Les offres Post-DEA de l'association

	Date	Statut	P/P	Titre	Pays
	21/11/2006	Thèse	public	PhD studentship in Bioinformatics	Angleterre, Grande-Bretagne
	31/10/2006	???	prive	broadcasting	Ontario
	30/06/2005	Postdoc	prive
	30/06/2005	Postdoc	prive	Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites	France
	30/06/2005	Postdoc	prive	Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis	France
	29/11/2004	Postdoc	public
	13/12/2003	???	prive
	13/12/2003	???	prive
	06/11/2003	CDD	public	Research Fellow/Assistant
	05/11/2003	CDD	public	Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics	France
	05/11/2003	CDI	public	Senior Bioinformatics Positon at the FMI	Suisse
	05/11/2003	ATER	prive	Bioinformaticien (poste ATER)	France
	21/10/2003	CDI	prive	Bioinformatics Research Scientist	Etats-Unis
	09/10/2003	Postdoc	public	2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)	Canada/Quebec
	09/10/2003	CDI	prive	BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
	09/10/2003	Postdoc	prive	motif discovery algorithm/statistics	Etats-Unis
	18/09/2003	Thèse	public	three PhD positions in Bioinformatics	Australie
	18/09/2003	Postdoc	public	Post-doctoral position in microarray data analysis	Suisse
	03/09/2003	Postdoc	public	RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS	Grande-Bretagne
	02/09/2003	CDI	public	Bioinformaticien confirmé	France
	11/08/2003	Maître de Conférence	public	RESEARCH POSITION	Canada/Quebec
	03/08/2003	CDI	public	Chef de projet bioinformatique au Genoscope	France
	03/08/2003	Thèse	public	Bourse de These en Microbiologie	France
	03/08/2003	Postdoc	public	bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis	France
	03/08/2003	CDD	prive	Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)	France
	03/08/2003	CDI	prive	Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS	Etats-Unis
	26/06/2003	Maître de Conférence	public	MC de bioinformatique	France
	23/06/2003	CDD	public	Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie	France
	23/06/2003	CDI	prive	Computational Biologist	Etats-Unis
	10/06/2003	CDD	public	CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster	France
	10/06/2003	Postdoc	public	Research Associate in biostatistics and	Grande-Bretagne
	10/06/2003	Postdoc	public	Postdoctoral Position at MIPS	Allemagne
	10/06/2003	Postdoc	public	Biologist	Suisse
	10/06/2003	CDD	prive	CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services	Allemagne
	10/06/2003	Postdoc	prive	2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy	Etats-Unis
	21/05/2003	Postdoc	public	Postdoc modele « plante virtuelle »	France
	21/05/2003	CDI	public	charge de cours en bioinformatique	Belgique
	21/05/2003	Postdoc	public	Postdoc	Etats-Unis
	24/04/2003	CDD	public	chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD	France
	24/04/2003	Postdoc	public	computational biology/bioinformatics	Etats-Unis
	18/04/2003	CDD	public	Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique	France
	17/04/2003	CDI	public	INFORMATICIEN CHEF DE PROJET	France
	14/04/2003	CDI	public	Computer Biologist - Metabolic Disease Group	Grande-Bretagne
	14/04/2003	CDI	public	Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation	Grande-Bretagne
	08/04/2003	Postdoc	public	Postdoctoral job opening in Computational Biology	Etats-Unis
	08/04/2003	CDD	prive	Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)	France
	07/04/2003	CDD	public	SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE	Grande-Bretagne
	06/04/2003	Postdoc	public	bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS	France
	06/04/2003	CDI	public	BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN	France
	06/04/2003	Postdoc	public	Postdoc modélisation des réseaux de gènes	France
	06/04/2003	CDI	public	Poste de professeur en génétique & bio-informatique	France
	06/04/2003	Postdoc	public	Stage post-doctoral en génomique végétale	France
	06/04/2003	CDD	public	POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM	France
	06/04/2003	CDI	public	professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques	France
	06/04/2003	CDI	public	professeur de bioinformatique	France
	02/04/2003	Thèse	public	Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department	Irelande
	28/03/2003	CDI	public	Ingénieur de recherche CNRS	France
	28/03/2003	CDI	public	professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière	France
	28/03/2003	Postdoc	prive	Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics	France
	23/02/2003	CDI	prive	Data Analysis Scientist	Etats-Unis
	20/02/2003	Postdoc	public	Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)	Grande-Bretagne
	16/02/2003	???	public	Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute	Grande-Bretagne
	06/02/2003	Postdoc	public	STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE	Canada/Quebec
	06/02/2003	Postdoc	public	Plant Genomics Research Unit PostDoc	France
	06/02/2003	CDD	public	annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana	France
	30/01/2003	CDD	public	8 postes	Allemagne
	29/01/2003	CDI	public	Molecular Database Indexer	Canada
	15/01/2003	Postdoc	public	Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques	France
	15/01/2003	CDI	prive	BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST	France
	02/01/2003	CDD	public	BioInfomaticien stockage et analyse de données	France)
	08/12/2002	Postdoc	public	7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes	France
	08/12/2002	CDD	public	BioInformaticien	France
	03/12/2002	Postdoc	public	Postdoctoral position : Genomique bacterienne	France
	18/10/2002	CDI	prive	IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER	Grande-Bretagne
	30/09/2002	ATER	public	2 1/2 postes ATER vacants	France
	26/09/2002	Postdoc	public	2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV	Etats-Unis
	16/09/2002	Postdoc	prive	Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc	Grande-Bretagne
	30/08/2002	Postdoc	public	Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows	Japon
	07/08/2002	Thèse	public	Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments	France
	07/08/2002	Thèse	public	Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique	France
	07/08/2002	Thèse	public	Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus	France
	07/08/2002	Thèse	public	Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.	France
	07/08/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Researcher	Californie, USA
	07/08/2002	Postdoc	public	Full time postdoctoral research position	Ontario, Canada
	07/08/2002	CDI	prive	Biostatistician - Fungal Genomics Project	Québec, Canada
	06/08/2002	Thèse	public	Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont	France
	30/07/2002	CDD	public	young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines	Grande-Bretagne
	26/07/2002	CDD	public	CDD, URGV d'Evry	France
	26/07/2002	CDI	public	Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry	France
	24/07/2002	Postdoc	public	Research Assistant/Fellow	Grande-Bretagne
	17/07/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis	Danemark
	14/06/2002	CDI	public	Postdoctoral and Research Assistant Positions	Québec, Canada
	14/06/2002	CDI	prive	IT and Database specialist	Italie
	11/06/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Positions	Iowa, USA
	07/06/2002	CDI	prive	Bioinformatic Position at The Nestle research center	Suisse
	05/06/2002	ATER	public	ATER bio-informatique & ATER génétique moléculaire du diabète de type 2	France
	11/02/2002	CDI	public	Analyst for the analysis of gene expression data	Grande-Bretagne
	11/02/2002	Postdoc	public	Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA	Grande-Bretagne
	07/02/2002	Postdoc	public	role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease	Grande-Bretagne
	07/02/2002	CDI	public	Maître de conférences (Université Paris XI)	France
	07/02/2002	CDI	public	Head of Bioinformatics Applications	Grande-Bretagne
	07/02/2002	Postdoc	public	Position post doctorale en data mining	France
	07/02/2002	CDD	public	Ingénieur/Post-Doc Bioinformatique (BAC+5 Bioinformatique / 6 mois / PARIS )	France
	07/02/2002	CDD	public	Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression	France
	07/02/2002	Postdoc	public	Postdoc Positions in Bioinformatics at NCGR, New Mexico	Nouveau-Mexique, Etats-Unis
	07/02/2002	CDD	prive	Bioinformaticien	France
	01/07/2001	Postdoc	public	A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project	France
	01/07/2001	???	prive	ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique	France
	01/07/2000	Thèse	public	allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive	France
	01/07/2000	CDI	public	two informatics positions at the University of California, Berkeley	USA
	01/07/2000	CDD	public	CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg	France
	01/07/2000	CDI	public	Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand	France
	01/07/2000	CDI	public	Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY	France
	01/07/2000	Thèse	public	Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse	France
	01/07/2000	Thèse	public	PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G)	France
	01/07/2000	CDD	public	Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)	France
	01/07/2000	CDD	public	2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst	Belgique
	01/07/2000	CDD	public	Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5	France
	01/07/2000	CDD	public	CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante)	France
	01/07/2000	CDI	prive	Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA.	Manitoba, Canada
	01/07/2000	CDI	prive	Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project	USA
	01/07/2000	CDI	prive	Bioinformatics Applications Developer	France
	01/07/2000	CDD	prive	projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir	France

21/11/2006

[AG]

PhD studentship in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

21/11/2006

Date limite de réponse:

01/12/2006

Lieu:

Londres (Angleterre, Grande-Bretagne)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

PhD studentship in Bioinformatics "Bio-Communication Theory for Genetically influenced Chronic Diseases" Most diseases are influenced by genetic factors such as Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The aim of this project is firstly to express gene mutation as a digital communication problem (Bio-Communication model) and secondly to apply communication theory to detect SNPs which are likely to predispose people to chronic diseases. Please note that this position is only open to European Union citizens. Closing Date: November 30th 2006 For more information: http://cism.kingston.ac.uk/research/phd-studentship-vacancies/bio-communication-theory-for-genetically-influenced-chronic-diseases_phd-university.htm

Contacts:

j.nebel@kingston.ac.uk

31/10/2006

[AG]

broadcasting

Source:

Date de parution:

31/10/2006

Date limite de réponse:

?

Lieu:

(Ontario)

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Centre de Recherche expérimental pour la réalisation de Home vidéo et de reality scientifiques en.ligne et de la télévision visé à découvrir des nouvelles stratégies d’amélioration de la vie, sélectionne des deux sexes 18 à 65 ans motivés, ambitieux et dynamiques. Les test de sélections se feront en ligne et sont programmés avec des techniques innovants. Le Centre offre formation, et possibilité de carrière. Envoyer CV de préférence avec photo a : broadcasting@themadivita.com

Contacts:

via monte di Dio

30/06/2005

[AG]

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiology and Intracellular Parasitism unit

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

?

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites: Description: One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute. The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position. Activities: This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks. Requirements: The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se. She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data. Conditions: The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

30/06/2005

[AG]

Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites: Description: One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute. The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position. Activities: This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks. Requirements: The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se. She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data. Conditions: The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

30/06/2005

[AG]

Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis

Source:

Institut Pasteur-Unité d'Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites: Description: One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute. The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position. Activities: This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks. Requirements: The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se. She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data. Conditions: The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05.pdf (20 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

29/11/2004

[AG]

Source:

Date de parution:

29/11/2004

Date limite de réponse:

?

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

corps de l annonce

Contacts:

adresse

13/12/2003

[AG]

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

corps de l annonce

Contacts:

adresse

13/12/2003

[AG]

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

corps de l annonce

Contacts:

adresse

06/11/2003

[AG]

Research Fellow/Assistant

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2233

Date de parution:

06/11/2003

Date limite de réponse:

25/11/2003

Lieu:

()

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Robert Gordon University, Aberdeen School of Computing Research Fellow/Assistant (Ref T229) (2.5 Years) Efficient Biological Grammar Acquisition DETAILS: Applications are invited for the position of Research Fellow/Assistant on an EPSRC funded project entitled "Efficient Biological Grammar Acquisition". The project will be based in the Computing Technologies Centre (a recent 1.5 million pounds, purpose-designed SRIF-funded research centre) in the School of Computing at the Robert Gordon University, Aberdeen. The industrial collaborator on the project will be GlaxoSmithKline, one of the world's leading research-based pharmaceutical and healthcare companies. Linguistic methods have provided some interesting results in the recognition of complex biological signals. However the hand development of grammars is difficult and, because it requires human expertise, expensive. Thus, given the enormous volume of data arising from genome projects, there is a need to automate the acquisition of grammars from sets of biological sequences. As the researcher on this project, you will develop an efficient method of acquiring such grammars using Inductive Logic Programming (ILP). Your method will use efficient techniques for discovering non-terminals which are potentially pertinent to the subsequent induction of a biological grammar and a parser which increases the speed at which biological grammars may be acquired by an ILP system. QUALIFICATIONS: You should have a good honours degree in Computing or a cognate discipline and some experience of bioinformatics research; or you may have a background in the life sciences and have an advanced MSc in Computing or a cognate discipline. Preferably you will have a PhD in Machine Learning or Bioinformatics or equivalent experience, as demonstrated by a good publication record. Experience of ILP, Prolog or Parsers would be an advantage. A good communicator and programmer, you will bring an enthusiastic and organised approach to this challenging position. Informal enquiries to: Dr Chris Bryant Tel: +44 (0)1224 262475 E-mail: chb@comp.rgu.ac.uk Starting Salary: 18,265 - 27,339 GBP

Contacts:

HOW TO APPLY: Further particulars and an application form are available from: Human Resources Department, The Robert Gordon University, Schoolhill, Aberdeen, AB10 1FR. www.rgujobs.ac.uk Tel: +44 (0)1224 262085 E-mail: staffrec@rgu.ac.uk

05/11/2003

[AG]

Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics

Source:

ABGf-3355

Date de parution:

22/10/2003

Date limite de réponse:

22/12/2003

Lieu:

Lille (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/10/2003 Date de fin de diffusion prevue : 22/12/2003 Position in Biostatistics and Bioinformatics Field : Microarray data and complex genetic disease analysis Full time POSITION for 2 years starting November, 2003 in the Department of Human Genetics - Genetics of Multifactorial Diseases – Director of Unit : Professor Philippe Froguel Project Description : Analysis of Affymetrix microarray data from transcriptome experiments using animal models and genetic data from human polymorphisms typed in both cohort and family studies. This will be carried out in the context of exploration of the molecular mechanisms underlying pancreatic beta-cell dysfunction and associated insulin-resistance. Activities: * Select and set up appropriate statistical methods for analyzing: o Microarray data, including normalization, selection of significant expression variation, clustering, GO annotation o Genetic data, including linkage analysis, association analysis, linkage disequilibrium mapping and haplotype construction * Manage data (acquisition, validation, quality control, organization) * Analyze data, interpret and present results * Adapt or develop new statistical tools when necessary * Optimize usage of such tools and set up standard analysis procedures * Data acquisition from public databases and other online resources Skills : * Knowledge of statistical methods * Experience of statistical software such as SPSS, S+ or R * Strong experience in microarray data analysis * Knowledge of public databases and other online biological resources Experience : Masters Degree (DESS) or PhD, and, ideally, practical experience of microarray experiments. Training in population genetics can be provided by the lab Application Deadline : Applications will be reviewed in October 2003 until a suitable candidate is identified. Interviews may begin in late October

Contacts:

Interested applicants should submit a letter of intent, a summary of previous research experience and a curriculum vitae, and reference to : Sophie Gallina : Sophie.Gallina@mail-good.pasteur-lille.fr Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

05/11/2003

[AG]

Senior Bioinformatics Positon at the FMI

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2206

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Bale (Suisse)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

BACKGROUND: Tired of the poor funding in academia or the lack of freedom in a company? Want your own office? We are looking for an enthusiastic person with several years experience in bioinformatics. Extensive experience in sequence analysis, data mining/data integration and genome analysis is required. A good knowledge of UNIX, database programming and shell scripting is a plus. Candidates with a PhD are encouraged to apply but a masters together with several years of practical experience will also be considered. In addition to their support and development commitments the successful candidate will be encouraged to attend international bioinformatics conferences and to have the initiative to develop their own research projects in the field of bioinformatics. The FMI (www.fmi.ch), which is funded by the Novartis Research Foundation, is an International Institute with over 280 people of which approximately are 150 postdoctoral fellows and graduate students committed to basic research in areas as diverse as cellular growth control, epigenetic gene regulation and neurobiology. The FMI offers highly competitive academic salaries and it provides state-of-the-art core technologies, transgenic mouse facilities, computing, genomice, and proteomics services. The FMI is located in Basel, a city offering an outstanding scientific environment in the center of Europe. JOB DESCRIPTION: * Help and support: data mining, sequence comparisons, sequence alignment, BLASTs, individual projects with groups, etc. * Teaching: Teaching of classes in bioinformatics * Development: Evaluation of new tools and software, development of bioinformatics tools. Making tools accessible to users at (on www, central servers, ...) * Databases: Maintenance of existing in-house databases (such as genbank,SWISS-PROT, etc.) * Interface and collaborate with outside institutions: Interact with commercial and academic bioinformaticians in developing and sharing bioinformatic resources.

Contacts:

HOW TO APPLY: Please submit your resume or questions to dean.flanders@fmi.ch. http://www.fmi.ch

05/11/2003

[AG]

Bioinformaticien (poste ATER)

Source:

ABGf-3363

Date de parution:

27/10/2003

Date limite de réponse:

27/12/2003

Lieu:

Paris (France)

Statut:

ATER

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 27/10/2003 Date de fin de diffusion prevue : 27/12/2003 Un poste ATER en Bioinformatique est disponible immediatement a l’Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles, rattache au laboratoire CNRS de Neurobiologie et Diversite Cellulaire (UMR 7637) sous la responsabilite du Pr.J. Rossier, Professeur de Biologie en 1ere annee. Les candidats seront titulaires d’une these ou d’une experience equivalente. L’ATER recrute(e) sera responsable de l'enseignement (TP, 3 fois 15H) en bioinformatique (analyse de genomes, data mining). Il/elle assistera le professeur dans la preparation des cours et effectuera le suivi des stages des etudiants. Son projet de recherche sera dans le domaine de l’analyse du transcriptome (regulation de l’expression des genes dans la Trisomie 21 et le retard mental). Il/elle aura pour mission de developper et de maintenir une plate forme informatique, en collaboration avec les plate formes publiques existantes. Remuneration brute mensuelle : environ 1900 euros.

Contacts:

Envoyer un cv au Prof . Jean Rossier : jean.rossier@espci.fr Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

21/10/2003

[AG]

Bioinformatics Research Scientist

Source:

ABG-8094

Date de parution:

08/10/2003

Date limite de réponse:

07/12/2003

Lieu:

Johnston (Iowa) (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Position Purpose : To implement, validate, and customize statistical methods for analyzing functional genomic experiments. Duties/Responsibilities : This person will be responsible for identifying, implementing, and validating statistical and data mining methods for designing and analyzing gene expression profiling experiments. This person should also be capable of customizing or extending previously-published methods when needed. This person will lead an effort to integrate gene expression results into biological networks. In addition to these roles, the successful candidate will be able to contribute to other bioinformatics projects requiring statistical analysis. Educational Qualifications Desired : Ph.D. in Statistics or closely-related field; post-doctoral experience is desirable. Competencies and Experience Desired : The ideal candidate will have a proven track record of application and/or development of innovating data mining algorithms to the analysis of large-scale expression profile data. Rather than specializing in one particular technique, the candidate will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. He/She will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the analysis of gene expression data. Excellent computational skills with the ability to work in a UNIX-based environment is expected. Familiarity with statistical software is expected and a strong preference will be given to those applicants with expertise in either Splus or R. This position requires a self-motivated scientist who works well in a team environment, communicates clearly and effectively, and creatively and independently solves problems. Reports To : Computational Biologist Department : Information Management - Bioinformatics and Exploratory Research

Contacts:

There are two ways to submit a resume for this position : You must reference the job code PHI/QA323/WCP in your cover letter or the subject line of your email. Pioneer employees must apply through PHIweb. - Send your resume and cover letter in an email message (Attachments should be in Word, WordPerfect, Lotus, or ASCII format.) to : apply@pioneerjobs.com - Mail your scannable resume and cover letter to the following address : Resume Processing Center Pioneer Hi-Bred International, Inc. 400 Locust Street, Suite 700 P.O. Box 14454 Des Moines, IA 50306-3454 Resumes will be accepted until the position is filled. For general inquiries regarding employment, contact jobs@pioneer.com or call the Pioneer Hi-Bred Employment Job Line number at 515-270-4000 or 1-800-247-6803 ext. 4000. Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

09/10/2003

[AG]

2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)

Source:

ABGe-1249

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

18/10/2003

Lieu:

Laval (Canada/Quebec)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 19/09/2003 Date de fin de diffusion prevue : 18/10/2003 Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique/bio-statistique sont presentement a combler, a l'UNIVERSITE LAVAL (Quebec) au sein d'un projet multi institutionnel, finance par Genome Quebec pour une periode de deux ans. Le travail vise le developpement de methodes d'analyse pertinente a l'expression de genes a grande echelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration etroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des biostatisticiens et des informaticiens. Position 1.Traitement des donnees de microarray et analyse de designs experimentaux complexes. Des developpements importants ont ete recemment acquis en analyse statistique des microarrays, toutefois ces progres ont ete principalement appliques a des comparaisons simples. Deux themes principaux seront abordes dans cette partie du projet : la correction de biais dans l'analyse des donnees quantitatives de microarrays et les methodes statistiques pour l'analyse dispositif experimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le developpement de modele pour quantifier le biais experimental ; l'evaluation et l'amelioration des procedures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l'analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l'evaluation de la pertinence et des limites de differentes methodes statistiques ; la modification novatrice des methodes existantes pour les rendre mieux adaptees aux donnees obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d'un projet de genomique fonctionnel situe dans un pavillon de recherche en sciences de la vie. Qualifications : Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la sante, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise developpee en statistiques. Une comprehension des principes de l'expression des genes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l'experience dans les domaines suivants : connaissance de langages de programmation, manipulation de grands fichiers de donnees, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacites de communications en Anglais ou en Francais sont essentielles. Position 2. Integration des donnees d'expressions geniques Le projet consiste a developper des techniques d'analyses concernant deux types d'integration: 1-Integration de donnees provenant de differentes techniques de mesures d'expression genique; 2- Integration des fonctions des genes a leurs profils d'expressions. Ce projet consiste d'abord a integrer les donnees produites par les trois differentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression) et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiees sur les fonctions des genes ainsi que leurs roles dans les differents sentiers, metaboliques ou de signalisations, devront etre integrees aux profils d'expressions geniques. Qualifications : Un Ph.D en biologie moleculaire ou fonctionnelle ou equivalent avec une tres bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne experience en programmation, en bases de donnees relationnelles et en extraction d'informations des bases de donnees publiques.

Contacts:

Pour postuler, soumettre : - une lettre de presentation - un curriculum vitae a jour - IMPORTANT : les noms et coordonnees de trois personnes references - Transmettre par courriel en un seul document attache (format Word ou PDF) a genome.foret@rsvs.ulaval.ca - Le nom du candidat doit etre donne au titre du fichier, ou l'inserer dans le texte du courriel. - Inscrire le numero de position dans la ligne sujet du message. Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

09/10/2003

[AG]

BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER

Source:

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

()

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Bioinformatics Software Engineer opening At Perlegen Sciences, we conduct genetics research and develop products that impact and improve people's lives. Established in March 2001, we are a well-funded, pre-IPO company aggressively developing our core competencies in research, genome scanning, bioinformatics, and other key areas of our business. We invite you to consider our team as we apply this technology to bring focus to biological research and to accelerate the discovery of drugs and diagnostics. We currently have an excellent opportunity for a Bioinformatics Software Engineer to aid in the analysis and preparation of sequence and primers, as well as to assist colleagues in issues related to these design elements. We'll rely on you to analyze and design genetic sequence and primers for our association studies, place Perlegen's data in new contexts, make resulting information easily accessible, and quickly respond to questions about Perlegen's SNPs and assays in relation to the human genome. You will also examine past primer performance and make recommendations for design process improvements. To qualify, you must be a team player who is both meticulous and insightful. You should have a BS in CS/EE or equivalent with a strong genetics/molecular biology background and/or a BS in Biology with a very strong computational background. Excellent Perl, SQL, analytical and communication skills, the ability to work in both Windows and Linux environments, proven ability to find and refine relationships between and within data-sets, and proficiency manipulating and dissecting large data collections are essential. Two or more years of bioinformatics development experience preferred. Strong PL/SQL, Access and VB skills as well as competency with statistics would be a plus.

Contacts:

Email your resume, indicating Job Code GN78, to perlegen_HR@perlegen.com; mail, again indicating Job Code GN78, to Perlegen Sciences, 2021 Stierlin Court, Mountain View, CA 94043; or fax to 650-625-4580. For more information on this position and other opportunities, visit our website at www.perlegen.com. EOE.

09/10/2003

[AG]

motif discovery algorithm/statistics

Source:

BioInfo

Date de parution:

09/10/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

We have an immediate open position for a postdoc working on motif discovery algorithm/statistics. If you or someone you know are interested, please contact me asap.

Contacts:

Michael Q. Zhang, Ph.D. Professor Cold Spring Harbor Lab 1 Bungtown Road Cold Spring Harbor, NY 11724. USA Tel:1-516-367-8393 Fax:1-516-367-8461 http://www.cshl.edu/mzhanglab/ Secretary: Ms. Carol Marcincuk (1-516-367-8387, marcincu@cshl.edu)

18/09/2003

[AG]

three PhD positions in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

04/09/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Callaghan (Australie)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

1431 (Evolutionary Algorithms and Optimization Methods for large-scale problems in Bioinformatics), 1432 (Algorithmic approaches for problems in Proteomics, Molecular Modelling and Drug Design) 1433 (Novel Statistical and Optimization Methods for the Life Sciences). These numbers correspond to the entries in the Jason Postgraduate Scholarship Database for Australia: http://www.jason.unimelb.edu.au where the complete information can be retrieved. Please follow the link and the procedures described in the Jason database. In addition, the University offers other Scholarships http://www.newcastle.edu.au/study/scholarships/index.html which may relate to other Bioinformatics ongoing projects at Newcastle. These other scholarships may suit International Students and have a closer deadline in some cases. More information about the Newcastle Bioinformatics Initiative is available from the web site at: http://www.cs.newcastle.edu.au/~nbi As you can probably see from the scholarships announcements, we are interested in people who have already some expertise in algorithmic engineering and in solving large optimization problems with combinatorial optimization methods, metaheuristics and exact techniques.

Contacts:

Dr. Pablo Moscato Newcastle Bioinformatics Initiative - Director Postgraduate Director for Computer Science School of Electrical Engineering and Computer Science The University of Newcastle, Callaghan, 2308, NSW AUSTRALIA moscato@cs.newcastle.edu.au Phone : +61 2 4921 6056 Fax: +61-2-4921-6929

18/09/2003

[AG]

Post-doctoral position in microarray data analysis

Source:

Date de parution:

18/09/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Bâle (Suisse)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

We seek a highly motivated and enthusiastic scientist who is interested in cutting-edge genomics and bioinformatics approaches that include large-scale expression profiling and genome wide identification of protein-DNA interactions in the field of meiosis, gametogenesis and germline development. Our lab operates a high density oligonucleotide microarray platform that enables researchers interested in statistical and clustering aspects of microarray data analysis to work with very large and very well documented data sets. We are a member of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), a prestigious association of laboratories that work in the field of computational biology. The Biozentrum and the SIB provide an excellent wet lab and IT infrastructure, full support for the recently established Department of Bioinformatics and a highly stimulating, international academic environment. Candidates should be familiar with statistics of microarray data analysis, statistical languages and environments (R, S+), programming languages (PHP, Perl), database management systems (Oracle, MySQL), and be comfortable in a Linux development environment.

Contacts:

Please send your CV and the names of two references to Prof. Michael Primig Department of Bioinformatics Biozentrum, University of Basel & the Swiss Institute of Bioinformatics Klingelbergstrasse 50/70 CH-4056 Basel / Switzerland Phone Office: +41 61 267 20 98 Phone IT-Office: +41 61 267 15 78 Fax: +41 61 267 33 98 http://www.bioz.unibas.ch/primig http://www.isb-sib.ch http://www.bioz.unibas.ch/corelab http://www.germonline.org

03/09/2003

[AG]

RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS

Source:

ABGe-1229

Date de parution:

26/08/2003

Date limite de réponse:

26/09/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

DTI-FUNDED “BEACON” PROJECT ON BAYESIAN MODELLING OF METABOLIC AND TOXIC PROCESSES This is an exciting opportunity for an ambitious and highly computer literate Research Associate with a PhD in chemistry, biochemistry, chemometrics, bioinformatics or cognate subject who is looking to develop their career in the field of metabonomics and whole organism metabolic modelling. The post holder will be part of a post-doctoral team working to develop novel Bayesian methods to model quantitative metabolic data generated by NMR spectroscopy and mass spectrometry of biofluids and be under the supervision of Prof. Jeremy Nicholson, Head of the Biological Chemistry Section (in association with Profs. Steve Muggleton and Mike Sternberg in Computer Science). In particular the post-holder will be involved in the multivariate statistical analysis of spectroscopic data. A knowledge of NMR spectroscopy and/or mass spectrometry would be advantageous, but is not essential. The position is available immediately for a period of 2.5 years. Salary will be on the RA1A scale: £18,265 - £27,390 per annum plus £2,134 London Allowance.

Contacts:

Further details and an application form can be obtained from : - Nahid ASHBY (phone +44 20 7594 3225) email n.ashby@imperial.ac.uk - Dr. Marc-Emmanuel DUMAS, m.dumas@imperial.ac.uk

02/09/2003

[AG]

Bioinformaticien confirmé

Source:

Date de parution:

24/07/2003

Date limite de réponse:

30/09/2003

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : Drh-588 Date de publication : 24 juillet 2003 Date de clôture : 30 septembre 2003 Au sein d'un laboratoire de recherche en génétique et génomique végétales travaillant avec des équipes de renommée mondiale, vous participerez à un enjeu stratégique de premier plan: approfondir la connaissance, la compréhension et la représentation du génome des plantes cultivées tropicales. Bio-informaticien, vous êtes attiré par ce défi et souhaitez travailler dans l'environnement scientifique de la Génopole de Montpellier Descriptif du poste : Le poste s'intègre dans l'équipe de bio-informatique d'une unité d'analyse des polymorphismes chez les plantes cultivées tropicales et méditerranéennes. En partenariat avec différentes équipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amélioration des méthodes pour l'analyse bio-informatique des données issues des travaux de séquençage de grands fragments chez les Monocotylédones et de génotypage chez différentes espèces. Il contribuera à l'intégration de différentes méthodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation comparative) et réalisera les développements bio-informatiques nécessaires. Il élaborera les approches bio-informatiques adaptées aux études d'association et de déséquilibre de liaison chez des espèces à biologie variée. Profil souhaité : Doctorat en bioinformatique, avec une expérience significative dans le domaine de l'analyse de séquences. Une expérience post-doctorale serait appréciée. Bonne connaissance des outils d'annotation (détection de motifs, logiciels de prédiction de gènes...). Maîtrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc. Connaissance des modules informatiques spécifiques de la bio-informatique : Bioperl, BioJava,BioPipeline, etc... Expérience de la modélisation. Bonne culture générale en génétique et biologie moléculaire. Aptitude à la communication interdisciplinaire. Esprit d'équipe, bon relationnel Date de prise de fonction : Dés que possible

Contacts:

Renseignements sur le poste : Brigitte Courtois 04.67.61.56.94 Avenue Agropolis 34398 Montpellier Cedex 5 France Tel: (33) 04 67 61 56 94 Fax : (33) 4 67 61 56 05 e-mail: brigitte.courtois@cirad.fr ou Manuel Ruiz 04.67.61.56.31 [ Contacts ] Cirad: http://www.cirad.fr Cirad-Drh/Emploi TA 174/04 34398 Montpellier Cedex 5, France emploi@cirad.fr

11/08/2003

[AG]

RESEARCH POSITION

Source:

Date de parution:

02/08/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Montreal (Canada/Quebec)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Comparative and Evolutionary Genomics/Bioinformatics. Faculty Position, Canadian Institute for Advanced Research The Department of Biochemistry at the Faculty of Medicine invites applicants for a faculty position at the Assistant Research Professor level in the areas of Comparative and Evolutionary Genomics, and Bioinformatics. This position implies a prestigious Scholar appointment in the Evolutionary Biology Program of the Canadian Institute for Advanced Research (CIAR). The successful candidate will have demonstrated excellence in the field of bio- informatics and/or genomics. Preference will be given to candidates with experience in evolutionary biology. He or she is expected to establish an innovative research program, and participate in teaching at both the undergraduate and graduate levels. Salary and startup funds will be commensurable with qualifications and experience, and successful candidates will be eligible for considerable infrastructural support through the Canada Foundation for Innovation.

Contacts:

jobs@bch.umontreal.ca

03/08/2003

[AG]

Chef de projet bioinformatique au Genoscope

Source:

ABG-7916

Date de parution:

02/07/2003

Date limite de réponse:

02/09/2003

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 02/07/2003 Date de fin de diffusion prevue : 02/09/2003 Le Genoscope – Centre National de Sequencage recrute un Chef de Projet Bioinformatique, responsable de sa plate-forme d'annotation. Le Genoscope, composante du GIP CNRG (Consortium National de Recherche en Genomique), mene des projets de genomique a grande echelle en collaboration avec des laboratoires experts de la biologie des organismes concernes, et developpe ses propres thematiques de recherche dans le cadre de l’UMR Genoscope/CNRS/Universite d’Evry « Structure et Evolution des Genomes ». L’equipe bioinformatique est fortement implique dans l’annotation et l’analyse des genomes sequences au Genoscope, ainsi que dans le developpement de methodes et outils bioinformatiques lies aux differents programmes de recherche. Elle se compose a l’heure actuelle de 9 chercheurs et ingenieurs, qui travaillent en collaboration etroite avec les biologistes du Centre. L’equipe bioinformatique collabore egalement de pres avec le service Informatique (15 personnes), charge de l’informatique liee a la production de sequences, des processus de traitements automatises, et de la gestion de l’infrastructure materielle et logicielle. Le Genoscope dispose d'un systeme de calcul a haute performance, constitue principalement d'un cluster Compaq Alpha a 8 membres et 40 processeurs, et d’un espace de stockage.de 10 To. Le candidat prendra la responsabilite de l’evolution de la plate-forme logicielle d’annotation du Genoscope : expression des besoins, specification fonctionnelle, conception de l’architecture, integration de composants logiciels existants et developpements nouveaux. Il sera seconde dans sa mission par une petite equipe de 2 bioinformaticiens. Competences requises : Au minimum 4 ans d'experience Bonne connaissance et experience de developpement sous Perl et de C++ ou Java Experience de la gestion d’un projet de developpement consequent Excellente maitrise de l’environnement Unix dans un contexte de calcul scientifique a haute performance (calcul distribue, grands ensembles de donnees) Competences appreciees : Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (notamment lies a analyse de sequences) Bonne connaissance des SGBD relationnels (modelisation, administration) Anglais courant Formation souhaitee : ecole d’ingenieur generaliste, ecole d’informatique, ou 3eme cycle Date de prise de fonction : Septembre 2003

Contacts:

Candidature a adresser par courrier electronique a Vincent Schachter (vs@genoscope.cns.fr) Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

03/08/2003

[AG]

Bourse de These en Microbiologie

Source:

ABGt-3122

Date de parution:

16/07/2003

Date limite de réponse:

15/08/2003

Lieu:

Brest (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 16/07/2003 Date de fin de diffusion prevue : 15/08/2003 Proposition de sujet : Le laboratoire dispose d'une collection originale d'Archaea hyperthermophiles du groupe des Thermococcales (Pyrococcus, Thermococcus), isolees a partir d'echantillons preleves sur des sources hydrothermales oceaniques de divers sites des oceans Atlantique, Pacifique et Indien. Un premier crible realise sur 190 isolats a revele la presence de nombreux plasmides de differentes tailles (2,8 a plus de 30kb) chez plus de 40% des isolats examines suggerant que ces elements joueraient un role important dans la b iologie des communautes microbiennes des sources hydrothermales. A ce jour, seuls deux petits plasmides presents chez des Archaea de ce groupe ont ete decrits, dont l'un, pGT5 dans notre laboratoire a permis la mise au point du premier systeme de transformation chez ces organismes. Les objectifs de cette these sont d'etudier la diversite et la biogeographie de ces elements genetiques, de rechercher les homologies de sequence et d'analyser celles-ci pour mettre en evidence les structures conservees impliquees dans les fonctions de maintenance, de replication et de propagation et enfin de trouver des indices de transferts horizontaux de genes. Par ailleurs, la comparaison avec les genomes d'Archaea hyperthermophiles apparentees devrait permettre de mieux comprendre le role des plasmides dans la plasticite des genomes de leurs hotes. Qualifications : Le candidat ou la candidate detiendra un DEA en microbiologie, genetique ou biologie moleculaire. Il ou elle possedera des competences en genetique bacterienne, en biologie moleculaire et en bioinformatique. Lieu : A l'IUEM, Technopole Brest-Iroise, place Nicolas Coppernic, 29280 Plouzane, principalement dans le laboratoire de Microbiologie Marine (UMR 6539) de l'IUEM, mais egalement au laboratoire de " Microbiologie et Biotechnologies des Extremophiles " IFREMER, les deux laboratoires fusionnant en une nouvelle UMR debut 2004. Debut de la these : Octobre 2003 Financement : Bourse regionale pour 3 ans

Contacts:

Les candidats et candidates sont pries de transmettre pour le 15 aout au plus tard leur dossier comprenant un CV, un resume du stage de DEA, une lettre d'intention ainsi que le nom d'une personne de reference a : daniel.Prieur@univ-brest.fr et marc.leromancer@univ-brest.fr les candidats et candidates retenus seront auditionnes la premiere quinzaine de septembre. Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

03/08/2003

[AG]

bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis

Source:

Date de parution:

31/07/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date négociable) à la Génopole d’Evry (banlieue sud de Paris) pour travailler sur l’organisation du génome de la vigne et mener des recherches en génomique comparative avec Arabidopsis thaliana. Cette étude sera réalisée dans un groupe d’environ 50 personnes travaillant en génomique végétale et ira d’études bioinformatiques à la validation des hypothèses à la paillasse. Le salaire brut sera d’environ 2900€. La Génopole (www.genopole.org) est une « vallée de la génétique » qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d’entreprises de biotechnologie autour de l’Université d’Evry-Val d’Essonne. Le candidat, titulaire d’une thèse et travaillant actuellement en dehors de la France, sera fortement intéressé par la génomique comparative. Des expériences en bioinformatique (analyse et comparaisons multiples de séquences essentiellement) et en génétique (cartographie génétique et/ou physique) sont demandées.

Contacts:

SVP envoyez un CV à adam@evry.inra.fr (http://www.evry.inra.fr).

03/08/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)

Source:

Date de parution:

18/07/2003

Date limite de réponse:

25/08/2003

Lieu:

Gif sur Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Le Centre de Génétique Moléculaire (CGM) Unité CNRS, situé à Gif sur Yvette (91) recherche un Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS). Celui-ci sera intégré à la plate-forme de bio-puces dirigée par Lon Aggerbeck, et plus précisémént à l'équipe de Bio-informatique dirigée par Hervé Delacroix. Il participera à la mise en place et à l'interfaçage des outils d'analyses statistiques et de clustering (développés en R), ainsi que des outils d'analyse d'images avec la base de données de transcriptome. Profil : Vous connaissez plusieurs langages de programmation, en particulier des outils de développement web (HTML, Java, SOAP, expresso, TomCat, ...), des langages de script (perl, php, ...) et avez une expérience de la gestion des bases de données (JDBC, PostgreSQL, MySQL, Oracle, ...). Des connaissances en statistiques seront particulièrement appréciées. Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminée d'une durée maximale de 6 mois, disponible à partir du 1er octobre.

Contacts:

Les candidats intéressés doivent faire parvenir une lettre de motivation ainsi qu'un curriculum vitae détaillé avant le 25 aout à l'adresse suivante: Pr Hervé DELACROIX Centre de Génétique Moléculaire CNRS UPR 2167 91198 Gif-sur-Yvette Cedex mail : delacroix@cgm.cnrs-gif.fr

03/08/2003

[AG]

Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS

Source:

Date de parution:

03/08/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

St Louis (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

LOCATION: Nestlé Purina Petcare PTC - St Louis, Missouri JOB DESCRIPTION: Interact with multi-disciplined scientist teams including nutritionists, animal scientists, molecular biologists, geneticists and other bioinformaticians working against multiple projects. Responsibilities will include input against experimental design and output, focusing on integrating experimental data, bioinformatical analyses and statistics. REPORTS TO: Manager of Molecular Biology group RESPONSIBILITIES: The position is responsible for leading projects and participating on project teams that conduct basic, non-invasive nutrition research to benefit cats and dogs. The successful candidate will have the capability of using their molecular biology and bioinformatics expertise to aid our product development scientists to develop products with unique nutritional or wellness claims. The candidate will be expected to collaborate as necessary with other Nestle R&D Centers as well as Universities to stay current in the field. Occasional travel to other R&D Centers and Universities is required. EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED: .. Minimum of BS Degree in Molecular biology or related field (PhD degree highly preferred) .. Three years experience using bioinformatics and biostatistics with a strength in combining statistics and bioinformatical analyses .. Research experience working with microarray, rtPCR and comparative genomics data LANGUAGES NEEDED: English necessary. French an added positive OTHER SKILLS REQUIRED: Excellent computer skills required as well as good verbal and written communication skills. Must have excellent teamwork skills. DATE NEEDED: Immediately

Contacts:

CONTACT: Bob Foley 3916 Pettis Rd St. Joseph, MO 64503 Phone-816-387-4103 Fax-816-387-4115 robert.foley@rdmo.nestle.com Nestle Purina Petcare PTC is an equal opportunity employer (M,F,D,V)

26/06/2003

[AG]

MC de bioinformatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

26/06/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Nice (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'Université de Nice Sophia Antipolis demandera un poste de MC de bioinformatique pour la rentrée 2004. Le profil retenu est "fouille de données, génomique et protéomique". Dans le cadre des recherches faites sur le campus actuellement, data mining et/ou ontologies en relation avec les puces à ADN semble être le domaine qui pourrait être privilégié, mais sans pour autant exclure d'autres candidats en fonction de leur dossier. Comme d'habitude, une expérience post-doctorale ayant permis l'acquisition d'une double compétence sera un réel avantage, mais un stage post-doctoral ne sera pas exigé du candidat. Les éventuels futurs candidats, peuvent me contacter par email pour plus de détails et discussions.

Contacts:

Richard CHRISTEN UMR6543 CNRS - Université de Nice Sophia Antipolis Biologie Virtuelle. Centre de Biochimie. Parc Valrose. 06108 Nice cedex2 christen@unice.fr tel 33 - 4 93 76 52 10 fax 33 - 4 93 76 52 19

23/06/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie

Source:

BioInfo

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

11/07/2003

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (Paris) recherche un : Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie (CDD INSERM) Vous serez intégré à l'Institut Fédératif de Recherche du Département de Biologie dirigé par Patrick Charnay. Plus précisément, vous serez rattaché aux plates-formes du transcriptome et d'Imagerie dirigées par Claude Jacq et Antoine Triller. Vous participerez aux analyses informatiques des images de ces services, ainsi qu'à la mise en place des outils nécessaires à leur réalisation. Vous serez plus particulièrement conduit à travailler sur des thématiques liées à l'imagerie. Mission : Des outils d'analyse des puces à ADN, commerciales ou fabriquées localement, ont été mis en place (GenePix). Vous assurerez le maintien de ces outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d'analyse. Vous serez chargé d'assurer le bon fonctionnement des outils de la plate- forme et de vous tenir au courant des évolutions du secteur. Des robots sont disponibles sur la plate-forme pour la gestion des matériels biologiques. Vous aurez en charge le fonctionnement des programmes de ces robots ainsi que le développement d'outils automatisés permettant par exemple la reconnaissance de colonies sur boîtes. Vous aurez en charge une partie de la formation des utilisateurs aux techniques d'analyse d'images des puces à ADN. Profil : Vous connaissez plusieurs langages de programmation et vous avez l'expérience des programmes d'automatisation des tâches plus particulièrement dans le domaine de l'imagerie. La maîtrise des outils de développement d'interface web (HTML, Javascript, .), des langages de script (PHP, perl, .) et de la gestion des bases de données (SQL) serait un plus. Des connaissances en biologie seront particulièrement appréciées. Perspectives : Ce poste s'inscrit dans la politique de développement de la bioinformatique et de l'imagerie dans le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure . Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminé disponible immédiatement jusqu'au 30 novembre. Ce poste est accordé avant le recrutement d'un ingénieur d'étude par l'INSERM par concours national. Vous pourrez ensuite vous présenter à ce poste. Les conditions salariales sont celles des ingénieurs d'études de l'INSERM. L'arrêté d'ouverture est paru, la date limite de retrait des dossiers est fixée au 11 juillet et la date limite de depôt au 15 juillet

Contacts:

Envoyez vos références à Stéphane LE CROM : lecrom@biologie.ens.fr

23/06/2003

[AG]

Computational Biologist

Source:

bambct-list@molbio.mgh.harvard.edu

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Waltham (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

JOIN A FAST PACED VENTURE BACKED BIOTECHNOGOLGY START-UP engeneOS was formed in late 2000 to exploit the tremendous opportunity created by the genomics revolution in the biological sciences merged with cutting edge technologies from the physical and information sciences. We are a pioneer in establishing the field of Biomolecular Engineering to enable the design and construction of programmable Biomolecular Machines from natural and artificial building blocks. These Biomolecular Machines will serve a broad range of commercial applications including biosensors, chemical synthesis and processing, bio-electronic devices and materials, nanotechnology, functional genomics and drug discovery. Founded and lead by an extraordinarily talented group of advisors/partners and management team, engeneOS is a fast paced entrepreneurial organization providing talented people with the opportunity for growth, development and contribution to our dynamic and growing organization. We are seeking a high energy, dynamic individual to join our team as a Contract to Permanent Computational Biologist. Contract Computational Biologist As a key member of our dynamic interdisciplinary team you will actively participate in developing innovative solutions for complex computational biological problems. The ideal candidate should have the following: -strong biology (especially genomics) and bioinformatics background -familiarity with genomics database (Genbank, Protein database) and data mining - Proficiency in search algorithm and database programming with experience in writing multiple applications that interface with databases (MySQL, PostgreSQL, Oracle) - Statistical Analysis, Proteomics - Experience with the following technologies: - C or C++ or Java - Perl or Python - GUI development (Swing, GTK+, Tk) Excellent written and verbal communication skills are required along with the ability to work under aggressive timelines. engeneOS offers a competitive compensation and benefits package including, medical and dental coverage, Flexible Spending Accounts, Life & Disability Insurance, and stock options.engeneOS is an equal opportunity employer.

Contacts:

Please submit your resume/CV to:jobs@engeneos.com Fax:781-891-3796 Jennifer Neves Staffing Specialist Compound Therapeutics 1365 Main Street Waltham, MA02451 PH: (781) 891-3745 x 321 FAX: (781) 891-3796 jneves@compoundtherapeutics.com

10/06/2003

[AG]

CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/05/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Gif-sur-Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

TRES URGENT: CDD de 12 mois non-renouvelable, niveau IE ou IR selon le diplôme, salaire premier échelon de la catégorie correspondante. Mots clés: base de données relationnelle, interface web, Projet: Dans le cadre de la création d'un centre de ressources biologiques drosophiles organisé en réseau, nous recherchons un ingénieur (ou post-doc) pour développer l'outil de gestion commun sous forme d'une base de données relationnelle. La base recensera l'ensemble des ressources disponibles dans les différents laboratoires partenaires et comportera deux grands types de ressources, - des lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster espèce modèle dont le génome est entièrement connu, - des lignées de populations naturelles et d'espèces variées. (plusieurs milliers de lignées au total) Mission: Prendre en charge la conception et la réalisation de la base de données sécurisée (MySql ou PostGreSql) regroupant l'ensemble des lignées et espèces de drosophiles et de l'interface web. Ce poste est réservé à un candidat qui n'a pas déjà bénéficié d'un CDD avec un établissement public de recherche. Lieu de travail: CNRS, Gif-sur-Yvette, Populations, Génétique et Evolution (PGE)

Contacts:

Personne à contacter: Marie-Louise Cariou Populations, génétique et Evolution - UPR 9034 CNRS - Gif-sur-Yvette Tél 01 69 82 37 10 Mail: cariou@pge.cnrs-gif.fr

10/06/2003

[AG]

Research Associate in biostatistics and

Source:

ABGe-1165-Postdoctoral

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

23/06/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 23/05/2003 Date de fin de diffusion prevue : 23/06/2003 This is an exciting opportunity for an ambitious post-doc with a PhD in mathematics, statistics, physics or bioinformatics who is looking to develop their career as a biostatistician in the field of genomics. The post is linked to a Wellcome Trust project, coordinated by Professor James Scott and involving an inter-disciplinary team working to develop the understanding of metabolic diseases and in particular the syndrome of insulin resistance. You will work directly with Professor Sylvia Richardson, Head of Biostatistics Group in the Department of Epidemiology for developing and applying multivariate statistical tools to gene expression data. The post is funded by a Wellcome Trust Thematic grant for Cardiovascular Functional Genomics. The appointment will be for 2 years in the first instance, with a possibility of a third year. Further details concerning the Biological Atlas of Insulin Resistance are available on the web pages from the Consortium: http://www.icggri.ic.ac.uk/bair/index.htm The appointment will be on the RA1A scale with a minimum of £21,125 per annum plus London Allowance of £2,134 per annum. Valuing diversity and committed to equality of opportunity.

Contacts:

Please contact: Professor Sylvia Richardson sylvia.richardson@imperial.ac.uk Further particular and application form can be obtained from Madeline Kirk on +44 20 7594 3319, or email: m.kirk@imperial.ac.uk. Closing date: 12th June 2003. Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

10/06/2003

[AG]

Postdoctoral Position at MIPS

Source:

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Munich (Allemagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for a postdoctoral fellowship to develop new methods for automatic classification of protein sequences using machine learning methods. The input data will include BLAST/FASTA similarity scores, protein domains and motifs, as well as secondary and tertiary structures predicted by standard bioinformatics methods. The primary classification target will be functional categories (FunCat) developed by the MIPS. Applicants with a Ph.D. in bioinformatics, computer science/engineering are encouraged to apply. A background in molecular biology as well as demonstrated computer skills (programming in Perl, SQL, C/C++ familiarity with UNIX, Web) are preferred. The position will be supervised by Prof. H.W. Mewes and Dr. I.V. Tetko. The salary will be according to BAT IIa. The appointment will be for two years. The position is available immediately. Informal inquiries are also welcome.

Contacts:

Please send curriculum vitae, names for letters of recommendation to i.tetko@gsf.de, http://mips.gsf.de.

10/06/2003

[AG]

Biologist

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

31/05/2003

Lieu:

Genève (Suisse)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist The BioMinT project is focused on the development of statistical, machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information: http://biomint.org/). The main tasks of the position will consist of: exploring domain-specific knowledge resources in order to create lexicons, thesauri and ontologies furnishing sets of document corpora for each stage of tools development and validation evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators A university level degree in biology is required, as well as an experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position. Eligible candidate for hold a Swiss or European union passport. Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva

Contacts:

Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to: Anne-Lise Veuthey Swiss Institute of Bioinformatics CMU 1, rue Michel Servet 1211 Genève 4 email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

10/06/2003

[AG]

CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services

Source:

EMBL Job Vacancy 03/57

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

15/07/2003

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire European Molecular Biology Laboratory Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie EMBL/V/03/57 Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Heidelberg: HEAD OF CENTRAL COMPUTING SERVICES Grade: 9 Duty Station: Heidelberg, Germany Job Description: The successful candidate will lead a team of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services for the main Laboratory of the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg. A key task of this team is to provide service and support to the EMBL scientific community at all levels of computing and networking. Supported equipment includes a broad range of computing devices (from desktop machines, workstations to large servers). The operating system environment is heterogeneous and includes Unix, Linux, MacOS and Windows. The implemented networking technology is state-of-the-art and allows the provision of extensive online services to the worldwide scientific community. It is essential that the central computing service team collaborate with research groups in computational biology at EMBL. The Head of central computing services is expected to serve as a facilitator for the in-house computational biology community as well as for the EMBL Outstations. The duty of the person also involves support and interaction with the SAP based administrative computing system and consultants. Qualifications and Experience: Applicants should have a university degree or equivalent as well as having substantial experience in managing and integrating a heterogeneous scientific computing environment, which includes expertise in network security and network administration. The position requires the ability to develop technical concepts and proposals for further improvement of the computing and networking services, including improvement in the areas of the GRID and network security. Previous experience in management of an IT team and skills in negotiating with computer equipment manufactures are highly desirable. Contract: A contract of 3 yearsí duration will be offered to the successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review. Closing Date: 15.07.2003

Contacts:

EMBL Web site: http://www.embl.de/

10/06/2003

[AG]

2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy

Source:

ABG-7827

Date de parution:

22/05/2003

Date limite de réponse:

21/07/2003

Lieu:

Rochester (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/05/2003 Date de fin de diffusion prevue : 21/07/2003 There are immediate openings for two postdoctoral positions in biological NMR at Mayo Clinic and Research Foundation. Several projects involving structural characterization of protein complexes are available. Applicants should have experience in NMR spectroscopy. Salary is very competitive and will be determined by the successful candidate's experience. There is an attractive benefit package. For some general information about research at Mayo Clinic please visit: http://www.mayo.edu/research/

Contacts:

Applications, including curriculum vitae and bibliography, and the names of three references, should be sent by email to : Dr. Georges Mer Mayo Clinic Guggenheim 1511B 200 First Street S.W. Rochester, MN 55905 mer.georges@mayo.edu Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

21/05/2003

[AG]

Postdoc modele « plante virtuelle »

Source:

ABGt-2813

Date de parution:

05/05/2003

Date limite de réponse:

25/05/2003

Lieu:

Grignon (78) (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Integration dans un modele « plante virtuelle » des relations source-puit et de la senescence au cours du remplissage des grains chez le ble. Date de debut de diffusion du poste : 05/05/2003 Date de fin de diffusion prevue : 25/05/2003 Contexte des travaux de l’equipe L’equipe met au point des modeles de fonctionnement de plantes et de population de plantes. Nous developpons en particulier des modeles de « plante virtuelle», fondes sur une representation informatique realiste des plantes. Nous cherchons a integrer dans cette approche les processus essentiels pour la simulation des interactions entre la plante et son environnement, en particulier les stress biotiques (maladies) et abiotiques (ozone, carence azotee). Il apparait que l’impact de ces stress est en grande partie lie a une acceleration de la senescence foliaire, probablement due aux modifications des sources et puits de carbone et d’azote. La modelisation de l’effet des contraintes necessite donc la mise au point d’un modele mecaniste de senescence foliaire. Le choix de l’approche « plante virtuelle » permettra de realiser l’integration sur la base d’une representation detaillee des processus, au sein de la plante et dans le temps. Resume de la proposition : Lors du remplissage des grains chez les cereales, la demande d’azote est superieure aux possibilites de prelevement racinaire et le complement est fourni par remobilisation a partir des organes aeriens. Il en resulte une diminution de la photosynthese qui affecte l’activite racinaire, et accelere le processus. L’objectif de la these sera de mettre au point un modele exprimant ces interactions, et d’evaluer en particulier si la boucle de retroaction decrite plus haut permet de rendre compte de la progression de la senescence foliaire au cours du temps, dans differentes conditions environnementales. Le modele sera developpe selon une approche plante virtuelle developpee dans l’equipe, qui permettra de prendre en compte de facon precise la progression de la senescence au sein de l’architecture et son impact sur l’acquisition du carbone. La recherche est donc fondee sur l’investigation de processus biologiques, elle inclut une composante importante en modelisation. Lieu de Travail INRA : Unite Environnement et Grandes Cultures 78850 Thiverval-Grignon, France Profil recherche Nous recherchons de preference un candidat de formation initiale en biologie, motive par la formalisation mathematique et informatique. Le candidat doit avoir effectue son DEA en France. Les candidatures selectionnees par l’equipe seront soumises fin mai a l’Ecole doctorale ABIES pour la decision quant a l’attribution de l’allocation de recherche.

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à : Bruno Andrieu INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures 78850 Thiverval-Grignon, France Tel : 01 30 81 55 27 Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

21/05/2003

[AG]

charge de cours en bioinformatique

Source:

ABGe-1159

Date de parution:

?

Date limite de réponse:

29/05/2003

Lieu:

Bruxelles (Belgique)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 13/05/2003 Date de fin de diffusion prevue : 29/05/2003 OUVERTURE DE POSTE L'Universite Libre de Bruxelles annonce l'ouverture, a partir du 1er octobre 2003, d'un poste de charge de cours a temps plein en bioinformatique en Faculte des Sciences. Les candidats doivent etre titulaires d'un doctorat en Sciences (ou d'un titre equivalent), et aire etat d'une experience soutenue de recherche de haut niveau portant sur un ou plusieurs aspects de la bioinformatique: genomique ou proteomique comparative, structurale ou fonctionnelle, modelisation de processus cellulaires, conception rationnelle de molecules biologiquement actives, etc... Une grande importance sera donnee aux synergies qui pourront s'etablir entre le nouveau charge de cours et les unites de recherche actives en bioinformatique a l'ULB. Le nouveau charge de cours participera a la promotion de la bioinformatique en tant que science interdisciplinaire. Les candidats doivent egalement faire preuve de dispositions pedagogiques pour l'enseignement superieur. Le candidat retenu se verra attribuer des charges d'enseignement dans le cadre du DEA inter-universitaire en bioinformatique (en langue anglaise). Ces charges seront progressivement completees par des enseignements de 1er ou 2me cycle. Si le candidat retenu n'appartient pas au personnel enseignant ou scientifique de l'ULB, ou au personnel definitif du Fonds National de la Recherche Scientifique travaillant a l'ULB, il sera engage a titre temporaire pour une periode a trois ans. A l'issue de cette periode, et moyennant une decision du Conseil d'Administration de l'Universite, son engagement fera l'objet d'une nomination a duree indeterminee sur le budget de fonctionnement de l'Universite. Toutes les informations sont disponibles sur le site : http://www.ulb.ac.be/docs/greffe/vacances/academique/index_6.html la reference de l'offre est : 28.04.03/IV.21 Les candidats sont invites a retirer un modele de presentation du curriculum vitae sur le site http://resu1.ulb.ac.be/tools/CV-type.rtf. La candidature accompagnee dudit curriculum vitae, d'un resume des activites precedentes et d'un projet de recherches, doit etre adressee en deux exemplaires a M. Pierre de Maret, Recteur de l'Universite Libre de Bruxelles, 50 avenue Roosevelt, 1050 Bruxelles. Le candidat priera deux personnalites d'envoyer une lettre de recommandation a M. Guy Latouche, Vice-Doyen de la Faculte des Sciences, ULB, CP 212, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles, qui, par ailleurs, se tient a disposition pour toute demande d'information. La date limite du depot des candidatures est fixee au 29 mai 2003

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à Bruno Andrieu INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures 78850 Thiverval-Grignon, France Tel : 01 30 81 55 27 Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

21/05/2003

[AG]

Postdoc

Source:

Date de parution:

21/05/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Boston (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

If you know of any potentially qualified and interested recent PhD in computer science, math, stats, or physics who is interested in computational biology/bioinformatics, please urge them to contact me directly concerning an open postdoctoral position to work with me in the Department of Biology at Boston College. Current projects concern algorithm design for the analysis of time series oligonucleotide and cDNA array data, RNA structure prediction, and extensions/refinements of aspects of sequence alignment. Essential skills required: strong programming ability (especially in C/C++ and python or perl), some probability theory. Some background in computational biology would be helpful, but for someone really interested, this can be learned. The Boston area has many opportunities in computational biology/bioinformatics, both academic and industrial. The weekly MIT Bioinformatics Seminar, co-organized by Bonnie Berger and myself, facilitates potentially useful future contacts, and the Boston area is home to a number of leading biotech and pharmaceutical companies involved in bioinformatics research (such as Novartis, Millenium, Serono, Lion Bioscience, US Genomics,etc.).

Contacts:

Peter Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat Professor, Biology Department Courtesy appt. Computer Science Department Boston College Higgins Hall 416 140 Commonwealth Avenue 617 552 1332 (office) Chestnut Hill, MA 02467 617 552 2011 (fax) http://cs.bc.edu/~clote/ clote@bc.edu

24/04/2003

[AG]

chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD

Source:

ABGf-2986

Date de parution:

18/04/2003

Date limite de réponse:

07/05/2003

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

ABGf-2986-CDD - Le Cirad recrute un chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique - Montpellier Date de debut de diffusion du poste : 18/04/2003 Date de fin de diffusion prevue : 07/05/2003 Au sein de l'equipe "Analyse du genome" du programme canne a sucre et de l'UMR " polymorphismes d'interet agronomique " et pour assurer le suivi de plusieurs developpements intervenus recemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge • la poursuite du travail sur les " Single Nucleotide Polymorphism " (SNP) comme outils de genotypage chez la canne a sucre • l'exploitation des collections d'ESTs de canne a sucre produites a la FAPESP au Bresil et de mais et ble produites par le programme Genoplante pour le marquage de caracteres d'interet agronomique chez la canne a sucre • l'appui a l'analyse bio-informatique de sequences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gene de resistance a la maladie de la rouille chez le cultivar de canne a sucre R570 • la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du desequilibre de liaison pour le marquage de genes d'interet agronomique chez la canne a sucre Profil souhaite : Doctorat en genetique avec maitrise des techniques moleculaires, ou en biologie moleculaire Experience significative en genetique quantitative et bio-informatique Bonne connaissance des outils d'analyse de sequences Lieu d'affectation : Montpellier Type de contrat : Contrat a duree determinee Date de prise de fonction : Immediate

Contacts:

Renseignements sur le poste : Angelique D'HONT, ca-cas, Tel. 04-67-61-59-27 Pour postuler : Bernadette VINCENT CIRAD-CA TA 70/09 Avenue Agropolis B.P. 5035 34398 Montpellier Cedex 5 Tel : 04.67.61.55.38 Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

24/04/2003

[AG]

computational biology/bioinformatics

Source:

BioJobs

Date de parution:

24/04/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Memphis (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A postdoctoral position in computational biology/bioinformatics is available in Dr. Yan Cui’s lab at Univeristy of Tennessee Health Science Center (Memphis, TN). We are interested in DNA microarray data analysis, gene network inference and protein structure prediction (http://compbio.utmem.edu). Ph.D. degree, researh experiences in bioinformatics or related fields, computer programming skills in C/C++ are required. The successful candidate will be able to take advantage of high performance computing facility including a new 48-processor Beowulf cluster. [Please reference Bioinformatics.Org when replying to this announcement.]

Contacts:

For immediate consideration send your CV to Dr. Yan Cui (ycui2@utmem.edu)

18/04/2003

[AG]

Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

25/04/2003

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : DRH ca-705 Date de publication : 07/04/2003 Date de clôture : 25/04/2003 Descriptif du poste : Au sein de l'équipe «Analyse du génome» du programme canne à sucre et de l'UMR « Polymorphismes d'intérêt agronomique » et pour assurer le suivi de plusieurs développements intervenus récemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge - la poursuite du travail sur les « Single Nucléotide Polymorphism » (SNP) comme outils de génotypage chez la canne à sucre - l'exploitation des collections dESTs de canne à sucre produites à la FAPESP au Brésil et de maïs et blé produites par le programme Génoplante pour le marquage de caractères dintérêt agronomique chez la canne à sucre - l'appui à l'analyse bio-informatique de séquences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gène de résistance à la maladie de la rouille chez le cultivar de canne à sucre R570 - la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du déséquilibre de liaison pour le marquage de gènes d'intérêt agronomique chez la canne à sucre Profil souhaité : Doctorat en génétique avec maîtrise des techniques moléculaires, ou en biologie moléculaire Expérience significative en génétique quantitative et bio-informatique Bonne connaissance des outils d'analyse de séquences Lieu d'affectation : Montpellier Type de contrat : CDD de remplacement (11 mois minimum) Date de prise de fonction : immédiate

Contacts:

Renseignements : Angélique DHONT, ca-cas, Tél. 04-67-61-59-27 Candidatures à adresser à : Bernadette VINCENT (bernadette.vincent@cirad.fr) Adresse postale : TA 70 / 09 Ave Agropolis 34398 Montpellier

17/04/2003

[AG]

INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Source:

BioInfo

Date de parution:

15/04/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le service Bionformatique de l'Institut Curie recrute : UN INFORMATICIEN CHEF DE PROJET Contexte : L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau (6 personnes) pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut. Missions : Le candidat sera chargé de la gestion de projets informatiques : expression de besoins, cahier des charges, définition de l'architecture, développement ou sous-traitance, validation à chaque étape du processus, installation et maintenance. Il aura à participer aux développements et à coordonner trois ingénieurs dans ces missions. Il aura également à organiser le fonctionnement de l'équipe pour garantir la qualité des développements et des flux d'information. Compétences : - Gestion de projets - Maîtrise d'ouvrage - Architectures client-serveur et multi-couches - SGBD relationnels (modélisation et administration) - conception UML - Apache (administration) - Environnement de développement Unix et Windows - Développement sous C/C++, Java (Swing, AWT, JSP, RMI), Perl, PHP - Connaissances métier en bioinformatique - Anglais courant 5 ans d'expérience minimum Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Merci d'envoyer vos CV, lettre de motivation et prétentions en précisant la référence BI4 à : Mme Anna Biedak-Cohen Institut Curie - Bioinformatique 26 rue d'Ulm 75005 PARIS Anna.Biedak-Cohen@curie.fr Tél. : 01 42 34 65 27 Fax : 01 42 34 65 28

14/04/2003

[AG]

Computer Biologist - Metabolic Disease Group

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

18/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Computer Biologist - Metabolic Disease Group (Ref: 560) Closing Date: 18th Apr 2003 Contact: humanresources@sanger.ac.uk The Metabolic Disease Group is a new group at The Wellcome Trust Sanger Institute; our aim is to apply genetic approaches to study type 2 diabetes and obesity. We are following a candidate gene approach and will be investigating the putative role of hundreds of genes via genetic association studies and functional analysis of mutations. We are seeking a Computer Biologist to provide support to the data handling activities of the group, this will involve close collaborative work with other groups at the Institute, in particular the Human Genetics Informatics group. Informal enquires may be made to Inês Barroso (ib1@sanger.ac.uk) The ideal candidate for will have at least two years post graduate experience of programming in a UNIX/LINUX environment, using one or more of the following: perl, C, java, javascript, plsql. A familiarity with RDBMS and a working knowledge of perl are essential. The role involves working closely with laboratory scientists and collaboration with other informatics groups, strong communication skills are required.

Contacts:

To apply for these positions please write with your CV and current salary details quoting the reference number to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA

14/04/2003

[AG]

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

11/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation (Ref: 559) Closing Date: 11th Apr 2003 Contact: humanresources@sanger.ac.uk The Wellcome Trust Sanger Institute is one of the leading genomics centres in the world, dedicated to analysing and understanding genomes. Through large-scale analysis - and focused research and collaborations - the Sanger Institute's programmes underpin biological and medical research worldwide. The pathogen sequencing unit has established a curated genome database, geneDB, to house gene annotation and functional genomic data. A position is now available for a senior computer biologist within the pathogen sequencing unit responsible for analysis of Plasmodium genome data and maintaining the Plasmodium content of the geneDB database. As a senior computer biologist you will be expected to interact proactively with both malaria and informatics research communities to develop and optimise the content and accessibility of the data. You will also interact with in house computer programmers to maximise the quality and utility of the data to the community. You should have a PhD and preferably laboratory experience of Plasmodium. Knowledge of programming/scripting is desirable, although not essential, as training will be provided.

Contacts:

To apply, please write with your CV and current salary details quoting reference 559 to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA. The closing date for applications is 11th April 2003

08/04/2003

[AG]

Postdoctoral job opening in Computational Biology

Source:

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

01/06/2003

Lieu:

Boston (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Department of Biology at Boston College has available a postdoctoral position for work in the CLOTE LAB in computational biology/bioinformatics with start date June 1, 2003. Requirements include a recent Ph.D. in computational biology/bioinformatics or strongly computational field such as computer science, mathematics, statistics, physics, chemistry. Strong programming skills are necessary, preferably in C/C++ and Python, as well as ability in mathematical modeling, probability and statistics. Current research projects in the Clote Lab include modeling of RNA and protein, functional genomics, applications of machine learning theory to bioinformatics, and mathematical evolution theory. Boston College provides a supportive, collegial environment with good Ph.D. program in biology, close proximity for possible research collaborations with other universities in the Boston area, and a very pleasant campus ambience.

Contacts:

For more information, please contact: Peter G. Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat Professor of Biology and Computer Science (courtesy appt) Boston College Chestnut Hill, MA 02467 Email: clote@bc.edu http://www.cs.bc.edu/~clote http://www.bc.edu/biology Tel: 617 552 1332 Fax: 617 552 2011 To apply please send either a hardcopy or email application. Application materials should include a CV,names and addresses of three references. For hardcopy applications please send reprints or preprints of articles. For email applications, please email pointers to on-line articles (please do NOT email the articles). Applications will be evaluated from now on until the position is filled.

08/04/2003

[AG]

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)

Source:

http://www.iarc.fr/pageroot/VACANCY/RC03_1_P2_GCS.html

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

09/05/2003

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS) Vacancy notice No. IARC/03/FT156 Grade: P.2 Contract Type: Fixed-term appointment Duration: Time-limited duration of four years Objectives of the programme: The overall objective of the Unit of Genetic Cancer Susceptibility is the identification and evaluation of inherited genetic factors in the etiology of cancer and the interaction between environmental factors and susceptibility genes. The successful candidate will: - To take a lead role in programming both a genotyping & gene-resequencing database and a laboratory information management system (LIMS) that will manage interaction between laboratory robotics, sequencing and genotyping instrumentation, and the database ; - To make sure that database and LIMS programming with the GCS Unit is compatible with systems and programs provided by the Biostatistics and Bioinformatics Unit, and collaborate in support with the Computer Services Group ; - To collaborate with other IARC Research Units and Groups and with outside scientists in the implementation of molecular epidemiological studies and their execution ; - To keep abreast with methodological developments in the field; - To be expected to attend several scientific meetings each year. Qualifications Required: Education and Skills: M.S. in Computer Science with documented background in Molecular Biology, or M.S. in Molecular Biology, or Biochemistry, or Biotechnology, or in a related field, with documented background in database programming experience. Ph.D. in any of the fields cited above would be an asset. Advanced knowledge of database programming and/or laboratory robotics programming. Ability to work in a teamwork environment. Would be an asset: knowledge of Java or Microsoft.NET software platforms, and ability to draft reports and grant proposals. Experience: At least two years of relevant professional experience at the national level or one year at the international level. Experience in programming web browser database interfaces would be an asset.. Languages: Good knowledge of English with a working knowledge of French. Annual salary (net of tax): US$ 40191 at a single rate - US$ 42849 with primary dependents. Post Adjustment: 27.30 % of the above figures. This percentage is to be considered as indicative since variations may occur each month either upwards or downwards due to currency exchange rate fluctations or inflation. Applicants should complete a Personal History Form and include a photograph. Internal candidates should use Form WHO.824.

Contacts:

APPLICATIONS SHOULD BE SENT TO: Personnel Office IARC 150, Cours Albert Thomas FR-69372 Lyon CEDEX 08 Fax: +33(0)4 72 73 83 35 Email: personnel@iarc.fr NB: This Email address should ONLY be used for vacancy applications. Due to the large number of messages, any other type of correspondance may not be answered. Applications from women are encouraged. Any appointment/extension is subject to WHO Staff regulations, Staff Rules and Manual. Staff are subject to assignment to any office of the WHO in the world and mobility is encouraged. Qualifications indicated in this vacancy are the minimum requirements. Candidates who are less qualified will not be considered.

07/04/2003

[AG]

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

21/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/34 March 2003 Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK: SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE Grade: 6 or 7, depending on age, experience and qualifications Duty Station: Hinxton, near Cambridge, UK Commencing Date: As soon as possible after closing date Job Description: We are looking for a software developer or bioinformatician to join a new Biochemical Compound Database project at the EBI. The EBI is home to the world class bioinformatics resources, such as the EMBL-Bank, SWISS-PROT + TrEMBL, InterPro, Macromolecular Structure Database (MSD), Gene Ontology (GO), IntEnz database of Enzyme Nomenclature and IUPHAR Receptor Database. The successful applicant will contribute to our efforts in developing a database of biochemical compounds, focussed on the metabolites and ligands in living cells. The goal is to create a definitive open resource of biochemical terminology and structure for consistent use by other EBI services and groups. The post-holder will take responsibility for the design and development of database and web applications. She/he is also expected to make a scientific contribution to the future expansion of activities in this area. Qualifications and Experience: Applicants should hold a masters (or higher) degree in Bioinformatics or Computer Science, plus some post-graduate or employment experience in chemoinformatics or bioinformatics. The candidate should be proficient in object-oriented programming languages (preferably Java). Experience with relational database management systems and/or commercial chemical databases would be an advantage. Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review. Closing Date: 21.04.2003 EMBL WWW pages: http://www.embl-heidelberg.de/ and http://www.ebi.ac.uk/ EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation. Please note that EMBL does not return CVs or attached documents to applicants.

Contacts:

Please send a CV and covering letter, including names and addresses of referees, quoting ref. no. 03/34, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, D-69012 Heidelberg, Germany Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

06/04/2003

[AG]

bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

10/04/2003

Lieu:

Nancy (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS INRIA-UHP-INPL recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS. Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences. Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm. L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses étant réalisées au MAEM.

Contacts:

Réponse nécessaire avant le 10 avril 2003 à adresser à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 : Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

06/04/2003

[AG]

BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le groupe Bionformatique de l'Institut Curie recrute : UN BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN Contexte : L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut. Missions : Le candidat travaillera à l'analyse des données génomiques (séquences, puces, réseaux génétiques) issues des différentes plate-formes technologiques de l'Institut et de ses partenaires. Son implication couvrira le développement des aspects méthodologiques, leur implémentation informatique et les analyses proprement dites. Compétences : - Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (analyse de séquences, analyses des données de puces) - Modélisation et analyse de données - Maîtrise des packages mathématiques et statistiques classiques (R/S+, Mathlab, Spotfire …) - Maîtrise d'un langage de programmation (C/C++, Java, Perl …) - Expérience des environnements Unix et Windows - Anglais courant Formation souhaitée : Ingénieur Grande Ecole ou 3ème cycle Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Personne à contacter, en précisant la référence BI2 : Mme Anna Biedak-Cohen Institut Curie Section Recherche Bioinformatique 26 rue d'Ulm 75005 PARIS Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

06/04/2003

[AG]

Postdoc modélisation des réseaux de gènes

Source:

BioInfo

Date de parution:

13/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la campagne de recutement de post-doc par l'INRA (http://www.inra.fr/drh), notre UMR propose, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes (équipe Helix) un sujet sur la modélisation des réseaux de gènes. Nous développons une puce à ADN dédiée la bactérie Buchnera, symbiote du puceron. Le but du travail sera de réaliser une première application consistant à étudier des réseaux de régulation identifiés chez Buchnera. L'accent sera particulère mis sur le métabolisme des acides aminés pour lequel l'UMR BF2I possède une expertise aux plans biochimiques et physiologiques. Plus généralement, ce travail permettra de compléter la panoplie d'outils bioinformatiques proposés dans la plate-forme Génostar en permettant notamment l'analyse des transcriptomes bactériens. Les personnes intéressés, jeunes docteurs bioinformaticiens -informaticiens ayant acquis une expérience dans la modélisation des réseaux sont priés de me contacter rapidement.

Contacts:

Jean Michel FAYARD: jmfayard@insa.insa-lyon.fr

06/04/2003

[AG]

Poste de professeur en génétique & bio-informatique

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

21/03/2003

Lieu:

Toulouse (31) (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Poste de professeur en génétique & bio-informatique à l'Université de Toulouse Section 65, Emploi nº 1312, analyse des génomes. Date limite de dépôt des candidatures : 21 mars 2003 Profil Recherche : Le LMGM souhaiterait accueillir un Professeur de Génétique pour créer une équipe s’intéressant à une thématique à l’interface de la Génétique et de la Bio-informatique centrée sur l’Analyse des Génomes et la Génomique Evolutive des Procaryotes. Cette thématique s’intégrerait parfaitement au sein de l’UMR 5100, la nouvelle équipe venant en complément de six (des neuf) équipes du LMGM qui développent leurs projets dans le cadre de deux (des trois) thématiques majeures de l’Unité, ‘‘Organisation et Dynamique du Génome’’ et ‘‘Plasticité Génétique’’. Profil Enseignement : La révolution de la Génomique élargit le champ d'investigation en Génétique. Il est impératif que notre université recrute un collègue capable de manier et enseigner les concepts et les méthodes de cette discipline d'avenir qu’est la Génomique. Le remplacement de Jean-Michel Louarn offre l'occasion d'ouvrir ce nouveau champ, par le recrutement d'un collègue travaillant à l'interface de la génétique et de la bio-informatique dans l’Analyse des Génomes et dans la Génomique Evolutive. Ce collègue devrait pour partie renforcer les enseignements déjà assumés par la commission pédagogique de Génétique. Il lui sera bien entendu également demandé de développer l'aspect Génomique Evolutive en s’appuyant sur les données de séquence génomique complète de très nombreux organismes procaryotes (plus de 80 répertoriés à ce jour) appartenant à des branches évolutives différentes.

Contacts:

Les candidats intéressés sont priés de contacter le Directeur du LMGM : Jean-Pierre Claverys UMR5100 CNRS-Université Paul Sabatier Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires 118 route de Narbonne 31062 Toulouse Cedex France tel. 05 61 33 58 55 (from outside France: 33 561 33 58 55) 05 61 33 59 11 (from outside France: 33 561 33 59 11) fax 05 61 33 58 86 (from outside France: 33 561 33 58 86) 05 61 33 58 61 (from outside France: 33 561 33 58 61) claverys@ibcg.biotoul.fr (e-mail) http://www-ibcg.biotoul.fr/recherche.html

06/04/2003

[AG]

Stage post-doctoral en génomique végétale

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de publication de l'offre : février 2003 Entreprise : Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS Lieu : 2 rue Gaston Crémieux CP 5708 91057 Evry Description de l'activité de l'entreprise : L'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) est localisée sur le site du Genopole d'Evry. Cette unité récemment implantée et spécialisée dans la Génomique des Plantes, est une unité mixte INRA/CNRS (UMR 8114). L'URGV occupe une superficie de 1000 m2 scindée en 2 laboratoires. Un premier laboratoire de 500 m2 se trouve dans le même bâtiment que le Genoscope, le second laboratoire étant dans le bâtiment du Centre National de Génotypage (CNG). L'URGV est équipée d'outils performants pour les manipulations "haut débit" (robots, arrayer, etc.). Nous collaborons étroitement avec le Genoscope et le CNG pour des projets impliquant le séquençage et le génotypage respectivement. L'objectif principal de l'Unité est de développer et d'appliquer des approches modernes en génomique pour l'étude des plantes modèles ou d'intérêt agronomique (voir site web: www.evry.inra.fr/) Description du poste : Génomique comparée entre Vitis vinifera et Arabidopsis thaliana. De nombreux caractères sont importants pour la production de raisins de cuve, qu'ils soient liés à la qualité ou à la résistance aux agents pathogènes. Or, leur analyse est ralentie par le long temps de génération de cette espèce pérenne. En revanche, la petite taille du génome de Vitis vinifera (475 Mb) est un avantage pour le développement d'approches génomiques. La construction d'une carte physique du génome de la vigne a donc été initiée à l'UMRGV avec la construction d'une banque BAC d'ADN de Cabernet Sauvignon clone 412 (44 900 clones, taille moyenne des inserts de 145 kb, au moins 13 équivalents génome), un programme d'ancrage de STS sur ces clones BAC (séquence des deux extrémités de 15 000 à 20 000 BACs). En parallèle, des stratégies vont être développées dans l'objectif d'utiliser les données obtenues sur la plante modèle Arabidopsis pour accélérer les recherches sur la vigne. Dans ce cadre, nous souhaitons évaluer dans quelle mesure la connaissance de la séquence du génome d'Arabidopsis pourrait aider à la construction de la carte physique du génome de la vigne en combinant des approches bioinformatiques et de cartographie physique. Le stage implique des interactions entre l'équipe travaillant sur l'organisation des génomes de plantes cultivées (blé, colza, peuplier et vigne), et l'équipe bioinformatique, qui regroupe de façon unique des compétences en analyse des génomes, annotation, construction de bases de données et interfaçage. Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003 Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable 1 fois

Contacts:

Contact : Anne-Françoise Adam-Blondon Tél.: +33 (01) 60 87 45 34 adam@evry.inra.fr

06/04/2003

[AG]

POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Au sein d'une équipe de recherche en génétique statistique (INSERM-Université d'Evry), située sur le campus de génomique d'Evry, le(la) candidat(e) participera à un programme de recherche visant à mettre en évidence des facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans des maladies humaines (asthme, mélanome malin) par des analyses statistiques de données familiales (analyses classiques et analyses propres à la génétique) Missions: - contribuer à la gestion de données à l'aide de procédures/programmes informatiques - effectuer des analyses statistiques de données (univariées et multivariée) à l'aide de logiciels statistiques - contribuer au développement de procédures et programmes informatiques pour faciliter la manipulation et l'analyse des données. - contribuer aux analyses génétiques des données à l'aide de logiciels propres à la génétique Compétences - Niveau Maîtrise ou DEA/DESS en biostatistique/informatique/épidémiologie - Maîtrise des environnements informatiques Windows et UNIX (procédures shell) - Connaissances des logiciels classiques de statistique (SAS, STATA) - Connaissances en programmation informatique (Fortran, Pascal, C, shell, perl) - Connaissances de logiciels utilisés en épidémiologie génétique ou volonté de les acquérir. Aptitudes: Rigueur dans le travail, fiabilité, communication, capacité d'autonomie, disponibilité Salaire: - Niveau Ingénieur d'Etude INSERM/Université (à partir de 1 800 Euros brut par mois) à déterminer en fonction de la qualification et des compétences du candidat - Contrat à Durée Déterminée (un an et renouvelable)

Contacts:

Florence DEMENAIS INSERM EMI 0006 Tour Evry 2 523 Place des Terrasses de l'Agora 91034 EVRY Tél : 01 60 87 38 26 Fax : 01 60 87 38 48 Mél : demenais@evry.inserm.fr

06/04/2003

[AG]

professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Departement de Biologie de l ENS-Paris cherche a recruter un professeur animant recherche et enseignement sur le theme: Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques. Celui ci devra mener ses recherches au sein du Departement de Biologie en interaction avec les groupes des Departements de Physique et Informatique.

Contacts:

Contacts: A Prochiantz Directeur du Departement de Biologie, prochian@biologie.ens.fr, A Feltz, pour la CS de Biologie 27-28, feltz@biologie.ens.fr Claude Jacq Laboratoire de Genetique Moleculaire CNRS UMR 8541 Ecole Normale Superieure 46 rue d Ulm 75230 PARIS Cedex 05 Tel: 33 1 44 32 35 46 (office) 33 1 44 32 35 70 (secretariat) mobile: 33 (0)6 61 76 28 98 Fax: 33 (0)1 44 32 37 30 http://www.biologie.ens.fr/microarrays.html

06/04/2003

[AG]

professeur de bioinformatique

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Lille (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la création de l’Institut de Recherches Interdisciplinaires à Lille (http://www.dr18.cnrs.fr/iri/index.htm), l’Université de Lille 1 cherche à recruter un professeur de bioinformatique dont les travaux de recherche concernent l’analyse des séquences régulatrices, le développement de banques de données pour l’étude des réseaux de régulation transcriptionnelle. Des moyens seront alloués pour permettre au candidat retenu de développer une équipe de recherche en collaboration avec les équipes de mathématiciens, de bioinformaticiens et de biologistes de la Génopole de Lille. Chargé de mission pour la création de l’IRI : Bernard Vandenbunder (Bernard.Vandenbunder@ibl.fr) CNRS UMR 8117 / Institut Pasteur de Lille / Université de Lille 1 Institut de Biologie de Lille 1 rue Calmette BP 447 59021 Lille Cedex (France) Tel : (33) 3 20 87 10 90 Fax : (33) 3 20 87 11 11

Contacts:

Nom de la personne à contacter pour l’enseignement : Hélène Touzet (touzet@lifl.fr) Nom de la personne à contacter pour la recherche : Jean Marc Geib (geib@lifl.fr) Le profil complet du poste se trouve à l’adresse suivante : http://www.univ-lille1.fr/personnels/recrutement/informations.htm

02/04/2003

[AG]

Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department

Source:

BioJobs

Date de parution:

02/04/2003

Date limite de réponse:

25/04/2003

Lieu:

Dublin (Irelande)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A postgraduate studentship is available from Oct 2003 in the Computer Science Department for research in Data Mining and Knowledge Discovery in Bioinformatics. Applications are sought from candidates with a good honours degree in a biological subject and from candidates who expect to graduate in the summer of 2003. Previous experience using standard bioinformatics tools and in developing new approaches and methods would be useful.The studentship is funded by Science Foundation Ireland and the research will focus on the development of Machine Learning and Data Mining techniques for application in Bioinformatics.

Contacts:

Further details are available from Prof. Pádraig Cunningham or Dr. Nadia Bolshakova (Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie). Applicants should send a full CV to Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie before 25th April.

28/03/2003

[AG]

Ingénieur de recherche CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Mission : L'ingénieur de recherche a en charge de concevoir, développer et déployer les méthodes et outils bioinformatiques d'intégration et d'analyse des données issues des plate-formes de génomique à haut débit, en vue de leur exploitation au sein des programmes de recherche de l'unité et de l'Institut. Il mènera sa mission en concertation étroite avec les biologistes de l'unité, les médecins et les bioinformaticiens de l'Institut. Activités : - Analyser les besoins dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges, en relation avec l'ingénieur de la plateforme de génomique fonctionnelle (en cours de recrutement) ; - Développer des solutions méthodologiques aux problèmes d'analyses à haut débit ; - Implémenter et mettre en service ces solutions (déploiement, formation) ; - Intégrer les données génomiques et phénotypiques publiques et privées nécessaires aux analyses ; - Participer aux analyses de données en relations avec les biologistes et médecins ; - Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine ; - Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en Suvre des techniques bio-informatiques. Compétences : - Avoir de bonnes connaissances de la biologie cellulaire et des grands principes qui régissent le fonctionnement des cellules ; - Avoir une formation approfondie en bio-informatique (diplôme d'ingénieur ou 3ème cycle universitaire) ; - Avoir une expérience de l'environnement UNIX, des langages Java, C/C++, Perl, PHP, SQL et une pratique des architectures client/serveur ; - Avoir une expérience dans la gestion et l'analyse de gros volumes de données scientifiques ; - Avoir une pratique des bases de données, outils d'analyse et concepts de la bioinformatique ; - Maîtriser l'anglais scientifique à l'orale et à l'écrit ; - Aptitude à la communication ; - Travailler en équipe. Contexte : Travail au sein de l'UMR 144 CNRS - Institut Curie, en étroite collaboration avec le service Bioinformatique de l'Institut Curie, les plate-formes de transcriptome, CGH, protéome et génotypage, ainsi que d'autres unités du Campus participant au site Mte Ste Geneviève du Génopole Ile de France.

Contacts:

Voir http://www.sg.cnrs.fr/drhita/concoursita/2003/02_consulter.htm et en bas de la page demander à voir le concours n°3

28/03/2003

[AG]

professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière

Source:

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un poste de professeur en bio-informatique (0122 s) est ouvert au recrutement à l'université Paris 6 en 27e section (informatique). La recherche sera effectuée à l'Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière. L'enseignement sera dispensé à l'UFR d'informatique. Le profil complet du poste est disponible à l'adresse www.lip6.fr

Contacts:

Recherche : Dominique MAZIER, Unité INSERM 511, Pitié-Salpêtrière, 0140779736 Enseignement : Mme la Directrice de l'UFR informatique : DirUfr@ufr-info-p6.jussieu.fr Présidente de la commission de spécialistes 27e section : Anne.Doucet@lip6.fr

28/03/2003

[AG]

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics

Source:

ABG-7697-2

Date de parution:

21/03/2003

Date limite de réponse:

01/06/2003

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics : Development of Statistical Strategies and Tools - Evry, France Date de debut de diffusion du poste : 21/03/2003 Date de fin de diffusion prevue : 01/06/2003 Aventis Pharma, in partnership with the European Commission, offers 2 Marie Curie Industry Host Fellowships, for a 2 year period, on a project focused on the development of statistical strategies for the analysis of case-control pharmacogenetic data. The methods will enable the discovery and consequently the diagnosis of genetic polymorphisms underlying factors such as drug response, drug toxicity, and disease state and severity. Based at the Evry Genetics and Pharmacogenetics Center,your roles will be to : - Develop single-and multi-point linkage disequilibrium methods, with special reference to issues such as control sample selection and genomic control, marker selection, haplotype construction and analysis,and multiple testing. Candidates should have experience in a field such as mathematics, statistics, population genetics, or genetic epidemiology. Fluency in English is required. The positions are open to members of the E.C. or residents of associated countries* for more than 5 years. You must hold a PhD. The age limit at the time of selection is 35 years old. * Austria, Belgium, Bulgaria, Czech republic, Denmark, Estonia, Finland, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Israel, Italy, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, The Netherlands, Norway, Poland, Portugal, Republic of Cyprus, Romania, Slovakia, Slovenia, Sweden, Spain, and United Kingdom. However French citizens are ineligible as well as those who have been resident in France for more than 12 out of the last 24 months. Employment Conditions Field of application The Marie Curie Post-Doc Fellows are recruited on a fixed-term contract. Aventis has been selected by the European Commission as a hosting institution able to deliver research training for post-doctoral researchers. Salary and benefits The annual scales are normally within the range of 30 to 39 k€ depending on the age and experience of the scientist. Post-doctoral fellows are entitled to elect and participate in the Aventis French benefits as offered to regular full-time associates. This includes: medical and/or dental insurance, healthcare and dependant care reimbursement accounts. Relocation In regard to the household goods, Aventis DI&A Paris will reimburse the candidate as follow: up to 600 € for a single person up to 900€ if the Post doc fellow comes with his/her spouse. up to 200€ per child Mobility allowances The post doc fellow will receive a monthly mobility allowance of 400 € (as agreed with the EC) all along his/her assignment. Airfare Economy airfare will be provided to work site from home and a return economy flight home completion of the post-doc assignment. Housing accommodations The company will pay for furnished lodging accommodations for up to 15 days at the post doc fellow arrival in France. In order to help the Post-doc fellow to find a suitable housing, relocation counselor provided by Aventis will be available to discuss the details on housing arrangements. If needed, support will also be provided to open bank account in France and for administrative steps. French lessons Aventis will help all post-doctoral fellows who will express the wish to be trained in French. According to their French language knowledge, the most appropriate course will be given. Two 40 hour-package can be offered by Aventis and if necessary additional courses could be given by the “Alliance Francaise”. Working hours In application of the agreements on the organization and duration of work in force within the company, working time consists of an average of 35 hours effective work per week over the year. Vacations Employees at Aventis are eligible for 31 vacation days for a full period (i.e.12 months), more 14 days off in application to the 35 hours agreement (RTT days) for a full period.

Contacts:

Written details and letters of application for both positions, together with CVs and the names of two referees should be sent to : Dr. JF Deleuze, Director of the Evry Genetics Center, Aventis Pharma, 2, rue Gaston Cremieux, 91057, Evry, France. Tel: 33 1 58 93 90 01, Fax: 33 1 58 93 90 10, e-mail : jean-francois.deleuze@aventis.com Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

23/02/2003

[AG]

Data Analysis Scientist

Source:

Date de parution:

23/02/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Ankeny (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Monsanto values diversity and is an equal opportunity affirmative action employer. Department: Technology Development Title: Data Analysis Scientist Req Number: mons-00000893 Location(s): Ankeny IA Responsibilities: The successful candidate will be part of a Data Analysis team within our plant breeding organization. The individual in this role will be analyzing molecular marker data sets and crop trial data, this implies: Test procedures through simulations and validations methods to help optimize research strategies. Develop analysis tools and routines to be used by other researchers in the organization. Apply current and new statistical tools to the analysis of experiments. Design and propose experiments, based on analysis results and/or new technological developments. Required Skills: A Ph.D. in bioinformatics, statistics, statistical genetics, or in a related discipline with a solid statistical training is required. The candidate should demonstrate ability to work as a team member, have good communication skills, be creative at problem solving, and be detailed-oriented. Consideration will be given if the candidate could demonstrate any of the following skills: Computer programming as well as building, querying, and managing large databases. Prior exposure to quantitative and population genetics, and the application of molecular markers to large/complex pedigrees. Experience with simulation procedures and Bayesian analysis.

Contacts:

http://sh.webhire.com/Public/554/jd1224976.html

20/02/2003

[AG]

Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)

Source:

AGM2

Date de parution:

20/02/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Hertfordshire (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for 2 postdoctoral fellowships in the group of Kim Hammond-Kosack studying Fusarium ear blight and mycotoxin control in Europe’s Cereal Crops. Our studies employ a wide range of techniques from plant pathology, molecular biology, bioinformatics, wheat genetics and functional genomics (http://www.iacr.ac.uk/ppi/wptop.html). One post-doc fellow will be in charge of the bioinformatics analysis of the plant’s response to Fusarium ear blight infection in both susceptible and resistant wheat cultivars. The second post–doc will be in charge of the bioinformatics analysis of the Fusarium graminearum genes expressed in planta, during the invasion of susceptible and resistant wheat cultivars. Both posts will take advantage of Monsanto’s proprietary wheat EST collection and transcriptome profiling data sets, specifically generated for these project. In addition, there are growing public wheat ESTs collections and in 2003 the entire F. graminearum genome will be sequenced at the Whitehead Institute, Boston, USA. Candidates should have a strong background in bioinformatics and molecular biology. An interest in fungal biology/host-pathogen interactions is desirable but not essential. Collaboration and teamwork are essential to this position. Candidates should also show excellent interpersonal skills. The work will be based in the new Centenary laboratory at Rothamsted Research, with access to first class molecular and analytical facilities, bioimaging, controlled environments and new glasshouses. Eligible candidate for these 2 posts must be under 35 years of age, have obtained their Ph. D. degree within the last 5 years, hold a European passport and have not worked previously in the UK.

Contacts:

Applications, including a detailed CV, a brief summary of research interests, the names and addresses of three referees, should be addressed to Dr Kim Hammond-Kosack, Rothamsted Research, Plant-Pathogen Interaction Division, Harpenden, Hertfordshire, AL5 2QJ, UK. Tel 44(0) 1582 763133 Ext 2240, Fax 44(0) 1582 715009. E. mail kim.hammond-kosack@bbsrc.ac.uk. Rothamsted Research is situated 30 Km north of London, England and has excellent links to the major motorway, rail and air routes. This government institute with approximately 500 staff undertakes basic and strategic research on sustainable plant-based agriculture and the environment. Both positions are available April 2003-March 2005 and are funded under EU Framework V.

16/02/2003

[AG]

Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute

Source:

Date de parution:

16/02/2003

Date limite de réponse:

31/03/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

???

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of computational and experimental genome research. We have strengths in bioinformatics software, algorithm and database development, and exceptional data and computational infrastructure. The Wellcome Trust has recently awarded £300 million to the Sanger Institute to support our new biological/genetics research direction as well as our existing programmes over five years, plus £65 million for IT infrastructure. Applications are invited for full time faculty positions at the rank of Investigator, Senior Investigator, or Principal Investigator . For faculty members, we are looking for individuals with a proven background in first class research, with a strong, vision and innovative projects that are ideally in areas related to our large scale experimental programmes. We encourage relevant applications from people with backgrounds in bioinformatics, computer science or mathematical or scientific areas. Head of Production Software: We are also looking for a new head of our production software group, who will be responsible for directing teams involved in internal data processing. This position will have faculty status at one of the levels listed above, with independent research opportunities. The Sanger Institute is committed to provide a level of support so that there is no impediment to performing high quality and productive science. This includes access to our infrastructure as well as unencumbered support commensurate with the rank of appointment.

Contacts:

Applicants are requested to send their curriculum vitae with a full publication list by 31st March 2003. You should also provide a two page description summarising your research accomplishments to date and a three page plan of your future research goals and strategies indicating how these fit with, or make use of Sanger Institute programmes and infrastructure. All candidates must provide three letters of recommendation. Please arrange to have these letters and application sent to: Richard Durbin Faculty Search Committee The Wellcome Trust Sanger Institute Wellcome Trust Genome Campus Hinxton, Cambridge CB10 1SA ENGLAND Email: rd@sanger.ac.uk FAX: +44 (0) 1223 494714

06/02/2003

[AG]

STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE

Source:

ABGe-1068

Date de parution:

28/01/2003

Date limite de réponse:

27/03/2003

Lieu:

Laval (Canada/Quebec)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un grand projet de genomique fonctionnelle appliquee aux arbres forestiers au Centre de recherche en biologie forestiere de l'Universite Laval et finance par Genome Quebec/Genome Canada, offre des opportunites uniques. Les technologies nouvelles, le travail en equipe, le developpement professionnel et les collaborations internationales vous interessent? Voici un poste de haut-niveau qui pourra combler vos attentes! Fonctions : Etude du role de facteurs de transcription et autres genes regulateurs des arbres forestiers, impliques dans la differentiation du tissu vasculaire et la formation du bois, ou les mecanismes de defense des arbres. Analyses detaillees de l'expression des genes par RT-PCR en temps reel Analyse de la fonction des genes par surexpression ou inhibition chez l'epinette et le peuplier transgeniques, grace a notre plateforme specialisee de transgenese des arbres forestiers Analyse des profils de transcription des cellules et arbres transgeniques par l'utilisation de puces d'ADN specialisee (microarrays) Participation a la formation et l'encadrement d'etudiants et du personnel de laboratoire Redaction d'articles scientifiques et presentation des resultats dans des congres specialises Qualifications : Diplome de doctorat (Ph. D.) en genomique, biologie vegetale, biologie moleculaire ou cellulaire, ou dans un domaine connexe Une bonne connaissance pratique des methodes de biologie moleculaire est requise Experience souhaitable en manipulation d'ARN, etudes sur micropuces d'ADN, RT-PCR en temps reel ou transgenese des plants Tres bonne communication orale et ecrite Aptitude demontree pour le travail en equipe Capacite au travail autonome et a l'encadrement Tres bonne connaissance de l'anglais ecrit et oral

Contacts:

Poste disponible des maintenant, contrat jusqu'au 31 mars 2005 avec possibilites de renouvellement. Par e-mail : genome.foret@rsvs.ulaval.ca SVP, pour postuler, soumettre : - une lettre de presentation - un curriculum vitae a jour - les noms et coordonnees de trois personnes references La description du projet est disponible a l'adresse suivante : http://forgenome.rsvs.ulaval.ca Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

06/02/2003

[AG]

Plant Genomics Research Unit PostDoc

Source:

Date de parution:

17/01/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The URGV, Plant Genomics Research Unit (Evry, France), supported by INRA and the CNRS, has a post-doctoral position available immedialetly. Description : The applicant must have a PhD in molecular biology, with expertise in bioinformatics. He/she will be involved in a project studying large scale transcription profiling of Arabidopsis. The aims of the project is to develop a Compendium of Arabidopsis Gene Expression (funded by the European Union) using the european Complete Arabidopsis Transcriptome Microarray (CATMA), for Arabidopsis gene function discovery through large scale expression data analysis. Two teams at the URGV are involved in microarray analysis, comprising 2 senior scientists, 5 engineers, 2 post-docs, one PhD student and 2 technicians. The URGV also includes a strong bio-informatics/statistics group. Salary : 1800EUR per month, free of charge

Contacts:

Dr Renou jean Pierre The Transcriptome Group INRA/CNRS -URGV 2, rue Gaston Crémieux, CP5708, 91057 Evry cedex, France Phone + 33 1 60 87 45 17 e-mail : renou@evry.inra.fr

06/02/2003

[AG]

annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/02/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Orsay (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre d'un projet Génoplante nous recherchons un DESS biologiste-bioinformaticien motivé, désirant participer à l'annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana. L'annotation semi-automatique du génome d'Arabidopsis thaliana a permis l'identification et la localisation d'environ 29.000 gènes. Cependant, cette première annotation, puisque rapide, est de mauvaise qualité. Or l'ensemble des projets de génomique fonctionnelle qui se développent actuellement dépend de ces annotations. Le but du projet est d'obtenir une annotation homogène, fiable, documentée et traçable des gènes d'Arabidopsis et de leurs protéines puis de les saisir dans une base de données à valeur ajoutée. La ré-annotation est effectuée, au sein de laboratoires experts, par l'analyse exhaustive de familles de gènes, à l'aide d'un protocole d'annotation défini lors de la première phase du projet et mettant en oeuvre les logiciels de prédiction les plus efficaces actuellement. Ce projet, effectué par un réseau de laboratoires français et SwissProt présente une réelle opportunité pour acquérir rapidement une expérience en analyse de séquences, fouille de données dans les grandes bases de données de séquences, connaissance des génomes et analyse fonctionnelle bioinformatique. Lieu: IBP à Orsay. Durée : 18 mois, début probable 15 mars - début avril 2003. Rémunération: niveau IE CNRS.

Contacts:

Responsable du projet: C. Toffano-Nioche, CR CNRS Responsable du laboratoire: A. Lecharny, DR CNRS. Equipe "Analyse des génomes des plantes" Institut de Biotechnologie des Plantes lecharny@ibp.u-psud.fr Tel : 33 (0)1 60 87 45 18 Fax : 33 (0)1 60 87 45 49 http://www.ibp.u-psud.fr/ Equipe de bioinformatique de l'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) INRA-CNRS-Univ. Evry-Val d'Essonne 2, rue G. Crémieux CP 5708 F-91057 Evry CEDEX FRANCE http://www.evry.inra.fr/ Claire Toffano-Nioche (toffano@ibp.u-psud.fr) Génome, évolution et développement de la plante Institut de Biotechnologie des Plantes bat.630 - Universite Paris-Sud 91405 - Orsay cedex tel.: 01 69 15 34 04

30/01/2003

[AG]

8 postes

Source:

AGM2

Date de parution:

30/01/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Munich (Allemagne)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

8 postes à pourvoir en relation avec les base de données développées au Munich Info center for Protein Seq (MIPS).

Pièce Jointe :

mips.pdf (64 ko)

Contacts:

Voir http://mips.gsf.de/positions

29/01/2003

[AG]

Molecular Database Indexer

Source:

http://www.bind.ca/index.phtml?page=jobs

Date de parution:

29/01/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Toronto (Canada)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Indexers will gather information from the published literature in order to enter and curate database records. The ideal candidate is a recent Ph.D. or M.Sc. graduate with experience in the detection and analysis of molecular interactions. You have excellent written communication skills and an interest in bioinformatics (training is provided). You may also have a broad knowledge in one or more of the following areas: signal transduction pathways, regulation of gene expression, metabolic pathways in any organism, biophysical measurement of molecular interactions and/or enzyme kinetics.

Contacts:

We will be conducting several rounds of hiring throughout the year. Qualified individuals are encouraged to apply directly with salary expectations, availability and references to: Blueprint Positions c/o Christopher W.V. Hogue, Ph.D. Samuel Lunenfeld Research Institute Rm 1063, Mt. Sinai Hospital 600 University Ave. Toronto, Ontario. Canada. M5G 1X5 (416) 586-4800 xt2866 fax (416) 586-8869 blueprintjobs@mshri.on.ca Only suitable applicants will be contacted.

15/01/2003

[AG]

Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques

Source:

ABG-7538

Date de parution:

08/01/2003

Date limite de réponse:

08/02/2003

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

ABG-7538-POSITION POST-DOCTORALE EN STATISTIQUES, BIOSTATISTIQUES/BIOMATHEMATIQUES - Montpellier, France Le departement Immunologie-Oncologie recherche, dans le cadre d'analyses de donnees generees par les puces a ADN, un post-doc pour developper des methodes statistiques appliquees au transcriptome. Le candidat devra posseder un doctorat de Statistiques, biostatistiques et/ou biomathemathiques, une excellente connaissance des methodes statistiques et d'analyse de donnees de masse. Des connaissances en biologie seront tres appreciees. La duree de ce programme est de 12 mois renouvelable 6 mois. Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

Contacts:

Omar JBILO De preference par e-mail : omar.jbilo@sanofi-synthelabo.com Sanofi-synthelabo 371 Rue du Professeur Blayac 34184 MONTPELLIER Cedex 4 - France

15/01/2003

[AG]

BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST

Source:

BioInfo

Date de parution:

15/01/2003

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Toulouse (31) (France)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

SANOFI-SYNTHELABO RECHERCHE BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST We are currently looking for a bioinformatics scientist to fill a positionin the Bioinformatics unit within the Department of Molecular and Functional Genomics. Applicants will be involved in sequence analysis with a strong emphasis on genome and proteome data mining and the developing of application pipelines for gene discovery, to identify potentially new and innovative drug targets in both public and proprietary genomic databases. She/he should also be able to participate in projects concerning other computational biology systems (transcriptome analysis of microarray chips, proteomics analysis by 2D gel electrophoresis, protein characterization by mass-spectroscopy fingerprinting, etc.) as well as in projects integrating data coming from all the bioinformatics systems. The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or related area. She/he should have a strong experience in conceiving sequence analysis pipelines and in using state of the art sequence analysis tools and software packages. Solid knowledge of molecular biology, biochemistry and metabolic pathways is required, as well as strong programming skills and background in computing science (Unix, Perl/CGI, HTML, Java, C/C++, SQL, Oracle). Excellent communication skills and a collaborative attitude to work in multidisciplinary teams are essential. A working knowledge of french is not indispensable. In return for your expertise, we offer a competitive salary/benefits package that includes the opportunity to participate in the success of the company. The post will be based at Labège, on the southeastern of Toulouse.

Contacts:

If you are interested in this position, please forward your application immediately to: Dr. Edgardo Ferrán, Bioinformatics, Molecular and Functional Genomics Department, Sanofi-Synthélabo Recherche, Labège Innopole, BP 137, 31676 Labège Cedex, France. Fax: +33 561004228. e-mail: edgardo.ferran@sanofi-synthelabo.com.

02/01/2003

[AG]

BioInfomaticien stockage et analyse de données

Source:

BioInfo

Date de parution:

17/12/2002

Date limite de réponse:

17/01/2003

Lieu:

Toulouse (31) (France))

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un CDD de 11 mois (salaire mensuel brut : 1868 euros) est proposé dans l'équipe informatique du projet AGENAE (Analyse du Génome des Animaux d'Elevage) sur le site INRA de Toulouse-Auzeville (31), à partir du 1er févier 2003. Le projet AGENAE a pour but de réunir les connaissances fondamentales sur la structure des principaux génomes d'intérêt pour l'élevage - dans un contexte de collaboration internationale - et valoriser les expertises concentrées à l'INRA en génétique moléculaire et en physiologie expérimentale sur les systèmes biologiques bien contrôlés dont l'institut dispose (animaux /ad hoc/ et installations expérimentales correspondantes). L'équipe bio-informatique (SIGENAE) composée de cinq personnes, met à disposition des différents laboratoires du projet (plus de 20) des outils et des services bio-informatiques. Ses travaux actuels sont centrés sur l'analyse de la qualité des séquences d'EST, leur contigage et leur annotation. Les demandes des utilisateurs pour la période à venir concernent l'analyse d'expression et la cartographie. Le bio-informaticien recruté aura comme mission de mettre en place des outils de stockage et d'analyse de données d'expression et d'apporter le support nécessaire à leur utilisation. Le niveau d'étude demandé est BAC +4 et plus. Cette personne doit être familière avec le traitement des données d'analyse d'expression (parties informatique et statistique), connaître le langage PERL et la programmation d'interface web.

Contacts:

Veuillez envoyer vos lettre de motivation, CV détaillé et demande de renseignement à Christophe Klopp (christophe.klopp@toulouse.inra.fr) = Christophe KLOPP BIA INRA Toulouse 31326 Castanet-Tolosan = = Tel: 05 61 28 50 36 Email: christophe.klopp@toulouse.inra.fr = La date limite des réponses est fixée au 17 janvier 2003.

08/12/2002

[AG]

7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes

Source:

http://www.inra.fr/gap/actualite/infosgap/concoursCR2003/index.htm

Date de parution:

08/12/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

(France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Département INRA de Génétique et d'Amélioration des Plantes recrute par concours 7 Chargés de Recherche en 2003 11 profils recouvrant des compétences en génétique des populations, génétique quantitative et génétique fonctionnelle sont proposés. Ces concours sont ouverts à toute personne titulaire d'un doctorat, PhD ou équivalent, quelque soit sa nationalité.

Pièce Jointe :

inra_dgap.pdf (124 ko)

Contacts:

Pour tout renseignement concernant un profil particulier, contacter les équipes directement concernées (indication en bas de chaque profil). Pour tout renseignement concernant l'organisation des concours (ouverture prévue début janvier 2003) contacter la Direction de Ressources Humaines (Chantal David, DRH INRA, 147 rue de l'Université,75338 Paris Cedex 07, david@paris.inra.fr)

08/12/2002

[AG]

BioInformaticien

Source:

BioInfo

Date de parution:

08/12/2002

Date limite de réponse:

31/12/2002

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un cdd de 6 mois (salaire mensuel net: 1870 euos) est proposé dans l'équipe inra de génotypage à haut débit des plantes installée au centre national de génotypage à evry (91). cette équipe permet aux équipes nécessitant du génotypage à haut débit chez les plantes d'accéder aux technologies de pointe, en utilisant en particulier les snp (single nucleotide polymorphism); elle participe aux programmes scientifiques des équipes du secteur végétal de l 'inra et de ses partenaires qui nécessitent des capacités de production massive de données (analyse des ressources génétiques naturelles, connaissance des génomes et des déterminants génétiques de caractà¨res phénotypiques...). le cng a développé un logiciel "tout en un", genalys (m.takahashi.2002) pour la détection des snps: incorporation directe des résultats des séquenceurs, alignement par rapport à une séquence de référence, visualisation des chromatogrammes, caractérisation automatique des snps (position, type de changement), fichier de sortie compatible avec différents formats de fichiers (dont excel), en relation avec des bases de données. cependant des besoins plus particuliers aux programmes réalisés par l'équipe "plantes" sont à résoudre pour permettre une plus grande efficacité dans la manipulation et l'analyse des résultats et surtout leur diffusion aux équipes partenaires. la présence d'un (bio)informaticien dans l'équipe pendant 6 mois permettrait notamment: • la création automatique d'une séquence "virtuelle" permettant de visualiser simultanément tous les polymorphismes connus sur une séquence à • partir du fichier de sortie de genalys, • la reconstitution automatique d'une séquence nucléotidique à partir d'une séquence de référence et des positions et qualité des snps identifiés. • la constitution automatique des haplotypes et leur tri en fonction de leur proximité phylogénétique. • le calcul des estimateurs usuellement utilisés pour décrire la variabilité génétique des populations: hétérozygotie, fréquence des snps, des haplotypes. la personne recherchée doit être capable de concevoir des programmes en c,c++, perl. la connaissance de java serait appréciée. le cdd en question peut commencer au plus tard le 01/01/03.

Contacts:

pour tous renseignements, contacter dominique brunel (brunel@cng.fr) centre national de génotypage 2 rue gaston crémieux cp 5721 91057 evry cedex

03/12/2002

[AG]

Postdoctoral position : Genomique bacterienne

Source:

ABG

Date de parution:

25/11/2002

Date limite de réponse:

25/12/2002

Lieu:

Jouy en Josas (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Unite de Virologie et Immunologie Moleculaires of the Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) has a 18-month postdoctoral position available for someone interested in bacterial genomics. Theproject is supported by a grant from INRA and involves the sequencing of the whole genome of one of the most economically significant fish-pathogenic bacterium worlwide. The position is available immediately and will be based in the INRA research center in Jouy-en-Josas, close to Paris, France. We are seeking a person with proven skills and experience with a wide range of molecular techniques and bioinformatic analyses. The applicants' nationality should be other than French. The laboratory has access to a variety of facilities in the general area of microbial genomics. More details about the project can be provided on request.

Contacts:

Send CV or request for more informations to abdenour@jouy.inra.fr Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

18/10/2002

[AG]

IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER

Source:

http://www.biotoile.org/annonces.asp

Date de parution:

18/10/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

(Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

HIGHLY COMPETITIVE AND FLEXIBLE REWARDS PACKAGE UK Our client, one of the world's leading pharmaceutical companies, is seeking a talented, experienced scientist to lead a successful, established bioinformatics team and work on the forefront of drug discovery. THE POSITION The appointed candidate will be responsible for developing new Bioinformatics initiatives to drive the discovery of new therapies for respiratory and inflammatory disease. This pivotal and challenging role offers the incumbent an opportunity to exploit, explore and champion the use of Bioinformatics throughout the drug discovery pipeline – from target identification through to late stage discovery, lead optimisation and pharmacogenomics. The successful candidate will need excellent interpersonal skills and will be expected to interact with key people in other departments, locally and internationally across the other sites which make up the research area. A creative approach to scientific research is important. The successful candidate will be able to use his/her knowledge, experience, and judgment to provide novel solutions to problems and to make a difference to the direction of the science. The new incumbent will understand Bioinformatics systems and with this knowledge, exploit and use it. He or She will help other scientists to learn and build their own bioinformatics data and will liase closely and coordinate activities with other Bioinformatics Scientists at sites in North America, UK and Sweden. THE CANDIDATE The successful candidate will have the following background: - A good honours degree in biochemistry, microbiology, biotechnology or biological sciences. A higher degree, such as a PhD, in a relevant discipline would be beneficial. - A minimum of three years’ experience in Bioinformatics, of which at least two years would have been gained in the pharmaceutical industry. - Practical experience of all main areas of bioinformatics, including microarray, sequence analysis, proteomics, knowledge management, etc. - Extensive knowledge of biological techniques used in target identification. - Proven experience of interacting with external collaborators and vendors. - An understanding of drug discovery processes, chemoinformatics and genetics would be desirable. - Proven skills in management and direction, where the candidate has managed a small team or supervised a small number of people for a minimum of two years, preferably in a team-leadership role. - Experience of training of personnel as well as of programming (key languages include Perl, SQL, VB, VBA, C, Javascript) would be a distinct advantage. - Knowledge of Maths and, in particular, of Statistics when applied to microarray data is essential.

Contacts:

CONTACT Quoting reference number LTDB-44-1487, please apply with your CV by email to Boris BOUQUENIAUX, Research Associate to borisbouqueniaux@euromedica.com or call on his direct line: +44 (0) 1223 209 509 for more information.

30/09/2002

[AG]

2 1/2 postes ATER vacants

Source:

hd-emploi

Date de parution:

30/09/2002

Date limite de réponse:

07/10/2002

Lieu:

Orsay (France)

Statut:

ATER

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A l'Universite Paris 11 (Orsay), deux 1/2 postes d'ATER sont vacants,les profils souhaités sont : 1) Biostatistiques (DEUST) et Génétique formelle (DEUG/LICENCE) 2) Bioinformatique/ bureautique (DEUST de Biotechnologies) Les enseignements débuteront dès le 1er semestre. Les dossiers administratifs peuvent être retirés au secrétariat du Dépt de Biologie, Bâtiment 360 au 1er étage, ou téléchargés ici Penser a y joindre un dossier scientifique.

Contacts:

Les dossiers de candidature sont à déposer pour le 7 Octobre 2002 au secrétariat du département (bât 360) ou à envoyer par email à Antonie Alet (antonie.alet@ibaic.u-psud.fr).

26/09/2002

[AG]

2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV

Source:

Ph. marc

Date de parution:

26/09/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Los Angeles (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

We are accepting applications for 2 postdoc positions to join our group to work on modelling the evolution of drug-resistant HIV. These are 3 year positions. This work is funded by an NIH grant (PI Dr. Sally Blower) that will run to 2007. We are looking for mathematicians, mathematical/computational biologists, physicists or engineers. Our work is focused on using mathematical models as health policy tools to predict the impact of vaccines and treatment, and also to design epidemic control strategies. We use a variety of mathematical and computational techniques, and our research group collaborates with many infectious disease experts. For an overview of our research & recent publications please visit our web site at www.biomath.ucla.edu/faculty/sblower.

Contacts:

Please email Professor Sally Blower (sblower@mednet.ucla.edu), Department of Biomathematics, David Geffen School of Medicine at UCLA if you are interested in applying.

16/09/2002

[AG]

Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc

Source:

ABG (ref:ABG-7332)

Date de parution:

16/09/2002

Date limite de réponse:

15/11/2002

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Sygen International plc (formerly PIC International Group), a leading international farm animal genetics company, has recently been awarded two Marie Curie Industrial Host Fellowships, funded by the European Union. Sygen has over 1000 employees, distributed in 30 different countries. The company is developing genetic tools to select and breed improved farm animals. The company has two research laboratories, one in Cambridge (UK) and one in Berkeley (CA, USA). Two positions are currently available in our Cambridge laboratory where research is focussed on using genomic approaches to discover markers associated with economically important traits in the pig. The first fellowship is for a bioinformatician and the second fellowship is for a molecular biologist. Bioinformatician : The work will involve the development of bioinformatics tools and database mining applications. Applicants should have experience in programming and knowledge of database applications. Knowledge in molecular biology and statistics will be an advantage. Molecular biologist : The work will involve the discovery of SNPs (single nucleotide polymorphisms) in candidate genes. Applicants should have experience in molecular biology techniques, such as PCR and sequencing. Knowledge in SNP discovery and genotyping will be an advantage. The laboratory is well funded, well equipped and integrated into an academic environment. The two positions offer a unique opportunity to work with a cutting-edge genomics company.

Contacts:

For further information or to send your CV, please contact : Dr. Dominique Rocha Sygen Laboratory, Department of Pathology, University of Cambridge, Tennis Court Road, Cambridge, CB2 1QP, UK Email: dr219@mole.bio.cam.ac.uk phone: 44 1223 333 709; fax: 44 1223 333 346). The EU has strict eligibility criteria for people being accepted onto the Marie Curie Fellowship Programme. Candidates, maximum 35 years of age, national of an EU (except UK) or associated state or resident in the EU for the past 5 years are eligible to apply. The two positions are available from November/December 2002. Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

30/08/2002

[AG]

Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows

Source:

PlanetJobs

Date de parution:

26/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Tokyo (Japon)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Post Doctoral Fellows in Bioinformatics and Biostatistics Human Genome Center Institute of Medical Science, University of Tokyo Program Term: October 2002 - March 2007 Organization: Education and Research Organization for Genome Information Science Joint Project by Bioinformatics Center (Kyoto University) and Human Genome Center (University of Tokyo) Post Doctoral Fellows of Interest: - Biostatistics, gene network, microarray data analysis, systems biology, pathway analysis, biosimulation, computational knowledge discovery - Academic Background: This program will encourage not only bioinformatics specialists but also who would like to become bioinformatics specialists through this project. Post doctoral fellows with biology/computer science/physics/chemistry/statisitcs are encouraged. - Condition: Within 5 years after Ph.D. - Term: At most 3 years in any period within October 2002 - 2007.

Contacts:

How to Apply: Please send the following items to miyano@ims.u-tokyo.ac.jp - CV with a publication list - Research proposal (please describe how your background is related to the proposal) Contact: Satoru Miyano, Ph.D., Professor Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo Email: miyano@ims.u-tokyo.ac.jp Phone: +81-3-5449-5442, Fax: +81-3-5449-5442 URL: http://bonsai.ims.u-tokyo.ac.jp/

07/08/2002

[AG]

Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments

Source:

Préparer sa thèse à l'INRA

Date de parution:

07/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Lyon, Villeurbanne (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le projet est de développer des méthodes d'apprentissage pour extraire automatiquement des informations pertinentes des données générées par les puces à ADN. L'approche de "data mining'' proposée est la découverte de règles d'association puis le traitement des règles fréquentes et valides dans un processus interactif entre informaticien et biologiste. Les réseaux de gènes étudiés sont ceux de l'adaptation métabolique à des changements nutritionnels en vue de l'étude de leur implication dans le développement de l'obésité et du diabète de type 2 chez l'homme.

Pièce Jointe :

13B.pdf (99 ko)

Contacts:

Département NASA et INSA Lyon, Unité INSERM U449 et LISI de Lyon, Encadrants S. Rome, J.-F. Boulicaut

07/08/2002

[AG]

Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique

Source:

Préparer sa thèse à l'INRA

Date de parution:

07/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Versailles (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'objectif de ce projet de recherche est de concevoir et d'adapter des méthodes d'apprentissage automatique capables d'apprendre les connaissances nécessaires à l'extraction automatique de connaissances à partir de textes scientifiques. L'apprentissage se fera à base de corpus à l'aide de méthodes d'analyse linguistique et conceptuelle. Cette approche sera appliquée à l'étude des fonctions géniques, à travers par exemple, l'étude des interactions entre gènes. L'objectif est de mieux interpréter les mécanismes cellulaires et de contribuer à la compréhension du fonctionnement des génomes.

Pièce Jointe :

5B.pdf (103 ko)

Contacts:

Départements BIA-MIC, Unité MIG Versailles, Encadrants C. Nedellec, Ph. Bessières

07/08/2002

[AG]

Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus

Source:

Préparer sa thèse à l'INRA

Date de parution:

07/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Pour comprendre la grande stabilité de certaines zones du génome des rétrovirus et ce qui les distingue de régions beaucoup plus variables, on construira des modèles probabilistes des séquences qui rendent compte des différences biologiques de ces deux types de régions par des propriétés statistiques. Ces modèles prendront en compte la composition des séquences, les statistiques de motifs caractéristiques ou fonctionnels, et des structures tridimensionnelles connues. Ces modèles feront l'objet d'une validation expérimentale.

Pièce Jointe :

4B.pdf (99 ko)

Contacts:

Département SA et Université Lyon1, UMR754 INRA-UCB-ENVL et Laboratoire de Probabilités Combinatoire et Statistique Encadrants C. Leroux, D. Piau

07/08/2002

[AG]

Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.

Source:

Préparer sa thèse à l'INRA

Date de parution:

07/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Villeurbanne, Toulouse (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une modélisation informatique intégrant une représentation complète des différentes notions d'homologie a permis de développer un modèle de cartographie génomique pour plusieurs espèces (homme, souris). Le projet consiste à modéliser la variabilité génétique (intraspécifique ou interspécifique) relative à la structuration des génomes. Cette modélisation ainsi que la synthèse de l'ensemble des connaissances disponibles dans les différentes espèces devraient permettre d'éclairer le lien entre le polymorphisme des gènes, leur évolution et leur positionnement au sein des génomes.

Pièce Jointe :

12B.pdf (117 ko)

Contacts:

Département GA et Université Lyon, Unité Génétique Cellulaire Toulouse et UMR 5558 Lyon Encadrants D. Milan, C. Gautier

07/08/2002

[AG]

Postdoctoral Researcher

Source:

Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs

Date de parution:

26/06/2002

Date limite de réponse:

01/11/2002

Lieu:

Santa Barbara (Californie, USA)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Company/Institution: University of California-Santa Barbara Job Title: Postdoctoral Researcher Required Skills: PhD in Biology, Mathematics, Computer Science or related field. Research experience in Bioinformatics, Genomics, or Phylogenetics. Knowledge of computer programming (prefer C, Java, or PERL) essential. Job Description: Note that project 3 most heavily involves bioinformatics. One postdoctoral position in evolutionary biology is open in the Ecology Evolution and Marine Biology (EEMB) Department http://www.lifesci.ucsb.edu at the University of California-Santa Barbara, with a start date between Jan. 1, 2003 and Oct. 1, 2003. The position is guaranteed for one year with the possibility of additional support, depending on funding. The candidate would work on one of the project below, which are ongoing or planned in the lab. There is also potential for additional collaboration on a project initiated by the postdoc. Genomic-scale studies of the evolution of gene expression. This project aims to develop and compare alternative models for the evolution of gene expression using genomic scale data from the literature/databases (microarray, SAGE, ESTs, etc). We have developed maximum likelihood models for the evolution of gene expression using microarray data and would like to extend these analyses to other data sets/data types.

Contacts:

Send Resume to: oakley@lifesci.ucsb.edu Please apply for or inquire about this position by sending an email message to Todd Oakley oakley@lifesci.ucsb.edu with the following information (as either attachments or text): 1. Your CV including publication list (with links to electronic versions of papers when possible) 2. A 2-3 page description of your research interests/experience, future career goals and how working on one (or more) of the above projects would facilitate achieving those goals. 3. Names, addresses, and e-mail addresses of 3 references familiar with your work. (Note that it is not necessary to send letters of recommendation with the initial application). Applications received by November 1, 2002 will be guaranteed consideration, but the position will remain open until filled. The University of California is an Affirmative Action / Equal Opportunity employer. See http://hr.ucsb.edu for additional information. Contact for more information: Todd Oakley University of California-Santa Barbara Biological Sciences/EEMB Santa Barbara, CA. US Phone: (805) 893-3511 oakley@lifesci.ucsb.edu http://www.lifesci.ucsb.edu

07/08/2002

[AG]

Full time postdoctoral research position

Source:

Ph. Marc (AGM2)

Date de parution:

07/08/2002

Date limite de réponse:

15/08/2002

Lieu:

Hamilton (Ontario, Canada)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A full time postdoctoral research position is available to study the comparative genomics of sibling species in the Drosophila melanogaster species complex. We're looking for PhD's in biology, genomics or a related field with interests in evolutionary biology and molecular evolution. Previous experience in molecular evolution , microarrays and computational methods is essential. Position is available August 1, 2002 (this date is flexible- a month or two). To obtain more information about this position or to apply: submit a letter of interest, CV, names and email address of three references. Also, indicate the date you will be able to start.

Contacts:

Emails and CVs to be sent to : Dr. Rama Singh Department of biology, Mcmaster University, 1280 main street west, Hamilton, Ontario, L8S 4K1 Canada Tel:(905)-525-9140 ext 24378 Fax: 905-522-6066 Email - singh@mcmaster.ca

07/08/2002

[AG]

Biostatistician - Fungal Genomics Project

Source:

Bioinformatics.ca - Bioinformatics Jobs

Date de parution:

19/07/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Montréal (Québec, Canada)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Company/Institution: Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics Job Title: Biostatistician - Fungal Genomics Project Required Skills: Strong background in statistics is required; Strong knowledge of statistical issues in bioinformatics is highly desirable, especially in the areas of sequence similarity scores, normalization of microarray data, clustering and bootstrap estimation of significance, and high-throughput chemical assays; Knowledge of machine learning techniques is desirable; Programming fluency in MatLab or R or S/S-plus is required; Ability to program in C++, Java, and Perl is desirable; A PhD in statistics or a related area is essential; postdoctoral experience is preferable. Industry experience is desirable but not required. Job Description: The Centre for Structural and Functional Genomics, Concordia University, Montreal, Quebec is seeking a biostatistician to provide statistical analysis as part of our bioinformatics team for a project that will identify fungal enzymes with applications to industrial processes. Dr. Adrian Tsang, principal investigator has recently received a large project grant from Genome Canada/ Genome Quebec for 2002- 2005. We are inviting qualified researchers in the fields of molecular biology, genomics, proteomics and bioinformatics to participate in a large-scale project at Concordia University. The project is supported by a multi-disciplinary team of scientists based at the following research centres located in Montreal and Laval: Concordia University's Departments of Biology, Biochemistry, Chemistry and Computer Science, Institute Nationale Recherche Scientifique - Institute Armand Frappier, National Research Centre - Biotechnology Research Institute and the Pulp and Paper Research Institute of Canada. The biostatistician will ensure that appropriate statistical methods are used in all aspects of the project. This mainly involves analysis of cDNA microarray data, but also includes data quality reports for each wet lab process, the interpretation of statistical significance of sequence analysis results, and the analysis of data from high-throughput chemical assays. It is expected that the biostatistician will be able to develop new statistical models and methods as required. The position requires that the biostatistician will guide postdoctoral fellows and graduate students in the analysis of transcription profiles.

Contacts:

Send Resume to: genecan@gene.concordia.ca Contact for more information: Margaret Guest Concordia University, Centre for Structural and Functional Genomics 1455 de Maissonneuve Blvd. West Montreal, PQ. CA Phone: (514) 848-3392 genecan@gene.concordia.ca

06/08/2002

[AG]

Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont

Source:

Ph. Marc (AGM2)

Date de parution:

06/08/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Ministère de la Recherche vient d'attribuer nominativement une bourse fléchée "génomique" à l'équipe de Christian Biemont, de l'université Lyon1. La bourse est libre pour un candidat extérieur ayant déjà son DEA ou qui va l'avoir très bientôt, puisque cette équipe n'a pas de candidat en cours de DEA cette année. Le thème de recherche concernera l'analyse des Eléments Transposables du génome de l'Anophèle et leur distribution dans les populations naturelles. L'approche moléculaire sera associée à l'utilisation des outils de la bioinformatique. Le dossier doit être envoyé rapidement au Ministère.

Contacts:

Contacter le plus rapidement possible Christian Biemont : Mel : biemont@biomserv.univ-lyon1.fr UMR CNRS 5558: "Biometrie et Biologie Evolutive" http://biomserv.univ-lyon1.fr/ Bât Gregor Mendel - Universite Lyon1 69622 Villeurbanne (France) Tél.: (33) 4 72 44 81 98 - Fax.: (33) 4 78 89 27 19

30/07/2002

[AG]

young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines

Source:

EMBL

Date de parution:

30/07/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Hinxton/Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL-EBI European Bioinformatics Institute The European Bioinformatics Institute in Hinxton, near Cambridge, UK, wishes to recruit outstanding young research group leaders in Bioinformatics in one or more of the following areas: * Analysis of molecular complexes, pathways and networks * The evolution of sequence, structure and function to relate genotype to phenotype * Chemo-informatics in relation to biology * Deciphering transcriptome/proteome data to understand biological processes * The molecular basis of disease * Algorithm development for biology The EBI provides a world-class research environment and is committed to fostering top quality interdisciplinary research in a highly collaborative international culture. As the European Centre for the international archiving for DNA and protein sequence data, genome data, protein structure data, GO, and expression data, the opportunities for better data integration, analysis and understanding are enormous. An initial contract of 5 years' duration will be offered to the successful candidate(s). This can be renewed, depending on circumstances at the time of the review. Informal enquiries are welcomed and can be made to the Director, Professor J. Thornton (thornton@ebi.ac.uk). For more information about the EBI, please refer to: http://www.embl-heidelberg.de/ and http://www.ebi.ac.uk/ EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.

Contacts:

Applicants should submit a curriculum vitae, quoting ref. no. 02/49, with a concise description of research interests and future plans, and should arrange for three letters of recommendation to be sent as soon as possible to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg, Germany. Fax: +49 6221 387555; email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

26/07/2002

[AG]

CDD, URGV d'Evry

Source:

Liste Bioinfo IMPG

Date de parution:

15/04/2002

Date limite de réponse:

01/05/2002

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'URGV d'Evry (Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS, Resp. M. Caboche; http://www.evry.inra.fr ) mai 2002), dans le cadre d'un projet Génoplante. Ce CDD concerne un poste de niveau ingénieur au sein de l'équipe bioinformatique de l'URGV qui comprend 5 permanents, 2 CDD et 3 étudiants stagiaires. Le projet concerne le développement d'interfaces (JAVA) pour l'exploitation d'une base de données intégrative sur la génomique structurale et fonctionnelle de la plante modèle Arabidopsis thaliana. Toutes les données de génomique de cette base (sous ORACLE) sont organisées topologiquement autour des séquences des 5 chromosomes d'Arabidopsis.Cette base de données doit entre autres faciliter l'interprétation fonctionnelle des données de type 'transcriptome' et permettre d'étudier les relations entre la structure, la fonction, la localisation et l'évolution des gènes végétaux. Ce poste nécessite une bonne connaissance du langage JAVA (en particulier des bibliothèques graphiques) et du langage de requête des bases de données relationnelles (SQL). Une expérience dans les domaines de l'analyse de séquences et de la génomique serait appréciée.

Contacts:

Responsable à contacter: Sébastien Aubourg (aubourg@evry.inra.fr)

26/07/2002

[AG]

Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry

Source:

Liste Bioinfo IMPG

Date de parution:

26/07/2002

Date limite de réponse:

?

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

PRE-ANNONCE L'INRA (Institut National de la Recherche Agronomique) recrute fin 2002 le Directeur de l'Unité de recherche "Génomique-Info" située à Evry (30kms sud de Paris). Cette Unité est responsable d'une plate-forme Bioinformatique et constitue un pôle national de compétences et d'expertise dans le domaine du végétal. Le directeur exercera ses missions en collaboration avec les équipes de l'INRA concernées, dans le cadre de partenariats y compris européens (Génoplante particulièrement, mais aussi GABI, GARNET, ...) : -Conception, développement et mise en place de systèmes d'informations génomiques intégrés. -Développement des méthodologies, outils et interfaces pour l'analyse et la valorisation des données. -Stratégies d'analyse à haut débit des données produites. -Veille technologique dans les domaines bioinformatiques. -Diffusion de l'information et de l'expertise vers les différentes équipes-relais de l'INRA. -Animation et coordination en partenariat avec les responsables d'autres projets transversaux (ex : AGENAE). -Valorisation des travaux, publications et transferts. -Assistance technique aux équipes biologistes partenaires. -En collaboration avec Infobiogen, exploitation, maintenance et sécurité du système. Responsable d'une équipe d'une dizaine d'ingénieurs, il(elle) devra à ce titre assurer un certain nombre de fonctions : - animation scientifique et collective de l'Unité ; - accompagnement et aide à l'insertion des jeunes chercheurs ; - suivi du bon déroulement des travaux et démarche qualité ; - gestion optimale des ressources humaines ; - gestion administrative et financière de l'Unité ; - organisation de la communication avec l'extérieur. Compétences requises : -5 ans minimum d'expérience en conduite de projets informatiques dans le domaine de la recherche en biologie ; -expérience en management d'équipe et animation scientifique ; -connaissances en bioinformatique et génomique ; -expérience solide du monde Unix, SGBD, développement et architectures distribuées ; -aptitude à la communication ; -français et anglais courant. Formation initiale : Thèse ou Diplôme Ingénieur ou équivalent BAC + 5 Double compétence biologie - informatique

Contacts:

Des précisions sur le poste et la procédure de recrutement seront données début septembre 2002