ASSOCIATION AGM2
Association des Étudiants du DEA d'Analyse de Génome et de Modélisation moléculaire Offres d'emploi post DEA

Les offres Post-DEA de l'association

252 annonces en Analyse de Génome [AG].

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Date	Statut	P/P	Titre	Pays
21/11/2006	Thèse	public	PhD studentship in Bioinformatics	Angleterre, Grande-Bretagne
31/10/2006	???	prive	broadcasting	Ontario
31/10/2006	ATER	prive	broadcasting	Ontario
31/10/2006	ATER	prive	broadcasting	Ontario
30/06/2005	Postdoc	prive
30/06/2005	Postdoc	prive	Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites	France
30/06/2005	Postdoc	prive	Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis	France
29/11/2004	???	prive
29/11/2004	Postdoc	public
22/07/2004	Postdoc	prive	physic, byophysic, single molecule	France
13/12/2003	???	prive
13/12/2003	???	prive
06/11/2003	CDD	public	Research Fellow/Assistant
05/11/2003	CDI	public	Assistant/Associate PROFESSOR	Etats-Unis
05/11/2003	CDI	prive	Lectureship in Bioinformatics	Grande-Bretagne
05/11/2003	CDI	public	Senior Bioinformatics Positon at the FMI	Suisse
05/11/2003	CDD	public	Position in Biostatistics and Bioinformatics	France
05/11/2003	CDD	public	Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics	France
05/11/2003	Postdoc	prive	Stage Post-Doctoral en Bioinformatique/Bio-Statistique	France
05/11/2003	ATER	prive	Bioinformaticien (poste ATER)	France
21/10/2003	CDI	prive	Bioinformatics Research Scientist	Etats-Unis
21/10/2003	CDD	public	CDD Math-Info pour la biologie	France
21/10/2003	Postdoc	public	Post-doctoral positions BIOINFORMATICS	Etats-Unis
09/10/2003	CDI	prive	BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER
09/10/2003	CDD	prive	CDD Math-Info	France
09/10/2003	CDD	prive	2 CDD Ingenieur d'etudes	France
09/10/2003	Postdoc	public	2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)	Canada/Quebec
09/10/2003	Postdoc	prive	motif discovery algorithm/statistics	Etats-Unis
18/09/2003	Thèse	public	three PhD positions in Bioinformatics	Australie
18/09/2003	CDI	prive	Computational Biologist / Bioinformatician	Canada
18/09/2003	Postdoc	public	Post-doctoral position in microarray data analysis	Suisse
08/09/2003	CDI	public	tenure track faculty position at the assistant professorship level	Etats-Unis
03/09/2003	CDI	public	poste d'ingénieur d'étude génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle
03/09/2003	Postdoc	public	RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS	Grande-Bretagne
02/09/2003	CDI	public	Bioinformaticien confirmé	France
02/09/2003	CDI	public	poste d'ingénieur d'étude AGNAE	France
11/08/2003	Thèse	public	molecular genetics and genomic analysis of a bacterial pathogen	Suisse
11/08/2003	Maître de Conférence	public	RESEARCH POSITION	Canada/Quebec
08/08/2003	Thèse	public	molecular genetics and genomic analysis of a bacterial pathogen	Suisse
03/08/2003	Thèse	public	Bourse de These en Microbiologie	France
03/08/2003	Thèse	public	These Puces ADN	France
03/08/2003	CDI	public	Chef de projet bioinformatique au Genoscope	France
03/08/2003	CDI	public	bioinformaticien confirme	France
03/08/2003	CDI	prive	Nestlé BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868)	Suisse
03/08/2003	CDI	prive	Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS	Etats-Unis
03/08/2003	CDD	prive	Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)	France
03/08/2003	Postdoc	public	postdoc paillasse/modélisation post-génomiqueà genopole	France
03/08/2003	Postdoc	prive	Stage Post-Doctoral en Bio-Informatique/Bio-Statistique	France
03/08/2003	Postdoc	public	bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis	France
03/08/2003	Postdoc	public	chercheurs postdoctoraux en bioinformatique	Canada
02/08/2003	Postdoc	public	Post-Doctoral Research Fellowships	Etats-Unis
26/06/2003	Maître de Conférence	public	MC de bioinformatique	France
23/06/2003	Thèse	public	Open Ph.D. positions in Algorithmic	Allemagne
23/06/2003	CDI	prive	Computational Biologist	Etats-Unis
23/06/2003	CDI	prive	BIOMEDICAL INFORMATICS - Research	Etats-Unis
23/06/2003	CDD	public	Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie	France
23/06/2003	Postdoc	public	Computational Neurobiology at EMBL	Grande-Bretagne
16/06/2003	CDI	public	Associate or Full Professor computational biology and bioinformatics	Etats-Unis
16/06/2003	Postdoc	public	postdoctoral research associate position	Etats-Unis
13/06/2003	Postdoc	public	Bioinformatics Postdoctoral Fellow	Etats-Unis
10/06/2003	Thèse	public	2 PhD position starting September 2003 in computational biology and bioinformatics	Italie
10/06/2003	CDI	prive	GenBank Biologist	Etats-Unis
10/06/2003	CDI	public	Faculty researcher in Gene Expression	Afrique du Sud
10/06/2003	CDD	public	CDD 12 mois: annotation de genome	France
10/06/2003	CDD	public	CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster	France
10/06/2003	CDD	prive	CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services	Allemagne
10/06/2003	???	prive	SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY	Allemagne
10/06/2003	Postdoc	public	Research Associate in biostatistics and	Grande-Bretagne
10/06/2003	Postdoc	public	post-doctoral position bench work and algorithmic development	Etats-Unis
10/06/2003	Postdoc	public	Postdoctoral Position at MIPS	Allemagne
10/06/2003	Postdoc	prive	2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy	Etats-Unis
10/06/2003	Postdoc	prive	bourse post-doctorale Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés	France
10/06/2003	Postdoc	public	Biologist	Suisse
10/06/2003	ATER	public	postes d'ATER en informatique/bioinformatique	France
21/05/2003	CDI	public	charge de cours en bioinformatique	Belgique
21/05/2003	CDI	public	Ingénieur de Recherche en bioinformatique campagne NOEMI	France
21/05/2003	CDD	public	Biologiste	Suisse
21/05/2003	Postdoc	public	Postdoc modele « plante virtuelle »	France
21/05/2003	Postdoc	public	Modelisation Réseaux Moléculaires	France
21/05/2003	Postdoc	public	Postdoc	Etats-Unis
21/05/2003	Postdoc	public	CDD CNRS "POSTDOC"	France
21/05/2003	Postdoc	public	Postdoctoral opportunities in Biological Classification and	Etats-Unis
24/04/2003	CDD	public	chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD	France
24/04/2003	Postdoc	public	computational biology/bioinformatics	Etats-Unis
18/04/2003	CDD	public	Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique	France
17/04/2003	CDI	public	INFORMATICIEN CHEF DE PROJET	France
14/04/2003	CDI	public	Computer Biologist - Metabolic Disease Group	Grande-Bretagne
14/04/2003	CDI	public	Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation	Grande-Bretagne
14/04/2003	Postdoc	public	Sanger Institute Postdoctoral Fellowships	Grande-Bretagne
08/04/2003	CDD	prive	Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)	France
08/04/2003	Postdoc	public	Postdoctoral job opening in Computational Biology	Etats-Unis
07/04/2003	CDI	public	Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot	Suisse
07/04/2003	CDI	public	RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS	Grande-Bretagne
07/04/2003	CDI	public	SOFTWARE ENGINEER FOR PROTEOMICS DATABASE	Grande-Bretagne
07/04/2003	CDD	public	SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE	Grande-Bretagne
07/04/2003	Maître de Conférence	public	Poste d'enseignant-chercheur à l'Ecole des Mines de Paris	France
06/04/2003	CDI	public	BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN	France
06/04/2003	CDI	public	Poste de professeur en génétique & bio-informatique	France
06/04/2003	CDI	public	professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques	France
06/04/2003	CDI	public	23 postes chargés de recherche INRIA	France
06/04/2003	CDI	public	professeur de bioinformatique	France
06/04/2003	CDD	public	POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM	France
06/04/2003	CDD	public	BioInfomaticien projet MEDIANTE	France
06/04/2003	Postdoc	public	bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS	France
06/04/2003	Postdoc	public	Postdoc modélisation des réseaux de gènes	France
06/04/2003	Postdoc	prive	Stage post-doctoral en bio-informatique/bio-statistique	France
06/04/2003	Postdoc	public	Stage post-doctoral en génomique végétale	France
06/04/2003	Postdoc	public	SENIOR FELLOW MICROARRAY STATISTICS / BIOINFORMATICS	Espagne
06/04/2003	Maître de Conférence	public	MCF vacant en biochimie et bioinformatique	France
06/04/2003	Maître de Conférence	public	Postes Enseignants Vacants à l'U.B.P. Campagne 2003 Première Vague	France
06/04/2003	Maître de Conférence	public	2 CDD + MDC	France
02/04/2003	Thèse	public	Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department	Irelande
28/03/2003	CDI	public	Ingénieur de recherche CNRS	France
28/03/2003	CDI	public	professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière	France
28/03/2003	Postdoc	prive	Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics	France
28/03/2003	ATER	public	plusieurs ATER et agreges-preparateurs rentrée 2003	France
23/02/2003	CDI	prive	Data Analysis Scientist	Etats-Unis
23/02/2003	???	prive	Postdoctoral position in Bioinformatics for non-french citizen	France
21/02/2003	Stage	public	stage de bio-informatique	France
21/02/2003	CDI	public	Scientist--BIOINFORMATICS and MACHINE LEARNING	Etats-Unis
21/02/2003	CDD	public	Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire	France
20/02/2003	Postdoc	public	Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)	Grande-Bretagne
16/02/2003	???	public	Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute	Grande-Bretagne
11/02/2003	CDI	public	Potsdam Faculty Position	Allemagne
11/02/2003	Postdoc	prive	Bioinformatics scientist	Etats-Unis
09/02/2003	CDI	prive	BIOINFORMATICS POSITION	France
06/02/2003	CDI	public	Bioinformatics Director	Etats-Unis
06/02/2003	CDI	public	Chair and lecturers/senior lecturers/readers	Grande-Bretagne
06/02/2003	CDI	public	Bioinformatics Programmer	Grande-Bretagne
06/02/2003	CDI	prive	NBCI RefSeq Project Scientist	Etats-Unis
06/02/2003	CDD	public	annotation structurale et fonctionnelle de la plante Arabidopsis thaliana	France
06/02/2003	Postdoc	public	STAGIAIRES POST-DOCTORAUX EN GENOMIQUE ET EN BIO-MOLECULAIRE	Canada/Quebec
06/02/2003	Postdoc	public	POSTDOCTORAL POSITION IN COMPUTATIONAL POPULATION GENETICS	Etats-Unis
06/02/2003	Postdoc	public	PLANT/MICROBIAL GENOMICS POSTDOC	Grande-Bretagne
06/02/2003	Postdoc	public	postdoctoral fellowship Experimental and computational genome research
06/02/2003	Postdoc	public	Plant Genomics Research Unit PostDoc	France
05/02/2003	CDI	public	GO Curator and Bioinformatics Positions at Rat Genome Database	Etats-Unis
05/02/2003	CDD	public	Maitre de Conferences en Genomique bacterienne	France
05/02/2003	CDD	prive	Bio-statisticien/Bio-informaticien chez Pfizer	France
04/02/2003	Postdoc	public	ANALYSE MATHEMATIQUE ET ALGORITHMIQUE DE RESEAUX DE REGULATION GENIQUE	France
30/01/2003	CDD	public	8 postes	Allemagne
29/01/2003	CDI	public	Molecular Database Indexer	Canada
15/01/2003	CDI	prive	BIOINFORMATICS RESEARCH SCIENTIST	France
15/01/2003	Postdoc	public	Postdoc statistiques Biostatistiques/Biomathématiques	France
02/01/2003	CDI	public	Génétique à haut débit chez Arabidopsis thaliana : approche quantitative de la réponse aux contraintes environnementales	France
02/01/2003	CDD	public	BioInfomaticien stockage et analyse de données	France)
02/01/2003	Postdoc	public	Ontology of animal expression patterns	France
02/01/2003	Postdoc	public	POSTDOCTORAL POSITION IN BIOINFORMATICS AND GENOME ANALYSIS	Belgique
08/12/2002	CDI	public	Maitre de conférence à Polytechnique	France
08/12/2002	CDI	prive	chef de projet Basede données/java	France
08/12/2002	CDD	public	BioInformaticien	France
08/12/2002	CDD	public	3 postes pour programme bioinformatique CIT	France
08/12/2002	Postdoc	public	Chercheur BioInformaticien	France
08/12/2002	Postdoc	public	7 Chargés de Recherche Génétique et d'Amélioration des Plantes	France
03/12/2002	Postdoc	public	Postdoctoral position : Genomique bacterienne	France
03/12/2002	Postdoc	prive	bio-statistique en genetique animale	France
18/10/2002	CDI	public	Poste Maitre de conférence analyse informatique des genomes	France
18/10/2002	CDI	prive	IN SILICO BIOLOGY TEAM LEADER	Grande-Bretagne
07/10/2002	CDD	public	CDD bioinformaticien Génoplante-Info	France
30/09/2002	ATER	public	2 1/2 postes ATER vacants	France
26/09/2002	Postdoc	public	2 postdoc positions: modelling the evolution of drug-resistant HIV	Etats-Unis
24/09/2002	Postdoc	public	Agricultural Genomics	Grande-Bretagne
24/09/2002	Postdoc	public	3 Post Doctoral/Research Assistants	Grande-Bretagne
23/09/2002	CDI	public	Research Fellow in Bioinformatics (Ref:A318-02L )	Nouvelle-Zélande
20/09/2002	Thèse	public	Genomique et post-genomique d'un lactobacille d'interet industriel	France
17/09/2002	Thèse	public	Web sémantique et Mémoire d'expériences sur l'analyse du transcriptome	France
17/09/2002	CDD	prive	Ingenieur de Recherche: Genomique fonctionnelle du Développement	France
17/09/2002	Postdoc	public	GENOMICS OF RICE SUSCEPTIBILITY TO BACTERIAL DISEASES	Etats-Unis
16/09/2002	Postdoc	prive	Marie Curie Postdoctoral Opportunities with Sygen International plc	Grande-Bretagne
10/09/2002	CDD	public	Experimental Officer (International Database Administrator)	Grande-Bretagne
02/09/2002	CDD	public	2-3 BIOINFORMATICISTS	Grande-Bretagne
30/08/2002	Postdoc	public	Bioinformatics & Biostatistics Post Doctoral Fellows	Japon
07/08/2002	Thèse	public	Extraction de connaissances à partir de puces à ADN à haute densité : application à la compréhension des mécanismes d'expression et de régulation des gènes par les nutriments	France
07/08/2002	Thèse	public	Application de l'apprentissage à l'extraction de connaissances à partir de notices bibliographiques en génomique	France
07/08/2002	Thèse	public	Développement d'une méthode de prédiction de la structure 3D des protéines de novo	France
07/08/2002	Thèse	public	Modélisation de l'architecture des plantes : vers une prise en compte des interactions moléculaires, cellulaires et environnementales	France
07/08/2002	Thèse	public	Modèle probabiliste prédictif des régions constantes des lentivirus	France
07/08/2002	Thèse	public	Analyse à grande échelle du déterminisme génétique de caractères quantitatifs chez les végétaux : méta-analyse de QTL et études d'associations	France
07/08/2002	Thèse	public	Modélisation des connaissances en génomique en vue d'une introduction de données génomiques multispécifiques dans une démarche de cartographie comparée : Application à l'étude de la variabilité génétique.	France
07/08/2002	CDI	prive	Director Bioinformatics	Québec, Canada
07/08/2002	CDI	prive	Biostatistician - Fungal Genomics Project	Québec, Canada
07/08/2002	CDI	prive	Bioinformatician	Québec, Canada
07/08/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Researcher	Californie, USA
07/08/2002	Postdoc	public	Postdoc for molecular systematics	Allemagne
07/08/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Research Associate	Floride, USA
07/08/2002	Postdoc	public	Full time postdoctoral research position	Ontario, Canada
06/08/2002	Thèse	public	Bourse fléchée "génomique" chez Christian Biémont	France
30/07/2002	CDD	public	young research group leaders in Bioinformatics - 6 domaines	Grande-Bretagne
26/07/2002	Thèse	public	Thèse en bioinformatique	France
26/07/2002	CDI	prive	Chercheur en bio-analyse (Région parisienne)	France
26/07/2002	CDI	public	Pré-annonce : Responsable plate-forme R&D bioinformatique à Evry	France
26/07/2002	CDD	public	CDD, URGV d'Evry	France
26/07/2002	Postdoc	public	4 open positions in computer science	Suisse
24/07/2002	CDD	public	Health Informatics Scientist	Grande-Bretagne
24/07/2002	Postdoc	public	Research Assistant/Fellow	Grande-Bretagne
18/07/2002	CDI	prive	Development of bioinformatics tools and database mining applications	Grande-Bretagne
17/07/2002	CDI	public	Un poste de CR2 à l'INRA	France
17/07/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Research Position in Pig Genome Analysis	Danemark
15/07/2002	CDI	prive	Chef de projet Progiciels en Biotechnologies végétales	France
18/06/2002	CDI	public	Bioinformatics Expert	Suisse
14/06/2002	CDI	public	Postdoctoral and Research Assistant Positions	Québec, Canada
14/06/2002	CDI	prive	IT and Database specialist	Italie
11/06/2002	CDI	prive	RESEARCH ASSOCIATES	Allemagne
11/06/2002	CDI	prive	Bioanalyste expert en microbiologie	France
11/06/2002	CDI	prive	Positions in Bioinformatic	Suisse
11/06/2002	Postdoc	public	Postdoctoral Positions	Iowa, USA
07/06/2002	CDI	prive	Bioinformatic Position at The Nestle research center	Suisse
05/06/2002	ATER	public	ATER bio-informatique & ATER génétique moléculaire du diabète de type 2	France
04/06/2002	Postdoc	public	Computational Biology	France
11/02/2002	CDI	public	Analyst for the analysis of gene expression data	Grande-Bretagne
11/02/2002	Postdoc	public	Post-Doctoral Research Fellows and a Bioinformatician - CONSTRUCTING GENE NETWORKS FROM GENE ARRAY TIME SERIES DATA	Grande-Bretagne
07/02/2002	CDI	public	FULL-TIME POSITION - Ithaca, NY Database specialist	New York, USA
07/02/2002	CDI	public	Maître de conférences (Université Paris XI)	France
07/02/2002	CDI	prive	Bioinformatics Scientist	Singapoure
07/02/2002	CDI	public	Head of Bioinformatics Applications	Grande-Bretagne
07/02/2002	CDI	prive	Database Administrator	Washington, Etats-Unis
07/02/2002	CDD	public	Ingénieur/Post-Doc Bioinformatique (BAC+5 Bioinformatique / 6 mois / PARIS )	France
07/02/2002	CDD	prive	Bioinformaticien	France
07/02/2002	CDD	public	Bioinformaticien niveau IE pour développement BD génomique et outils d'analyse des données d'expression	France
07/02/2002	Postdoc	public	role of translation elongation factor 1A (EF1a) isoforms in disease	Grande-Bretagne
07/02/2002	Postdoc	public	Research Associate in Biostatistics and Bioinformatics	Grande-Bretagne
07/02/2002	Postdoc	public	Position post doctorale en data mining	France
07/02/2002	Postdoc	public	Three Postdoctoral Positions, Institute for Child Health,	Grande-Bretagne
07/02/2002	Postdoc	public	Postdoc Positions in Bioinformatics at NCGR, New Mexico	Nouveau-Mexique, Etats-Unis
25/07/2001	CDI	prive	Genetic Modeling	France
01/07/2001	Stage	public	Reformatage et analyse de fichiers de résultats du programme BLAST,application pour la cartographie génétique in silico	France
01/07/2001	CDD	public	1 or 2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst	Belgique
01/07/2001	???	prive	ABG-6411 - Chef de Projet en Bioinformatique	France
01/07/2001	???	prive	CELOGOS, Société de Biotechnologie, recherche	France
01/07/2001	Postdoc	public	A 12 months post-doctoral fellowship in bioinformatics is available for the LIGNOME project	France
01/07/2000	Thèse	public	allocation de recherche est fléchée pour le Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive	France
01/07/2000	Thèse	public	Génoplante, outils informatiques pour la prédiction de gènes et l’annotation de génomes à Toulouse	France
01/07/2000	Thèse	public	PROPOSITION DE THESE: Annotation du génome humain (Les récepteurs couplés aux protéines G)	France
01/07/2000	CDI	prive	Molecular Bio-Informatics Biologist in CANADA.	Manitoba, Canada
01/07/2000	CDI	prive	Position is available to manage and analyze data associated with the human genome project	USA
01/07/2000	CDI	public	two informatics positions at the University of California, Berkeley	USA
01/07/2000	CDI	public	Génoplante: gestion de bases de données à Clermont Ferrand	France
01/07/2000	CDI	public	Génoplante, Nouveaux outils d’analyse du génome à EVRY	France
01/07/2000	CDI	prive	PERL/UNIX Developer (chip design) Rosetta Inpharmatics (USA)	USA
01/07/2000	CDI	prive	Bioinformatics Applications Developer	France
01/07/2000	CDI	public	INFORMATICIEN CHARGE D'ADAPTER CERTAINS PROGRAMMES DE BIO-INFORMATIQUE ET DE FORMER LES UTILISATEURS	France
01/07/2000	CDI	public	BIO-INFORMATICIEN : GESTION DES DONNEES DE SEQUENCE ET DE CARTOGRAPHIE GENETIQUE	France
01/07/2000	CDD	public	CDD ingenieur en bioinformatique Duree : 2 ans Localisation : LIRMM-CNRS a Montpellier.	France
01/07/2000	CDD	public	Ingénieur-Expert en Bioinformatique (CDD) est à pourvoir courant 2000 pour 12 mois	France
01/07/2000	CDD	public	CDD 9 mois annotations de séquences à Strasbourg	France
01/07/2000	CDD	public	CDD 6 mois annotations de séquences à Lyon	France
01/07/2000	CDD	public	Ingénieur en traitement et analyse statistique de données (CDD 1 an)	France
01/07/2000	CDD	public	2 years contract job offer for a computer scientist/systems analyst	Belgique
01/07/2000	CDD	public	Trois bio-informaticiens, niveau Bac+5	France
01/07/2000	CDD	prive	projet GenoStar de developpement d'un environnement informatique de genomique exploratoir	France
01/07/2000	CDD	public	CDD en Bio-informatique (dans le cadre du programme Genoplante)	France
01/07/2000	Bourse	public	ALLOCATIONS au titre "MOBILITE - INTERCLASSEMENT" dans l'ECOLE DOCTORALE E2M2	France

21/11/2006

[AG]

PhD studentship in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

21/11/2006

Date limite de réponse:

01/12/2006

Lieu:

Londres (Angleterre, Grande-Bretagne)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

PhD studentship in Bioinformatics

"Bio-Communication Theory for Genetically influenced Chronic Diseases"
Most diseases are influenced by genetic factors such as Single Nucleotide Polymorphism (SNP). The aim of this project is firstly to express gene mutation as a digital communication problem (Bio-Communication model) and secondly to apply communication theory to detect SNPs which are likely to predispose people to chronic diseases.

Please note that this position is only open to European Union citizens.

Closing Date: November 30th 2006

For more information:

http://cism.kingston.ac.uk/research/phd-studentship-vacancies/bio-communication-theory-for-genetically-influenced-chronic-diseases_phd-university.htm

Contacts:

j.nebel@kingston.ac.uk

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31/10/2006

[AG]

broadcasting

Source:

Date de parution:

31/10/2006

Date limite de réponse:

Lieu:

(Ontario)

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Centre de Recherche expérimental pour la réalisation de Home vidéo et de reality scientifiques en.ligne et de la télévision visé à découvrir des nouvelles stratégies d’amélioration de la vie, sélectionne des deux sexes 18 à 65 ans motivés, ambitieux et dynamiques. Les test de sélections se feront en ligne et sont programmés avec des techniques innovants. Le Centre offre formation, et possibilité de carrière. Envoyer CV de préférence avec photo a : broadcasting@themadivita.com

Contacts:

31/10/2006

Source:

Date de parution:

31/10/2006

Date limite de réponse:

Lieu:

Ontario (Ontario)

Statut:

ATER

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

31/10/2006

Source:

Date de parution:

31/10/2006

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Contacts:

via monte di Dio

[retour]

30/06/2005

[AG]

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiology and Intracellular Parasitism unit

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Project — Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites:

Description:
One postdoctoral position funded within the frame of a tripartite convention ( Sanofi –Aventis/Ministry of Research / Institut Pasteur ) is available immediately in the group of Dr. Geneviève Milon in the Parasitology Department at the Pasteur Institute.
The candidate will be involved in a project on a comparative transcriptional analysis of un-parasitized dendritic leucocytes/dendritic cells (DCs) and Leishmania-loaded DCs recovered either from in vitro cultures or from parasitized-loaded tissues. She/he will work closely with investigators with complementary multifaceted expertise in the fields of (a) the biology of parasitism (in vitro and in vivo approaches) (b) the global gene expression analysis (c) computational and statistical tools .She /he will be expected to master all the steps from the preparation of RNA samples, to data acquisition normalization and computational analysis. Good communication skills and the ability to work as part of a team are essential for this position.

Activities:
This post-doc will take primary responsibility for the use of Affymetrix mouse GeneChips, the pre-processing of scanned images (image analysis methods, data normalization), statistical analyses and gene expression data integration into biologically relevant pathways / networks.

Requirements:
The ideal candidate will have a Ph.D in bioinformatics, computational biology or biostatistic. She/he should have a strong experience in using state of the art microarray data analysis tools and software packages. Preference will be given to candidates who can also demonstrate a bona fide interest for and background in biological processes per se.
She/he will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. She /he will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the optimal analysis of gene expression data.

Conditions:
The position is available for 2 years. To apply, please e-mail a cover letter, emphasizing relevant background and project experience, a CV, a one-page statement of research interests, and arrange for two or three references to be sent. The present position call will remain open until filled.

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

[retour]

30/06/2005

[AG]

Analyzing the gene expression profiles of mouse dendritic leucocytes harbouring Leishmania parasites

Source:

Institut Pasteur-Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05pasteur.doc (27 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

[retour]

30/06/2005

[AG]

Post-doctoral position in Affymetrix GeneChip analysis

Source:

Institut Pasteur-Unité d'Immunophysiologie et Parasitisme Intracellulaire

Date de parution:

30/06/2005

Date limite de réponse:

Lieu:

Institut Pasteur Paris (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Pièce Jointe :

postdoc_position30juin05.pdf (20 ko)

Contacts:

Contact: Eric PRINA, Béatrice REGNAULT
E-mail: eprina@pasteur.fr, regnault@pasteur.fr
Phone: 33 1 40 61 35 14 / 33 1 40 61 35 13

[retour]

29/11/2004

[AG]

Source:

Date de parution:

29/11/2004

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

corps de l annonce

Pièce Jointe :

16.jpg (58 ko)

Contacts:

adresse

[retour]

29/11/2004

[AG]

Source:

Date de parution:

29/11/2004

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Contacts:

22/07/2004

physic, byophysic, single molecule

Source:

Date de parution:

22/04/2004

Date limite de réponse:

Lieu:

(France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

13/12/2003

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

13/12/2003

Source:

Date de parution:

13/12/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Contacts:

06/11/2003

Research Fellow/Assistant

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2233

Date de parution:

06/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

The Robert Gordon University, Aberdeen School of Computing
Research Fellow/Assistant (Ref T229) (2.5 Years)

Efficient Biological Grammar Acquisition

DETAILS:
Applications are invited for the position of Research Fellow/Assistant on an EPSRC funded project entitled "Efficient Biological Grammar Acquisition". The project will be based in the Computing Technologies Centre (a recent 1.5 million pounds, purpose-designed SRIF-funded research centre) in the School of Computing at the Robert Gordon University, Aberdeen. The industrial collaborator on the project will be GlaxoSmithKline, one of the world's leading research-based pharmaceutical and healthcare companies.

Linguistic methods have provided some interesting results in the
recognition of complex biological signals. However the hand
development of grammars is difficult and, because it requires human expertise, expensive. Thus, given the enormous volume of data arising from genome projects, there is a need to automate the acquisition of grammars from sets of biological sequences. As the researcher on this project, you will develop an efficient method of acquiring such grammars using Inductive Logic Programming (ILP). Your method will use efficient techniques for discovering non-terminals which are potentially pertinent to the subsequent induction of a biological grammar and a parser which increases the speed at which biological
grammars may be acquired by an ILP system.

QUALIFICATIONS:
You should have a good honours degree in Computing or a cognate
discipline and some experience of bioinformatics research; or you may have a background in the life sciences and have an advanced MSc in Computing or a cognate discipline. Preferably you will have a PhD in Machine Learning or Bioinformatics or equivalent experience, as demonstrated by a good publication record. Experience of ILP, Prolog or Parsers would be an advantage. A good communicator and programmer, you will bring an enthusiastic and organised approach to this challenging position.

Informal enquiries to: Dr Chris Bryant Tel: +44 (0)1224 262475 E-mail: chb@comp.rgu.ac.uk
Starting Salary: 18,265 - 27,339 GBP

Contacts:

HOW TO APPLY:
Further particulars and an application form are available from: Human Resources Department, The Robert Gordon University, Schoolhill, Aberdeen, AB10 1FR. www.rgujobs.ac.uk Tel: +44 (0)1224 262085 E-mail: staffrec@rgu.ac.uk

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05/11/2003

[AG]

Assistant/Associate PROFESSOR

Source:

bioinformatics.org

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Department of Biological Sciences, St. John's University, New York, New York is seeking candidates for a tenure track assistant or associate professor position. The successful candidate will have postdoctoral experience in bioinformatics/proteomics/genomics, the potential to develop a funded research program, and the ability to offer graduate and undergraduate courses in his/her speciality.

Contacts:

Interested candidates should send their CV, 3 letters of recommendation and a statement of research and teaching interests to:
Jay A. Zimmerman, Ph.D.
Chair
Department of Biological Sciences
St. John's University
Jamaica, NY 11439
or email to
zimmermj@stjohns.edu

St. John's University is an equal opportunity employer, and inquiry from women and underrepresented minority applicants is encouraged.

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http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2208

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05/11/2003

[AG]

Lectureship in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

20/11/2003

Lieu:

Sheffield (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

The Division of Genomic Medicine at the University of Sheffield seeks to appoint a lecturer in Bioinformatics to join the Mathematical Modelling and Genetic Epidemiology group. The appointee will carry out research in mathematical/statistical/computational genetics.

Possible areas of collaborative research are in comparative genomics and sequence assembly, graphical modelling of protein interactions, MCMC for genetic problems, human population genetics, disease models and genetic epidemiology.
More information about the group can be found at http://www.shef.ac.uk/mmge/

The appointee will also be expected to participate in the undergraduate medical course and postgraduate teaching.

The successful candidate will have, or be about to complete, a PhD in a mathematical subject and will have a strong interest in pursuing research in problems in genetics.

Salary: £22,191 - £33,679 pa

Closing Date: 20th November, 2003

Contacts:

Details about applying for the job can be found at:
http://www.shef.ac.uk/jobs/job_details.php?file=job_list&ID=1773&start=31

Informal enquiries may be addressed to Chris Cannings (c.cannings@shef.ac.uk).

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05/11/2003

[AG]

Senior Bioinformatics Positon at the FMI

Source:

http://bioinformatics.org/forums/forum.php?forum_id=2206

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bale (Suisse)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

BACKGROUND:
Tired of the poor funding in academia or the lack of freedom in a company? Want your own office?

We are looking for an enthusiastic person with several years experience in bioinformatics. Extensive experience in sequence analysis, data mining/data integration and genome analysis is required. A good knowledge of UNIX, database programming and shell scripting is a plus. Candidates with a PhD are encouraged to apply but a masters together with several years of practical experience will also be considered. In addition to their support and development commitments the successful candidate will be encouraged to attend international bioinformatics conferences and to have the initiative to develop their own research projects in the field of bioinformatics.

The FMI (www.fmi.ch), which is funded by the Novartis Research Foundation, is an International Institute with over 280 people of which approximately are 150 postdoctoral fellows and graduate students committed to basic research in areas as diverse as cellular growth control, epigenetic gene
regulation and neurobiology. The FMI offers highly competitive academic salaries and it provides state-of-the-art core technologies, transgenic mouse facilities, computing, genomice, and proteomics services.

The FMI is located in Basel, a city offering an outstanding scientific environment in the center of Europe.

JOB DESCRIPTION:
* Help and support: data mining, sequence comparisons, sequence alignment, BLASTs, individual projects with groups, etc.

* Teaching: Teaching of classes in bioinformatics

* Development: Evaluation of new tools and software, development of bioinformatics tools. Making tools accessible to users at (on www, central servers, ...)

* Databases: Maintenance of existing in-house databases (such as genbank,SWISS-PROT, etc.)

* Interface and collaborate with outside institutions: Interact with commercial and academic bioinformaticians in developing and sharing bioinformatic resources.

Contacts:

HOW TO APPLY:
Please submit your resume or questions to dean.flanders@fmi.ch.

http://www.fmi.ch

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05/11/2003

[AG]

Position in Biostatistics and Bioinformatics

Source:

bioinformatics.org

Date de parution:

05/11/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lille (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

FIELD
Microarray data and complex genetic disease analysis

LOCATION
INSTITUT DE BIOLOGIE DE LILLE
CNRS UMR 8090 - Genetics of Multifactorial Diseases
Lille - FRANCE

A full time POSITION in Biostatistics and Bioinformatics is available for 2 years starting November, 2003 in the Department of Human Genetics - Genetics of Multifactorial Diseases â€“ CNRS UMR 8090 - Director of Unit: Professor Philippe Froguel

DESCRIPTION:
Analysis of Affymetrix microarray data from transcriptome experiments using animal models and genetic data from human polymorphisms typed in both cohort and family studies. This will be carried out in the context of exploration of the molecular mechanisms underlying pancreatic beta-cell dysfunction and associated insulin-resistance.

Activities:

* Select and set up appropriate statistical methods for analyzing:
o Microarray data, including normalization, selection of
significant expression variation, clustering, GO annotation
o Genetic data, including linkage analysis, association
analysis, linkage disequilibrium mapping and haplotype
construction
* Manage data (acquisition, validation, quality control, organization)
* Analyze data, interpret and present results
* Adapt or develop new statistical tools when necessary
* Optimize usage of such tools and set up standard analysis procedures
* Data acquisition from public databases and other online resources

REQUIREMENTS

Skills:

* Knowledge of statistical methods
* Experience of statistical software such as SPSS, S+ or R
* Strong experience in microarray data analysis
* Knowledge of public databases and other online biological resources

Experience:
Masters Degree (DESS) or PhD, and, ideally, practical experience of microarray experiments.

CONDITIONS
The Position is for 2 years, from the 1st of November 2003, in Lille, France, in the bioinformatics and biostatistics team (6 people) of the Genetics of Multifactorial Diseases Laboratory.
Training in population genetics can be provided by the lab

APPLICATION DEADLINE
Applications will be reviewed in October 2003 until a suitable candidate is identified.
Interviews may begin in late October

Contacts:

HOW TO APPLY
Interested applicants should submit a letter of intent, a summary of previous research experience and a curriculum vitae, and reference to Sophie Gallina:
Sophie.Gallina@mail-good.pasteur-lille.fr

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05/11/2003

[AG]

Full time POSITION for 2 years - Position in Biostatistics and Bioinformatics

Source:

ABGf-3355

Date de parution:

22/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 22/12/2003

Position in Biostatistics and Bioinformatics
Field : Microarray data and complex genetic disease analysis

Full time POSITION for 2 years starting November, 2003 in the Department of Human Genetics - Genetics of Multifactorial Diseases – Director of Unit : Professor Philippe Froguel

Project Description :
Analysis of Affymetrix microarray data from transcriptome experiments using animal models and genetic data from human polymorphisms typed in both cohort and family studies. This will be carried out in the context of exploration of the
molecular mechanisms underlying pancreatic beta-cell dysfunction and associated insulin-resistance.

Activities:
* Select and set up appropriate statistical methods for analyzing:
o Microarray data, including normalization, selection of significant expression variation, clustering, GO annotation
o Genetic data, including linkage analysis, association analysis, linkage disequilibrium mapping and haplotype construction
* Manage data (acquisition, validation, quality control, organization)
* Analyze data, interpret and present results
* Adapt or develop new statistical tools when necessary
* Optimize usage of such tools and set up standard analysis procedures
* Data acquisition from public databases and other online resources

Skills :
* Knowledge of statistical methods
* Experience of statistical software such as SPSS, S+ or R
* Strong experience in microarray data analysis
* Knowledge of public databases and other online biological resources

Experience :
Masters Degree (DESS) or PhD, and, ideally, practical experience of microarray experiments.

Training in population genetics can be provided by the lab

Application Deadline :
Applications will be reviewed in October 2003 until a suitable candidate is identified. Interviews may begin in late October

Contacts:

Interested applicants should submit a letter of intent, a summary of previous research experience and a curriculum vitae, and reference to :
Sophie Gallina : Sophie.Gallina@mail-good.pasteur-lille.fr

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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05/11/2003

[AG]

Stage Post-Doctoral en Bioinformatique/Bio-Statistique

Source:

ABG-8115

Date de parution:

20/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 20/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 20/12/2003

ATRAGENE BIOINFORMATICS est une jeune societe de biotechnologies en pleine expansion implantee sur le bioparc Genopole a Evry (Essonne).

Accompagnant les evolutions rapides de la genomique et de la post-genomique, nous editons et commercialisons des outils innovants pour aller plus loin dans le processus d'analyse et accelerer les decouvertes des entreprises de biotechnologies, des groupes pharmaceutiques et des laboratoires academiques.

Nous recherchons actuellement un candidat pour un stage post-doctoral d'une duree de 12 mois, reconductible un an. Le candidat participera au developpement et a l'optimisation d'algorithmes dans le domaine de la recherche de motifs communs dans des sequences nucleiques.

Le candidat possedera un doctorat en bio-informatique ou en bio-statistique complete obligatoirement par un stage post-doctoral a l'etranger. Il aura une forte experience dans le domaine de l'analyse de sequences. Le candidat montrera de solides competences dans le domaine de la genomique. Des notions en programmation C et perl seraient appreciees.

Evoluant dans l'environnement dynamique des start-up de biotechnologies, le candidat devra presenter de bonnes capacites d'adaptation, d'innovation et de communication. Compte tenu des perspectives de developpement de notre societe, ce poste est evolutif.

Contacts:

Vous etes interesse par ce poste, envoyez votre candidature a recrutement@atragene.com en mentionnant la reference : RH/031016/GB/1002

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et d'indiquer non seulement la reference de l'employeur mais aussi la reference ABG de cette offre.

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05/11/2003

[AG]

Bioinformaticien (poste ATER)

Source:

ABGf-3363

Date de parution:

27/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 27/10/2003
Date de fin de diffusion prevue : 27/12/2003

Un poste ATER en Bioinformatique est disponible immediatement a l’Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles, rattache au laboratoire CNRS de Neurobiologie et Diversite Cellulaire (UMR 7637) sous la responsabilite du Pr.J.
Rossier, Professeur de Biologie en 1ere annee.
Les candidats seront titulaires d’une these ou d’une experience equivalente.
L’ATER recrute(e) sera responsable de l'enseignement (TP, 3 fois 15H) en bioinformatique (analyse de genomes, data mining).
Il/elle assistera le professeur dans la preparation des cours et
effectuera le suivi des stages des etudiants.
Son projet de recherche sera dans le domaine de l’analyse du transcriptome (regulation de l’expression des genes dans la Trisomie 21 et le retard mental).
Il/elle aura pour mission de developper et de maintenir une plate forme informatique, en collaboration avec les plate formes publiques existantes.
Remuneration brute mensuelle : environ 1900 euros.

Contacts:

Envoyer un cv au Prof . Jean Rossier : jean.rossier@espci.fr
Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/10/2003

[AG]

Bioinformatics Research Scientist

Source:

ABG-8094

Date de parution:

08/10/2003

Date limite de réponse:

07/12/2003

Lieu:

Johnston (Iowa) (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Position Purpose :
To implement, validate, and customize statistical methods for analyzing functional genomic experiments.

Duties/Responsibilities :
This person will be responsible for identifying, implementing, and validating statistical and data mining methods for designing and analyzing gene expression profiling experiments. This person should also be capable of customizing or extending previously-published methods when needed. This person will lead an effort to integrate gene expression results into biological networks. In addition to these roles, the successful candidate will be able to contribute to other bioinformatics projects requiring statistical analysis.

Educational Qualifications Desired :
Ph.D. in Statistics or closely-related field; post-doctoral experience is desirable.

Competencies and Experience Desired :
The ideal candidate will have a proven track record of application and/or development of innovating data mining algorithms to the analysis of large-scale expression profile data.

Rather than specializing in one particular technique, the candidate will have a global vision of recent developments in various fields such as statistics, data mining, or data visualization. He/She will be capable of evaluating how these recently-published methods may contribute to the analysis of gene expression data.

Excellent computational skills with the ability to work in a UNIX-based environment is expected.

Familiarity with statistical software is expected and a strong preference will be given to those applicants with expertise in either Splus or R.

This position requires a self-motivated scientist who works well in a team environment, communicates clearly and effectively, and creatively and independently solves problems.

Reports To :
Computational Biologist

Department :
Information Management - Bioinformatics and Exploratory Research

Contacts:

There are two ways to submit a resume for this position :

You must reference the job code PHI/QA323/WCP in your cover letter or the subject line of your email.

Pioneer employees must apply through PHIweb.

- Send your resume and cover letter in an email message (Attachments should be in Word, WordPerfect, Lotus, or ASCII format.) to : apply@pioneerjobs.com

- Mail your scannable resume and cover letter to the following address :
Resume Processing Center
Pioneer Hi-Bred International, Inc.
400 Locust Street, Suite 700
P.O. Box 14454
Des Moines, IA 50306-3454

Resumes will be accepted until the position is filled.

For general inquiries regarding employment, contact jobs@pioneer.com or call the Pioneer Hi-Bred Employment Job Line number at 515-270-4000 or 1-800-247-6803 ext. 4000.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory, when applying.

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21/10/2003

[AG]

CDD Math-Info pour la biologie

Source:

Date de parution:

13/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Développement de méthodes mathématiques de traitement de données de PCR quantitative. Ce travail s'insère dans un projet de recherche-développement en relation avec une entreprise du domaine privé. Le candidat devra faire preuve d'une bonne autonomie dans la mise en place des solutions mathématique proposées et sera en lien étroit avec des experts du domaine et les concepteurs de l'appareillage.
Le poste proposé sera localisé dans un laboratoire académique mais avec un statut salarié du privé.
La durée du contrat est de 8 mois renouvelable.

Contacts:

Contact :
Franck Molina
Tel: +33/0 467 548 603 ; Fax: +33/0 467 548 610
franck.molina@ibph.pharma.univ-montp1.fr

Lieu :
CNRS UMR 5160
Equipe Bioinformatique
Center for Pharmacology and Health Biotechnology
Faculte de Pharmacie, 15 av Charles Flahault, BP 14491, 34093 Montpellier
Cedex 5
tel: 00 33 (0)4 67 54 86 03
fax: 00 33 (0)4 67 54 86 10

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21/10/2003

[AG]

Post-doctoral positions BIOINFORMATICS

Source:

BioJobs

Date de parution:

14/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Two post-doctoral positions are available to work in bioinformatics and computational biology in Weill Cornell Medical College (New York City). Successful applicants will contribute to the design and development of SigPath, an information management system to support quantitative studies of signaling pathways and networks (http://www.sigpath.org). This project is a multi-disciplinary collaboration between laboratories at Weill Cornell Medical College and Mount Sinai School of Medicine. Candidates should demonstrate strong computational skills (UNIX, detailed knowledge of at least one significant programming language, Java preferred). Preference will be given to candidates who can also demonstrate a good background in biology or chemistry.

Software development and engineering skills, web-based technology, XML and database experience are a plus but can be learned as part of the post-doctoral training offered with this position. Each successful applicant will work in the multidisciplinary and advanced computational environment of the Institute for Computational Biomedicine (http://icb.med.cornell.edu).

Areas of scientific interest include: development of novel data representations for pathway information, information extraction from the literature, visualization and navigation of pathway information, quantitative models and simulation results.

Contacts:

Please address resume and two letters of reference to Dr. Fabien Campagne (mailto:icb-jobs@med.cornell.edu).

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09/10/2003

[AG]

BIOINFORMATICS SOFTWARE ENGINEER

Source:

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Bioinformatics Software Engineer opening

At Perlegen Sciences, we conduct genetics research and develop products that impact and improve people's lives. Established in March 2001, we are a well-funded, pre-IPO company aggressively developing our core competencies in research, genome scanning, bioinformatics, and other key areas of our business. We invite you to consider our team as we apply this technology to bring focus to biological research and to accelerate the discovery of drugs and diagnostics.

We currently have an excellent opportunity for a Bioinformatics Software Engineer to aid in the analysis and preparation of sequence and primers, as well as to assist colleagues in issues related to these design elements. We'll rely on you to analyze and design genetic sequence and primers for our association studies, place Perlegen's data in new contexts, make resulting information easily accessible, and quickly respond to questions about Perlegen's SNPs and assays in relation to the human genome. You will also examine past primer performance and make
recommendations for design process improvements. To qualify, you must be a team player who is both meticulous and insightful. You should have a BS in CS/EE or equivalent with a strong genetics/molecular biology background and/or a BS in Biology with a very strong computational background. Excellent Perl, SQL, analytical and communication skills, the ability to work in both Windows and Linux environments, proven ability to find and refine relationships between and within data-sets,
and proficiency manipulating and dissecting large data collections are essential. Two or more years of bioinformatics development experience preferred. Strong PL/SQL, Access and VB skills as well as competency with statistics would be a plus.

Contacts:

Email your resume, indicating Job Code GN78, to
perlegen_HR@perlegen.com; mail, again indicating Job Code GN78, to Perlegen Sciences, 2021 Stierlin Court, Mountain View, CA 94043; or fax to 650-625-4580. For more information on this position and other opportunities, visit our website at www.perlegen.com. EOE.

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09/10/2003

[AG]

CDD Math-Info

Source:

Date de parution:

09/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Montpellier (France)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Développement de méthodes mathématiques de traitement automatique de données de PCR quantitative pour le diagnostic (traitement du signal, modélisation).

Ce travail s’insère dans un projet de recherche-développement en relation avec une entreprise du domaine privé.

Le candidat devra faire preuve d’une bonne autonomie dans la mise en place des solutions mathématique proposées et sera en lien étroit avec des experts du domaine et les concepteurs de l’appareillage.

Le poste proposé sera localisé dans un laboratoire académique mais avec un statut salarié du privé.

Lieu :
CNRS UMR 5160
Equipe Bioinformatique
Montpellier

Contacts:

Contact :
Franck Molina
Tel: +33/0 467 548 603 ; Fax: +33/0 467 548 610
franck.molina@ibph.pharma.univ-montp1.fr

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09/10/2003

[AG]

2 CDD Ingenieur d'etudes

Source:

Date de parution:

09/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Nous recherchons 2 à pourvoir 2 CDD sur la période Janvier-Juin 2003.

Niveau: Ingenieur d'etudes

Description du poste:

Vous participerez au developpement d'un serveur Web dedie à la
Bioinformatique structurale, localisé à Paris (Jussieu).
Vous participerez à la conception de l'arborescence des services.
Votre tache consistera a mettre a disposition de nouveaux services sur le Web, (interfacer des programmes existants), les documenter, et a organiser le chaînage des programmes existants sur le serveur.

Compétences souhaitées:
Vous avez une connaissance des problématiques de la
bioinformatique structurale, ou ces problématiques vous intéressent et vous etes dynamique et curieux.
Vous avez une bonne compétence en informatique:
Connaissance du système UNIX (Linux)
Aspects Web: HMTL, CGI, (PHP, mySQL), perl
Aspects generaux: C, Fortran (au moins pour pourvoir adapter des programmes existants si nécessaire)
La connaissance du langage Python est un réel plus.

Postes à pourvoir pour 6 mois à partir de Janvier 2004.
Rémunération au niveau ingénieur d'études selon les grilles INSERM.

Attention: cloture des candidatures pour le 21 Octobre, l'audition des candidats sélectionnés aura lieu le Mercredi 22 après midi.

Contacts:

Contact: Pierre Tuffery
tuffery@urbb.jussieu.fr
(01 44 27 77 33)

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09/10/2003

[AG]

2 STAGIAIRE POST-DOCT (bio-info/bio-stats)

Source:

ABGe-1249

Date de parution:

19/09/2003

Date limite de réponse:

18/10/2003

Lieu:

Laval (Canada/Quebec)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 19/09/2003
Date de fin de diffusion prevue : 18/10/2003

Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique/bio-statistique sont presentement a combler, a l'UNIVERSITE LAVAL (Quebec) au sein d'un projet multi institutionnel, finance par Genome Quebec pour une periode de deux ans. Le travail vise le developpement de methodes d'analyse pertinente a l'expression de genes a grande echelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration etroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des biostatisticiens et des informaticiens.

Position 1.Traitement des donnees de microarray et analyse de designs experimentaux complexes.
Des developpements importants ont ete recemment acquis en analyse statistique des microarrays, toutefois ces progres ont ete principalement appliques a des comparaisons simples. Deux themes principaux seront abordes dans cette partie du projet : la correction de biais dans l'analyse des donnees quantitatives de microarrays et les methodes statistiques pour l'analyse dispositif experimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le developpement de modele pour quantifier le biais experimental ; l'evaluation et l'amelioration des procedures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l'analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l'evaluation de la pertinence et des limites de differentes methodes statistiques ; la modification novatrice des methodes existantes pour les rendre mieux adaptees aux donnees obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d'un projet de genomique fonctionnel situe dans un pavillon de recherche en sciences de la vie.

Qualifications : Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la sante, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise developpee en statistiques. Une comprehension des principes de l'expression des genes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l'experience dans les domaines suivants : connaissance de langages de programmation, manipulation de grands fichiers de donnees, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacites de communications en Anglais ou en Francais sont essentielles.

Position 2. Integration des donnees d'expressions geniques
Le projet consiste a developper des techniques d'analyses concernant deux types d'integration: 1-Integration de donnees provenant de differentes techniques de mesures d'expression genique; 2- Integration des fonctions des genes a leurs profils d'expressions. Ce projet consiste d'abord a integrer les donnees produites par les trois differentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression) et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiees sur les fonctions des genes ainsi que leurs roles dans les differents sentiers, metaboliques ou de signalisations, devront etre integrees aux profils d'expressions geniques.

Qualifications : Un Ph.D en biologie moleculaire ou fonctionnelle ou equivalent avec une tres bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne experience en programmation, en bases de donnees relationnelles et en extraction d'informations des bases de donnees publiques.

Contacts:

Pour postuler, soumettre :
- une lettre de presentation
- un curriculum vitae a jour
- IMPORTANT : les noms et coordonnees de trois personnes references

- Transmettre par courriel en un seul document attache (format Word ou PDF) a genome.foret@rsvs.ulaval.ca
- Le nom du candidat doit etre donne au titre du fichier, ou l'inserer dans le texte du courriel.
- Inscrire le numero de position dans la ligne sujet du message.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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09/10/2003

[AG]

motif discovery algorithm/statistics

Source:

BioInfo

Date de parution:

09/10/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

New York (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

We have an immediate open position for a postdoc working on motif discovery algorithm/statistics. If you or someone you know are interested, please contact me asap.

Contacts:

Michael Q. Zhang, Ph.D.
Professor
Cold Spring Harbor Lab
1 Bungtown Road
Cold Spring Harbor, NY 11724.
USA
Tel:1-516-367-8393
Fax:1-516-367-8461
http://www.cshl.edu/mzhanglab/
Secretary: Ms. Carol Marcincuk (1-516-367-8387, marcincu@cshl.edu)

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18/09/2003

[AG]

three PhD positions in Bioinformatics

Source:

Date de parution:

04/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Callaghan (Australie)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

1431 (Evolutionary Algorithms and Optimization Methods
for large-scale problems in Bioinformatics),

1432 (Algorithmic approaches for problems in Proteomics,
Molecular Modelling and Drug Design)

1433 (Novel Statistical and Optimization Methods for the Life Sciences).

These numbers correspond to the entries in the Jason Postgraduate
Scholarship Database for Australia:

http://www.jason.unimelb.edu.au

where the complete information can be retrieved. Please follow the link and the procedures described in the Jason
database.

In addition, the University offers other Scholarships

http://www.newcastle.edu.au/study/scholarships/index.html

which may relate to other Bioinformatics ongoing projects at Newcastle.
These other scholarships may suit International Students and have a closer deadline in some cases.

More information about the Newcastle
Bioinformatics Initiative is available from the web site at:

http://www.cs.newcastle.edu.au/~nbi

As you can probably see from the scholarships announcements,
we are interested in people who have already some expertise
in algorithmic engineering and in solving large optimization
problems with combinatorial optimization methods, metaheuristics and exact techniques.

Contacts:

Dr. Pablo Moscato
Newcastle Bioinformatics Initiative - Director
Postgraduate Director for Computer Science
School of Electrical Engineering and Computer Science
The University of Newcastle, Callaghan, 2308, NSW
AUSTRALIA
moscato@cs.newcastle.edu.au
Phone : +61 2 4921 6056
Fax: +61-2-4921-6929

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18/09/2003

[AG]

Computational Biologist / Bioinformatician

Source:

Date de parution:

18/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Mountain View (Canada)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Ingenuity (TM) delivers systems biology expertise to biologists and bioninformaticians through pathways analysis software, genome-scale computable network databases, and knowledge management services and infrastructure, resulting in increased R&D productivity and faster drugs to market. We are a group of creative, energetic motivated people passionate about our product, and dedicated to providing researchers with the knowledge required to make Better Decisions Faster (TM).

Computational Biologist

As a computational biologist at Ingenuity Systems, you will help a product research team design and implement user-centered, computational approaches for the functional analysis of large biological datasets based on Ingenuity's proprietary ontology and knowledge base of scientific findings.

Specific work areas at Ingenuity will include:

· Development of biologically-motivated algorithms which operate over complex biological networks and experimental data
· Pathway identification, characterization, and analysis approaches
· Drug target characterization and validation

Skills and Experiences Required:

· Interest in comparative genome-scale analysis of protein, gene, and metabolic networks, pathways, regulatory networks, and gene expression data analysis
· Basic knowledge of biochemistry and cell biology, including signal transduction, metabolism, and transcriptional regulation
· Demonstrated ability to develop, implement, and validate innovative algorithms for the quantitative analysis of genome-scale datasets in a systems biology context
· Ph.D. or equivalent in Computational Biology, Computer Science,
Mathematics, Physics or other relevant discipline
· Understanding of graph theory, algorithms, and applications
· Strong algorithm development skills, including complexity analysis and performance optimization
· Ability to comprehensively assess algorithmic approaches to pathway-and systems-biology-based data analysis: identify and effectively communicate similarities and differences from design, algorithm, statistics, and end-user value standpoints
· Ability to implement and validate algorithms using Java, Perl, or Python
· Familiarity with ontologies and knowledge representation
· Excellent writing and communication skills, with a particular emphasis on the ability to communicate algorithmic concepts to scientists and to make effective presentations to an interdisciplinary, cross-functional group
· Organized, detail-oriented, and self-motivated
· Flexible and works well as part of an interdisciplinary research team

Experiences and Skills Desired:

· Experience working on drug discovery and with scientists in the
pharmaceutical industry is strongly preferred
· Knowledge of molecular and cell biology techniques used to credibly demonstrate protein functions and biomarkers used to infer functions
· Experience analyzing gene expression, sequence, and proteomic data
· Familiarity with AI, text mining, or lexical semantics
· Experience with sequence classification algorithms (such as Pfam)
· Ability to use HMMs and Bayesian statistics
· Familiarity with statistical clustering and classification algorithms (eg. K-means)
· Knowledge of human diseases: molecular biology, models, stages, and markers

Contacts:

Contact Information:
Email your resume to jobs@ingenuity.com ATTN: CTKH346
For more information on Ingenuity, check our website: www.ingenuity.com
Ingenuity is located at: 1565 Charleston Road in Mountain View.

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18/09/2003

[AG]

Post-doctoral position in microarray data analysis

Source:

Date de parution:

18/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bâle (Suisse)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

We seek a highly motivated and enthusiastic scientist who is interested in cutting-edge genomics and bioinformatics approaches that include large-scale expression profiling and genome wide identification of protein-DNA interactions in the field of meiosis, gametogenesis and germline development. Our lab operates a high density oligonucleotide microarray platform that enables researchers interested in statistical and clustering aspects of microarray data analysis to work with very
large and very well documented data sets.

We are a member of the Swiss Institute of Bioinformatics (SIB), a
prestigious association of laboratories that work in the field of
computational biology. The Biozentrum and the SIB provide an excellent wet lab and IT infrastructure, full support for the recently established Department of Bioinformatics and a highly stimulating, international academic environment.

Candidates should be familiar with statistics of microarray data
analysis, statistical languages and environments (R, S+), programming languages (PHP, Perl), database management systems (Oracle, MySQL), and be comfortable in a Linux development environment.

Contacts:

Please send your CV and the names of two references to
Prof. Michael Primig
Department of Bioinformatics
Biozentrum, University of Basel &
the Swiss Institute of Bioinformatics
Klingelbergstrasse 50/70
CH-4056 Basel / Switzerland

Phone Office: +41 61 267 20 98
Phone IT-Office: +41 61 267 15 78
Fax: +41 61 267 33 98
http://www.bioz.unibas.ch/primig
http://www.isb-sib.ch
http://www.bioz.unibas.ch/corelab
http://www.germonline.org

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08/09/2003

[AG]

tenure track faculty position at the assistant professorship level

Source:

Date de parution:

03/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

The Information and Computer Sciences (ICS) department is pleased to announce a tenure track faculty position at the assistant professorship level. The department has a 35-year history of excellence and innovation in information and computer science. We are seeking a computational scientist whose research interests include developing new approaches to the analysis of large biological and ecological data sets. The candidate
should have the interest and background to collaborate effectively with the life sciences community. The candidate should also have the computer science background to participate as an active faculty member in ICS.
The duties include developing a strong bioinformatics research program and teaching undergraduate and graduate courses in bioinformatics.
Applicants must have a Ph.D. (or equivalent degree) from an accredited college or university in computer science, biology, bioinformatics, genetics, evolutionary biology, or closely related field, and must de monstrate a strong aptitude for research, a commitment to effective teaching, and a student and community oriented attitude relevant to implementing the objectives of the University and the ICS Department. Desirable qualifications include research and teaching experience with graphical databases, quantitative data analysis, data visualization, and multimedia systems. Knowledge of Hawaii’s native biota and conservation issues are also desirable. Salary
and benefits are competitive. Interested applicants are invited to present a resume and contact information for three references.

Contacts:

Please email a URL reference to your application (no attachments) to ics-search@hawaii.edu or send hardcopy to: Bioinformatics Search Committee, Dept. of Information and Computer Sciences, University of Hawaii at Manoa, POST 317, 1680 East West Road, Honolulu, HI 96822.
Review of applications will begin on Dec-22-2003 and will continue until the position is filled. Applications received after Dec-22-2003 may not receive full consideration.
Additional information can be found at http://www.ics.hawaii.edu.

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03/09/2003

[AG]

poste d'ingénieur d'étude génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle

Source:

Date de parution:

29/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

()

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'INRA ouvre un poste d'ingénieur d'étude au sein de l'équipe génome de l'UMR INA-PG / ENGREF / INRA de Biométrie et Intelligence artificielle (Paris, 5°).

Cette équipe, dirigée par J.-J. Daudin et S. Robin, est composée de 6 chercheurs, enseignants-chercheurs et doctorants en statistiques travaillant sur des applications à
- l'analyse des séquences,
- l'analyse des données issues de biopuces (puces à ADN).
Le titulaire de ce poste travaillerait essentiellement sur le 2ème point. Le profil de poste est accessible à l'adresse

http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/profils/ie6002.htm

Contacts:

Les informations pratique liées au concours sont accessibles sur le serveur de l'INRA à l'adresse
http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/index.htm.

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03/09/2003

[AG]

RESEARCH ASSOCIATE (POST-DOC) IN BIOINFORMATICS AND METABONOMICS

Source:

ABGe-1229

Date de parution:

26/08/2003

Date limite de réponse:

26/09/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

DTI-FUNDED “BEACON” PROJECT ON BAYESIAN MODELLING OF METABOLIC AND TOXIC PROCESSES

This is an exciting opportunity for an ambitious and highly computer literate Research Associate with a PhD in chemistry, biochemistry, chemometrics, bioinformatics or cognate subject who is looking to develop their career in the field of metabonomics and whole organism metabolic modelling. The post holder will be part of a post-doctoral team working to develop novel Bayesian methods to model quantitative metabolic data generated by NMR spectroscopy and mass spectrometry of biofluids and be under the supervision of Prof. Jeremy Nicholson, Head of the Biological Chemistry Section (in association with Profs. Steve Muggleton and Mike Sternberg in Computer Science).
In particular the post-holder will be involved in the multivariate statistical analysis of spectroscopic data. A knowledge of NMR spectroscopy and/or mass spectrometry would be
advantageous, but is not essential.

The position is available immediately for a period of 2.5 years. Salary will be on the RA1A scale: £18,265 - £27,390 per annum plus £2,134 London Allowance.

Contacts:

Further details and an application form can be obtained from :
- Nahid ASHBY (phone +44 20 7594 3225)
email n.ashby@imperial.ac.uk
- Dr. Marc-Emmanuel DUMAS, m.dumas@imperial.ac.uk

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02/09/2003

[AG]

Bioinformaticien confirmé

Source:

Date de parution:

24/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : Drh-588
Date de publication : 24 juillet 2003
Date de clôture : 30 septembre 2003

Au sein d'un laboratoire de recherche en génétique et génomique
végétales travaillant avec des équipes de renommée mondiale, vous
participerez à un enjeu stratégique de premier plan: approfondir la connaissance, la compréhension et la représentation du génome des plantes cultivées tropicales. Bio-informaticien, vous êtes attiré par ce défi et souhaitez travailler dans l'environnement scientifique de la Génopole de Montpellier

Descriptif du poste :
Le poste s'intègre dans l'équipe de bio-informatique d'une unité
d'analyse des polymorphismes chez les plantes cultivées tropicales et méditerranéennes. En partenariat avec différentes équipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amélioration des méthodes pour l'analyse bio-informatique des données issues des travaux de séquençage de grands fragments chez les Monocotylédones et de génotypage chez différentes espèces.
Il contribuera à l'intégration de différentes méthodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation comparative) et réalisera les développements bio-informatiques nécessaires. Il élaborera les approches bio-informatiques adaptées aux études d'association et de
déséquilibre de liaison chez des espèces à biologie variée.

Profil souhaité :
Doctorat en bioinformatique, avec une expérience significative dans le domaine de l'analyse de séquences. Une expérience post-doctorale serait appréciée.
Bonne connaissance des outils d'annotation (détection de motifs,
logiciels de prédiction de gènes...).
Maîtrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc.
Connaissance des modules informatiques spécifiques de la
bio-informatique : Bioperl, BioJava,BioPipeline, etc...
Expérience de la modélisation.
Bonne culture générale en génétique et biologie moléculaire.
Aptitude à la communication interdisciplinaire.
Esprit d'équipe, bon relationnel

Date de prise de fonction :
Dés que possible

Contacts:

Renseignements sur le poste :
Brigitte Courtois 04.67.61.56.94
Avenue Agropolis
34398 Montpellier Cedex 5 France
Tel: (33) 04 67 61 56 94
Fax : (33) 4 67 61 56 05
e-mail: brigitte.courtois@cirad.fr

ou Manuel Ruiz 04.67.61.56.31

[ Contacts ]
Cirad: http://www.cirad.fr
Cirad-Drh/Emploi
TA 174/04
34398 Montpellier Cedex 5, France
emploi@cirad.fr

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02/09/2003

[AG]

poste d'ingénieur d'étude AGNAE

Source:

BioInfo

Date de parution:

02/09/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Jouy-en-Josas (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'INRA ouvre un poste d'ingénieur d'étude au sein de l'équipe système d'information d'AGENAE (projet d'Analyse de GEnomes des ANimaux d'Elavage). Ce poste est basé à Jouy-en-Josas (78) dans l'unité MIG (Mathématique, Informatique et Génome)

L'équipe d'accueil de ce poste se compose de 5 ingénieurs basés sur trois sites (Jouy-en-Josas, Rennes et Toulouse) mettant à disposition des biologistes des applications et des données concernant :
- le nettoyage, l'assemblage et l'annotation des séquences,
- l'analyse des données issues de biopuces (puces à ADN),
- la cartographie.

Contacts:

Le profil de ce poste est accessible à l'adresse :
http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/profils/ie3201.htm
Les informations pratiques liées au concours sont accessibles sur le serveur de l'INRA à l'adresse :
http://www.inra.fr/drh/ita/ce2003/infos.htm.

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11/08/2003

[AG]

molecular genetics and genomic analysis of a bacterial pathogen

Source:

ABGt-3176-PhD

Date de parution:

01/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 01/08/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/09/2003

We are studying weapons bacterial pathogens use to neutralize the
defence mechanisms of their animal or human host.
for info, see: http://www.biozentrum.unibas.ch/cornelis/
We open a PhD position to start the molecular genetics and genomic analysis of a new pathogen .
Main skills required are in molecular microbiology and bioinformatics.
Applicants should have a diploma in biology, biochemistry, microbiology or molecular biology.

Contacts:

Please send motivation mail, CV and E-mail of 3 references to :
guy.cornelis@unibas.ch

Thank you for quoting ABG reference number when applying.

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11/08/2003

[AG]

RESEARCH POSITION

Source:

Date de parution:

02/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Montreal (Canada/Quebec)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Comparative and Evolutionary Genomics/Bioinformatics.
Faculty Position, Canadian Institute for Advanced Research

The Department of Biochemistry at the Faculty of Medicine
invites applicants for a faculty position at the Assistant Research Professor level in the areas of Comparative and Evolutionary Genomics, and Bioinformatics. This position implies a prestigious Scholar appointment in the Evolutionary Biology Program of the Canadian Institute for Advanced Research (CIAR). The successful candidate will have demonstrated excellence in the field of bio- informatics and/or genomics. Preference will be given to candidates with experience in evolutionary biology. He or she is expected to establish an innovative research program, and participate in teaching at both the undergraduate and graduate levels. Salary and startup funds will be commensurable with qualifications and experience, and successful candidates will be eligible for considerable infrastructural support through the Canada Foundation for Innovation.

Contacts:

jobs@bch.umontreal.ca

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08/08/2003

[AG]

molecular genetics and genomic analysis of a bacterial pathogen

Source:

ABGt-3176-PhD

Date de parution:

01/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

molecular genetics and genomic analysis of a bacterial
pathogen - Basel (Switzerland).

Date de debut de diffusion du poste : 01/08/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/09/2003

We are studying weapons bacterial pathogens use to neutralize the
defence mechanisms of their animal or human host.
for info, see: http://www.biozentrum.unibas.ch/cornelis/
We open a PhD position to start the molecular genetics and genomic analysis of a new pathogen .
Main skills required are in molecular microbiology and bioinformatics.
Applicants should have a diploma in biology, biochemistry, microbiology or molecular biology.

Contacts:

Please send motivation mail, CV and E-mail of 3 references to :
guy.cornelis@unibas.ch

Thank you for quoting ABG reference number when applying.

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03/08/2003

[AG]

Bourse de These en Microbiologie

Source:

ABGt-3122

Date de parution:

16/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 16/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 15/08/2003

Proposition de sujet :
Le laboratoire dispose d'une collection originale d'Archaea
hyperthermophiles du groupe des Thermococcales (Pyrococcus, Thermococcus), isolees a partir d'echantillons preleves sur des
sources hydrothermales oceaniques de divers sites des oceans Atlantique, Pacifique et Indien. Un premier crible realise sur 190 isolats a revele la presence de nombreux plasmides de differentes tailles (2,8 a plus de 30kb) chez plus de 40% des isolats examines suggerant que ces elements joueraient un role important dans la b iologie des communautes microbiennes des sources hydrothermales.
A ce jour, seuls deux petits plasmides presents chez des Archaea de ce groupe ont ete decrits, dont l'un, pGT5 dans notre laboratoire a permis la mise au point du premier systeme de
transformation chez ces organismes.
Les objectifs de cette these sont d'etudier la diversite et la
biogeographie de ces elements genetiques, de rechercher les homologies de sequence et d'analyser celles-ci pour mettre
en evidence les structures conservees impliquees dans les fonctions de maintenance, de replication et de propagation et enfin de trouver des indices de transferts horizontaux de genes. Par ailleurs, la comparaison avec les genomes d'Archaea hyperthermophiles apparentees devrait permettre de mieux comprendre le role des plasmides dans la plasticite des genomes de leurs hotes.

Qualifications :
Le candidat ou la candidate detiendra un DEA en microbiologie, genetique ou biologie moleculaire.
Il ou elle possedera des competences en genetique bacterienne, en
biologie moleculaire et en bioinformatique.

Lieu :
A l'IUEM, Technopole Brest-Iroise, place Nicolas Coppernic, 29280
Plouzane, principalement dans le laboratoire de Microbiologie Marine (UMR 6539) de l'IUEM, mais egalement au laboratoire de "
Microbiologie et Biotechnologies des Extremophiles " IFREMER, les deux laboratoires fusionnant en une nouvelle UMR debut 2004.

Debut de la these :
Octobre 2003

Financement :
Bourse regionale pour 3 ans

Contacts:

Les candidats et candidates sont pries de transmettre pour le 15 aout au plus tard leur dossier comprenant un CV, un resume du stage de DEA, une lettre d'intention ainsi que le nom d'une
personne de reference a :

daniel.Prieur@univ-brest.fr
et marc.leromancer@univ-brest.fr

les candidats et candidates retenus seront auditionnes la premiere quinzaine de septembre.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003

[AG]

These Puces ADN

Source:

Date de parution:

01/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Nice (France)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de l'ACI : Programme de Microbiologie. Microbiologie fondamentale et appliquée, Maladies infectieuses, environnement et bioterrorisme (http://www.recherche.gouv.fr/appel/2003/microbio.htm),
notre projet : "Development and validation of a prototype microarray based on ribosomal DNA-targeting oligonucleotide probes for the analysis of ectomycorrhizal fungi community" a été financé.

Pièce Jointe :

these_nice.pdf (45 ko)

Contacts:

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03/08/2003

[AG]

Chef de projet bioinformatique au Genoscope

Source:

ABG-7916

Date de parution:

02/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 02/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 02/09/2003

Le Genoscope – Centre National de Sequencage recrute un Chef de Projet Bioinformatique, responsable de sa plate-forme d'annotation.

Le Genoscope, composante du GIP CNRG (Consortium National de Recherche en Genomique), mene des projets de genomique a grande echelle en collaboration avec des laboratoires experts de la biologie des organismes concernes, et developpe ses propres thematiques de recherche dans le cadre de l’UMR Genoscope/CNRS/Universite d’Evry « Structure et Evolution des Genomes ».

L’equipe bioinformatique est fortement implique dans l’annotation et l’analyse des genomes sequences au Genoscope, ainsi que dans le developpement de methodes et outils bioinformatiques lies aux differents programmes de recherche. Elle se compose a l’heure actuelle de 9 chercheurs et ingenieurs, qui travaillent en collaboration etroite avec les
biologistes du Centre. L’equipe bioinformatique collabore egalement de pres avec le service Informatique (15 personnes), charge de l’informatique liee a la production de sequences, des processus de traitements automatises, et de la gestion de l’infrastructure materielle et logicielle.
Le Genoscope dispose d'un systeme de calcul a haute performance, constitue principalement d'un cluster Compaq Alpha a 8 membres et 40 processeurs, et d’un espace de stockage.de 10 To.

Le candidat prendra la responsabilite de l’evolution de la plate-forme logicielle d’annotation du Genoscope : expression des besoins, specification fonctionnelle, conception de l’architecture, integration de composants logiciels existants et developpements nouveaux.
Il sera seconde dans sa mission par une petite equipe de 2 bioinformaticiens.

Competences requises :

Au minimum 4 ans d'experience
Bonne connaissance et experience de developpement sous Perl et de C++ ou Java
Experience de la gestion d’un projet de developpement consequent
Excellente maitrise de l’environnement Unix dans un contexte de calcul scientifique a haute performance (calcul distribue, grands ensembles de donnees)

Competences appreciees :

Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (notamment lies a analyse de sequences) Bonne connaissance des SGBD relationnels (modelisation, administration)
Anglais courant

Formation souhaitee : ecole d’ingenieur generaliste, ecole d’informatique, ou 3eme cycle

Date de prise de fonction : Septembre 2003

Contacts:

Candidature a adresser par courrier electronique a Vincent Schachter (vs@genoscope.cns.fr)

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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03/08/2003

[AG]

bioinformaticien confirme

Source:

ABGf-3198

Date de parution:

24/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Le Cirad recrute un bioinformaticien confirme - Montpellier

Date de debut de diffusion du poste : 24/07/2003
Date de fin de diffusion prevue : 30/09/2003

Au sein d'un laboratoire de recherche en genetique et genomique
vegetales travaillant avec des equipes de renommee mondiale, vous participerez a un enjeu strategique de premier plan:
approfondir la connaissance, la comprehension et la representation du genome des plantes cultivees tropicales.
Bio-informaticien, vous etes attire par ce defi et souhaitez
travailler dans l'environnement scientifique de la Genopole de
Montpellier
Le poste s’integre dans l’equipe de bio-informatique d’une unite
d’analyse des polymorphismes chez les plantes cultivees
tropicales et mediterraneennes.
En partenariat avec differentes equipes de biologistes, le titulaire du poste prendra en charge l'amelioration des methodes
pour l'analyse bio-informatique des donnees issues des travaux de
sequencage de grands fragments chez les Monocotyledones
et de genotypage chez differentes especes.
Il contribuera a l'integration de differentes methodes de bioanalyse (logiciels d'annotation, utilisation d'EST, annotation
comparative) et realisera les developpements bio-informatiques
necessaires. Il elaborera les approches bio-informatiques
adaptees aux etudes d'association et de desequilibre de liaison chez des especes a biologie variee.

Profil souhaite :
Doctorat en bioinformatique, avec une experience significative dans le domaine de l'analyse de sequences. Une experience
post-doctorale serait appreciee.
Bonne connaissance des outils d'annotation (detection de motifs,
logiciels de prediction de genes...)
Maitrise de langages de programmation : Perl ou Python, Java, SQL, etc.
Connaissance des modules informatiques specifiques de la
bio-informatique : Bioperl, BioJava, BioPipeline, etc...
Experience de la modelisation
Bonne culture generale en genetique et biologie moleculaire
Aptitude a la communication interdisciplinaire
Esprit d'equipe, bon relationnel

Lieu d'affectation :
Cirad Montpellier, campus lavalette

Contacts:

Informations complementaires et depot des candidatures
http://www.cirad.fr/emploi/chercheurs.html

Complements de dossier de candidature a adresser, avec le numero de reference du poste, par email a : emploi@cirad.fr
ou par courrier postal a :
Cirad Drh - TA 174/04
Avenue Agropolis
34398 Montpellier CEDEX 5

Merci de faire reference a l'ABG lors de tout contact ou lors du depot de votre candidature.

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03/08/2003

[AG]

Nestlé BIOINFORMATICS GROUP MANAGER (REF :868)

Source:

Ref.868

Date de parution:

14/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

(Suisse)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

LOCATION:Vers-chez-les-Blanc
OVERALL OBJECTIVE:
Drive innovation to achieve business impact by managing projects in his/her Group and delivering high quality end-products.
MAIN RESPONSIBILITIES AND CHALLENGES:
.. Provide leadership, focus and motivational support to his/her group.
.. Implement NRC and Departmental strategy and Departmental policies within the Group.
.. Collaborate with other Group Managers and Project Leaders to define bioinformatic needs and prioritize, launch, terminate
projects/activities in his/her portfolio accordingly.
.. Lead the Bioinformatics Group to be innovative and proactive to anticipate needs of NRC researchers.
.. Manage Group members, including objectives setting and appraisal, to ensure timely delivery of high quality results.
.. Ensure quality and documentation of bioinformatics work and training of NRC users.
.. Interact and communicate effectively with business and scientific partners (internally and externally) and provide technical assistance as fitted.
.. Manage allocated budgets (investments, external contracts)

Recruit, integrate, coach and develop people.
REPORTS TO: NRC Department head
EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED:
University degree (PhD or equivalent) in bioinformatics. Basic knowledge of human biology or physiology and min of 5 years of industrial experience managing a Bioinformatic Group.
LANGUAGE: Verbal and written communication skills in English.
DATE NEEDED: ASAP
CONTACT: Please attach a CV with names of three references (postal and e-mail addresses), on http://www.careers.nestle.com website. (Ref.868)

Contacts:

Bob Foley
3916 Pettis Rd
St. Joseph, MO 64503
Phone-816-387-4103
Fax-816-387-4115
robert.foley@rdmo.nestle.com
Nestle Purina Petcare PTC is an equal opportunity employer (M,F,D,V)

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03/08/2003

[AG]

Nestlé Purina PetCare: BIOINFORMATICS

Source:

Date de parution:

03/08/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

St Louis (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

LOCATION: Nestlé Purina Petcare PTC - St Louis, Missouri
JOB DESCRIPTION:
Interact with multi-disciplined scientist teams including nutritionists, animal scientists, molecular biologists, geneticists and other bioinformaticians working against multiple projects. Responsibilities will include input against
experimental design and output, focusing on integrating experimental data, bioinformatical analyses and statistics.
REPORTS TO: Manager of Molecular Biology group
RESPONSIBILITIES:
The position is responsible for leading projects and participating on project teams that conduct basic, non-invasive nutrition research to benefit cats and dogs. The successful candidate will have the capability of using their molecular biology and bioinformatics expertise to aid our product
development scientists to develop products with unique nutritional or wellness claims. The candidate will be expected to collaborate as necessary with other Nestle R&D Centers as well as Universities to stay current in the field. Occasional
travel to other R&D Centers and Universities is required.
EDUCATION AND EXPERIENCE REQUIRED:
.. Minimum of BS Degree in Molecular biology or related field (PhD degree highly preferred)
.. Three years experience using bioinformatics and biostatistics with a strength in combining statistics and bioinformatical analyses
.. Research experience working with microarray, rtPCR and comparative genomics data

LANGUAGES NEEDED: English necessary. French an added positive
OTHER SKILLS REQUIRED: Excellent computer skills required as well as good verbal and written communication skills. Must have excellent teamwork skills.
DATE NEEDED: Immediately

Contacts:

CONTACT: Bob Foley
3916 Pettis Rd
St. Joseph, MO 64503
Phone-816-387-4103
Fax-816-387-4115
robert.foley@rdmo.nestle.com
Nestle Purina Petcare PTC is an equal opportunity employer (M,F,D,V)

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03/08/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS)

Source:

Date de parution:

18/07/2003

Date limite de réponse:

25/08/2003

Lieu:

Gif sur Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Le Centre de Génétique Moléculaire (CGM) Unité CNRS, situé à Gif sur Yvette (91) recherche un Ingénieur d'étude en bioinformatique (CDD CNRS).
Celui-ci sera intégré à la plate-forme de bio-puces dirigée par Lon Aggerbeck, et plus précisémént à l'équipe de Bio-informatique dirigée par Hervé Delacroix.
Il participera à la mise en place et à l'interfaçage des outils
d'analyses statistiques et de clustering (développés en R), ainsi que des outils d'analyse d'images avec la base de données de transcriptome.
Profil : Vous connaissez plusieurs langages de programmation, en
particulier des outils de développement web (HTML, Java, SOAP, expresso, TomCat, ...), des langages de script (perl, php, ...) et avez une expérience de la gestion des bases de données (JDBC, PostgreSQL, MySQL, Oracle, ...).
Des connaissances en statistiques seront particulièrement appréciées.

Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminée d'une durée maximale de 6 mois, disponible à partir du 1er octobre.

Contacts:

Les candidats intéressés doivent faire parvenir une lettre de motivation ainsi qu'un curriculum vitae détaillé avant le 25 aout à l'adresse suivante:

Pr Hervé DELACROIX
Centre de Génétique Moléculaire
CNRS UPR 2167
91198 Gif-sur-Yvette Cedex

mail : delacroix@cgm.cnrs-gif.fr

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03/08/2003

[AG]

postdoc paillasse/modélisation post-génomiqueà genopole

Source:

Date de parution:

16/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la genopole d'Evry (banlieue Sud de Paris) pour
travailler à la frontière expérimentale entre paillasse et modèle
formel. L'étude, à connotation post-génomique, pourrait porter par exemple sur l'organisation fonctionnelle du noyau eucaryote ou du nucléoïde bactérien, ou sur la différenciation hématopoïétique.

Genopole (www.genopole.org) est une "vallée de la génétique" qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d'entreprises de biotechnologies autour de l'université d'Evry-Val d'Essonne.

Le candidat, titulaire d'une thèse et travaillant actuellement en
dehors de France, sera fortement intéressé par la modélisation
mathématique en biologie. Une bonne formation en biologie et une
expérience de la paillasse sont nécessaires.

Contacts:

SVP envoyez un CV à Gilles Bernot (bernot@lami.univ-evry.fr, http://www.lami.univ-evry.fr) ou François Képès (Francois.Kepes@genopole.cnrs.fr, http://stat.genopole.cnrs.fr/~kepes/)

Programme d'Épigénomique, genopole.

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03/08/2003

[AG]

Stage Post-Doctoral en Bio-Informatique/Bio-Statistique

Source:

Réf : RH/030303/GB/1002

Date de parution:

23/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

ATRAGENE BIOINFORMATICS développe des outils appliqués à la génomique et la protéomique à destination des entreprises de biotechnologies, des groupes pharmaceutiques et des laboratoires académiques. Notre société est implantée depuis janvier 2003 sur le bioparc Genopole à Evry (Essonne).

Nous recherchons actuellement un candidat pour un stage post-doctoral d'une durée de 12 mois - reconductible un an - et financé par Genopole. Le candidat participera, sous la direction du directeur du département, au développement et à l'optimisation d'algorithmes dans le domaine de la
recherche de motifs communs dans des séquences nucléiques non alignées.

Le candidat possèdera un doctorat en bio-informatique ou en
bio-statistique complété par un stage post-doctoral à l'étranger. Il aura une forte expérience dans le domaine de l'analyse de séquences. La maîtrise des algorithmes communément utilisés pour la recherche de motifs serait un plus.
Le candidat montrera de solides compétences dans le domaine de la
génomique, ainsi qu'en programmation (C). Des notions en programmation objet seraient appréciées (C++, Java).

Evoluant dans l'environnement dynamique des start-up de biotechnologies, le candidat devra présenter de bonnes capacités d'adaptation, d'innovation et de communication. Une grande aptitude au travail en équipe en milieu multidisciplinaire sera indispensable. Compte tenu des perspectives de développement de notre société, ce poste est évolutif.

Contacts:

Vous êtes intéressé par ce poste, envoyez votre candidature à
recrutement@atragene.com.

David Polverari
Directeur bioinformatique
ATRAGENE BIOINFORMATICS
4, rue Pierre Fontaine
91058 Evry - France
david.polverari@atragene.com
www.atragene.com

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03/08/2003

[AG]

bourse postdoctorale : analyse comparative génomes de la vigne et Arabidopsis

Source:

Date de parution:

31/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date
négociable) à la Génopole d’Evry (banlieue sud de Paris) pour travailler sur l’organisation du génome de la vigne et mener des recherches en génomique comparative avec Arabidopsis thaliana. Cette étude sera réalisée dans un groupe d’environ 50 personnes travaillant en génomique végétale et ira d’études bioinformatiques à la validation des hypothèses à la paillasse. Le salaire brut sera d’environ 2900€.

La Génopole (www.genopole.org) est une « vallée de la génétique » qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d’entreprises de biotechnologie autour de l’Université d’Evry-Val d’Essonne.

Le candidat, titulaire d’une thèse et travaillant actuellement en dehors de la France, sera fortement intéressé par la génomique comparative. Des expériences en bioinformatique (analyse et comparaisons multiples de séquences essentiellement) et en génétique (cartographie génétique et/ou physique) sont demandées.

Contacts:

SVP envoyez un CV à adam@evry.inra.fr (http://www.evry.inra.fr).

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03/08/2003

[AG]

chercheurs postdoctoraux en bioinformatique

Source:

Date de parution:

28/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Quebec (Canada)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Deux postes de chercheurs postdoctoraux en bioinformatique sont
présentement à combler, à l’Université Laval (Québec) au sein d’un projet multi institutionnel, financé par Génome Québec pour une période de deux ans. Le travail vise le développement de méthodes d’analyse pertinente à l’expression de gènes à grande échelle. Les candidats retenus travailleront en collaboration étroite avec des chercheurs en sciences biologiques, des
biostatisticiens et des informaticiens.

Position 1. Traitement des données de microarray et analyse de designs expérimentaux complexes.
Des développements importants ont été récemment acquis en analyse
statistique des microarrays, toutefois ces progrès ont été
principalement appliqués à des comparaisons simples. Deux thèmes principaux seront abordés dans cette partie du projet : la correction de biais dans l’analyse des données quantitatives de microarrays et les méthodes statistiques pour l’analyse dispositif expérimentaux de type factoriel et temporel. Pour la correction de biais, les objectifs sont le développement
de modèle pour quantifier le biais expérimental ; l’évaluation et l’amélioration des procédures existantes pour la correction des sources de biais. Pour l’analyse statistique de dispositifs factoriels et temporels, les objectifs sont l’évaluation de la pertinence et des limites de différentes méthodes statistiques ; la modification novatrice des méthodes existantes pour les rendre mieux adaptées aux données obtenues des microarrays. Le candidat travaillera au sein d’un projet de génomique fonctionnel situé dans un pavillon de recherche en sciences de la vie.

Qualifications. Un Ph. D. en statistiques pertinent pour les sciences biologiques ou de la santé, ou un Ph. D. en sciences biologiques avec une expertise développée en statistiques. Une compréhension des principes des l’expression des gènes est souhaitable mais non obligatoire. Les candidats doivent avoir de l’expérience dans les domaines suivants: connaissance de
langages de programmation, manipulation de grands fichiers de données, connaissance de UNIX souhaitable. D'excellentes capacités de communications en Anglais ou en Français sont essentielles.

Position 2. Intégration des données d’expressions géniques
Le projet consiste à développer des techniques d’analyses concernant deux types d’intégration: 1-Intégration de données provenant de différentes techniques de mesures d’expression génique; 2- Intégration des fonctions des gènes à leurs profils d’expressions. Ce projet consiste d’abord à intégrer les données produites par les trois différentes techniques suivantes : les biopuces, le SAGE (serial analysis of gene expression)
et le Q-RT-PCR. De plus les informations publiées sur les fonctions des gènes ainsi que leurs rôles dans les différents sentiers, métaboliques ou de signalisations, devront être intégrées aux profils d’expressions géniques.

Qualifications. Un Ph.D en biologie moléculaire ou fonctionnelle ou équivalent avec une très bonne connaissance en informatique. Les candidates devront avoir une bonne expérience en programmation, en bases de données relationnelles et en extraction d’informations des bases de données publiques.

Contacts:

Pour postuler, soumettre :
- une lettre de présentation
- un curriculum vitae à jour
- les noms et coordonnées de trois personnes références

- Transmettre par courriel en un seul document attaché (format Word ou PDF) à genome.foret@rsvs.ulaval.ca
- Le nom du candidat doit être donné au titre du fichier, ou l'insérer dans le texte du courriel.
- Inscrire le numéro de position dans la ligne sujet du message.

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02/08/2003

[AG]

Post-Doctoral Research Fellowships

Source:

Date de parution:

04/07/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Washington (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

One or more postdoctoral positions are available in George Lake’s new group at Washington State University. The successful candidate will be part of both the Physics department and the newly formed Center for Integrative Biology. We are looking for a candidate who will use bioinformatics and computational biology with the theory building eye of a physical scientist. The particular projects that will be pursued are:
1) understanding the dynamics of gene regulatory networks, constraints on their properties and evolution that insure robust behavior,
2) developing techniques to examine the evolution of gene regulatory networks as distinct from the evolution of individual genes, and
3) working on a new theory for the explosion of species as occurred in the Cambrian explosion and the mammalian radiation.

Candidate should have a Ph.D. in Biology, Computer Science, Physics or a related field. Programming experience is required as well as an understanding of building quantitative theoretical models.

Job Information
Position Type: Post-Doctoral Research Fellowships
Reference (Job ID number):
Start Date: 2003-09-01
Duration: Full Time
Status: open

Contacts:

Washington State University
Department of Physics
George Lake
lake@wsu.edu
Tel. Number: 509-335-1698
FAX Number: 509-335-7816
http://134.121.46.58/Opportunities/current.htm
How To Apply: To apply, please submit a CV, list of publications,
statement of research interests, and have three letters of reference
sent directly to George Lake; Department of Physics; 1245 Webster;
Washington State University; Pullman; WA 99164-2814. Applications
arriving by September 1, 2003 will receive full consideration, but
review of applications and interviews will begin immediately.

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26/06/2003

[AG]

MC de bioinformatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

26/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Nice (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'Université de Nice Sophia Antipolis demandera un poste de MC de
bioinformatique pour la rentrée 2004.
Le profil retenu est "fouille de données, génomique et protéomique".
Dans le cadre des recherches faites sur le campus actuellement, data mining et/ou ontologies en relation avec les puces à ADN semble être le domaine qui pourrait être privilégié, mais sans pour autant exclure d'autres candidats en fonction de leur dossier.

Comme d'habitude, une expérience post-doctorale ayant permis
l'acquisition d'une double compétence sera un réel avantage, mais un stage post-doctoral ne sera pas exigé du candidat.

Les éventuels futurs candidats, peuvent me contacter par email pour plus de détails et discussions.

Contacts:

Richard CHRISTEN
UMR6543 CNRS - Université de Nice Sophia Antipolis
Biologie Virtuelle.
Centre de Biochimie. Parc Valrose.
06108 Nice cedex2
christen@unice.fr
tel 33 - 4 93 76 52 10
fax 33 - 4 93 76 52 19

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23/06/2003

[AG]

Open Ph.D. positions in Algorithmic

Source:

hd-emploi-info@jeunes-chercheurs.org

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Munich (Allemagne)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Department of Computer Science at the Ludwig-Maximilians-
University München offers several full time positions as

RESEARCH ASSOCIATES

within the Research Group on Algorithmic Bioinformatics. These
positions are integrated in the recently established Bioinformatics Initiative Munich (BIM) funded by the DFG. Research and teaching is conducted within a wide cooperation of other Munich Bioinformatics Centers. Our research focuses in design and analysis of efficient algorithms for discrete and combinatorial problems in Bioinformatics.

Applicants for these positions need to have the equivalent of the German University Diploma (e.g., M.Sc.) in Bioinformatics, Computer Science or Mathematics. These are fixed term positions for a period of 2 years with the possibility of extension for another 2 years. Prospective collaborators will have the opportunity to work towards a doctorate from the Ludwig-Maximilians-University Munich. The salary rate is according to the federal salary scale (BAT) on the IIa level.

Candidates are expected to have in-depth knowledge in Computer
Science, in particular in algorithmics, should have basic knowledge in Molecular Biology. Due to teaching obligations, profound knowledge of the German language is mandatory.

Contacts:

Applications (including curriculum vitae, copies of certificates, and a
statement of research interests) should be sent to the following
address, where also further information can be obtained:

Prof. Dr. Volker Heun
Institut für Informatik
Ludwig-Maximilians-Universität München
Theresienstr. 39
80333 München
Germany

Email: heun@informatik.uni-muenchen.de
Web: www.bio.informatik.uni-muenchen.de/personen/heun/group/

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23/06/2003

[AG]

Computational Biologist

Source:

bambct-list@molbio.mgh.harvard.edu

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Waltham (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

JOIN A FAST PACED VENTURE BACKED BIOTECHNOGOLGY START-UP

engeneOS was formed in late 2000 to exploit the tremendous opportunity created by the genomics revolution in the biological sciences merged with cutting edge technologies from the physical and information sciences. We are a pioneer in establishing the field of Biomolecular Engineering to enable the design and construction of programmable Biomolecular Machines from natural and artificial building blocks. These Biomolecular Machines will serve a broad range of commercial applications including biosensors, chemical synthesis and processing, bio-electronic devices and materials, nanotechnology, functional genomics and drug discovery.

Founded and lead by an extraordinarily talented group of advisors/partners and management team, engeneOS is a fast paced entrepreneurial organization providing talented people with the opportunity for growth, development and contribution to our dynamic and growing organization.

We are seeking a high energy, dynamic individual to join our team as a Contract to Permanent Computational Biologist.

Contract Computational Biologist

As a key member of our dynamic interdisciplinary team you will actively participate in developing innovative solutions for complex computational biological problems. The ideal candidate should have the following:
-strong biology (especially genomics) and bioinformatics background
-familiarity with genomics database (Genbank, Protein database) and data mining
- Proficiency in search algorithm and database programming with experience in writing multiple applications that interface with databases (MySQL, PostgreSQL, Oracle)
- Statistical Analysis, Proteomics
- Experience with the following technologies:
- C or C++ or Java
- Perl or Python
- GUI development (Swing, GTK+, Tk)

Excellent written and verbal communication skills are required along with the ability to work under aggressive timelines.

engeneOS offers a competitive compensation and benefits package including, medical and dental coverage, Flexible Spending Accounts, Life & Disability Insurance, and stock options.engeneOS is an equal opportunity employer.

Contacts:

Please submit your resume/CV to:jobs@engeneos.com
Fax:781-891-3796
Jennifer Neves
Staffing Specialist
Compound Therapeutics
1365 Main Street
Waltham, MA02451
PH: (781) 891-3745 x 321
FAX: (781) 891-3796
jneves@compoundtherapeutics.com

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23/06/2003

[AG]

BIOMEDICAL INFORMATICS - Research

Source:

bioinformatics.org

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

(Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Responsibilities: Join GE's research in molecular imaging as a
Bioinformatics Scientist, working with world-class experts in imaging physics, molecular biology, and medicinal chemistry, developing the nextgeneration of molecular diagnostics. We need experts in bioinformatics analysis of protein pathways and gene expression to develop tools and techniques for discovering molecular imaging targets and apply these techniques to the study of specific diseases. Projects will involve developing platform technologies for integrating many disparate types of
public and proprietary genomic and proteomic data along with analysis methods to elucidate pathways and identify molecular imaging targets.
Collaborate with GE’s luminary academic and commercial scientific
partners both to develop next generation diagnostic products and to publish research results.
Requirements: Candidates need to have either a PhD in bioinformatics or computational biology, or degrees in both biological and computational sciences, with one being at the PhD level.
·Knowledge of molecular disease mechanisms and pathways.
·Knowledge of genomics and analysis of DNA microarray data.
·Mathematical and computer science background.
·Published work in the bioinformatics field.
·Excellent communication skills (verbal, written, presentation).
·Ability to work effectively in teams.
Demonstrated experience in one or more of the following areas would also be highly desirable:
·Experience in building computational models of biological phenomena.
·Experience in statistical analysis of biological data.
·Experience with microarray tools and algorithms, knowledgeable about their limitations and research areas.
·Experience building bioinformatics databases and software tools.
Desired:
·Experience in pharmaceutical or biotech industry.
·Experience as Principal Investigator on funded research grants.
·Leadership / coordination ability.

Contacts:

To apply to this position, please click on this link.
https://www.research.ge.com/eHire
Please enter GECRD/319910/WB2273 in the job reference code field.

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23/06/2003

[AG]

Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie

Source:

BioInfo

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure (Paris)
recherche un : Ingénieur d'étude en bioinformatique/imagerie (CDD INSERM)

Vous serez intégré à l'Institut Fédératif de Recherche du
Département de Biologie dirigé par Patrick Charnay. Plus précisément, vous serez rattaché aux plates-formes du transcriptome et d'Imagerie dirigées par Claude Jacq et Antoine Triller. Vous participerez aux analyses informatiques des
images de ces services, ainsi qu'à la mise en place des outils nécessaires à leur réalisation. Vous serez plus particulièrement conduit à travailler sur des thématiques liées à l'imagerie.

Mission :
Des outils d'analyse des puces à ADN, commerciales ou
fabriquées localement, ont été mis en place (GenePix). Vous assurerez le maintien de ces outils et contribuerez à l'intégration de nouvelles méthodes d'analyse.
Vous serez chargé d'assurer le bon fonctionnement des outils de la plate- forme et de vous tenir au courant des évolutions du secteur.
Des robots sont disponibles sur la plate-forme pour la gestion
des matériels biologiques. Vous aurez en charge le fonctionnement
des programmes de ces robots ainsi que le développement d'outils
automatisés permettant par exemple la reconnaissance de colonies sur boîtes.
Vous aurez en charge une partie de la formation des utilisateurs
aux techniques d'analyse d'images des puces à ADN.

Profil :
Vous connaissez plusieurs langages de programmation et vous
avez l'expérience des programmes d'automatisation des tâches
plus particulièrement dans le domaine de l'imagerie. La maîtrise des outils de développement d'interface web (HTML, Javascript, .), des langages de script (PHP, perl, .) et de la gestion des bases de données (SQL) serait un plus.
Des connaissances en biologie seront particulièrement appréciées.

Perspectives :
Ce poste s'inscrit dans la politique de développement de la
bioinformatique et de l'imagerie dans le Département de Biologie de l'Ecole Normale Supérieure . Il s'agit d'un Contrat à Durée Déterminé disponible immédiatement jusqu'au 30 novembre. Ce poste est accordé avant le recrutement d'un ingénieur d'étude par l'INSERM par concours national.
Vous pourrez ensuite vous présenter à ce poste. Les conditions salariales sont celles des ingénieurs d'études de l'INSERM.

L'arrêté d'ouverture est paru, la date limite de retrait des dossiers est fixée au 11 juillet et la date limite de depôt au 15 juillet

Contacts:

Envoyez vos références à Stéphane LE CROM : lecrom@biologie.ens.fr

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23/06/2003

[AG]

Computational Neurobiology at EMBL

Source:

BioInfo

Date de parution:

23/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Postdoctoral position available in the team of Computational
Neurobiology at the European Bioinformatics Institute (UK)

The DopaNet consortium (http://www.dopanet.org) is a tentative to
mobilise the european scientific expertise in molecular and cellular neurobiology, in order to investigate precisely and quantitatively all the aspects of neurotransmission --- at the levels of the molecule, the supra-molecular assembly, the neuronal cell and the neuronal network --- in a specific neuronal system.

A crucial step of the DopaNet project will be to build realistic models of networks of signal transduction at the levels of the synapse, the neuron, and the micro-circuit. Those models will provide a deeper understanding of neuronal signalling, but also will aim at reproducing neuronal disorders in silico to understand how specific molecular and cellular abnormalities could generate pathological phenotypes, and to predict the effect of pharmacological treatments

A team of bioinformaticians located at the European Bioinformatics Institute will be in charge of the databases, but also of the modeling of neuronal functions. Within this framework, we look for a person to develop detailled and realistic models of dynamical synapses.

PhD interested in Systems Biology and Signal Transduction are invited to apply.

Requirements:

- Solid culture in Molecular and Cellular Biology. A knowledge of
Neurobiology is a plus.

- Background in Mathematics and/ort Physcics;

- Skills in computing: Knowledge of several programming languages (if possible one of C++, Java or Perl). Experiences of some flavor of Unix would be a plus (the work will be done under Sun solaris, True64 or Linux).

The position will be open at the end of 2003. Interested fellows should send their CV as quick as possible to:

Contacts:

Nicolas Le Novère
Receptors and Cognition
Institut Pasteur
25, rue du Dr ROUX
75724 Paris, France

tel: +33 1 45 68 88 44
fax: +33 1 45 68 88 36

email: lenov@pasteur.fr

The European Bioinformatics Institute (EBI, http://www.ebi.ac.uk), part of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL), was established at Hinxton near Cambridge, UK, to foster leading edge research and development in biocomputing. In collaboration with groups in Europe, the
USA and Japan, the EBI maintains many biological databases, including comprehensive public databases of DNA and protein sequences and their 3D structures. The EBI is currently broadening its interests toward transcriptomics, protein networks and metabolic pathways.

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16/06/2003

[AG]

Associate or Full Professor computational biology and bioinformatics

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

01/08/2003

Lieu:

Washington (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Fred Hutchinson Cancer Research Center
USA-WA-Seattle
Senior Faculty Position (Associate/Full member)

Senior Faculty Position in Bioinformatics or Computational Biology The Fred Hutchinson Cancer Research Center is recruiting an Associate or Full Member (corresponding to Associate or Full Professor) to lead an initiative to develop the broad area of computational biology and bioinformatics. Applicants should have expertise in such areas as computational genomics or proteomics, systems biology, or bioinformatics. Applicants should also have an excellent research history using quantitative methods to investigate biological mechanisms and have demonstrated success in bridging theoretical and empirical approaches. The successful applicant will have the capability of leading multidisciplinary research teams, with a pertinent record of funding. An appointment in a relevant department at the University of Washington is possible depending on mutual interest. A letter summarizing experience and research plans, a complete CV, and the name, title and addresses (including email address) of four references should be sent to: Gail DeVun Fred Hutchinson Cancer Research Center 1100 Fairview Avenue North, MP-702 PO Box 19024 Seattle, WA 98109 gdevun@fhcrc.org Applications or statements of interest should be received by August 1, 2003 to assure consideration. Later applications may also be considered if the position is not yet filled. The Fred Hutchinson Cancer Research Center and the University of Washington are equal Opportunity/affirmative action employers. Both institutions are building culturally diverse faculty and strongly encourage applications from women and minority candidates.

Job Information
Position Type: Faculty
Reference (Job ID number):
Start Date: ASAP
Duration: Full Time
Status: open

Contacts:

Fred Hutchinson Cancer Research Center
Quantitative Biology
Gail Devun
gdevun@fhcrc.org

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16/06/2003

[AG]

postdoctoral research associate position

Source:

AGM2

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Ames (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A postdoctoral research associate position is available starting July 1, 2003.

Long-range goal:
Understanding, at the whole genome level, mechanisms that produce genetic variation in populations under selection, to detect these mechanisms using DNA marker information, and to exploit them in population improvement programs. Immediate objective: Develop statistical theory and software to detect QTL that interact with genetic background or that have undergone mutation or recombination during the
course of selection.

Qualifications
- Ph.D. in plant or animal breeding or genetics with strong statistical background and interest is required.
- Ability or interest in computer programming also required (preferably in C++).
- Familiarity with Bayesian statistics and with statistical methods associated with analyzing pedigrees highly desirable.
- Research experience and analysis of molecular marker / phenotype associations preferable but not required.
- Ability to think independently and possession of excellent oral and written communication skills.

Details
The initial appointment will be for one year, with funding available for up to three years, contingent on satisfactory progress. Starting salary $30,000 to $35,000 with benefits.

Contacts:

For inquiries and to apply send (by email if possible) a cover letter indicating relevant experience, CV, publication reprints, and contact information for three references to
Jean-Luc Jannink
Dept. of Agronomy
Iowa State University
Ames, IA 50011
Phone: (515) 294-4153
Fax: (515) 294-6505
Email: jjannink@iastate.edu
Web: http://www.public.iastate.edu/~jjannink/

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13/06/2003

[AG]

Bioinformatics Postdoctoral Fellow

Source:

Date de parution:

13/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

San Francisco (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Bioinformatics Postdoctoral Fellow in the laboratory of Dr. Bruce R. Conklin.

We are looking for a highly motivated scientist to help drive a
development of new pathway-oriented public bioinformatics software tools (see www.GenMAPP.org). An ideal candidate will have a PhD or equivalent in Computational Biology, Bioinformatics, Computer Science, or Biology with a strong background in both the computational and biological sciences. Candidates should be familiar with at least one programming language (Java, or Visual Basic is a plus), open source
programs and database systems. Ability to work with computer scientists and wet-lab biologists is a plus.

Contacts:

Contact Bruce Conklin via btaylor@gladstone.ucsf.edu or see www.ConklinLab.org.

Bruce R. Conklin
Gladstone Institutes, UCSF
www.ConklinLab.org
www.GenMAPP.org
http://baygenomics.ucsf.edu/

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10/06/2003

[AG]

2 PhD position starting September 2003 in computational biology and bioinformatics

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Naples (Italie)

Statut:

Thèse

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Project 1: Computational approaches to Cis-Regulatory Elements
identification in Disease Genes.

Control of gene expression is achieved in the cell using signals
embedded in the noncoding DNA sequence flanking, and sometimes
including, the gene. These signals are cis-regulatory elements (CREs) controlling gene transcription, such as core promoters, enhancers and insulators. Genes involved in many genetic diseases do not have mutations in the coding sequence and therefore mutations in cis-regulatory elements may be involved. Computational identification of CREs is currently based on two different approaches: (1) identification of conserved motifs using interspecies sequence alignments; (2) identification of conserved motifs in the promoters of co-regulated genes. The first approach is based on the hypothesis that functionally important motifs have a small but invariant core (usually 4-6 bps) conserved during evolution in similar positions. This approach relies on global alignments between the promoter sequences in the different species. However, it suffers from limitations caused by the high mutation, deletion and insertion rates in gene promoter regions that prevent their correct alignment. On the other hand, if the promoters are highly conserved (for example, in evolutionary close species), also nonfunctional sequence motifs will be conserved and it will not be possible to distinguish from these, the important functional motifs. The second approach is based on the hypothesis that co-regulated genes must have the same, or very similar, motifs in their promoters. The specificity of the method is however low, since many of the motifs detected do not have any functional significance. The aim of the project is a novel algorithm to overcome these limitations and to apply it to the identification of novel regulatory elements in promoter regions of genes involved in genetic diseases.

Project 2: System biology approaches to the identification of complex regulatory networks.

Cells are composed of extensive, interconnected networks of genes, proteins and metabolites that control and regulate every activity of the cell. The strategic aim of this project is to develop integrated experimental and computational tools to identify complex regulatory networks in eukaryotic cells, using methodologies from Biomedical Engineering and System Theory. The problem we wish to address is the following: given a regulatory network with unknown structure and function in a eukaryotic cell, we want to be able to construct a quantitative model of the network using experimental gene expression measurements. Such a model would allow the identification of direct targets of gene of interest and to elucidate its regulation. This would be a fundamental contribution to the area of functional genomics, because it would provide a novel framework for elucidating the functional properties of genes. A major problem today is that computational and experimental approaches are usually not adapted to each other. Specifically the project aims to the development of a rapid and scalable computational and experimental method that enables construction of a quantitative model of a gene and protein regulatory network using no prior information on the network structure or function.
This will be achieved by developing an algorithm that uses mRNA and/or protein measurements following transcriptional perturbations of the genes in the network. A perturbation consists in an artificially induced upregulation or downregulation of the transcription of the genes in the network. These perturbations are the inputs to the system (network) that we want to identify. The mRNA and/or protein measurements are the outputs. The algorithm we plan to develop should be robust to noise in the data and should be able to reconstruct the network from a limited set of experimental data.

Possibilità di 2 Dottorati di Ricerca con Borsa di Studio per 3 o 4 anni.

Il Dottorato si svolgerà, in parte, presso il Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM) di Napoli.

Per ulteriori informazioni rivolgersi a:
Diego di Bernardo (dibernardo@tigem.it)

Contacts:

PhD positions with a grant based on experience of the applicant for 3 or 4 yrs. The PhD students will be based at TIGEM in Naples, Italy. For more information please write to:

Diego di Bernardo (dibernardo@tigem.it)
Telethon Institute of Genetics and Medicine (TIGEM)
Via P Castellino 111, 80131, Napoli
Tel: 081 6132 229
www.tigem.it/PhD/

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10/06/2003

[AG]

GenBank Biologist

Source:

http://www.bioplanet.com/planetforums/viewthread.php?tid=1344

Date de parution:

10/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bethesda (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Enjoy Puzzles? Consider GenBank Biologist - Bethesda, MD

Interested in an exciting and rewarding alternative career in the
biosciences? Tired of bench work? Allergic to latex? Had enough 24/7?
Looking for a real job and not another postdoc? Enjoy puzzles and
problem solving? Incredibly detail-oriented? Comfortable using a
computer? If you have answered yes to most of these questions, then consider joining our team of highly skilled and dedicated scientists working onsite at the National Institutes of Health (NIH) in Bethesda, Maryland. This position is particularly suitable for a molecular biologist just completing a postdoc.

With over 24 million sequence records in its database, GenBank is
recognized by researchers worldwide, and its database is designed to provide and encourage access within the scientific community to the most up to date and comprehensive information available.

Using your molecular biology skills, you will partner with computational biologists, genomic science experts, and computer specialists at the NIH's National Center for Biotechnology Information (NCBI) to help build and maintain GenBank, the nucleotide sequence database for all publicly-available gene sequences. Computercraft has provided scientific expertise to GenBank continuously since 1991.

This is a highly diversified and challenging position requiring a Ph.D. in molecular biology (or related field), excellent written and verbal communication skills, and an aptitude for utilizing DNA sequence analysis software and web-related resources for extensive problem solving. With the training we provide using state-of-the-art custom software, the GenBank Biologist:

· Reviews sequence data directly submitted from individual laboratories, and large-scale sequencing projects.
· Evaluates nucleotide sequence submissions for biological integrity and accuracy.
· Biologically annotates DNA/RNA sequence submissions.
· Communicates extensively with submitters to resolve issues and
concerns related to their sequence submission(s).
· Conducts database and administrative activities related to the
maintenance of GenBank and related NCBI Web resources.
· Travels on occasion to scientific meetings to help disseminate
information about NCBI's resources to the scientific community.

Extensive sequence analysis and/or laboratory experience in molecular biology is essential. Experience with DNA sequence analysis software a plus. In addition, considerable teamwork interaction and excellent organizational and communicational skills are required for this extremely detail-oriented position. Must have strong desire to support publicly available scientific databases.

Qualified scientists who enjoy teamwork interaction, multi-tasking, and problem-solving with a results-oriented focus, are invited to submit all of the following for consideration: cover letter, curriculum vitae, salary history, salary requirements, and U.S. employment eligibility (you must currently reside in the U.S. and be eligible to work). Please note that incomplete applications cannot be considered.

We offer an excellent salary and benefits package, 40-hour work week with flexible start times, and relief from publishing requirements.

Contacts:

Email: hr@computercraft-usa.com
Fax: (301) 493-1288
Mail: Computercraft Corporation, Attn: HR, 6701 Democracy Blvd., Suite 401, Bethesda, MD 20817.

Please see our web site for more information: www.computercraft-usa.com

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10/06/2003

[AG]

Faculty researcher in Gene Expression

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

30/05/2003

Lieu:

Western Cape (Afrique du Sud)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

University of the Western Cape
South Africa-wp-Cape Town

The University of Western Cape is host to the South African National Bioinformatics Institute (SANBI) which shares the UWC campus with the central node of the National Bioinformatics Network (NBN). The University of Western Cape is seeking to fill a permanent post at the level of senior lecturer, (notch 12) with benefits, within SANBI. We seek a recognized bioinformaticist with evidence of research and commercial experience to join our team in gene expression bioinformatics. The incumbent will develop statistically sound high quality microarray data analysis and will work with the NBN to develop a proposal and project for a National gene expression platform under the auspices of the NBN (www.nbn.ac.za). In addition, he or she will work closely with the gene expression team at SANBI to develop and implement systems that extract knowledge from gene expression data. In accordance with the directives of SANBI as declared in its mission statement http://www.sanbi.ac.za/mission.html, the incumbent will help develop capacity in bioinformatics in South Africa. Please send applications, including contact details of 3 referees, to winhide@sanbi.ac.za closing date 30 May 2003. Winston Hide. South African National Bioinformatics Institute Private Bag X17, University of the Western Cape Bellville , South Africa , +27 21 959 3645 Fax +27 21 959 2512, www.sanbi.ac.za

The ideal candidate should have:

· Ph.D. or equivalent in a relevant area.

· Evidence of experience in an academic or scientific environment

· A record of relevant scholarly activity

· Strong leadership and interpersonal skills to work effectively in a diverse environment.

· An in-depth knowledge of bioinformatics tools and evidence of
development of tools and systems for analysis of biological data

· Evidence of commercial experience in an international environment

· A high degree of personal motivation and a desire to make an immediate contribution

Job Information
Position Type: Faculty
Reference (Job ID number): PROF03
Start Date: 2003-06-01
Duration: Full Time
Status: open

Contacts:

Contact Information
University of the Western Cape
SANBI
Win Hide
winhide@sanbi.ac.za
www.sanbi.ac.za

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10/06/2003

[AG]

CDD 12 mois: annotation de genome

Source:

ABGf-3067-CDD

Date de parution:

22/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 22/06/2003

CDD 12 mois non-renouvelable, niveau post-doctoral (ou IR)
salaire IR premier echelon

mots cles : genomique, bioinformatique, perl, bioperl, annotation

Projet : dans le cadre d'un projet de sequencage du genome de la
paramecie, en cours

Developpement d'outils pour l'annotation automatique du genome;
developpement de bases de donnees

Des bonnes connaissances de biologie moleculaire et d'informatique (niveau systeme ou programmation) sont souhaites; connaisances du langage Perl et des modules bioperl et/ou une
experience de recherche en bioinformatique seraient un grand plus.

Ce poste est reserve a un candidat qui n'a pas deja beneficie d'un CDD avec un etablissement public.

Reponses souhaitees tres rapidement, avant le 8 Juin dans le mesure du possible.

Contacts:

Envoie d'un CV par courrier electronique (sperling@cgm.cnrs-gif.fr) avec toutes les cordonnees pour vous joindre rapidement.

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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10/06/2003

[AG]

CDD 12 mois: creation base de données lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Gif-sur-Yvette (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

TRES URGENT: CDD de 12 mois non-renouvelable, niveau IE ou IR selon le diplôme, salaire premier échelon de la catégorie correspondante.

Mots clés: base de données relationnelle, interface web,

Projet:
Dans le cadre de la création d'un centre de ressources biologiques drosophiles organisé en réseau, nous recherchons un ingénieur (ou post-doc) pour développer l'outil de gestion commun sous forme d'une base de données relationnelle. La base recensera l'ensemble des ressources disponibles dans les différents laboratoires partenaires et comportera deux grands types de ressources, - des lignées mutantes ou transgéniques de Drosophila melanogaster espèce modèle dont le génome est entièrement connu, - des lignées de populations naturelles et d'espèces variées. (plusieurs milliers de lignées au total)

Mission:
Prendre en charge la conception et la réalisation de la base de données sécurisée (MySql ou PostGreSql) regroupant l'ensemble des lignées et espèces de drosophiles et de l'interface web.

Ce poste est réservé à un candidat qui n'a pas déjà bénéficié d'un CDD avec un établissement public de recherche.

Lieu de travail: CNRS, Gif-sur-Yvette, Populations, Génétique et
Evolution (PGE)

Contacts:

Personne à contacter:
Marie-Louise Cariou
Populations, génétique et Evolution - UPR 9034
CNRS - Gif-sur-Yvette
Tél 01 69 82 37 10
Mail: cariou@pge.cnrs-gif.fr

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10/06/2003

[AG]

CDD 3 ans Team Leader of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services

Source:

EMBL Job Vacancy 03/57

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

15/07/2003

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

CDD

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/57

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position in Heidelberg:

HEAD OF CENTRAL COMPUTING SERVICES

Grade: 9

Duty Station: Heidelberg, Germany

Job Description: The successful candidate will lead a team of about 10 IT specialists in charge of the maintenance and development of central computing and networking services for the main Laboratory of the European Molecular Biology Laboratory in Heidelberg.

A key task of this team is to provide service and support to the EMBL scientific community at all levels of computing and networking.
Supported equipment includes a broad range of computing devices (from desktop machines, workstations to large servers). The operating system environment is heterogeneous and includes Unix, Linux, MacOS and Windows. The implemented networking technology is state-of-the-art and allows the provision of extensive online services to the worldwide scientific community.

It is essential that the central computing service team collaborate with research groups in computational biology at EMBL. The Head of central computing services is expected to serve as a facilitator for the in-house computational biology community as well as for the EMBL Outstations. The duty of the person also involves support and interaction with the SAP based administrative computing system and consultants.

Qualifications and Experience: Applicants should have a university degree or equivalent as well as having substantial experience in managing and integrating a heterogeneous scientific computing environment, which includes expertise in network security and network administration. The position requires the ability to develop technical concepts and proposals for further improvement of the computing and networking services, including improvement in the areas of the GRID and network security. Previous experience in management of an IT team and skills in negotiating with computer equipment manufactures are highly desirable.

Contract: A contract of 3 yearsí duration will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 15.07.2003

Contacts:

EMBL Web site: http://www.embl.de/

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10/06/2003

[AG]

SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Heidelberg (Allemagne)

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

EMBL Job Vacancy 03/22

Laboratoire Européen de Biologie Moléculaire
European Molecular Biology Laboratory
Europäisches Laboratorium für Molekularbiologie
EMBL/V/03/22

rev. May 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France,
Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal,
Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that
applications are being sought for the following position in Hamburg:

SOFTWARE ENGINEER / SCIENTIFIC PROGRAMMER IN PROTEIN CRYSTALLOGRAPHY

Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications

Duty Station: Hamburg, Germany

Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: The work will involve development of graphical user
interfaces (to be built on the existing modules), support of the Web and
Email server, support of remote execution of ARP/wARP jobs on local
mulit-processor computer cluster.

Qualifications and Experience: Applicants should have a computational
background and experience in the design of GUI. Profound knowledge of
C/C++, Java/Javascript, Perl, Tcl/Tk, HTML or Python programming
environments is required. Some familiarity with crystallography will be
of advantage.

Contract: A contract of 1 year will be offered to the successful
candidate. This may be renewed, depending on circumstances at the time
of the review.

Closing date: 30.05.03

EMBL Web site: http://www.embl.de/ and http://www.embl-hamburg.de

Please note that EMBL does not return CVs and attached documents to applicants.

EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation.

Contacts:

To apply for this position, candidates should submit a detailed CV, including a list of publications (if relevant), and a summary of recent projects, scientific interests and expertise, as well as the names and addresses of two referees for letters of recommendation, quoting ref. no. 03/22, to:
The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, 69012 Heidelberg,
Germany.
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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10/06/2003

[AG]

Research Associate in biostatistics and

Source:

ABGe-1165-Postdoctoral

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

23/06/2003

Lieu:

Londres (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 23/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 23/06/2003

This is an exciting opportunity for an ambitious post-doc with a PhD in mathematics, statistics, physics or bioinformatics who is looking to develop their career as a biostatistician in the field
of genomics. The post is linked to a Wellcome Trust project, coordinated by Professor James Scott and involving an inter-disciplinary team working to develop the understanding of metabolic diseases and in particular the syndrome of insulin resistance.
You will work directly with Professor Sylvia Richardson, Head of
Biostatistics Group in the Department of Epidemiology for developing and applying multivariate statistical tools to gene
expression data. The post is funded by a Wellcome Trust Thematic grant for Cardiovascular Functional Genomics. The appointment will be for 2 years in the first instance, with a possibility
of a third year.

Further details concerning the Biological Atlas of Insulin Resistance are available on the web pages from the Consortium:
http://www.icggri.ic.ac.uk/bair/index.htm

The appointment will be on the RA1A scale with a minimum of £21,125 per annum plus London Allowance of £2,134 per annum.

Valuing diversity and committed to equality of opportunity.

Contacts:

Please contact:
Professor Sylvia Richardson
sylvia.richardson@imperial.ac.uk

Further particular and application form can be obtained from Madeline
Kirk on +44 20 7594 3319, or
email: m.kirk@imperial.ac.uk.

Closing date: 12th June 2003.

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003

[AG]

post-doctoral position bench work and algorithmic development

Source:

BioInfo

Date de parution:

02/06/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Pittsburgh (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A post-doctoral position is opened in my lab. The project combines bench work and algorithmic development. I am primarily looking for a biologist with good lab skills that he/she wants to learn some computational biology (and -perhaps- gradually moving into it). I am *not* looking for a computer scientist that wants to learn biology; nor for a biologist that wants to switch immediately to purely computational work.

A description of the position can be found at my web page
http://www.hgen.pitt.edu/~benos/lab_pages/open_posit.html

Contacts:

Panayiotis (Takis) Benos, Ph.D.
Assistant Professor
Dept. of Human Genetics, GSPH | Tel. : +1 412 648 3315
University of Pittsburgh, | Fax : +1 412 624 3020
130 DeSoto str., A309 Crabtree Hall | e-mail: benos@pitt.edu
Pittsburgh, PA 15261, U.S.A. | URL: http://www.hgen.pitt.edu/benos.htm

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10/06/2003

[AG]

Postdoctoral Position at MIPS

Source:

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Munich (Allemagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for a postdoctoral fellowship to
develop new methods for automatic classification of protein
sequences using machine learning methods.

The input data will include BLAST/FASTA similarity scores,
protein domains and motifs, as well as secondary and tertiary structures predicted by standard bioinformatics methods. The primary classification target will be functional categories (FunCat) developed by the MIPS.

Applicants with a Ph.D. in bioinformatics, computer science/engineering are encouraged to apply. A background in molecular biology as well as demonstrated computer skills (programming in Perl, SQL, C/C++ familiarity with UNIX, Web) are preferred.

The position will be supervised by Prof. H.W. Mewes and Dr. I.V. Tetko.

The salary will be according to BAT IIa. The appointment will be for two years.
The position is available immediately.
Informal inquiries are also welcome.

Contacts:

Please send curriculum vitae, names for letters of recommendation to i.tetko@gsf.de, http://mips.gsf.de.

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10/06/2003

[AG]

2 Postdoctoral Fellows in Biological NMR Spectroscopy

Source:

ABG-7827

Date de parution:

22/05/2003

Date limite de réponse:

21/07/2003

Lieu:

Rochester (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 22/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 21/07/2003

There are immediate openings for two postdoctoral positions in
biological NMR at Mayo Clinic and Research Foundation. Several projects involving structural characterization of protein complexes are available.

Applicants should have experience in NMR spectroscopy.
Salary is very competitive and will be determined by the successful candidate's experience. There is an attractive benefit package.

For some general information about research at Mayo Clinic please visit: http://www.mayo.edu/research/

Contacts:

Applications, including curriculum vitae and bibliography, and the names of three references, should be sent by email to :

Dr. Georges Mer
Mayo Clinic
Guggenheim 1511B
200 First Street S.W.
Rochester, MN 55905
mer.georges@mayo.edu

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job
reference number, when applying.

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10/06/2003

[AG]

bourse post-doctorale Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés

Source:

Date de parution:

27/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Nancy (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS-INRIA-Universités recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et
Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses
étant réalisées au MAEM.

Contacts:

Réponse le plus tôt possible à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 :
Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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10/06/2003

[AG]

Biologist

Source:

Date de parution:

25/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist
The BioMinT project is focused on the development of statistical,
machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information:
http://biomint.org/).

The main tasks of the position will consist of:

exploring domain-specific knowledge resources in order to create
lexicons, thesauri and ontologies furnishing sets of document corpora for each stage of tools development and validation
evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators
A university level degree in biology is required, as well as an
experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position.

Eligible candidate for hold a Swiss or European union passport.

Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months

Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva

Contacts:

Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to:

Anne-Lise Veuthey

Swiss Institute of Bioinformatics
CMU
1, rue Michel Servet
1211 Genève 4
email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

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10/06/2003

[AG]

postes d'ATER en informatique/bioinformatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

23/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

L'Universite de Lille 1 dispose de postes d'ATER en
informatique, avec des besoins d'enseignement en bioinformatique. Les formations concernees sont :
DESS Bioinformatique, DESS Proteomique, DESS Genie Cellulaire, IUP Proteomique et Maitrise de genetique.

La recherche se ferait dans l'equipe Bioinfo
du LIFL: http://www.lifl.fr/BIOINFO/

La date limite d'envoi des dossiers est le 28 mai :
http://www.univ-lille1.fr/personnels/ater/recrutement_ater.htm

Contacts:

N'hesitez pas a me contacter pour avoir
plus d'informations :
Helene Touzet, au 03 20 43 68 02 ou touzet@lifl.fr

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21/05/2003

[AG]

charge de cours en bioinformatique

Source:

ABGe-1159

Date de parution:

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Date de debut de diffusion du poste : 13/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 29/05/2003

OUVERTURE DE POSTE

L'Universite Libre de Bruxelles annonce l'ouverture, a partir du 1er octobre 2003, d'un poste de charge de cours a temps plein en bioinformatique en Faculte des Sciences.

Les candidats doivent etre titulaires d'un doctorat en Sciences (ou d'un titre equivalent), et aire etat d'une experience soutenue de recherche de haut niveau portant sur un ou plusieurs
aspects de la bioinformatique: genomique ou proteomique comparative, structurale ou fonctionnelle, modelisation de processus cellulaires, conception rationnelle de molecules biologiquement actives, etc...

Une grande importance sera donnee aux synergies qui pourront s'etablir entre le nouveau charge de cours et les unites de recherche actives en bioinformatique a l'ULB. Le nouveau charge de cours participera a la promotion de la bioinformatique en tant que science interdisciplinaire.

Les candidats doivent egalement faire preuve de dispositions pedagogiques pour l'enseignement superieur. Le candidat retenu se verra attribuer des charges d'enseignement dans le cadre du DEA inter-universitaire en bioinformatique (en langue anglaise). Ces charges seront progressivement completees par des enseignements de 1er ou 2me cycle.

Si le candidat retenu n'appartient pas au personnel enseignant ou scientifique de l'ULB, ou au personnel definitif du Fonds National de la Recherche Scientifique travaillant a l'ULB, il sera engage a titre temporaire pour une periode a trois ans. A l'issue de cette periode, et moyennant une decision du Conseil d'Administration de l'Universite, son engagement fera l'objet d'une nomination a duree indeterminee sur le budget de fonctionnement de l'Universite.

Toutes les informations sont disponibles sur le site :
http://www.ulb.ac.be/docs/greffe/vacances/academique/index_6.html

la reference de l'offre est : 28.04.03/IV.21

Les candidats sont invites a retirer un modele de presentation du curriculum vitae sur le site http://resu1.ulb.ac.be/tools/CV-type.rtf. La candidature accompagnee dudit curriculum vitae, d'un resume des activites precedentes et d'un projet de recherches, doit etre adressee en deux exemplaires a M. Pierre de Maret, Recteur de l'Universite Libre de Bruxelles, 50 avenue Roosevelt, 1050 Bruxelles. Le candidat priera deux personnalites d'envoyer une lettre de recommandation a M. Guy Latouche, Vice-Doyen de la Faculte des Sciences, ULB, CP 212, boulevard du Triomphe, 1050 Bruxelles, qui, par ailleurs, se tient a disposition pour toute demande d'information.

La date limite du depot des candidatures est fixee au 29 mai 2003

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos
contacts, la source
(l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003

[AG]

Ingénieur de Recherche en bioinformatique campagne NOEMI

Source:

BioInfo

Date de parution:

21/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Gif-sur-Yvette (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un poste d'Ingénieur de Recherche en bioinformatique (Ingénieur expert en développement d'applications) est ouvert dans notre unité au titre de la campagne Noemi
(http://web.dsi.cnrs.fr/afip/owa/consult.affiche_fonc?code_fonc=C60087&code_
corps=IR&code_dr=4&code_bap=E&code_ds=60&nbjours=). Il s'agit d'un concours interne CNRS, mais qui est également ouvert à des personnes issues d'autres organismes publiques sous certaines conditions.

Mission :
Réaliser le développement de logiciels et/ou d’interfaces de bases de données nécessaires au maintien et à l’évolution de l’environnement bioinformatique de la plate-forme de protéomique de l’UMR de Génétique Végétale du Moulon.
Cet environnement concerne l’organisation, la gestion et l’analyse des données produites. Les développements seront donc réalisés autour de la base de données de la plate-forme ainsi que sous forme de logiciels indépendants.
L’ingénieur interagira avec les différents acteurs de la plate-forme (chercheurs, ingénieurs) et définira avec eux les solutions à apporter à leurs besoins.

Activités :
- Réaliser le développement de logiciels (spécification, conception, maquettage, codage et tests)
- Assurer la mise en œuvre des applications (installation, assistance, formation, évaluation)
- Assurer l’évolution des applications en relation avec les besoins scientifiques, techniques et de gestion
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine
d’application et les experts du domaine

Compétences :
- Connaissance approfondie de l’environnement UNIX et du langage C/C++ .
Une bonne pratique des langages Java, Perl, PHP et SQL sera appréciée ;
- Connaissance des architectures client/serveur ;
- Solides compétences en statistiques et analyse de données ;
- Capacité à travailler en équipe ;
- Capacités managériales ;
- Maîtrise de l'anglais technique du domaine.

Contexte :
L’ingénieur travaillera au sein de la plate-forme de protéomique de l’UMR de Génétique Végétale du Moulon, dont plusieurs équipes sont impliquées de longue date dans les analyses de protéomique. Cette structure est par ailleurs « plate-forme technique l’IFR 87 « la Plante et son Environnement ».
Il sera épaulé par les autres bioinformaticiens de l’UMR avec lesquels il sera amené à collaborer.

Pour plus de détails, consulter le site du CNRS :
http://web.dsi.cnrs.fr/afip/owa/consult.accueil ou me contacter.

Contacts:

Johann JOETS
UMR de Génétique Végétale du Moulon
Ferme du Moulon
91 190 Gif-sur-Yvette
tel : 330(1)69332378
fax : 330(1)69332340

21/05/2003

Source:

Date de parution:

15/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Genève (Suisse)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

In the framework of the FP5 European research project BioMinT, the Swiss-Prot group of the Swiss Institute of Bioinformatics is looking for a Biologist.

The BioMinT project is focused on the development of statistical, machine learning and natural language processing methods for mining the biological literature. The goal of the project is to create a curator's assistant for information retrieval and extraction in order to accelerate, by partially automating, the annotation and update of Swiss-Prot knowledgebase. In a second phase, the development of a more
generic researcher's assistant able to generate readable reports in response to queries from biological researchers is planned. The project is conducted by an inter-disciplinary team from biology, computational linguistics and data/text mining (for more information:
http://biomint.org/).
The main tasks of the position will consist of:
- exploring domain-specific knowledge resources in order to create lexicons, thesauri and ontologies
- furnishing sets of document corpora for each stage of tools
development and validation
- evaluating the prototype by providing direct feedback from database curators
A university level degree in biology is required, as well as an
experience in the field of proteomics. A good knowledge of Swiss-Prot database and web resources for biology is an asset. Some skills in bioinformatics would be an advantage. Collaboration and teamwork are essential to this position.

Eligible candidate for hold a Swiss or European Union passport.
Duration of the appointment: 18 months extendable to 36 months
Workplace: Swiss Institute of Bioinformatics, group Swiss-Prot, Geneva

Contacts:

Please send CV and covering letter until May 31st , 2003 to:
Anne-Lise Veuthey
Swiss Institute of Bioinformatics
CMU
1, rue Michel Servet
1211 Genève 4
email : Anne-Lise.Veuthey@isb-sib.ch

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21/05/2003

[AG]

Postdoc modele « plante virtuelle »

Source:

ABGt-2813

Date de parution:

05/05/2003

Date limite de réponse:

25/05/2003

Lieu:

Grignon (78) (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Integration dans un modele « plante virtuelle » des relations
source-puit et de la senescence au cours du remplissage des grains chez le ble.

Date de debut de diffusion du poste : 05/05/2003
Date de fin de diffusion prevue : 25/05/2003

Contexte des travaux de l’equipe
L’equipe met au point des modeles de fonctionnement de plantes et de population de plantes. Nous developpons en particulier des modeles de « plante virtuelle», fondes sur une representation informatique realiste des plantes. Nous cherchons a integrer dans cette approche les processus essentiels pour la simulation des interactions entre la plante et son environnement, en particulier les stress biotiques (maladies) et abiotiques (ozone,
carence azotee).
Il apparait que l’impact de ces stress est en grande partie lie a une acceleration de la senescence foliaire, probablement due aux modifications des sources et puits de carbone et d’azote. La modelisation de l’effet des contraintes necessite donc la mise au point d’un modele mecaniste de senescence foliaire. Le choix de l’approche « plante virtuelle » permettra de realiser l’integration sur la base d’une representation detaillee des processus, au sein de la plante et dans le temps.

Resume de la proposition : Lors du remplissage des grains chez les cereales, la demande d’azote est superieure aux possibilites de prelevement racinaire et le complement est fourni par remobilisation a partir des organes aeriens. Il en resulte une diminution de la photosynthese qui affecte l’activite racinaire, et accelere le processus. L’objectif de la these sera de mettre au point un modele exprimant ces interactions, et d’evaluer en particulier si la boucle de retroaction decrite plus haut permet de rendre compte de la progression de la senescence foliaire au cours du temps, dans differentes conditions environnementales. Le modele sera developpe selon une approche plante virtuelle developpee dans l’equipe, qui permettra de prendre en compte de facon precise la progression de la senescence au sein de l’architecture et son impact sur l’acquisition du carbone.
La recherche est donc fondee sur l’investigation de processus biologiques, elle inclut une composante importante en modelisation.

Lieu de Travail
INRA : Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France

Profil recherche
Nous recherchons de preference un candidat de formation initiale en biologie, motive par la formalisation mathematique et informatique.

Le candidat doit avoir effectue son DEA en France.
Les candidatures selectionnees par l’equipe seront soumises fin mai a l’Ecole doctorale ABIES pour la decision quant a l’attribution de l’allocation de recherche.

Contacts:

Envoyer lettre de motivation et CV detaille, de preference par mail, à :
Bruno Andrieu
INRA, Unite Environnement et Grandes Cultures
78850 Thiverval-Grignon, France
Tel : 01 30 81 55 27
Mail Bruno.Andrieu@bcgn.grignon.inra.fr

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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21/05/2003

[AG]

Modelisation Réseaux Moléculaires

Source:

Date de parution:

13/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Une bourse postdoctorale est disponible vers novembre 2003 (date négociable) à la genopole d'Evry (banlieue Sud de Paris) pour modéliser les réseaux moléculaires dans le cadre d'une nouvelle vue de l'organisation chromosomique.

Genopole (www.genopole.org) est une "vallée de la génétique" qui fédère actuellement une vingtaine de laboratoires de recherche et une quarantaine d'entreprises de biotechnologies autour de l'université d'Evry-Val d'Essonne.

Le candidat, titulaire d'une thèse et travaillant actuellement en dehors de France, sera intéressé par les récents développements de la post-génomique et de la modélisation en biologie. Mathématicien, physicien (de préférence) ou biologiste de formation, il aura une expérience de la programmation informatique.

Contacts:

SVP envoyez un CV à François Képès: francois.Kepes@genopole.cnrs.fr
http://stat.genopole.cnrs.fr/~kepes/

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21/05/2003

[AG]

Postdoc

Source:

Date de parution:

21/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Boston (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

If you know of any potentially qualified and interested recent PhD in computer science, math, stats, or physics who is interested in computational biology/bioinformatics, please urge them to contact me directly concerning an open postdoctoral position to work with me in the Department of Biology at Boston College.

Current projects concern algorithm design for the analysis of time series oligonucleotide and cDNA array data, RNA structure prediction, and extensions/refinements of aspects of sequence alignment.

Essential skills required: strong programming ability (especially in C/C++ and python or perl), some probability theory. Some background in computational biology would be helpful, but for someone really interested, this can be learned.

The Boston area has many opportunities in computational biology/bioinformatics, both academic and industrial. The weekly MIT Bioinformatics Seminar, co-organized by Bonnie Berger and myself, facilitates potentially useful future contacts, and the Boston area is home to a number of leading biotech and pharmaceutical companies involved in bioinformatics research (such as Novartis, Millenium, Serono, Lion Bioscience, US Genomics,etc.).

Contacts:

Peter Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor, Biology Department
Courtesy appt. Computer Science Department
Boston College
Higgins Hall 416 140 Commonwealth Avenue
617 552 1332 (office) Chestnut Hill, MA 02467
617 552 2011 (fax)
http://cs.bc.edu/~clote/
clote@bc.edu

21/05/2003

Source:

Date de parution:

12/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Marseille (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

CDD CNRS "POSTDOC" 2150 Euro/mois. Pas de condition de
nationalité

Ville : Marseille
UPR 2589 Information Génomique et Structurale
Directeur : Jean-Michel CLAVERIE

Voir le site CNRS: www.sg.cnrs.fr/drhchercheurs/post_doc/default.htm
et le site du laboratoire: igs-server.cnrs-mrs.fr

Notre laboratoire recherche des candidats pour le profil suivant

Domaine d'expertise :
Phylogénie moléculaire, analyse des séquences et/ou de structures 3D

Projet
Le candidat sera chargé d'implanter dans le laboratoire les méthodes bayésiennes d'analyse phylogénétique. Ces méthodes seront ensuite utilisées pour l'analyse de l'évolution moléculaire d'éléments répétés codants et la reconstitution de leur séquence ancestrale (Ogata et al., Science 2000, Science 2001: Claverie et Ogata, TIBS 2003).

Ces méthodes pourront ensuite être adaptées à l'analyse d'alignements multiples de kinases en conjonction avec la structure tridimensionnelle des protéines, dans le contexte du logiciel d'alignement multiple T-coffee, et de son optimisation.

Le candidat disposera de moyens de calculs importants (cluster de 96 cpu « Gigablaster », 2 serveurs ES45) et pourra également participer à l'analyse de nouvelles séquences de génomes bactériens pathogènes. Ses prédictions théoriques pourront également être validées (synthèse de gènes, expression des protéines, analyse structurale).

Titre du projet :
Méthodes bayésiennes en reconstruction phylogénétique: Application à l'origine des éléments palindromiques codants de type RPE (Rickettsia Palindromic Elements).

Contacts:

Tel: 04 91 16 45 48
Fax: 04 91 16 45 49

Jean-Michel.Claverie@igs.cnrs-mrs.fr

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21/05/2003

[AG]

Postdoctoral opportunities in Biological Classification and

Source:

BioInfo

Date de parution:

21/05/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Caroline du Nord (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

We seek two postdoctoral fellows to participate in a large, NSF and Mellon-funded ITR Project directed at development of a technology framework for data discovery, integration, and visualization for biodiversity research. The persons in these positions will be involved specifically in development of standards, methods, and tools for representing biological nomenclature and classification information.
Even though the rules of taxonomy are quite specific, taxonomic understanding is dynamic, leading to constant changes in the taxonomic entities, the names applied to those entities, and their phylogenetic relationships.
Consequently, taxonomic concepts and the application of names to those concepts vary through time and with the authority employed. Effective integration of data from diverse sources requires that the multiple and overlaping taxonomic concepts be tracked, as well as the multiple names that have been applied to them. We envision that the need for data integration will reshape the way organisms are reported in biodiversity
and ecological data and publications, and the way biological taxonomists and ecologists conduct, report, and disseminate their research.
Developing this link between ecology, systematics, and informatics is crucial to developing effective and useful ecological informatics tools.
The postdocs will work directly with researchers at NCEAS and the
University of North Carolina, and will be expected to locate at one of these institutions. Strong background in both biological systematics and computer and database skills is desirable. Send applications and at least two letters of recommendations by May 26 to Robert K. Peet, Dept. of Biology, CB#3280, University of North Carolina, Chapel Hill, NC
27599-3280, 919-962-6942, peet@unc.edu.

Contacts:

Robert K. Peet, Professor Phone: 919-962-6942
Department of Biology, CB#3280 Fax: 919-962-6930
University of North Carolina Cell: 919-368-4971
Chapel Hill, NC 27599-3280 USA Email: peet@unc.edu

http://www.bio.unc.edu/faculty/peet/

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24/04/2003

[AG]

chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique CIRAD

Source:

ABGf-2986

Date de parution:

18/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

ABGf-2986-CDD - Le Cirad recrute un chercheur en genetique moleculaire et bio-informatique - Montpellier

Date de debut de diffusion du poste : 18/04/2003
Date de fin de diffusion prevue : 07/05/2003

Au sein de l'equipe "Analyse du genome" du programme canne a sucre et de l'UMR " polymorphismes d'interet agronomique " et pour assurer le suivi de plusieurs developpements intervenus recemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
• la poursuite du travail sur les " Single Nucleotide Polymorphism " (SNP) comme outils de genotypage chez la canne a sucre
• l'exploitation des collections d'ESTs de canne a sucre produites a la FAPESP au Bresil et de mais et ble produites par le programme Genoplante pour le marquage de caracteres d'interet agronomique chez la canne a sucre
• l'appui a l'analyse bio-informatique de sequences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gene de resistance a la maladie de la rouille chez le cultivar de canne a sucre R570
• la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du desequilibre de liaison pour le marquage de genes d'interet agronomique chez la canne a sucre

Profil souhaite :
Doctorat en genetique avec maitrise des techniques moleculaires, ou en biologie moleculaire
Experience significative en genetique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de sequences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : Contrat a duree determinee
Date de prise de fonction : Immediate

Contacts:

Renseignements sur le poste :
Angelique D'HONT, ca-cas, Tel. 04-67-61-59-27

Pour postuler :

Bernadette VINCENT
CIRAD-CA
TA 70/09
Avenue Agropolis
B.P. 5035
34398 Montpellier Cedex 5
Tel : 04.67.61.55.38

Merci de preciser dans votre courrier de candidature et/ou lors de vos contacts, la source (l'Association Bernard Gregory) et la reference ABG de cette offre.

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24/04/2003

[AG]

computational biology/bioinformatics

Source:

BioJobs

Date de parution:

24/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Memphis (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

A postdoctoral position in computational biology/bioinformatics is available in Dr. Yan Cui’s lab at Univeristy of Tennessee Health Science Center (Memphis, TN). We are interested in DNA microarray data analysis, gene network inference and protein structure prediction (http://compbio.utmem.edu).

Ph.D. degree, researh experiences in bioinformatics or related fields, computer programming skills in C/C++ are required.

The successful candidate will be able to take advantage of high
performance computing facility including a new 48-processor Beowulf cluster.

[Please reference Bioinformatics.Org when replying to this
announcement.]

Contacts:

For immediate consideration send your CV to Dr. Yan Cui
(ycui2@utmem.edu)

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18/04/2003

[AG]

Chercheur en génétique moléculaire et bio-informatique

Source:

BioInfo

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Référence à rappeler : DRH ca-705
Date de publication : 07/04/2003
Date de clôture : 25/04/2003

Descriptif du poste :
Au sein de l'équipe «Analyse du génome» du programme canne à sucre et de l'UMR « Polymorphismes d'intérêt agronomique » et pour assurer le suivi de plusieurs développements intervenus récemment sur cette plante, le titulaire du poste prendra en charge
- la poursuite du travail sur les « Single Nucléotide Polymorphism »
(SNP) comme outils de génotypage chez la canne à sucre
- l'exploitation des collections dESTs de canne à sucre produites à la FAPESP au Brésil et de maïs et blé produites par le programme Génoplante pour le marquage de caractères dintérêt agronomique chez la canne à sucre
- l'appui à l'analyse bio-informatique de séquences de grands fragments d'ADN dans le cadre du clonage positionnel en cours du gène de résistance à la maladie de la rouille chez le cultivar de canne à sucre R570
- la mise en place d'outils d'analyse pour l'exploitation du
déséquilibre de liaison pour le marquage de gènes d'intérêt agronomique chez la canne à sucre

Profil souhaité :
Doctorat en génétique avec maîtrise des techniques moléculaires, ou en biologie moléculaire
Expérience significative en génétique quantitative et bio-informatique
Bonne connaissance des outils d'analyse de séquences

Lieu d'affectation : Montpellier
Type de contrat : CDD de remplacement (11 mois minimum)
Date de prise de fonction : immédiate

Contacts:

Renseignements : Angélique DHONT, ca-cas, Tél. 04-67-61-59-27

Candidatures à adresser à :
Bernadette VINCENT (bernadette.vincent@cirad.fr)
Adresse postale : TA 70 / 09 Ave Agropolis 34398 Montpellier

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17/04/2003

[AG]

INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Source:

BioInfo

Date de parution:

15/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le service Bionformatique de l'Institut Curie recrute :
UN INFORMATICIEN CHEF DE PROJET

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le
service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7
ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau (6 personnes) pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat sera chargé de la gestion de projets informatiques :
expression de besoins, cahier des charges, définition de l'architecture, développement ou sous-traitance, validation à chaque étape du processus, installation et maintenance. Il aura à participer aux développements et à coordonner trois ingénieurs dans ces missions.
Il aura également à organiser le fonctionnement de l'équipe pour garantir la qualité des développements et des flux d'information.

Compétences :
- Gestion de projets
- Maîtrise d'ouvrage
- Architectures client-serveur et multi-couches
- SGBD relationnels (modélisation et administration)
- conception UML
- Apache (administration)
- Environnement de développement Unix et Windows
- Développement sous C/C++, Java (Swing, AWT, JSP, RMI), Perl, PHP
- Connaissances métier en bioinformatique
- Anglais courant
5 ans d'expérience minimum
Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Merci d'envoyer vos CV, lettre de motivation et prétentions en précisant la référence BI4 à :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie - Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

Tél. : 01 42 34 65 27
Fax : 01 42 34 65 28

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14/04/2003

[AG]

Computer Biologist - Metabolic Disease Group

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

18/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Computer Biologist - Metabolic Disease Group (Ref: 560)

Closing Date: 18th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Metabolic Disease Group is a new group at The Wellcome Trust Sanger Institute; our aim is to apply genetic approaches to study type 2 diabetes and obesity. We are following a candidate gene approach and will be investigating the putative role of hundreds of genes via genetic association studies and functional analysis of mutations. We are seeking a Computer Biologist to provide support to the data handling activities of the group, this will involve close collaborative work with other groups at the Institute, in particular the Human Genetics Informatics group.

Informal enquires may be made to Inês Barroso (ib1@sanger.ac.uk)

The ideal candidate for will have at least two years post graduate experience of programming in a UNIX/LINUX environment, using one or more of the following: perl, C, java, javascript, plsql. A familiarity with RDBMS and a working knowledge of perl are essential. The role involves working closely with laboratory scientists and collaboration with other informatics groups, strong communication skills are required.

Contacts:

To apply for these positions please write with your CV and current salary details quoting the reference number to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA

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14/04/2003

[AG]

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation

Source:

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

11/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Senior Computer Biologist - Plasmodium genome analysis and curation
(Ref: 559)

Closing Date: 11th Apr 2003
Contact: humanresources@sanger.ac.uk
The Wellcome Trust Sanger Institute is one of the leading genomics centres in the world, dedicated to analysing and understanding genomes. Through large-scale analysis - and focused research and collaborations - the Sanger Institute's programmes underpin biological and medical research worldwide. The pathogen sequencing unit has established a curated genome database, geneDB, to house gene annotation and functional genomic data. A position is now available for a senior computer biologist within the pathogen sequencing unit responsible for analysis of Plasmodium genome data and maintaining the Plasmodium content of the geneDB database. As a senior computer biologist you will be expected to interact proactively with both malaria and informatics research communities to develop and optimise the content and accessibility of the data. You will also interact with in house computer programmers to maximise the quality and utility of the data to the community. You should have a PhD and preferably laboratory experience of Plasmodium. Knowledge of programming/scripting is desirable, although not essential, as training will be provided.

Contacts:

To apply, please write with your CV and current salary details quoting reference 559 to: Human Resources, Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridge, CB10 1SA. The closing date for applications is 11th April 2003

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14/04/2003

[AG]

Sanger Institute Postdoctoral Fellowships

Source:

http://www.sanger.ac.uk/careers/postdoc/

Date de parution:

14/04/2003

Date limite de réponse:

30/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of experimental and computational genome research. We are recognized leaders in genome sequencing, high throughput systems, informatics and analysis of gene function using genetic approaches in a variety of model organisms and humans.

Applications are invited for Postdoctoral Research Fellowships within the Sanger Faculty. This is an exciting opportunity to begin an independent research career in state of the art genomics facilities. Successful candidates will be awarded a fellowship with a starting salary of circa £25,000 p.a. plus excellent benefits. This post is initially offered for two years after which it is expected that the candidate will seek independent support. We are particularly interested in hearing from candidates who have completed their Ph.D within the last year.

Applications
To apply please complete the on-line application form here and attach Degrees, (including grades, GPA or equivalent, dates)
a one page description summarising your research accomplishments to date a list of your publications a two page synopsis of the proposed research programme

NB
You are also expected to arrange for three letters of reference to be sent under separate cover to arrive with the Postdoctoral Committee by the closing date. These can be sent by email to pdc@sanger.ac.uk

If you are interested you must contact current Sanger Institute Faculty members to discuss potential projects in the first instance. A full list of Faculty members is shown here, which includes their contact information and research interests.

The closing date for applications is 30th April 2003. Applications received after this date, or those which do not conform to the above criteria will not be accepted.

Questions regarding this process can be e-mailed to pdc@sanger.ac.uk or by contacting Human Resources on tel:+44 (0)1223 834244.

Postdoctoral Committee
Human Resources
The Wellcome Trust Sanger Institute
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SA
ENGLAND

Email: pdc@sanger.ac.uk
FAX: +44 (0) 1223 494919

Eligibility
Candidates for this programme will be encouraged from all nations. Candidates will have recently (within one year) completed their PhD or are close to completion (e.g. at thesis submission stage). In the latter case, award of a Sanger Postdoctoral Fellowship will be subject to successful completion of the PhD. Alternatively, candidates may chose to apply at a later time. Applications of more experienced candidates (five plus years after completion of PhD), who are considering a career change, may be considered on a case by case basis. Sanger internal applicants are eligible only if not already employed on a postdoctoral contract. Applications for 'tail end funding' will be considered on a case by case basis for all Sanger postdocs.

Ideally, candidates should have several first author publications from their PhD work. Applications will be considered four times per year.

Deadlines
The application deadline for the next committee meeting is: 30th April 2003.

Preliminary application deadlines for 2003 are:
January 31st Concluded
April 30th Now open for applications
July 31st
October 31st

Contacts:

For any further inquiries, please feel free to contact the Sanger Institute's Postdoctoral Committee at the above address.

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08/04/2003

[AG]

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)

Source:

http://www.iarc.fr/pageroot/VACANCY/RC03_1_P2_GCS.html

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Scientist Genetic Cancer Susceptibility (GCS)
Vacancy notice No. IARC/03/FT156

Grade: P.2
Contract Type: Fixed-term appointment
Duration: Time-limited duration of four years

Objectives of the programme:
The overall objective of the Unit of Genetic Cancer Susceptibility is the identification and evaluation of inherited genetic factors in the etiology of cancer and the interaction between environmental factors and susceptibility genes.

The successful candidate will:
- To take a lead role in programming both a genotyping & gene-resequencing database and a laboratory information management system (LIMS) that will manage interaction between laboratory robotics, sequencing and genotyping instrumentation, and the database ;
- To make sure that database and LIMS programming with the GCS Unit is compatible with systems and programs provided by the Biostatistics and Bioinformatics Unit, and collaborate in support with the Computer Services Group ;
- To collaborate with other IARC Research Units and Groups and with outside scientists in the implementation of molecular epidemiological studies and their execution ;
- To keep abreast with methodological developments in the field;
- To be expected to attend several scientific meetings each year.

Qualifications Required:
Education and Skills:
M.S. in Computer Science with documented background in Molecular Biology, or M.S. in Molecular Biology, or Biochemistry, or Biotechnology, or in a related field, with documented background in database programming experience. Ph.D. in any of the fields cited above would be an asset.

Advanced knowledge of database programming and/or laboratory robotics programming. Ability to work in a teamwork environment. Would be an asset: knowledge of Java or Microsoft.NET software platforms, and ability to draft reports and grant proposals.

Experience:
At least two years of relevant professional experience at the national level or one year at the international level. Experience in programming web browser database interfaces would be an asset..

Languages:
Good knowledge of English with a working knowledge of French.

Annual salary
(net of tax):
US$ 40191 at a single rate - US$ 42849 with primary dependents.

Post Adjustment: 27.30 % of the above figures. This percentage is to be considered as indicative since variations may occur each month either upwards or downwards due to currency exchange rate fluctations or inflation.

Applicants should complete a Personal History Form and include a photograph. Internal candidates should use Form WHO.824.

Contacts:

APPLICATIONS SHOULD BE SENT TO:

Personnel Office
IARC
150, Cours Albert Thomas
FR-69372 Lyon CEDEX 08
Fax: +33(0)4 72 73 83 35
Email: personnel@iarc.fr

NB: This Email address should ONLY be used for vacancy applications. Due to the large number of messages, any other type of correspondance may not be answered.

Applications from women are encouraged.
Any appointment/extension is subject to WHO Staff regulations, Staff Rules and Manual. Staff are subject to assignment to any office of the WHO in the world and mobility is encouraged.

Qualifications indicated in this vacancy are the minimum requirements. Candidates who are less qualified will not be considered.

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08/04/2003

[AG]

Postdoctoral job opening in Computational Biology

Source:

Date de parution:

08/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

The Department of Biology at Boston College has available a postdoctoral position for work in the CLOTE LAB in computational biology/bioinformatics with start date June 1, 2003.

Requirements include a recent Ph.D. in computational biology/bioinformatics or strongly computational field such as computer science, mathematics, statistics, physics, chemistry. Strong programming skills are necessary, preferably in C/C++ and Python, as well as ability in mathematical modeling, probability and statistics. Current research projects in the Clote Lab include modeling of RNA and protein, functional genomics, applications of machine learning theory to bioinformatics, and mathematical evolution theory.

Boston College provides a supportive, collegial environment with good Ph.D. program in biology, close proximity for possible research collaborations with other universities in the Boston area, and a very pleasant campus ambience.

Contacts:

For more information, please contact:
Peter G. Clote, Ph.D., Doctorat d'Etat
Professor of Biology and Computer Science (courtesy appt)
Boston College
Chestnut Hill, MA 02467
Email: clote@bc.edu
http://www.cs.bc.edu/~clote
http://www.bc.edu/biology
Tel: 617 552 1332
Fax: 617 552 2011

To apply please send either a hardcopy or email application.
Application materials should include a CV,names and addresses of three references. For hardcopy applications please send reprints or preprints of articles. For email applications, please email pointers to on-line articles (please do NOT email the articles).

Applications will be evaluated from now on until the position is filled.

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07/04/2003

[AG]

Annotateur(trice) Levure - Swiss-Prot

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Le groupe Swiss-Prot (http://www.expasy.org/sprot) de l'Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) (http://www.isb-sib.ch/) cherche un(e) annotateur(trice). Le travail consiste à entrer des informations sur les protéines et/ou familles de protéines de levures (S. cerevisiae, S. pombe, etc..) dans la base de données Swiss-Prot .

Le projet a pour but une annotation de qualité des protéomes de levures. Dans ce contexte, le travail consistera essentiellement en l’annotation manuelle des protéines. Les informations fournies par la base de données concernent la fonction, la localisation subcellulaire, les modifications posttraductionnelles, la description des isoformes, etc. Elles proviennent essentiellement de données expérimentales décrites dans la littérature scientifique et, dans une moindre mesure, de résultats obtenus grâce à des programmes de prédiction, interprétés de façon critique.

Nous offrons ce poste au sein d’une équipe dynamique, motivée et soudée et nous cherchons une personne qui s’intégrerait avec plaisir dans ce cadre. D’autre part, ce travail implique une collaboration étroite avec l’Institut Européen de Bioinformatique (EBI) (http://www.ebi.ac.uk/), Hinxton, UK, et nécessitera des déplacements réguliers à l’étranger.

Conditions indispensables :
Biologiste ou biochimiste, expert en biologie des levures. Bonne connaissance de l’anglais. Travail à temps complet. Nationalité : suisse ou permis C. Bonne motivation pour travail en équipe. Motivation claire pour Swiss-Prot.

Contacts:

Veuillez envoyer votre CV et une lettre de motivation jusqu’au 30 avril 2003, à : Claudia Sapsezian Levure Institut suisse de bioinformatique CMU 1, rue Michel-Servet 1211 Genève 4 Claudia.Sapsezian@isb-sib.ch

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07/04/2003

[AG]

RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

24/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/37
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

RESEARCH ASSOCIATE IN MOLECULAR PHYLOGENETICS

Grade: 5 or 6, depending on age, experience and qualifications

Duty Station: Hinxton, UK

Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: A research associate position is available in Dr Nick Goldman's research at the EMBL-European Bioinformatics Institute (EBI). The group undertakes research into the evolutionary analysis of DNA and protein sequences. The core research in the group is into computational data analysis methods, and in particular the probabilistic modelling of molecular evolutionary processes and statistical inference based on these models. We also have interests in applications of existing and novel sequence analyses, and benefit from close association with other research and database groups at the EBI (see http://www.ebi.ac.uk/Groups and http://www.ebi.ac.uk/Databases)

The research associate would work with Nick Goldman and other members of the group on issues relating to evolutionary sequence analysis. It is expected that these would include phylogenetic methodology, and may also include specific biological applications. The position permits great freedom for the successful applicant to become involved in research projects already underway in the group (for example, detection of adaptive evolution, analysis of patterns of DNA mutations in both genomic and protein-coding sequences, analysis of patterns of amino acid replacements over evolutionary timescales, relationship of protein structure and evolution, comparative analysis of genome-scale sequences) and to develop her/his own interests and research proposal; the successful candidate will be encouraged to do both of these things.

Qualifications and Experience: It is expected that the successful
applicant will have a Ph.D., and ideally some further research experience, in a related field. Exceptional post-graduate candidates with research experience may also be considered. Necessary qualifications include understanding of and enthusiasm for the questions molecular biologists need to ask of sequence data, experience of mathematical modelling and statistical data analysis, and scientific computer programming. Candidates with backgrounds in biology, mathematics/ statistics or scientific computer programming will be considered.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 24.04.2003

Note: There is also the possibility of one or more post-doctoral fellowships being awarded to permit researchers with established molecular phylogenetics projects to work with Nick Goldman's group for periods of approx. 2-6 months.

Contacts:

Anyone interested in this possibility is encouraged to contact Nick Goldman directly.

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07/04/2003

[AG]

SOFTWARE ENGINEER FOR PROTEOMICS DATABASE

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/35
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

SOFTWARE ENGINEER FOR PROTEOMICS DATABASE

Grade: 6 or 7, depending on age, experience and qualifications
Duty Station: Hinxton, near Cambridge, UK
Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: Proteomics is currently a key focus of biomolecular
research, many large-scale experiments are being planned or conducted. The EBI, building on its role as a key protein sequence data provider, is participating in several proteomics research and international standardisation efforts. For further information on this, please refer to the following web pages: http://psidev.sf.net and http://www.ebi.ac.uk/swissprot.

We are seeking a new staff member to design and implement new proteomics data resources in close collaboration with the Swiss-Prot group and international collaborators.

Qualifications and Experience: Candidates will have a PhD or MSc with a strong background in both computer science and molecular biology, ideally complemented by at least two years of practical experience. Experience in database design or proteomics will be a strong advantage.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 21.04.2003

EMBL WWW pages: http://www.embl-heidelberg.de/ and
http://www.ebi.ac.uk/
EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation. Please note that EMBL does not return CVs or attached documents to applicants.

Contacts:

Please send a CV and covering letter, including names and addresses of referees, quoting ref. no. 03/35, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, D-69012 Heidelberg, Germany
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003

[AG]

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

21/04/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

EMBL/V/03/34
March 2003

Member States of EMBL (Austria, Belgium, Denmark, Finland, France, Germany, Greece, Israel, Italy, the Netherlands, Norway, Portugal, Spain, Sweden, Switzerland and the United Kingdom) are advised that applications are being sought for the following position at the Laboratory's Outstation, The European Bioinformatics Institute (EBI), in Hinxton, nr Cambridge, UK:

SOFTWARE ENGINEER FOR THE BIOCHEMICAL COMPOUND DATABASE

Grade: 6 or 7, depending on age, experience and qualifications
Duty Station: Hinxton, near Cambridge, UK
Commencing Date: As soon as possible after closing date

Job Description: We are looking for a software developer or
bioinformatician to join a new Biochemical Compound Database project at the EBI. The EBI is home to the world class bioinformatics resources, such as the EMBL-Bank, SWISS-PROT + TrEMBL, InterPro, Macromolecular Structure Database (MSD), Gene Ontology (GO), IntEnz database of Enzyme Nomenclature and IUPHAR Receptor Database.

The successful applicant will contribute to our efforts in developing a database of biochemical compounds, focussed on the metabolites and ligands in living cells. The goal is to create a definitive open resource of biochemical terminology and structure for consistent use by other EBI services and groups. The post-holder will take responsibility for the design and development of database and web applications. She/he is also expected to make a scientific contribution to the future expansion of activities in this area.

Qualifications and Experience: Applicants should hold a masters (or higher) degree in Bioinformatics or Computer Science, plus some post-graduate or employment experience in chemoinformatics or bioinformatics. The candidate should be proficient in object-oriented programming languages (preferably Java). Experience with relational database management systems and/or commercial chemical databases would be an advantage.

Contract: An initial contract of 3 years will be offered to the
successful candidate. This can be renewed, depending on circumstances at the time of review.

Closing Date: 21.04.2003

EMBL WWW pages: http://www.embl-heidelberg.de/ and
http://www.ebi.ac.uk/
EMBL is an inclusive, equal opportunity employer offering attractive conditions and benefits appropriate to an international research organisation. Please note that EMBL does not return CVs or attached documents to applicants.

Contacts:

Please send a CV and covering letter, including names and addresses of referees, quoting ref. no. 03/34, to: The Personnel Section, EMBL, Postfach 10.2209, D-69012 Heidelberg, Germany
Fax: +49 6221 387555 email: jobs@EMBL-Heidelberg.de

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07/04/2003

[AG]

Poste d'enseignant-chercheur à l'Ecole des Mines de Paris

Source:

Date de parution:

07/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Ce poste, localisé au Centre de Géostatistique à Fontainebleau, comporte une activité principale d'enseignement couplée à une activité de recherche.

Enseignement
L'activité d'enseignement recouvre la responsabilité de l'option "biotechnologie" (organisation des activités pédagogiques liées à
l'option) set de l'enseignement spécialisé "Introduction aux
biotechnologies" dans le cursus des ingénieurs civils de l'Ecole des
Mines, ainsi qu'une charge d'enseignements fondamentaux et appliqués dans ces deux cursus.

Un complément d'information sur l'Option Biotechnologie est disponible à l'adresse suivante : http://www.ensmp.fr/Fr/Formation/2emeCycle/IngCivil/Options/Option-Biotechnologie.html

Recherche
Les activités de recherche se dérouleront au sein du groupe
"Bioinformatique", créé au Centre de Géostatistique à l'automne 2002. Il
participera aux projets de recherche inscrits dans la thématique de
l'équipe concernant l'intégration, la modélisation et l'exploitation de
données hétérogènes en post-génomique (séquences et structures
biologiques, données d'expression, réseaux d'interaction et de
régulation...) avec des applications en génomique fonctionnelle et
structurelle, biologie des systèmes, analyse de voies métabolique et
recherche pharmaceutique. Il sera également invité à proposer de
nouveaux thèmes de recherche sujets à collaboration au sein de l'équipe
et avec des partenaires extérieurs.

De plus amples informations pourront être trouvées sur le serveur du
groupe de bio-informatique : http://cg.ensmp.fr/Bioinfo

Au cours de ses activités de recherche et d'enseignement, le candidat
développera des relations de partenariat étroit avec des industriels et recherchera des financements externes institutionnels et privés.

Profil du candidat
Titulaire d'un doctorat, le candidat devra avoir une bonne connaissance
des domaines de la biophysique, de la biologie moléculaire ou de la
bioinformatique et être fortement sensibilisé aux applications, enjeux
et acteurs des biotechnologies. Un séjour post-doctoral à l’étranger
sera un plus. Une insertion dans les réseaux scientifiques
internationaux et une connaissance du milieu industriel seront
particulièrement appréciées.

Le dossier de candidature comprend :
- Un Curriculum Vitae détaillé ainsi qu’une liste de publications
- Une ou plusieurs lettres de recommandation
- Un projet de recherche

Les dossiers devront parvenir avant le 15 mai 2003 à Mr. Michel Schmitt
Ecole des Mines de Paris
60, Bd Saint Michel
75272 PARIS-Cedex 06

Une description plus précise et une version papier de ce poste est disponible à l'adresse suivante: http://cg.ensmp.fr/Bioinfo/news/poste_biotech.html

Contacts:

Pour tout renseignement concernant le profil de l'emploi, vous pouvez contacter :
- Michel Schmitt, Directeur de la Recherche, (michel.schmitt@ensmp.fr
; Tél : +33 1 40 51 92 45 )
- Nicolas Cheimanoff , Directeur des Etudes (nicolas.cheimanoff@ensmp.fr)
; Tél : +33 1 40 51 91 33)
- Jean-Philippe Vert, Responsable de la Bioinformatique au Centre de Géostatistique (jean-philippe.vert@ensmp.fr

; Tél : +33 1 64 69 47 82)

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06/04/2003

[AG]

BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le groupe Bionformatique de l'Institut Curie recrute :

UN BIOINFORMATICIEN/BIOSTATISTICIEN

Contexte :
L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche contre le cancer. Il est constitué d'une section médicale (hôpital de 200 lits) et d'une section recherche (800 personnes environ). Le service Bioinformatique a été créé en Décembre 2002 et s'implique fortement dans l'analyse des données génomiques de tumeurs de différents cancers. Il est composée actuellement de 7 ingénieurs et chercheurs, et bénéficie de l'appui de l'équipe système/réseau pour les infrastructures. Ces 7 personnes travaillent en concertation étroite avec les biologistes, les médecins et les biostatisticiens de l'Institut.

Missions :
Le candidat travaillera à l'analyse des données génomiques (séquences, puces, réseaux génétiques) issues des différentes plate-formes technologiques de l'Institut et de ses partenaires. Son implication couvrira le développement des aspects méthodologiques, leur implémentation informatique et les analyses proprement dites.

Compétences :
- Bonne connaissance des concepts et outils de la bioinformatique (analyse de séquences, analyses des données de puces)
- Modélisation et analyse de données
- Maîtrise des packages mathématiques et statistiques classiques (R/S+, Mathlab, Spotfire …)
- Maîtrise d'un langage de programmation (C/C++, Java, Perl …)
- Expérience des environnements Unix et Windows
- Anglais courant

Formation souhaitée : Ingénieur Grande Ecole ou 3ème cycle

Salaire selon profil et expérience

Contacts:

Personne à contacter, en précisant la référence BI2 :
Mme Anna Biedak-Cohen
Institut Curie Section Recherche
Bioinformatique
26 rue d'Ulm
75005 PARIS
Anna.Biedak-Cohen@curie.fr

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06/04/2003

[AG]

Poste de professeur en génétique & bio-informatique

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

21/03/2003

Lieu:

Toulouse (31) (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Poste de professeur en génétique & bio-informatique à l'Université de Toulouse
Section 65, Emploi nº 1312, analyse des génomes.
Date limite de dépôt des candidatures : 21 mars 2003

Profil Recherche :
Le LMGM souhaiterait accueillir un Professeur de Génétique pour créer une équipe s’intéressant à une thématique à l’interface de la Génétique et de la Bio-informatique centrée sur l’Analyse des Génomes et la Génomique Evolutive des Procaryotes. Cette thématique s’intégrerait parfaitement au sein de l’UMR 5100, la nouvelle équipe venant en complément de six (des neuf) équipes du LMGM qui développent leurs projets dans le cadre de deux (des trois) thématiques majeures de l’Unité, ‘‘Organisation et Dynamique du Génome’’ et ‘‘Plasticité Génétique’’.

Profil Enseignement :
La révolution de la Génomique élargit le champ d'investigation en Génétique. Il est impératif que notre université recrute un collègue capable de manier et enseigner les concepts et les méthodes de cette discipline d'avenir qu’est la Génomique. Le remplacement de Jean-Michel Louarn offre l'occasion d'ouvrir ce nouveau champ, par le recrutement d'un collègue travaillant à l'interface de la génétique et de la bio-informatique dans l’Analyse des Génomes et dans la Génomique Evolutive. Ce collègue devrait pour partie renforcer les enseignements déjà assumés par la commission pédagogique de Génétique. Il lui sera bien entendu également demandé de développer l'aspect Génomique Evolutive en s’appuyant sur les données de séquence génomique complète de très nombreux organismes procaryotes (plus de 80 répertoriés à ce jour) appartenant à des branches évolutives différentes.

Contacts:

Les candidats intéressés sont priés de contacter le Directeur du LMGM :

Jean-Pierre Claverys
UMR5100 CNRS-Université Paul Sabatier
Laboratoire de Microbiologie et de Génétique Moléculaires
118 route de Narbonne
31062 Toulouse Cedex
France
tel. 05 61 33 58 55 (from outside France: 33 561 33 58 55)
05 61 33 59 11 (from outside France: 33 561 33 59 11)
fax 05 61 33 58 86 (from outside France: 33 561 33 58 86)
05 61 33 58 61 (from outside France: 33 561 33 58 61)
claverys@ibcg.biotoul.fr (e-mail)
http://www-ibcg.biotoul.fr/recherche.html

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06/04/2003

[AG]

professeur/chercheur Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le Departement de Biologie de l ENS-Paris cherche a recruter un professeur animant recherche et enseignement sur le theme: Reseaux genetiques, proteiques et metaboliques. Celui ci devra mener ses recherches au sein du Departement de Biologie en interaction avec les groupes des Departements de Physique et Informatique.

Contacts:

Contacts: A Prochiantz Directeur du Departement de Biologie, prochian@biologie.ens.fr, A Feltz, pour la CS de Biologie 27-28, feltz@biologie.ens.fr

Claude Jacq
Laboratoire de Genetique Moleculaire
CNRS UMR 8541
Ecole Normale Superieure
46 rue d Ulm
75230 PARIS Cedex 05

Tel: 33 1 44 32 35 46 (office)
33 1 44 32 35 70 (secretariat)
mobile: 33 (0)6 61 76 28 98
Fax: 33 (0)1 44 32 37 30 http://www.biologie.ens.fr/microarrays.html

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06/04/2003

[AG]

23 postes chargés de recherche INRIA

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

L'INRIA ouvre au concours 23 postes de Charges de Recherche 2eme classe, repartis comme suit sur les differentes unites de recherche :

- 5 postes à l'INRIA Futurs,
- 4 postes à l'INRIA Lorraine,
- 3 postes à l'INRIA Rennes,
- 3 postes à l'INRIA Rhône-Alpes,
- 4 postes à l'INRIA Rocquencourt,
- 4 postes à l'INRIA Sophia Antipolis,

Les postes ne sont pas fleches par projets, et etant donne qu'un certain nombre des equipes INRIA sont axes sur la bioinformatique, n'hesitez pas a consulter la page

http://www.inria.fr/travailler/opportunites/chercheurs/concourscr2.fr.html pour plus d'informations.

Attention, date limite de depot des dossiers : 18 mars 2003

Contacts:

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06/04/2003

[AG]

professeur de bioinformatique

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lille (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la création de l’Institut de Recherches Interdisciplinaires à Lille (http://www.dr18.cnrs.fr/iri/index.htm), l’Université de Lille 1 cherche à recruter un professeur de bioinformatique dont les travaux de recherche concernent l’analyse des séquences régulatrices, le développement de banques de données pour l’étude des réseaux de régulation transcriptionnelle. Des moyens seront alloués pour permettre au candidat retenu de développer une équipe de recherche en collaboration avec les équipes de mathématiciens, de bioinformaticiens et de biologistes de la Génopole de Lille. Chargé de mission pour la création de l’IRI : Bernard Vandenbunder (Bernard.Vandenbunder@ibl.fr)
CNRS UMR 8117 / Institut Pasteur de Lille / Université de Lille 1 Institut de Biologie de Lille 1 rue Calmette BP 447 59021 Lille Cedex (France) Tel : (33) 3 20 87 10 90 Fax : (33) 3 20 87 11 11

Contacts:

Nom de la personne à contacter pour l’enseignement : Hélène Touzet
(touzet@lifl.fr)
Nom de la personne à contacter pour la recherche : Jean Marc Geib
(geib@lifl.fr)
Le profil complet du poste se trouve à l’adresse suivante : http://www.univ-lille1.fr/personnels/recrutement/informations.htm

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06/04/2003

[AG]

POSTE D'INGENIEUR EN INFORMATIQUE/STATISTIQUE INSREM

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Au sein d'une équipe de recherche en génétique statistique (INSERM-Université d'Evry), située sur le campus de génomique d'Evry, le(la) candidat(e) participera à un programme de recherche visant à mettre en évidence des facteurs génétiques et environnementaux impliqués dans des maladies humaines (asthme, mélanome malin) par des analyses statistiques de données familiales (analyses classiques et analyses propres à la génétique)

Missions:
- contribuer à la gestion de données à l'aide de procédures/programmes informatiques
- effectuer des analyses statistiques de données (univariées et multivariée) à l'aide de logiciels statistiques
- contribuer au développement de procédures et programmes
informatiques pour faciliter la manipulation et l'analyse des données.

- contribuer aux analyses génétiques des données à l'aide de logiciels propres à la génétique

Compétences
- Niveau Maîtrise ou DEA/DESS en biostatistique/informatique/épidémiologie
- Maîtrise des environnements informatiques Windows et UNIX (procédures shell)
- Connaissances des logiciels classiques de statistique (SAS, STATA)
- Connaissances en programmation informatique (Fortran, Pascal, C, shell, perl)
- Connaissances de logiciels utilisés en épidémiologie génétique ou volonté de les acquérir.

Aptitudes: Rigueur dans le travail, fiabilité, communication, capacité d'autonomie, disponibilité

Salaire:
- Niveau Ingénieur d'Etude INSERM/Université (à partir de 1 800 Euros brut par mois) à déterminer en fonction de la qualification et des compétences du candidat
- Contrat à Durée Déterminée (un an et renouvelable)

Contacts:

Florence DEMENAIS
INSERM EMI 0006
Tour Evry 2
523 Place des Terrasses de l'Agora
91034 EVRY
Tél : 01 60 87 38 26
Fax : 01 60 87 38 48
Mél : demenais@evry.inserm.fr

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06/04/2003

[AG]

BioInfomaticien projet MEDIANTE

Source:

Date de parution:

05/03/2003

Date limite de réponse:

28/03/2003

Lieu:

Sophia-Antipolis (06) (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Position ouverte sur la plate-forme transcriptome de Sophia Antipolis

La plate-forme transcriptome CNRS/INRA de Nice/Sophia Antipolis (rattachée à Marseille-Génopole), en association avec le projet ACACIA de l'INRIA Sophia Antipolis, recrute un (bio-)informaticien pour participer au projet « MEDIANTE ». Ce projet, fruit d'une collaboration entre biologistes et informaticiens de Sophia Antipolis, vise au développement d'outils informatiques dédiés à la conception, à la validation et à l'annotation «intelligente» des sondes utilisées lors de la fabrication et/ou de l'utilisation de puces à ADN. La phase I du projet produira une aide à la sélection de gènes pour leur mise en production sur une biopuce, à partir d'une base de sondes calculées ou disponibles dans les différents laboratoires adhérents au projet. Orienté sur des collections de sondes (EST, fragments de PCR ou oligos longs) déjà disponibles sur le site, le projet vise à simplifier les échanges doutils partagés entre plusieurs plates-formes, à permettre la diffusion des informations de séquences déjà utilisées lors des expériences de transcriptome, et la comparaison de résultats obtenus entre plates-formes différentes (lames de verre, SAGE, Affymetrix, ). La collection des sondes produites sera adaptée en fonction des demandes de consultation exprimées par la communauté des chercheurs visitant le site. Le rôle du candidat dans cette partie du projet sera de poursuivre la mise en place de la base de données dans laquelle sont stockées toutes les sondes disponibles des différents projets, ainsi que l'interface permettant à un client distant de sélectionner les sondes les mieux adaptées à ses besoins. Ces sondes pourront être sélectionnées par mots-clés, références ou séquences. La phase II du projet produira un outil de publication de résultats dexpérimentations sur des biopuces, établissant des liens entre les données générées dans les différentes plates-formes avec le corpus de connaissances en biologie (disponible sous la forme darticles scientifiques répertoriés -cf par exemple :
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/). Cette phase comprendra le développement d'une architecture logicielle permettant de conserver la trace de toutes les manipulations impliquant les biopuces d'ADN, et le développement d'une méthode permettant la capitalisation et la valorisation des connaissances générées au cours des expériences. La modélisation et la matérialisation de «Mémoire d'Expériences sur l'Analyse du Transcriptome» (MEAT) reposera principalement sur les technologies de lingénierie des connaissances et du Web sémantique. Le rôle du candidat dans cette partie du projet sera d'appliquer sur les données des laboratoires adhérents au projet les résultats de ces
travaux. Nous recherchons pour cet emploi un (bio-)informaticien ayant de bonnes connaissances en bases de données et web ainsi qu'une forte motivation à travailler sur des applications génomiques. Une capacité à travailler en équipe et à communiquer avec des scientifiques de disciplines différentes est indispensable. Le poste est à pourvoir immédiatement (en comptant une période de mise en place administrative d'environ 1 mois).

Lieu : Le candidat sera accueilli par l'IPMC de Sophia-Antipolis (CNRS UMR6097), tout en travaillant en collaboration étroite avec le projet ACACIA (INRIA, Sophia Antipolis).

Durée : 12 mois.

Rémunérations : le salaire NET mensuel s'échelonne de 2120 euros pour un débutant à 2350 euros pour une personne bénéficiant de plus de 4
ans d'expérience. Le niveau de rémunération à retenir sera apprécié
par le Bureau du Personnel de lINRIA.

Niveau de diplôme requis : bac+5 (DEA, DESS ou diplôme d'ingénieur en informatique ou double compétence -bio + info-).

Contacts:

Les candidats intéressés sont invités à envoyer un CV, les coordonnées de deux personnes pouvant les recommander, et une lettre de motivation AVANT LE 28 MARS 2003 à :

Pascal Barbry (barbry@ipmc.cnrs.fr),
Rose Dieng-Kuntz (dieng@sophia.inria.fr).
Vous trouverez des informations complémentaires sur les sites suivants : http://medlab.ipmc.cnrs.fr/MedLab.pdf
http://www-sop.inria.fr/acacia/meat/meat.pdf

Pascal Barbry
CNRS UMR 6097
Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire
660, route des Lucioles
F-06560 Sophia Antipolis
France
tel: 33 (0)4 93 95 77 93 (office)
tel: 33 (0)4 93 95 77 42 (secretariat)
tel: 33 (0)4 93 95 77 90 (lab)
Fax: 33 (0)4 93 95 77 08
E-Mail: barbry@ipmc.cnrs.fr

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06/04/2003

[AG]

bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

L'UMR CNRS UHP 7567 et l'UMR 7503 CNRS INRIA-UHP-INPL recherchent un candidat de qualité pour une bourse post-doctorale avec cofinancement Région/CNRS.

Thème proposé : Recherche des gènes d'ARN non codant dans les génomes séquencés, par approches informatiques avec vérifications expérimentale des hypothèses formulées sur la base du traitement informatique des séquences.

Un nombre de plus en plus élevé de séquences complètes de génomes est connu. Il est relativement facile d'exploiter ces données de séquence au niveau recherche des gènes de protéines (traduction des séquences sur les 3 phases possibles de lecture). Par contre, la recherche de l'ensemble des gènes d'ARN non codant est plus difficile à aborder. Elle nécessite la combinaison d'outils informatiques puissants et de tests expérimentaux. Or, les travaux des dernières années démontrent l'importance d'un très grand nombre de petits ARN non codant dans des processus cellulaires aussi divers que la transcription, la maturation des ARN, la traduction, le transport et la stabilité des ARNm.

L'UMR 7567 CNRS-UHP Nancy 1, Laboratoire de Maturation des ARN et Enzymologie Moléculaire, spécialiste du domaine des ARN collabore avec le LORIA (Laboratoire Lorrain de Recherche en Informatique et ses Applications - UMR 7503, CNRS INRIA, UHP, Nancy 2, INPL) pour développer et appliquer des outils informatiques permettant la recherche de gènes candidats d'ARN non codant, la vérification expérimentale des hypothèses étant réalisées au MAEM.

Contacts:

Réponse nécessaire avant le 10 avril 2003 à adresser à Mme Christiane Branlant, Directeur de l'UMR 7567 : Christiane.Branlant@maem.uhp-nancy.fr

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06/04/2003

[AG]

Postdoc modélisation des réseaux de gènes

Source:

BioInfo

Date de parution:

13/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Dans le cadre de la campagne de recutement de post-doc par
l'INRA (http://www.inra.fr/drh), notre UMR propose, en collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes (équipe Helix) un sujet sur la modélisation des réseaux de gènes.

Nous développons une puce à ADN dédiée la bactérie Buchnera,
symbiote du puceron. Le but du travail sera de réaliser une première application consistant à étudier des réseaux de régulation identifiés chez Buchnera. L'accent sera particulère mis sur le métabolisme des acides aminés pour lequel l'UMR BF2I possède une expertise aux plans biochimiques et physiologiques. Plus généralement, ce travail permettra de compléter la panoplie d'outils bioinformatiques proposés dans la plate-forme Génostar en permettant notamment l'analyse des transcriptomes bactériens.

Les personnes intéressés, jeunes docteurs bioinformaticiens -informaticiens ayant acquis une expérience dans la modélisation des réseaux sont priés de me contacter rapidement.

Contacts:

Jean Michel FAYARD: jmfayard@insa.insa-lyon.fr

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06/04/2003

[AG]

Stage post-doctoral en bio-informatique/bio-statistique

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Date de publication de l'offre : mars 2003
Entreprise : Atragene
Lieu : Pépinière CCIE/Genopole
4, rue Pierre Fontaine
91000 Evry

Description de l'activité de l'entreprise : Créée en 2001 et implantée sur le bioparc de Genopole® à Evry (91), Atragene® BioInformatics est une jeune société en pleine expansion (www.atragene.com). Accompagnant les évolutions rapides de la génomique et de la post-génomique, nous éditons des logiciels innovants adaptés aux nouveaux besoins des laboratoires de recherche publics et privés des Sciences du Vivant. Développés suivant un concept de modularité au sein de notre département bio-informatique, nos produits sont compatibles avec les principaux outils bio-informatiques de référence tout en offrant de nouvelles fonctionnalités. Par ailleurs, notre département Atragene® BioIntegrations conçoit sur mesure des plateformes bio-informatiques intégrées.

Description du poste :
Dans le cadre du 5ème appel d’offres d’allocations de recherche Genopole®, nous proposons actuellement un stage post-doctoral d’une durée de 12 mois au sein de notre département de bio-informatique. Le candidat participera, sous la direction du directeur de département, au développement et à l’optimisation d’algorithmes propriétaires dans le domaine de la recherche de motifs communs dans des séquences nucléiques non alignées. Le candidat aura un doctorat en bio-informatique ou en bio-statistique complété par un stage post-doctoral à l’étranger. Il aura une forte expérience dans le domaine de l’analyse de séquences. La maîtrise des algorithmes communément utilisés pour la recherche de motifs serait un plus. Le candidat montrera de solides compétences dans le domaine de la génomique, ainsi qu’en programmation (C). Des notions en programmation projet seraient appréciées (C++, JavaTM). Evoluant dans l’environnement dynamique des start-up de biotechnologies et répondant aux besoins d’un marché européen en émergence, le candidat devra présenter de bonnes capacités d’adaptation, d’innovation et de communication. Une grande aptitude au travail en équipe en milieu multidisciplinaire sera indispensable. Compte tenu des perspectives de développement de notre société, ce poste est évolutif.

Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003

Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable une fois

Contacts:

Contact : Guillaume Burtin - guillaume.burtin@atragene.com - +33 (0) 1 60 87 89 14

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06/04/2003

[AG]

Stage post-doctoral en génomique végétale

Source:

Date de parution:

06/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Date de publication de l'offre : février 2003
Entreprise : Unité de Recherche en Génomique Végétale, INRA-CNRS

Lieu : 2 rue Gaston Crémieux
CP 5708
91057 Evry

Description de l'activité de l'entreprise : L'Unité de Recherche en Génomique Végétale (URGV) est localisée sur le site du Genopole d'Evry. Cette unité récemment implantée et spécialisée dans la Génomique des Plantes, est une unité mixte INRA/CNRS (UMR 8114). L'URGV occupe une superficie de 1000 m2 scindée en 2 laboratoires. Un premier laboratoire de 500 m2 se trouve dans le même bâtiment que le Genoscope, le second laboratoire étant dans le bâtiment du Centre National de Génotypage (CNG). L'URGV est équipée d'outils performants pour les manipulations "haut débit" (robots, arrayer, etc.). Nous collaborons étroitement avec le Genoscope et le CNG pour des projets impliquant le séquençage et le génotypage respectivement. L'objectif principal de l'Unité est de développer et d'appliquer des approches modernes en génomique pour l'étude des plantes modèles ou d'intérêt agronomique (voir site web:
www.evry.inra.fr/)

Description du poste : Génomique comparée entre Vitis vinifera et Arabidopsis thaliana.

De nombreux caractères sont importants pour la production de raisins de cuve, qu'ils soient liés à la qualité ou à la résistance aux agents pathogènes. Or, leur analyse est ralentie par le long temps de génération de cette espèce pérenne. En revanche, la petite taille du génome de Vitis vinifera (475 Mb) est un avantage pour le développement d'approches génomiques. La construction d'une carte physique du génome de la vigne a donc été initiée à l'UMRGV avec la construction d'une banque BAC d'ADN de Cabernet Sauvignon clone 412 (44 900 clones, taille moyenne des inserts de 145 kb, au moins 13 équivalents génome), un programme d'ancrage de STS sur ces clones BAC (séquence des deux extrémités de 15 000 à 20 000 BACs). En parallèle, des stratégies vont être développées dans l'objectif d'utiliser les données obtenues sur la plante modèle Arabidopsis pour accélérer les recherches sur la vigne. Dans ce cadre, nous souhaitons évaluer dans quelle mesure la connaissance de la séquence du génome d'Arabidopsis pourrait aider à la construction de la carte physique du génome de la vigne en combinant des approches bioinformatiques et de cartographie physique. Le stage implique des interactions entre l'équipe travaillant sur l'organisation des génomes de plantes cultivées (blé, colza, peuplier et vigne), et l'équipe bioinformatique, qui regroupe de façon unique des compétences en analyse des génomes, annotation, construction de bases de données et interfaçage.

Date d'ouverture du poste : 3è trimestre 2003

Salaire : 55'000 euros pour une année (salaire brut), renouvelable 1 fois

Contacts:

Contact : Anne-Françoise Adam-Blondon
Tél.: +33 (01) 60 87 45 34
adam@evry.inra.fr

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06/04/2003

[AG]

SENIOR FELLOW MICROARRAY STATISTICS / BIOINFORMATICS

Source:

Date de parution:

24/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Barcelone (Espagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Ref. P7105/03
CONTRACTED POSITION OPENING - RAMON Y CAJAL PROGRAM
SENIOR FELLOW MICROARRAY STATISTICS / BIOINFORMATICS

CRG is seeking a postdoctoral researcher within the Bioinformatics and Genomics Program. Emphasis will be given to applicants who are capable of leading an independent research program with a focus on the development of new algorithms and software for the analysis of microarray data. Possible areas of application include: normalization of small size microarrays, statistical analysis of results from expression profiling and comparative genomic hybridisation on microarrays, and cross-validation of microarray data generated from different platforms and through alternative methodologies.

The successful candidate will join the Microarray Laboratory at CRG and is expected to interact with research groups in Genome Bioinformatics (http://genome.imim.es), Molecular Modelling and Structural Biology (http://www.imim.es/grib) and Complex Systems (http://complex.upf.es), existing at the Parc de Recerca Biomèdica de Barcelona, a joint venture of CRG with the Institut Municipal d'Investigació Mèdica (IMIM) and Universitat Pompeu Fabra (UPF).

Applicants should have a PhD in statistics, bioinformatics, or a biomedical science-related field with a strong background in bioinformatics and/or statistics, plus at least 1-2 years of experience in microarray research. Starting gross salary (before
taxes) will be 29.702 Euros per year.

Contacts:

Interested applicants should submit a letter of intent indicating the ref. Number, their major research interests, a C.V., and a list of three referees including their address, who can be contacted to request letters of recommendation, to

Glòria Freixas (RRHH)
Centre de Regulació Genómica
Passeig Marítim 37-49
08003 Barcelona
SPAIN

gloria.freixas@crg.es

For more information related to the Ramon y Cajal Program please see CRG's website (www.crg.es)

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06/04/2003

[AG]

MCF vacant en biochimie et bioinformatique

Source:

Date de parution:

10/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Annonce pour une poste de MCF vacant en biochimie et bioinformatique pour un recrutement en 2003 à l'Université de Bourgogne à Dijon. Je vous serez reconnaissant de bien vouloir en faire la diffusion dans vos laboratoires.
Date limie de dépot de dissier le 21 Mars 2003! Sincères salutations. Mustapha Cherkaoui UNIVERSITE DE BOURGOGNE RECRUTEMENT D'UN MAÎTRE DE CONFÉRENCES 2003 Le dossiers de candidature à envoyer au chef de l'établissement, au plus tard le 21 mars 2003 N° du Poste : 0425 S Section : 64 Discipline:Biochimie Corps : MCF UFR : Sciences de la Vie Profil particulier :Biochimie et Bio-informatique Profil enseignement : Participation à l'enseignement pratique et dirigé de biochimie générale du DEUG SVT.Enseignement de biochimie/biologie moléculaire de la licence de Biochimie. Implication dans l'enseignement de bio-informatique, protéomique et modélisation de la Maîtrise de Biochimie. Autres enseignements: DESS de Génie Biochimique. Argumentaire : Compétences souhaitées ou à développer : Biochimie des protéines, protéomique fonctionnelle. Etude des interactions moléculaires par méthodes génétiques ou autres; bioséquences. Production de protéines recombinantes. Profil recherche Le Maître de Conférence viendra étoffer la sous-équipe Biochimie fonctionnelle des peroxysomes (Resp. Pr. M. Cherkaoui Malki). Ses travaux pourront se dérouler en relation avec la future plate-forme protéomique du SERCOBIO (SERvice Commun de BIOlogie de l'Université) Laboratoire de rattachement : UPRES-EA 2978-GDR CNRS 2583, LBMC (Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire), Responsable Prof. Norbert Latruffe L'Unité est affiliée à l'IFR n°92 Qualité des Aliments et travaille sur le rôle cellulaire des peroxysomes et leur régulation par les nutriments.

Contacts:

Contact enseignement :
M. Yves JASSEY Directeur UFR Sciences de la Vie Téléphone : 03 80 39 62 76 Fax : 03 80 39 38 25 E-Mail : Yves.Jassey@u-bourgogne.fr
Contact recherche :
Pr. Mustapha Cherkaoui-Malki : Tél : 03 80 39 62 39 , E-mail: malki@u-bourgogne.fr Et Pr. Norbert LATRUFFE Directeur du LBMC Tél. : 03 80 39 62 36 ; Fax : 03 80 39 62 50 E-Mail : latruffe@u-bourgogne.fr

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06/04/2003

[AG]

Postes Enseignants Vacants à l'U.B.P. Campagne 2003 Première Vague

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

21/03/2003

Lieu:

Clermont-Ferrand (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Le dossier doit être adressé, de préférence en envoi recommandé simple (sans avis de réception), au plus tard le 21/03/2003, à minuit (le cachet de la poste faisant foi) à l'adresse suivante:

Université Blaise PASCAL
Service Gestion du Personnel
34, avenue Carnot - BP 185
63006 Clermont-Ferrand Cedex 1/ FRANCE
Tél : 04.73.40.61.36 - Tél : 04.73.40.63.28
Fax : 04.73.40.64.31

N° 0562 Situation de l'emploi Vacant
Date de vacance 01/09/2002

Section(s) CNU concernée(s): 0065-Biologie cellulaire

Nature: Maître de Conférence

Composante: Sciences Exates et Naturelles

Profil publication du Journal Officiel : Bio-informatique, génomique

Profil Enseignement Filières de formation concernées :
Le service d'enseignement sera assuré en bio-informatique dans les filières existantes, en particulier le DESS Bio-informatique pour génomique et post-génomique et la maîtrise de Biologie cellulaire et Physiologie. Il sera complété par des enseignements d'informatique pour les biologistes en DEUG et licence.
La personne recrutée s'investira dans le développement des enseignements de bio-informatique à mettre en place au niveau des cursus de licence et de master dans le cadre des nouvelles filières de la Construction de l'espace européen de l'enseignement supérieur.

Objectifs pédagogiques et besoin d'encadrement :
La bio-informatique est devenue une discipline clef, liée au développement de différents secteurs de la biologie générant des quantités importantes de données qu'il faut exploiter. Il y a pénurie de bio-informaticiens et notre Université a entrepris d'investir dans la formation de ce type de spécialistes.

Filières de formation concernées :
Le service d'enseignement sera assuré en bio-informatique dans les filières existantes, en particulier le DESS Bio-informatique pour génomique et post-génomique et la maîtrise de Biologie cellulaire et Physiologie. Il sera complété par des enseignements d'informatique pour les biologistes en DEUG et licence.
La personne recrutée s'investira dans le développement des enseignements de bio-informatique à mettre en place au niveau des cursus de licence et de master dans le cadre des nouvelles filières de la Construction de l'espace européen de l'enseignement supérieur.

Objectifs pédagogiques et besoin d'encadrement :
La bio-informatique est devenue une discipline clef, liée au développement de différents secteurs de la biologie générant des quantités importantes de données qu'il faut exploiter. Il y a pénurie de bio-informaticiens et notre Université a entrepris d'investir dans la formation de ce type de spécialistes.

Profil Recherche

L'UMR "Amélioration et Santé des Plantes" est impliquée dans l'analyse génomique de plantes à grand génome. Ces espèces ont des spécificités d'organisation et de structure de l'information génétique par rapport aux plantes modèles à petit génome qui servent de référence.
La personne recrutée s'impliquera dans les études de génomique structurale et fonctionnelle de ces espèces à grand génome, sur des cibles d'intérêt agronomique.
Elle travaillera en concertation avec les équipes de génomique de l'UMR, avec le Centre de génotypage qui s'y développe et avec
l'ingénieur-informaticien prévu au recrutement INRA.
Elle établira des collaborations avec les équipes universitaires
d'informatique et de bio-mathématiques.

Compétences requises :

Maîtrise des concepts et outils de l'informatique pour la génomique, entre autre algorithmique et/ou bases de données ; connaissances en génomique ou génétique moléculaire.
Laboratoire d'accueil Amélioration et Santé des Plantes (UMR-INRA)

Contacts:

Contact Enseignement
BECKERT Michel
beckert@inra.clermont.fr
Tel : 04.73.62.43.19

Contact Recherche
DERAGON Jean-Marc
J-Marc.DERAGON@geem.univ-bpclermont.fr
Tel : 04.73.40.77.52

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06/04/2003

[AG]

2 CDD + MDC

Source:

Date de parution:

06/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Rennes (France)

Statut:

Maître de Conférence

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un poste de maître de conf est ouvert à Rennes avec un profil
préférentiel en bioinformatique http://www.personnel.univ-rennes1.fr/profil_postes_ens_2003/mcf/27MCF0492.htm
Le candidat retenu pourra effectuer sa recherche au sein du projet Inria Symbiose http://www.irisa.fr/symbiose/

Deux postes de CDD sont également ouvert dans le but de développer et mettre à disposition une plate forme logicielle de recherche et découverte de motifs dans les séquences.
On recherche deux types de profils sur ces postes :
* Un candidat interressé pour participer à la création d'une société charger de valoriser les travaux.
* un ingénieur pour assurer le développement des algorithmes disponibles.

Contacts:

Des informations plus complètes sont disponibles sur http://www.irisa.fr/symbiose/emplois/

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02/04/2003

[AG]

Postgraduate Studentships in the Bioinformatics, Computer Science Department

Source:

BioJobs

Date de parution:

02/04/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

A postgraduate studentship is available from Oct 2003 in the Computer Science Department for research in Data Mining and Knowledge Discovery in Bioinformatics. Applications are sought from candidates with a good honours degree in a biological subject and from candidates who expect to graduate in the summer of 2003. Previous experience using standard bioinformatics tools and in developing new approaches and methods would be useful.The studentship is funded by Science Foundation Ireland and the research will focus on the development of Machine Learning and Data Mining techniques for application in Bioinformatics.

Contacts:

Further details are available from Prof. Pádraig Cunningham or Dr. Nadia Bolshakova (Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie). Applicants should send a full CV to Nadia.Bolshakova@cs.tcd.ie before 25th April.

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28/03/2003

[AG]

Ingénieur de recherche CNRS

Source:

BioInfo

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Mission :
L'ingénieur de recherche a en charge de concevoir, développer et déployer les méthodes et outils bioinformatiques d'intégration et d'analyse des données issues des plate-formes de génomique à haut débit, en vue de leur exploitation au sein des programmes de recherche de l'unité et de l'Institut. Il mènera sa mission en concertation étroite avec les biologistes de l'unité, les médecins et les bioinformaticiens de l'Institut.

Activités :
- Analyser les besoins dans le cadre de programmes de génomique à haut débit et participer à la rédaction du cahier des charges, en relation avec l'ingénieur de la plateforme de génomique fonctionnelle (en cours de recrutement) ;
- Développer des solutions méthodologiques aux problèmes d'analyses à haut débit ;
- Implémenter et mettre en service ces solutions (déploiement, formation) ;
- Intégrer les données génomiques et phénotypiques publiques et privées nécessaires aux analyses ;
- Participer aux analyses de données en relations avec les biologistes et médecins ;
- Assurer la veille technologique en relation avec le domaine de la bioinformatique et les experts du domaine ;
- Former, en interne et en externe, sur les principes et la mise en Suvre des techniques bio-informatiques.

Compétences :
- Avoir de bonnes connaissances de la biologie cellulaire et des grands principes qui régissent le fonctionnement des cellules ;
- Avoir une formation approfondie en bio-informatique (diplôme d'ingénieur ou 3ème cycle universitaire) ;
- Avoir une expérience de l'environnement UNIX, des langages Java, C/C++, Perl, PHP, SQL et une pratique des architectures client/serveur ;
- Avoir une expérience dans la gestion et l'analyse de gros volumes de données scientifiques ;
- Avoir une pratique des bases de données, outils d'analyse et concepts de la bioinformatique ;
- Maîtriser l'anglais scientifique à l'orale et à l'écrit ;
- Aptitude à la communication ;
- Travailler en équipe.

Contexte :
Travail au sein de l'UMR 144 CNRS - Institut Curie, en étroite collaboration avec le service Bioinformatique de l'Institut Curie, les plate-formes de transcriptome, CGH, protéome et génotypage, ainsi que d'autres unités du Campus participant au site Mte Ste Geneviève du Génopole Ile de France.

Contacts:

Voir http://www.sg.cnrs.fr/drhita/concoursita/2003/02_consulter.htm
et en bas de la page demander à voir le concours n°3

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28/03/2003

[AG]

professeur en bio-informatique Université Paris 6 Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière

Source:

Date de parution:

28/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Un poste de professeur en bio-informatique (0122 s) est ouvert au
recrutement à l'université Paris 6 en 27e section (informatique).

La recherche sera effectuée à l'Unité INSERM 511 de la Pitié-Salpêtrière.

L'enseignement sera dispensé à l'UFR d'informatique.

Le profil complet du poste est disponible à l'adresse www.lip6.fr

Contacts:

Recherche : Dominique MAZIER, Unité INSERM 511, Pitié-Salpêtrière, 0140779736

Enseignement : Mme la Directrice de l'UFR informatique :
DirUfr@ufr-info-p6.jussieu.fr

Présidente de la commission de spécialistes 27e section : Anne.Doucet@lip6.fr

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28/03/2003

[AG]

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics

Source:

ABG-7697-2

Date de parution:

21/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Marie Curie Industry Host Fellowships - Pharmacogenetics : Development of Statistical Strategies and Tools - Evry, France

Date de debut de diffusion du poste : 21/03/2003
Date de fin de diffusion prevue : 01/06/2003

Aventis Pharma, in partnership with the European Commission, offers 2 Marie Curie Industry Host Fellowships, for a 2 year period, on a project focused on the development of statistical strategies for the analysis of case-control pharmacogenetic data. The methods will enable the discovery and consequently the diagnosis of genetic polymorphisms underlying factors such as drug response, drug toxicity, and disease state and severity.

Based at the Evry Genetics and Pharmacogenetics Center,your roles will be to :

- Develop single-and multi-point linkage disequilibrium methods, with special reference to issues such as control sample selection and genomic control, marker selection, haplotype construction and analysis,and multiple testing.

Candidates should have experience in a field such as mathematics, statistics, population genetics, or genetic epidemiology. Fluency in English is required. The positions are open to members of the E.C. or residents of associated countries* for more than 5 years. You must hold a PhD. The age limit at the time of selection is 35 years old.

* Austria, Belgium, Bulgaria, Czech republic, Denmark, Estonia, Finland, Germany, Greece, Hungary, Iceland, Ireland, Israel, Italy, Latvia, Liechtenstein, Lithuania, Luxembourg, Malta, The Netherlands, Norway, Poland, Portugal, Republic of Cyprus, Romania, Slovakia, Slovenia, Sweden, Spain, and United Kingdom. However French citizens are ineligible as well as those who have been resident in France for more than 12 out of the last 24 months.

Employment Conditions

Field of application
The Marie Curie Post-Doc Fellows are recruited on a fixed-term contract. Aventis has been selected by the European Commission as a hosting institution able to deliver research training for post-doctoral researchers.

Salary and benefits
The annual scales are normally within the range of 30 to 39 k€ depending on the age and experience of the scientist.

Post-doctoral fellows are entitled to elect and participate in the Aventis French benefits as offered to regular full-time associates. This includes: medical and/or dental insurance, healthcare and dependant care reimbursement accounts.

Relocation
In regard to the household goods, Aventis DI&A Paris will reimburse the candidate as follow: up to 600 € for a single person up to 900€ if the Post doc fellow comes with his/her spouse. up to 200€ per child

Mobility allowances
The post doc fellow will receive a monthly mobility allowance of 400 € (as agreed with the EC) all along his/her assignment.

Airfare
Economy airfare will be provided to work site from home and a return economy flight home completion of the post-doc assignment.

Housing accommodations
The company will pay for furnished lodging accommodations for up to 15 days at the post doc fellow arrival in France. In order to help the Post-doc fellow to find a suitable housing, relocation counselor provided by Aventis will be available to discuss the details on housing arrangements. If needed, support will also be provided to open bank account in France and for administrative steps.

French lessons
Aventis will help all post-doctoral fellows who will express the wish to be trained in French. According to their French language knowledge, the most appropriate course will be given. Two 40 hour-package can be offered by Aventis and if necessary additional courses could be given by the “Alliance Francaise”.

Working hours
In application of the agreements on the organization and duration of work in force within the company, working time consists of an average of 35 hours effective work per week over the year.

Vacations
Employees at Aventis are eligible for 31 vacation days for a full period (i.e.12 months), more 14 days off in application to the 35 hours agreement (RTT days) for a full period.

Contacts:

Written details and letters of application for both positions, together with CVs and the names of two referees should be sent to :

Dr. JF Deleuze, Director of the Evry Genetics Center, Aventis Pharma, 2, rue Gaston Cremieux, 91057, Evry, France.
Tel: 33 1 58 93 90 01, Fax: 33 1 58 93 90 10, e-mail : jean-francois.deleuze@aventis.com

Thank you for quoting Association Bernard Gregory and the ABG job reference number, when applying.

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28/03/2003

[AG]

plusieurs ATER et agreges-preparateurs rentrée 2003

Source:

BioInfo

Date de parution:

13/03/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lyon (France)

Statut:

ATER

Secteur:

public

Description de l'annonce:

le Departement Sciences de la Vie et de la Terre de l'ENS Lyon va recruter plusieurs ATER et agreges-preparateurs (titulaires d'une agregation) a la rentree 2003. Les personnes avec un profil bioinformatique et/ou evolution sont fortement incitees a presenter des dossiers, etant donne des besoins importants en recherche et en enseignement.

La politique de l'ENS est d'utiliser ces postes pour des post-docs. Donc priorite sera donnee aux candidats externes, la these devra etre soutenue (ou a soutenir fin 2003 au plus tard), et la priorite sera donne a des profils de recherche de qualite. Donc aussi les ATER sont recrutes pour 2 ans et les agreges-preparateurs pour 3 ans, et nous garantissons de pouvoir faire de la recherche dans d'excellentes conditions.

Le lieu des etudes de deuxieme cycle n'est pas un critere ! (en d'autres termes, pas besoin d'etre normalien)

Contacts:

Si vous etes interesses, envoyez un CV a Vincent Laudet : vincent.laudet@ens-lyon.fr

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23/02/2003

[AG]

Data Analysis Scientist

Source:

Date de parution:

23/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Ankeny (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Monsanto values diversity and is an equal opportunity affirmative action employer.

Department: Technology Development
Title: Data Analysis Scientist
Req Number: mons-00000893
Location(s): Ankeny IA

Responsibilities:
The successful candidate will be part of a Data Analysis team within our plant breeding organization. The individual in this role will be analyzing molecular marker data sets and crop trial data, this implies: Test procedures through simulations and validations methods to help optimize research strategies. Develop analysis tools and routines to be used by other researchers in the organization. Apply current and new statistical tools to the analysis of experiments. Design and propose experiments, based on analysis results and/or new technological developments.

Required Skills:
A Ph.D. in bioinformatics, statistics, statistical genetics, or in a related discipline with a solid statistical training is required. The candidate should demonstrate ability to work as a team member, have good communication skills, be creative at problem solving, and be detailed-oriented.

Consideration will be given if the candidate could demonstrate any of the following skills: Computer programming as well as building, querying, and managing large databases. Prior exposure to quantitative and population genetics, and the application of molecular markers to large/complex pedigrees. Experience with simulation procedures and Bayesian analysis.

Contacts:

http://sh.webhire.com/Public/554/jd1224976.html

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23/02/2003

[AG]

Postdoctoral position in Bioinformatics for non-french citizen

Source:

Date de parution:

23/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Evry (France)

Statut:

???

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Postdoctoral position in Bioinformatics (ref : 398)

The french Laboratoire de Phytopathologie et Méthodologie de la Détection (INRA) offers a one year postdoctoral position for a non-french citizen immediately available. The aim of the study is the bioinformatic analysis of genomic data concerning Botrytis cinerea, a phytopathological fungus : EST sequences and BAC end sequences coming from the Centre National de Séquençage.

The candidate will be in charge of the building of EST contigs, their annotation against public databases, in particular yeast, Neurospora crassa and Magnaporthe grisea. He will set up a process for analyzing genomic sequences and in particular perform gene finding. He will adapt structural prediction tools to the genome of Botrytis. The resulting information will be stored in a database and he will set up a web site to allow access to the data and links on transcriptomics data.

He will be based in the Unité de Recherche en Génomique-Info at Evry, France (in the suburbs of Paris) and he will be surrounded and supported by a bioinformatics team of about 15 people. The tasks of this group have been mainly focused on databases building, data integration and software development for a large community of scientists as well as the developing of large scale analysis processes (web site : http://genoplante-info.infobiogen.fr).

The successful candidate should have a PhD in Bioinformatics or Biology with good skills in bioinformatics and sequence annotation. Salaries will be between 1700 to 2100 Eur.

Contacts:

duclert@infobiogen.fr
http://genoplante-info.infobiogen.fr/Information/About/jobs.html

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21/02/2003

[AG]

stage de bio-informatique

Source:

bioinfo

Date de parution:

21/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Paris (France)

Statut:

Stage

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Proposition de stage de bio-informatique

Sujet:
Constitution d'une base de connaissance pour l'étude des réseaux de régulation génétique

Descriptif:
Dans le cadre d'une collaboration entre le Laboratoire de Génétique de la Neurotransmission (LGN, unité CNRS UMR 7091) et le Laboratoire d'Informatique de Paris 6 (LIP6), nous développons une plate-forme logicielle destinée à l'étude des réseaux génétiques. Ce système permettra l'exploitation conjointe de deux types d'informations:

les connaissances sur les réseaux de régulation génétique, issues d'expériences de biologie humide démontrant un lien de régulation entre deux gènes, et actuellement dispersées dans la littérature scientifique ou des bases de données hétérogènes.

les profils d'expression des gènes constituant ces réseaux, obtenus par des technologies comme les puces à ADN, le SAGE ou la RT-PCR.

Ce système logiciel, appelé GeNetDB (pour Genetic Network Database), est destiné à servir de source de données pour les équipes pluridisciplinaires travaillant sur la problématique de l'inférence et/ou de la modélisation des réseaux génétiques.
En plus de constituer une base de connaissance, GeNetDB pourra être utilisé comme outil de traitement via l'écriture de scripts de commande ou de modules additionnels pour manipuler les données qu'il propose.

Le modèle de donnée étant finalisé, et l'implémentation du logiciel suffisamment avancée pour une première exploitation, nous recherchons une personne capable de nous aider dans le processus de recherche, d'importation et d'annotation des données qui vont constituer la base de GeNetDB.
Cette personne devra évaluer la pertinence et la qualité des données accessibles sur Internet ou auprès d'auteurs, et en gérer la récupération. Une fois obtenues, elles devront être nettoyées et adaptées au modèle de donnée sous-jacent à GeNetDB, pour enfin être annotées.

Ce stage est d'une durée minimum de 2 mois.

Profil recherché:
Biologiste (ayant de bonnes connaissances en biologie moléculaire, et éventuellement en microbiologie), de niveau maîtrise ou DEA/DESS, possédant en informatique de solides compétences dans les domaines de la recherche d'informations sur Internet (utilisation des moteurs et méta-moteurs de recherche, exploitation de bases de données en ligne) et de la manipulation de ces informations (stockage, organisation des données, requêtes sur celles-ci). Cette personne devra être à l'aise
dans les environnements Windows et Unix.
Des compétences en programmation (Perl, Python ou Java), en gestion du format XML (DTD, XPath, XSLT), et en bases de données (MySQL), seraient un plus.

Contacts:

Adresser candidature (CV et lettre de motivation):
- par e-mail (de préférence) aurelien.mazurie@free.fr
- par courrier
Aurélien Mazurie
Laboratoire LGN
CNRS UMR 7091
Bat. CERVI, 5ème étage
Hopital Pitié-Salpétrière
83, bd de l'Hopital
75013 Paris
- par fax
01.42.17.75.33

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21/02/2003

[AG]

Scientist--BIOINFORMATICS and MACHINE LEARNING

Source:

bioinformatics.org

Date de parution:

21/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Moffett Field - Californie (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Research Institute for Advanced Computer Science (RIACS) and NASA Ames Research Center seek a scientist in the areas of Bioinformatics and Machine Learning to collaborate with RIACS and NASA scientists in pursuit of grand challenge problems in space biology.

RIACS performs basic and applied computer science research in collaboration with NASA and university scientists to solve challenging scientific problems in support of NASA's goals and missions. RIACS is located at NASA Ames Research Center in the heart of Silicon Valley. RIACS is an institute of the Universities Space Research Association (USRA), a non-profit organization.

Early studies indicate that space impacts life in profoundly different ways than on Earth, as demonstrated by gene expression data obtained in experiments in space and under simulated microgravity and high radiation environments. With its mission to improve life on Earth, to search for life outside our home planet, and to extend life to space, NASA has undertaken a broad range of activities in space biology and biotechnology. These activities are broadly focused on the the impact of the space environment on living matter, including risks, remedies, and potential benefits.

RIACS and NASA Ames seek a scientist with a proven record in bioinformatics and a strong computer science background to contribute to this research program. The scientist will work closely with molecular biologists, bioinformaticians, and the the Machine Learning Group of the Computational Sciences Division at NASA Ames Research Center. Initial duties may include but are not limited to:

Collaboration with NASA scientists on the analysis and interpretation of microarray data related to space experiments;
Contributions to the development of machine learning and data mining methods for bioinformatics.

The candidate will also play an active role and responsibility in identifying and applying for follow-on funding from NASA and other government agencies.

The successful candidate will have many of the following qualifications:

A Ph.D. with 2 years experience, or a Master's degree and five years experience in Molecular Biology, Computer Science, or a related field.
Familiarity with bioinformatics tools and methods.
Publication history in bioinformatics.
Wet lab experience.
Strong computer science and machine learning background.
Experience in statistics, Bayesian models, and Markov models.
Ability to work effectively with scientific personnel in multiple disciplines (e.g., life science and computer science).
Strong interpersonal skills.

Compensation for this position is competitive, and based on the candidates' experience and expertise.

Contacts:

Working at RIACS provides the opportunity to collaborate on a variety of challenging space-related information technology research problems with top quality researchers from around the world. If this position excites you, please visit our web site at http://www.riacs.edu and follow the instructions under the Employment page to apply.

RIACS is an equal opportunity employer.

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21/02/2003

[AG]

Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire

Source:

Date de parution:

21/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Nantes (France)

Statut:

CDD

Secteur:

public

Description de l'annonce:

L'Université de Nantes dispose, pour la rentrée 2003, d'un poste de Maître de Conférences intitulé Bio-informatique et Combinatoire. Ce poste est ouvert dans la section 27 Informatique) et à ce titre le profil du candidat recherché est le suivant :

Recherche :
Le candidat devra effectuer ses travaux de recherche au sein du thème ComBi (Combinatoire et Bio-informatique) de l'IRIN (l'Institut de Recherche en Informatique de Nantes). Ses compétences en informatique devront être complémentaires à celles (fortement combinatoires) des membres du thème, et ses compétences en biologie seront, de préférence, appuyées par une première expérience en bio-informatique. Le candidat pourra soit s'intégrer dans l'une des directions de recherche actuelles
du thème (découverte de motifs sur les structures primaires, comparaison de structures secondaires, comparaison de génomes), soit proposer une nouvelle direction de recherche. Il sera, par ailleurs, demandé au candidat recruté de participer activement au renforcement des collaborations entre le thème ComBi et les équipes de recherche en Biologie de Nantes ou d'ailleurs.

Enseignement :
Le candidat devra enseigner l'informatique à tous les niveaux de
formation proposés par le Département Informatique de l'Université de Nantes, et devra participer aux tâches administratives inhérentes au bon fonctionnement du département.

Contacts:

Toute personne intéressée est priée de prendre contact avec :

Recherche : Irena Rusu, rusu@irin.univ-nantes.fr
Responsable du thème ComBi
Enseignement : Marie-Madeleine Tallineau, tallinea@info.univ-nantes.fr
Responsable du Département d'Informatique

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20/02/2003

[AG]

Bioinformatics analysis of the Fusarium ear blight-wheat interaction (2 potdocs)

Source:

AGM2

Date de parution:

20/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Hertfordshire (Grande-Bretagne)

Statut:

Postdoc

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Applications are invited for 2 postdoctoral fellowships in the group of Kim Hammond-Kosack studying Fusarium ear blight and mycotoxin control in Europe’s Cereal Crops. Our studies employ a wide range of techniques from plant pathology, molecular biology, bioinformatics, wheat genetics and functional genomics (http://www.iacr.ac.uk/ppi/wptop.html).

One post-doc fellow will be in charge of the bioinformatics analysis of the plant’s response to Fusarium ear blight infection in both susceptible and resistant wheat cultivars. The second post–doc will be in charge of the bioinformatics analysis of the Fusarium graminearum genes expressed in planta, during the invasion of susceptible and resistant wheat cultivars.

Both posts will take advantage of Monsanto’s proprietary wheat EST collection and transcriptome profiling data sets, specifically generated for these project. In addition, there are growing public wheat ESTs collections and in 2003 the entire F. graminearum genome will be sequenced at the Whitehead Institute, Boston, USA.

Candidates should have a strong background in bioinformatics and molecular biology. An interest in fungal biology/host-pathogen interactions is desirable but not essential. Collaboration and teamwork are essential to this position. Candidates should also show excellent interpersonal skills.

The work will be based in the new Centenary laboratory at Rothamsted Research, with access to first class molecular and analytical facilities, bioimaging, controlled environments and new glasshouses.

Eligible candidate for these 2 posts must be under 35 years of age, have obtained their Ph. D. degree within the last 5 years, hold a European passport and have not worked previously in the UK.

Contacts:

Applications, including a detailed CV, a brief summary of research interests, the names and addresses of three referees, should be addressed to Dr Kim Hammond-Kosack, Rothamsted Research, Plant-Pathogen Interaction Division, Harpenden, Hertfordshire, AL5 2QJ, UK. Tel 44(0) 1582 763133 Ext 2240, Fax 44(0) 1582 715009. E. mail kim.hammond-kosack@bbsrc.ac.uk.

Rothamsted Research is situated 30 Km north of London, England and has excellent links to the major motorway, rail and air routes. This government institute with approximately 500 staff undertakes basic and strategic research on sustainable plant-based agriculture and the environment.

Both positions are available April 2003-March 2005 and are funded under EU Framework V.

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16/02/2003

[AG]

Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute

Source:

Date de parution:

16/02/2003

Date limite de réponse:

31/03/2003

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

???

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Bioinformatics Faculty Positions At The Sanger Institute

The Wellcome Trust Sanger Institute is at the forefront of computational and experimental genome research. We have strengths in bioinformatics software, algorithm and database development, and exceptional data and computational infrastructure. The Wellcome Trust has recently awarded £300 million to the Sanger Institute to support our new biological/genetics research direction as well as our existing programmes over five years, plus £65 million for IT infrastructure.

Applications are invited for full time faculty positions at the rank of Investigator, Senior Investigator, or Principal Investigator . For faculty members, we are looking for individuals with a proven background in first class research, with a strong, vision and innovative projects that are ideally in areas related to our large scale experimental programmes. We encourage relevant applications from people with backgrounds in bioinformatics, computer science or mathematical or scientific areas.

Head of Production Software: We are also looking for a new head of our production software group, who will be responsible for directing teams involved in internal data processing. This position will have faculty status at one of the levels listed above, with independent research opportunities.

The Sanger Institute is committed to provide a level of support so that there is no impediment to performing high quality and productive science. This includes access to our infrastructure as well as unencumbered support commensurate with the rank of appointment.

Contacts:

Applicants are requested to send their curriculum vitae with a full publication list by 31st March 2003. You should also provide a two page description summarising your research accomplishments to date and a three page plan of your future research goals and strategies indicating how these fit with, or make use of Sanger Institute programmes and infrastructure.

All candidates must provide three letters of recommendation. Please arrange to have these letters and application sent to:
Richard Durbin
Faculty Search Committee
The Wellcome Trust Sanger Institute
Wellcome Trust Genome Campus
Hinxton, Cambridge
CB10 1SA
ENGLAND

Email: rd@sanger.ac.uk
FAX: +44 (0) 1223 494714

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11/02/2003

[AG]

Potsdam Faculty Position

Source:

AGM2

Date de parution:

11/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Statut:

Secteur:

Description de l'annonce:

Department of Biochemistry and Biology and Department of Computer Science

The Department of Biochemistry and Biology and the Department of Computer Science at University of Potsdam invite outstanding applications for a Chair of Bioinformatics.

The position is a professorship according to the Brandenburgisches Hochschulgesetz BbgHG (May 20, 1999). Areas of interest include, but are not limited to: plant genomics, proteomics, expression or metabolite profiling in plants, regulatory networks in biological systems.

The successful applicant will be expected to interact with researchers within the two departments as well as with researchers from the Max-Planck Institute for Molecular Plant Physiology located in Golm. Participation in existing research programs (e.g. Sonderforschungsbereich 429, GABI) is desired.

The candidate will be expected to teach at the undergraduate and graduate levels in bioinformatics education.

Contacts:

The applicant should send a letter of application, CV, a resume including a statement of research and teaching interests and selected publications to:

Rektor der Universität Potsdam,
Postfach 60 15 53,
D-14415 Potsdam,
Germany.

Applications received by March 1, 2003 will be guaranteed full consideration.

The University of Potsdam is an Equal Opportunity/Affirmative Action Employer. Women and disabled people are encouraged to apply. In the case of equal qualifications female and disabled applicants are preferred.

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11/02/2003

[AG]

Bioinformatics scientist

Source:

http://bioinformatics.org/

Date de parution:

11/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Richmond (Virginie) (Etats-Unis)

Statut:

Postdoc

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Philip Morris USA, a global leader in the manufacturing and marketing of consumer products made for adults, seeks a Post Doctoral Research Fellow to join us at our Research, Development and Engineering headquarters in Richmond, VA.

We are seeking a uniquely qualified bioinformatics scientist to support cutting edge research in the field of plant genomics. Specifically, the successful candidate will work interactively with Philip Morris USA scientists and company-funded researchers at various academic institutions to develop computational tools that will facilitate gene discovery and annotation from data generated as part of a major project sponsored by Philip Morris USA.

Qualified candidates must have completed a Ph.D. in either the biological or computer sciences and have experience and a publication record in bioinformatics and/or genomics research. Candidates who have experience applying computer science expertise toward biological research projects are especially desired. The successful candidate will possess these qualifications and will be well versed in standard databases and software applicable to DNA and protein research. Expertise with object-oriented programming and scripting tools (JAVA, C++, PERL, XML, BPEL4WS etc.) and experience working interactively with biological scientists in problem solving is also desired.

In addition to the opportunity to apply your scientific skills toward critical business objectives, we offer an excellent compensation package including a competitive base salary, health insurance reimbursement and relocation assistance.

Contacts:

For immediate consideration, visit our web site: www.philipmorrisusa.com/careers. Select the ?Search Our Jobs? option. Select the ?Begin Your Search? option. Select the ?Search Openings? option. Enter requisition ?3099BR? into the keyword or requisition number search box and select the ?Search? option. Select the job and click Submit to Job.

Philip Morris USA is an Equal Opportunity/Affirmative Action employer (M/F/D/V). We support diversity in our workforce.

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09/02/2003

[AG]

BIOINFORMATICS POSITION

Source:

http://www.forumusa.org/exposants/oe/GENFIT_oe.html

Date de parution:

10/01/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Lille (59) (France)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Entreprise : GENFIT / IT.OMICS
Lieu : Genfit - 885 avenue Eugène Avinée, Parc Eurasanté, 59120 LOOS (LILLE) - France

Description de l'activité de l'entreprise : Genfit (a biotech company based in Lille, France (www.genfit.com) is seeking a bioinformatics leader for its bioinformatics dedicated subsidiary, IT.Omics.

Candidat :

Formation/Diplômes requis : PhD graduated in life sciences (or possibly computational sciences)

Experience requise : he/she is expected to have 2 to 5 years of experience in the field of bioinformatics research. He/she for instance may have taken part in the development of algorithms for the analysis of expression data and/or for in silico modelling of biological pathways within a research programme in functional genomics/proteomics. He/she is knowledgeable about programming, SGBDRs and usual mathematics applied to bioinformatics (statistics, graphs, Mqarkov chains, etc.).

Contacts:

contact@genfit.com

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06/02/2003

[AG]

Bioinformatics Director

Source:

bioinformatics.org

Date de parution:

06/02/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

El Paso (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Bioinformatics Director
Faculty Position in The Department of Mathematical Sciences University of Texas at El Paso

The Department of Mathematical Sciences at The University of Texas at El Paso (UTEP) invites applications and nominations for a tenure-track/tenured ASSISTANT, ASSOCIATE, or FULL PROFESSOR to serve as Director of the Bioinformatics Program. Rank and salary will be commensurate with experience, research start-up funds are available.
The Bioinformatics Program leads to a Professional Master's of Science Degree with a focus on computational molecular biology and computational genomic aspects of bioinformatics, providing professionals for the life science industry who can support the entire research and development process: to access, manage, analyze, simulate, and interpret biological information. It is a non-thesis degree administered through the College of Science, developed with the support of The Sloan Foundation, enrolling the first cohort of students the Fall semester of 2001. Candidates with active research programs who are interested in working on cross-d isciplinary problems involving Statistics in the Biological Sciences, Computer Science or Chemistry, and with a strong commitment to teaching are sought. Applicants must have a Ph.D. in Statistics, Biostatistics, or a related field with theoretical or applied research experience in statistical modeling of biochemical systems. Candidates are sought who complement the existing team of interdisciplinary researchers needed to support and to lead further development of the Bioinformatics Program.
The administrative duties of the director include arranging summer internships for students; individuals with extensive industry contacts are encouraged to apply.

Contacts:

Candidates should send a letter of application with a vision statement explaining their contribution to the Bioinformatics Program at UTEP, a statement of research with representative reprints, a statement of teaching interests, curriculum vitae, and contact information for at least 3 references to: Bioinformatics Director Search Committee, Department of Mathematical Sciences, University of Texas at El Paso, El Paso, TX, 79968-0514. Evaluation of applications will begin December 1, 2002 and continue until the position is filled.
Visit the following websites for more information about us: www.bioinformatics.utep.edu, www.utep.edu/biology , www.math.utep.edu , www.statlab.utep.edu . UTEP is located on the western-most border of Texas with Mexico in the Chihuahuan desert near the southern-most end of the Rocky Mountains.
Seventy percent of the student body is Hispanic, and we are committed to contributing to the diversity of the nation's profile of professionals in science.

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06/02/2003

[AG]

Chair and lecturers/senior lecturers/readers

Source:

ScienceCareers.org

Date de parution:

09/01/2003

Date limite de réponse:

14/02/2003

Lieu:

Liverpool (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Chair and lecturers/senior lecturers/readers Biochemistry/molecular biology, host-parasite biology, evolutionary psychology/behavioural ecology, functional genomic genomics and cellular regulation, employing transgenics, etc. University of Liverpool Liverpool

THE UNIVERSITY of LIVERPOOL
School of Biological Sciences
Chair and Lecturers/Senior Lecturers/Readers
Salary will be negotiable for the Chair
Salary will be £22,191 - £33,679 pa (Lecturer) or £35,251 - £39,958 pa (Senior Lecturer/Reader)

The School of Biological Sciences (rated 5 in RAE 2001) is the largest department in The University, with 61 academic staff covering the full range of the biological sub-disciplines in a single research and teaching organisation (see http://www.liv.ac.uk/biosciences). The School has just moved into a new Biosciences Research Building, which provides state-of-the-art laboratories, including a range of core facilities for post-genomic research, and a business incubator. The Building will serve as a focus for the Liverpool life sciences community with over 450 academic staff. As part of the strategy to develop the biosciences at Liverpool, The University wishes to appoint exceptional candidates to a range of positions in the School of Biological Sciences. Candidates should be able to present evidence of research excellence and potential in their field, and those who can demonstrate links with the activities of one or more research groups within the School and/or University will be particularly welcome.

We are seeking to appoint one Chair and five Lecturers, although suitable applicants at Senior Lecturer/Reader level will also be considered. A professorial appointment to the prestigious Johnston Chair of Biochemistry will be available to a candidate in the general area of Biochemistry/Molecular Biology.

The appointments will be made as follows:

A Chair and three Lectureships in up to four of the following areas:

functional genomics and cellular regulation, employing transgenics, transcriptomics, proteomics, or cell imaging the interface of biology with chemistry and physics molecular microbiology in microbial pathogenesis, host-pathogen biology, or microbial biotransformations bioinformatics in genomic or post-genomic science bioinformatics in phylogenetic, evolutionary, population, or environmental science Lectureship in host-parasite biology Lectureship in evolutionary psychology/behavioural ecology

Contacts:

Applicants with interests or expertise in more than one of these areas will be especially welcome.

Informal enquiries for all the above posts may be made to Professor Brian Tomsett, Head of Department on 0151 795 4413, email: biolhos@liv.ac.uk

For the post of Chair quote ref: B/990/S.
For the post of Lecturer/Senior Lecturer/Reader quote ref: B/991/S. Closing date: 14 February 2003

Further particulars and details of the application procedure should be requested from the Director of Personnel, The University of Liverpool, Liverpool L69 3BX on 0151 794 2210 (24 hr answerphone), via email:jobs@liv.ac.uk or are available online at http://www.liv.ac.uk/university/jobs.html

COMMITTED TO EQUAL OPPORTUNITIES

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Be sure to mention that you saw this ad on ScienceCareers.org.

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06/02/2003

[AG]

Bioinformatics Programmer

Source:

Date de parution:

02/01/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Cambridge (Grande-Bretagne)

Statut:

CDI

Secteur:

public

Description de l'annonce:

Paradigm Therapeutics (www.paradigm-therapeutics.co.uk) was started as a spin-out company from the University of Cambridge and has since established a platform based on transgenic technology for defining the biological functions of previously uncharacterised human drugable proteins. Paradigm is about to undergo a period of rapid expansion and offers a dynamic and fast paced working environment, where creative thinking is encouraged and results rewarded.

A post is available immediately for a bioinformatician with programming and development experience in the area of biological databases and database integration.

The post holder will be responsible for developing and maintaining in-house databases for the integration of internally generated genomic and biological data with external datasources.

Experience of unix based Perl, Bioperl and SQL based relational database design are essential and familiarity with Ensembl, HTML/CGI, CORBA and DAS will be an advantage.

Contacts:

Interested candidates should send their CVs to markcarlton@paradigm-therapeutics.co.uk

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06/02/2003

[AG]

NBCI RefSeq Project Scientist

Source:

Planet Jobs

Date de parution:

13/01/2003

Date limite de réponse:

Lieu:

Bethesda (Etats-Unis)

Statut:

CDI

Secteur:

prive

Description de l'annonce:

Here is an exciting opportunity to contribute to the RefSeq project using your experience in mammalian comparative genomics. The RefSeq Curator defines the RefSeq sequence and expanded annotation through sequence analysis and literature review. A Ph.D. in biology or molecular biology, focusing on mammalian comparative genomics is required for this intellectually challenging opportunity.

While not a laboratory position, it does require extensive sequence analysis and molecular biology laboratory experience. Strong verbal, written, problem-solving, and organizational skills are required for this detail-oriented project. The RefSeq Scientist works at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) on the NIH campus in Bethesda, Maryland and:

Analyzes sequence data to provide the most complete, accurate reference sequence.

Contributes toward an international collaborative effort to resolve sequence associations for gene families.

Reviews literature and database resources to provide expanded annotation including sequence features, gene-specific information for display in LocusLink, and concise, informative summaries.

Collaborates with a variety of scientists with diverse backgrounds and training both inside and outside NCBI.

Uses state-of-the art computational tools and databases.
Qualified scientists who enjoy teamwork interaction, and problem-solving with a results-oriented focus, are invited to submit all of the following for consideration: cover letter, curriculum vitae, salary history, salary requirements, and U.S. employment eligibility (you must currently reside in the U.S.). Please note that incomplete applications cannot be considered.