a competitive base salary, health insurance reimbursement and relocation assistance.
Contacts:For immediate consideration, visit our web site: www.philipmorrisusa.com/careers. Select the ?Search Our Jobs? option. Select the ?Begin Your Search? option. Select the ?Search Openings? option. Enter requisition ?3099BR? into the keyword or requisition number search box and select the ?Search? option. Select the job and click Submit to Job.

Philip Morris USA is an Equal Opportunity/Affirmative Action employer (M/F/D/V). We support diversity in our workforce.

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10/02/2003[MM]PhD Position, Computational Molecular Biology
Source:http://www.cnd.mcgill.ca/~swain
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:01/09/2003
Lieu:Montreal (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
PhD POSITIONS IN COMPUTATIONAL BIOLOGY
Centre for Non-Linear Dynamics, McGill University, Montreal. http://www.cnd.mcgill.ca

Applications are invited for one or two PhD positions in the area of computational molecular biology at McGill University. This is an exciting, rapidly growing field driven by the recent explosion in quantitative biological data. See Nature 397, 89 (1999). Students will investigate the `design' behind biochemical information processing networks in simple living organisms. We use techniques from stochastic systems, non-linear dynamics, statistical mechanics and Bayesian probability theory. The positions are ideal for students, who have or expect to obtain a good degree in Mathematics or Physics, and are committed to moving into the areas of molecular biology and bioinformatics.

The Centre for Non-Linear Dynamics is based around a group of mainly theorists in the department of Physiology. It offers a unique graduate training and is an ideal environment for gaining both modelling and biological expertise.

More details are at http://www.cnd.mcgill.ca/~swain
Contacts:Please send/email a CV with the names of two referees to Peter Swain, Department of Physiology, McGill University, 3655 Promenade Sir William Osler, Montreal, Quebec, Canada H3G 1Y6. A probable start date is around September 2003.

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10/02/2003[AGMM]Research Scholarships
Source:AGM2
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Plymouth (Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
Description de l'annonce:
Centre for Theoretical and Computational Neuroscience University of Plymouth, UK http://www.tech.plym.ac.uk/soc/research/neural/research.html

A number of University Research Scholarships are available for students wishing to study for a PhD in the Centre starting in September/October 2003. The scholarships cover full tuition fees for three years plus an annual living-expenses stipend of £9000. Further support for living expenses is usually available via teaching assistantships.
Contacts:Interested applicants for these Research Scholarships must first make application to the University and to the Centre for admission to its PhD programme. Initially this can be done by sending an email to the Head of the Centre, Professor Mike Denham (mdenham@plym.ac.uk), including a brief statement of research interests and a short curriculum vitae, plus postal address. Applicants will then be sent formal admission application forms.

Note: The closing date for University Scholarship applications is 31st March 2003. Applications for admission to the University's PhD programme should be made well in advance of this date, ideally by the end of February.

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10/02/2003[AGMM]Postdoctoral Research Fellowship
Source:AGM2
Date de parution:10/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
Lieu:Plymouth (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:prive
Description de l'annonce:
Centre for Theoretical and Computational Neuroscience University of Plymouth, UK: http://www.tech.plym.ac.uk/soc/research/neural/research.html

A Postdoctoral Research Fellowship is available for candidates who have just completed or are about to complete a PhD in a suitable area of study, to carry out research within the Centre for Theoretical and Computational Neuroscience. The Fellowship will be for two years initially, at a salary level on the University's scales commensurate with experience and age.
Contacts:Interested applicants for this Research Fellowship should in the first instance send an email to the Head of the Centre, Professor Mike Denham (mdenham@plym.ac.uk), including a brief statement of research interests and a short curriculum vitae, plus postal address. Applicants will then be sent a formal application form.

Note: The closing date for applications for the Research Fellowship is 31st March 2003.

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06/02/2003[AG]STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE
Source:ABGe-1068
Date de parution:28/01/2003Date limite de réponse:27/03/2003
Lieu:Laval (Canada/Quebec)Statut:PostdocSecteur:public
Description de l'annonce:
Un grand projet de genomique fonctionnelle appliquee aux arbres forestiers au Centre de recherche en biologie forestiere de l'Universite Laval et finance par Genome Quebec/Genome Canada, offre des opportunites uniques.

Les technologies nouvelles, le travail en equipe, le developpement professionnel et les collaborations internationales vous interessent? Voici un poste de haut-niveau qui pourra combler vos attentes!

Fonctions :

  • Etude du role de facteurs de transcription et autres genes regulateurs des arbres forestiers, impliques dans la differentiation du tissu vasculaire et la formation du bois, ou les mecanismes de defense des arbres.

  • Analyses detaillees de l'expression des genes par RT-PCR en temps reel

  • Analyse de la fonction des genes par surexpression ou inhibition chez l'epinette et le peuplier transgeniques, grace a notre plateforme specialisee de transgenese des arbres forestiers

  • Analyse des profils de transcription des cellules et arbres transgeniques par l'utilisation de puces d'ADN specialisee (microarrays)

  • Participation a la formation et l'encadrement d'etudiants et du personnel de laboratoire

  • Redaction d'articles scientifiques et presentation des resultats dans des congres specialises


    • Qualifications :

  • Diplome de doctorat (Ph. D.) en genomique, biologie vegetale, biologie moleculaire ou cellulaire, ou dans un domaine connexe

  • Une bonne connaissance pratique des methodes de biologie moleculaire est requise

  • Experience souhaitable en manipulation d'ARN, etudes sur micropuces d'ADN, RT-PCR en temps reel ou transgenese des plants

  • Tres bonne communication orale et ecrite

  • Aptitude demontree pour le travail en equipe

  • Capacite au travail autonome et a l'encadrement

  • Tres bonne connaissance de l'anglais ecrit et oral

    • Contacts:Poste disponible des maintenant, contrat jusqu'au 31 mars 2005 avec possibilites de renouvellement.

    Par e-mail : genome.foret@rsvs.ulaval.ca

    SVP, pour postuler, soumettre :
    - une lettre de presentation
    - un curriculum vitae a jour
    - les noms et coordonnees de trois personnes references

    La description du projet est disponible a l'adresse suivante : http://forgenome.rsvs.ulaval.ca

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    06/02/2003[AG]Chair and lecturers/senior lecturers/readers
    Source:ScienceCareers.org
    Date de parution:09/01/2003Date limite de réponse:14/02/2003
    Lieu:Liverpool (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Chair and lecturers/senior lecturers/readers Biochemistry/molecular biology, host-parasite biology, evolutionary psychology/behavioural ecology, functional genomic genomics and cellular regulation, employing transgenics, etc. University of Liverpool Liverpool

    THE UNIVERSITY of LIVERPOOL
    School of Biological Sciences
    Chair and Lecturers/Senior Lecturers/Readers
    Salary will be negotiable for the Chair
    Salary will be £22,191 - £33,679 pa (Lecturer) or £35,251 - £39,958 pa (Senior Lecturer/Reader)

    The School of Biological Sciences (rated 5 in RAE 2001) is the largest department in The University, with 61 academic staff covering the full range of the biological sub-disciplines in a single research and teaching organisation (see http://www.liv.ac.uk/biosciences). The School has just moved into a new Biosciences Research Building, which provides state-of-the-art laboratories, including a range of core facilities for post-genomic research, and a business incubator. The Building will serve as a focus for the Liverpool life sciences community with over 450 academic staff. As part of the strategy to develop the biosciences at Liverpool, The University wishes to appoint exceptional candidates to a range of positions in the School of Biological Sciences. Candidates should be able to present evidence of research excellence and potential in their field, and those who can demonstrate links with the activities of one or more research groups within the School and/or University will be particularly welcome.

    We are seeking to appoint one Chair and five Lecturers, although suitable applicants at Senior Lecturer/Reader level will also be considered. A professorial appointment to the prestigious Johnston Chair of Biochemistry will be available to a candidate in the general area of Biochemistry/Molecular Biology.

    The appointments will be made as follows:

    A Chair and three Lectureships in up to four of the following areas:

    functional genomics and cellular regulation, employing transgenics, transcriptomics, proteomics, or cell imaging the interface of biology with chemistry and physics molecular microbiology in microbial pathogenesis, host-pathogen biology, or microbial biotransformations bioinformatics in genomic or post-genomic science bioinformatics in phylogenetic, evolutionary, population, or environmental science Lectureship in host-parasite biology Lectureship in evolutionary psychology/behavioural ecology
    Contacts:Applicants with interests or expertise in more than one of these areas will be especially welcome.

    Informal enquiries for all the above posts may be made to Professor Brian Tomsett, Head of Department on 0151 795 4413, email: biolhos@liv.ac.uk

    For the post of Chair quote ref: B/990/S.
    For the post of Lecturer/Senior Lecturer/Reader quote ref: B/991/S. Closing date: 14 February 2003

    Further particulars and details of the application procedure should be requested from the Director of Personnel, The University of Liverpool, Liverpool L69 3BX on 0151 794 2210 (24 hr answerphone), via email:jobs@liv.ac.uk or are available online at http://www.liv.ac.uk/university/jobs.html

    COMMITTED TO EQUAL OPPORTUNITIES

    5604xD35002-O112439
    Be sure to mention that you saw this ad on ScienceCareers.org.

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    06/02/2003[AG]Plant Genomics Research Unit PostDoc
    Source:
    Date de parution:17/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The URGV, Plant Genomics Research Unit (Evry, France), supported by INRA and the CNRS, has a post-doctoral position available immedialetly.

    Description : The applicant must have a PhD in molecular biology, with expertise in bioinformatics. He/she will be involved in a project studying large scale transcription profiling of Arabidopsis. The aims of the project is to develop a Compendium of Arabidopsis Gene Expression (funded by the European Union) using the european Complete Arabidopsis Transcriptome Microarray (CATMA), for Arabidopsis gene function discovery through large scale expression data analysis. Two teams at the URGV are involved in microarray analysis, comprising 2 senior scientists, 5 engineers, 2 post-docs, one PhD student and 2 technicians. The URGV also includes a strong bio-informatics/statistics group.

    Salary : 1800EUR per month, free of charge
    Contacts:Dr Renou jean Pierre
    The Transcriptome Group
    INRA/CNRS -URGV
    2, rue Gaston Crémieux, CP5708, 91057 Evry cedex, France
    Phone + 33 1 60 87 45 17
    e-mail : renou@evry.inra.fr

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    06/02/2003[AG]annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana
    Source:BioInfo
    Date de parution:06/02/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Orsay (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre d'un projet Génoplante nous recherchons un DESS biologiste-bioinformaticien motivé, désirant participer à l'annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana.

    L'annotation semi-automatique du génome d'Arabidopsis thaliana a permis l'identification et la localisation d'environ 29.000 gènes. Cependant, cette première annotation, puisque rapide, est de mauvaise qualité. Or l'ensemble des projets de génomique fonctionnelle qui se développent actuellement dépend de ces annotations.
    Le but du projet est d'obtenir une annotation homogène, fiable, documentée et traçable des gènes d'Arabidopsis et de leurs protéines puis de les saisir dans une base de données à valeur ajoutée. La ré-annotation est effectuée, au sein de laboratoires experts, par l'analyse exhaustive de familles de gènes, à l'aide d'un protocole d'annotation défini lors de la première phase du projet et mettant en oeuvre les logiciels de prédiction les plus efficaces actuellement.

    Ce projet, effectué par un réseau de laboratoires français et SwissProt présente une réelle opportunité pour acquérir rapidement une expérience en analyse de séquences, fouille de données dans les grandes bases de données de séquences, connaissance des génomes et analyse fonctionnelle bioinformatique.

    Lieu: IBP à Orsay.
    Durée : 18 mois, début probable 15 mars - début avril 2003.
    Rémunération: niveau IE CNRS.
    Contacts:Responsable du projet: C. Toffano-Nioche, CR CNRS
    Responsable du laboratoire: A. Lecharny, DR CNRS.
    Equipe "Analyse des génomes des plantes"
    Institut de Biotechnologie des Plantes
    lecharny@ibp.u-psud.fr
    Tel : 33 (0)1 60 87 45 18
    Fax : 33 (0)1 60 87 45 49
    http://www.ibp.u-psud.fr/

    Equipe de bioinformatique de l'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) INRA-CNRS-Univ. Evry-Val d'Essonne
    2, rue G. Crémieux
    CP 5708
    F-91057 Evry CEDEX
    FRANCE
    http://www.evry.inra.fr/

    Claire Toffano-Nioche (toffano@ibp.u-psud.fr)
    Génome, évolution et développement de la plante
    Institut de Biotechnologie des Plantes
    bat.630 - Universite Paris-Sud
    91405 - Orsay cedex
    tel.: 01 69 15 34 04

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    06/02/2003[AGMM]EMBL-BI Group Leaders In BioInformatics
    Source:
    Date de parution:24/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Heidelberg (Allemagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    http://us.expasy.org/positions/GroupLeadersEBI.pdf
    Pièce Jointe : GroupLeadersEBI.pdf (494 ko)
    Contacts:

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    06/02/2003[AGMM]10 Bioinformatics/Biostatistics
    Source:
    Date de parution:15/01/2003Date limite de réponse:07/02/2003
    Lieu:Cardiff (Grande-Bretagne)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Announcing the launch of a new Biostatistics/Bioinformatics unit in the UK.
    Embedded in the University of Wales College of Medicine, Cardiff University and Aberystwyth University, the aim of the Unit is to maintain and improve the quality of basic, strategic and applied research and to promote a resilient research base. Spanning across basic to applied research, the Unit will bring together a core of research staff, providing strength and flexibility, together with skill consolidation through tailored training.
    Pièce Jointe : job_advert.pdf (201 ko)
    Contacts:Go to www.finestpooloftalent.co.uk for further information and application procedures.

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    06/02/2003[AGMM]BIOINFORMATICS
    Source:bioinformatics.org
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Chicago (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Summary:Opportunity: BIOINFORMATICS (with GENOMICS) with experience in DATA WAREHOUSING (with ETL) Knightsbridge Solutions, LLC are looking for BIOINFORMATICS (with
    Genomics) with experience in DATA WAREHOUSING (with ETL).

    Recently voted by INC as one of the fastest growing consulting firms in the country, Knightsbridge Solutions, LLC is a privately held systems integration consulting firm which specializes in delivering solutions for Fortune 200 clients who have big data problems. We design and build scalable architectures that address data integration, ETL, data repositories and analytics.
    Contacts:Please email your COMPLETE resume to me at tjones@knightsbridge.com and be sure to include your full name, address, phone number, email, and the words "bioinformatics.org -BIOINFORMATICS (datawarehousing) opportunity " in the subject line.

    We invite your to learn more about our company by visiting our website which is listed below. We look forward to hearing from you soon.

    Todd E. Jones
    Internet Researcher
    Knightsbridge Solutions
    tjones@knightsbridge.com
    732-603-2700 ext.2223

    http://www.knightsbridge.com


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    06/02/2003[AGMM]Sr. Genomics Lab Manager
    Source:AGM2
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Redwood City (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Located: Redwood City, CA
    Permanent-Full Time.
    Pay: 90-110K

    We are an exciting genome technology company located in the bay area. We are in search of a strong Lab Manager who is highly interested in Geonome and Bioinformatic scanning and comparing.

    You will be responsible for hiring and training staff; monitoring quality of data; ensuring budgets and schedules are met; and preparing technical reports.

    Ideal candidates will have a PhD in Genetics, Molecular Biology, Biology or related scientific discipline, at least 5+ years in Lab Management(up to 6 experiments at a time) and leadership skills.
    Contacts:If interested, please send your CV to: Curtis@CyberScientific.com

    Curtis Weigel
    Sr. Recruiter
    CyberScientific
    www.cyberscientific.com

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    05/02/2003[AG]GO Curator and Bioinformatics Positions at Rat Genome Database
    Source:AGM2
    Date de parution:04/02/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Milwaukee (Etats-Unis)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Bioinformatics Research Center, Medical College of Wisconsin, Milwaukee The Rat Genome Database (RGD) at the Bioinformatics Research Center, Medical College of Wisconsin, Milwaukee, seeks two people to work on GO. A GO curator will be primarily responsible for continuing the integration of Gene Ontology in RGD and participate in the development of this and other standardized vocabularies for phenotype and disease. A bioinformatics person will create the software necessary to implement GO. Applicants for the curation position should have a Ph.D. or an M.S. with experience, be familiar with GO, have experience in molecular biology or mammalian systems, and be versed in genetics, genomics, and cellular or developmental biology. Applicants for the bioinformatics position should have a M.S in mathematics, computer science, or biological sciences with strong computer background. Both positions require excellent oral and written English skills.
    Contacts:Send cover letter and resume to:

    Gail Schemberger
    Bioinformatics Research Center
    Medical College of Wisconsin
    8701 W. Watertown Plank Road
    Milwaukee, WI 53226
    Phone: 414 456-4475

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    05/02/2003[AG]Maitre de Conferences en Genomique bacterienne
    Source:ABGf-2736
    Date de parution:31/01/2003Date limite de réponse:03/03/2003
    Lieu:NANCY (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:

    Date de debut de diffusion du poste : 31/01/2003
    Date de fin de diffusion prevue : 03/03/2003

    Universite Henri Poincare - Nancy 1
    Profil de Maitre de Conferences en Genomique bacterienne (section CNU 65 et 27)

    L’Univeriste Henri Poincare renforce le laboratoire de Genetique et Microbiologie UMR INRA- Univeriste Henri Poincare (Nancy 1) par le recrutement au 1er Septembre 2003 d’un Maitre de Conferences en Genomique bacterienne.

    Les thematiques de recherche du laboratoire concernent l'impact des transferts d'information genetique et des mecanismes de variabilite genetique sur l'evolution chez les bacteries, l'expression du metabolisme secondaire et la reponse aux stress. Deux bacteries a interet industriel constituent les modeles d'etudes : le producteur d'antibiotiques Streptomyces ambofaciens, et la bacterie lactique Streptococcus thermophilus utilisee en industrie laitiere. Le projet developpe par le candidat retenu beneficiera de l'environnement scientifique et technique de l'IFR Genetique, Physiologie, Ecologie des Interactions Microbiennes (GPEIM) avec son plateau technique de genomique structurale et fonctionnelle, et des collaborations avec le Genoscope (CNS, Evry) et les equipes d'informaticiens du LORIA (INRIA Lorrain). Au niveau pedagogique, le nouveau Maitre de Conferences participera au developpement des enseignements en genomique dans les futurs Masters recherche et professionnalise en genetique moleculaire et genomique.

    Le candidat possede des competences en genetique moleculaire bacterienne, microbiologie, et bio-informatique. Une experience en genomique bacterienne structurale (analyse globale de genomes, annotation, genomique comparee…) et/ou fonctionnelle (transcriptomique,proteomique…) sera appreciee.

    Contacts:Dossier de candidature administrative au rectorat de l'academie de Nancy.

    Contacts au laboratoire d'accueil :

     Bernard Decaris (Directeur de l'unite)
     Pierre Leblond

    Genetique et Microbiologie UMR INRA-UHP 1128 - IFR 110 Universite Henri Poincare - Nancy 1 BP 239 Boulevard des Aiguilettes 54506 Vandoeuvre-les-Nancy

    Tel BD : 03 83 68 42 12,
    PL : 03 83 68 42 07
    Secretariat 03 83 68 42 13
    Fax 03 83 68 44 99
    Email BD : decaris@nancy.inra.fr,
    PL : leblond@nancy.inra.fr

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    05/02/2003[AG]Bio-statisticien/Bio-informaticien chez Pfizer
    Source:ABG-7598
    Date de parution:03/02/2003Date limite de réponse:31/03/2003
    Lieu:Amboise (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Avec 12 000 scientifiques dans le monde et un budget R&D de 5 Mds de $, Pfizer confirme sa position de leader mondial dans le domaine de la recherche medicale. En rejoignant nos equipes, vous aurez l'opportunite de developper vos competences dans un environnement international d'envergure exceptionnelle, anime par des valeurs communes: respect, esprit d'equipe, performance et integrite. Ainsi, vous realiserez avec nous les objectifs de Pfizer : contribuer au bien-etre et a la sante de tous.

    Pour le groupe de Toxicologie Moleculaire et Cellualire de notre Centre de Recherche d'Amboise, nous recherchons un :

    Bio-statisticien/Bio-informaticien
    CDD 5 mois (fin avril-fin septembre 2003)

    Dans le cadre des etudes de toxicite pre-cliniques de molecules pharmaceutiques en cours de developpement, vous avez pour mission principale de realiser des analyses de donnees d'expression genique a l'aide de differents logiciels, de comparer et d'interpreter les resultats obtenus. Vous aurez notamment la charge d'identifier des genes impliques dans les vasculopathies, afin de proposer des mecanismes de toxicite par lesquels des molecules induisent cette pathologie.

    De formation initiale en biologie moleculaire et cellulaire, vous etes titulaire d'un DESS bio-informatique/ bio-statistique ou possedez un doctorat dans ce domaine de specialite. Vous maitrisez de preference un ou plusieurs logiciels d'analyse de donnees (Data Mining Tool (Affymetrix), Spot Fire decision site, GEN EXPRESS….).

    Votre gout pour le travail en equipe, votre esprit proactif et votre capacite d'adaptation vous permettront de reussir pleinement votre mission.
    Contacts:Merci d'envoyer votre CV et lettre de motivation a :

    Emmanuelle de La Mairieu
    Centre de Recherche Pfizer
    BP 159, 37401 Amboise cedex, France.
    e-mail: drh.pgrd.amboise@pfizer.com

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    29/01/2003[MM]Mathematicien - Modelisation dynamique en biologie
    Source:ABG-7555
    Date de parution:16/01/2003Date limite de réponse:25/02/2003
    Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Helios Biosciences, jeune entreprise de biotechnologies, lelaureate du 4eme concours creation-developpement d'entreprises innovantes du Ministere de la Recherche,selectionne des cibles therapeutiques pour soigner les maladies neurologiques grace a des modeles dynamiques des reseaux d'interactions moleculaires du systeme nerveux.

    Le poste concerne le developpement et la mise au point d'un systeme de modelisation de processus biologiques complexes sous la forme de reseaux . Le collaborateur aura pour mission la recherche et la selection l'algorithmes,leur programmation et integration dans le modele, la mise au point et la validation.

    Notre futur collaborateur, docteur ou ingenieur, aura une formation de haut niveau en Mathematiques, et si possible des notions en biologie. Pour mener a bien sa mission au sein de la societe, il est indispensable que celui-ci ait une bonne competence en algebre et en statistiques (notamment analyse matricielle, theorie des graphes). L'algorithmique de propagation / retro propagation de signaux dans des reseaux sera maitrisee.
    Autres exigences : autonomie en matiere de programmation, anglais lu et parle, dynamisme et capacites d'initiative (contexte start-up de biotechnologies).
    Contacts:Priere de nous envoyer votre CV, votre date de disponibilite et votre souhait de remuneration.

    Votre contact est :
    Olivier SOUPAULT olivier@heliobiosciences.com
    06 08 69 24 50

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    15/01/2003[AG]Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques
    Source:ABG-7538
    Date de parution:08/01/2003Date limite de réponse:08/02/2003
    Lieu:Montpellier (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:

    ABG-7538-POSITION POST-DOCTORALE EN STATISTIQUES, BIOSTATISTIQUES/BIOMATHEMATIQUES - Montpellier, France

    Le departement Immunologie-Oncologie recherche, dans le cadre
    d'analyses de donnees generees par les puces a ADN, un post-doc pour developper des methodes statistiques appliquees au transcriptome.
    Le candidat devra posseder un doctorat de Statistiques, biostatistiques et/ou biomathemathiques, une excellente connaissance des methodes statistiques et d'analyse de donnees de masse. Des connaissances en biologie seront tres appreciees.
    La duree de ce programme est de 12 mois renouvelable 6 mois.
    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.
    Contacts:Omar JBILO
    De preference par e-mail : omar.jbilo@sanofi-synthelabo.com
    Sanofi-synthelabo 371 Rue du Professeur Blayac
    34184 MONTPELLIER Cedex 4 - France


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    02/01/2003[AG]Génétique à haut débit chez Arabidopsis thaliana : approche quantitative de la réponse aux contraintes environnementales
    Source:AGM2
    Date de parution:19/12/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Versailles (78) (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Voir Pièce jointe
    Pièce Jointe : VersaillessechCR2.pdf (12 ko)
    Contacts:Voir Pièce jointe

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    02/01/2003[AG]BioInfomaticien stockage et analyse de données
    Source:BioInfo
    Date de parution:17/12/2002Date limite de réponse:17/01/2003
    Lieu:Toulouse (31) (France))Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Un CDD de 11 mois (salaire mensuel brut : 1868 euros) est proposé dans
    l'équipe informatique du projet AGENAE (Analyse du Génome des Animaux
    d'Elevage) sur le site INRA de Toulouse-Auzeville (31), à partir du 1er
    févier 2003.

    Le projet AGENAE a pour but de réunir les connaissances fondamentales
    sur la structure des principaux génomes d'intérêt pour l'élevage - dans
    un contexte de collaboration internationale - et valoriser les
    expertises concentrées à l'INRA en génétique moléculaire et en
    physiologie expérimentale sur les systèmes biologiques bien contrôlés
    dont l'institut dispose (animaux /ad hoc/ et installations
    expérimentales correspondantes).

    L'équipe bio-informatique (SIGENAE) composée de cinq personnes, met à
    disposition des différents laboratoires du projet (plus de 20) des
    outils et des services bio-informatiques. Ses travaux actuels sont
    centrés sur l'analyse de la qualité des séquences d'EST, leur contigage
    et leur annotation.

    Les demandes des utilisateurs pour la période à venir concernent
    l'analyse d'expression et la cartographie.

    Le bio-informaticien recruté aura comme mission de mettre en place des
    outils de stockage et d'analyse de données d'expression et d'apporter le
    support nécessaire à leur utilisation.

    Le niveau d'étude demandé est BAC +4 et plus.

    Cette personne doit être familière avec le traitement des données
    d'analyse d'expression (parties informatique et statistique), connaître
    le langage PERL et la programmation d'interface web.

    Contacts:Veuillez envoyer vos lettre de motivation, CV détaillé et demande de renseignement à Christophe Klopp (christophe.klopp@toulouse.inra.fr)
    = Christophe KLOPP BIA INRA Toulouse 31326 Castanet-Tolosan =
    = Tel: 05 61 28 50 36 Email: christophe.klopp@toulouse.inra.fr =

    La date limite des réponses est fixée au 17 janvier 2003.

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    02/01/2003[AG]POSTDOCTORAL POSITION IN BIOINFORMATICS AND GENOME ANALYSIS
    Source:BioInfo
    Date de parution:02/01/2003Date limite de réponse:?
    Lieu:Gant (Belgique)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Voir Piece jointe
    Pièce Jointe : gant.pdf (39 ko)
    Contacts:Voir Piece jointe

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    08/12/2002[AG]Chercheur BioInformaticien
    Source:BioInfo
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:31/12/2002
    Lieu:Paris (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (ENS) de Paris met actuellement en place une équipe de recherche en bioinformatique qui souhaite accueillir un chercheur ou un enseignant-chercheur post-doctoral ou statutaire (bio)informaticien.

    La thématique porte sur l'analyse structurale et fonctionnelle des génomes eucaryotes, en particulier de vertébrés. Les objectifs comprennent l'identification de contraintes évolutives s'exercant sur l'organisation et la régulation de l'expression des génomes (signaux et réseaux de régulation, topologie chromosomique et nucléaire,...).
    Les projets de recherches qui seront menés exploiteront des analyses de séquences à l'échelle des génomes avec d'autres données biologiques, par exemple des données globales ou spécifiques d'expression de gènes, à l'aide d'algorithmes qu'il conviendra de développer (intégration de données hétérogènes, cartographie de réseaux de régulation, recherche de motifs).

    Le ou la candidat(e) rejoindra l'équipe émergente (installation prévue en juin 2003) en lui apportant son expertise des méthodologies informatiques, ses connaissances en mathématique, statistique et programmation et en les appliquant à des problèmes biologiques fondamentaux. La personne choisie pourra mener des sujets de recherche propre en complémentarité avec les thèmes de l'équipe.
    Contacts:Le dossier comportant un résumé des travaux de recherche (une page maximum) et un CV est à envoyer à Hugues Roest Crollius (hrc@genoscope.cns.fr) avant le 31 décembre 2002.

    H. Roest Crollius
    Genoscope
    CNRS UMR8030
    2 rue Gaston Cremieux Tel: +33 (0)1 60 87 25 64
    91057 Evry Cedex Fax: +33 (0)1 60 87 25 89
    France e-mail:hrc@genoscope.cns

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    08/12/2002[AG]Maitre de conférence à Polytechnique
    Source:AGM2
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Palaiseau (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Poste de Maitre de Conférences en Bioinformatique à l'Ecole Polytechnique

    Un poste à plein temps va etre ouvert pour la rentrée 2003.

    Le/la candidat(e) rejoindra le groupe de bioinformatique, nouvellement créé, que je dirige.

    Il/elle participera à l'enseignement de biologie et de bioinformatique (charge annuelle comparable à un poste de MdC à l'université; il s'agit d'enseigner à un public débutant en biologie).

    Le domaine de recherches peut aller de la modélisation et aux différents volets de la bioinformatique "structurale", jusqu'à la simulation de l'évolution ou de réseaux cellulaires, en passant par l'analyse de séquences ou la protéomique "in silico".
    Contacts:J'invite les personnes intéressées à me contacter par email (simonson@igbmc.u-strasbg.fr) en envoyant CV, liste de publications, noms de trois personnes références.

    Les dossiers officiels de candidature seront à envoyer à l'Ecole Polytechnique à Palaiseau avant le 15 février (cf http://www.polytechnique.fr).

    L'inscription sur la liste de qualification des Maitres de Conférences des Universités n'est pas nécessaire (mais un niveau équivalent sera évidemment requis).

    Thomas Simonson
    Professeur, Département de Biologie, Ecole Polytechnique Directeur de Recherches, CNRS

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    08/12/2002[AG]BioInformaticien
    Source:BioInfo
    Date de parution:08/12/2002Date limite de réponse:31/12/2002
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Un cdd de 6 mois (salaire mensuel net: 1870 euos) est proposé dans l'équipe inra de génotypage à haut débit des plantes installée au centre national de génotypage à evry (91).

    cette équipe permet aux équipes nécessitant du génotypage à haut débit chez les plantes d'accéder aux technologies de pointe, en utilisant en particulier les snp (single nucleotide polymorphism); elle participe aux programmes scientifiques des équipes du secteur végétal de l 'inra et de ses partenaires qui nécessitent des capacités de production massive de données (analyse des ressources génétiques naturelles, connaissance des génomes et des déterminants génétiques de caractà¨res phénotypiques...).

    le cng a développé un logiciel "tout en un", genalys (m.takahashi.2002)
    pour la détection des snps: incorporation directe des résultats des séquenceurs, alignement par rapport à une séquence de référence, visualisation des chromatogrammes, caractérisation automatique des snps (position, type de changement), fichier de sortie compatible avec différents formats de fichiers (dont excel), en relation avec des bases de données.

    cependant des besoins plus particuliers aux programmes réalisés par l'équipe "plantes" sont à résoudre pour permettre une plus grande efficacité dans la manipulation et l'analyse des résultats et surtout leur diffusion aux équipes partenaires.

    la présence d'un (bio)informaticien dans l'équipe pendant 6 mois permettrait
    notamment:
    • la création automatique d'une séquence "virtuelle" permettant de visualiser simultanément tous les polymorphismes connus sur une séquence à
    • partir du fichier de sortie de genalys,
    • la reconstitution automatique d'une séquence nucléotidique à partir d'une séquence de référence et des positions et qualité des snps identifiés.
    • la constitution automatique des haplotypes et leur tri en fonction de leur proximité phylogénétique.
    • le calcul des estimateurs usuellement utilisés pour décrire la variabilité génétique des populations: hétérozygotie, fréquence des snps, des haplotypes.

    la personne recherchée doit être capable de concevoir des programmes en c,c++, perl. la connaissance de java serait appréciée.

    le cdd en question peut commencer au plus tard le 01/01/03.
    Contacts:pour tous renseignements, contacter dominique brunel (brunel@cng.fr)

    centre national de génotypage
    2 rue gaston crémieux cp 5721
    91057 evry cedex


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    03/12/2002[AG]Postdoctoral position : Genomique bacterienne
    Source:ABG
    Date de parution:25/11/2002Date limite de réponse:25/12/2002
    Lieu:Jouy en Josas (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The Unite de Virologie et Immunologie Moleculaires of the Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) has a 18-month postdoctoral position available for someone interested in bacterial genomics. Theproject is supported by a grant from INRA and involves the sequencing of the whole genome of one of the most economically significant fish-pathogenic bacterium worlwide. The position is available immediately and will be based in the INRA research center in Jouy-en-Josas, close to Paris, France. We are seeking a person with proven skills and experience with a wide range of molecular techniques and bioinformatic analyses. The applicants' nationality should be other than French. The laboratory has access to a variety of facilities in the general area of microbial genomics. More details about the project can be provided on request.
    Contacts:Send CV or request for more informations to abdenour@jouy.inra.fr

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    03/12/2002[AGMM]post-doc bioinformatique des patrons d'expression
    Source:BioInfo
    Date de parution:03/12/2002Date limite de réponse:20/12/2002
    Lieu:Lyon (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Une place de post-doctorant est disponible dans notre equipe pour la periode 2003-2005, sur le sujet suivant : modelisation des patrons d'expression, et application a la base de donnees de recepteurs nucleaires Nurebase.

    L'equipe Laudet travaille sur les recepteurs nucleaires, par des approches experimentales et bioinformatiques, incluant des aspects fonctionnels, evolutifs et genomiques. Les recepteurs nucleaires sont des facteurs de transcription hormone-dependants, avec des implications physiologiques et medicales majeures. Nous developpons depuis 2000 la base de donnees de recepteurs nucleaires Nurebase, en collaboration avec Guy Perriere au Pole bioinformatique lyonnais.

    Le post-doc devra developper une ontologie des patrons d'expression animaux qui permette des etudes comparatives, du type "les genes exprimes a l'avant des embryons de drosophile et de mammiferes". Il/elle devra egalement developper une extraction efficace des patrons d'expression de maniere automatique a partir des donnees EST, SAGE, puces, etc. Les methodes developpees seront appliquees en priorite aux recepteurs nucleaires dans Nurebase, mais seront de portee plus generale. Le post-doc devra egalement maintenir la version existante de Nurebase, et aura l'oportunite d'encadrer des stagiaires.
    Vous trouverez des informations complementaires sur les pages suivantes :

    http://www.ens-lyon.fr/LBMC/laudet/pres-fr.htm
    http://www.ens-lyon.fr/LBMC/laudet/nurebase.html
    http://www.ens-lyon.fr/~mrobinso/
    Contacts:Les candidats interesses doivent envoyer un CV et les coordonnees de deux personnes pouvant les recommander AVANT LE 20 DECEMBRE 2002 a :

    Marc Robinson-Rechavi

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    03/12/2002[AGMM]INGENIEUR COMMERCIAL
    Source:ABG
    Date de parution:19/11/2002Date limite de réponse:19/01/2003
    Lieu:Les Ulis (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    ABG-7463-AREA SALES REPRESENTATIVE / INGENIEUR COMMERCIAL (France & South Europe) - Les Ulis - 91 France

    Date de debut de diffusion du poste : 19/11/2002
    Date de fin de diffusion prevue : 19/01/2003

    We are a leading provider of discovery research software and services to life sciences companies. The company is dedicated to accelerating
    the discovery of new products in the pharmaceutical and related industries. We offer « chemically intelligent » discovery software tools to manage,
    analyze and share biological and chemical information; systemsintegration services; diverse chemical libraries; and contract research for identification and
    synthesis of new chemical compounds that are active in biological systems.

    For our French office we are looking for an:

    «Area Sales Representative» (based in Les Ulis - 91)

    Your responsibilities: Reporting to the Sales Manager, you prospect, develop, plan, and close sales: you maximize the opportunities for selling products and services to new and existing customers in assigned territory (mainly in France, Belgium, Italy, Spain, Portugal and part of Switzerland); you develop and maintain high-level customer satisfaction;
    you coordinate account activity with scientific and business development staff.

    Your profile: Your have a strong scientific and technical background (PhD, Engineer or equivalent, in chemistry or biochemistry). You have excellent communication skills and good ability to work within a team. You must be willing to travel frequently (50% of working time).

    We offer: A stimulating innovative and entrepreneurial working environment. Full-training on our products and services. A very attractive package (part fixed + bonus + company car).
    Contacts:For an interview with the company on December 13th, please send your application form (letter, CV and photo) with the following reference 021107 ABG to: ALTERNATYS, 11 rue de Cronstadt 75015 Paris. Email: contact@alternatys.com

    Thank you for quoting not only the employer reference above, but also Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    05/11/2002[AGMM]Assistant professor positions at the Biozentrum
    Source:BioInfo
    Date de parution:05/11/2002Date limite de réponse:10/11/2002
    Lieu:Basel (Suisse)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    The Biozentrum Basel and the Swiss Institute of Bioinformatics are recruiting two computational biologists for Assistant Professor positions in the field of Comparative Genomics, Biological Networks, or Simulation of Molecular Interactions. Details about these positions can be found at:
    http://www.biozentrum.unibas.ch/Open_positions/

    The deadline for sending applications is during the first week of November. If you know anybody interested, we kindly ask you to notify him/her about the approaching application deadline.

    Michael Primig & Torsten Schwede
    Contacts:Dr. Torsten Schwede (Assistant Professor)
    Biozentrum der Universität Basel & Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
    Klingelbergstr 50-70
    CH - 4056 Basel, Switzerland
    Tel: +41-61 267 15 81 Fax: +41-61 267 15 84
    Mail: Torsten.Schwede@unibas.ch
    http://www.biozentrum.unibas.ch

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    26/09/2002[AGMM]BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN
    Source:Ph. marc
    Date de parution:26/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Charleston (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    MEDICAL UNIVERSITY OF SOUTH CAROLINA

    BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN

    The Department of Biometry and Epidemiology (DBE) at the Medical University of South Carolina (MUSC) invites applications for a tenure track position in Bioinformatics and computational Biology, with a focus on functional analysis of genomic data. The Department offers numerous opportunities for collaboration with colleagues in basic science and clinical departments and in various centers on campus. The computational biology activities in MUSC are supported by the Departments of Pharmacology, Biochemistry, and others.

    The successful applicant will be expected to pursue an independent research program and collaborate with investigators in the basic and clinical sciences. Rank and salary will be commensurate with the applicant's qualification and experience.
    Contacts:Applications should include a CV with bibliography, names and addresses of three references, three representative reprints, and a brief description of research plan.

    Application materials should be addressed to:
    Eberhard O. Voit, Professor and Chair of Bioinformatics Search
    Committee, Department of Biometry and Epidemiology, P.O. Box 250835, Medical University of South Carolina, 135 Cannon Street, Charleston, South Carolina, 29425; E-mail: VoitEO@MUSC.edu.

    Evaluation of applications will begin immediately, but the search will remain open until the position is filled.
    MUSC is an Equal Opportunity/Affirmative Action Employer;
    women/minorities are encouraged to apply.

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    23/09/2002[AGMM]2 1/2 postes ATER
    Source:BioDocs
    Date de parution:23/09/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Orsay (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Il reste 2 1/2 postes ATER encore vacants au centre d'Orsay (désistement et retour inesperé d'un support) pour enseigner principalement en biostatistiques, bioinformatique, bureautique (Excel) au DEUST de biotechnologie, plus quelques heures en Genetique formelle (DEUG et licence).
    Contacts:Si vous êtes interessés (ou connaissez quelqu'un susceptible d'être interessé), veuillez SVP me donner rapidement vos (ses) coordonnées.

    Jane LECOMTE
    Vice-présidente de la commission de specialistes 66-69
    jane.lecomte@ese.u-psud.fr
    Université de Paris-Sud XI
    Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution
    UPRESA - 8079 CNRS
    Bat. 362, 91405 ORSAY CEDEX
    FRANCE
    Tel : 33 (0) 1 69 15 76 57
    Fax : 33 (0) 1 69 15 73 53

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    20/09/2002[AG]Genomique et post-genomique d'un lactobacille d'interet industriel
    Source:ABGt-2270
    Date de parution:18/09/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Jouy en Josas (78) (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    ABGt-2270-Pour le 30/09/2002 : Genomique et post-genomique d'un
    lactobacille d'interet industriel - INRA. Jouy en Josas.

    Date de debut de diffusion du poste : 18/09/2002
    Date de fin de diffusion prevue : 30/09/2002

    Projet:
    Le projet concerne de Lactobacillus bulgaricus, utilise pour la
    fabrication des yoghurts. Il s'agit d'analyser le genome de L. bulgaricus in silico et in vivo avec un interet particulier pour
    les voies metaboliques, les reponses aux stress et leur regulations. Pour l'analyse in vivo, les approches physiologique,
    genetique, transcriptomique et proteomique seront utilisees.

    Localisation:
    La these sera effectuee en Genetique Microbienne (~60 personnes,
    direction : SD. Ehrlich) dans l'equipe 'reponses aux stress' (responsable E. Maguin) sur le centre INRA de Jouy en Josas ou
    plusieurs unites de microbiologie travaillent egalement sur des projets concernant les bacteries lactiques ou modeles (E. coli, B. subtilis).

    Formation recherchee:
    DEA ou niveau equivalent. Formation en Genetique, microbiologie. Desconnaissances ou une experience en bio-informatique, analyse de genomes, transcriptomiques seront appreciees.

    Autres informations:
    La these est cofinancee par l'INRA et un industriel. Le financement (3ans) etant acquis, la these pourra commencer des le
    recrutement effectue.
    L'avancement du travail sera presente par le candidat lors i) des comites de theses INRA et ii) des reunions de suivi de
    projet avec le partenaire industriel.
    Contacts:Envoyer AVANT LE 30 SEPTEMBRE:
    i) un CV,
    ii) une lettre de motivation et,
    iii) les coordonnees d'1 ou 2 referants scientifiques (prof, encadrantde stage...) a Emmanuelle MAGUIN
    e-mail: maguin@jouy.inra.fr
    ou adresse : Genetique Microbienne. INRA. Domaine de Vilvert. 78352 Jouy en Josas Cedex. France

    Vous serez contacte pour un entretien debut Octobre.

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    17/09/2002[AG]GENOMICS OF RICE SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL DISEASES
    Source:hd-emploi-bio
    Date de parution:06/09/2002Date limite de réponse:01/10/2002
    Lieu:Ames (Etats-Unis)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Research Associate
    Iowa State University
    Date Posted: 09/06/02
    Ames IA United States
    Specialties: MB - Molecular Biology/Gene Regulation,MP - Microbe-Plant Interactions Other Specialties: Functional genomics, bioinformatics, microbial genetics

    Full Description:
    POSTDOCTORAL POSITION - GENOMICS OF RICE SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL DISEASES Position available immediately to take part in a recently funded functional genomics project to study rice (Oryza sativa) susceptibility to bacterial diseases, in the Department of Plant Pathology at Iowa State University. The objectives of this five-year project are 1) to identify rice genes that affect susceptibility or tissue specificity to the two
    subspecies of Xanthmonas oryzae, patthovar oryzae and pathovar oryzicola, that cause different, broadly representative types of disease, 2) to characterize genetic differences between these pathogens that relate to their unique modes of pathogenesis, and 3) to analyze and compare rice gene expression changes in response to each pathogen. Rice deletion mutant and activation-tagged lines with altered susceptibility or tissue specificity
    will be identified, and characterized by global gene expression
    analysis; pathogen genome comparisons and analysis of secreted proteins including in planta expression, random mutagenesis, and heterologous expression will be performed to characterize differences related to the different modes of pathogenicity; protein-protein interaction screens (yeast two-hybrid and
    tandem affinity purification) will be carried out to identify and
    characterize rice targets of pathogen effector proteins; and global gene expression changes in wild type rice in response to each pathogen will be examined. The position is available for six months, renewable on a yearly basis after that depending on performance. Starting salary is $35,000 per year. Applicants should have a strong record of accomplishment in molecular
    genetics, molecular biology, or a related field, and excellent writing and interpersonal skills.
    Contacts:Application Instructions: Send curriculum vitae including list of publications, statement of research interests and professional goals, and contact information for three referrers to Dr. Adam Bogdanove as hard copy to 351 Bessey Hall, Ames, IA 50011 or electronically to ajbog@iastate.edu.
    To guarantee consideration, applications must be received by October 1, 2002.
    Related Web Site: http://www.public.iastate.edu/~ajbog/
    Job Contact Email: ajbog@iastate.edu
    Job Type: Postdoctoral

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    17/09/2002[AG]Ingenieur de Recherche: Genomique fonctionnelle du Développement
    Source:ABG-7340
    Date de parution:16/09/2002Date limite de réponse:16/11/2002
    Lieu:Clermond-Ferrand (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Le candidat sera integre dans une equipe d’une vingtaine de personnes,specialisee dans la production de mais transgeniques
    et la caracterisation de genes et de mutants mais et riz.
    Il/elle participera plus specialement a un projet visant a identifier des nouveaux genes du developpement via differentes
    approches de genomique et s’impliquera sur l’utilisation des resultats dans certains domaines de post-genomique.
    Le candidat doit avoir une solide experience en biologie vegetale et genetique ainsi qu’une maitrise des techniques
    classiques de biologie moleculaire et des competences et aptitudes dans l’utilisation des outils bio-informatiques.

    Il/Elle aura en charge la planification des experiences en accord avec son responsable hierarchique et l’autonomie pour
    realiser ces dernieres. Il/Elle interagira fortement avec divers
    chercheurs, ingenieurs et techniciens du groupe qui
    l’accueille et pourra etre amene a collaborer avec d’autres groupes du laboratoire.
    Sens de l’organisation, rigueur, disponibilite et curiosite sont des qualites requises pour ce poste.

    NIVEAU
    BAC +5 minimum
    Maitrise de l’anglais scientifique.

    DATE DE DEBUT ET DUREE
    Novembre 2002
    18 mois

    LIEU
    Clermont-Ferrand (Aubiere) Puy de Dome
    Contacts:RESPONSABLE SCIENTIFIQUE
    Pascual PEREZ
    Directeur de Site / Coordinateur de Recherche
    Email: pascual.perez@biogemma.com
    Tel: 04 73 42 79 77
    Fax: 04 73 42 79 81

    ADRESSE DU LABORATOIRE
    BIOGEMMA
    Campus Universitaire des Cezeaux
    24, avenue des Landais
    63170 Aubiere
    Site internet: http://www.biogemma.com/

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory)
    et la reference ABG de cette offre.

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    16/09/2002[AG]Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc
    Source:ABG (ref:ABG-7332)
    Date de parution:16/09/2002Date limite de réponse:15/11/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Sygen International plc (formerly PIC International Group), a leading international farm animal genetics company, has recently been awarded two Marie Curie Industrial Host Fellowships, funded by the European Union.

    Sygen has over 1000 employees, distributed in 30 different countries. The company is developing genetic tools to select and breed improved farm animals. The company has two research laboratories, one in Cambridge (UK) and one in Berkeley (CA, USA).

    Two positions are currently available in our Cambridge laboratory where research is focussed on using genomic approaches to discover markers associated with economically important traits in the pig. The first fellowship is for a bioinformatician and the second fellowship is for a molecular biologist.

    Bioinformatician : The work will involve the development of bioinformatics tools and database mining applications. Applicants should have experience in programming and knowledge of database applications. Knowledge in molecular biology and statistics will be an advantage.

    Molecular biologist : The work will involve the discovery of SNPs (single nucleotide polymorphisms) in candidate genes. Applicants should have experience in molecular biology techniques, such as PCR and sequencing. Knowledge in SNP discovery and genotyping will be an advantage.

    The laboratory is well funded, well equipped and integrated into an academic environment. The two positions offer a unique opportunity to work with a cutting-edge genomics company.
    Contacts:For further information or to send your CV, please contact :
    Dr. Dominique Rocha
    Sygen Laboratory, Department of Pathology, University of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge, CB2 1QP, UK
    Email: dr219@mole.bio.cam.ac.uk
    phone: 44 1223 333 709; fax: 44 1223 333 346).

    The EU has strict eligibility criteria for people being accepted onto the Marie Curie Fellowship Programme. Candidates, maximum 35 years of age, national of an EU (except UK) or associated state or resident in the EU for the past 5 years are eligible to apply.
    The two positions are available from November/December 2002.


    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    11/09/2002[MM]Computational Biology or Bioinformatics
    Source:hd-emploi-info
    Date de parution:11/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Kyoto (Japon)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A Post-Doctoral Position in
    Computational Biology or Bioinformatics
    in Institute for Chemical Research
    Kyoto University, Japan

    A post-doctoral position in computational biology or bioinformatics is available at the Proteome Informatics Laboratory, Institute for Chemical Research, Kyoto University, Japan. The laboratory was established in April 2002 with donations from Silicon Graphics Japan,Ltd. The main objective of the laboratory is to build novel computational approaches for analyzing a variety of subjects related to proteomes.

    Current application areas of the laboratory include protein-protein interaction, docking between a protein and its ligand, small-molecule similarity, and pathways.

    The laboratory uses a variety of computational techniques, including algorithmic/thoretical approaches such as approximation algorithms for combinatorial optimization problems as well as machine learning techniques such as active ensemble methods and probabilistic models like finite-mixture models, hidden Markov models, and stochastic grammars.

    The candidate should have a Ph.D. and solid technical experience in one of the above fields or another field in computer science or a similar quantitative area of study. The applicant should be
    enthusiastic and energetic in doing new research in proteome
    informatics and should have sufficient programming skills in C, C++ or Java.

    The laboratory is well funded, and an excellent research environment will be provided. The position is for one year but renewable, by mutual agreement, until as late as March 2005.

    Kyoto University's Institute for Chemical Research is located 10 miles south of downtown Kyoto and 25 miles north of the center of Nara, and thus convenient to Japan's two most famous historical cities. The location is ideal for you to both enjoy Japanese traditional beauty and to devote yourself to a new research field, proteome informatics.

    Contacts:Please send your detailed curriculum vitae to:

    Dr. Hiroshi Mamitsuka
    Associate Professor
    Institute for Chemical Research
    Kyoto University
    Email: mami@kuicr.kyoto-u.ac.jp

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    10/09/2002[MM]Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics
    Source:http://jobs.ac.uk
    Date de parution:10/09/2002Date limite de réponse:03/10/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics
    Department of Biochemistry

    Applications are invited for two posts in connection with a collaboration between Cambridge University and Tripos Associates to develop software for fold recognition and comparative modelling. A computer programmer is required to integrate existing software from Cambridge into the Tripos package and to develop new alogrithms. A post-doctoral research associate with knowledge of and experience in bioinformatics is required to develop new approaches in structural bioinformatics. The posts are available up to three years depending on experience and qualifications on the University scale (£17,626 - £26,491).

    The closing date for applications is 3rd October 2002.

    The Department operates a no-smoking policy.


    The University is committed to equality of opportunity.


    Contacts:Written applications including CV and names and addresses of two referees should be sent to Mrs B Humphry, Department of Biochemistry, 80 Tennis Court Road, Old Addenbrooke's Site, Cambridge, CB2 1GA, email: bjh32@mole.bio.cam.ac.uk.

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    05/09/2002[MM]Post Doc en bioinformatique aux NIH, Bethesda, USA
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:05/09/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Bethesda (Maryland, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    On monte un projet Jean-Francois Gibrat et moi (Unite MIG, INRA) de collaboration avec des collegues du NIH a Bethesda, Maryland, BK Lee (National Cancer Institute) et Peter Munson (Center for Information Technology, CIT). Il s'agit d'analyser et de classer les domaines des proteines de la pdb en utilisant VAST et SHEBA (un programme developpe par BK Lee) de facon a avoir une analyse automatique de la pdb en domaines structuraux. Cela peut servir pour ameliorer le threading et autres types de prediction du repliement des proteines. Un poste de Post Doc, deux ans renouvelables eventuellement est ouvert au CIT, Il faudrait un bioinformaticien ayant un experience en structure des proteines, ou quelqu'un forme en RMN ou radiocristallographie des proteines ayant une experience pratique en programmation. Le lieu est ideal pour ce genre de chose et l'ambiance tres conviviale et scientifiquement tres bon. Le projet va demarrer fin de cette annee, la position est ouverte.
    Contacts:Pendre contact avec moi par email (jgarnier@jouy.inra.fr)

    Jean Garnier
    INRA - Centre de Recherche de Versailles
    Unite Mathematique Informatique et Genome
    RD 10 (route de Saint-Cyr)
    F-78026 Versailles Cedex, France

    Tel. : 33.(0).1.30.83.33.67 or 33 51 (sec.)
    Fax : 33.(0).1.30.83.33.59

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    02/09/2002[AGMM]Novembre 2002 : Recrutement du Responsable d'une plate-forme R&D en bioinformatique.
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:02/09/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique) recrute fin 2002 le Directeur de l'Unité de recherche "Génomique-Info" située à Evry (30kms sud de Paris). Cette Unité est responsable d'une plate-forme Bioinformatique et constitue un pôle national de compétences et d'expertise dans le domaine du végétal.

    Le directeur exercera ses missions en collaboration avec les équipes de l'INRA concernées, dans le cadre de partenariats y compris européens (Génoplante particulièrement, mais aussi GABI, GARNET, ...) :
    -Conception, développement et mise en place de systèmes d'informations génomiques intégrés.
    -Développement des méthodologies, outils et interfaces pour l'analyse et la valorisation des données.
    -Stratégies d'analyse à haut débit des données produites.
    -Veille technologique dans les domaines bioinformatiques.
    -Diffusion de l'information et de l'expertise vers les différentes équipes-relais de l'INRA.
    -Animation et coordination en partenariat avec les responsables d'autres projets transversaux (ex : AGENAE).
    -Valorisation des travaux, publications et transferts.
    -Assistance technique aux équipes biologistes partenaires.
    -En collaboration avec Infobiogen, exploitation, maintenance et sécurité du système.

    Responsable d'une équipe d'une dizaine d'ingénieurs, il(elle) devra à ce titre assurer un certain nombre de fonctions :
    - animation scientifique et collective de l'Unité ;
    - accompagnement et aide à l'insertion des jeunes chercheurs ;
    - suivi du bon déroulement des travaux et démarche qualité ;
    - gestion optimale des ressources humaines ;
    - gestion administrative et financière de l'Unité ;
    - organisation de la communication avec l'extérieur.

    Compétences requises :
    -5 ans minimum d'expérience en conduite de projets informatiques dans le domaine de la recherche en biologie ;
    -expérience en management d'équipe et animation scientifique ;
    -connaissances en bioinformatique et génomique indispensables ;
    -expérience solide du monde Unix, SGBD, développement et architectures distribuées ;
    -aptitude à la communication ;
    -français et anglais courant.

    Formation initiale :
    Thèse ou Diplôme Ingénieur ou équivalent BAC + 5
    Double compétence biologie - informatique

    Le poste est ouvert au 1er novembre, CDD niveau IR, rémunération fonction du nombre d'années d'expérience.
    Contacts:Pour des détails sur le poste, contacter Emmanuel Barillot : manu@infobiogen.fr

    Envoyer CV + lettre de motivation + court rapport d'activités AVANT FIN SEPTEMBRE à cch@jouy.inra.fr
    ou à :
    Catherine CHRISTOPHE
    Biométrie et Intelligence Artificielle
    INRA Domaine de Vilvert
    78352 Jouy-en-Josas cedex

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    30/08/2002[AGMM]Thèses en data/text mining
    Source:ABG (ref:ABGt-2197)
    Date de parution:30/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Genève (Suisse)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for 2 PhD studentships in data and text mining applied to molecular biology. Successful candidates will join the Artificial Intelligence Research Group, CSD, University of Geneva. They will pursue research in connection with two European projects due to start next fall:
    BioMinT (Biological Text Mining) http://cui.unige.ch/AI-group/biomint/biomint.html
    FunProt (Knowledge Discovery in Functional Proteomics) http://cui.unige.ch/AI-group/funprot/funprot.html

    A third position (pending approval) will involve basic research on developing more powerful representations for automated knowledge discovery.

    Candidates should have the following qualifications or at least a substantial subset thereof:
    - solid training in computer science with good mathematical and outstanding programming skills
    - a strong background in data analysis, machine learning, data/text mining,knowledge representation and management (in particular ontology engineering and information integration)
    - a clear aptitude for independent and creative research
    - bioinformatics literacy or at least a strong interest in the biological sciences, particularly in genomics and proteomics
    - good communication skills in English and French (or at least a clear indication of willingness to learn the latter).

    The salary for a PhD student is around 47500 Swiss Francs per annum.
    Contacts:Please send your curriculum vitae and contact information on three references to Melanie.Hilario@cui.unige.ch.

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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    30/08/2002[AGMM]Ph.D. or M.Sc. Studentship in BIOINFORMATICS
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:26/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Winnipeg (Manitoba, Canada)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Required Skills:
    Qualified applicants must have a B.Sc. or M.Sc. in Bioinformatics, Computational Biology, or related field. Applicants with a degree in biology and extensive programming experience will also be considered.

    Send Resume to: frist@cc.umanitoba.ca

    Job Description:
    Databases are an increasingly valuable resource for biological discovery. However, in-silico experiments are only as good as the underlying datasets that are extracted from these databases. In particular, biases of many different types exist in databases. For example, databases such as GenBank and SwissProt are biased toward model species, while most species are underrepresented. As well, the extraction and refinement of data from these databases is often difficult to automate. We wish to address the following questions:
    1. What kinds of biases exist in biological databases?
    2. How can bias be quantified?
    3. Which analytical methods are affected by bias, and how are they affected?
    4. How can methods for dataset creation and analysis of genomic data be adapted to correct for the biases inherent in biological databases?

    The incumbent would pursue a degree in the interdepartmental Graduate Genetics Program . Stipends are at NSERC Fellowship rates (Ph.D.: $19,100, M. Sc. $17,300 per year) to cover living expenses, tuition and fees. Funding for up to three years has been provided as part of the Genome Canada Bioinformatics Platform ). The position is available immediately.
    Contacts:Applications MUST include: 1) a curriculum vitae, including a brief description of your academic and research experience and representative publications 2) an example of computer code that you have written, illustrating your ability to write clean and understandable code 3) the names, phone numbers and email addresses of three referees.

    Contact for more information:
    Brian Fristensky
    University of Manitoba
    Department of Plant Science
    Winnipeg, MB. CA
    Phone: 204-474-6085
    Fax: 204-474-7528
    frist@cc.umanitoba.ca
    http://home.cc.umanitoba.ca/~frist

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    29/08/2002[AGMM]IR2501 Ingénieur de Recherche - Ingénieur en biologie
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Versailles-Grignon (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur de recherche en biologie conçoit, développe et expérimente de nouvelles méthodes ou technologies dans le cadre de thématiques de recherche en biologie.

    Références du concours :
    Concours: IRA02
    Intitulé: Ingénieur en Biologie
    Lieu: Paris

    Activités:
    Conception et développement d'un projet d'analyse du métabolisme végétal. Responsabilité de la réalisation de ce projet.
    Elaboration des protocoles et mise en place des techniques analytiques adéquates
    Analyse, interprétation et diffusion des résultats
    Recherche et synthèse bibliographiques sur la thématique scientifique et les techniques d'analyse
    Suivre l'évolution scientifique et technique du domaine
    Conseiller et encadrer les utilisateurs internes et externes

    Compétences:
    Connaissances théoriques et pratiques en biologie
    Maîtrise et connaissance pratique des techniques de biochimie et de spectrométrie de masse
    Utilisation des outils informatiques pour le traitement des données et interprétation des résultats
    Connaissances des réglementations en hygiène et sécurité
    Maîtrise des techniques de présentation écrite et orale des résultats
    Maîtrise de l'anglais scientifique et technique

    Environnement:
    L'activité s'exercera au sein du laboratoire de Biologie des Semences, en interaction avec d'autres laboratoires du centre (Phytopharmacie, Nutrition azotée des Plantes). La personne recrutée travaillera sous la responsabilité d'un scientifique du laboratoire.

    Capacités personnelles:
    Diplôme de doctorat, d'ingénieur ou équivalent
    Formation en biologie avec de solides connaissances de biochimie et des techniques physico-chimiques appliquées à la biologie
    Expérience en biochimie analytique et spectrométrie de masse
    Compétence souhaitée en analyse statistique et en bioinformatique
    Autonomie, capacité d'encadrement et de travail en équipe
    Maîtrise de l'anglais scientifique
    Contacts:Personne(s) à contacter:
    Mme POLL 01 30 83 30 68
    Mme GARCÈS 01 30 83 34 79

    Annonce sur le site de l'INRA

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    29/08/2002[AGMM]IR1601 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Valbonne Sophia-Antipolis (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur expert en développement d’applications prend en charge la maîtrise d’œuvre de développement d’applications – architecture et logiciel – en assurant la conception, la conduite de la réalisation et la mise en place.

    Références du concours :
    Concours: IRE01
    Intitulé: Ingénieur en informatique et bioinformatique
    Lieu: Paris

    Références du profil :
    n° BAP: E Informatique Calculs Scientifiques
    Centre: Antibes Département: Santé des Plantes et Environnement
    unité n°: 1112 UMR INRA-UNSA Réponses des Organismes aux Stress Environnementaux
    lieu de travail (si différent): Valbonne Sophia-Antipolis

    Activités:
    Réaliser le développement de logiciels d'analyse et de stockage de données bioinformatiques.
    Intégrer du matériel de technologie avancée et les logiciels correspondants.
    Assurer la mise en oeuvre d'applications bioinformatiques et la formation d'utilisateurs de ces applications.
    Assurer la veille sur les méthodes d'analyse de génomes et de transcriptomes.

    Le poste donne droit à une prime informatique de type 1 à 100% en qualité de Chef de projet (cf. note de service n° 2001-56).

    Compétences:
    Double compétence en informatique et en biologie.
    Maîtriser une ou plusieurs langages de programmation et un ou plusieurs outils de développement.
    Maintenir un site web dynamique.
    Avoir des notions en statistiques, probabilités et bases de données.
    Connaître le domaine d'application et maîtriser ses techniques spécifiques.
    Maîtriser l'anglais scientifique et technique.

    Environnement:
    Une plate-forme de génomique fonctionnelle est mise en place par le Centre d'Antibes. Cette plate-forme commune INRA-CNRS a développé des méthodes d'analyse du transcriptome par biopuces d'ADN (DNA microarrays). L'analyse massivement parallèle de séquences issues de programmes de séquençage (génomique comparative) conjointement aux résultats expérimentaux issus de l'analyse du transcriptome requiert le dessin et l'utilisation de logiciels complexes. L'agent aura une mission-clef à l'interface entre les technologies de génomique fonctionnelle et les sciences biologiques représentées par les utilisateurs de la plate-forme (recherche agronomique, biomédicale, écotoxicologie etc.). L'agent devra anticiper (recherche) et répondre (service) aux besoins nouveaux en matière de bioinformatique.

    Capacités personnelles:
    Des connaissances solides en informatique (bases de données, génie logiciel, technologie des réseaux) ou bioinformatique. Une expérience dans un laboratoire de biologie est souhaitée. Un candidat dont la formation initiale est en biologie devra alors démontrer (publications et activité professionnelle antérieure) une compétence avérée en bioinformatique. Aptitude aux relations humaines, contacts fréquents (recherche, formation, information) avec des biologistes ayant des horizons et intérêts divers.
    Contacts:Personne(s) à contacter:
    M. FEYEREISEN 04 93 12 38 02

    Annonce sur le site de l'INRA

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    29/08/2002[AGMM]IE1602 Ingénieur d' Etudes - Ingénieur en développement d'applications
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/08/2002Date limite de réponse:20/09/2002
    Lieu:Toulouse (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Résumé:
    L’ingénieur en développement d’applications analyse, réalise et met en place des développements logiciels en définissant des moyens matériels et logiciels en concertation avec le responsable de projet. Il en assure la
    maintenance corrective voire évolutive.

    Références du concours :
    Concours: IEE01
    Intitulé: Ingénieur en bioinformatique
    Lieu: Paris

    Références du profil :
    n° BAP: E Informatique Calculs Scientifiques
    Centre: Toulouse Département: Santé des Plantes et Environnement
    unité n°: 441 Laboratoire de Biologie moléculaire des relations plantes-microorganismes

    Activités:
    - Développer, mettre en oeuvre et diffuser des outils d'annotation et de comparaison des génomes.
    - Exploiter les données d'expression à grande échelle (microarrays).
    - Assurer la veille sur les méthodes d'analyse de génomes.

    Le poste donne droit à une prime informatique de type 2 à 75% en qualité d'Analyste (cf. note de service n° ?)

    Compétences:
    - Double compétence en informatique et en biologie.
    - Connaître l'analyse des séquences.
    - Maîtriser l'environnement Unix et les langages perl, C et un langage objet.
    - Maintenir un site Web dynamique.
    - Avoir des notions en statistiques et en bases de données.
    - Maîtriser l'anglais scientifique et technique.

    Environnement:
    L'activité sera réalisée dans le double contexte du pôle Génome & Informatique de l'INRA et de la Génopole de Toulouse, au sein de l'équipe "Régulateurs de Rhizobium et analyse informatisée des génomes". L'ingénieur sera impliqué dans des projets de génomique de bactéries des plantes, symbiotiques et pathogènes. Les outils qu'il mettra en oeuvre contribueront à l'identification de gènes candidats, en particulier par génomique comparative et par l'analyse des données d'expression.

    Capacités personnelles:
    La double compétence en informatique et en biologie est requise. Elle peut résulter d'une formation complémentaire (ex., DEA, DESS) ou d'une expérience en bio-informatique. Des connaissances en statistiques et en bases de données seront appréciées.
    Contacts:Les dossiers de candidature sont à retirer sur le site de l'INRA.

    Ils devront être envoyés à l'INRA-Paris avant le 20 septembre 2002. Le concours aura lieu à Paris en décembre 2002 pour un recrutement à compter de janvier 2003.

    Personne à contacter:
    M. KAHN
    Laboratoire de Biologie Moléculaire des Relations Plantes-Microorganismes
    INRA/CNRS
    BP 27
    31326 Castanet-Tolosan Cedex
    France
    Tel. +33(0)561.28.53.29
    Fax. +33(0)561.28.50.61

    Annonce sur le site de l'INRA

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    12/08/2002[AGMM]Post-doct informatique pour la protéomique
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:12/08/2002Date limite de réponse:30/09/2002
    Lieu:Grenoble (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Contexte scientifique du projet
    Le premier niveau d'annotation d'un génome consiste (1) à repérer l'ensemble des séquences codantes de ce génome puis (2) à leur associer toutes les informations dont on peut disposer. Ces informations concernent le gène lui-même ou la protéine codée par ce gène. L'annotation du génome d'un organisme vise donc à réunir l'ensemble des informations pertinentes qui permettront d'appréhender, au niveau moléculaire, les grands mécanismes biologiques mis en jeu chez cet organisme.
    L'analyse " massive " des protéines présentes dans une cellule (appelée analyse protéomique) constitue un moyen d'identifier les gènes codant pour ces protéines. Dans cet esprit, le laboratoire de Chimie des Protéines du CEA/Grenoble (équipe mixte CEA/INSERM), fortement soutenu par la Génopole Rhône-Alpes, met en place, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes et la société Génome Express, un projet visant à utiliser la Protéomique comme outil d'annotation des génomes. Une des conditions nécessaires à la réussite de cet objectif réside dans notre capacité à développer rapidement une plate-forme bioinformatique et informatique dédiée à la Protéomique afin d'être en mesure de traiter l'importante masse d'informations (estimée à environ 10 Go/jour au début 2003) produite par ce type d'approche.

    Le projet
    Le projet proposé consiste à concevoir et réaliser une base de données performante qui, interfacée avec notre future plate-forme informatique (LIMS, logiciels de bioinformatique commerciaux ou développés en interne), nous permettra d'exploiter au mieux les informations produites dans le but d'annoter les génomes. La réalisation de ce projet devra s'intégrer harmonieusement avec le reste des travaux conçus pour cette plate-forme.

    Environnement informatique
    Système: Unix, Windows NT
    Programmation: C, Java SGBD Relationnels et/ou Orientés Objet.

    Compétences souhaitées et profil recherché
    Compétences : Bonne connaissance des systèmes de gestion de bases de données (relationnels et/ou orientés objet) et des langages de modélisation (UML).
    Expérience souhaitée dans le développement d'applications sous Unix. Goût pour le travail en équipe et pour la communication interdisciplinaire.

    Profil : les candidats doivent remplir fin Septembre l'une des deux conditions suivantes : 1) être engagés dans la préparation d'un doctorat, hors labos CEA, et l'obtenir avant Décembre 2002, ou 2) être titulaires depuis 2 ans maximum d'un doctorat (préparé hors labos CEA) et avoir eu pour activité depuis leur soutenance de thèse, soit un premier stage post-doctoral hors CEA, soit une période de recherche de stage post-doctoral de 6 mois maximum.

    Contrat : CDD d'un an, renouvelable un an.
    Rénumération : La rénumération est alignée sur la grille des salaires du CEA.
    Date d'embauche souhaitée : Automne 2002
    Lieu de travail : Grenoble
    Contacts:Pour toute information complémentaire et envoi de CV (accompagné d'une lettre de motivation), contacter :
    Jérome Garin : jgarin@cea.fr
    Alain Viari : Alain.Viari@inrialpes.fr

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    12/08/2002[AGMM]Possibilité d'accueil pour un an à l'Université de Cambridge
    Source:BioDocs
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:15/11/2002
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le Service Scientifique de l'Ambassade de France au Royaume Uni a signé une convention avec le "Churchill College" de Cambridge afin de permettre l'accueil d'un chercheur français pendant une période pouvant aller jusqu'à un an. Après examen des candidatures par le Service Scientifique et le Churchill College, le chercheur selectionné est nommé Fellow par l'assemblée du Collège. Il(elle) peut ainsi bénéficier gratuitement pendant un an du logement, de la participation aux déjeuners et diners à la "Haute table" ainsi que de toutes les facilités du Collège. Le titre de Fellow restant acquis, il(elle) peut par la suite continuer de bénéficier des avantages liés à ce statut à l'occasion de séjours sur le campus de Cambridge. Pendant sa résidence au Churchill Collège, le Fellow doit effectuer ses recherches dans un laboratoire de l'Université de Cambridge. Cette convention est ouverte aux chercheurs de toutes les disciplines. Le niveau qui doit être au minimum celui d'un post-docteur confirmé, peut aller jusqu'à celui de Professeur ou Directeur de Recherche. Pour la prochaine année universitaire les candidatures pourront être reçues jusqu'au 15 novembre 2002.
    Contacts:Les candidatures ou les demandes de renseignements complémentaires doivent être envoyées à l'adresse suivante (par courrier ou par E-mail):
    Professeur Gilbert Balavoine
    Conseiller pour la Science et la Technologie
    Ambassade de France
    6 Cromwel Place
    London SW7 2JN UK
    E-mail: gilbert.balavoine@diplomatie.fr

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    07/08/2002[MM]PostDoc position in Bioinformatics
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Boston (Massachussets)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Northeastern University

    Job Title: PostDoc position in Bioinformatics

    Required Skills:
    PhD in biology, structural biology, bioinformatics, physics, computer science, mathematics, statiscits or related disciplines is required. Programming experience for non-computer science applicants (especially C/C++, Java, Perl, SQL) and/or website and database construction are advantage.

    Job Description:
    There are several projects available, from protein folding theory to large-scale methods, which also includes protein network and expression data analysis and development and maintenance of innovative web database resource for molecular biology. Work in close collaboration with experimental laboratories. PhD in biology, structural biology, bioinformatics, physics, computer science, mathematics, statiscits or related disciplines is required. Programming experience for
    non-computer science applicants (especially C/C++, Java, Perl, SQL) and/or website and database construction are advantage. For applicants with computer science degree, knowledge of biology, biochemistry, molecular biology is a plus. The position is for two years with possible extention.
    Interested applicants should send CV, statement of research interests and the names and addresses of three references to Valentin Ilyin, ilyin@mozart.bio.neu.edu, 414 Mugar, Department of Biology, Northeastern University, Boston, MA 02115.
    Contacts:Contact for more information and questions please contact :
    Valentin Ilyin
    Northeastern University
    414 Mugar, Northeastern University
    Boston, MA 02115, MA. US
    Phone: 1-617-373-4031
    ilyin@mozart.bio.neu.edu

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    07/08/2002[MM]Several PhD level openings
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    The Department of Informatics at Aventis Paris Research Center has several PhD level openings. If you are interested in working in multicultural pharmaceutical environment at the informatics interface between chemistry and biology and you can offer significant skills, we would like to hear from you. We are looking for qualified candidates in bio- and chemoinformatics for research and/or managerial positions.
    Contacts:For further details please contact vladimir.saudek@aventis.com

    Vladimir Saudek, PhD
    Director of Informatics France
    Aventis Pharma
    Paris Research Center
    13 Quai Jules Guesde
    F-94400 Vitry-sur-Seine
    France
    tel : +33 1 5893 2133
    tel : +33 1 5893 2504 (secretary)

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    07/08/2002[MM]Modélisateur moléculaire chez L'Oréal
    Source:http://www.ibcp.fr/GGMM/emplois.html
    Date de parution:25/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Aulnay (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    MODELISATEUR MOLECULAIRE - Paris -France - (25 juin 2002)

    Vous ne ressemblez à personne.
    Bien entendu, vous voulez intégrer une entreprise qui ne ressemble à aucune autre.
    Imaginez... L'Oréal. Le plus beau portefeuille de marques internationales dans le monde de la beauté, qui s'appuie sur une recherche à la pointe de la technologie. Quelques faits de l'année 2000 : L'Oréal a déposé 420 brevets, lancé environ 450 nouveaux produits, vend 85 produits à la seconde et a plus que triplé son chiffre d'affaires consolidé (12,7 milliards d'Euros) en 10 ans...mais avant tout L'Oréal représente une formidable aventure humaine partagée à travers le monde autour de la beauté, l'innovation et la conquête de nouveaux marchés.

    L'Oréal recherche un Modélisateur Moléculaire pour son Département Modélisation et Evaluations Rapides. Le poste est basé à Aulnay (93) dans notre Centre International de Recherche Avancée consacré aux Sciences de la Matière.

    Rejoignez les 2700 chercheurs du Groupe L'Oréal passionnés par la cosmétique et spécialisés dans une trentaine de disciplines scientifiques (chimie, biologie, physique, physico-chimie, biotechnologies , toxicologie, génétique, pharmacie, formulation cosmétique...) au service de nos différents métiers : le capillaire (coloration, soin et hygiène du cheveu, coiffage) et la peau (soin, maquillage, hygiène corporelle, protection solaire, parfums).

    Rattaché au Responsable Modélisation et Statistique, vous travaillerez en étroite collaboration avec les chimistes de synthèse, à la modélisation et à la conception de molécules originales et innovantes.
    Votre mission consistera à développer plusieurs modèles structure-activités prédictifs et pertinents permettant de faire des propositions aux chimistes de nouvelles molécules à synthétiser possédant les propriétés cosmétiques et biologiques adéquates.

    Titulaire d'un Doctorat, vous maîtrisez les méthodes de modélisation moléculaire, en particulier les techniques modernes de QSAR : descripteurs moléculaires 2D et 3D, techniques de sélection des descripteurs pertinents et d'évaluation de la qualité prédictive des modèles structure-activité.
    Une première expérience (post-doctorale ou industrielle), au cours de laquelle vous avez géré un programme de recherche en collaboration avec des chimistes serait un plus.
    Par ailleurs vous avez une bonne pratique des logiciels usuels de modélisation moléculaire ainsi que des langages et environnements de programmation informatique, et de bonnes connaissances en chimie.
    Ouvert, pragmatique et rigoureux, vous avez le sens du travail en équipe pluridisciplinaire.
    L'Oréal accueille avant tout de fortes personnalités génératrices d'idées.

    Faire partie de ceux qui imagineront L'Oréal demain : voici votre L'Oréalité !
    Contacts:Postulez en ligne en indiquant le numéro de référence suivant : 223

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    07/08/2002[AG]Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon, Villeurbanne (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Le projet est de développer des méthodes d'apprentissage pour extraire automatiquement des informations pertinentes des données générées par les puces à ADN. L'approche de "data mining'' proposée est la découverte de règles d'association puis le traitement des règles fréquentes et valides dans un processus interactif entre informaticien et biologiste. Les réseaux de gènes étudiés sont ceux de l'adaptation métabolique à des changements nutritionnels en vue de l'étude de leur implication dans le développement de l'obésité et du diabète de type 2 chez l'homme.
    Pièce Jointe : 13B.pdf (99 ko)
    Contacts:Département NASA et INSA Lyon, Unité INSERM U449 et LISI de Lyon,
    Encadrants S. Rome, J.-F. Boulicaut

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    07/08/2002[AG]Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Versailles (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'objectif de ce projet de recherche est de concevoir et d'adapter des méthodes d'apprentissage automatique capables d'apprendre les connaissances nécessaires à l'extraction automatique de connaissances à partir de textes scientifiques. L'apprentissage se fera à base de corpus à l'aide de méthodes d'analyse linguistique et conceptuelle. Cette approche sera appliquée à l'étude des fonctions géniques, à travers par exemple, l'étude des interactions entre gènes. L'objectif est de mieux interpréter les mécanismes cellulaires et de contribuer à la compréhension du fonctionnement des génomes.
    Pièce Jointe : 5B.pdf (103 ko)
    Contacts:Départements BIA-MIC, Unité MIG Versailles,
    Encadrants C. Nedellec, Ph. Bessières

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    07/08/2002[AG]Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.
    Source:Préparer sa thèse à l'INRA
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Villeurbanne, Toulouse (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Une modélisation informatique intégrant une représentation complète des différentes notions d'homologie a permis de développer un modèle de cartographie génomique pour plusieurs espèces (homme, souris). Le projet consiste à modéliser la variabilité génétique (intraspécifique ou interspécifique) relative à la structuration des génomes. Cette modélisation ainsi que la synthèse de l'ensemble des connaissances disponibles dans les différentes espèces devraient permettre d'éclairer le lien entre le polymorphisme des gènes, leur évolution et leur positionnement au sein des génomes.
    Pièce Jointe : 12B.pdf (117 ko)
    Contacts:Département GA et Université Lyon, Unité Génétique Cellulaire Toulouse et UMR 5558 Lyon
    Encadrants D. Milan, C. Gautier

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    07/08/2002[AG]Biostatistician - Fungal Genomics Project
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:19/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Montréal (Québec, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics

    Job Title: Biostatistician - Fungal Genomics Project

    Required Skills:
    Strong background in statistics is required; Strong knowledge of statistical issues in bioinformatics is highly desirable, especially in the areas of sequence similarity scores, normalization of microarray data, clustering and bootstrap estimation of significance, and high-throughput chemical assays;
    Knowledge of machine learning techniques is desirable;
    Programming fluency in MatLab or R or S/S-plus is required;
    Ability to program in C++, Java, and Perl is desirable;

    A PhD in statistics or a related area is essential; postdoctoral experience is preferable. Industry experience is desirable but not required.

    Job Description:
    The Centre for Structural and Functional Genomics, Concordia University, Montreal, Quebec is seeking a biostatistician to provide statistical analysis as part of our bioinformatics team for a project that will identify fungal enzymes with applications to industrial processes. Dr. Adrian Tsang, principal investigator has recently received a large project grant from Genome Canada/ Genome Quebec for 2002- 2005. We are inviting qualified researchers in the fields of molecular biology, genomics, proteomics and bioinformatics to participate in a large-scale project at Concordia University. The project is supported by a multi-disciplinary team of scientists based at the following research centres located in Montreal and Laval: Concordia University's Departments of Biology, Biochemistry, Chemistry and Computer Science, Institute Nationale Recherche Scientifique - Institute Armand Frappier, National Research Centre - Biotechnology Research Institute and the Pulp and Paper Research Institute of Canada.

    The biostatistician will ensure that appropriate statistical methods are used in all aspects of the project. This mainly involves analysis of cDNA microarray data, but also includes data quality reports for each wet lab process, the interpretation of statistical significance of sequence analysis results, and the analysis of data from high-throughput chemical assays. It is expected that the biostatistician will be able to develop new statistical models and methods as required. The position requires that the biostatistician will guide postdoctoral fellows and graduate students in the analysis of transcription profiles.
    Contacts:Send Resume to: genecan@gene.concordia.ca

    Contact for more information:
    Margaret Guest
    Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics
    1455 de Maissonneuve Blvd. West
    Montreal, PQ. CA
    Phone: (514) 848-3392
    genecan@gene.concordia.ca

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    07/08/2002[AGMM]Positions in a Multidisciplinary Team for Bioinformatics
    Source:Université libre de Bruxelles
    Date de parution:07/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Bruxelles (Belgique)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A new non-for-profit organisation, set up by the Brussels Region and the Université Libre de Bruxelles to develop state of the art bioinformatics methods and software, is recruiting highly qualified staff for its research and development projects. The main project is in the area of functional genomics. It concerns the development of aMAZE, an integrated system for storage, management and querying information on metabolic and gene regulation networks, transport, and signal transduction.
    Several positions are available immediately to join the aMAZE team, in order to develop professional level software targeted to Academic and Industrial scientists world-wide, with whom frequent contacts will take place. Team work skills are an important requirement, while knowledge of French is not mandatory. For the IT positions, previous experience in working in a scientific environment will be an advantage.

    Biologists or Biochemists to work on data annotation
    He/she will annotate and curate biological and biochemical data. He/she will have the opportunity to work closely with programmers, database developers, and experimental scientists.
    The successful candidate should have a PhD in chemistry, biochemistry or biology and possess basic scripting/programming experience.

    Computer Systems Administrator
    He/she will be in charge of the administration of the computer systems. His/her first task will be to design, install and maintain the new computer systems used by the team.
    The successful candidate should have proven experience in Unix system administration, including server management, networking and security aspects.

    Database Administrator
    His/her main task will be to install and manage the database servers. His/her will also assist the scientists in the design and the optimisation of the various databases needed for the ongoing research and development activities.
    The successful candidate should have proven experience with management of relational databases. Knowledge of Oracle will be an advantage.

    Programmers
    They will be in charge of the maintenance, testing and further development of the aMAZE kernel, tools, and interfaces. They will be involved in the design process of the system.
    The successful candidate should have proven experience in Object-Oriented programming and in some of the following technologies, JAVA/RMI/EJB, C/C++, CORBA, SQL, Client-Server, GUI. Knowledge of relational databases will be a definitive advantage.
    Contacts:Applicants should send their CV and names of two references to:
    Prof. Shoshana J. Wodak
    Service de Conformation de Macromolécules Biologiques
    av. F.D. Roosevelt 50 - CP 160/16
    B-1050 Brussels, Belgium
    Tel: +32 2 650 20 13 ; Fax: +32 2 648 89 54

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    07/08/2002[AGMM]Bioinformatics Database Administrator
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:02/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Vancouver (Colombie-Britannique, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Interomex Biopharmaceuticals Inc.

    Job Title: Bioinformatics Database Administrator

    Required Skills:
    University or technical degree in software engineering or computer science. Minimum two years' related experience. Post-secondary education in LifeSciences or Molecular Biology. Solid experience and knowledge of RDBMS (DB2, Oracle, MySQL and Postresql) administration, SQL, C/C++ programming, Java, PERL or shell scripting and advanced knowledge of AIX/Linux/UNIX operating systems. Knowledge of Bioperl, Biojava, NCBI Toolkit, BLAST and databases such as Genbank perferred. Strong knowledge and experience in object-oriented design, network administration, data mining, modeling languages such as ASN.1 or XML is an asset. Effective oral and written communications, analytical, problem-solving, organizational and interpersonal skills.

    Job Description:
    Work in close collaboraqtion with researchers to create and extend databases containg biological information, maintain and administer biological databases with a relational database management system (RDBMS). Responsibilities include: designing, implementing, administering and deploying databases containing information such as nucleotide and protein sequences, images, laboratory management information and Medline publications; managing and administering RDBMS servers and DB2 on a UNIX platform; creating automated scripts for daily update of database content; performing backups and administrative functions; reporting on database progress; and performing other related duties. System support is also part of the weekly tasks.
    Appropriate candidates will be contacted. No phone calls please.
    Contacts:Send Resume to: info@interomex.com

    Contact for more information:
    Lynn Miller
    Interomex Biopharmaceuticals Inc.
    #201 - 1618 Station Street
    Vancouver, BC. CA
    Phone: 604-267-8000
    Fax: 604-267-2411
    info@interomex.com
    http://www.interomex.com

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    07/08/2002[AGMM]Industrial Post-Doc in Proteomics
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:St Catharines (Ontario, Canada)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Norgen Biotek Corp.

    Job Title: Industrial Post-Doc in Proteomics

    Required Skills:
    Training in protein engineering, expression and purification for use in Proteomics research. Candidate must have above average computer skills. Familiarity with high throughput proteome screening, profiling, 2D gels, mass spectrometry, crystallography and NMR is essential. Candidate must be vibrant and a team worker. Must be able to lead a team and/or able to follow a team leader with lesser academic qualifications. Candidate must have innovative skills.

    Job Description:
    Candidate will be part of a team to develop/validate processes and pipeline products for use in Proteomics research. The candidate will use his/her academic background to explore innovative ideas related to protein purification and analysis, and high-throughput proteome analysis.
    Contacts:Send Resume to: dbautista@norgenbiotek.com

    Contact for more information:
    Dody Bautista, Ph.D.
    Norgen Biotek Corp.
    344 Merritt St.
    St. Catharines, ON. CA
    Phone: 905-227-8848
    Fax: 905-227-1061
    dbautista@norgenbiotek.com
    http://www.norgenbiotek.com

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    07/08/2002[AG]Bioinformatician
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:26/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Montréal (Québec, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: PROCREA Biosciences Inc.

    Job Title: Bioinformatician

    Required Skills:
    University degree in both computer sciences and a molecular biology related field with a least a MSc degree. The candidate has a minimum of two years experience in a related position. Good knowledge of Linux, Perl, BioPerl, C++ applied to sequence analysis or microarray data analysis. Experience in setting up and maintaining databases and intranets. Excellent knowledge of genomic data related databases and tools. Communication skils and experience in supervision. PROCREA Biosciences is a french working environment, therefore french communication skills is a criteria.

    Job Description:
    The candidate will have the responsibility to install and maintain Linux software for sequence analysis and microarray analysis. The candidate will develop scripts or programs to automate sequence analysis and to extract and combine data from different databases. In collaboration with our biostatistician, the candidate will help with the analysis of microarray data. In collaboration with scientists at PROCREA, the candidate will propose and develop software solutions to automate sequence, gene expression and image analysis tasks. The candidate will act as a consultant for internal and external collaborations projects.
    Contacts:Send Resume to: smarchand@procrea.com

    Contact for more information:
    Sonia Marchand
    PROCREA Biosciences Inc.
    1100 avenue Beaumont, bureau 305
    Montreal, PQ. CA
    Phone: (514) 345-8978 (FAX)
    Fax: (514) 345-8978
    smarchand@procrea.com
    http://www.procrea.com/rd/rdset.html

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    06/08/2002[MM]Bourse de thèse fléchée Inter///Bio
    Source:http://germ.cnrs-orleans.fr/annonces.htm
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:17/07/2002
    Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dynamique interne de Biomolécules
    Grâce à l'utilisation de nouvelles méthodes spectroscopiques de RMN récemment développées au Laboratoire, nous pouvons caractériser les mouvements internes de biomolécules telles que les protéines et leurs complexes. Il est possible de localiser ces mouvements, et notamment de distinguer la mobilité du squelette d'une protéine de celle des chaînes latérales des acides aminés. Nous voulons aussi caractériser les échelles de temps de ces mouvements, qui varient des picosecondes jusqu'aux microsecondes.

    Directeur de Thèse : Geoffrey Bodenhauden
    Equipe d'accueil : Laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire, Département de Chimie, ENS Paris
    Bourse du Ministère : Bourse fléchée qui a été attribuée à ce sujet par l'Ecole Doctorale Inter///Bio.
    Contacts:Après consultation avec le Directeur de Thèse, les candidat(e)s devront présenter le sujet devant le jury de l'Ecole Doctorale, probablement entre le 15 et le 17 juillet 2002, en vue de l'attribution définitive de la bourse fléchée à l'un(e) des candidat(e)s.
    Début de la thèse : Octobre 2002
    Contenu Scientifique du programme de Thèse
    Informations administratives :
    Renseignements relatifs à l'Equipe d'Accueil Doctorale (EAD)
    Laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire, Département de chimie, Ecole Normale Supérieure, 24 rue Lhomond, 75231 Paris 05
    Responsable de l'EAD et directeur de thèse: Pr Geoffrey Bodenhausen
    Téléphone : :01 44 32 33 89
    Télécopie : 01 44 32 33 97
    E.mail : Geoffrey.Bodenhausen@ens.fr
    Renseignements relatifs à l'Unité de Recherche
    Nom et appartenance : UMR 8642
    Directeur : Pr Pierre Sinaÿ
    Téléphone : 01 44 32 33 89
    Télécopie : : 01 44 32 33 97
    E.mail : Pierre.Sinay@ens.fr

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    06/08/2002[MM]Contribution à l'annotation structurale du génome de Botrytis cinerea
    Source:ED Logique du vivant
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:18/08/2002
    Lieu:Paris (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Introduction:
    Le séquençage de chaque nouveau génome révèle de nombreuses "orfs" dont la fonction ne peut être déterminée (séquence orphelines). Nous nous proposons d'améliorer les méthodes de reconnaissance de repliements qui peuvent, en association avec des méthodes "humides", permettre d'attribuer une fonction aux séquences orphelines avec plus de sensibilité que PSIBLAST. Nous comptons appliquer ces méthodes dans le cadre de l'annotation de Botrytis cinerea, dont le séquençage est prévu pour 2003. Responsable en particulier de la "pourriture grise" sur la vigne, ce champignon est un phytopathogène nécrotrophe à large spectre d'hôte. Ce caractère d'adaptabilité à l'hôte laisse présager des fonctions non encore identifiées dans les génomes déjà séquencés de levures et de filamenteux. En parallèle, avec les mêmes méthodes, nous nous intéresserons aux duplications structurales.

    Projet:
    Les techniques de reconnaissance de repliement par une séquence (« threading ») consistent à mesurer la "compatibilité" d'une séquence de structure inconnue avec toutes les structures protéiques connues, représentées sous formes de "cœurs". Elles nécessitent des techniques de détermination des structures conservées [5,6] dans les familles structurales de protéines afin de constituer la base de "cœurs" structuraux : un cœur est un modèle caractérisant une famille structurale. Ces techniques peuvent fournir des modèles 3D de "travail", utiles dans le domaine de l'enzymologie, mais elles sont surtout de plus en plus utilisées à des fins d'annotation de séquences inconnues, car elles permettent de repérer des similarités qui ne sont pas détectées par les méthodes utilisant seulement l'information de séquence comme BLAST, PSIBLAST ou FASTA. On pourrait parler d'annotation "structurale". Par exemple, sur le génome de Bacillus Subtilis, dans les gènes classés comme orphelins (22% du total des gènes), on peut trouver un repliement similaire à une protéine de structure connue chez 42% de ces orphelins.
    Nous nous fixons pour buts :
    1) d'améliorer la reconnaissance de repliement en développant des programmes de détection de sous-structures communes à plusieurs structures protéiques, afin de redéfinir de manière plus adéquate les "cœurs" de la PDB qui sont utilisés dans les programmes de reconnaissance de repliement (nous développons actuellement un tel programme en collaboration avec A. Marin et J-F. Gibrat, équipe MIG- INRA Versailles[1]).
    2) d'appliquer ces méthodes :
    2a) pour l'annotation des gènes orphelins de Botrytis cinerea.
    2b) pour l'obtention d'un modèle 3D [2,4] de protéines à activité pectinolytique (un travail préliminaire sur ces familles de protéines a été initié en DEA dans l'équipe)
    3) d'examiner à l'aide de ces outils de détection de répétitions structurales, les répétitions internes des structures de protéines connues. De manière complémentaire, nous voulons évaluer si les motifs (en séquences) approximativement répétés dans les mêmes gènes [3] présentent des particularités structurales et fonctionnelles, en examinant les structures de protéines connues par cristallographie ou déterminées par reconnaissance de repliement.

    Annexe:
    Nous avons participé au Programme "Relations séquence - structure des protéines, entre gènes et fonctions" dans le cadre de l'action Génome du CNRS (1998-2000) pour le "Développement d'une nouvelle fonction et évaluation statistique pour les techniques de reconnaissance de repliements".
    Nous sommes aussi partie prenante dans deux projets acceptés en cours dans le cadre de l'action "Programme Bio-informatique inter-EPST" CNRS, INSERM, INRA, INRIA, Ministère de la Recherche, (2001-2002).
    Contacts:Pierre Netter : netter@ijm.jussieu.fr
    Joël Pothier : jompo@abi.snv.jussieu.fr

    Modalités d'attributions de l'allocation

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    06/08/2002[MM]Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory
    Source:Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs
    Date de parution:18/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Boston (Massachussets, USA)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Company/Institution: Northeastern University

    Job Title: Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory

    Required Skills:
    Particularly appropriate are those who have experience in one or more computer languages, C/C++, Java, Perl/CGI, HTML and others, experience with database development and support, MySQL, PostgressSQL, SQL language is a plus. (Molecular ) Biology or biochemistry background is also a plus.

    Job Description:
    The Department of Biology at Northeastern University has an opening for a PhD Student in the bioinformatics laboratory. Those who are interested in work on protein theory, protein folding, stability, sequence alignments, structure superposition of proteins and DNA/RNA etc. are welcome to apply. Two types of candidates are appropriate for this field. One is from a natural science field such as biology, biochemistry, molecular biology, chemistry or physics who wish to learn computer and math and the second is from math, statistics and computer science who wish to learn biology. Particularly appropriate are those who have experience in one or more computer languages, C/C++, Java, Perl/CGI, HTML and others, experience with database development and support, MySQL, PostgressSQL, SQL language is a plus. Biology or biochemistry background is also a plus.
    Contacts:Send Resume to: ilyin@neu.edu

    Contact for more information and questions please contact :
    Valentin Ilyin
    Northeastern University
    414 Mugar, Northeastern University
    Boston, MA 02115, MA. US
    Phone: 1-617-373-4031
    ilyin@mozart.bio.neu.edu

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    06/08/2002[AGMM]Écoles Doctorales proposant des allocations au titre de la mobilité
    Source:Ministère
    Date de parution:06/08/2002Date limite de réponse:?
    Lieu: (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Site du Ministère regroupant les sites des ED proposant des allocations de recherche au titre de la mobilité
    Contacts:

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    26/07/2002[AG]CDD, URGV d'Evry
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:15/04/2002Date limite de réponse:01/05/2002
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'URGV d'Evry (Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS, Resp. M. Caboche; http://www.evry.inra.fr ) mai 2002), dans le cadre d'un projet Génoplante. Ce CDD concerne un poste de niveau ingénieur au sein de l'équipe bioinformatique de l'URGV qui comprend 5
    permanents, 2 CDD et 3 étudiants stagiaires.

    Le projet concerne le développement d'interfaces (JAVA) pour l'exploitation d'une base de données intégrative sur la génomique structurale et fonctionnelle de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Toutes les données de génomique de cette base (sous ORACLE) sont organisées topologiquement autour des séquences des 5 chromosomes d'Arabidopsis.Cette base de données
    doit entre autres faciliter l'interprétation fonctionnelle des données de type 'transcriptome' et permettre d'étudier les relations entre la structure, la fonction, la localisation et l'évolution des gènes végétaux.

    Ce poste nécessite une bonne connaissance du langage JAVA (en particulier des bibliothèques graphiques) et du langage de requête des bases de données relationnelles (SQL). Une expérience dans les domaines de l'analyse de séquences et de la génomique serait appréciée.

    Contacts:Responsable à contacter: Sébastien Aubourg
    (aubourg@evry.inra.fr)


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    26/07/2002[AGMM]Postdoc Position, Computational and Integrative Bioengineering
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:26/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Seattle (Washington, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    The Department of Bioengineering at the University of Washington is looking for a postdoctoral research candidate to join the group on Computational and Integrative Bioengineering within the National Simulation Resource Facility.
    The candidate will be involved in the development and analysis of cardiac metabolic systems analysis, and to a lesser extent, biological signal transduction, and gene regulatory networks. Information about the programs and projects can be found at http://nsr.bioeng.washington.edu and http://www.physiome.org.

    The available position is funded by an annual stipend from a NIH/NHLBI Cardiovascular Training Grant. Current levels of funding range from $31,092 to $48,852/year depending on experience.
    We are looking for someone with a computational science or bioengineering background who has experience and interests in integrative biology research.

    An ideal candidate will have an interdisciplinary training with a strong background in computation and in mammalian biology, emphasising metabolism. Experience in network analysis methods, control theory, and the analysis of signaling processes and networks using engineering or applied mathematics approaches is highly preferred. Required skills include expertise in at least one scientific programming language. Eligible candidates for this position must be citizens or noncitizen nationals of the United States.

    This position is available immediately and will be initially limited to a one-year term. The appointment may be continued for two more years, depending upon mutual agreement and availability of the funds.
    Contacts:Applicants should e-mail their resume, list of publications, and contact details of three references to:
    Dr. James Bassingthwaighte
    University of Washington
    Department of Bioengineering
    Box 357962,
    Seattle, WA 98195-7962

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    25/07/2002[AGMM]Postdoc, Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle, VT
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:25/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Blacksburg (Virginie, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Position
    Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle

    Openings are available in an interdisciplinary team building mathematical models of the eukaryotic cell cycle. On the computational side, one or two postdoctoral research scientists are needed to carry out simulations of molecular models of cell cycle regulation in frog eggs and yeast cells.
    A Ph.D. in computational science, applied mathematics, or theoretical chemistry is required. Experience in nonlinear dynamical systems is preferred. The individual must be able to work closely with biochemists and molecular biologists collecting data on these organisms.
    Contacts:Please send curriculum vitae and contact information for two references to:
    Dr. John J. Tyson,
    Biology Department,
    Virginia Polytechnic Institute and State University,
    Blacksburg, VA 24061;
    (540) 231-4662;
    tyson@vt.edu

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    24/07/2002[MM]PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:15/08/2002
    Lieu:Norwich (Grande-Bretagne)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Studentship
    School of Information Systems

    Applications are invited for a PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry at the University of East Anglia. The postholder will undertake research on the EPSRC project "Understanding Protein Domain Motions through Simulation with a Focus on Citrate Synthase". The supervisor will be Dr Steven Hayward.

    Background
    Proteins are molecular machines designed to carry out specific tasks. For a large number of proteins, their structure and function is known, but the key question remains largely unanswered: what is the relationship between structure and function? The study of protein dynamical behavior will provide the answer to this question, but experimental techniques do not gives us a complete picture of the processes occurring at the atomic level. The computational technique of molecular dynamics simulation presents an atomic level description of protein dynamical behavior and has recently provided us with some important insights [1].

    The aim of the project will be to understand the detailed mechanisms of domain closure in enzymes by making comparisons between experimentally determined functional movements in domain proteins and results from molecular dynamics simulations. The project will utilise information stored in the new DynDom database of protein domain movements (see http://www.sys.uea.ac.uk/dyndom ) which is being developed in a bioinformatics approach to understanding and predicting functional movements in proteins[2]. The research project will build upon our recent simulation study of the enzyme citrate synthase[3].

    References
    [1]H.J.C. Berendsen, S.Hayward, "Collective protein dynamics in relation to function", Current Opinions in Structural Biology, 10 (2), 165, 2000.
    [2] S.Hayward,"Structural Principles Governing Domain Motions in Proteins", Proteins, Structure, Function and Genetics, 36, 425, 1999.
    [3]D.Roccatano, A.E.Mark and S.Hayward,"Investigation of the Mechanism of Domain Closure in Citrate Synthase by Molecular Dynamics Simulation",J. Mol. Biol., 310, 1039, 2001.

    To apply you should have or expect to be awarded a First or Upper Second Class Honours degree or MSc in an appropriate discipline.

    The studentship is sponsored by EPSRC and is offered at the rate of £8,000 per year for three years, plus tuition fees. The post is available from October 2002.
    Contacts:Further information may be obtained from Dr Steven Hayward,
    Tel: 01603 593542 or e-mail: sjh@sys.uea.ac.uk

    To apply please send a CV, covering letter and names/addresses of two academic referees to:
    Ms C. Bramwell, Research Administrator, School of Information Systems, University of East Anglia, Norwich NR4 7TJ.
    Applications via email are not permitted.

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    24/07/2002[AG]Research Assistant/Fellow
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:24/07/2002Date limite de réponse:14/08/2002
    Lieu:Southampton (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Genetic Epidemiology and Bioinformatics Research Group - Genome Map Integration
    School of Medicine - Human Genetics Division
    University of Southampton

    We are looking for a research assistant (postgraduate or postdoctoral) to join our expanding research team. We have developed the first metric linkage disequilibrium maps (Maniatis et al, 2002, Proc Natl Acad Sci USA 99:2228-33). The integration of these maps with the sequence based maps we are already developing should provide more precise localisation of disease genes and facilitate studies of recombination and other biological properties of maps. A research assistant is required to continue to develop and apply software for internet data mining and sequence analysis and to construct and integrate linkage disequilibrium maps. A biological background and programming experience (JAVA, C) and experience in sequence analysis and statistics is desirable. The position is for 12 months in the first instance.

    Informal enquiries are welcome in the first instance to Dr Andrew Collins, telephone 023 80 796939.

    Previous applicants need not apply.

    Salary will be in the range £17,626 to £26,491 per annum on Research Grade 1A scale depending on experience.
    Contacts:Application forms and a job description may be obtained from
    the Personnel Department (M),
    University of Southampton, Highfield, Southampton, SO17 1BJ,
    Tel: 023 8059 2750,
    e-mail: recruit@soton.ac.uk or minicom: 023 8059 5595.

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    18/07/2002[MM]Enzyme Function And Reaction Mechanisms: Computational Studies
    Source:ABG (ref:ABGe-879)
    Date de parution:16/07/2002Date limite de réponse:16/09/2002
    Lieu:Cleveland (Ohio, USA)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A postdoctoral position is open at Cleveland State University (Ohio -USA) for 2 years (with possible extention for another year). Different projects are proposed in collaboration with Cleveland Clinic:
    1) NOS enzyme
    2) Reaction mechanism of Cl- oxidation to Cl+ by myeloperoxydase
    3) Modeling the AT1 receptor
    4) Activity of Factor V (blood coagulation cofactor).
    In close collaboration with experimentalists our main tools used for these projects are molecular modelling, QM/MM approaches and MD simulations. The salary is very attractive depending on condidate experience.

    You should hold a Ph.D. or equivalent degree in biochemistry, biophysics, chemistry or physics or a related discipline. Very motivated scientist willing to work in a multidisciplinary team and a previous experience with computational methods is appreciable but not a requirement.
    Contacts:For application please send or email your CV + at least 1 recommendation letter to :
    Dr. A. ABABOU
    NMR Center (MSB)
    Leicester University
    University Road
    Leicester LE1 9HN
    UK
    phone: 44 (0) 116 223 3071
    fax: 44 (0) 116 223 1503
    e-mail: aa116@le.ac.uk

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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    17/07/2002[MM]Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:17/07/2002Date limite de réponse:30/08/2002
    Lieu:Nancy (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    We have an opening for a post-doctoral fellow for up to 2 years, commencing september/october 2002 or later, to work on:

    Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization Molecular docking is the natural process by which molecules recognize and interact with one another. From a computational standpoint, it also refers to the prediction of the structures of ligand-receptor complexes from the conformations of unbound ligand and unbound receptor. Molecular docking is at the center of such practical applications as protein engineering and drug design. It has already helped to design new ligands for anti-AIDS and anti-cancer agents and for the treatment of diabetes.

    Structure-based molecular docking programs are based on the assumption that ligands which form favorable interactions with the receptor must have high binding affinity. They rely on the number-crunching capabilities of computers to generate and evaluate large numbers of possible bindings. Computers however do not have the experience of human beings and molecular docking methods severely limit the biochemists' ability to analyze the bindings computed and exploit their intuition and expertise to generate sound and reliable solutions. Also, most approaches to molecular docking do not take advantage of the visualization capabilities offered by modern workstations.

    Major challenges in this field are (1) predicting how molecules will dock with one another and (2) identifying the factors that determine the specificity of interaction. To make significant advances, it is necessary to develop novel methods to facilitate the docking techniques by enhancing our ability to understand and analyze docking interactions and to develop hypotheses about which molecules are most likely to interact favorably. These factors can be incorporated into molecular docking by including advanced visualization and haptic (sense of touch) feedback in the process.

    The main goal of this project is to develop an immersive, interactive and easy-to-use modelling environment to enhance molecular docking. The candidate will have at its disposal the state-of-the-art SGI high-performance computing technologies available at LORIA, notably the Reality Center immersive visualization facility and the Onyx 3800
    shared-memory system platform.

    In particular, the postdoctoral candidate is expected:
    - To integrate existing molecular docking programs with the LORIA collaborative computing environment.
    - To implement a haptic interface to facilitate interaction with molecular models, through a high-fidelity, 3D force-feedback device.
    - To combine visualization and haptic feedback to allow interactive docking simulations in the Reality Center.
    - To develop a multimodal user interface to facilitate the work of molecular scientists.

    The successful candidate will have a solid background in SGI graphics software and architecture. He is also expected to have a working knowledge of programming and scripting languages such as Java, Perl and TCL/TK.Candidates having experience in parallel computing and/or grid computing will be given priority.

    Salary will be approximately 21400 euros per annum. There are no restrictions on the nationality of the applicant.
    Contacts:For more information on this position as well as indication of interest, please contact
    Bernard Maigret (Bernard.Maigret@lctn.uhp-nancy.fr) http://www.lctn.uhp-nancy.fr
    or Sylvain Petitjean (Sylvain.Petitjean@loria.fr) http://www.loria.fr

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    17/07/2002[AG]Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis
    Source:comp.theory
    Date de parution:20/06/2020Date limite de réponse:09/08/2002
    Lieu:Aarhus (Danemark)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Applications are invited for a postdoctoral position for a two year period with possibility of extension at the Bioinformatics Research Center (BiRC), University of Aarhus, Denmark.

    The position is in the field of genome analysis, with particular emphasis on developing and applying computational methods to whole genome shotgun and EST sequences from the Pig Genome Project. Emphasis is on using evolutionary approaches, including efficient comparison with the human and mouse genomes.

    Applicants must have a PhD in computer science, statistics, genetics, or molecular biology, with an interest and some prior experience in computational biology and/or evolutionary analysis. The appointee should be able to handle efficiently large amounts of genome data, so prior experience with programming in Python/Perl and/or C/C++ is preferable.

    Pig Genome Project: The position is funded by the Danish National Research Councils as part of a trans-disciplinary national initiative, involving five Danish Research Institutions. The goal of this initiative is to add value to the data generated within the Sino-Danish genome consortium. The overall goal is to use the data to understand the Pig Genome and use those results to increase the understanding of the Human Genome by direct and indirect comparison. BiRCs participation in the project is focused on methods for genome assembly using the human genome as a template, gene finding in Pig and Human, and whole genome evolutionary analysis.

    BiRC: The successful candidate will be situated at BiRC (Bioinformatics Research Center at University of Aarhus, http://www.birc.dk), an interdisciplinary group with approx. 20 scientists from Computer Science, Statistics, Biology, and Molecular Biology. BiRC focuses on various aspects of bioinformatics, ranging form theoretical work in computer science, statistics and biology, to software development, and experimental work in collaboration with biological and medical research laboratories.

    Applicants must submit a curriculum vitae, a description of scientific accomplishments, and a list of publications (all in 4 copies), and 3 copies of publications to be considered in the evaluation.

    The Faculty refers to the Ministerial Order No. 820 of 31.8.2000 on the appointment of teaching and research staff at the universities under the Ministry of Research and Information Technology.

    Salary as agreed between the Danish Ministry of Finance and the Confederation of Professional Unions.
    Contacts:Applications should be addressed to:
    The Faculty of Science
    University of Aarhus
    Ny Munkegade, Building 520
    DK-8000 Aarhus C
    Denmark

    and marked 212/5-9.

    The deadline for receipt of applications is August 9, 2002, at 12,00 noon.

    Supplementary information can be obtained from:
    Mikkel Schierup,
    Tel. +45 8942 3231,
    E-mail: mheide@birc.dk

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    15/07/2002[AG]Chef de projet Progiciels en Biotechnologies végétales
    Source:Labgeneration.com
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Nice (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Etudes supérieures en agronomie, génétique et/ou biotechnologies, et Modules informatique, DEA ou DESS ou expériences équivalentes.
    Vous devrez avoir une expérience de trois années au moins de developpement informatique objet, Windows et Base de données.
    Maitriser l'anglais et avoir une connaissance du domaine de la recherche.
    Connaissances techniques :
    -Connaissances de la programmation objet, de Windows et composants distribués,
    -La connaissance de Power Builder serait un plus

    DORIANE est éditeur de logiciel pour la Recherche et Développement en Biotechnologies végétales. C'est une société française de 8 personnes à vocation internationale.
    DORIANE a développé deux logiciels standards CATCHkeya (Progiciel de saisie de données portable) et LABkeya (Progiciel de gestion et d'analyses de données) pour les départements de recherche des industriels de l'Agronomie.
    La société a reçu en novembre 2001 le label "Entreprise Innovante" de l'ANVAR. En 2002, la société veut assurer son développement européen et international et recrute : Chef de projet Progiciels en Biotechnologies végétales.
    Mission :
    Dans le cadre de missions et objectifs pour le service technique vous devrez assurer l'encadrement du développement informatique de LABkey en relation avec les techniciens et les groupes utilisateurs. Vous devrez également participer au développement des partenariats scientifiques avec des laboratoires européens.

    Activités :
    - Assurer une veille dans le domaine concerne, Comprendre et proposer des solutions innovantes pour l'avenir des produits DORIANE.
    - Gérer les projets informatiques,
    - Définir le planning de travail,
    - Coordonner les acteurs des projets,
    - Participer à l'élaboration des spécifications,
    - Participer aux tests et recettes

    Salaire: 33 000 à 40 000 euros
    Contacts:florence.royer@doriane.com

    Source Lageneration.com

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    15/07/2002[AGMM]Thèse avec allocation MENRT - "Sélection et caractérisation de peptides inhibiteurs de biocatalyseurs"
    Source:ABG (ref:ABGt-2089)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Compiègne (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Nous avons généré dans l'Unité 6022 CNRS de l'Université de Technologie de Compiègne (UTC) des anticorps anti-idiotypiques catalytiques possédant des activités de type amidase (beta-lactamase et protéase). Nous avons préalablement sélectionné par "phage display" un peptide inhibant un anticorps à activité beta-lactamase (peptide antibiotique). Les objectifs de la thèse proposée sont de caractériser le type d'inhibition induit par cette molécule, de sélectionner d'autres peptides antibiotiques et éventuellement anti-protéasiques et de modéliser les interactions sur des outils de bio-informatique. L'effet du peptide antibiotique en modèle animal sera parallèlement étudié dans le cadre de collaborations.
    Domaines abordés : Biochimie, biologie moléculaire, immunochimie, enzymologie, modélisation moléculaire assistée par ordinateur.
    Compétences requises : Biochimiste titulaire d'un DEA. Le candidat devra avoir une expérience en biochimie des protéines et en enzymologie.
    La thèse débutera à la rentrée universitaire 2002-2003.
    Plus d'informations sur le site Web : http://www.utc.fr/~friboule
    Contacts:Le dossier de candidature comportant un CV devra être envoyé à :
    Alain FRIBOULET - Directeur de Recherches
    ou Bérangère BIHAN-AVALLE - Maître de Conférences

    UMR 6022 CNRS - Génie Enzymatique et Cellulaire
    Université de Technologie de Compiègne
    BP20529
    60205 COMPIEGNE CEDEX
    Tel : 03-44-23-44-13
    E-mail : alain.friboulet@utc.fr, berangere.avalle@utc.fr

    Merci de préciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (Association Bernard Gregory) et la référence ABG de cette offre.

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    15/07/2002[AGMM]Postdoctoral Research Fellowships
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Zurich (Suisse)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral Research Fellowships

    Computational Laboratory (CoLab), Swiss Federal Institute of Technology www.colab.ethz.ch

    The CoLab Postdoctoral Program is envisioned as a core of researchers conducting computational research on topics within the research goals of the CoLab.

    Current research focus areas include : Machine Learning Algorithms and Multiscale Computational Methods as applied to Cell Biology, Bioinformatics and Materials Science.

    Research opportunities
    The postdoctoral fellowships provide successful applicants with the resources and the interdisciplinary environment to support their research goals. The purpose of the fellowship is to stimulate cross-fertilization of ideas and to apply computational science to challenging problems in Science and Engineering. The fellows are responsible for conducting their own research projects and are encouraged to contribute to the CoLab environment of openness, interaction and collaboration.

    Qualifications
    An applicant must have a Ph.D. or Sc.D. degree granted within three years preceding the application date. We strongly encourage applications from women and minorities.
    Criteria used in the selection of postdoctoral fellows are the applicants' scientific competence, their spirit of innovation and the capability of conducting original and independent research in a highly collaborative environment.

    Stipend
    Successful applicants currently receive a stipend of about 90,000 to 100,000 SFR in the first year. These stipends are adjusted annually, based on the governing guidelines of ETH Zurich.

    Numbers and terms of appointments
    We anticipate 5 to 10 initial appointments, followed by another 10 appointments within the next 6 months. The fellowships have a one to three year term. Review of applications will begin July 1, 2002, and will continue until the positions are filled.

    How to apply :
    Each applicant for a postdoctoral fellowship at the CoLab should submit:
    An up-to-date curriculum vitae including summary of scientific work experience, including :
    A detailed list of publications.
    The names and addresses of three people familiar with the applicant's research
    An abstract of her/his doctoral thesis
    A concise statement (1 to 3 pages) describing the applicant's interest in CSE and the research that he/she wishes to pursue during the CoLab appointment

    We encourage applications via e-mail in electronic format (PDF, Word).
    Contacts:Dr. Sabine Attinger
    CoLab Scientific Coordinator
    Swiss Federal Institute of Technology
    ETH Zentrum
    8092 Zurich, Switzerland

    E-mail: sabine.attinger@inf.ethz.ch
    Tel: +41 1 632 2920

    For further information please visit www.colab.ethz.ch

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    15/07/2002[AGMM]Two Bioinformatics Support Specialists
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:15/07/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Epalinges (Suisse)Statut:???Secteur:prive
    Description de l'annonce:
    The Swiss Institute of Bioinformatics seeks two Bioinformatics Support Specialists.

    Detailed job descriptions are available here

    Contacts:Dr. Laurent Falquet, Swiss EMBnet node Manager Swiss Institute of Bioinformatics
    Ch. des Boveresses 155
    CH-1066 Epalinges
    Switzerland

    Tel: +41 (21) 692 5954
    FAX: +41 (21) 692 5945

    Email: Laurent.Falquet@isb-sib.ch

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    14/06/2002[AG]Postdoctoral and Research Assistant Positions
    Source:hd-emploi-bio
    Date de parution:06/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Laval (Québec, Canada)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Postdoctoral and Research Assistant Positions Université Laval, Québec, Canada

    A large-scale project in functional genomics applied to forest trees funded by Genome Canada is now offering several employment opportunities at Université Laval and the Canadian Forestry Service, both located in Québec city, Canada. The project will investigate the regulation of wood formation (secondary xylem differentiation) and defense response in trees by utilizing functional genomics methods including transcriptome analysis and manipulation of gene expression.
    Positions include:
    Project Manager (Position #1);
    Scientific Coordinator - Bioinformatics (Position #2);
    Research Assistant - Molecular Biology and Bioinformatics - Several Positions (Position #3);
    Postdoctoral Fellowships, Molecular Biology and Functional Genomics (Position #4);
    Research Assistants: Platform in Plant Transformation (Forest Trees) - Several positions (Position #5).

    Complete descriptions of positions and application deadlines are available at http://www.forgenome.rsvs.ulava.ca.
    Contacts:Apply by e-mail to genome.foret@rsvs.ulaval.ca. Submit a current résumé, a cover letter, and the name and address of three references. Send requested information in a single attachment (MS Word or pdf files only) with applicant's name in filename, or insert information in body of message. Write the position number in subject line.

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    14/06/2002[AGMM]Thèse sur la génétique du cheval: Modélisation des schémas de sélection dans l'élevage du cheval français
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:14/06/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Toulouse (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Les Haras-Nationaux et l'INRA ont décidé de co-financer une thèse sur la génétique du cheval dont le titre est : Modélisation des schémas de sélection dans l'élevage du cheval français .

    L'objectif est d'optimiser différents programmes de sélection des chevaux français incluant la réussite (en sport ou en course), les facteurs de productions (reproduction, viabilité), les facteurs d'adaptation (comportement, résistance aux maladies, longévité sportive), les caractères secondaires associées à une plus-value (beauté, allure) ou à une sélection précoce (biomécanique, paramètres physiologiques).
    Il s'agit donc de manipuler des modèles mathématiques décrivants
    l'objectif de sélection, les tests de sélection possibles et d'optimiser le progrès attendu en fonction des contraintes économiques et biologiques. Une attention particulière sera portée à l'impact des nouvelles techniques de reproduction, de la connaissance de QTL, de l'évolution de l'objectif dans le temps, de l'intervention du croisement.

    Cette thèse pourrait voir le jour dès Septembre 2002 pour une durée de 3 ans à la SAGA (INRA Castanet-Tolosan).
    Contacts:Anne RICARD
    Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA)
    Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
    BP 27
    31326 Auzeville
    Francetel: 33 5 61 28 51 83
    Fax : 33 5 61 28 53 53

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    07/06/2002[AG]Bioinformatic Position at The Nestle research center
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:28/05/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Lausanne (Suisse)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    LOCATION: Nestlé Research Center Lausanne, Switzerland
    http:// www.nutrition.nestle.com/discovery/network/research.asp

    JOB DESCRIPTION :
    We are seeking a BIOINFORMATICIAN to work within a small and dynamic bioinformatics team collaborating closely with "wet-lab" biologicalscientists. Your work will bring you in contact with numerous projectsthroughout Nestlé, including prokaryote genome analysis, sequenceanalysis tools, DNA and protein sequence database management,bioinformatics architecture and integration. Your scientific knowledgeand thorough understanding of bioinformatics applications will be amplyemployed in this vital, multi-disciplinary position. Knowledge of SRS isa plus.

    RESPONSIBILITIES:
    -participate in scientific projects as bioinformatics expert.

    EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED :
    Your background must include a M. Sc. or Ph.D. in Life Science (e.g.,molecular biology or microbiology) and experience in bioinformaticsincluding demonstrated success in project management. Linux, Unixenvironement knowledge required. Familiar with Perl. Bioperl is a plus.

    LANGUAGES NEEDED :
    Fluent in English, knowledge in French is a plus.OTHER SKILLS REQUIRED :The desired individual will be self-motivated, able to communicateequally well with biologists and computer scientists and working well inan interdisciplinary team is of paramount importance.

    DATE NEEDED :
    a.s.a.p.
    Contacts:CONTACT:
    Dr. Frank Desiere, Nestle Research Center, P.O.Box 44,
    CH-100 Lausanne 26
    frank.desiere@rdls.nestle.com

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    06/06/2002[AGMM]Ingenieur-expert Bioinformaticien
    Source:ABG (ref:ABGf-2097)
    Date de parution:27/05/2002Date limite de réponse:24/06/2002
    Lieu:Rennes (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    CDD ingenieur-expert Bioinformaticien 12 a 24 mois, Irisa Rennes, à partir de juillet

    Date de début de diffusion du poste : 27/05/2002
    Date de fin de diffusion prévue : 24/06/2002

    La Genopole Ouest est la dernière née des génopoles, ensemble de plus de 40 laboratoires fédérés pour la recherche en génomique.
    Le but du poste est d'assurer un service de mise à disposition de logiciels de bioinformatique pour tous les membres de la Génopole, à partir d'un serveur web ou de comptes informatiques sur une machine de calcul intensif. Ceci suppose l'installation et la mise à jour de logiciels publics ou privés et le developpement d'interfaces specifiques facilitant l'utilisation de ces logiciels par les biologistes.
    Ce travail comprend l'expertise de l'existant, la veille sur les nouveaux logiciels disponibles, la mise en place et le developpement d'outils génériques pour les laboratoires, et la
    participation active à un comité technique regroupant les personnes impliquées dans les différents laboratoires. Le candidat participera également à des actions de formation sur les outils mis en place. Le poste s'inscrit enfin en support pour la diffusion des recherches en bioinformatique se déroulant au sein de la Génopole.
    Il demande une bonne connaissance des principaux logiciels disponibles et des concepts sous-jacents et une maitrise des langages de script et de la programmation d'interfaces web. De
    bonnes connaissances des environnements de programmation en C ou C++ seront également appreciées.

    Profil du poste :
    En résumé, le profil du poste correspond à un ingénieur en
    bioinformatique chargé des tâches
    suivantes :
    - Rendre accessibles et mettre à jour les principaux logiciels de bioinformatique nécessaires au fonctionnement de la Génopole Ouest;
    - Assurer la veille des nouveaux logiciels disponibles;
    - Développer des interfaces d'accès spécifiques pour ces logiciels et participer à la diffusion des logiciels développés par les équipes de recherche en bioinformatique.
    - Participer aux actions de formation aux outils proposés.

    Duree du contrat :
    12 mois renouvelable 12 mois

    Conditions de recrutement :
    Le niveau de rémunération, dependant de l'experience du candidat, sera de l'ordre de 2000 euros net/mois.
    Le candidat intègrera l'équipe de recherche en bioinformatique Symbiose, à l'Irisa/Inria Rennes, dans le cadre stimulant de l'Irisa, le plus important laboratoire de recherche en informatique de l'Ouest.
    Les axes de recherche developpés dans l'équipe Symbiose offrent au candidat la possibilité de participer à des travaux innovants comme la recherche de signatures complexes dans des familles de séquences ou l'étude de reseaux de régulation de gènes.
    Un second poste de CDD est ouvert pour les aspects d'acces et de suivi des bases de données, et les deux personnes recrutées travailleront en coopération étroite.
    Contacts:Adresser un CV + lettre de motivation à Jacques.Nicolas@irisa.fr

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    04/06/2002[AGMM]Correspondant informatique et "Data manager"
    Source:ABG
    Date de parution:27/05/2002Date limite de réponse:27/06/2002
    Lieu:FOUGERES (35) (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    L'unite Enregistrement de l'AFSSA - Agence nationale du Medicament veterinaire recherche un ingenieur pour assurer les fonctions de correspondant informatique et de responsable du suivi des bases de donnees.

    Fonctions:
    a. Interlocuteur privilegie de l'Unite Informatique pour l'Unite Enregistrement, il redige le cahier des charges de l'Unite Enregistrement en collaboration avec les utilisateurs de l'unite ;
    b. Il assure le suivi de la mise en oeuvre du cahier des charges ;
    c. Il redige la documentation et forme les utilisateurs aux outils developpes conformement au cahier des charges ;
    d. Il valide le contenu des bases de donnees relatives au medicament
    veterinaire, et apporte les actions correctives necessaires.

    Competences requises :
    a. Capacite a travailler en equipe : ecoute, expression orale aisee ;
    b. Rigueur : analyse, synthese, redaction soignee ;
    c. Outils bureautique ;
    d. Connaissance de methodes informatiques et de SGBD.

    Poste de contractuel avec possibilite titularisation.
    Salaire brut mensuel pour un debutant : de 1593 a 1775 euros en
    fonction du diplome (+ primes annuelles de 3082 a 4397 euros)
    Le poste a pourvoir est base a FOUGERES (35)
    Contacts:CV et LM sont a adresser a
    Mme Sylviane LAURENTIE,
    responsable de l'unite Enregistrement,
    AFSSA - ANMV,
    BP 90203,
    35302 FOUGERES CEDEX
    (02 99 94 78 60)

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    11/02/2002[MM] Professor/Reader/Senior Lecturer/Lecturer in Structural Biology and Bioinformatics
    Source:Ph. Marc (Agm2) - jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:13/03/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Professor/Reader/Senior Lecturer/Lecturer in Structural Biology and Bioinformatics (2)
    Faculty of Science
    School of Crystallography



    Opportunities for structural biologists and bioinformaticians within School of Crystallography have arisen from the secondments of Professor Janet Thornton (Head of European Bioinformatics Institute) and Professor Julia Goodfellow (Chief Executive of the BBSRC). The School is internationally renowned for its research and postgraduate teaching, with excellent facilities for protein crystallography, cryo-electron microscopy, spectroscopy and computing. It also has a strong programme in Materials Science. It is a major partner in the Bloomsbury Centre for Structural Biology, and in a Joint Research School with the Department of Biochemistry and Molecular Biology of University College, London. The posts are tenable from 1 September 2002.

    Applicants for appointment at senior level should have an international reputation for outstanding research and a distinguished publication record in a relevant area (a strong interest in crystallography, genomics or computational biology would be especially welcome). For a lectureship, applicants should have a PhD in a relevant subject and postdoctoral research experience.

    Salary range (effective from 1 March 2002): Professor - negotiable but not less than £41,528 pa inc; Reader/Senior Lecturer - £36,292 to £40,737 pa inc; Lecturer - £21,815 to £34,671 pa inc, depending on qualifications and experience.

    Closing date: 13 March 2002 (Ref: ACR102)

    Download the job description and application form by clicking on ‘Further details’ below OR Email personnel@bbk.ac.uk OR send a large (A4) sae quoting the reference number to the Personnel Department Birkbeck, Malet Street, Bloomsbury, London WC1E 7HX.




    Further details


    Contacts:Click here for Employer Profile

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    11/02/2002[AG]Analyst for the analysis of gene expression data
    Source:Ph. Marc (Agm2) - jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:05/03/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Research Assistant Grade 1A

    Cancer Research UK Medical Oncology Unit Bioinformatics / Analyst for the analysis of gene expression data
    Barts and The London Queen Mary’s School of Medicine and Dentistry

    We invite applications for the above position to work on the bioinformatic analysis of gene expression data. St Bartholomew's and the Royal London Charitable Foundation have funded the purchase of an Affymetrix system for gene expression analysis. This system, which is available to all groups in the Medical School is located at the Cancer Research UK Department of Medical Oncology, Charterhouse Sq. and will be operated under the direction of Professor Bryan D Young, in close association with the newly established Genome Centre. In order to facilitate the analysis of the expression data generated, a position has been created for a bioinformatics analyst, funded by St Bartholomew's and the Royal London Charitable Foundation and Cancer Research UK.

    The successful applicant is expected to have a MSc in Bioinformatics. Or relevant experience. He/she will liase with research groups in the choice of analysis strategies to be adopted and will be involved in the interpretation of the significance of the results. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

    Salary will be in the range of £19,760 -£28,625 per annum inclusive of London Allowance.

    For an informal discussion of this post, please email Professor Bryan D Young ( bryan.young@cancer.org.uk).

    Working towards equal opportunities
    Contacts:For an application form and further information, please contact our 24 hour recruitment line on 020 7882 3737 or email: smd-recruit@qmw.ac.uk quoting reference number 02512/DP. Completed application forms together with three copies of your Curriculum Vitae should be returned by 05 March 2002 and addressed to SMD Recruitment, Queen Mary, University of London, London E1 4NS.

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    11/02/2002[AG]Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:11/02/2002Date limite de réponse:04/03/2002
    Lieu:Londres (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician
    CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA
    Great Ormond Street Hospital for Children NHS Trust
    Institute of Child Health, University College London

    Following the award of a BBSRC Exploiting Genomics grant, we are seeking to employ two post-doctoral research assistants and a bioinformatician to work on this innovative interdisciplinary project. Our goal is to develop new methods of constructing gene and protein regulatory networks, using time series of Affymetrix microarray gene expression data. We will be focussing on the network centred on the biologically important p53 regulated DNA damage response.

    Post-Doctoral Research Fellow: Transcriptional Response to DNA Damage (Ref: PC/02/07a) £17,626 - £19,631 plus LW of £2,134
    This Research Fellow will have a recent PhD in field related to molecular and cellular biology. The successful candidate will be responsible for carrying out biological experiments and gathering data from Affymetrix arrays of 39,000 human transcripts. Experience of RNA handling is an advantage, as is proven attention to detail.

    Post-Doctoral Research Fellow: Mathematical Modelling of the DNA Damage Response (Ref: PC/02/07b) £17,626 - £19,631 plus LW of £2,134
    This appointee is expected to have a mathematical or computational background and will concentrate on developing models based on the biological data. A background in nonlinear dynamics, time series analysis, or the mathematical modelling of biological systems would be an advantage.

    Bioinformatician: Transcriptomics (Ref: PC/02/07c) £17,626 - £24,435 plus LW of £2,134
    The bioinformatician will have a qualification in bioinformatics or experience in manipulating microarray data. Familiarity with current gene array data handling procedures is desirable. The successful candidate will be responsible for array data management in a biological context. In collaboration with the Bioinformatics unit at UCL, they will help ensure compatibility of array data with EBI preferred formats (ArrayExpress), and play an interdisciplinary role in the manipulation of microarray data generated by a variety of groups at UCL.

    The positions are all for a duration of 3 years and are all on the Research 1A payscale. The successful candidates will benefit from the lively interdisciplinary environment provided by the 5*-rated Institute of Child Health and will have the opportunity to interact with a wide variety of projects at the interface of medical science, mathematics and computing.

    Informal enquiries about the post are welcome. Contact Mike Hubank ( m.hubank@ich.ucl.ac.uk) for cell molecular biology and bioinformatics posts and Professor J Stark (j.stark@ucl.ac.uk) for the mathematical post.


    Closing date for applications: 4 March 2002.

    TAKING ACTION FOR EQUALITY

    Contacts:For application details and a job description please contact the Human Resources Office by e-mailing hr1@ich.ucl.ac.uk or telephoning the 24-hour recruitment line on 020 7242 9789 ext. 0766. Please quote the relevant reference.

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    07/02/2002[AG]FULL-TIME POSITION - Ithaca, NY Database specialist
    Source:hd-emploi-info@garp.univ-bpclermont.fr
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Ithaca (New York, USA)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Plant Breeding Department, Cornell University, Ithaca, NY, USA

    Deadline: ?
    Beginning: immediately
    Duration: ?
    Salary: ?

    Requirements
    MS or PhD in computational biology, computer science, genomics, or related field. Experience in database development and design, good programming skills, interest in biology and evolution. Excellent communication skills required.

    Responsibilities
    The successful candidate will work with the Gramene database team in the McCouch lab (Department of Plant Breeding, Cornell University, Ithaca,NY)to develop a module for newly emerging data on families of transposable elements (TE's) in rice as part of a multi-institutional NSF-funded project.
    Project information will be delivered in several formats including flat files, predefined queries, via graphical displays over the web, sets of computational tools for the identification and analysis of transposable elements, and as an integrated part of the Gramene database. The database specialist will visit
    project participants at 3 universities to consult and coordinate
    directly with them, resolve questions concerning data format and interpretation, and obtain detailed feedback on database presentation and accuracy. The position offers opportunities to participate in research publications based on the information assembled in the database. The database specialist will
    also work with undergraduate assistants at the Cornell Theory Center's Virtual Science Center to integrate results emerging from the different components of this project into an online outreach environment, making these research results accessible for practical use in elementary and secondary education.

    Anticipated division of time
    - Travel and communication with project participants: 15%
    - Database module development and design: 45%
    - Curation of data: 15%
    - Website development and maintenance: 25%
    Contacts:Interested candidates should send a cover letter, CV, and names of 3 references to:

    Susan McCouch
    418 Bradfield Hall
    Plant Breeding Department
    Cornell University
    Ithaca, NY 14853-1901, USA
    E-mail: srm4@cornell.edu

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    07/02/2002[AG]role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease
    Source:hd-emploi-bio@garp.univ-bpclermont.fr
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:28/02/2002
    Lieu:Edinbourgh (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Two postdoctoral research fellow positions are available in a
    research group working on the role of translation elongation
    factor 1A (EF1a) isoforms in disease. The two projects will
    involve the use of model organisms including yeast, zebrafish and
    mice, and a wide variety of techniques including molecular
    genetics, bioinformatics and cell biology. Experience in one or
    more of these areas is essential. The positions are available
    immediately and are funded for three years by the Wellcome
    Trust in a 5 rated department based in the Molecular Medicine
    Centre.

    Informal enquiries can be made to Dr. Cathy Abbott (email
    { HYPERLINK mailtoC.Abbott@ed.ac.uk) }C.Abbott@ed.ac.uk). For further
    details and an application form
    please contact the University of Edinburgh Personnel Office
    (details below), or see
    httpwww.jobs.ed.ac.ukjobsindex.cfmaction=jobdet&jobid=
    779
    The appointments will be made on the AR1A salary scale
    (£17,451 - £26,229)
    Application from with full CV and names and addresses of two
    referees should be submitted to the University of Edinburgh
    Personnel Office, 9-16 Chambers Street, Edinburgh EH1 1HT
    no later than 28th February.

    This advert will appear in this week's Nature.
    Contacts: Dr. C.M. Abbott
    Medical Genetics Section, Dept of Medical Sciences
    University of Edinburgh,
    Molecular Medicine Centre,
    Western General Hospital,
    Edinburgh EH4 2XU
    Phone 0131 651 1049, Fax 0131 651 1059

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    07/02/2002[AG]Head of Bioinformatics Applications
    Source:jobs.ac.uk
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:15/02/2002
    Lieu:Oxford (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    THE WELLCOME TRUST CENTRE FOR HUMAN GENETICS

    ACADEMIC-RELATED RESEARCH STAFF GRADE III: Salary £30,514 - £38,221 p.a: We are recruiting a senior research scientist to head the Bioinformatics Application Team, part of the Bioinformatics and Statistical Genetics group at the Wellcome Trust Centre for Human Genetics. You will have a proven postdoctoral research pedigree in DNA and protein sequence bioinformatics, and in particular the functional and structural annotation of protein sequences. You will be responsible for the overall provision of sequence bioinformatics to aid research programs within Centre, to identify genes associated with complex human disease. In addition the postholder will be expected to perform and publish high-quality independent bioinformatics research. The successful application will have experience at a senior level and an excellent publication record. The appointment would be for three years in the first instance.

    If you apply for this position, please say you saw it FIRST on
    URL of this document: http://jobs.ac.uk/jobfiles/XG193.html
    Date of input: 30/01/02
    Contacts:A letter of application with full curriculum vitae, publication list and a statement of research interests, plus the names and addresses of two referees should be sent to Alicia Vaux, The Wellcome Trust Centre for Human Genetics, Roosevelt Drive, Oxford OX3 7BN. Reference RM-02-011. The closing date for applications is 15 February 2002.

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    07/02/2002[AG]Position post doctorale en data mining
    Source:Association Bernard Gregory (Ph. Marc/Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:05/04/2002
    Lieu:Lyon (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Mining the SAGE data

    A post-doctoral position is available immediately to work on the
    Discovery of association rules
    for generating synexpression groups from large gene expression matrices.
    This project is a joint
    effort between two groups :
    1. one biologist group interested in understanding the molecular basis
    for the cellular switch
    from a self-renewal program to a differentiation program in normal
    cells, and
    2. one computer group interested in developing the forefront data mining
    algorithms.

    The project is based on the use of freely available SAGE data, that have
    been to date only poorly
    exploited. The initial proof of concept has been done and is submitted
    for publication. The
    post-doc is expected to refine from this standpoint, and notably explore
    the following directions:
    a. The expression data have to been transformed into boolean
    data before extraction.
    Various methods for such a transformation will be explored in terms of
    their consequences upon
    the discovered rules.
    b. An extremely interesting scientific challenge is to consider
    other user-defined
    constraints (not only related to frequency and accuracy of the
    association but also various
    constraints) that can be pushed into the association rule mining
    algorithms. It might enable to
    improve the focus and support user guidance in order to generate
    tractable extractions.

    The ideal candidate should be a highly motivated individual with a
    strong background in molecular
    biology and bioinformatics. Experience in programming with Access and
    Delphi will be a plus but is
    not a prerequisite, since the environment will provide learning
    resources in those fields.

    Gender equal opportunities : women are encouraged to participate and to
    apply for the proposed
    open position.

    Contacts:To apply, please submit a full CV, details of relevant experience, and
    the name of two referees to
    :

    Dr O. Gandrillon; Signalisation et identites cellulaires ; CGMC. UMR
    5534 ; Universite Claude
    Bernard Lyon I, Bat 741 ; 43, boulevard du 11 Novembre 1918 ; 69622
    Villeurbanne Cedex ; E-mail:
    Gandrillon@maccgmc.univ-lyon1.fr ; W3 :
    http://cgmc.univ-lyon1.fr/Gandrillon/index.html

    Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source
    (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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    07/02/2002[AG]Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Jouy en Josas (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Offre CDD Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et
    outils d'analyse des données d'expression à l'INRA de Jouy en Josas.
    durée : 1 an à compter du 1er février 2002.

    Les programmes de génomique animale (projet transversal AGENA)
    manipulent
    d'énormes volumes de données hétérogènes (de la séquence aux réseaux
    d'interaction entre protéines en passant par les données des
    transcriptomes)
    créées par les technologies à haut débit. L'acquisition, le stockage,
    l'analyse et le traitement de ces données brutes et des données
    annotées,
    leur comparaison avec d'autres données de bases extérieures
    généralistes ou
    spécifiques, leur consultation, ..., doivent être rendues possibles
    auprès
    des biologistes à travers des interfaces conviviaux et performants.
    L'ingénieur participera à la conception et au développement de bases de
    données, au développement d'interfaces pour le biologiste, il mettra à
    disposition des biologistes un ensemble d'outils bio-informatiques et
    il
    participera à leur formation.

    L'ingénieur recruté développera ses activités en étroite collaboration
    avec
    les autres informaticiens du projet AGENA sur Jouy, Toulouse et Rennes.
    Il
    collaborera étroitement avec l'équipe MIG (Mathématique Informatique et
    Génomes), et l'équipe BIA (Biométrie Intelligence Artificielle) de
    Toulouse
    et avec les chercheurs en génomique des 4 espèces animales concernées
    (bovin, porc, truite, poulet).
    Il participera aux groupes de travail et aux séminaires
    bioinformatiques à
    un échelon local, régional et même national.

    Compétences souhaitées :
    Formation en informatique : expérience Unix, Windows nécessaire.
    Compétences en programmation (C, C++ et Perl) et en bases de données
    relationnelles (SQL).
    Connaissances des logiciels de biologie moléculaire souhaitée (BLAST,
    FASTA,
    GCG, ...).
    Connaissances en biologie appréciée.
    Sens de l'organisation et du travail en équipe.

    Le poste (niveau IE) est affecté au centre INRA de Jouy en Josas, il
    est
    à pourvoir immédiatement.

    Contacts: Envoyer CV et lettre de motivation par mail à cch@jouy.inra.fr.

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    07/02/2002[AG]Bioinformatics Scientist
    Source:HeliXense, Singapore via Ph. Marc
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Singapoure (Singapoure)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    HeliXense is creating a basis for the systematic use and adoption of
    genomics to increase the speed of pharmaceutical and agricultural product
    discovery and development. HeliXense's proprietary research platform is a
    unique third-party-extensible architecture which provides for a basis for
    organized collaboration for analyzing and modeling genomic data.
    HeliXense's operating platform / software infrastructure, called the gRNA
    (genomics Research Network Architecture), allows for the development and
    deployment of genomics-centric applications. The underlying system
    infrastructure for the gRNA is a grid that has been designed to integrate
    distributed computing with seamless data transactions and database queries
    across grids. The gRNA ideology is to enable scientists to prototype,
    develop, deploy and test genomics-centric algorithms and applications,
    consistent with the "hypothesis" based research that they are used to.The
    strategic value of such a system is to augment internal capabilities and
    accelerate research and development in the biotechnology / life sciences
    sector by providing appropriate tools, applications and infrastructure.

    HeliXense is looking forBioinformatics Scientists

    The successful candidate will

    1)Be responsible for the research and implementation of algorithms and
    computational methods in statistical genomics, and in the design of
    graphical and other interfaces to allow users to interact with such
    algorithms. Be involved in the planning, development, testing and
    documentation of such programs;

    2)Be involved in the project-oriented development of tools and methods for
    sequence analysis, sequence annotation and gene expression data. Will also
    participate in knowledge discovery using bioinformatics tools for
    functional and project needs;

    3)Act as scientific liaison between the bioinformatics development group
    and the investigators defining new scientific requirements and identifying
    & implementing tools that integrate data enabling target selection.
    Evaluate, disseminate and test new systems created or proposed to meet
    these requirements;

    4)Assist in implementing (i) the graphics display libraries, (ii)
    implementing general scientific functionality to support model building
    and structure analysis and (iii) providing simple, automated interfaces to
    the scientific functionality;

    5)Assist in the development of software to facilitate rapid and reliable
    data integration and curation;

    6)Be involved in the modelling of biological primitives and processes.
    Assist in research into the identification and verification of ontological
    models. Assist in the validation of biological and other data and where
    possible, the automation thereof;

    7)Interact with Product Strategy to ensure the development of products
    that are both technologically feasible and to innovate around ways to
    deliver novel products;

    Requirements call for a PhD in computer science and / or molecular biology
    with extensive training in computer science such as scientific
    programming, sequence data mining and analysis, scientific software
    development, database and/or web programming, as well as significant
    practical experience within genome informatics. The position will consist
    of developing custom scientific software for drug discovery efforts of our
    partner companies and interacting with scientists on a regular basis to
    meet their needs in software development and support.

    Please write to us with details of your working experience, educational
    qualifications, current basic salary and expected salary.
    Contacts:Human Resources Department

    HeliXense Pte Ltd
    73 Science Park Drive
    #02-05 CINTECH I
    SingaporeSciencePark I
    Singapore 118254

    Tel: 65 7756676
    Fax: 65 2346293

    careers@helixense.com

    http://www.helixense.com

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    07/02/2002[AG]Bioinformaticien
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:01/01/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Localisation: Évry (91)
    Durée du contrat : CDD 18 mois
    Date d'embauche : janvier 2002

    Définition de la fonction :
    Biogemma, principale société de biotechnologie végétale française
    (www.biogemma.com) recrute un bioinformaticien. Responsable de la
    partie bioinformatique d'un projet scientifique européen vous devrez
    intégrer les données biologiques issues de ce programme et mettre en
    place un environnement permettant leur analyse et leur valorisation
    par les biologistes.

    Au sein d'une équipe de bioinformaticiens, vous implémenterez des bases
    de données, des chaînes de traitements automatiques ainsi que des
    interfaces homme-machine. Vous serez également impliqué dans différents
    projets bioinformatiques transversaux.

    De réelles capacités d'écoute ainsi qu'un esprit de service à
    l'utilisateur sont requises.

    Environnement de travail:
    - Serveurs Unix Sun/Compaq, WindowsNT
    - SGBDR Oracle
    - GCG, LASSAP, Biomerge

    Profil demandé :
    - Système d'exploitation Unix et Windows
    - Programmation (Perl, Java, PHP, ...)
    - Langages HTML, CGI, XML, SQL
    - BLAST, Package GCG, ...

    Si de bonnes connaissances en biologie sont requises, une expertise
    en biologie végétale n'est pas nécessaire.

    Source annonce:
    Denis SCALA
    BioInformatique
    Biogemma
    2, rue Gaston Crémieux
    91000 Évry
    75001 Paris
    Contacts:Contact:
    Envoyer CV et lettre de motivations à

    Catherine Guichard
    Biogemma - DRH
    1, rue Édouard Colonne


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    07/02/2002[AGMM]1 LECTURESHIP Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford
    Source:Ph. Marc
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:20/03/2001
    Lieu:Oxford (Grande-Bretagne)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford, Oxford, UK

    Deadline: 1 March 2002
    Beginning: 1 October 2002
    Duration: permanent
    Salary: 20 470 - 41 570 GB Pounds / year

    University Lecturership in Bioinformatics in association with a
    Supernumerary Fellowship at St John's College.

    Applications are invited for this permanent new post which is funded for the first five years by EPSRC, alongside its similar support for the new Professorship of Bioinformatics held by Professor Jotun Hein.

    These two appointments are part of a major expansion of the resources committed by the Department of Statistics, and more widely in Oxford, to bioinformatics. The anticipated start date for the post is 1 October 2002.

    The successful candidate will be offered a supernumerary fellowship with membership of the Governing Body by St John's College.

    Salary will be on the age-related scale for University Lecturers without tutorial fellowships, which will be £20,470-£41,570 per annum (at 1 March 2002 rates). Additional college allowances may be available as set out in the further particulars.

    Whilst applications are welcome from candidates with research interests in any area of methodological development in bioinformatics, there is a strong preference for candidates whose research is related to 'post-genomic' problems (including for example those pertaining to: structural biology; comparative genomics; analysis of modern experimental techniques such as gene expression arrays, or proteomics; data on genetic variation within species; and proposed 'medical informatics' databases which link medical records with genetic information) and which complements or builds on existing strengths within Oxford.



    Applications (nine copies, one for overseas applicants) including a CV detailing research interests, a publication list, and names, email and postal addresses, fax and telephone numbers for three referees (not more than two being from the same institution) should be sent to the administrator to reach her by 1 March 2002. Referees should be asked to write directly to the above address without waiting for a further request.

    Details of the current research interests in bioinformatics and mathematical genetics within the department may be found at:
    http://www.stats.ox.ac.uk/mathgen
    Other computational biology research in Oxford is described at:
    http://www.compbio.ox.ac.uk



    The closing date for applications is 1 March 2002. The University is an Equal Opportunities Employer.
    Contacts:Further particulars of the post are available from:

    The Administrator
    Department of Statistics
    1 South Parks Road
    Oxford OX1 3TG, UK
    tel 01865 272869
    email: beint@stats.ox.ac.uk
    http://www.stats.ox.ac.uk

    Informal enquiries may be made to Professor Donnelly
    (donnelly@stats.ox.ac.uk) or to Professor Hein (hein@stats.ox.ac.uk).

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    07/02/2002[AGMM]PhD / Postdoc Positions, European Project: HaeMOdel
    Source:P. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:05/03/2002
    Lieu:? (?)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Openings for PhD and Post-Doc positions are available in the frame of the European Union Funded RTN project "Mathematical Modelling for Haemodynamics"(HaeMOdel), aiming at developing research and training young researchers on the mathematical and numerical issues related to the simulation of the human cardiovascular system.

    The Network comprises six European Institutions with a long standing experience on different aspects of this research fields. The young researcher is expected to participate actively to the Network activities, which comprise Workshops, Tutorial courses and a visiting scheme among the Network Teams.

    The project expected starting date is October 1st , 2002. The deadline for the this candidature application is March 5th, 2002.

    The background required to a young pre-doc researcher wishing to
    participate to the project is a degree in Mathematics or Physics or Engineering or Computer Science, with a strong personal interest in numerical methods and scientific computing, as well as the willingness to learn new subjects,
    often not strictly related to his previous studies.

    The post-doc should have a solid experience in mathematical and
    numerical modelling and/or scientific computing. A background in medical research or bioengineering is also welcomed.
    Contacts:The researcher must comply with the eligibility rules for European RTN projects (more details on:
    http://www.cordis.lu/improving/networks/home.htm)

    The full text of the call for application together with the on-line application form, the list of positions available and more details on the HaeMOdel project are found in:
    http://dmawww.epfl.ch/Quarteroni-Chaire/HaeModel/Main/call.html

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    07/02/2002[AGMM]Informatics Scientist (Collaborator Liaison)
    Source:http://hum-molgen.org/positions/postdocs/1897.html
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:?
    Lieu:Cambridge (Grande-Bretagne)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    SciGenium

    Informatics Software

    Informatics Scientist (Collaborator Liaison)

    The person in this position serves as a liaison between SciGenium and a specific collaborating client, with primary responsibility for European operations. The liaison provides full-time on-site consulting including demonstration and support for data visualization and mining software, understanding the collaborator's needs and conveying those to the home office, defining software requirements to support the collaborator, participating in prototype development, and performing data analysis.

    The European liaison is part of a two-person team to support the collaborator's needs. Along with the other liaison, who has primary responsibility for North American operations, this two-person team must act in a unified fashion to best represent, unify, and integrate the needs of this client under a single client director. Effective and frequent communication is an important aspect of success in this position.

    The Informatics Scientist needs to have an understanding of information visualization, in general. In addition, knowledge of the technical areas being addressed by the client is needed. The candidate should have some familiarity with exploratory data analysis, bioinformatics, and cheminformatics and be willing to learn more in these areas. Familiarity with existing informatics software and Windows and UNIX platforms is desired. Experience with programming languages such as JAVA would be advantageous.

    Training and experience equivalent to a Ph.D. in mathematics/statistics, biochemistry/molecular biology, chemistry, or computer science or an M.D. Experience with informatics and excellent interpersonal skills required.
    Contacts:Interested candidates should forward their resumes to jtrynak@scigenium.com or FAX 208.567.3995 or send to:
    SciGenium
    P.O Box 380916
    Cambridge, MA 02238

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    07/02/2002[AGMM]Associate Professorship/Senior Lecturer/Lecturer
    Source:Ph. Marc (Agm2)
    Date de parution:07/02/2002Date limite de réponse:15/02/2002
    Lieu:Johannesburg (Afrique du Sud)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Subject: Position in Applied Mathematics, University of the
    Witwatersrand

    SCHOOL OF COMPUTATIONAL AND APPLIED MATHEMATICS

    Associate Professorship/Senior Lecturer/Lecturer

    Applications are invited for the above positions from suitably qualified

    candidates. Areas of interest in the School include numerical analysis,
    optimization and control, image processing, differential equations,
    continuum
    mechanics, astronomy, bio-mathematics, mathematics of finance,
    mathematics in
    industry and mathematical modelling.

    QUALIFICATIONS: PhD at least; research profile for senior posts;
    leadership
    ability for professorships.

    SALARY: This is negotiable. Additional benefits include contributions
    to the
    provident fund, an annual bonus, generous leave, medical aid, housing
    subsidy
    (if eligible), relocation allowance, 100% financial assistance of
    dependent's
    university studies (if eligible).

    ENQUIRIES: Prof D Sherwell, tel: (+27)(11) 717-6120, fax: (+27)(11)
    403-9317, e-mail: sherwell@cam.wits.ac.za

    An information sheet is available from the Human Resources Manager
    (address
    below) or from our website: http://www.cam.wits.ac.za/

    CLOSING DATE 15 FEBRUARY 2002

    THE UNIVERSITY OF THE WITWATERSRAND IS COMMITTED TO EXCELLENCE AND
    EQUITY
    Contacts:TO APPLY: Submit a detailed CV with the names, addresses and contact
    details
    (e-mail addresses) of three referees and certified copies of
    degrees/diplomas
    to: Prof D Sherwell, School of Computational and Applied Mathematics,
    University of the Witwatersrand, Private Bag 3, Wits 2050, Johannesburg,

    South Africa.

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    03/07/2001[MM]ATER Physico-Chimie moléculaire et cellulaire au Muséum National d'Histoire Naturelle
    Source:lettre d'information de l'iEDU
    Date de parution:03/07/2001Date limite de réponse:03/09/2001
    Lieu:Paris (France)Statut:ATERSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Avis de vacance d'emplois d' A.T.E.R. au Muséum National d'Histoire Naturelle :

    Une circulaire est envoyée, ce jour, pour affichage, à tous les Directeurs de Laboratoire et Chefs de service.

    10 emplois sont ouverts au Muséum :
    2 postes en Biologie des populations :
    Intitulés des profils :
    - Dynamique des Populations d'oiseaux
    - Dynamique des communautés d'oiseaux

    4 postes en Biologie des organismes :
    Intitulés des profils :
    - Technologies de la reproduction appliquées à la conservation d'espèces en voie de disparition ( Parc de la Haute Touche à
    Azay)
    - Biologie de la conservation des plantes (Conservatoire botanique national du Bassin parisien à Cherré (Sarthe)
    - Phylogénie des Téléostéens (Laboratoire d' Ichtyologie générale et appliquée)
    - Biologie et Biotechnologies Marines (Station de Biologie Marine de Concarneau)

    2 postes en Sciences de la Terre :
    Intitulés des profils :
    - Préhistoire et paléoenvironnements du Quaternaire, Pléistocène supérieur (Abri Pataud)
    - Modélisation hydrosédimentaire et biologique d'écosystèmes côtiers macrotidaux (Laboratoire d'Océanographie Physique)

    2 postes en Biologie expérimentale :
    Intitulés des profils :
    - Endocrinologie évolutive (Laboratoire de Physiologie)
    - Physico-Chimie moléculaire et cellulaire
    Les dossiers sont à retirer à l'Administration - service du Personnel - où ils devront être retournés, au plus tard, le 3
    septembre 2001, délai de rigueur, (le cachet de la poste faisant foi).
    Contacts: le telephone standart ( 01.40.79.30.00), serveur : http://www.mnhn.fr

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    01/07/2001[MM]ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire
    Source:association Bernard Gregory
    Date de parution:01/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Fresnes (France)Statut:PostdocSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire
    (industrie phamaceutique)

    Date de debut de diffusion du poste : 18/06/2001

    Au sein du Departement Sciences Pharmaceutiques de notre Centre de
    Recherche, ce post-doc integrera une equipe de physico-chimistes et
    de formulateurs pour un Contrat post-doctoral d'une duree de 12 mois.

    Il aura pour mission de relier des etudes conformationnelles a
    certaines proprietes physico-chimiques . Pour cela, il devra realiser
    des analyses conformationnelles sur petites molecules (principes
    actifs) en milieu solvant, en utilisant les logiciels MSI, Tripos
    (Sybyl 6.6)...

    Les candidats doivent etre titulaires d'un Doctorat en Chimie /
    physico-Chimie avec une specialisation en modelisation moleculaire.

    Nous vous remercions d'adresser CV + lettre de motivation a :
    PFIZER Global Research & Development
    A l'attention de Joel Vacus
    Departement Sciences Pharmaceutiques
    3/9 rue de la Loge BP 100
    94265 FRESNES Cedex
    Tel: 01 40 96 74 00 / joel.vacus@pfizer.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)
    Contacts:Nous vous remercions d'adresser CV + lettre de motivation a :
    PFIZER Global Research & Development
    A l'attention de Joel Vacus
    Departement Sciences Pharmaceutiques
    3/9 rue de la Loge BP 100
    94265 FRESNES Cedex
    Tel: 01 40 96 74 00 / joel.vacus@pfizer.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)

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    01/07/2001[MM]Researcher – Protein structure modelling NAUTILUS BIOTECH
    Source:http://www.arborescience.com/public/pages_fr/jobs_detail.php?id=1413
    Date de parution:25/05/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Description du poste à pourvoir :

    Job Description: Modelling of protein structure, folding, active sites/domains and ligand/protein-protein interaction.

    Place : Evry, France

    Compensation package:

    -Highly competitive salary
    -Stock options according to personal and Company performance

    Position available immediately
    Requirements: PhD in Biology, Biotechnology or similar Previous experience in modelling of protein structure
    Contacts:Contact :
    Contact information: Manuel Vega
    CEO
    mvega@nautilusbiotech.com
    tel : +33 (0)6 87 69 56 38
    Référence de l'offre, pour votre candidature et dans toute correspondance avec Arborescience :
    ARB1413

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    01/07/2001[AG]1 or 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    Source:Liste Bioinfo IMPG
    Date de parution:29/06/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Ghent (Belgique)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    1 or 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    People coming from an another field than computer science (biology for instance),
    but having a one year (or more) specialization in that domain are welcome.

    Place: University of Ghent, Belgium

    Organism: INRA/GenoPlante (French institute/organism)

    Date: as soon as possible

    Objective: in the frame of 2 GenoPlante projects,
    he/she will be involved in the building of databases and their Web user interfaces
    as well as in the development/enhancement of software for gene prediction,
    gene annotation, and gene products characterization.

    Skills: Relational Database Management Systems (Sybase, Oracle, postgreSQL)
    Web development (HTML, JavaScript, Java)
    CGI/software development (C, Perl)

    Qualification: master's degree in computer science or equivalent.

    Language: fluent English required

    Salary: between 12 000 FF and 16 000 FF gross / month (depending on the diploma and qualifications)
    Contacts:Contacts: Pierre Rouze (pirou@gengenp.rug.ac.be)
    Patrice Dehais (pahai@gengenp.rug.ac.be)

    Address: Laboratoire Associé de l'INRA
    VIB Department of Plant Genetics, University of Ghent,
    K.L. Ledeganckstraat 35, B-9000 GHENT, Belgium
    Tel: +32-9.264.5189 (Pierre Rouze)
    Tel: +32-9.264.87.21 (Patrice Dehais)
    Fax: +32-9.264.5008

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    01/07/2001[AG]A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project
    Source:liste bioinfo IMPG
    Date de parution:27/06/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Bordeaux (France)Statut:PostdocSecteur:public
    Description de l'annonce:
    A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for
    the LIGNOME project.
    This project deals with the functionnal genomics of diverse perennial
    plants (Pines, Poplars, Apricots and Grape)


    posted at : http://www.pierroton.inra.fr/postdoc.html
    Contacts:Jean-Marc Frigerio Genetique et Amelioration des Arbres
    Forestiers
    INRA BP45 Phone : +33 (0)5 57 97 90 79
    F-33611 Gazinet Cedex France Fax : +33 (0)5 57 97 90 88
    Frigerio@pierroton.inra.fr http://www.pierroton.inra.fr


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    01/07/2001[AG]ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique
    Source:association Bernard Gregory
    Date de parution:15/06/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:? (France)Statut:???Secteur:prive
    Description de l'annonce:
    ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique

    Date de debut de diffusion du poste : 15/06/2001

    Societe de Biotechnologies de la metropole lilloise, nous sommes
    specialises dans la decouverte de nouveaux medicaments.
    Dans la cadre de notre expansion nous recherchons un chef de projet
    en bioinformatique.

    Docteur en Biologie, vous avez une formation complementaire en
    informatique et de bonnes connaissances en bioinformatique.
    Maitrisant parfaitement les languages C+, XML ..., vous mettrez en
    place, en particulier, notre outil reseau.
    Votre anglais est courant et vous souhaitez vous investir dans une
    societe jeune et en pleine expansion.
    Contacts:Envoyer votre candidature a notre conseil :
    Valerie Lacoste
    Cabinet F2V
    5 rue Kepler 75116 Paris
    Fax 01 40 70 14 09 / Email : vlacoste@f2v.com

    Precisez dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
    contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference
    ABG de cette offre.
    Merci de nous informer des suites donnees a votre candidature sur ce
    poste, si ces suites sont positives et aboutissent a votre
    recrutement (E-mel: alain.valette@abg.asso.fr)

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    01/07/2001[AG]CELOGOS, Société de Biotechnologie, recherche
    Source:http://asso.univ-poitiers.fr/adbep/emploi/SocietedeBiotechnologie.htm
    Date de parution:28/05/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Paris (France)Statut:???Secteur:prive
    Description de l'annonce:
    - Des bioinformaticiens (construction du pôle bioinformatique, base de données, analyse d'image, automatisation)
    - Des biologistes cellulaires (caractérisation de milieux définis sélectifs et standardisation des procédés de culture cellulaire)
    - Un responsable de thérapie cellulaire (construction et caractérisation de cellules génétiquement modifiées et suivi de projet)
    Contacts:Contact : Christian Pinset
    Mail : cpinset@pasteur.fr
    Tél : 01 45 68 89 61

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    01/07/2000[MM]Software Developers à Gentech (Sophia antipolis)
    Source:Ph. Marc (AGM2)
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Sophia Antipolis (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Software Developers à Gentech (Sophia antipolis)
    Gentech is a biotechnology research laboratory and bioinformatics company. We are developing a cross-platform bioinformatics
    software package for DNA and protein sequence analysis and visualisation.
    Three software developer positions are available with the following requirements:
    - C++ programming
    - Expertise in one or more of the following platforms:Windows98-NT, Linux and MacOS
    - Knowledge of 3D programming, (Quickdraw, OpenGL).
    Gentech is located in the scientific park "Sophia Antipolis" in the South of France near Nice and Cannes, see our web site
    www.gentech.fr.
    Contacts:contact: Gentech 55, Allée Charles Victor Naudin Sophia Antipolis 06410 Biot France
    Tel : 04 93 95 68 28 Fax : 04 93 95 68 27

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    01/07/2000[AG] allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive
    Source:liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:13/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Une allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (UMR CNRS 5558).
    Des candidats souhaitant réaliser une thèse en bioinformatique sont espérés sur cette allocation. Le sujet de thèse proposé serait
    la conception d'algorithmes efficaces pour des programmes dédiés à l'analyse comparative, en particulier la reconstitution
    phylo-génétique. La thèse sera codirigée par Manolo Gouy (BBE - UMR CNRS 5558) et Bernard Tourancheau (RESAM, action
    RESO de l'INRIA).
    Plus précisémént l'objectif de cette thèse sera le développement d'une architecture de type client/serveur permettant de réaliser des
    analyses phylogénétiques lourdes (maximum de vraisemblance, bootstrap) grâce à la parallélisation des calculs effectués. Outre des
    développements au niveau des algorithmes de reconstitution phylogénétique proprement dits, ce travail impliquerait également la
    construction d'une interface utilisateur efficace,sur le modèle du logiciel Phylo_win :
    http://pbil.univ-lyon1.fr/software/phylowin.html
    Contacts:Nous encourageons vivement les candidatures et nous invitons les personnes intéressées à prendre contact dès que possible avec :
    Pr. Christian Gautier
    Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR CNRS 5558 Université Claude Bernard - Lyon 1 43, bd. du 11 Novembre
    1918 69622 Villeurbanne Cedex
    cgautier@biomserv.univ-lyon1.fr

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    01/07/2000[AG]CDD ingenieur en bioinformatique Duree : 2 ans Localisation : LIRMM-CNRS a Montpellier.
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Montpellier (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre de la Genopole de Montpellier, un CDD d'ingenieur bioinformaticien pour une duree de 2 ans sera disponible en
    septembre 2000 au laboratoire d'Informatique Robotique et Microelectronique de Montpellier (LIRMM). Cet ingenieur travaillera au
    sein l'equipe Methodes et Algorithmes pour l'Analyse de Sequences (MAAS) dans le domaine de la bioinformatique.
    Plus precisement, son travail portera sur la conception, le test et le developpement les methodes d'analyse de donnees et d'analyse
    statistique pour l'exploitation des mesures d'activite des genes. Les biologistes acquierent ces mesures appelees "donnees
    d'expression" par differentes techniques : puces a ADN, macro et micro-array, methode SAGE, gels bidimensionnels. Le but est de
    proposer et de mettre en place des outils pour aider les biologistes a analyser ces donnees.
    Le candidat devra assurer l'interface entre les informaticiens et les biologistes de la Genopole Montpellier Languedoc-Roussillon. Il
    participera a la mise en place de formations et de seminaires sur ce theme. Il devra avoir de bon acquis en programmation et analyse
    des donnees, et des connaissance en biologie sont souhaitables. La fourchette de salaire fixee selon les baremes de la fonction
    publique, categorie ingenieurs CNRS, va de 9500 F a 11500 F nets par mois suivant la qualification et l'anciennete.
    Le LIRMM est un laboratoire de l'Universite de Montpellier II et du CNRS ou travaillent quelques 200 enseignants, chercheurs et
    administratifs. L'equipe MAAS, active dans la recherche en bioinformatique depuis plus de 15 ans, regroupe 11 personnes et est
    dirigee par O. Gascuel (DR-CNRS). Elle beneficie d'un bon environnement materiel, ainsi que d'une bonne ambiance de travail. Pour
    plus de details consulter le site web de l'equipe: http://www.lirmm.fr/~w3ifa/MAAS/
    Montpellier, grand centre de recherche au rayonnement international, est devenu en 1999 une des premieres Genopoles francaises. La
    metropole regionale offre un excellent environnement scientifique et un cadre de vie fort agreable. Ce poste est donc une reelle
    opportunite de formation a la bioinformatique dans un contexte scientifique de qualite.
    Contacts:Contact:
    Olivier Gascuel
    LIRMM, 161 rue Ada,
    34392 - Montpellier - FRANCE
    Tel. (33 or 0 from France) 4 67 41 85 47
    Fax. (33 or 0 from France) 4 67 41 85 00
    gascuel@lirmm.fr

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    01/07/2000[AG]CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:01/09/2000
    Lieu:Strasbourg (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante: CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg
    Profil : Analyse de séquences d'ADN de plantes
    Connaissances dans le domaine de la cytocinèse et de la paroi
    Connaissances en bioinformatique
    Niveau de formation requis : Doctorat
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : Janvier 2001-9 mois
    Région/lieu ou s'effectuera la recherche : Alsace/Strasbourg
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Dr Elisabeth JAMET elisabeth.jamet@ibmp-ulp.u-strasbg.fr
    Adresse du laboratoire : IBMP-CNRS 12, rue du Général Zimmer 67000 STRASBOURG
    Date limite de candidature : septembre 2000

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    01/07/2000[AG]Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Clermont Ferrand (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand
    Programme : Génoplante-blé gestion de bases de données
    Profil : Le candidat sera chargé de l’organisation, de la maintenance et de l’incrémentation de ressources biologiques moléculaires et
    végétales. Compétences demandées : Expérience en marquage moléculaire et bactériologie, maîtrise des logiciels de gestion de bases
    de données type ORACLE (AURIGE), ACCESS ou PARADOX impérative, grande rigueur et minutie, Il devra avoir des qualités
    d’organisateur et une bonne aptitude pour les relations humaines et le travail en équipe.
    Niveau de formation requis : bac + 5
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : 01/12/99
    Région /lieu où s'effectuera la recherche : Clermont-Ferrand
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Michel Bernard (Michel.Bernard@clermont.inra.fr)
    Adresse du laboratoire : INRA Station d’Amélioration des Plantes Domaine de Crouelle 234, Avenue du Brézet 63039
    Clermont-Ferrand cedex 2
    pas de date limite de candidature annoncée

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    01/07/2000[AG]Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY
    Source: transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2001Date limite de réponse:?
    Lieu:Evry (France)Statut:CDISecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY
    Programme : Génoplante Générique, Nouveaux outils d’analyse du génome
    Profil : Ingénieur de recherches.
    Participation à l’organisation de bases de données FST et EST et recherches bioinformatiques sur ces données. ("Data mining")
    Niveau de formation requis : Thèse en biologie moléculaire végétale. Connaissances en analyse de séquences bioinformatique
    souhaitées.
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : Février 2000, CDI sur financement privé
    Région/lieu où s’effectuera la recherche :Evry, région parisienne
    Contacts:Scientifique responsable à contacter : Alain Lecharny lecharny@evry.inra.fr
    Adresse du laboratoire : Unité de Recherche en Génomique végétale INRA 2 Rue Gaston Crémieux 91057 Evry Cedex, France
    Tel: +33 1 60 87 45 06 Fax:+33 1 60 87 45 10
    Date limite de candidature : fin Décembre 2000

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    01/07/2000[AG]Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Toulouse (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse
    Thèse : Développement d’un prototype permettant la localisation de gènes et/ou de motifs structurés. Application à la recherche
    d’éléments d’intérêt chez Arabidopsis thaliana.
    Niveau de formation requis : DEA Informatique (avec goût pour la biologie) ou bioinformatique
    Date souhaitée du recrutement et durée prévue : octobre 2000
    Région/lieu ou s’effectuera la recherche : INRA – Midi-Pyrénées – Toulouse
    Contacts:Scientifique(s) a contacter : Christine Gaspin : Christine.Gaspin@toulouse.inra.fr ou Thomas Schiex :
    Thomas.Schiex@toulouse.inra.fr
    Adresse du laboratoire : INRA/UBIA Chemin de Borde-Rouge Auzeville BP 27 31326 CASTANET-TOLOSAN
    Date limite de candidature : Septembre 2000

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    01/07/2000[AG]Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)
    Source:trouvé sur webbio.com
    Date de parution:31/08/2000Date limite de réponse:30/09/2000
    Lieu:Lille (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)
    Société : CNRS UPRESA 8090 Laboratoire Genetique des Maladies Multifactorielles, Lille
    Présentation du poste : Réaliser des analyses statistiques de données génétiques en collaboration avec des chercheurs en biologie
    moléculaire, épidémiologie génétique et des médecins : - Gestion des données (vérification / mise en forme informatique) -
    Organisation des contrôles de qualité - Utilisation de programmes spécifiques de statistique génétique - Mise en forme des résultats
    -Aide à l'interprétation des résultats - Développement de procédures d'automatisation - Participation au développement et à la gestion
    des bases de données - Profil : - Bac + 4 ou 5. Bonnes connaissances statistiques -Formation en statistiques génétiques assurée au sein
    du laboratoire - Disponibilité pour suivre des formations à l'étranger - Connaissances : - Utilisation UNIX, base de programmation C
    ou Pascal et Anglais - Lieu : Institut de Biologie de Lille -
    Contacts:Sophie Gallina Institut de Biologie de Lille
    Laboratoire des maladies multifactorielles 1 rue du professeur Calmette, B.P. 245, 59019 Lille
    Date limite d'envoi : 30 septembre 2000

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    01/07/2000[AG]2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:22/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Ghent (Belgique)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst
    Place: University of Ghent, Belgium
    Organism: INRA/GenoPlante (French institute/organism)
    Date: as soon as possible
    Objective: in the frame of 2 GenoPlante projects, he/she will be involved in the building of databases and their Web user interfaces
    as well as in the development/enhancement of software for gene prediction, gene annotation, and gene products characterization.
    Skills: Relational Database Management Systems (Sybase, Oracle, postgreSQL) Web development (HTML, JavaScript, Java)
    CGI/software development (C, Perl)
    Qualification: master's degree in computer science or equivalent
    Language: fluent English required
    Contacts:Pierre Rouze (pirou@gengenp.rug.ac.be)
    Patrice Dehais (href=mailto:pahai@gengenp.rug.ac.be>pahai@gengenp.rug.ac.be)
    Address: Laboratoire Associé de l'INRA
    VIB Department of Plant Genetics, University of Ghent,
    K.L. Ledeganckstraat 35, B-9000 GHENT, Belgium
    Tel: +32-9.264.5189
    Fax: +32-9.264.5008

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    01/07/2000[AG]CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante)
    Source:posté sur la liste de l'ABG
    Date de parution:18/10/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lyon (France)Statut:CDDSecteur:public
    Description de l'annonce:
    ABGf-648 - CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) - Lyon
    Date de debut de diffusion du poste : 13/10/2000
    A position is open on a short-term contract (5 months from the 1 December 2000) at the Laboratoire de Reproduction etDeveloppement
    des Plantes (UMR 5667 INRA, CNRS, ENSL, Univ. Lyon I), to analyse data produced by the Arabidopsis genomesequencing project.
    This project is part of a nation-wide programme of Arabidopsis genome sequence annotation co-ordinatedby Genoplante. Work in
    Lyon will concentrate on the receptor-like kinase gene superfamily.
    We are looking for a biologist with some experience in sequence analysis and annotation and, if possible, some knowledge of the gene
    family being studied. The position is ideal for a biologist aiming to acquire experience in Bioinformatics. The salary will be
    calculated on the INRA scale depending on the level of experience. The position is open immediately.
    Contacts:Please send a CV and the names of 3 referees to Dr. Mark Cock, R.D.P.,
    UMR 5667 INRA - CNRS ENSL, Ecole Normale Superieure de Lyon, 46, Allee d'Italie, 69364 LYON Cedex 07
    Mark.Cock@ens-lyon.fr, tel: 0472728611

    Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.
    ABGf-648 - CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante) - Lyon

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    01/07/2000[AG]Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA.
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:18/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Winnipeg (Manitoba, Canada)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Optimex Group, Inc. is presently has an agreement to locate professionals for the positions below. Negotiations are presently ongoing
    to locate openings in other capacities. Resumes may be forwarded to contact@optimexgroup.com. All positions are located in
    Winnipeg, Manitoba.
    Salary approx. CAD$50,000 per annum. In consultation with the cereal genetics and molecular genomics research scientists and in
    collaboration with a computer programmer, you will conduct research and development in the area of molecular bioinformatics. This
    includes: evaluating current software for the storage, analysis and interpretation of DNA sequence, proteomics and microarray (DNA
    chip) data; developing contacts with recognized experts in the field to facilitate the exchange of the most current theories and
    methodologies; collaborating with local scientists to determine the most important requirements for molecular bioinformatics at the
    Cereal Research Centre; designing, implementing and maintaining a state-of-the-art system to satisfy these requirements, designing
    noval software where necessary; training local staff in the use of molecular bioinformatics systems and sharing developments with
    other AAFC Centres engaged in genomics research. A M.Sc. in biological sciences, biochemistry or molecular biology is required.
    Experience in molecular biology research including the analysis of DNA sequence data. Informatics experience including the use and
    design of large databases and computer programming.
    RESUMES WILL BE SCREENED ACCORDING TO THE ABOVE EXPERIENCE FACTORS. PLEASE INDICATE IN YOUR
    RESUME HOW YOU MEET EACH FACTOR.
    http://www.canadaimmigrationlaw.net/Employment/open-positions.htm#Molecular Bio-Informatics Biologist
    NOTE: M.Sc.= Master of Science = dernier diplome américain avant le Phd = bac +4
    Contacts:contact@optimexgroup.com

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    01/07/2000[AG]Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:21/07/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Philadelphia (USA)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project. University of Pennsylvania
    The individual will be responsible for managing a database, GenMapDB (http://genomics.med.upenn.edu/genmapdb) and running a
    wide range of bioinformatics and image analysis software related to DNAmicroarray studies.
    Experience in Unix and NT systems, database management and programming in C, Java and Perl is necessary. Background in biology
    and genetics would be a major advantage. The successful applicant will hold at least a MS Degree in Computer Science or Biology.
    On-the-job training and course attendance will be available.
    Contacts:Applications including the names and phone numbers of three referees to be sent to:
    Vivian Cheung, MD, University of Pennsylvania, 3516 Civic Center Blvd., ARC 516, Philadelphia, PA 19104; email:
    vcheung@mail.med.upenn.edu.
    plus de détails: http://asso.univ-poitiers.fr/adbep/emploi/BIOINFORMATICSPENNSYLVANIA.htm

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    01/07/2000[AG]PERL/UNIX Developer (chip design) Rosetta Inpharmatics (USA)
    Source: trouvé sur http://www.bioview.com
    Date de parution:08/08/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Kirkland (USA)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    PERL/UNIX Developer (chip design) Rosetta Inpharmatics (USA)
    Background: Rosetta Inpharmatics is the leader in informational genomics - the integration of bioinformatics with genomics tools to
    accelerate and improve the discovery process. Our mission is to provide an economical, reliable, and flexible technology platform to
    solve critical drug discovery challenges for pharmaceutical and biotechnology companies, and to improve agricultural products. We
    have the following opening:
    Position – PERL/UNIX Specialist: Candidate should have PERL programming experience, familiarity with UNIX, and SQL. MATLAB
    beneficial, although not essential. Design DNA microarray chips. Familiarity with biological terminology helpful. Must interact well
    with people. Attention to detail important.
    BA required.
    Contacts:Contact: Please email your resume to us at: hr@rii.com and include the title of the position you are applying for in the subject line.
    (Emails preferred.) Or mail us your resume at: Rosetta Inpharmatics, Attn: Recruiting Dept, 12040 115th Avenue NE, Kirkland, WA
    98034. Selected candidates will be contacted. Principals only. EOE. Thank you for applying!
    http://www.rii.com

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    01/07/2000[AG]Bioinformatics Applications Developer
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:07/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Paris (France)Statut:CDISecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Bioinformatics Applications Developer à Hybrigenics (Paris)
    You will work with our bioinformatics scientists on the design and development of leading-edge biological modeling and analysis
    software. Your initial responsibilities will include design and development of an Oracle-based platform dedicated to the functional
    annotation of protein domain sequences detected using Hybrigenics' PIM building technology.
    Required : An M.Sc. or equivalent experience in either biology or CS/Math, complemented by proven software development
    experience within the life sciences context Familiarity with classical biological sequence analysis algorithms Strong experience with
    object-oriented design and development in C++ or Java (Java preferred) Familiarity with Unix environment Excellent
    problem-solving and communications skills, ability to work both independently and within a team.
    Preferred Competencies : Relational databases (Oracle preferred), SQL
    Contacts:Applications including CV and references should be sent to :
    jobs@hybrigenics.fr - Vincent Schachter & Yvan Chemama - Hybrigenics - 180 avenue Daumesnil - 75012 Paris - France (Ref DV1,
    08/2000)

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    01/07/2000[AG]projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir
    Source:posté sur la liste bioinfo du CRIHAN
    Date de parution:10/10/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Meylan (France)Statut:CDDSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    Dans le cadre du projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoire, en partenariat
    avec l'Institut Pasteur (Paris), l'INRIA Rhone-Alpes (Grenoble) et la societe Hybrigenics (Paris), GENOME Express recrute en CDD
    (un an renouvelable ET pouvant par
    la suite evoluer en CDI) :
    - Un ingenieur concepteur/developpeur, formation de niveau Bac+5 en informatique, competence confirmee en programmation par
    objets (Java, et/ou
    C++).
    Il s'agit de participer a la conception et au developpement du noyau d'un systeme a base de connaissances, ainsi que de ses interfaces
    personne-machine generiques (navigation, visualisation, edition, expression de requetes).
    Date d'embauche souhaitee : 1er novembre 2000
    Lieu de travail : Grenoble
    - Un bio-informaticien, niveau Bac+5. Formation en biologie moleculaire et formation complementaire en informatique (par exemple a
    travers un DESS
    "double completence"), ou formation en informatique assortie de connaissances en biologie. Competences souhaitees en modelisation
    (UML) et programmation par objets (Java et/ou C++).
    Taches a realiser :
    1. Modelisation des entites biologiques concernees et de leurs relations dans le cadre d'un modele de connaissances a objets.
    2. Conception et programmation d'algorithmes et de strategies d'annotation des genomes.
    3. Conception et developpement des interfaces personne-machine.
    4. Experimentation en vraie grandeur des systemes informatiques resultants.
    Date d'embauche souhaitee : 1er decembre 2000
    Lieu de travail : Grenoble

    Composition du dossier de candidature :
    - une lettre de candidature et de motivation
    - un CV mentionnant les emplois et fonctions remplis anterieurement
    - les éventuelles references ou lettres de recommandation

    Contacts:A adresser a :
    Yves Vandenbrouck
    GENOME express
    11 Chemin des Pres
    38944 Meylan
    ou par voie electronique a :
    y.vandenbrouck@genomex.com
    Pour toute information supplmentaires, contacter :
    Yves Vandenbrouck
    Bioinformatics Project Coordinator
    y.vandenbrouck@genomex.com
    ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
    GENOME express
    11 Chemin des Pres
    38944 Meylan
    France
    Tel: + 33 (0)4 76 04 16 42 et/and + 33 (0)4 56 38 11 11
    Fax: + 33 (0)4 76 04 16 42 et/and + 33 (0)4 56 38 11 00
    Mobile: +33 613307550
    http://www.genomex.com

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    01/07/2000[AGMM]Appel à candidature : bourse de thèse
    Source:transmis par Philippe Marc
    Date de parution:10/09/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Lille (France)Statut:ThèseSecteur:public
    Description de l'annonce:
    Appel à candidature : bourse de thèse
    École Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé de Lille (Directeur Pr Marc Mazzuca)
    Lieu : Université des Sciences et Technologies de Lille
    Équipe : Christian Rolando, UPRESA CNRS 8009 en collaboration avec le Pr. Christian Druon Institut d’Électronique et de
    Microélectronique du Nord, UMR CNRS
    Dans le cadre du Plateau de protéomique de la Génopole de Lille, notre équipe en partenariat avec l’Institut d’Électronique et de
    Microélectronique du Nord, développe des systèmes intégrés basés sur des microsystèmes en silicium (échelle 10 microns) pour la
    purification et la séparation en ligne des échantillons afin de pouvoir accéder à une protéomique à haut débit. Ce programme fait
    l’objet d’une labellisation par le Réseau National de Micro et nanotechnologie.
    Le candidat aura en charge toute la partie biologique du développement de ces nouveaux objets sur des thématiques en partenariat avec
    les équipes de biologie de l’USTL en particulier le Pr Michel Salzet, UPRESA CNRS 87017 (peptide antibactérien) et le Dr
    Jean-Claude Michalski, UMR CNRS 8576 (glycobiologie). Le laboratoire assurera la formation à l’ensemble des techniques de la
    protéomique.
    Équipements spécifiques: électrophorèse bi-dimensionnelle, chromatographie liquide faible débit, spectromètre de masse MALDI,
    spectromètre de masse « Q-TOF », accès local aux banques de données.
    Contacts:Pour tout renseignement complémentaire contacter :
    Dr. Christian Rolando Directeur de Recherche au CNRS
    Courrier électronique / E-mail : Christian.Rolando@univ-lille1.fr
    Université des Sciences et Technologies de Lille (Lille 1)
    UFR de Chimie, Bâtiment C4, 2ème étage, porte 210
    UPRESA CNRS 8009, Chimie Organique et Macromoléculaire
    59655 Villeneuve d'Ascq Cedex, France
    Bureau / Office
    Téléphone: 03 20 43 49 77; Télécopie : 03 20 33 61 36; Téléphone mobile: 06 60 67 37 78
    From outside France
    Phone: 333 20 43 49 77; Fax: 333 20 33 61 36; Cellular Phone: 336 60 67 37 78
    Centre de Spectrométrie de Masse / Mass Spectrometry Center
    Téléphone: 03 20 43 49 76; Télécopie: 03 20 43 43 63;
    From outside France
    Phone: 333 20 43 49 76; Fax: 333 20 43 43 63

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    01/07/2000[AGMM]ASSISTANT DE RECHERCHE CLINIQUE
    Source:proposition de l'APEC
    Date de parution:31/08/2000Date limite de réponse:?
    Lieu:Vincennes (Paris)Statut:ThèseSecteur:prive
    Description de l'annonce:
    ASSISTANT DE RECHERCHE CLINIQUE - Lieu: VINCENNES (94) (APEC - 30/08/2000)
    Biologie et Industrie est une "Clinical research Organization", c'est à dire une société de services pour l'industrie pharmaceutique dont
    le métier principal est l'expérimentation de médicament chez l'être humain malade. Nous formons des "Assistants de Recherche
    Clinique". Nous recherchons des étudiants en "Science de la vie", toutes spécialités, futurs thésard pour passer avec nous une
    convention pour une bourse CIFRE. La maîtrise de la langue anglaise, au mieux après un séjour dans un laboratoire en pays
    anglophone est importante.
    Contacts: Merci d'adresser votre dossier de candidature à: BIOLOGIE & INDUSTRIE - Dr BROSSEL - 158 avenue
    de Paris - 94300 Vincennes - E Mail: biometrie@biologieindustrie.com.

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