ASSOCIATION AGM2
Association des Étudiants du DEA d'Analyse de Génome et de Modélisation moléculaire Offres d'emploi post DEA

Les offres Post-DEA de l'association

223 annonces en cours de validité dans toute la base

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Date	BR	Statut	P/P	Titre	Pays
27/06/2007	MM	Stage	prive	amour	france
21/11/2006	AG	Thèse	public	PhD studentship in Bioinformatics	Angleterre, Grande-Bretagne
31/10/2006	AG	???	prive	broadcasting	Ontario
30/06/2005	AG	Postdoc	prive
30/06/2005	AG	Postdoc	prive	Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites	France
30/06/2005	AG	Postdoc	prive	Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis	France
25/01/2005	AGMM	CDD	public	CDD Ingénieur d'Etude en biologie moléculaire des algues	France
29/11/2004	AG	Postdoc	public
13/12/2003	AG	???	prive
13/12/2003	AG	???	prive
06/11/2003	MM	CDI	public	Computational Chemist	Etats-Unis
06/11/2003	AG	CDD	public	Research Fellow/Assistant
05/11/2003	MM	CDI	prive	Molecular Modeler	Etats-Unis
05/11/2003	AG	CDD	public	Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics	France
05/11/2003	AG	CDI	public	Senior Bioinformatics Positon at the FMI	Suisse
05/11/2003	AG	ATER	prive	Bioinformaticien (poste ATER)	France
21/10/2003	AG	CDI	prive	Bioinformatics Research Scientist	Etats-Unis
21/10/2003	AGMM	CDI	prive	BIOINFORMATICS Scientist	Singapour
09/10/2003	AG	Postdoc	public	2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)	Canada/Quebec
09/10/2003	AG	CDI	prive	BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
09/10/2003	AG	Postdoc	prive	motif discovery algorithm/statistics	Etats-Unis
05/10/2003	AGMM	Postdoc	public	Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics	Etats-Unis
19/09/2003	AGMM	CDI	prive	BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868)	Canada/Quebec
18/09/2003	AG	Thèse	public	three PhD positions in Bioinformatics	Australie
18/09/2003	AG	Postdoc	public	Post-doctoral position in microarray data analysis	Suisse
18/09/2003	AGMM	CDD	prive	plusieurs postes de Bioinformatique	Suisse
09/09/2003	MM	CDI	prive	BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist	Etats-Unis
03/09/2003	AG	Postdoc	public	RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS	Grande-Bretagne
03/09/2003	AGMM	CDD	public	Developpeur Web pour le site La main a la pate	France
02/09/2003	AG	CDI	public	Bioinformaticien confirmé	France
11/08/2003	AG	Maître de Conférence	public	RESEARCH POSITION	Canada/Quebec
03/08/2003	MM	Postdoc	public	Postdoctoral Fellowship	Etats-Unis
03/08/2003	AG	CDI	public	Chef de projet bioinformatique au Genoscope	France
03/08/2003	AG	Thèse	public	Bourse de These en Microbiologie	France
03/08/2003	AG	Postdoc	public	bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis	France
03/08/2003	AG	CDD	prive	Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)	France
03/08/2003	AG	CDI	prive	Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS	Etats-Unis
26/06/2003	AG	Maître de Conférence	public	MC de bioinformatique	France
23/06/2003	AG	CDD	public	Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie	France
23/06/2003	AG	CDI	prive	Computational Biologist	Etats-Unis
13/06/2003	MM	Thèse	public	These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole	France
11/06/2003	MM	Postdoc	public	POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS	Etats-Unis
10/06/2003	MM	Postdoc	public	Postdoctorals Fellowships in Structural Molecular Biology at the EMBL Outstation	France
10/06/2003	MM	Thèse	public	Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche	France
10/06/2003	MM	Thèse	public	Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP	France
10/06/2003	MM	Thèse	public	Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire	France
10/06/2003	MM	CDI	prive	Computational Chemists/C++	Etats-Unis
10/06/2003	AG	CDD	public	CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster	France
10/06/2003	AG	Postdoc	public	Research Associate in biostatistics and	Grande-Bretagne
10/06/2003	AG	Postdoc	public	Postdoctoral Position at MIPS	Allemagne
10/06/2003	AG	Postdoc	public	Biologist	Suisse
10/06/2003	AG	CDD	prive	CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services	Allemagne
10/06/2003	AG	Postdoc	prive	2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy	Etats-Unis
10/06/2003	AGMM	CDI	prive	Senior Scientist Bioinformatics, NITD	Singapour
28/05/2003	AGMM	ATER	public	ATER - Bioinformatique - Lille	France
21/05/2003	AG	Postdoc	public	Postdoc modele « plante virtuelle »	France
21/05/2003	AG	CDI	public	charge de cours en bioinformatique	Belgique
21/05/2003	AG	Postdoc	public	Postdoc	Etats-Unis
24/04/2003	MM	Postdoc	public	Post-Doctorat au CEA Saclay	France
24/04/2003	AG	CDD	public	chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD	France
24/04/2003	AG	Postdoc	public	computational biology/bioinformatics	Etats-Unis
18/04/2003	AG	CDD	public	Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique	France
17/04/2003	AG	CDI	public	INFORMATICIEN CHEF DE PROJET	France
15/04/2003	AGMM	CDI	public	2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology	Irelande
14/04/2003	AG	CDI	public	Computer Biologist - Metabolic Disease Group	Grande-Bretagne
14/04/2003	AG	CDI	public	Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation	Grande-Bretagne
08/04/2003	MM	CDI	prive	Computational Chemists	Etats-Unis
08/04/2003	AG	Postdoc	public	Postdoctoral job opening in Computational Biology	Etats-Unis
08/04/2003	AG	CDD	prive	Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)	France
07/04/2003	MM	CDI	public	SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY	Allemagne
07/04/2003	MM	CDI	public	SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY	Allemagne
07/04/2003	MM	Postdoc	public	POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY	Allemagne
07/04/2003	MM	Postdoc	public	Post-doctoral Postion in Structural Genomics	Etats-Unis
07/04/2003	AG	CDD	public	SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE	Grande-Bretagne
06/04/2003	MM	Postdoc	public	Post-doctorants CDD 18 moisINRA	France
06/04/2003	AG	Postdoc	public	bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS	France
06/04/2003	AG	CDI	public	BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN	France
06/04/2003	AG	Postdoc	public	Postdoc modélisation des réseaux de gènes	France
06/04/2003	AG	CDI	public	Poste de professeur en génétique & bio-informatique	France
06/04/2003	AG	Postdoc	public	Stage post-doctoral en génomique végétale	France
06/04/2003	AG	CDD	public	POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM	France
06/04/2003	AG	CDI	public	professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques	France
06/04/2003	AG	CDI	public	professeur de bioinformatique	France
06/04/2003	AGMM	Postdoc	public	Postdocs CNRS	France
06/04/2003	AGMM	Maître de Conférence	public	poste de maître de conférences en Bioinformatique	France
06/04/2003	AGMM	Postdoc	public	Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)
06/04/2003	AGMM	CDD	prive	Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline	Etats-Unis
02/04/2003	AG	Thèse	public	Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department	Irelande
28/03/2003	AG	CDI	public	Ingénieur de recherche CNRS	France
28/03/2003	AG	CDI	public	professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière	France
28/03/2003	AG	Postdoc	prive	Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics	France
23/02/2003	AG	CDI	prive	Data Analysis Scientist	Etats-Unis
21/02/2003	AGMM	Postdoc	public	Postdoctoral Positions, Computational Cell Biology	Etats-Unis
20/02/2003	AG	Postdoc	public	Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)	Grande-Bretagne
20/02/2003	AGMM	Postdoc	public	Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot	Suisse
20/02/2003	AGMM	Postdoc	public	Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships	Etats-Unis
20/02/2003	AGMM	Postdoc	public	Postdoc at the Computational and Molecular Population Genetics lab	Suisse
20/02/2003	AGMM	CDI	public	POSTES DE PROFESSEURS DES UNIVERSITES ET DE MAITRES DE CONFERENCES	France
16/02/2003	AG	???	public	Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute	Grande-Bretagne
12/02/2003	AGMM	Postdoc	public	Stage postdoctoral Marie Curie : Data Mining & Modelling: High Throughput Experimentation	Grande-Bretagne
10/02/2003	MM	Postdoc	public	PhD Position, Computational Molecular Biology	Canada/Quebec
10/02/2003	AGMM	Thèse	public	Research Scholarships	Grande-Bretagne
10/02/2003	AGMM	Postdoc	prive	Postdoctoral Research Fellowship	Grande-Bretagne
07/02/2003	AGMM	Postdoc	public	210 Postdoc CNRS en 2003	France
06/02/2003	AG	Postdoc	public	STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE	Canada/Quebec
06/02/2003	AG	Postdoc	public	Plant Genomics Research Unit PostDoc	France
06/02/2003	AG	CDD	public	annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana	France
06/02/2003	AGMM	CDI	public	2 Senior Principal Investigators and 5-7 Junior Principal Investigators	Autriche
06/02/2003	AGMM	CDI	public	Poste d'annotateur(trice) SWISS-PROT	Suisse
06/02/2003	AGMM	CDI	prive	CUSTOMER SUPPORT SPECIALIST	Grande-Bretagne
06/02/2003	AGMM	CDI	prive	BIOINFORMATICS	Etats-Unis
30/01/2003	AG	CDD	public	8 postes	Allemagne
29/01/2003	MM	Postdoc	public	Postdoc in COMPUTATIONAL MEDICINAL CHEMISTRY	Grande-Bretagne
29/01/2003	MM	CDI	prive	Mathematicien - Modelisation dynamique en biologie	France
29/01/2003	AG	CDI	public	Molecular Database Indexer	Canada
15/01/2003	AG	Postdoc	public	Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques	France
15/01/2003	AG	CDI	prive	BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST	France
15/01/2003	AGMM	CDI	public	postes Maitre de Conf et Prof	France
02/01/2003	AG	CDD	public	BioInfomaticien stockage et analyse de données	France)
08/12/2002	AG	Postdoc	public	7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes	France
08/12/2002	AG	CDI	public	Maitre de conférence à Polytechnique	France
08/12/2002	AG	CDD	public	BioInformaticien	France
03/12/2002	AG	Postdoc	public	Postdoctoral position : Genomique bacterienne	France
28/10/2002	MM	Thèse	public	Database Mining en Olfaction	France
18/10/2002	AG	CDI	prive	IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER	Grande-Bretagne
14/10/2002	AGMM	ATER	public	Poste d'ATER en section 27- Annecy	France
30/09/2002	AG	ATER	public	2 1/2 postes ATER vacants	France
26/09/2002	AG	Postdoc	public	2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV	Etats-Unis
26/09/2002	AGMM	Postdoc	public	BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY RANK OPEN	Etats-Unis
23/09/2002	AGMM	ATER	public	2 1/2 postes ATER	France
16/09/2002	AG	Postdoc	prive	Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc	Grande-Bretagne
11/09/2002	MM	Postdoc	public	Computational Biology or Bioinformatics	Japon
10/09/2002	MM	Postdoc	public	Post-doctoral Computer Programmers in Structural Bioinformatics	Grande-Bretagne
03/09/2002	MM	CDD	prive	Chimie-informatique/lead informatics/CRP-VITRY	France
30/08/2002	MM	Thèse	public	Thèse en Modélisation Moléculaire	Grande-Bretagne
30/08/2002	AG	Postdoc	public	Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows	Japon
30/08/2002	AGMM	Thèse	public	Thèses en data/text mining	Suisse
30/08/2002	AGMM	Thèse	public	Ph.D. or M.Sc. Studentship in BIOINFORMATICS	Manitoba, Canada
29/08/2002	AGMM	CDI	public	IR2501 Ingénieur de Recherche - Ingénieur en biologie	France
29/08/2002	AGMM	CDI	public	IR1601 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications	France
29/08/2002	AGMM	CDI	public	IR2202 Ingénieur de Recherche - Ingénieur expert en développement d'applications	France
29/08/2002	AGMM	CDI	public	IE7301 Ingénieur d' Etudes - Ingénieur en techniques biologiques	France
12/08/2002	AGMM	Postdoc	public	Post-doct informatique pour la protéomique	France
12/08/2002	AGMM	CDD	public	Possibilité d'accueil pour un an à l'Université de Cambridge	Grande-Bretagne
07/08/2002	MM	Postdoc	public	PostDoc position in Bioinformatics	Massachussets
07/08/2002	MM	Postdoc	public	Postdoctoral Fellow	Japon
07/08/2002	MM	CDI	prive	Modélisateur moléculaire chez L'Oréal	France
07/08/2002	AG	Thèse	public	Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments	France
07/08/2002	AG	Thèse	public	Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique	France
07/08/2002	AG	Thèse	public	Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus	France
07/08/2002	AG	Thèse	public	Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.	France
07/08/2002	AG	Postdoc	public	Postdoctoral Researcher	Californie, USA
07/08/2002	AG	Postdoc	public	Full time postdoctoral research position	Ontario, Canada
07/08/2002	AG	CDI	prive	Biostatistician - Fungal Genomics Project	Québec, Canada
07/08/2002	AGMM	CDI	prive	Bioinformatics Database Administrator	Colombie-Britannique, Canada
07/08/2002	AGMM	Postdoc	prive	Industrial Post-Doc in Proteomics	Ontario, Canada
06/08/2002	MM	Thèse	public	Bourse de thèse fléchée Inter///Bio	France
06/08/2002	MM	Thèse	public	Biology PhD Student in Bioinformatics Laboratory	Massachussets, USA
06/08/2002	AG	Thèse	public	Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont	France
06/08/2002	AGMM	Thèse	public	Écoles Doctorales proposant des allocations au titre de la mobilité	France
30/07/2002	AG	CDD	public	young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines	Grande-Bretagne
26/07/2002	AG	CDD	public	CDD, URGV d'Evry	France
26/07/2002	AG	CDI	public	Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry	France
26/07/2002	AGMM	Postdoc	public	Post-doctoral position in theorical ecology	Californie, USA
26/07/2002	AGMM	Postdoc	public	Postdoc Position, Computational and Integrative Bioengineering	Washington, USA
25/07/2002	AGMM	Postdoc	public	Postdoc, Computational Biology of the Eukaryotic Cell Cycle, VT	Virginie, USA
24/07/2002	MM	Thèse	public	PhD in Bioinformatics/Computational Biochemistry	Grande-Bretagne
24/07/2002	AG	Postdoc	public	Research Assistant/Fellow	Grande-Bretagne
22/07/2002	MM	Thèse	public	These en chem-informatique / bio-informatique	France
18/07/2002	MM	Postdoc	public	Enzyme Function And Reaction Mechanisms: Computational Studies	Ohio, USA
17/07/2002	MM	Postdoc	public	Enhancing Molecular Docking Through High-Performance Computing and Advanced Visualization	France
17/07/2002	AG	Postdoc	public	Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis	Danemark
15/07/2002	AGMM	Thèse	public	Thèse avec allocation MENRT - "Sélection et caractérisation de peptides inhibiteurs de biocatalyseurs"	France
15/07/2002	AGMM	Postdoc	public	Postdoctoral Research Fellowships	Suisse
15/07/2002	AGMM	CDD	public	Bioinformatics Coordinator	Idaho, USA
15/07/2002	AGMM	???	prive	Two Bioinformatics Support Specialists	Suisse
14/06/2002	AG	CDI	public	Postdoctoral and Research Assistant Positions	Québec, Canada
14/06/2002	AG	CDI	prive	IT and Database specialist	Italie
11/06/2002	AG	Postdoc	public	Postdoctoral Positions	Iowa, USA
11/06/2002	AGMM	CDI	prive	Expert scientifique et Informatique	France
11/06/2002	AGMM	CDI	prive	Bio informaticien	France
07/06/2002	AG	CDI	prive	Bioinformatic Position at The Nestle research center	Suisse
06/06/2002	AGMM	CDD	public	Ingenieur-expert Bioinformaticien	France
05/06/2002	AG	ATER	public	ATER bio-informatique & ATER génétique moléculaire du diabète de type 2	France
04/06/2002	AGMM	CDI	public	Correspondant informatique et "Data manager"	France
11/02/2002	AG	CDI	public	Analyst for the analysis of gene expression data	Grande-Bretagne
11/02/2002	AG	Postdoc	public	Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA	Grande-Bretagne
11/02/2002	AGMM	CDI	public	Postdoctoral Research Worker - statistical genetics	Grande-Bretagne
07/02/2002	AG	Postdoc	public	role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease	Grande-Bretagne
07/02/2002	AG	CDI	public	Maître de conférences (Université Paris XI)	France
07/02/2002	AG	CDI	public	Head of Bioinformatics Applications	Grande-Bretagne
07/02/2002	AG	Postdoc	public	Position post doctorale en data mining	France
07/02/2002	AG	CDD	public	Ingénieur/Post-Doc Bioinformatique (BAC+5 Bioinformatique / 6 mois / PARIS )	France
07/02/2002	AG	CDD	public	Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression	France
07/02/2002	AG	Postdoc	public	Postdoc Positions in Bioinformatics at NCGR, New Mexico	Nouveau-Mexique, Etats-Unis
07/02/2002	AG	CDD	prive	Bioinformaticien	France
07/02/2002	AGMM	Postdoc	public	1 LECTURESHIP Department of Statistics, Mathematical and Physical Sciences Division University of Oxford	Grande-Bretagne
07/02/2002	AGMM	Postdoc	public	PhD / Postdoc Positions, European Project: HaeMOdel	?
07/02/2002	AGMM	CDI	public	Informatics Scientist (Collaborator Liaison)	Grande-Bretagne
07/02/2002	AGMM	CDI	prive	BIOINFORMATICIAN	Ontario, Canada
03/07/2001	MM	ATER	public	ATER Physico-Chimie moléculaire et cellulaire au Muséum National d'Histoire Naturelle	France
01/07/2001	MM	Postdoc	prive	ABG-6416 - Position postdoctorale en Modelisation Moleculaire	France
01/07/2001	MM	CDI	prive	Researcher – Protein structure modelling NAUTILUS BIOTECH	France
01/07/2001	AG	Postdoc	public	A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project	France
01/07/2001	AG	???	prive	ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique	France
01/07/2000	MM	CDI	prive	Software Developers à Gentech (Sophia antipolis)	France
01/07/2000	AG	Thèse	public	allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive	France
01/07/2000	AG	CDI	public	two informatics positions at the University of California, Berkeley	USA
01/07/2000	AG	CDD	public	CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg	France
01/07/2000	AG	CDI	public	Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand	France
01/07/2000	AG	CDI	public	Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY	France
01/07/2000	AG	Thèse	public	Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse	France
01/07/2000	AG	Thèse	public	PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G)	France
01/07/2000	AG	CDD	public	Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)	France
01/07/2000	AG	CDD	public	2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst	Belgique
01/07/2000	AG	CDD	public	Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5	France
01/07/2000	AG	CDD	public	CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante)	France
01/07/2000	AG	CDI	prive	Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA.	Manitoba, Canada
01/07/2000	AG	CDI	prive	Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project	USA
01/07/2000	AG	CDI	prive	Bioinformatics Applications Developer	France
01/07/2000	AG	CDD	prive	projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir	France
01/07/2000	AGMM	Thèse	public	Modélisation de l?influence de la démographie sur la cohésion des groupes et les modalités de dispersion des animaux chez les espèces à femelles philopatriques - Le cas du magot	France
01/07/2000	AGMM	Thèse	public	Appel à candidature : bourse de thèse	France

27/06/2007

[MM]

amour

Source:

officiel

Date de parution:

27/06/2007

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

chereche personne pouvons m'apprendre à faire l'amour

Contacts:

bystere@yahoo.fr

[retour]

21/11/2006

[AG]

PhD studentship in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

21/11/2006

Date limite de réponse:

01/12/2006

Lieu:

Londres (Angleterre, Grande-Bretagne)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

PhD studentship in Bioinformatics

"Bio-Communication Theory for Genetically influenced Chronic Diseases"
Most diseases are influenced by genetic factors such as Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The aim of this project is firstly to express gene mutation as a digital communication problem (Bio-Communication model) and secondly to apply communication theory to detect SNPs which are likely to predispose people to chronic diseases.

Please note that this position is only open to European Union citizens.

Closing Date: November 30th 2006

For more information:

http://cism.kingston.ac.uk/research/phd-studentship-vacancies/bio-communication-theory-for-genetically-influenced-chronic-diseases_phd-university.htm

Contacts:

j.nebel@kingston.ac.uk

[retour]

31/10/2006

[AG]

broadcasting

Source:

Date de parution:

31/10/2006

Date limite de réponse:

Lieu:

(Ontario)

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Centre de Recherche expérimental pour la réalisation de Home vidéo et de reality scientifiques en.ligne et de la télévision visé à découvrir des nouvelles stratégies d’amélioration de la vie, sélectionne des deux sexes 18 à 65 ans motivés, ambitieux et dynamiques. Les test de sélections se feront en ligne et sont programmés avec des techniques innovants. Le Centre offre formation, et possibilité de carrière. Envoyer CV de préférence avec photo a : broadcasting@themadivita.com

Contacts:

via monte di Dio

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30/06/2005

[AG]

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiology and Intracellular Parasitism unit

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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30/06/2005

[AG]

Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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30/06/2005

[AG]

Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis

Source:

Institut Pasteur-Unité d'Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05.pdf (20 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

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25/01/2005

[AGMM]

CDD Ingénieur d'Etude en biologie moléculaire des algues

Source:

Date de parution:

25/01/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Un poste CDD de 18 mois, financé par la Région Bretagne, est ouvert dans l'équipe Génétique d'Algues à la Station Biologique de Roscoff. L'équipe Génétique des Algues (6 scientifiques) a pour but de faire émerger l'algue brune filamenteuse Ectocarpus siliculosus comme modèle pour ce groupe d'organismes. Des outils génétiques, comme la transformation et des approches de RNAi sont en cours de développement et un programme de séquençage complet du génome d'Ectocarpus a été initier en collaboration avec Genoscope. Le(la) candidat(e) sélectionner travaillera sur la transformation d'Ectocarpus en utilisant une gamme d'approches comme le biolistique, le micro-injection, des liposomes et la transformation de protoplastes. Des candidates devraient avoir des compétences en biologie moléculaire; une connaissance des techniques de culture d'algues et des notions en biologie cellulaire seront appréciées. Des candidates devraient envoyer une lettre de candidature, un CV complet et les noms de deux référées a l'adresse suivante.

Pièce Jointe :

cdd_roscoff_mcock_vf.dot (56 ko)

Contacts:

Pour plus de détails, contact J. Mark Cock, Génétique des Algues, UMR 7139 CNRS-Goëmar-UPMC Végétaux Marins et Biomolécules, Station Biologique, Place Georges Teissier, BP74, 29682 Roscoff Cedex, France
Email: cock@sb-roscoff.fr; website: http://www.sb-roscoff.fr/UMR7139/en/genetics.html

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29/11/2004

[AG]

Source:

Date de parution:

29/11/2004

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Contacts:

13/12/2003

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

13/12/2003

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

06/11/2003

Computational Chemist

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2218

Date de parution:

06/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York State (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A client of ours is seeking a Sr Computational Chemist.

QUALIFICATIONS:
The candidate should be willing to provide molecular modeling support for discovery projects by applying state-of-the-art computational techniques, with the goal of identifying and optimizing novel drug leads.

3 or more years industrial experience in de-novo ligand design,
pharmacophore analyses, ligand docking, library design and analysis, homology modeling and protein-ligand simulations is REQUIRED.

Additional requirements include a Ph.D. in Chemistry, Biochemistry, Biophysics, or a related discipline, and excellent communication skills.

Contacts:

HOW TO APPLY:
If you are interested in pursuing this opportunity, please forward your CV, salary requirement, relocation considerations and references to resumes@workwondersstaffing.net. It is important to use the position title as the subject of your email to allow your resume to reach the appropriate recruiter as quickly as possible. If you feel you are not qualified or are not interested in the opportunity, do you know anyone who
might be a good fit?

[Please reference Bioinformatics.Org when responding to this announcement.]

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06/11/2003

[AG]

Research Fellow/Assistant

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2233

Date de parution:

06/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

The Robert Gordon University, Aberdeen School of Computing
Research Fellow/Assistant (Ref T229) (2.5 Years)

Efficient Biological Grammar Acquisition

DETAILS:
Applications are invited for the position of Research Fellow/Assistant on an EPSRC funded project entitled "Efficient Biological Grammar Acquisition". The project will be based in the Computing Technologies Centre (a recent 1.5 million pounds, purpose-designed SRIF-funded research centre) in the School of Computing at the Robert Gordon University, Aberdeen. The industrial collaborator on the project will be GlaxoSmithKline, one of the world's leading research-based pharmaceutical and healthcare companies.

Linguistic methods have provided some interesting results in the
recognition of complex biological signals. However the hand
development of grammars is difficult and, because it requires human expertise, expensive. Thus, given the enormous volume of data arising from genome projects, there is a need to automate the acquisition of grammars from sets of biological sequences. As the researcher on this project, you will develop an efficient method of acquiring such grammars using Inductive Logic Programming (ILP). Your method will use efficient techniques for discovering non-terminals which are potentially pertinent to the subsequent induction of a biological grammar and a parser which increases the speed at which biological
grammars may be acquired by an ILP system.

QUALIFICATIONS:
You should have a good honours degree in Computing or a cognate
discipline and some experience of bioinformatics research; or you may have a background in the life sciences and have an advanced MSc in Computing or a cognate discipline. Preferably you will have a PhD in Machine Learning or Bioinformatics or equivalent experience, as demonstrated by a good publication record. Experience of ILP, Prolog or Parsers would be an advantage. A good communicator and programmer, you will bring an enthusiastic and organised approach to this challenging position.

Informal enquiries to: Dr Chris Bryant Tel: +44 (0)1224 262475 E-mail: chb@comp.rgu.ac.uk
Starting Salary: 18,265 - 27,339 GBP

Contacts:

HOW TO APPLY:
Further particulars and an application form are available from: Human Resources Department, The Robert Gordon University, Schoolhill, Aberdeen, AB10 1FR. www.rgujobs.ac.uk Tel: +44 (0)1224 262085 E-mail: staffrec@rgu.ac.uk

05/11/2003

Source:

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

I am assisting to recruit Molecular Modeler for a client's Drug Discovery Applications Group in New York City. Here is more information:

This client is a technology leader specializing in computational methods for drug discovery and development. Benefits include medical, dental, 401(k), flexible spending account, 3+ weeks vacation, stock options, and tuition reimbursement. Visa sponsorship and/or relocation are available.

The successful candidate will become part of a multidisciplinary drug discovery team working on both in-house efforts to improve and apply drug discovery methodologies and on collaborative projects with pharmaceutical/biotechnology partners.

JOB DESCRIPTION:
Actively participate in Drug Discovery Applications Group projects
Apply drug discovery software and perform analysis of the results
Effectively communicate results to other members of the Group
Work closely with the Development Team to test and improve Drug Discovery technologies

QUALIFICATIONS:
Ph.D. in computational chemistry, organic chemistry, or biochemistry
Computational experience in at least 1 of the following areas: molecular modeling, structure-based drug design, virtual ligand screening, computationally-driven lead optimization, ligand-based design, or homology modeling
Excellent verbal and written communication skills
Ability to work independently

SKILLS:
Programming skills: Perl script writing, in particular
Experience with chemical databases

Contacts:

HOW TO APPLY:
For consideration, please send CV including publications, thesis topic, and advisor to resumes@workwondersstaffing.net

This client is an Equal Opportunity Employer.

[Please reference Bioinformatiocs.Org when replying to this announcement.]

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05/11/2003

[AG]

Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics

Source:

ABGf-3355

Date de parution:

22/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 22/12/2003

Position in Biostatistics and Bioinformatics
Field : Microarray data and complex genetic disease analysis

Full time POSITION for 2 years starting November, 2003 in the Department of Human Genetics - Genetics of Multifactorial Diseases – Director of Unit : Professor Philippe Froguel

Project Description :
Analysis of Affymetrix microarray data from transcriptome experiments using animal models and genetic data from human polymorphisms typed in both cohort and family studies. This will be carried out in the context of exploration of the
molecular mechanisms underlying pancreatic beta-cell dysfunction and associated insulin-resistance.

Activities:
* Select and set up appropriate statistical methods for analyzing:
o Microarray data, including normalization, selection of significant expression variation, clustering, GO annotation
o Genetic data, including linkage analysis, association analysis, linkage disequilibrium mapping and haplotype construction
* Manage data (acquisition, validation, quality control, organization)
* Analyze data, interpret and present results
* Adapt or develop new statistical tools when necessary
* Optimize usage of such tools and set up standard analysis procedures
* Data acquisition from public databases and other online resources

Skills :
* Knowledge of statistical methods
* Experience of statistical software such as SPSS, S+ or R
* Strong experience in microarray data analysis
* Knowledge of public databases and other online biological resources

Experience :
Masters Degree (DESS) or PhD, and, ideally, practical experience of microarray experiments.

Training in population genetics can be provided by the lab

Application Deadline :
Applications will be reviewed in October 2003 until a suitable candidate is identified. Interviews may begin in late October

Contacts:

Interested applicants should submit a letter of intent, a summary of previous research experience and a curriculum vitae, and reference to :
Sophie Gallina : Sophie.Gallina@mail-good.pasteur-lille.fr

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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05/11/2003

[AG]

Senior Bioinformatics Positon at the FMI

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2206

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bale (Suisse)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

BACKGROUND:
Tired of the poor funding in academia or the lack of freedom in a company? Want your own office?

We are looking for an enthusiastic person with several years experience in bioinformatics. Extensive experience in sequence analysis, data mining/data integration and genome analysis is required. A good knowledge of UNIX, database programming and shell scripting is a plus. Candidates with a PhD are encouraged to apply but a masters together with several years of practical experience will also be considered. In addition to their support and development commitments the successful candidate will be encouraged to attend international bioinformatics conferences and to have the initiative to develop their own research projects in the field of bioinformatics.

The FMI (www.fmi.ch), which is funded by the Novartis Research Foundation, is an International Institute with over 280 people of which approximately are 150 postdoctoral fellows and graduate students committed to basic research in areas as diverse as cellular growth control, epigenetic gene
regulation and neurobiology. The FMI offers highly competitive academic salaries and it provides state-of-the-art core technologies, transgenic mouse facilities, computing, genomice, and proteomics services.

The FMI is located in Basel, a city offering an outstanding scientific environment in the center of Europe.

JOB DESCRIPTION:
* Help and support: data mining, sequence comparisons, sequence alignment, BLASTs, individual projects with groups, etc.

* Teaching: Teaching of classes in bioinformatics

* Development: Evaluation of new tools and software, development of bioinformatics tools. Making tools accessible to users at (on www, central servers, ...)

* Databases: Maintenance of existing in-house databases (such as genbank,SWISS-PROT, etc.)

* Interface and collaborate with outside institutions: Interact with commercial and academic bioinformaticians in developing and sharing bioinformatic resources.

Contacts:

HOW TO APPLY:
Please submit your resume or questions to dean.flanders@fmi.ch.

http://www.fmi.ch

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05/11/2003

[AG]

Bioinformaticien (poste ATER)

Source:

ABGf-3363

Date de parution:

27/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 27/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 27/12/2003

Un poste ATER en Bioinformatique est disponible immediatement a l’Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles, rattache au laboratoire CNRS de Neurobiologie et Diversite Cellulaire (UMR 7637) sous la responsabilite du Pr.J.
Rossier, Professeur de Biologie en 1ere annee.
Les candidats seront titulaires d’une these ou d’une experience equivalente.
L’ATER recrute(e) sera responsable de l'enseignement (TP, 3 fois 15H) en bioinformatique (analyse de genomes, data mining).
Il/elle assistera le professeur dans la preparation des cours et
effectuera le suivi des stages des etudiants.
Son projet de recherche sera dans le domaine de l’analyse du transcriptome (regulation de l’expression des genes dans la Trisomie 21 et le retard mental).
Il/elle aura pour mission de developper et de maintenir une plate forme informatique, en collaboration avec les plate formes publiques existantes.
Remuneration brute mensuelle : environ 1900 euros.

Contacts:

Envoyer un cv au Prof . Jean Rossier : jean.rossier@espci.fr
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/10/2003

[AG]

Bioinformatics Research Scientist

Source:

ABG-8094

Date de parution:

08/10/2003

Date limite de réponse:

07/12/2003

Lieu:

Johnston (Iowa) (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Position Purpose :
To implement, validate, and customize statistical methods for analyzing functional genomic experiments.

Duties/Responsibilities :
This person will be responsible for identifying, implementing, and validating statistical and data mining methods for designing and analyzing gene expression profiling experiments. This person should also be capable of customizing or extending previously-published methods when needed. This person will lead an effort to integrate gene expression results into biological networks. In addition to these roles, the successful candidate will be able to contribute to other bioinformatics projects requiring statistical analysis.

Educational Qualifications Desired :
Ph.D. in Statistics or closely-related field; post-doctoral experience is desirable.

Competencies and Experience Desired :
The ideal candidate will have a proven track record of application and/or development of innovating data mining algorithms to the analysis of large-scale expression profile data.

Rather than specializing in one particular technique, the candidate will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. He/She will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the analysis of gene expression data.

Excellent computational skills with the ability to work in a UNIX-based environment is expected.

Familiarity with statistical software is expected and a strong preference will be given to those applicants with expertise in either Splus or R.

This position requires a self-motivated scientist who works well in a team environment, communicates clearly and effectively, and creatively and independently solves problems.

Reports To :
Computational Biologist

Department :
Information Management - Bioinformatics and Exploratory Research

Contacts:

There are two ways to submit a resume for this position :

You must reference the job code PHI/QA323/WCP in your cover letter or the subject line of your email.

Pioneer employees must apply through PHIweb.

- Send your resume and cover letter in an email message (Attachments should be in Word, WordPerfect, Lotus, or ASCII format.) to : apply@pioneerjobs.com

- Mail your scannable resume and cover letter to the following address :
Resume Processing Center
Pioneer Hi-Bred International, Inc.
400 Locust Street, Suite 700
P.O. Box 14454
Des Moines, IA 50306-3454

Resumes will be accepted until the position is filled.

For general inquiries regarding employment, contact jobs@pioneer.com or call the Pioneer Hi-Bred Employment Job Line number at 515-270-4000 or 1-800-247-6803 ext. 4000.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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21/10/2003

[AGMM]

BIOINFORMATICS Scientist

Source:

Date de parution:

21/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Singapore (Singapour)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Our client is the national flagship initiative in the genomic sciences for Singapore as the country seeks to be an international center for the biomedical sciences and its relevant industrial research and development. In this research institute, the major technical platforms of high throughput
sequencing, genotyping, cDNA library production, bioinformatics, proteomics and expression array technologies have been established and programs in stem cell biology, molecular pharmacology, cancer biology, comparative genomics,
computational biology and population genetics have begun.

BIOINFORMATICS SCIENTIST
Senior level Bioinformatics Scientists are needed who will identify, design, develop and apply advanced computational analyses to biological research throughout the institute. Successful candidates will work closely with investigators in the Biological Investigations, Disease Gene Discovery, Gene
Expression Microarrays, and Population Genetics groups. Outstanding candidates will have a Ph.D. and extensive training in bioinformatics, computational biology, mathematical sciences, or a related field. A research background in molecular or cell biology is advantageous. You must be able to
work in a fast-paced and dynamic environment. Previous experience in managing bioinformatics scientists and projects is required. We are seeking candidates with expertise in one or more of the following areas:

a.. Protein database analysis
b.. Mathematical modelling of protein and gene functions
c.. Statistical analysis and modelling applied to genomic data
d.. Advanced transcript sequence analysis

Contacts:

Interested candidates, please forward your detailed resume in MS Word format to: search@scientecsearch.com

ScienTec Search (www.scientecpersonnel.com)
No. 5 Shenton Way
#37-02 UIC Building
Singapore 068808

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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09/10/2003

[AG]

2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)

Source:

ABGe-1249

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

18/10/2003

Lieu:

Laval (Canada/Quebec)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 19/09/2003
Date de fin de diffusion prevue : 18/10/2003

Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique/bio-statistique sont presentement a combler, a l'UNIVERSITE LAVAL (Quebec) au sein d'un projet multi institutionnel, finance par Genome Quebec pour une periode de deux ans. Le travail vise le developpement de methodes d'analyse pertinente a l'expression de genes a grande echelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration etroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des biostatisticiens et des informaticiens.

Position 1.Traitement des donnees de microarray et analyse de designs experimentaux complexes.
Des developpements importants ont ete recemment acquis en analyse statistique des microarrays, toutefois ces progres ont ete principalement appliques a des comparaisons simples. Deux themes principaux seront abordes dans cette partie du projet : la correction de biais dans l'analyse des donnees quantitatives de microarrays et les methodes statistiques pour l'analyse dispositif experimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le developpement de modele pour quantifier le biais experimental ; l'evaluation et l'amelioration des procedures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l'analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l'evaluation de la pertinence et des limites de differentes methodes statistiques ; la modification novatrice des methodes existantes pour les rendre mieux adaptees aux donnees obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d'un projet de genomique fonctionnel situe dans un pavillon de recherche en sciences de la vie.

Qualifications : Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la sante, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise developpee en statistiques. Une comprehension des principes de l'expression des genes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l'experience dans les domaines suivants : connaissance de langages de programmation, manipulation de grands fichiers de donnees, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacites de communications en Anglais ou en Francais sont essentielles.

Position 2. Integration des donnees d'expressions geniques
Le projet consiste a developper des techniques d'analyses concernant deux types d'integration: 1-Integration de donnees provenant de differentes techniques de mesures d'expression genique; 2- Integration des fonctions des genes a leurs profils d'expressions. Ce projet consiste d'abord a integrer les donnees produites par les trois differentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression) et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiees sur les fonctions des genes ainsi que leurs roles dans les differents sentiers, metaboliques ou de signalisations, devront etre integrees aux profils d'expressions geniques.

Qualifications : Un Ph.D en biologie moleculaire ou fonctionnelle ou equivalent avec une tres bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne experience en programmation, en bases de donnees relationnelles et en extraction d'informations des bases de donnees publiques.

Contacts:

Pour postuler, soumettre :
- une lettre de presentation
- un curriculum vitae a jour
- IMPORTANT : les noms et coordonnees de trois personnes references

- Transmettre par courriel en un seul document attache (format Word ou PDF) a genome.foret@rsvs.ulaval.ca
- Le nom du candidat doit etre donne au titre du fichier, ou l'inserer dans le texte du courriel.
- Inscrire le numero de position dans la ligne sujet du message.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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09/10/2003

[AG]

BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER

Source:

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Bioinformatics Software Engineer opening

At Perlegen Sciences, we conduct genetics research and develop products that impact and improve people's lives. Established in March 2001, we are a well-funded, pre-IPO company aggressively developing our core competencies in research, genome scanning, bioinformatics, and other key areas of our business. We invite you to consider our team as we apply this technology to bring focus to biological research and to accelerate the discovery of drugs and diagnostics.

We currently have an excellent opportunity for a Bioinformatics Software Engineer to aid in the analysis and preparation of sequence and primers, as well as to assist colleagues in issues related to these design elements. We'll rely on you to analyze and design genetic sequence and primers for our association studies, place Perlegen's data in new contexts, make resulting information easily accessible, and quickly respond to questions about Perlegen's SNPs and assays in relation to the human genome. You will also examine past primer performance and make
recommendations for design process improvements. To qualify, you must be a team player who is both meticulous and insightful. You should have a BS in CS/EE or equivalent with a strong genetics/molecular biology background and/or a BS in Biology with a very strong computational background. Excellent Perl, SQL, analytical and communication skills, the ability to work in both Windows and Linux environments, proven ability to find and refine relationships between and within data-sets,
and proficiency manipulating and dissecting large data collections are essential. Two or more years of bioinformatics development experience preferred. Strong PL/SQL, Access and VB skills as well as competency with statistics would be a plus.

Contacts:

Email your resume, indicating Job Code GN78, to
perlegen_HR@perlegen.com; mail, again indicating Job Code GN78, to Perlegen Sciences, 2021 Stierlin Court, Mountain View, CA 94043; or fax to 650-625-4580. For more information on this position and other opportunities, visit our website at www.perlegen.com. EOE.

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09/10/2003

[AG]

motif discovery algorithm/statistics

Source:

BioInfo

Date de parution:

09/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

We have an immediate open position for a postdoc working on motif discovery algorithm/statistics. If you or someone you know are interested, please contact me asap.

Contacts:

Michael Q. Zhang, Ph.D.
Professor
Cold Spring Harbor Lab
1 Bungtown Road
Cold Spring Harbor, NY 11724.
USA
Tel:1-516-367-8393
Fax:1-516-367-8461
http://www.cshl.edu/mzhanglab/
Secretary: Ms. Carol Marcincuk (1-516-367-8387, marcincu@cshl.edu)

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05/10/2003

[AGMM]

Post-doc position in Computational Biology and Bioiformatics

Source:

dmanet

Date de parution:

05/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Los Angeles (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A post-doctoral research associate position in computational
biology/bioinformatics is available immediately within the Computational Biology program at the University of Southern California (USC), Los Angeles.

Topics of research fall under computational functional genomics. In particular:
- Studying the structure, function, and evolution of cellular interaction/regulatory networks
- Developing computational and statistical algorithms to analyze microarray expression data
- Predicting gene/protein function through data integration

Candidate Qualification:
- Recent Ph.D. in biological science, computer science, or statistics
- Research experiences in bioinformatics or related fields
- Good programming skill
- Experience in machine learning or pattern recognition is a plus

More information about the interdisciplinary program in
computational biology at USC can be found at http://www-hto.usc.edu/

Contacts:

Please send CV with contact addresses of 2 references to:

Xianghong Jasmine Zhou, Assistant Professor
Program in Molecular and Computational Biology
Department of Biological Sciences, DRB291
University of Southern California
Los Angeles, CA 90089-1340
Email: xjzhou@usc.edu (preferred)
Phone:(213) 740 7055
Fax:(213) 740 2437
http://www-hto.usc.edu/~xjzhou

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19/09/2003

[AGMM]

BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868)

Source:

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Vers-chez-les-Blanc (Canada/Quebec)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

LOCATION: Vers-chez-les-Blanc

OVERALL OBJECTIVE: Drive innovation to achieve business impact by managing projects in his/her Group and delivering high quality end-products.

MAIN RESPONSIBILITIES AND CHALLENGES:

. Provide leadership, focus and motivational support to his/her group.
. Implement NRC and Departmental strategy and Departmental policies within the Group.
. Collaborate with other Group Managers and Project Leaders to define bioinformatic needs and prioritize, launch, terminate projects/activities in his/her portfolio accordingly.
. Lead the Bioinformatics Group to be innovative and proactive to anticipate needs of NRC researchers.
. Manage Group members, including objectives setting and appraisal, to ensure timely delivery of high quality results.
. Ensure quality and documentation of bioinformatics work and training of NRC users.
. Interact and communicate effectively with business and scientific partners (internally and externally) and provide technical assistance as fitted.
. Manage allocated budgets (investments, external contracts) Recruit, integrate, coach and develop people.

REPORTS TO: NRC Department head

EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED: University degree (PhD or equivalent) in bioinformatics. Basic knowledge of human biology or physiology and min of 5 years of industrial experience managing a Bioinformatic Group.

LANGUAGE: Verbal and written communication skills in English.

DATE NEEDED: ASAP

Contacts:

CONTACT: Please attach a CV with names of three references (postal and e-mail addresses), on http://www.careers.nestle.com website. (Ref.868)

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18/09/2003

[AG]

three PhD positions in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

04/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Callaghan (Australie)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

1431 (Evolutionary Algorithms and Optimization Methods
for large-scale problems in Bioinformatics),

1432 (Algorithmic approaches for problems in Proteomics,
Molecular Modelling and Drug Design)

1433 (Novel Statistical and Optimization Methods for the Life Sciences).

These numbers correspond to the entries in the Jason Postgraduate
Scholarship Database for Australia:

http://www.jason.unimelb.edu.au

where the complete information can be retrieved. Please follow the link and the procedures described in the Jason
database.

In addition, the University offers other Scholarships

http://www.newcastle.edu.au/study/scholarships/index.html

which may relate to other Bioinformatics ongoing projects at Newcastle.
These other scholarships may suit International Students and have a closer deadline in some cases.

More information about the Newcastle
Bioinformatics Initiative is available from the web site at:

http://www.cs.newcastle.edu.au/~nbi

As you can probably see from the scholarships announcements,
we are interested in people who have already some expertise
in algorithmic engineering and in solving large optimization
problems with combinatorial optimization methods, metaheuristics and exact techniques.

Contacts:

Dr. Pablo Moscato
Newcastle Bioinformatics Initiative - Director
Postgraduate Director for Computer Science
School of Electrical Engineering and Computer Science
The University of Newcastle, Callaghan, 2308, NSW
AUSTRALIA
moscato@cs.newcastle.edu.au
Phone : +61 2 4921 6056
Fax: +61-2-4921-6929

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18/09/2003

[AG]

Post-doctoral position in microarray data analysis

Source:

Date de parution:

18/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bâle (Suisse)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

We seek a highly motivated and enthusiastic scientist who is interested in cutting-edge genomics and bioinformatics approaches that include large-scale expression profiling and genome wide identification of protein-DNA interactions in the field of meiosis, gametogenesis and germline development. Our lab operates a high density oligonucleotide microarray platform that enables researchers interested in statistical and clustering aspects of microarray data analysis to work with very
large and very well documented data sets.

We are a member of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), a
prestigious association of laboratories that work in the field of
computational biology. The Biozentrum and the SIB provide an excellent wet lab and IT infrastructure, full support for the recently established Department of Bioinformatics and a highly stimulating, international academic environment.

Candidates should be familiar with statistics of microarray data
analysis, statistical languages and environments (R, S+), programming languages (PHP, Perl), database management systems (Oracle, MySQL), and be comfortable in a Linux development environment.

Contacts:

Please send your CV and the names of two references to
Prof. Michael Primig
Department of Bioinformatics
Biozentrum, University of Basel &
the Swiss Institute of Bioinformatics
Klingelbergstrasse 50/70
CH-4056 Basel / Switzerland

Phone Office: +41 61 267 20 98
Phone IT-Office: +41 61 267 15 78
Fax: +41 61 267 33 98
http://www.bioz.unibas.ch/primig
http://www.isb-sib.ch
http://www.bioz.unibas.ch/corelab
http://www.germonline.org

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18/09/2003

[AGMM]

plusieurs postes de Bioinformatique

Source:

Date de parution:

18/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lausanne/Geneve/Bale (Suisse)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Pour info, plusieurs postes sont a pourvoir a l'institut Suisse de Bioinformatique:
* Annotator HAMAP-Swiss-Prot
* Post-doctoral position available
* Code Optimization Scientist
* Genomics Scientist
* Proteomics Scientist

Contacts:

Toutes informations utiles a l'url suivante:
http://www.isb-sib.ch/infos/careers.htm

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09/09/2003

[MM]

BIOMEDICAL INFORMATICS - Research Scientist

Source:

BioJobs

Date de parution:

09/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

(Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Responsibilities: Join GE's research in molecular imaging as a
Bioinformatics Scientist, working with world-class experts in imaging physics, molecular biology, and medicinal chemistry, developing the next generation of molecular diagnostics. We need experts in bioinformatics analysis of protein pathways and gene expression to develop tools and techniques for discovering molecular imaging targets and apply these techniques to the study of specific diseases. Projects will involve developing platform technologies for integrating many disparate types of
public and proprietary genomic and proteomic data along with analysis methods to elucidate pathways and identify molecular imaging targets.
Collaborate with GE’s luminary academic and commercial scientific
partners both to develop next generation diagnostic products and to publish research results.
Requirements: Candidates need to have either a PhD in bioinformatics or computational biology, or degrees in both biological and computational sciences, with one being at the PhD level.
·Knowledge of molecular disease mechanisms and pathways.
·Knowledge of genomics and analysis of DNA microarray data.
·Mathematical and computer science background.
·Published work in the bioinformatics field.
·Excellent communication skills (verbal, written, presentation).
·Ability to work effectively in teams.
Demonstrated experience in one or more of the following areas would also be highly desirable:
·Experience in building computational models of biological phenomena.
·Experience in statistical analysis of biological data.
·Experience with microarray tools and algorithms, knowledgeable about their limitations and research areas. ·Experience building
bioinformatics databases and software tools.
Desired: ·Experience in pharmaceutical or biotech industry.
·Experience as Principal Investigator on funded research grants.
·Leadership / coordination ability.

We offer a competitive salary, outstanding benefits package and the professional advantages of an environment that supports your development and recognizes your achievements.

Contacts:

To apply to this position, please click on this link.
https://www.research.ge.com/eHire
Please enter GECRD/319910/WB2273 in the job reference code field.

An Equal Opportunity Employer.

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03/09/2003

[AG]

RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS

Source:

ABGe-1229

Date de parution:

26/08/2003

Date limite de réponse:

26/09/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

DTI-FUNDED “BEACON” PROJECT ON BAYESIAN MODELLING OF METABOLIC AND TOXIC PROCESSES

This is an exciting opportunity for an ambitious and highly computer literate Research Associate with a PhD in chemistry, biochemistry, chemometrics, bioinformatics or cognate subject who is looking to develop their career in the field of metabonomics and whole organism metabolic modelling. The post holder will be part of a post-doctoral team working to develop novel Bayesian methods to model quantitative metabolic data generated by NMR spectroscopy and mass spectrometry of biofluids and be under the supervision of Prof. Jeremy Nicholson, Head of the Biological Chemistry Section (in association with Profs. Steve Muggleton and Mike Sternberg in Computer Science).
In particular the post-holder will be involved in the multivariate statistical analysis of spectroscopic data. A knowledge of NMR spectroscopy and/or mass spectrometry would be
advantageous, but is not essential.

The position is available immediately for a period of 2.5 years. Salary will be on the RA1A scale: £18,265 - £27,390 per annum plus £2,134 London Allowance.

Contacts:

Further details and an application form can be obtained from :
- Nahid ASHBY (phone +44 20 7594 3225)
email n.ashby@imperial.ac.uk
- Dr. Marc-Emmanuel DUMAS, m.dumas@imperial.ac.uk

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03/09/2003

[AGMM]

Developpeur Web pour le site La main a la pate

Source:

ABGf-3227

Date de parution:

26/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 26/08/2003
Date de fin de diffusion prevue : 26/09/2003

Description du poste :
La main a la pate cherche un developpeur Web avec une bonne experience professionnelle. Cette personne aura en charge le developpement du nouveau site Internet de La main a la pate, ainsi que des applications d’administration et de gestion de ce site.
Une tres bonne maitrise des langages et technologies du Web dynamique (XML, PHP/MySQL, JAVA, PERL) ainsi que des notions en UML seront indispensables. Les systemes Unix et Windows 2000 serveur seront egalement connus.

Contrat :
Duree : 1 an
Salaire mensuel net : 2000 euros
Lieu : Montrouge (92)
Date de debut : septembre - octobre 2003

La main a la pate :
Creee en 1996 a l’initiative de Georges Charpak, prix Nobel de physique et membre de l’Academie des sciences, La main a la pate est une dynamique de renovation de l’enseignement des sciences a l’ecole primaire. Cette renovation vise a promouvoir une demarche d'investigation scientifique en articulant apprentissages scientifiques, maitrise des langages et
education a la citoyennete.
La main a la pate a mis en place un site Internet
(http://www.inrp.fr/lamap) sous la responsabilite de l'Academie des sciences et de l'Institut National de Recherche Pedagogique. Ce site a ete concu comme un outil d’autoformation pour les enseignants du primaire : ces derniers peuvent y trouver des ressources pedagogiques et scientifiques, en proposer, faire evoluer le corpus existant, faire appel a un scientifique
ou un formateur pour l’aider a mettre en oeuvre des activites dans sa classe, debattre de questions relatives a l’enseignement des sciences, contacter des collegues de sa region, participer a des projets scientifiques avec d’autres classes…
L’utilisation grandissante (140 000 visiteurs par mois) et reconnue (premier prix europeen e-learning en decembre 2001) du site temoigne de l'importance de cet outil pour la communaute enseignante. Il est aujourd'hui necessaire de faire evoluer le site Internet La main a la pate vers une plus grande dynamicite, tant sur l’acces aux ressources que pour la mise en place d’outils de production, d’echanges et d’administration.

Contacts:

Lettre + CV a Monsieur David Wilgenbus,
david.wilgenbus@inrp.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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02/09/2003

[AG]

Bioinformaticien confirmé

Source:

Date de parution:

24/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : Drh-588
Date de publication : 24 juillet 2003
Date de clôture : 30 septembre 2003

Au sein d'un laboratoire de recherche en génétique et génomique
végétales travaillant avec des équipes de renommée mondiale, vous
participerez à un enjeu stratégique de premier plan: approfondir la connaissance, la compréhension et la représentation du génome des plantes cultivées tropicales. Bio-informaticien, vous êtes attiré par ce défi et souhaitez travailler dans l'environnement scientifique de la Génopole de Montpellier

Descriptif du poste :
Le poste s'intègre dans l'équipe de bio-informatique d'une unité
d'analyse des polymorphismes chez les plantes cultivées tropicales et méditerranéennes. En partenariat avec différentes équipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amélioration des méthodes pour l'analyse bio-informatique des données issues des travaux de séquençage de grands fragments chez les Monocotylédones et de génotypage chez différentes espèces.
Il contribuera à l'intégration de différentes méthodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation comparative) et réalisera les développements bio-informatiques nécessaires. Il élaborera les approches bio-informatiques adaptées aux études d'association et de
déséquilibre de liaison chez des espèces à biologie variée.

Profil souhaité :
Doctorat en bioinformatique, avec une expérience significative dans le domaine de l'analyse de séquences. Une expérience post-doctorale serait appréciée.
Bonne connaissance des outils d'annotation (détection de motifs,
logiciels de prédiction de gènes...).
Maîtrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc.
Connaissance des modules informatiques spécifiques de la
bio-informatique : Bioperl, BioJava,BioPipeline, etc...
Expérience de la modélisation.
Bonne culture générale en génétique et biologie moléculaire.
Aptitude à la communication interdisciplinaire.
Esprit d'équipe, bon relationnel

Date de prise de fonction :
Dés que possible

Contacts:

Renseignements sur le poste :
Brigitte Courtois 04.67.61.56.94
Avenue Agropolis
34398 Montpellier Cedex 5 France
Tel: (33) 04 67 61 56 94
Fax : (33) 4 67 61 56 05
e-mail: brigitte.courtois@cirad.fr

ou Manuel Ruiz 04.67.61.56.31

[ Contacts ]
Cirad: http://www.cirad.fr
Cirad-Drh/Emploi
TA 174/04
34398 Montpellier Cedex 5, France
emploi@cirad.fr

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11/08/2003

[AG]

RESEARCH POSITION

Source:

Date de parution:

02/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Montreal (Canada/Quebec)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Comparative and Evolutionary Genomics/Bioinformatics.
Faculty Position, Canadian Institute for Advanced Research

The Department of Biochemistry at the Faculty of Medicine
invites applicants for a faculty position at the Assistant Research Professor level in the areas of Comparative and Evolutionary Genomics, and Bioinformatics. This position implies a prestigious Scholar appointment in the Evolutionary Biology Program of the Canadian Institute for Advanced Research (CIAR). The successful candidate will have demonstrated excellence in the field of bio- informatics and/or genomics. Preference will be given to candidates with experience in evolutionary biology. He or she is expected to establish an innovative research program, and participate in teaching at both the undergraduate and graduate levels. Salary and startup funds will be commensurable with qualifications and experience, and successful candidates will be eligible for considerable infrastructural support through the Canada Foundation for Innovation.

Contacts:

jobs@bch.umontreal.ca

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03/08/2003

[MM]

Postdoctoral Fellowship

Source:

Date de parution:

04/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

(Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Postdoctoral Fellowship under the direction of Dr. Ruth Nussinov, in the Laboratory of Experimental and Computation Biology, to conduct research on protein folding and binding. Will involve computational investigation of structural and functional genomics, and the inter-relationship between protein structure and function and probe the coupling between protein folding and function, and protein binding mechanisms. These
studies are currently at the forefront of structural bioinformatics, with direct implications for protein and for drug design. Will work with novel, state-of-the art computational tools toward these goals.

Ph.D. degree and strong background in molecular calculations; extensive knowledge in protein structures and in molecular simulations; a strong background in biophysics, computational chemistry or structural biology required.

SAIC-Frederick, Inc., a subsidiary of SAIC, is the Operations and
Technical Support (OTS) Contractor for the National Cancer Institute at Frederick (NCI-Frederick) a federally funded research and development center. The mission of SAIC-Frederick, Inc. is to provide scientific, technical, management, administrative, and logistical support to National Institutes of Health (NIH) intramural laboratory research and development related to the causes of and cures for cancer and AIDS.
Intramural research is that conducted by Government scientists operating within various units of NIH, principally the National Cancer Institute (NCI), and the largest institute of NIH. We also conduct basic and applied research in cancer and AIDS; operate and manage the Advanced Biomedical Computing Center (ABCC), the world’s only supercomputer devoted exclusively to biomedical research; and conduct large drug and natural product screening programs.
Excellent salary and benefits accompany our positions, including the opportunity to become an employee-owner in the nation’s largest employee owned research and engineering company.

Job Information
Position Type: Post-Doctoral Research Fellowships
Reference (Job ID number): KMB058452
Start Date: ASAP
Duration: Full Time
Status: open

Contacts:

SAIC-Frederick, Inc.
Basic Research Program
D. Higdon
higdon@ncifcrf.gov
http://saic.ncifcrf.gov
How To Apply: email CV or apply online at http://saic.ncifcrf.gov;
or www.saic.com

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03/08/2003

[AG]

Chef de projet bioinformatique au Genoscope

Source:

ABG-7916

Date de parution:

02/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 02/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 02/09/2003

Le Genoscope – Centre National de Sequencage recrute un Chef de Projet Bioinformatique, responsable de sa plate-forme d'annotation.

Le Genoscope, composante du GIP CNRG (Consortium National de Recherche en Genomique), mene des projets de genomique a grande echelle en collaboration avec des laboratoires experts de la biologie des organismes concernes, et developpe ses propres thematiques de recherche dans le cadre de l’UMR Genoscope/CNRS/Universite d’Evry « Structure et Evolution des Genomes ».

L’equipe bioinformatique est fortement implique dans l’annotation et l’analyse des genomes sequences au Genoscope, ainsi que dans le developpement de methodes et outils bioinformatiques lies aux differents programmes de recherche. Elle se compose a l’heure actuelle de 9 chercheurs et ingenieurs, qui travaillent en collaboration etroite avec les
biologistes du Centre. L’equipe bioinformatique collabore egalement de pres avec le service Informatique (15 personnes), charge de l’informatique liee a la production de sequences, des processus de traitements automatises, et de la gestion de l’infrastructure materielle et logicielle.
Le Genoscope dispose d'un systeme de calcul a haute performance, constitue principalement d'un cluster Compaq Alpha a 8 membres et 40 processeurs, et d’un espace de stockage.de 10 To.

Le candidat prendra la responsabilite de l’evolution de la plate-forme logicielle d’annotation du Genoscope : expression des besoins, specification fonctionnelle, conception de l’architecture, integration de composants logiciels existants et developpements nouveaux.
Il sera seconde dans sa mission par une petite equipe de 2 bioinformaticiens.

Competences requises :

Au minimum 4 ans d'experience
Bonne connaissance et experience de developpement sous Perl et de C++ ou Java
Experience de la gestion d’un projet de developpement consequent
Excellente maitrise de l’environnement Unix dans un contexte de calcul scientifique a haute performance (calcul distribue, grands ensembles de donnees)

Competences appreciees :

Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (notamment lies a analyse de sequences) Bonne connaissance des SGBD relationnels (modelisation, administration)
Anglais courant

Formation souhaitee : ecole d’ingenieur generaliste, ecole d’informatique, ou 3eme cycle

Date de prise de fonction : Septembre 2003

Contacts:

Candidature a adresser par courrier electronique a Vincent Schachter (vs@genoscope.cns.fr)

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003

[AG]

Bourse de These en Microbiologie

Source:

ABGt-3122

Date de parution:

16/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 16/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 15/08/2003

Proposition de sujet :
Le laboratoire dispose d'une collection originale d'Archaea
hyperthermophiles du groupe des Thermococcales (Pyrococcus, Thermococcus), isolees a partir d'echantillons preleves sur des
sources hydrothermales oceaniques de divers sites des oceans Atlantique, Pacifique et Indien. Un premier crible realise sur 190 isolats a revele la presence de nombreux plasmides de differentes tailles (2,8 a plus de 30kb) chez plus de 40% des isolats examines suggerant que ces elements joueraient un role important dans la b iologie des communautes microbiennes des sources hydrothermales.
A ce jour, seuls deux petits plasmides presents chez des Archaea de ce groupe ont ete decrits, dont l'un, pGT5 dans notre laboratoire a permis la mise au point du premier systeme de
transformation chez ces organismes.
Les objectifs de cette these sont d'etudier la diversite et la
biogeographie de ces elements genetiques, de rechercher les homologies de sequence et d'analyser celles-ci pour mettre
en evidence les structures conservees impliquees dans les fonctions de maintenance, de replication et de propagation et enfin de trouver des indices de transferts horizontaux de genes. Par ailleurs, la comparaison avec les genomes d'Archaea hyperthermophiles apparentees devrait permettre de mieux comprendre le role des plasmides dans la plasticite des genomes de leurs hotes.

Qualifications :
Le candidat ou la candidate detiendra un DEA en microbiologie, genetique ou biologie moleculaire.
Il ou elle possedera des competences en genetique bacterienne, en
biologie moleculaire et en bioinformatique.

Lieu :
A l'IUEM, Technopole Brest-Iroise, place Nicolas Coppernic, 29280
Plouzane, principalement dans le laboratoire de Microbiologie Marine (UMR 6539) de l'IUEM, mais egalement au laboratoire de "
Microbiologie et Biotechnologies des Extremophiles " IFREMER, les deux laboratoires fusionnant en une nouvelle UMR debut 2004.

Debut de la these :
Octobre 2003

Financement :
Bourse regionale pour 3 ans

Contacts:

Les candidats et candidates sont pries de transmettre pour le 15 aout au plus tard leur dossier comprenant un CV, un resume du stage de DEA, une lettre d'intention ainsi que le nom d'une
personne de reference a :

daniel.Prieur@univ-brest.fr
et marc.leromancer@univ-brest.fr

les candidats et candidates retenus seront auditionnes la premiere quinzaine de septembre.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003

[AG]

bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis

Source:

Date de parution:

31/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la Génopole d’Evry (banlieue sud de Paris) pour travailler sur l’organisation du génome de la vigne et mener des recherches en génomique comparative avec Arabidopsis thaliana. Cette étude sera réalisée dans un groupe d’environ 50 personnes travaillant en génomique végétale et ira d’études bioinformatiques à la validation des hypothèses à la paillasse. Le salaire brut sera d’environ 2900€.

La Génopole (www.genopole.org) est une « vallée de la génétique » qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d’entreprises de biotechnologie autour de l’Université d’Evry-Val d’Essonne.

Le candidat, titulaire d’une thèse et travaillant actuellement en dehors de la France, sera fortement intéressé par la génomique comparative. Des expériences en bioinformatique (analyse et comparaisons multiples de séquences essentiellement) et en génétique (cartographie génétique et/ou physique) sont demandées.

Contacts:

SVP envoyez un CV à adam@evry.inra.fr (http://www.evry.inra.fr).

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03/08/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)

Source:

Date de parution:

18/07/2003

Date limite de réponse:

25/08/2003

Lieu:

Gif sur Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Le Centre de Génétique Moléculaire (CGM) Unité CNRS, situé à Gif sur Yvette (91) recherche un Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS).
Celui-ci sera intégré à la plate-forme de bio-puces dirigée par Lon Aggerbeck, et plus précisémént à l'équipe de Bio-informatique dirigée par Hervé Delacroix.
Il participera à la mise en place et à l'interfaçage des outils
d'analyses statistiques et de clustering (développés en R), ainsi que des outils d'analyse d'images avec la base de données de transcriptome.
Profil : Vous connaissez plusieurs langages de programmation, en
particulier des outils de développement web (HTML, Java, SOAP, expresso, TomCat, ...), des langages de script (perl, php, ...) et avez une expérience de la gestion des bases de données (JDBC, PostgreSQL, MySQL, Oracle, ...).
Des connaissances en statistiques seront particulièrement appréciées.

Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminée d'une durée maximale de 6 mois, disponible à partir du 1er octobre.

Contacts:

Les candidats intéressés doivent faire parvenir une lettre de motivation ainsi qu'un curriculum vitae détaillé avant le 25 aout à l'adresse suivante:

Pr Hervé DELACROIX
Centre de Génétique Moléculaire
CNRS UPR 2167
91198 Gif-sur-Yvette Cedex

mail : delacroix@cgm.cnrs-gif.fr

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03/08/2003

[AG]

Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS

Source:

Date de parution:

03/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

St Louis (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

LOCATION: Nestlé Purina Petcare PTC - St Louis, Missouri
JOB DESCRIPTION:
Interact with multi-disciplined scientist teams including nutritionists, animal scientists, molecular biologists, geneticists and other bioinformaticians working against multiple projects. Responsibilities will include input against
experimental design and output, focusing on integrating experimental data, bioinformatical analyses and statistics.
REPORTS TO: Manager of Molecular Biology group
RESPONSIBILITIES:
The position is responsible for leading projects and participating on project teams that conduct basic, non-invasive nutrition research to benefit cats and dogs. The successful candidate will have the capability of using their molecular biology and bioinformatics expertise to aid our product
development scientists to develop products with unique nutritional or wellness claims. The candidate will be expected to collaborate as necessary with other Nestle R&D Centers as well as Universities to stay current in the field. Occasional
travel to other R&D Centers and Universities is required.
EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED:
.. Minimum of BS Degree in Molecular biology or related field (PhD degree highly preferred)
.. Three years experience using bioinformatics and biostatistics with a strength in combining statistics and bioinformatical analyses
.. Research experience working with microarray, rtPCR and comparative genomics data

LANGUAGES NEEDED: English necessary. French an added positive
OTHER SKILLS REQUIRED: Excellent computer skills required as well as good verbal and written communication skills. Must have excellent teamwork skills.
DATE NEEDED: Immediately

Contacts:

CONTACT: Bob Foley
3916 Pettis Rd
St. Joseph, MO 64503
Phone-816-387-4103
Fax-816-387-4115
robert.foley@rdmo.nestle.com
Nestle Purina Petcare PTC is an equal opportunity employer (M,F,D,V)

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26/06/2003

[AG]

MC de bioinformatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

26/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Nice (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'Université de Nice Sophia Antipolis demandera un poste de MC de
bioinformatique pour la rentrée 2004.
Le profil retenu est "fouille de données, génomique et protéomique".
Dans le cadre des recherches faites sur le campus actuellement, data mining et/ou ontologies en relation avec les puces à ADN semble être le domaine qui pourrait être privilégié, mais sans pour autant exclure d'autres candidats en fonction de leur dossier.

Comme d'habitude, une expérience post-doctorale ayant permis
l'acquisition d'une double compétence sera un réel avantage, mais un stage post-doctoral ne sera pas exigé du candidat.

Les éventuels futurs candidats, peuvent me contacter par email pour plus de détails et discussions.

Contacts:

Richard CHRISTEN
UMR6543 CNRS - Université de Nice Sophia Antipolis
Biologie Virtuelle.
Centre de Biochimie. Parc Valrose.
06108 Nice cedex2
christen@unice.fr
tel 33 - 4 93 76 52 10
fax 33 - 4 93 76 52 19

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23/06/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie

Source:

BioInfo

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (Paris)
recherche un : Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie (CDD INSERM)

Vous serez intégré à l'Institut Fédératif de Recherche du
Département de Biologie dirigé par Patrick Charnay. Plus précisément, vous serez rattaché aux plates-formes du transcriptome et d'Imagerie dirigées par Claude Jacq et Antoine Triller. Vous participerez aux analyses informatiques des
images de ces services, ainsi qu'à la mise en place des outils nécessaires à leur réalisation. Vous serez plus particulièrement conduit à travailler sur des thématiques liées à l'imagerie.

Mission :
Des outils d'analyse des puces à ADN, commerciales ou
fabriquées localement, ont été mis en place (GenePix). Vous assurerez le maintien de ces outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d'analyse.
Vous serez chargé d'assurer le bon fonctionnement des outils de la plate- forme et de vous tenir au courant des évolutions du secteur.
Des robots sont disponibles sur la plate-forme pour la gestion
des matériels biologiques. Vous aurez en charge le fonctionnement
des programmes de ces robots ainsi que le développement d'outils
automatisés permettant par exemple la reconnaissance de colonies sur boîtes.
Vous aurez en charge une partie de la formation des utilisateurs
aux techniques d'analyse d'images des puces à ADN.

Profil :
Vous connaissez plusieurs langages de programmation et vous
avez l'expérience des programmes d'automatisation des tâches
plus particulièrement dans le domaine de l'imagerie. La maîtrise des outils de développement d'interface web (HTML, Javascript, .), des langages de script (PHP, perl, .) et de la gestion des bases de données (SQL) serait un plus.
Des connaissances en biologie seront particulièrement appréciées.

Perspectives :
Ce poste s'inscrit dans la politique de développement de la
bioinformatique et de l'imagerie dans le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure . Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminé disponible immédiatement jusqu'au 30 novembre. Ce poste est accordé avant le recrutement d'un ingénieur d'étude par l'INSERM par concours national.
Vous pourrez ensuite vous présenter à ce poste. Les conditions salariales sont celles des ingénieurs d'études de l'INSERM.

L'arrêté d'ouverture est paru, la date limite de retrait des dossiers est fixée au 11 juillet et la date limite de depôt au 15 juillet

Contacts:

Envoyez vos références à Stéphane LE CROM : lecrom@biologie.ens.fr

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23/06/2003

[AG]

Computational Biologist

Source:

bambct-list@molbio.mgh.harvard.edu

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Waltham (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

JOIN A FAST PACED VENTURE BACKED BIOTECHNOGOLGY START-UP

engeneOS was formed in late 2000 to exploit the tremendous opportunity created by the genomics revolution in the biological sciences merged with cutting edge technologies from the physical and information sciences. We are a pioneer in establishing the field of Biomolecular Engineering to enable the design and construction of programmable Biomolecular Machines from natural and artificial building blocks. These Biomolecular Machines will serve a broad range of commercial applications including biosensors, chemical synthesis and processing, bio-electronic devices and materials, nanotechnology, functional genomics and drug discovery.

Founded and lead by an extraordinarily talented group of advisors/partners and management team, engeneOS is a fast paced entrepreneurial organization providing talented people with the opportunity for growth, development and contribution to our dynamic and growing organization.

We are seeking a high energy, dynamic individual to join our team as a Contract to Permanent Computational Biologist.

Contract Computational Biologist

As a key member of our dynamic interdisciplinary team you will actively participate in developing innovative solutions for complex computational biological problems. The ideal candidate should have the following:
-strong biology (especially genomics) and bioinformatics background
-familiarity with genomics database (Genbank, Protein database) and data mining
- Proficiency in search algorithm and database programming with experience in writing multiple applications that interface with databases (MySQL, PostgreSQL, Oracle)
- Statistical Analysis, Proteomics
- Experience with the following technologies:
- C or C++ or Java
- Perl or Python
- GUI development (Swing, GTK+, Tk)

Excellent written and verbal communication skills are required along with the ability to work under aggressive timelines.

engeneOS offers a competitive compensation and benefits package including, medical and dental coverage, Flexible Spending Accounts, Life & Disability Insurance, and stock options.engeneOS is an equal opportunity employer.

Contacts:

Please submit your resume/CV to:jobs@engeneos.com
Fax:781-891-3796
Jennifer Neves
Staffing Specialist
Compound Therapeutics
1365 Main Street
Waltham, MA02451
PH: (781) 891-3745 x 321
FAX: (781) 891-3796
jneves@compoundtherapeutics.com

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13/06/2003

[MM]

These en modelisation quantique moleculaire a l'Ecole

Source:

ABGt-2938

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 10/06/2003
Date de fin de diffusion prevue : 06/07/2003

Modelisation microscopique et optimisation des proprietes de molecules d’interet pharmaceutique :
complementarite avec des etudes experimentales

Plusieurs molecules d’interet pharmaceutique, ayant une action
anti-tumorale reconnue, ont fait l’objet d’etudes structurales poussees. Par exemple le busulfan a ete etudie au laboratoire SPMS, sous la responsabilite de N. Ghermani. Cette molecule, et d’autres, ont pu etre cristallisees, et etudiees par diffraction X haute resolution : ceci a permis une analyse detaillee de la densite electronique(1).
La comprehension du comportement alkylant d’une telle molecule au niveau de l’ADN ou des cellules necessite une analyse theorique poussee.
Cette molecule est par ailleurs tres active, et des etudes sont en cours pour en empecher la cristallisation en milieu biologique, cause reconnue de deces. Il s’agit essentiellement d’encapsuler des molecules, tout en maintenant la reconnaissance des sites d’action bio-chimique.
En dehors du travail primordial de pharmaco-technie, il apparait
important de comprendre par voie theorique puis de controler par modelisation les mecanismes microscopiques qui sont en jeu. Cet objectif est commun a de nombreuses molecules vectorisees par des nano-particules pharmacologiques.
Les grandes phases du travail de these seraient les suivantes :
1. Etude theorique de la molecule de busulfan (et aussi d’autres
molecules presentant la meme problematique de forte cristallisation) et comparaison avec les
resultats experimentaux .
Modelisation de l’interaction molecule-ADN.
2. Modelisation des forces de cohesion qui favorisent la
cristallisation. Cette phase fera largement appel a la description d’un solide en termes de « clusters ».
3. Description des interactions dans une molecule en capsulee dans un vecteur ou une nano-particule. Dans cette phase, a la fois l’approche par cluster et la modelisation conformationnelle developpees ces dernieres annees seront importantes.

Ce travail trouvera un prolongement sur des objectifs plus larges :
4. Modelisation des interactions entre nanoparticules.
5 . Modelisation de l’interaction complexe-site actif.

Un tel projet s’inscrit directement dans la ligne des travaux developpes au niveau theorique dans l’UMR ces dernieres annees, ainsi que dans l’operation scientifique « materiaux d’interet pharmaceutique », mixte UFR de Pharmacie / ECP. Il permettrait un pont avec une operation scientifique prioritaire actuelle. Il est certain que l’etude ne peut avancer que par une interaction permanente entre des composantes pharmacotechnique, structurale et theorique.

Le directeur de these serait Jean Michel Gillet, soutenu en co-direction par Nour Eddine Ghermani d’une part (pour les aspects biochimique et structural) et Pierre Becker d’autre part (concernant la reflexion sur les modeles a mettre en œuvre)

A noter enfin qu’une telle collaboration, si elle est un succes, peut deboucher sur des applications a terme mettant en jeu des grands groupes pharmaceutiques.

Jean Michel GILLET, ECP et SPMS
Nour Eddine GHERMANI, Paris XI et SPMS
Pierre BECKER, ECP et SPMS

References :
1. Experimental electron density and electrostatique potential analysis of Zinc (aspirinate)2(H2O)2 complex : a 3d10 metal bonding to a drug ligand A. Spasojevic-de Bire, N. Bouhmaida, A. Kremenovic, G. Morgant, N.E. Ghermani (2002), J. Phys.
Chem. A, 106, 12170-12177

2. A new approach to the electron distribution in flexible molecules. Application to conformational analysis P. Becker, E. Bec, (1996) Chem. Phys. Letters, 260, 319

3. Interpreting Compton anisotropy of ice Ih : a cluster partitioning method S. Ragot, J.M. Gillet, P. Becker, Phys Rev. B, 63, (2002) 235115-1 to 235115-6

4. Electrostatic properties of ibuprofen
N.E. Ghermani, M. Dutheil, P. Becker, J. Chem. Phys. (2002), 117,
205-212

Une bonne formation en physique ou chimie quantique est essentielle.
Une precedente experience dans la modelisation moleculaire serait
appreciable.
Un bon classement de DEA sera un atout favorable, sinon determinant,dans l'obtention d'une bourse de l'Ecole Doctorale de l'Ecole Centrale Paris.
Tous les cours de l'ECP sont accessibles aux doctorants du laboratoire SPMS, avec la possibilite de valider le Diplome d'Etudes Superieures Professionnelles delivre par l'Ecole Centrale Paris.
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

Contacts:

Envoyer un CV ainsi qu'une lettre de motivation (sous la forme d'un courrier electronique avec CV en document attache) a gillet@spms.ecp.fr

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11/06/2003

[MM]

POSTDOCTORAL POSITION in COMP.CHEM./COMP. BIOPHYSICS

Source:

BioInfo

Date de parution:

11/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

La Jolla (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for a postdoctoral position starting September 2003 or later in the Department of Biochemistry & Molecular Biology within the Center for Biological Modeling at Michigan State University (http://biomodel.msu.edu/). The position is available initially for 1 year with the possibility for extension.

Research interests focus on three main areas: Modeling of large
supramolecular assemblies, in particular interactions between mismatched DNA and the mismatch recognition protein mutS; development of hybrid explicit/implicit solvation methods; and development and application of novel methods for protein structure prediction and refinement.

Ideal candidates would have a strong background in computational or theoretical chemistry, biophysics, biochemistry, structural biology or related discplines. Familiarity with computational chemistry methods, experience in molecular modeling and simulation of biological systems, advanced programming skills, knowledge of the UNIX/Linux operating system, and an interest in developing new methodologies are highly desirable.

MSU, located in East Lansing, Michigan, provides a unique and
challenging interdiscplinary research environment at the interface of biological and physical sciences. East Lansing, located between the Great Lakes, offers a pleasant living environment with many cultural events and excellent opportunities for outdoor activities.

Contacts:

Interested applicants should send a curriculum vitae, including relevant experiences, a list of publications, and contact information of three references, to the address listed below. Electronic responses are highly encouraged.

Michael Feig
Department of Molecular Biology, TPC-6
The Scripps Research Institute
10550 N Torrey Pines Road
La Jolla, CA 92037
USA
email: meikel@scripps.edu

http://www.scripps.edu/~meikel/msu/feig.html

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=1856

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10/06/2003

[MM]

Postdoctorals Fellowships in Structural Molecular Biology at the EMBL Outstation

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Grenoble (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The European Molecular Biology Laboratory (EMBL) is an international research organization consisting of a headquarters laboratory situated in Heidelberg Germany and four Outstations. The EMBL Outstation in Grenoble has an active research programme in structural molecular biology and shares a common site with the European Synchrotron Radiation Facility (ESRF) and the Institut Laue Langevin (ILL), world leading centres for X-ray and neutron scattering.
We are seeking to recruit postdoctoral fellows with a strong interest in structural biology who can benefit from the juxtaposition of excellent wet-lab facilities with state-of-the-art beamlines for protein crystallography. Depending on the particular laboratory, candidates should either have a background in molecular biology and biochemistry combined with an interest in structural biology or a background in protein crystallography with some experience in molecular biology and biochemistry.

Fellowships are available in the following laboratories:

Stephen Cusack: Protein/RNA interaction group: the structural basis of protein-RNA recognition in the context of the signal recognition particle and proteins interacting with mRNA or tRNA. e-mail: cusack@embl-grenoble.fr.

Rob Ruigrok: Virus structure group: structure and function of viruses and sub-viral assemblies. e-mail: ruigrok@embl-grenoble.fr.

Christoph Müller: Protein/DNA interaction group: the structural basis of transcriptional regulation, transcription factor/DNA recognition and the mechanism of nuclear transport.
e-mail: mueller@embl-grenoble.fr.

Winfried Weissenhorn: Membrane fusion group: the structural basis for viral and cellular membrane fusion processes. e-mail:
weissen@embl-grenoble.fr.

EMBL is an inclusive, equal opportunity organisation with an exciting and stimulating research environment.

Contacts:

Applicants should submit a curriculum vitae, quoting reference no., with concise description of research experience and the names and addresses of at least two referees to:

Head of Outstation,
EMBL
6 rue Jules Horowitz
c/o ILL; B.P. 181;
F - 38042- Grenoble Cedex 9, France;

Fax: 33-4-76-20 77 86.

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10/06/2003

[MM]

Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche

Source:

http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-041.html

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Gif sur Yvette (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-041 DSV
Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire,
Sciences du vivant/Biologie structurale

1. Intitulé du sujet
Rôle de la protéine SGT1 dans le cycle cellulaire, une approche
bio-informatique et structurale
Topic tittle
SGT1 function in cell cycle regulation probed by biocomputing and
structural biology.

2. Détail du sujet
SGT1 est une protéine très conservée, essentielle à la régulation du cycle cellulaire. Sa fonction exacte demeure inconnue. Prédiction de structure, docking et RMN seront associés pour caractériser comment SGT1 interagit avec ses multiples partenaires biologiques. En étroite collaboration avec des généticiens et des biologistes des plantes, ce travail permettra d'établir le role de la protéine au cours du cycle
cellulaire.

Detailed tittle
SGT1 is an essential component of the cell cycle signalling pathway although its function remains unclear. Structure prediction, docking and NMR will be used to unravel the way SGT1 interacts with its numerous biological partners. In close collaboration with geneticists and plant biologists, this work will shed light on the role of SGT1 in the cell cycle.

3. DEA recommandés
DEA Analyse de génomes et Modélisation Moléculaire. DEA Biophysique Moléculaire.

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Département de Biologie Joliot Curie Service : Service de Biophysique des Fonctions Membranaires

Date souhaitée pour le début de la thèse : 1/09/2003

Contacts:

5. Personnes à contacter par le candidat
Raphaël Guerois
LBPM/Laboratoire de Biophysique des Protéines et des Membranes
CEA Saclay. 91191 Gif sur Yvette Cedex
Téléphone : +33 1 69 08 96 79

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10/06/2003

[MM]

Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP

Source:

http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-117.html

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Grenoble (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-117 DSV

Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Etude structure-fonction et modélisation moléculaire des transporteurs ABC de type MRP

Topic tittle
Structure-function and molecular modelling of MRP-type ABC transporters

2. Détail du sujet
Sur la base des données structurales parcellaires obtenues récemment par microscopie et cristallographie, il s'agira d'élaborer des modèles des transporteurs ABC homologues SUR, YCF1, MRP1 en utilisant les contraintes imposées par nos résultats. Ces modèles permettront d'une part de mieux interpréter les résultats connus et d'autre part de formuler des hypothèses sur les mécanismes et de concevoir des expériences pour les tester. Ce projet demandera des compétences en bioinformatique ainsi qu'en biologie et sera réalisé en parallèle dans l'équipe de simulation et modélisation moléculaire et de l'équipe Transporteurs ABC du laboratoire.

Detailed tittle
On the basis of existing structural data obtained by microscopy and crystallography, models of the homologous ABC transporters, SUR, YCF1 and MRP1 will be constructed using constraints imposed by our experimental results. These models will allow a better interpretation of known data and will constitute a basis for bringing forth hypothesis on the mechanisms and for designing experiments to test these hypothesis.
This project will require knowledge of bioinformatics as well as biology and will be pursued in parallel in the Molecular Simulation and
Modelisation group and the ABC transporters group of the laboratory.

3. DEA recommandés
Modélisation, Mathématiques, Bioinformatique, Biologie Structurale et Fonctionnelle

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Département Réponse et Dynamique
Cellulaires

Date souhaitée pour le début de la thèse : Oct/nov 2003

Contacts:

5. Personnes à contacter par le candidat
Serge CROUZY
BMC/Laboratoire de Biophysique Moléculaire et Cellulaire
CEA-DRDC-BMC, 17 rue des Martyrs, 38054 Grenoble
Téléphone : +33 4 38 78 48 48

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10/06/2003

[MM]

Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire

Source:

http://www-dsv.cea.fr/thema/SujDSV/SL-DSV-03-104.html

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Grenoble (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Proposition de sujet de thèse SL-DSV-03-104 DSV
Domaine de recherche
Sciences du vivant/Bio-informatique, simulation bio-moléculaire

1. Intitulé du sujet
Simulation Numérique du Comportement Intracellulaire
Topic tittle
Numerical Simulation of Intracellular Behavior

2. Détail du sujet
Récemment, il y a une révolution dans la biologie due aux projets
génomiques. Le déluge des données produites par ces projets a changé la façon de penser la recherche en biologie et permet des approches novatrices pour aborder les problèmes biologiques. Le projet proposé pour cette thèse se situe dans le domaine de la biologie post-génomique et a pour but ultime la compréhension des réseaux de protéines - comment ils se comportent et les règles générales qui les gouvernent
Detailed tittle
Recently, there has been a revolution in biology due to the genome projects. The deluge of data produced by these projects has changed the way in which research is done in biology and has led to new approaches to the treatment of biological problems. The project proposed for this thesis falls in the area of post-genomic biology and has as its aim the understanding of protein networks - how they behave and the rules that govern them.

3. DEA recommandés
DEAs de Modélisation, de Physique, de Chimie, de Biologie Structurale ou de Biologie Moléculaire

4. Informations pratiques
Direction des sciences du vivant/Institut de Biologie Structurale

Date souhaitée pour le début de la thèse : octobre 2003

Contacts:

5. Personnes à contacter par le candidat
Martin Field
LDM/Laboratoire de Dynamique Moléculaire
IBS 41 rue J. Horowitz 38027 Grenoble
Téléphone : +33 4-38-78-95-94

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10/06/2003

[MM]

Computational Chemists/C++

Source:

Bioinformatics.Org

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Salary plus bonus to 150K+

Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of
experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics,
or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills.
Relevant areas of experience might include the computation of
protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecular systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of
electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with
management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.

Contacts:

If you are interested send a Word Attachment copy of your resume to the attention of Norm Davis at normd@cisny.com

[Please Mention Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=1835

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10/06/2003

[AG]

CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Gif-sur-Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

TRES URGENT: CDD de 12 mois non-renouvelable, niveau IE ou IR selon le diplôme, salaire premier échelon de la catégorie correspondante.

Mots clés: base de données relationnelle, interface web,

Projet:
Dans le cadre de la création d'un centre de ressources biologiques drosophiles organisé en réseau, nous recherchons un ingénieur (ou post-doc) pour développer l'outil de gestion commun sous forme d'une base de données relationnelle. La base recensera l'ensemble des ressources disponibles dans les différents laboratoires partenaires et comportera deux grands types de ressources, - des lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster espèce modèle dont le génome est entièrement connu, - des lignées de populations naturelles et d'espèces variées. (plusieurs milliers de lignées au total)

Mission:
Prendre en charge la conception et la réalisation de la base de données sécurisée (MySql ou PostGreSql) regroupant l'ensemble des lignées et espèces de drosophiles et de l'interface web.

Ce poste est réservé à un candidat qui n'a pas déjà bénéficié d'un CDD avec un établissement public de recherche.

Lieu de travail: CNRS, Gif-sur-Yvette, Populations, Génétique et
Evolution (PGE)

Contacts:

Personne à contacter:
Marie-Louise Cariou
Populations, génétique et Evolution - UPR 9034
CNRS - Gif-sur-Yvette
Tél 01 69 82 37 10
Mail: cariou@pge.cnrs-gif.fr

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10/06/2003

[AG]

Research Associate in biostatistics and

Source:

ABGe-1165-Postdoctoral

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

23/06/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 23/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 23/06/2003

This is an exciting opportunity for an ambitious post-doc with a PhD in mathematics, statistics, physics or bioinformatics who is looking to develop their career as a biostatistician in the field
of genomics. The post is linked to a Wellcome Trust project, coordinated by Professor James Scott and involving an inter-disciplinary team working to develop the understanding of metabolic diseases and in particular the syndrome of insulin resistance.
You will work directly with Professor Sylvia Richardson, Head of
Biostatistics Group in the Department of Epidemiology for developing and applying multivariate statistical tools to gene
expression data. The post is funded by a Wellcome Trust Thematic grant for Cardiovascular Functional Genomics. The appointment will be for 2 years in the first instance, with a possibility
of a third year.

Further details concerning the Biological Atlas of Insulin Resistance are available on the web pages from the Consortium:
http://www.icggri.ic.ac.uk/bair/index.htm

The appointment will be on the RA1A scale with a minimum of £21,125 per annum plus London Allowance of £2,134 per annum.

Valuing diversity and committed to equality of opportunity.

Contacts:

Please contact:
Professor Sylvia Richardson
sylvia.richardson@imperial.ac.uk

Further particular and application form can be obtained from Madeline
Kirk on +44 20 7594 3319, or
email: m.kirk@imperial.ac.uk.

Closing date: 12th June 2003.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003

[AG]

Postdoctoral Position at MIPS

Source:

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Munich (Allemagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for a postdoctoral fellowship to
develop new methods for automatic classification of protein
sequences using machine learning methods.

The input data will include BLAST/FASTA similarity scores,
protein domains and motifs, as well as secondary and tertiary structures predicted by standard bioinformatics methods. The primary classification target will be functional categories (FunCat) developed by the MIPS.

Applicants with a Ph.D. in bioinformatics, computer science/engineering are encouraged to apply. A background in molecular biology as well as demonstrated computer skills (programming in Perl, SQL, C/C++ familiarity with UNIX, Web) are preferred.

The position will be supervised by Prof. H.W. Mewes and Dr. I.V. Tetko.

The salary will be according to BAT IIa. The appointment will be for two years.
The position is available immediately.
Informal inquiries are also welcome.

Contacts:

Please send curriculum vitae, names for letters of recommendation to i.tetko@gsf.de, http://mips.gsf.de.

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10/06/2003

[AG]

Biologist

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist
The BioMinT project is focused on the development of statistical,
machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information:
http://biomint.org/).

The main tasks of the position will consist of:

exploring domain-specific knowledge resources in order to create
lexicons, thesauri and ontologies furnishing sets of document corpora for each stage of tools development and validation
evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators
A university level degree in biology is required, as well as an
experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position.

Eligible candidate for hold a Swiss or European union passport.

Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months

Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva

Contacts:

Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to:

Anne-Lise Veuthey

Swiss Institute of Bioinformatics
CMU
1, rue Michel Servet
1211 Genève 4
email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

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10/06/2003

[AG]

CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services

Source:

EMBL Job Vacancy 03/57

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

15/07/2003

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/57

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Heidelberg:

HEAD OF CENTRAL COMPUTING SERVICES

Grade: 9

Duty Station: Heidelberg, Germany

Job Description: The successful candidate will lead a team of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services for the main Laboratory of the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg.

A key task of this team is to provide service and support to the EMBL scientific community at all levels of computing and networking.
Supported equipment includes a broad range of computing devices (from desktop machines, workstations to large servers). The operating system environment is heterogeneous and includes Unix, Linux, MacOS and Windows. The implemented networking technology is state-of-the-art and allows the provision of extensive online services to the worldwide scientific community.

It is essential that the central computing service team collaborate with research groups in computational biology at EMBL. The Head of central computing services is expected to serve as a facilitator for the in-house computational biology community as well as for the EMBL Outstations. The duty of the person also involves support and interaction with the SAP based administrative computing system and consultants.

Qualifications and Experience: Applicants should have a university degree or equivalent as well as having substantial experience in managing and integrating a heterogeneous scientific computing environment, which includes expertise in network security and network administration. The position requires the ability to develop technical concepts and proposals for further improvement of the computing and networking services, including improvement in the areas of the GRID and network security. Previous experience in management of an IT team and skills in negotiating with computer equipment manufactures are highly desirable.

Contract: A contract of 3 yearsí duration will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 15.07.2003

Contacts:

EMBL Web site: http://www.embl.de/

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10/06/2003

[AG]

2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy

Source:

ABG-7827

Date de parution:

22/05/2003

Date limite de réponse:

21/07/2003

Lieu:

Rochester (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 21/07/2003

There are immediate openings for two postdoctoral positions in
biological NMR at Mayo Clinic and Research Foundation. Several projects involving structural characterization of protein complexes are available.

Applicants should have experience in NMR spectroscopy.
Salary is very competitive and will be determined by the successful candidate's experience. There is an attractive benefit package.

For some general information about research at Mayo Clinic please visit: http://www.mayo.edu/research/

Contacts:

Applications, including curriculum vitae and bibliography, and the names of three references, should be sent by email to :

Dr. Georges Mer
Mayo Clinic
Guggenheim 1511B
200 First Street S.W.
Rochester, MN 55905
mer.georges@mayo.edu

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003

[AGMM]

Senior Scientist Bioinformatics, NITD

Source:

http://www.bioplanet.com/planetforums/viewthread.php?tid=1352

Date de parution:

13/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Singapour (Singapour)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Senior Scientist Bioinformatics, NITD, Singapore

The Novartis Institute for Tropical Diseases in Singapore (NITD) works to advance medical research in the area of progressive infectious and parasitic diseases that affect so many people in the developing world.
Novartis views this as a long term endeavor to enhance the discovery of preventative and effective treatments for diseases like tuberculosis (TB) and dengue, and ultimately reduce the overall affliction of tropical diseases and improve the prosperity of developing countries.

The successful candidate will play an instrumental role in setting up computational biology at the NITD. In close collaboration with the experimental scientist he will computationally support the various research projects and advise biologists and chemists in the use of bioinformatics applications and resources. In addition he will serve as an interface to other bioinformatics research groups in Novartis. He will co-ordinate joint projects and internalize or interface existing in-house resources and applications.

Requirements:

PhD in natural sciences, informatics or related education. Practical working experience, e.g. post doctoral training. Strong background in molecular- and cell-biology and the proven ability to publish in this field. Excellent knowledge of bioinformatics with an emphasis on the analysis of sequences and protein structures. Familiarity with all common bioinformatics algorithms and resources and a profound understanding of how these databases have been compiled. The ability to develop own bioinformatics data-mining strategies and to implement them as software on Unix platforms. Applied knowledge of working with relational databases and the creation of web-based user-interfaces.
Experiences in infectious disease related research would be an asset. As a member of an international, cross-disciplinary team, excellent written and spoken communication skills are essential.

Contacts:

Please apply directly via www.novartis.com, Job ID: 18723

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28/05/2003

[AGMM]

ATER - Bioinformatique - Lille

Source:

BioDocs

Date de parution:

28/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

L'Universite de Lille 1 dispose de postes d'ATER en informatique, avec des besoins d'enseignement en bioinformatique. Les formations concernees sont : DESS Bioinformatique, DESS Proteomique,
DESS Genie Cellulaire, IUP Proteomique et Maitrise de genetique.

La recherche se ferait dans l'equipe Bioinfo du LIFL.

La date limite d'envoi des dossiers est le 28 mai : http://www.univ-lille1.fr/personnels/ater/recrutement_ater.htm

Contacts:

N'hesitez pas à me contacter pour avoir plus d'informations :
Helene Touzet, au 03 20 43 68 02 ou touzet@lifl.fr

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21/05/2003

[AG]

Postdoc modele « plante virtuelle »

Source:

ABGt-2813

Date de parution:

05/05/2003

Date limite de réponse:

25/05/2003

Lieu:

Grignon (78) (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Integration dans un modele « plante virtuelle » des relations
source-puit et de la senescence au cours du remplissage des grains chez le ble.

Date de debut de diffusion du poste : 05/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 25/05/2003

Contexte des travaux de l’equipe
L’equipe met au point des modeles de fonctionnement de plantes et de population de plantes. Nous developpons en particulier des modeles de « plante virtuelle», fondes sur une representation informatique realiste des plantes. Nous cherchons a integrer dans cette approche les processus essentiels pour la simulation des interactions entre la plante et son environnement, en particulier les stress biotiques (maladies) et abiotiques (ozone,
carence azotee).
Il apparait que l’impact de ces stress est en grande partie lie a une acceleration de la senescence foliaire, probablement due aux modifications des sources et puits de carbone et d’azote. La modelisation de l’effet des contraintes necessite donc la mise au point d’un modele mecaniste de senescence foliaire. Le choix de l’approche « plante virtuelle » permettra de realiser l’integration sur la base d’une representation detaillee des processus, au sein de la plante et dans le temps.

Resume de la proposition : Lors du remplissage des grains chez les cereales, la demande d’azote est superieure aux possibilites de prelevement racinaire et le complement est fourni par remobilisation a partir des organes aeriens. Il en resulte une diminution de la photosynthese qui affecte l’activite racinaire, et accelere le processus. L’objectif de la these sera de mettre au point un modele exprimant ces interactions, et d’evaluer en particulier si la boucle de retroaction decrite plus haut permet de rendre compte de la progression de la senescence foliaire au cours du temps, dans differentes conditions environnementales. Le modele sera developpe selon une approche plante virtuelle developpee dans l’equipe, qui permettra de prendre en compte de facon precise la progression de la senescence au sein de l’architecture et son impact sur l’acquisition du carbone.
La recherche est donc fondee sur l’investigation de processus biologiques, elle inclut une composante importante en modelisation.

Lieu de Travail
INRA : Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France

Profil recherche
Nous recherchons de preference un candidat de formation initiale en biologie, motive par la formalisation mathematique et informatique.

Le candidat doit avoir effectue son DEA en France.
Les candidatures selectionnees par l’equipe seront soumises fin mai a l’Ecole doctorale ABIES pour la decision quant a l’attribution de l’allocation de recherche.

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à :
Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003

[AG]

charge de cours en bioinformatique

Source:

ABGe-1159

Date de parution:

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 13/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 29/05/2003

OUVERTURE DE POSTE

L'Universite Libre de Bruxelles annonce l'ouverture, a partir du 1er octobre 2003, d'un poste de charge de cours a temps plein en bioinformatique en Faculte des Sciences.

Les candidats doivent etre titulaires d'un doctorat en Sciences (ou d'un titre equivalent), et aire etat d'une experience soutenue de recherche de haut niveau portant sur un ou plusieurs
aspects de la bioinformatique: genomique ou proteomique comparative, structurale ou fonctionnelle, modelisation de processus cellulaires, conception rationnelle de molecules biologiquement actives, etc...

Une grande importance sera donnee aux synergies qui pourront s'etablir entre le nouveau charge de cours et les unites de recherche actives en bioinformatique a l'ULB. Le nouveau charge de cours participera a la promotion de la bioinformatique en tant que science interdisciplinaire.

Les candidats doivent egalement faire preuve de dispositions pedagogiques pour l'enseignement superieur. Le candidat retenu se verra attribuer des charges d'enseignement dans le cadre du DEA inter-universitaire en bioinformatique (en langue anglaise). Ces charges seront progressivement completees par des enseignements de 1er ou 2me cycle.

Si le candidat retenu n'appartient pas au personnel enseignant ou scientifique de l'ULB, ou au personnel definitif du Fonds National de la Recherche Scientifique travaillant a l'ULB, il sera engage a titre temporaire pour une periode a trois ans. A l'issue de cette periode, et moyennant une decision du Conseil d'Administration de l'Universite, son engagement fera l'objet d'une nomination a duree indeterminee sur le budget de fonctionnement de l'Universite.

Toutes les informations sont disponibles sur le site :
http://www.ulb.ac.be/docs/greffe/vacances/academique/index_6.html

la reference de l'offre est : 28.04.03/IV.21

Les candidats sont invites a retirer un modele de presentation du curriculum vitae sur le site http://resu1.ulb.ac.be/tools/CV-type.rtf. La candidature accompagnee dudit curriculum vitae, d'un resume des activites precedentes et d'un projet de recherches, doit etre adressee en deux exemplaires a M. Pierre de Maret, Recteur de l'Universite Libre de Bruxelles, 50 avenue Roosevelt, 1050 Bruxelles. Le candidat priera deux personnalites d'envoyer une lettre de recommandation a M. Guy Latouche, Vice-Doyen de la Faculte des Sciences, ULB, CP 212, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles, qui, par ailleurs, se tient a disposition pour toute demande d'information.

La date limite du depot des candidatures est fixee au 29 mai 2003

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
contacts, la source
(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003

[AG]

Postdoc

Source:

Date de parution:

21/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Boston (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

If you know of any potentially qualified and interested recent PhD in computer science, math, stats, or physics who is interested in computational biology/bioinformatics, please urge them to contact me directly concerning an open postdoctoral position to work with me in the Department of Biology at Boston College.

Current projects concern algorithm design for the analysis of time series oligonucleotide and cDNA array data, RNA structure prediction, and extensions/refinements of aspects of sequence alignment.

Essential skills required: strong programming ability (especially in C/C++ and python or perl), some probability theory. Some background in computational biology would be helpful, but for someone really interested, this can be learned.

The Boston area has many opportunities in computational biology/bioinformatics, both academic and industrial. The weekly MIT Bioinformatics Seminar, co-organized by Bonnie Berger and myself, facilitates potentially useful future contacts, and the Boston area is home to a number of leading biotech and pharmaceutical companies involved in bioinformatics research (such as Novartis, Millenium, Serono, Lion Bioscience, US Genomics,etc.).

Contacts:

Peter Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor, Biology Department
Courtesy appt. Computer Science Department
Boston College
Higgins Hall 416 140 Commonwealth Avenue
617 552 1332 (office) Chestnut Hill, MA 02467
617 552 2011 (fax)
http://cs.bc.edu/~clote/
clote@bc.edu

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24/04/2003

[MM]

Post-Doctorat au CEA Saclay

Source:

BioInfo

Date de parution:

24/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Titre: Post-Doctorat au CEA Saclay: Simulation moléculaire du transporteurABC bactérien MsbA inséré dans une membrane en vue de modéliser l'action de la Pgp

Présentation du laboratoire:
Le stage se déroulera au Service de Biophysique des Fonctions Membranaires (DBJC / DSV), dans le cadre d'une collaboration entre le Laboratoire de Biophysique des Protéines et des Membranes et le Laboratoire de Transport Membranaire et Détoxication, au Centre d'Etudes de Saclay (91).

Description de la mission proposée:
La P-glycoprotéine (P-gp) est un transporteur membranaire actif de détoxication cellulaire appartenant à la grande famille ABC ("ATP Binding Cassette"). Remarquablement multispécifique, la P-gp transporte de nombreux xénobiotiques amphiphiles, et nous venons de montrer qu'elle transporte un lipide membranaire, le cholestérol, vers le feuillet externe de la membrane. La protéine MsbA, transporteur ABC bactérien homodimérique, est très proche de la P-gp en terme d'homologie de séquences. C'est aussi un bon homologue fonctionnel de la P-gp puisqu'elle transporte un lipide létal pour la bactérie.
Une structure à haute résolution de MsbA vient d'être publiée. La forme très particulière, "en V" fortement ouvert, du dimère de MsbA est atypique pour une protéine membranaire, et pose le problème de la distribution des lipides autour de la protéine. Déterminer cette distribution permettrait d'avancer vers la compréhension des mécanismes de transport de la MsbA, mais aussi de la P-gp. Seule la simulation moléculaire est actuellement en mesure de fournir une telle information. Nous nous proposons donc d'obtenirpar simulation moléculaire un modèle du système MsbA-membrane, permettant en premier lieu de décrire l'interfacep rotéine-lipide, puis de localiser le site de liaison de son substrat physiologique. L'objectif est de proposer un mécanisme de transport pour ces transporteurs ABC. Ce travail sera effectué en collaboration avec notre équipe de simulation moléculaire.

Formation et profil requis:
Solide bagage en simulation moléculaire des protéines, avec utilisation des programmes CHARMM (de préférence), ou AMBER, ou GROMACS; bonne connaissance des protéines (plus particulièrement celles associées aux systèmes membranaires) permettant ultérieurement d'aborder la problématique de la modélisation par homologie.

Informations générales:
Le poste est à pourvoir dès maintenant et avant le 15/12/03. Le contrat proposé est un CDD de 1 an renouvelable une fois.

Lieu de travail: Centre d'Etudes de Saclay (RER Le Guichet, près d'Orsay).

Contacts:

Procédure de dépôt de candidature:
Envoyer par e-mail à Stéphane Orlowski (orlowski@dsvidf.cea.fr) un CV détaillé et une lettre de motivation.

Stéphane Orlowski, SBFM / DBJC, Centre d'Etudes de Saclay, 91191
Gif-sur-Yvette cedex.

Tel: 01 69 08 95 77; FAX: 01 69 08 81 39.

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24/04/2003

[AG]

chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD

Source:

ABGf-2986

Date de parution:

18/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

ABGf-2986-CDD - Le Cirad recrute un chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique - Montpellier

Date de debut de diffusion du poste : 18/04/2003
Date de fin de diffusion prevue : 07/05/2003

Au sein de l'equipe "Analyse du genome" du programme canne a sucre et de l'UMR " polymorphismes d'interet agronomique " et pour assurer le suivi de plusieurs developpements intervenus recemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
• la poursuite du travail sur les " Single Nucleotide Polymorphism " (SNP) comme outils de genotypage chez la canne a sucre
• l'exploitation des collections d'ESTs de canne a sucre produites a la FAPESP au Bresil et de mais et ble produites par le programme Genoplante pour le marquage de caracteres d'interet agronomique chez la canne a sucre
• l'appui a l'analyse bio-informatique de sequences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gene de resistance a la maladie de la rouille chez le cultivar de canne a sucre R570
• la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du desequilibre de liaison pour le marquage de genes d'interet agronomique chez la canne a sucre

Profil souhaite :
Doctorat en genetique avec maitrise des techniques moleculaires, ou en biologie moleculaire
Experience significative en genetique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de sequences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : Contrat a duree determinee
Date de prise de fonction : Immediate

Contacts:

Renseignements sur le poste :
Angelique D'HONT, ca-cas, Tel. 04-67-61-59-27

Pour postuler :

Bernadette VINCENT
CIRAD-CA
TA 70/09
Avenue Agropolis
B.P. 5035
34398 Montpellier Cedex 5
Tel : 04.67.61.55.38

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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24/04/2003

[AG]

computational biology/bioinformatics

Source:

BioJobs

Date de parution:

24/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Memphis (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A postdoctoral position in computational biology/bioinformatics is available in Dr. Yan Cui’s lab at Univeristy of Tennessee Health Science Center (Memphis, TN). We are interested in DNA microarray data analysis, gene network inference and protein structure prediction (http://compbio.utmem.edu).

Ph.D. degree, researh experiences in bioinformatics or related fields, computer programming skills in C/C++ are required.

The successful candidate will be able to take advantage of high
performance computing facility including a new 48-processor Beowulf cluster.

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this
announcement.]

Contacts:

For immediate consideration send your CV to Dr. Yan Cui
(ycui2@utmem.edu)

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18/04/2003

[AG]

Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : DRH ca-705
Date de publication : 07/04/2003
Date de clôture : 25/04/2003

Descriptif du poste :
Au sein de l'équipe «Analyse du génome» du programme canne à sucre et de l'UMR « Polymorphismes d'intérêt agronomique » et pour assurer le suivi de plusieurs développements intervenus récemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
- la poursuite du travail sur les « Single Nucléotide Polymorphism »
(SNP) comme outils de génotypage chez la canne à sucre
- l'exploitation des collections dESTs de canne à sucre produites à la FAPESP au Brésil et de maïs et blé produites par le programme Génoplante pour le marquage de caractères dintérêt agronomique chez la canne à sucre
- l'appui à l'analyse bio-informatique de séquences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gène de résistance à la maladie de la rouille chez le cultivar de canne à sucre R570
- la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du
déséquilibre de liaison pour le marquage de gènes d'intérêt agronomique chez la canne à sucre

Profil souhaité :
Doctorat en génétique avec maîtrise des techniques moléculaires, ou en biologie moléculaire
Expérience significative en génétique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de séquences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : CDD de remplacement (11 mois minimum)
Date de prise de fonction : immédiate

Contacts:

Renseignements : Angélique DHONT, ca-cas, Tél. 04-67-61-59-27

Candidatures à adresser à :
Bernadette VINCENT (bernadette.vincent@cirad.fr)
Adresse postale : TA 70 / 09 Ave Agropolis 34398 Montpellier

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17/04/2003

[AG]

INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Source:

BioInfo

Date de parution:

15/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le service Bionformatique de l'Institut Curie recrute :
UN INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le
service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7
ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau (6 personnes) pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat sera chargé de la gestion de projets informatiques :
expression de besoins, cahier des charges, définition de l'architecture, développement ou sous-traitance, validation à chaque étape du processus, installation et maintenance. Il aura à participer aux développements et à coordonner trois ingénieurs dans ces missions.
Il aura également à organiser le fonctionnement de l'équipe pour garantir la qualité des développements et des flux d'information.

Compétences :
- Gestion de projets
- Maîtrise d'ouvrage
- Architectures client-serveur et multi-couches
- SGBD relationnels (modélisation et administration)
- conception UML
- Apache (administration)
- Environnement de développement Unix et Windows
- Développement sous C/C++, Java (Swing, AWT, JSP, RMI), Perl, PHP
- Connaissances métier en bioinformatique
- Anglais courant
5 ans d'expérience minimum
Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Merci d'envoyer vos CV, lettre de motivation et prétentions en précisant la référence BI4 à :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie - Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

Tél. : 01 42 34 65 27
Fax : 01 42 34 65 28

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15/04/2003

[AGMM]

2 lectures proteomics/bioinformatics and molecular microbiology

Source:

BioInfo

Date de parution:

15/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Applications are invited for two appointments in the general areas of proteomics/bioinformatics and molecular microbiology. Outstanding candidates in other areas of modern biology are also encouraged to apply. Appointees will be expected to be fully involved in the Department's undergraduate and postgraduate teaching programmes and to develop an internationally competitive research programme in their areas of expertise.

Salary scales (new entrants)

Lecturer - Euro 42,064 - 68,188 p.a. (7 points)
Junior Lecturer - Euro 29,214 - 34,401 (5 points)

Applications in writing, including a full C.V., a list of publications and a brief account of future research objectives, together with the names, addresses, fax, telephone numbers and e-mail address of three referees, should be forwarded to the Personnel Officer, so as not to arrive later than Friday, 9 May 2003.

Contacts:

Prior to application, further details of the posts may be obtained from the Personnel Officer, National University of Ireland, Maynooth, Maynooth, Co. Kildare, Ireland.

Confidential Fax No: +353 1 708 3940
E-mail: personnel@may.ie

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14/04/2003

[AG]

Computer Biologist - Metabolic Disease Group

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

18/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Computer Biologist - Metabolic Disease Group (Ref: 560)

Closing Date: 18th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Metabolic Disease Group is a new group at The Wellcome Trust Sanger Institute; our aim is to apply genetic approaches to study type 2 diabetes and obesity. We are following a candidate gene approach and will be investigating the putative role of hundreds of genes via genetic association studies and functional analysis of mutations. We are seeking a Computer Biologist to provide support to the data handling activities of the group, this will involve close collaborative work with other groups at the Institute, in particular the Human Genetics Informatics group.

Informal enquires may be made to Inês Barroso (ib1@sanger.ac.uk)

The ideal candidate for will have at least two years post graduate experience of programming in a UNIX/LINUX environment, using one or more of the following: perl, C, java, javascript, plsql. A familiarity with RDBMS and a working knowledge of perl are essential. The role involves working closely with laboratory scientists and collaboration with other informatics groups, strong communication skills are required.

Contacts:

To apply for these positions please write with your CV and current salary details quoting the reference number to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA

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14/04/2003

[AG]

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

11/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation
(Ref: 559)

Closing Date: 11th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Wellcome Trust Sanger Institute is one of the leading genomics centres in the world, dedicated to analysing and understanding genomes. Through large-scale analysis - and focused research and collaborations - the Sanger Institute's programmes underpin biological and medical research worldwide. The pathogen sequencing unit has established a curated genome database, geneDB, to house gene annotation and functional genomic data. A position is now available for a senior computer biologist within the pathogen sequencing unit responsible for analysis of Plasmodium genome data and maintaining the Plasmodium content of the geneDB database. As a senior computer biologist you will be expected to interact proactively with both malaria and informatics research communities to develop and optimise the content and accessibility of the data. You will also interact with in house computer programmers to maximise the quality and utility of the data to the community. You should have a PhD and preferably laboratory experience of Plasmodium. Knowledge of programming/scripting is desirable, although not essential, as training will be provided.

Contacts:

To apply, please write with your CV and current salary details quoting reference 559 to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA. The closing date for applications is 11th April 2003

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08/04/2003

[MM]

Computational Chemists

Source:

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Extraordinarily gifted computational chemists at all levels of experience sought to join a select research group within a rapidly growing New York-based technology firm known for scientific leadership in the development of computational chemistry software for the pharmaceutical and biotechnology industries. We are looking for individuals with an exceptionally distinguished history of academic and/or industrial accomplishment to join our efforts to fundamentally transform the process of drug discovery.Candidates should have world-class credentials in computational chemistry, biology, or physics, or in a relevant area of computer science or applied mathematics, and must have unusually strong research and software engineering skills. Relevant areas of experience might include the computation of protein-ligand binding free energies, molecular dynamics and/or Monte Carlo simulations of biomolecular systems, application of statistical mechanics to biomolecu lar systems, free energy perturbation methods, and methods for speeding up evaluation of electrostatic energies -- but specific knowledge of any of these areas is less critical than exceptional intellectual ability and a demonstrated track record of achievement. Current areas of activity for the firm include structure- and ligand-based drug design, protein structure determination through homology modeling, molecular mechanics force field development, de novo drug design algorithms, and the development of special-purpose hardware to accelerate computational chemistry simulations.We are eager to add both senior- and junior-level members to our world-class team (including at least one group head with management responsibilities), and are prepared to offer above-market compensation to candidates of truly exceptional ability.

Contacts:

Please send your resume (including list of publications, thesis topic, and advisor, if applicable), along with a history of academic performance (including GPAs as well as SAT, GRE, and other standardized test scores), to . SALARY $ 100,000- 150,000 depending on experience there is flexibility.
SUBMIT RESUMES TO:
Concepts in Staffing
ATT: Norm Davis
normd@cisny.com

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08/04/2003

[AG]

Postdoctoral job opening in Computational Biology

Source:

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

The Department of Biology at Boston College has available a postdoctoral position for work in the CLOTE LAB in computational biology/bioinformatics with start date June 1, 2003.

Requirements include a recent Ph.D. in computational biology/bioinformatics or strongly computational field such as computer science, mathematics, statistics, physics, chemistry. Strong programming skills are necessary, preferably in C/C++ and Python, as well as ability in mathematical modeling, probability and statistics. Current research projects in the Clote Lab include modeling of RNA and protein, functional genomics, applications of machine learning theory to bioinformatics, and mathematical evolution theory.

Boston College provides a supportive, collegial environment with good Ph.D. program in biology, close proximity for possible research collaborations with other universities in the Boston area, and a very pleasant campus ambience.

Contacts:

For more information, please contact:
Peter G. Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor of Biology and Computer Science (courtesy appt)
Boston College
Chestnut Hill, MA 02467
Email: clote@bc.edu
http://www.cs.bc.edu/~clote
http://www.bc.edu/biology
Tel: 617 552 1332
Fax: 617 552 2011

To apply please send either a hardcopy or email application.
Application materials should include a CV,names and addresses of three references. For hardcopy applications please send reprints or preprints of articles. For email applications, please email pointers to on-line articles (please do NOT email the articles).

Applications will be evaluated from now on until the position is filled.

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08/04/2003

[AG]

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)

Source:

http://www.iarc.fr/pageroot/VACANCY/RC03_1_P2_GCS.html

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)
Vacancy notice No. IARC/03/FT156

Grade: P.2
Contract Type: Fixed-term appointment
Duration: Time-limited duration of four years

Objectives of the programme:
The overall objective of the Unit of Genetic Cancer Susceptibility is the identification and evaluation of inherited genetic factors in the etiology of cancer and the interaction between environmental factors and susceptibility genes.

The successful candidate will:
- To take a lead role in programming both a genotyping & gene-resequencing database and a laboratory information management system (LIMS) that will manage interaction between laboratory robotics, sequencing and genotyping instrumentation, and the database ;
- To make sure that database and LIMS programming with the GCS Unit is compatible with systems and programs provided by the Biostatistics and Bioinformatics Unit, and collaborate in support with the Computer Services Group ;
- To collaborate with other IARC Research Units and Groups and with outside scientists in the implementation of molecular epidemiological studies and their execution ;
- To keep abreast with methodological developments in the field;
- To be expected to attend several scientific meetings each year.

Qualifications Required:
Education and Skills:
M.S. in Computer Science with documented background in Molecular Biology, or M.S. in Molecular Biology, or Biochemistry, or Biotechnology, or in a related field, with documented background in database programming experience. Ph.D. in any of the fields cited above would be an asset.

Advanced knowledge of database programming and/or laboratory robotics programming. Ability to work in a teamwork environment. Would be an asset: knowledge of Java or Microsoft.NET software platforms, and ability to draft reports and grant proposals.

Experience:
At least two years of relevant professional experience at the national level or one year at the international level. Experience in programming web browser database interfaces would be an asset..

Languages:
Good knowledge of English with a working knowledge of French.

Annual salary
(net of tax):
US$ 40191 at a single rate - US$ 42849 with primary dependents.

Post Adjustment: 27.30 % of the above figures. This percentage is to be considered as indicative since variations may occur each month either upwards or downwards due to currency exchange rate fluctations or inflation.

Applicants should complete a Personal History Form and include a photograph. Internal candidates should use Form WHO.824.

Contacts:

APPLICATIONS SHOULD BE SENT TO:

Personnel Office
IARC
150, Cours Albert Thomas
FR-69372 Lyon CEDEX 08
Fax: +33(0)4 72 73 83 35
Email: personnel@iarc.fr

NB: This Email address should ONLY be used for vacancy applications. Due to the large number of messages, any other type of correspondance may not be answered.

Applications from women are encouraged.
Any appointment/extension is subject to WHO Staff regulations, Staff Rules and Manual. Staff are subject to assignment to any office of the WHO in the world and mobility is encouraged.

Qualifications indicated in this vacancy are the minimum requirements. Candidates who are less qualified will not be considered.

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07/04/2003

[MM]

SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

15/05/2003

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/22
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg: SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany

Commencing Date: As soon as possible after closing date
Job Description: The work will involve development of graphical user interfaces (to be built on the existing modules), support of the Web and Email server, support of remote execution of ARP/wARP jobs on local mulit-processor computer cluster.

Qualifications and Experience: Applicants should have a computational background and experience in the design of GUI. Profound knowledge of C/C++, Java/Javascript, Perl, Tcl/Tk, HTML or Python programming environments is required. Some familiarity with crystallography will be of advantage.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03
EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de

Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.

Contacts:

To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/22, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003

[MM]

SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

15/05/2003

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/21
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

SCIENTIFIC PROGRAMMER & ALGORITHM DEVELOPER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY
Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hamburg, Germany Commencing Date: As soon as possible after closing date Job Description: The work will involve research, development and/or coding the software modules in the areas of information theory, estimation theory, statistical pattern recognition, neural networks for information reduction and computer learning, independent component analysis - all applied for 3-dimensional image interpretation. The emphasis is on computational techniques.

Qualifications and Experience: Programming experience and familiarity with some of the above-mentioned areas are essential.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time of the review.

Closing date: 15.05.03

EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de
Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.

Contacts:

To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/21, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003

[MM]

POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/PD/05
rev. April 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Hamburg:

POSTDOCTORAL POSITION in PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Applications are invited for a postdoctoral fellow position at the EMBL Outstation in Hamburg, Germany. The work will involve development of tools and protocols for assembling, tuning and running software modules, specifically for structure solution, improvement of crystallographic phases, automatic interpretation of electron density maps and assessment of quality of X-ray data and structural models. A background in protein crystallography and interest in methodology is essential. Emphasis will be on computational techniques. Familiarity with computer programming, statistics and mathematical algorithms is advantageous. Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants. EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.

Contacts:

To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/PD/05, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003

[MM]

Post-doctoral Postion in Structural Genomics

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Yale (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applicants are invited for a post-doctoral post in the Department of Molecular Biophysics and Biochemistry at Yale University. The position is for two years with possible extensions. Choice of project would to some degree depend on the applicant's interests and abilities, though it is expected that the research will be purely computational and will fall into the emerging field of structural genomics: classifying protein fold families in genomes, developing sequence and structure comparison techniques, and developing databases and analyses for the new genomic information. The ideal applicant would have a PhD (preferably in bioinformatics, biophysics, genetics, or computer science) and have already had some experience in one of the above-mentioned research areas. He or she would be very skilled in programming and using the computer to solve problems (e.g. experience with C/C++, perl5, SQL, HTML/java, fortran, blast/fasta, excel/word, Irix/linux, and so on).

Contacts:

Please contact Mark Gerstein for further information (MB&B Department, PO Box 208114, Bass Center, Yale University, New Haven, CT 06520, FAX 203 432 5175, Mark.Gerstein@Yale.edu).

Applicants are requested to send a CV that includes a list of publications and details of 3 references. Normal e-mail is OK for all correspondence. However, copies of official documents should follow by regular post. Further details about the position and structural genomics research at Yale can be obtained over the web at: http://bioinfo.mbb.yale.edu/genome.

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07/04/2003

[AG]

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

21/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/34
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Grade: 6 or 7, depending on age, experience and qualifications
Duty Station: Hinxton, near Cambridge, UK
Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: We are looking for a software developer or
bioinformatician to join a new Biochemical Compound Database project at the EBI. The EBI is home to the world class bioinformatics resources, such as the EMBL-Bank, SWISS-PROT + TrEMBL, InterPro, Macromolecular Structure Database (MSD), Gene Ontology (GO), IntEnz database of Enzyme Nomenclature and IUPHAR Receptor Database.

The successful applicant will contribute to our efforts in developing a database of biochemical compounds, focussed on the metabolites and ligands in living cells. The goal is to create a definitive open resource of biochemical terminology and structure for consistent use by other EBI services and groups. The post-holder will take responsibility for the design and development of database and web applications. She/he is also expected to make a scientific contribution to the future expansion of activities in this area.

Qualifications and Experience: Applicants should hold a masters (or higher) degree in Bioinformatics or Computer Science, plus some post-graduate or employment experience in chemoinformatics or bioinformatics. The candidate should be proficient in object-oriented programming languages (preferably Java). Experience with relational database management systems and/or commercial chemical databases would be an advantage.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 21.04.2003

EMBL WWW pages: http://www.embl-heidelberg.de/ and
http://www.ebi.ac.uk/
EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation. Please note that EMBL does not return CVs or attached documents to applicants.

Contacts:

Please send a CV and covering letter, including names and addresses of referees, quoting ref. no. 03/34, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, D-69012 Heidelberg, Germany
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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06/04/2003

[MM]

Post-doctorants CDD 18 moisINRA

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

15/04/2003

Lieu:

Jouy-en-Josas (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'INRA recrute 40 post-doctorants sur des contrats à durée déterminée (18 mois) (voir le site http://www.inra.fr/drh rubrique "L'INRA recrute 40 post-doctorants").

Il n'y a aucune condition de nationalité. Les dossiers sont à rendre pour le 15 avril.

Notre unité, en collaboration avec l'unité Neurobiologie de l'Olfaction et de la Prise Alimentaire (NOPA) (également située sur le centre de recherche de Jouy-en-Josas) propose un sujet de post-doctorat ayant trait à la modélisation moléculaire de récepteurs olfactifs (qui sont des récepteurs à 7 segments transmembranaires couplés aux protéines G). Brièvement, il s'agit de modéliser certains récepteurs olfactifs d'intérêt pour l'unité NOPA et de tester la fixation de familles d'odorants sur ces récepteurs par des techniques d'amarrage moléculaire (docking). Les ligands potentiels seront ensuite testés expérimentalement.

Contacts:

Pour plus d'information, les personnes intéressées sont priées de me contacter, le plus tôt possible, à l'adresse indiquée ci-dessous.

Jean-Francois Gibrat Tel: +33 (1) 34 65 28 97
Mathematique Informatique et Genome, Fax: +33 (1) 34 65 29 01
Institut National de la Recherche Email: gibrat@jouy.inra.fr
Agronomique, Domaine de Vilvert,
Jouy-en-Josas 78352 cedex, France

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06/04/2003

[AG]

bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS INRIA-UHP-INPL recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses étant réalisées au MAEM.

Contacts:

Réponse nécessaire avant le 10 avril 2003 à adresser à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 : Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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06/04/2003

[AG]

BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le groupe Bionformatique de l'Institut Curie recrute :

UN BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat travaillera à l'analyse des données génomiques (séquences, puces, réseaux génétiques) issues des différentes plate-formes technologiques de l'Institut et de ses partenaires. Son implication couvrira le développement des aspects méthodologiques, leur implémentation informatique et les analyses proprement dites.

Compétences :
- Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (analyse de séquences, analyses des données de puces)
- Modélisation et analyse de données
- Maîtrise des packages mathématiques et statistiques classiques (R/S+, Mathlab, Spotfire …)
- Maîtrise d'un langage de programmation (C/C++, Java, Perl …)
- Expérience des environnements Unix et Windows
- Anglais courant

Formation souhaitée : Ingénieur Grande Ecole ou 3ème cycle

Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Personne à contacter, en précisant la référence BI2 :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie Section Recherche
Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

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06/04/2003

[AG]

Postdoc modélisation des réseaux de gènes

Source:

BioInfo

Date de parution:

13/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la campagne de recutement de post-doc par
l'INRA (http://www.inra.fr/drh), notre UMR propose, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes (équipe Helix) un sujet sur la modélisation des réseaux de gènes.

Nous développons une puce à ADN dédiée la bactérie Buchnera,
symbiote du puceron. Le but du travail sera de réaliser une première application consistant à étudier des réseaux de régulation identifiés chez Buchnera. L'accent sera particulère mis sur le métabolisme des acides aminés pour lequel l'UMR BF2I possède une expertise aux plans biochimiques et physiologiques. Plus généralement, ce travail permettra de compléter la panoplie d'outils bioinformatiques proposés dans la plate-forme Génostar en permettant notamment l'analyse des transcriptomes bactériens.

Les personnes intéressés, jeunes docteurs bioinformaticiens -informaticiens ayant acquis une expérience dans la modélisation des réseaux sont priés de me contacter rapidement.

Contacts:

Jean Michel FAYARD: jmfayard@insa.insa-lyon.fr

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06/04/2003

[AG]

Poste de professeur en génétique & bio-informatique

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

21/03/2003

Lieu:

Toulouse (31) (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Poste de professeur en génétique & bio-informatique à l'Université de Toulouse
Section 65, Emploi nº 1312, analyse des génomes.
Date limite de dépôt des candidatures : 21 mars 2003

Profil Recherche :
Le LMGM souhaiterait accueillir un Professeur de Génétique pour créer une équipe s’intéressant à une thématique à l’interface de la Génétique et de la Bio-informatique centrée sur l’Analyse des Génomes et la Génomique Evolutive des Procaryotes. Cette thématique s’intégrerait parfaitement au sein de l’UMR 5100, la nouvelle équipe venant en complément de six (des neuf) équipes du LMGM qui développent leurs projets dans le cadre de deux (des trois) thématiques majeures de l’Unité, ‘‘Organisation et Dynamique du Génome’’ et ‘‘Plasticité Génétique’’.

Profil Enseignement :
La révolution de la Génomique élargit le champ d'investigation en Génétique. Il est impératif que notre université recrute un collègue capable de manier et enseigner les concepts et les méthodes de cette discipline d'avenir qu’est la Génomique. Le remplacement de Jean-Michel Louarn offre l'occasion d'ouvrir ce nouveau champ, par le recrutement d'un collègue travaillant à l'interface de la génétique et de la bio-informatique dans l’Analyse des Génomes et dans la Génomique Evolutive. Ce collègue devrait pour partie renforcer les enseignements déjà assumés par la commission pédagogique de Génétique. Il lui sera bien entendu également demandé de développer l'aspect Génomique Evolutive en s’appuyant sur les données de séquence génomique complète de très nombreux organismes procaryotes (plus de 80 répertoriés à ce jour) appartenant à des branches évolutives différentes.

Contacts:

Les candidats intéressés sont priés de contacter le Directeur du LMGM :

Jean-Pierre Claverys
UMR5100 CNRS-Université Paul Sabatier
Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires
118 route de Narbonne
31062 Toulouse Cedex
France
tel. 05 61 33 58 55 (from outside France: 33 561 33 58 55)
05 61 33 59 11 (from outside France: 33 561 33 59 11)
fax 05 61 33 58 86 (from outside France: 33 561 33 58 86)
05 61 33 58 61 (from outside France: 33 561 33 58 61)
claverys@ibcg.biotoul.fr (e-mail)
http://www-ibcg.biotoul.fr/recherche.html

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06/04/2003

[AG]

Stage post-doctoral en génomique végétale

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de publication de l'offre : février 2003
Entreprise : Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS

Lieu : 2 rue Gaston Crémieux
CP 5708
91057 Evry

Description de l'activité de l'entreprise : L'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) est localisée sur le site du Genopole d'Evry. Cette unité récemment implantée et spécialisée dans la Génomique des Plantes, est une unité mixte INRA/CNRS (UMR 8114). L'URGV occupe une superficie de 1000 m2 scindée en 2 laboratoires. Un premier laboratoire de 500 m2 se trouve dans le même bâtiment que le Genoscope, le second laboratoire étant dans le bâtiment du Centre National de Génotypage (CNG). L'URGV est équipée d'outils performants pour les manipulations "haut débit" (robots, arrayer, etc.). Nous collaborons étroitement avec le Genoscope et le CNG pour des projets impliquant le séquençage et le génotypage respectivement. L'objectif principal de l'Unité est de développer et d'appliquer des approches modernes en génomique pour l'étude des plantes modèles ou d'intérêt agronomique (voir site web:
www.evry.inra.fr/)

Description du poste : Génomique comparée entre Vitis vinifera et Arabidopsis thaliana.

De nombreux caractères sont importants pour la production de raisins de cuve, qu'ils soient liés à la qualité ou à la résistance aux agents pathogènes. Or, leur analyse est ralentie par le long temps de génération de cette espèce pérenne. En revanche, la petite taille du génome de Vitis vinifera (475 Mb) est un avantage pour le développement d'approches génomiques. La construction d'une carte physique du génome de la vigne a donc été initiée à l'UMRGV avec la construction d'une banque BAC d'ADN de Cabernet Sauvignon clone 412 (44 900 clones, taille moyenne des inserts de 145 kb, au moins 13 équivalents génome), un programme d'ancrage de STS sur ces clones BAC (séquence des deux extrémités de 15 000 à 20 000 BACs). En parallèle, des stratégies vont être développées dans l'objectif d'utiliser les données obtenues sur la plante modèle Arabidopsis pour accélérer les recherches sur la vigne. Dans ce cadre, nous souhaitons évaluer dans quelle mesure la connaissance de la séquence du génome d'Arabidopsis pourrait aider à la construction de la carte physique du génome de la vigne en combinant des approches bioinformatiques et de cartographie physique. Le stage implique des interactions entre l'équipe travaillant sur l'organisation des génomes de plantes cultivées (blé, colza, peuplier et vigne), et l'équipe bioinformatique, qui regroupe de façon unique des compétences en analyse des génomes, annotation, construction de bases de données et interfaçage.

Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003

Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable 1 fois

Contacts:

Contact : Anne-Françoise Adam-Blondon
Tél.: +33 (01) 60 87 45 34
adam@evry.inra.fr

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06/04/2003

[AG]

POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Au sein d'une équipe de recherche en génétique statistique (INSERM-Université d'Evry), située sur le campus de génomique d'Evry, le(la) candidat(e) participera à un programme de recherche visant à mettre en évidence des facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans des maladies humaines (asthme, mélanome malin) par des analyses statistiques de données familiales (analyses classiques et analyses propres à la génétique)

Missions:
- contribuer à la gestion de données à l'aide de procédures/programmes informatiques
- effectuer des analyses statistiques de données (univariées et multivariée) à l'aide de logiciels statistiques
- contribuer au développement de procédures et programmes
informatiques pour faciliter la manipulation et l'analyse des données.

- contribuer aux analyses génétiques des données à l'aide de logiciels propres à la génétique

Compétences
- Niveau Maîtrise ou DEA/DESS en biostatistique/informatique/épidémiologie
- Maîtrise des environnements informatiques Windows et UNIX (procédures shell)
- Connaissances des logiciels classiques de statistique (SAS, STATA)
- Connaissances en programmation informatique (Fortran, Pascal, C, shell, perl)
- Connaissances de logiciels utilisés en épidémiologie génétique ou volonté de les acquérir.

Aptitudes: Rigueur dans le travail, fiabilité, communication, capacité d'autonomie, disponibilité

Salaire:
- Niveau Ingénieur d'Etude INSERM/Université (à partir de 1 800 Euros brut par mois) à déterminer en fonction de la qualification et des compétences du candidat
- Contrat à Durée Déterminée (un an et renouvelable)

Contacts:

Florence DEMENAIS
INSERM EMI 0006
Tour Evry 2
523 Place des Terrasses de l'Agora
91034 EVRY
Tél : 01 60 87 38 26
Fax : 01 60 87 38 48
Mél : demenais@evry.inserm.fr

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06/04/2003

[AG]

professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Departement de Biologie de l ENS-Paris cherche a recruter un professeur animant recherche et enseignement sur le theme: Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques. Celui ci devra mener ses recherches au sein du Departement de Biologie en interaction avec les groupes des Departements de Physique et Informatique.

Contacts:

Contacts: A Prochiantz Directeur du Departement de Biologie, prochian@biologie.ens.fr, A Feltz, pour la CS de Biologie 27-28, feltz@biologie.ens.fr

Claude Jacq
Laboratoire de Genetique Moleculaire
CNRS UMR 8541
Ecole Normale Superieure
46 rue d Ulm
75230 PARIS Cedex 05

Tel: 33 1 44 32 35 46 (office)
33 1 44 32 35 70 (secretariat)
mobile: 33 (0)6 61 76 28 98
Fax: 33 (0)1 44 32 37 30 http://www.biologie.ens.fr/microarrays.html

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06/04/2003

[AG]

professeur de bioinformatique

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lille (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la création de l’Institut de Recherches Interdisciplinaires à Lille (http://www.dr18.cnrs.fr/iri/index.htm), l’Université de Lille 1 cherche à recruter un professeur de bioinformatique dont les travaux de recherche concernent l’analyse des séquences régulatrices, le développement de banques de données pour l’étude des réseaux de régulation transcriptionnelle. Des moyens seront alloués pour permettre au candidat retenu de développer une équipe de recherche en collaboration avec les équipes de mathématiciens, de bioinformaticiens et de biologistes de la Génopole de Lille. Chargé de mission pour la création de l’IRI : Bernard Vandenbunder (Bernard.Vandenbunder@ibl.fr)
CNRS UMR 8117 / Institut Pasteur de Lille / Université de Lille 1 Institut de Biologie de Lille 1 rue Calmette BP 447 59021 Lille Cedex (France) Tel : (33) 3 20 87 10 90 Fax : (33) 3 20 87 11 11

Contacts:

Nom de la personne à contacter pour l’enseignement : Hélène Touzet
(touzet@lifl.fr)
Nom de la personne à contacter pour la recherche : Jean Marc Geib
(geib@lifl.fr)
Le profil complet du poste se trouve à l’adresse suivante : http://www.univ-lille1.fr/personnels/recrutement/informations.htm

06/04/2003

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

France (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

La liste des laboratoires retenus pour l'accueil des 210 postdocs CNRS est disponible à l'adresse suivante

Contacts:

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06/04/2003

[AGMM]

poste de maître de conférences en Bioinformatique

Source:

Date de parution:

11/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'INSA de Lyon propose un poste de maître de conférences en Bioinformatique dont les profils recherche et enseignement sont détaillés ci-après (ces profils sont disponibles sur le site de l'insa : http://www.insa-lyon.fr/recrutement/0095.pdf).

Le maitre de conferences recruté integrera l'equipe "systèmes autonomes" du laboratoire PRISMa pour renforcer son axe bioinformatique et modélisation. Ce groupe travaille en étroite collaboration avec des biologistes de l'INSA et de l'université Claude Bernard Lyon I pour proposer des modèles individus-centrés de systèmes biologiques sur la base d'approches bio-inspirées telles que la vie artificielle, les algorithmes génétiques, les réseaux neuromimétiques récurrents ou les animats. Les condidats devront donc disposer de compétences dans ces domaines ainsi qu'en modélisation et simulation, si possible appliquées à la biologie, à la génétique ou à la modélisation cellulaire.

Profil enseignement :
Le candidat sera amené a effectuer son enseignement au département premier cycle et au département informatique de l'INSA de Lyon. Au sein du département informatique, il intégrera les équipes pédagogiques "développement logiciel" et "informatique décisionnelle".

Contacts:

Contact recherche :
Joel Favrel : jfavrel@if.insa-lyon.fr (04.72.43.83.63) Jean-Michel Fayard : jmfayard@insa.insa-lyon.fr (04.72.43.60.01)

Contact enseignement :
Jean-Marie Pinon : jmpinon@if.insa-lyon.fr (04.72.43.84.81) Yves Jayet : yves.jayet@insa-lyon.fr (04.72.43.83.84)

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06/04/2003

[AGMM]

Site Post-docs Sciences de la vie et de la santé (INSERM)

Source:

Date de parution:

02/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le site Post-docs Sciences de la vie et de la santé vient d'être ouvert par l'INSERM à l'adresse suivante :
http://www.inserm.fr/postdocs/postdocs.nsf

Ce site permet de pouvoir mettre en contact des candidats aux postes de Chargés de Recherche avec des laboratoires qui en recherchent, d'obtenir des informations sur les différents programmes de l'INSERM...

Contacts:

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06/04/2003

[AGMM]

Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline

Source:

Date de parution:

04/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Philadelphie (Etats-Unis)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Subject: Three Summer Student Positions, Scientific Computing, GlaxoSmithKline

Summer student positions in scientific computing at GlaxoSmithKline

GlaxoSmithKline (GSK) is a world leading research-based pharmaceutical company with a powerful combination of skills and resources to provide a platform for delivering strong growth in today's rapidly changing healthcare environment. GSK's mission is to improve the quality of human life by enabling people to do more, feel better and live longer. GSK has

over 100,000 employees worldwide and over 16,000 are in R&D. GSK R&D is based at 24 sites in seven countries. The company has a leading position in genomics/genetics and new drug discovery technologies.

The Scientific Computing and Mathematical Modeling group has three summer student positions available in our state-of-the-art facilities in Upper Merion (near Philadelphia), PA and in Research Triangle Park (RTP), NC. The Scientific Computing and Mathematical Modeling group applies mathematical and computational techniques to a variety of challenging problems in pharmaceutical research.

Position 1 (REQ# 9056) – parallel programming (Upper Merion, PA). Develop parallel programming tools for a Beowulf cluster. Develop parallel versions for various simulation and optimization algorithms. Minimum requirements: Master/PhD student in Computer science or related field with experience in parallel programming and scientific computing. Experience with large C/C++ programs and knowledge of MPI is required. Experience with Matlab is a plus.

Position 2 (REQ# 9061) – biochemical pathway reconstruction (Upper Merion, PA). Experiment with existing algorithms and develop new ones for pathway reconstruction from expression data. Minimum requirements: Master/PhD student in Numerical Analysis/Scientific Computing with experience in optimization algorithms, knowledge of dynamical systems, inverse problems and regularization techniques. Good programming skills – preferably in Matlab. Knowledge of biology is not required but is a plus.

Position 3 (REQ# 9063) – animation/scientific visualization (RTP, NC). Develop tools for animating dynamical systems such as biochemical pathways or chemistry kinetics. The animated movies created using these tools should help demonstrate some of the complex interactions and nonlinear behaviors of the dynamical system studied. Minimum
requirements: Master/PhD student in Computer Science, Scientific Computing or related field. Experience with animation and/or scientific visualization. Knowledge of VRML or Matlab is a plus.

We are looking for individuals who can successfully integrate sophisticated mathematics and computer software with biological problems. We seek someone who has the motivation to solve real-world problems. Interactions will often be with a larger team composed of other computational scientists and R&D researchers. Excellent communication skills are required. Exceptionally talented undergraduate students also will be considered for all three positions.

Contacts:

You can apply by visiting our website: http://www.gsk.com/careers and reference the appropriate REQ#

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02/04/2003

[AG]

Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department

Source:

BioJobs

Date de parution:

02/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

A postgraduate studentship is available from Oct 2003 in the Computer Science Department for research in Data Mining and Knowledge Discovery in Bioinformatics. Applications are sought from candidates with a good honours degree in a biological subject and from candidates who expect to graduate in the summer of 2003. Previous experience using standard bioinformatics tools and in developing new approaches and methods would be useful.The studentship is funded by Science Foundation Ireland and the research will focus on the development of Machine Learning and Data Mining techniques for application in Bioinformatics.

Contacts:

Further details are available from Prof. Pádraig Cunningham or Dr. Nadia Bolshakova (Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie). Applicants should send a full CV to Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie before 25th April.

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28/03/2003

[AG]

Ingénieur de recherche CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Mission :
L'ingénieur de recherche a en charge de concevoir, développer et déployer les méthodes et outils bioinformatiques d'intégration et d'analyse des données issues des plate-formes de génomique à haut débit, en vue de leur exploitation au sein des programmes de recherche de l'unité et de l'Institut. Il mènera sa mission en concertation étroite avec les biologistes de l'unité, les médecins et les bioinformaticiens de l'Institut.

Activités :
- Analyser les besoins dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges, en relation avec l'ingénieur de la plateforme de génomique fonctionnelle (en cours de recrutement) ;
- Développer des solutions méthodologiques aux problèmes d'analyses à haut débit ;
- Implémenter et mettre en service ces solutions (déploiement, formation) ;
- Intégrer les données génomiques et phénotypiques publiques et privées nécessaires aux analyses ;
- Participer aux analyses de données en relations avec les biologistes et médecins ;
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine ;
- Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en Suvre des techniques bio-informatiques.

Compétences :
- Avoir de bonnes connaissances de la biologie cellulaire et des grands principes qui régissent le fonctionnement des cellules ;
- Avoir une formation approfondie en bio-informatique (diplôme d'ingénieur ou 3ème cycle universitaire) ;
- Avoir une expérience de l'environnement UNIX, des langages Java, C/C++, Perl, PHP, SQL et une pratique des architectures client/serveur ;
- Avoir une expérience dans la gestion et l'analyse de gros volumes de données scientifiques ;
- Avoir une pratique des bases de données, outils d'analyse et concepts de la bioinformatique ;
- Maîtriser l'anglais scientifique à l'orale et à l'écrit ;
- Aptitude à la communication ;
- Travailler en équipe.

Contexte :
Travail au sein de l'UMR 144 CNRS - Institut Curie, en étroite collaboration avec le service Bioinformatique de l'Institut Curie, les plate-formes de transcriptome, CGH, protéome et génotypage, ainsi que d'autres unités du Campus participant au site Mte Ste Geneviève du Génopole Ile de France.

Contacts:

Voir http://www.sg.cnrs.fr/drhita/concoursita/2003/02_consulter.htm
et en bas de la page demander à voir le concours n°3

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28/03/2003

[AG]

professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière

Source:

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un poste de professeur en bio-informatique (0122 s) est ouvert au
recrutement à l'université Paris 6 en 27e section (informatique).

La recherche sera effectuée à l'Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière.

L'enseignement sera dispensé à l'UFR d'informatique.

Le profil complet du poste est disponible à l'adresse www.lip6.fr

Contacts:

Recherche : Dominique MAZIER, Unité INSERM 511, Pitié-Salpêtrière, 0140779736

Enseignement : Mme la Directrice de l'UFR informatique :
DirUfr@ufr-info-p6.jussieu.fr

Présidente de la commission de spécialistes 27e section : Anne.Doucet@lip6.fr

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28/03/2003

[AG]

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics

Source:

ABG-7697-2

Date de parution:

21/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics : Development of Statistical Strategies and Tools - Evry, France

Date de debut de diffusion du poste : 21/03/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/06/2003

Aventis Pharma, in partnership with the European Commission, offers 2 Marie Curie Industry Host Fellowships, for a 2 year period, on a project focused on the development of statistical strategies for the analysis of case-control pharmacogenetic data. The methods will enable the discovery and consequently the diagnosis of genetic polymorphisms underlying factors such as drug response, drug toxicity, and disease state and severity.

Based at the Evry Genetics and Pharmacogenetics Center,your roles will be to :

- Develop single-and multi-point linkage disequilibrium methods, with special reference to issues such as control sample selection and genomic control, marker selection, haplotype construction and analysis,and multiple testing.

Candidates should have experience in a field such as mathematics, statistics, population genetics, or genetic epidemiology. Fluency in English is required. The positions are open to members of the E.C. or residents of associated countries* for more than 5 years. You must hold a PhD. The age limit at the time of selection is 35 years old.

* Austria, Belgium, Bulgaria, Czech republic, Denmark, Estonia, Finland, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Israel, Italy, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, The Netherlands, Norway, Poland, Portugal, Republic of Cyprus, Romania, Slovakia, Slovenia, Sweden, Spain, and United Kingdom. However French citizens are ineligible as well as those who have been resident in France for more than 12 out of the last 24 months.

Employment Conditions

Field of application
The Marie Curie Post-Doc Fellows are recruited on a fixed-term contract. Aventis has been selected by the European Commission as a hosting institution able to deliver research training for post-doctoral researchers.

Salary and benefits
The annual scales are normally within the range of 30 to 39 k€ depending on the age and experience of the scientist.

Post-doctoral fellows are entitled to elect and participate in the Aventis French benefits as offered to regular full-time associates. This includes: medical and/or dental insurance, healthcare and dependant care reimbursement accounts.

Relocation
In regard to the household goods, Aventis DI&A Paris will reimburse the candidate as follow: up to 600 € for a single person up to 900€ if the Post doc fellow comes with his/her spouse. up to 200€ per child

Mobility allowances
The post doc fellow will receive a monthly mobility allowance of 400 € (as agreed with the EC) all along his/her assignment.

Airfare
Economy airfare will be provided to work site from home and a return economy flight home completion of the post-doc assignment.

Housing accommodations
The company will pay for furnished lodging accommodations for up to 15 days at the post doc fellow arrival in France. In order to help the Post-doc fellow to find a suitable housing, relocation counselor provided by Aventis will be available to discuss the details on housing arrangements. If needed, support will also be provided to open bank account in France and for administrative steps.

French lessons
Aventis will help all post-doctoral fellows who will express the wish to be trained in French. According to their French language knowledge, the most appropriate course will be given. Two 40 hour-package can be offered by Aventis and if necessary additional courses could be given by the “Alliance Francaise”.

Working hours
In application of the agreements on the organization and duration of work in force within the company, working time consists of an average of 35 hours effective work per week over the year.

Vacations
Employees at Aventis are eligible for 31 vacation days for a full period (i.e.12 months), more 14 days off in application to the 35 hours agreement (RTT days) for a full period.

Contacts:

Written details and letters of application for both positions, together with CVs and the names of two referees should be sent to :

Dr. JF Deleuze, Director of the Evry Genetics Center, Aventis Pharma, 2, rue Gaston Cremieux, 91057, Evry, France.
Tel: 33 1 58 93 90 01, Fax: 33 1 58 93 90 10, e-mail : jean-francois.deleuze@aventis.com

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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23/02/2003

[AG]

Data Analysis Scientist

Source:

Date de parution:

23/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Ankeny (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Monsanto values diversity and is an equal opportunity affirmative action employer.

Department: Technology Development
Title: Data Analysis Scientist
Req Number: mons-00000893
Location(s): Ankeny IA

Responsibilities:
The successful candidate will be part of a Data Analysis team within our plant breeding organization. The individual in this role will be analyzing molecular marker data sets and crop trial data, this implies: Test procedures through simulations and validations methods to help optimize research strategies. Develop analysis tools and routines to be used by other researchers in the organization. Apply current and new statistical tools to the analysis of experiments. Design and propose experiments, based on analysis results and/or new technological developments.

Required Skills:
A Ph.D. in bioinformatics, statistics, statistical genetics, or in a related discipline with a solid statistical training is required. The candidate should demonstrate ability to work as a team member, have good communication skills, be creative at problem solving, and be detailed-oriented.

Consideration will be given if the candidate could demonstrate any of the following skills: Computer programming as well as building, querying, and managing large databases. Prior exposure to quantitative and population genetics, and the application of molecular markers to large/complex pedigrees. Experience with simulation procedures and Bayesian analysis.

Contacts:

http://sh.webhire.com/Public/554/jd1224976.html

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21/02/2003

[AGMM]

Postdoctoral Positions, Computational Cell Biology

Source:

SMB

Date de parution:

21/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

La Jolla (Californie) (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

POSTDOCTORAL POSITIONS IN COMPUTATIONAL CELL BIOLOGY
at The Scripps Research Institute, La Jolla, CA

Starting August 2003, we have several openings in our research program on computational cell biology, which is part of the new TSRI Center of Integrative Molecular Biosciences (CIMBio). The mission of CIMBio is to foster multidisciplinary studies of molecular machines, with the aim of determining their structure, their mechanism of action, and their dynamic behavior in the context of living cell. Specifically, our lab is working on biophysical modeling of cell migration and chromosome segregation and on using these systems to test the applicability of advanced quantitative live cell microscopy in conjunction with computational data analysis and interpretation to build high-content screens for genetic and molecular function. A long-term goal of this research is to study the molecular mechanisms of diseases like cancer and the application of live cell imaging and modeling to drug discovery. The lab collaborates with first class cell imaging and molecular biology labs within CIMBio and at the MIT in Cambridge, MA. Joint work with biologist and microscopists in an open lab environment will be an essential component of this research, and upon preference of the candidate, substantial effort can be spent on own experimental work.

Requirements:
Ph.D. degree in Biophysics, Applied Math, Mechanical/Electrical Engineering, or Computer Science, preferably with preliminary experience in applying these disciplines to biological research questions. Applications from cell and molecular biologists who wish to learn computational and modeling techniques are equally welcome.

Contacts:

Applicants should email a CV, publication list and a summary of ongoing and future research plans and at least 2 reference letters.
Email to: danuser@biomech.mavt.ethz.ch
More info: http://cimbio.scripps.edu/groups/Danuser/

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20/02/2003

[AG]

Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)

Source:

AGM2

Date de parution:

20/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Hertfordshire (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for 2 postdoctoral fellowships in the group of Kim Hammond-Kosack studying Fusarium ear blight and mycotoxin control in Europe’s Cereal Crops. Our studies employ a wide range of techniques from plant pathology, molecular biology, bioinformatics, wheat genetics and functional genomics (http://www.iacr.ac.uk/ppi/wptop.html).

One post-doc fellow will be in charge of the bioinformatics analysis of the plant’s response to Fusarium ear blight infection in both susceptible and resistant wheat cultivars. The second post–doc will be in charge of the bioinformatics analysis of the Fusarium graminearum genes expressed in planta, during the invasion of susceptible and resistant wheat cultivars.

Both posts will take advantage of Monsanto’s proprietary wheat EST collection and transcriptome profiling data sets, specifically generated for these project. In addition, there are growing public wheat ESTs collections and in 2003 the entire F. graminearum genome will be sequenced at the Whitehead Institute, Boston, USA.

Candidates should have a strong background in bioinformatics and molecular biology. An interest in fungal biology/host-pathogen interactions is desirable but not essential. Collaboration and teamwork are essential to this position. Candidates should also show excellent interpersonal skills.

The work will be based in the new Centenary laboratory at Rothamsted Research, with access to first class molecular and analytical facilities, bioimaging, controlled environments and new glasshouses.

Eligible candidate for these 2 posts must be under 35 years of age, have obtained their Ph. D. degree within the last 5 years, hold a European passport and have not worked previously in the UK.

Contacts:

Applications, including a detailed CV, a brief summary of research interests, the names and addresses of three referees, should be addressed to Dr Kim Hammond-Kosack, Rothamsted Research, Plant-Pathogen Interaction Division, Harpenden, Hertfordshire, AL5 2QJ, UK. Tel 44(0) 1582 763133 Ext 2240, Fax 44(0) 1582 715009. E. mail kim.hammond-kosack@bbsrc.ac.uk.

Rothamsted Research is situated 30 Km north of London, England and has excellent links to the major motorway, rail and air routes. This government institute with approximately 500 staff undertakes basic and strategic research on sustainable plant-based agriculture and the environment.

Both positions are available April 2003-March 2005 and are funded under EU Framework V.

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20/02/2003

[AGMM]

Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot

Source:

Date de parution:

20/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Le groupe Swiss-Prot (http://www.expasy.org/sprot) de l’Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.isb-sib.ch/) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de levures (S. cerevisiae, S. pombe, etc..) dans la base de données Swiss-Prot .

Le projet a pour but une annotation de qualité des protéomes de levures. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l’annotation manuelle des protéines. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

Nous offrons ce poste au sein d’une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s’intégrerait avec plaisir dans ce cadre. D’autre part, ce travail implique une collaboration étroite avec l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI) (http://www.ebi.ac.uk/), Hinxton, UK, et nécessitera des déplacements réguliers à l’étranger.

Conditions indispensables :
Biologiste ou biochimiste, expert en biologie des levures. Bonne connaissance de l’anglais. Travail à temps complet. Nationalité : suisse ou permis C. Bonne motivation pour travail en équipe. Motivation claire pour Swiss-Prot.

Contacts:

Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu’au 31 mars 2003, à :
Claudia Sapsezian
Levure
Institut suisse de bioinformatique
CMU
1, rue Michel-Servet
1211 Genève 4
Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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20/02/2003

[AGMM]

Predoctoral and postdoctoral informatics traineeships

Source:

http://www.cbmi.upmc.edu/training-2003.htm

Date de parution:

18/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Pittsburgh (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Center for Biomedical Informatics at the University of Pittsburgh expects to have openings for predoctoral and postdoctoral informatics traineeships beginning in the summer of 2003. The Pittsburgh Biomedical Informatics Training Program has more than 60 core and affiliated faculty members with expertise in:

Knowledge-based systems, medical artificial intelligence, biosurveillance
Simulation and modeling of complex phenomena in biology and health care
Information system development, software, and knowledge engineering
Information retrieval, problem solving, and cognition
System evaluation, social/organizational factors, and health services research
Machine learning, data mining, and knowledge discovery
Image processing, integration, and distribution
Enterprise computing: integrated architectures and clinical and biomedical applications of the Internet
Bioinformatics